sp|Q9ZW88|FBL34_ARATH ----> F-box/LRR-repeat protein At1g67190
Intron 1 GTGAGTCTCA ... GATTGTTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 70.55 | 91 | 240 | 196 |
| A2 | 64.15 | 95 | 181 | 159 |
| A3 | 64.83 | 99 | 178 | 187 |
| A4 | 66.49 | 95 | 217 | 160 |
| A5 | 67.43 | 62 | 134.8 | 122 |
| A6 | 72.05 | 615 | 1519.5 | 1650 |
| A7 | 70.2 | 468 | 1077.5 | 1128 |
| A8 | 68.94 | 465 | 933 | 1131 |
| A9 | 69.5 | 456 | 982 | 1096 |
| A10 | 71.02 | 297 | 687 | 769 |
>TRINITY_DN106774_c0_g1_i2 from sample A3 / Example spliced isoformAAAACAGGTCGACTAAATAAAGTTTTAGAAAATTGGGTTGCCTTGGTGGCTCCTATGATTCCTCCCCACGACTCCAAATAGCTGTTGAATTAGATAGGAAAAATAGTTGGGAACGATGATGACGGCCTGCCTCTGCCACTGGGATGCTTCCTTTTAATTTCTTTAATCGTTGTTGGTTTTCTTGTAATCGATTGAAGAAT
TGCTGAGGATCTCTTCTCCGAATTGTTTGGTAAATGTTACCAGATTGCTCTTTTGGATCCCTGGGCAATGGAACCAGATGATTGTTGTTTCAGAGCTTGGAACCCATCTCATGATCTCAGCTGTCTTTGGATTGACCTTTATTTTTAAGATTGTCGTCAGTTTCGGGGGGGAATTATGGAATCCCTTCCTGTGGAGGTAA
TAGGGATTATACTGTCTCGTCTTGCTGCTGCTAGGGATGTTATGCTAGCGTCGGCAACTTGCAGAAAATGGAGAGAAGCAACGAGAAAACATTTGCATTCCCTTTCATTCAATTTGTCTGACTGGCCTATGTACCGTGAACTTAGCACAAGCAGGTTGGAAATTCTTATTACTCAGACAATTTTTCAGACAACAGGTTTA
CAGAATCTACGCATTTGCATGGGCGATGCGGATGAATTTTCAGCAGCTTCGGTCATTGCCTGGCTTATGTATACAAGAGAGACCTTGCGCAGTCTTGTGTATATGATGCATACAAATCCTAATGTGAATATCTTTGAAAAATGTGGAAGGCAAAAATTGGAGGAACTAGTTTCAGGATTCACTTCGATTTCTGGTGTGGA
TCCAAGCTACCAACGATTTCCATGTTTAAAATCTCTCACCCTTCATAGTGTGAATATTTCTGCATTGGATTTGAGCCTTTTGTTGACTGCATGCCCTAAGCTTGAGTCCTTTTCGCTTATAAACCCGGAAATTGCCATGTCTGATGCTCAAGCAGTGATGGAGTTGACTAGCCCAAGTTTGAAAAAGCTATATGTGGAAG
AAATAAGCTTGGACAAATTTGTTCTTGAGGCAGATAATTTAGAAAGCCTTCATTTGAAGGATTCAACAGTTGAACTTTTTGAGCTTATAAGTAAGGGGAGTCTGAAACACCTTAGGATGGATGATGTGAGTATAATTCATCTCGATATTGGGGAGACCACTGATCTCTTAGAGGTAGTGGATGTAAGTGACTTCACAATC
ATGTGGCCAAAGTTCTACCAGATGATTTCGAGAGCTACTAAGCTGAGAAGATTAAGGCTTTGGGGTATAGTATTTGACTCAGAAGATGAGGTAATGGAATTGGAAACCATAGCAGTATGCTTTCCTAAACTAAACCATCTCTCGCTGAGTTATGATCTGAGAGATGGTCTTCTTCAACATGTCTTAAGAGGGTCATCATT
GCTGGAAAATGTGGTGGTGCTGAAGTTGGGATCTACAGTGATTAATGATTTGTTTGCTCAATGGATAGCAGGGTTGCTTGAAAGATGCCCTAGTCTCAAGCGGCTAATTATCCATGGTTTTGTCTCCGAGACAAAAAATCGGGATGAATGTGCAACTCTGGCAAGGTTTACCTCTTCTGTTTCCACTGGAGCATTACCAG
TACACCAGCACCAGCGTTGGATTGCACACAGCTCGATCCAATAGAATTTTTCAAGAGAAGTTTTTTTGGGGTATGTCTGAAGTTATATATATTTGATCTTGTAGCATGTCTTTACTGTTGTGTCGGTGGCTAGCCAAATTCATTGAAAGGGATTTTGTTAAAGTTGCTATTCCATCTAAACTGTTCTGGTCAGGATATTT
TGGCTGGAGATACCAGAAGATGGATAGGGAGTTGAATTTTTTTTAGAGAGCCTCGGTAAAGTTGGCTCAGTAAAAATCCAGGTGCACTATTTATTGTTTGGTCTCATGTTGTACTGCTCAACATTGTGATCTGCAGTGAATTAAATTTGGATGCTACCATTTCTTGCTTCAGTCTTTGATTATTGTAATCTCATTTTTTT
ATCAATGCTACTAGGATGAGTTATGGATTTGTTAAAGATTACTGTCCAACAACATTTACAATAACCAAGCTGATTTCCGTGATGCTGAAATTATCCAAGCACTAAAATTGGTTATCTTGTTTCCTGACCTACAAGTTTTATTTGTCAACAATGTCTTTTGTTTGCAATACAATATTACACCTC
>TRINITY_DN106774_c0_g1_i1 from sample A3 / Example unspliced isoform:AAAACAGGTCGACTAAATAAAGTTTTAGAAAATTGGGTTGCCTTGGTGGCTCCTATGATTCCTCCCCACGACTCCAAATAGCTGTTGAATTAAATGGGAAAAATAGTTGGGAACGATGATGACGGCCTGCCTCTGCCACTGGGATGCTTCCTTTTAATTTCTTTAATCGTTGTTGGTTTTCTTGTAATCGATTGAAGAAT
TTGCTGAGGATCTCTTCTCCGAATTGTTTGGTAAATGTTACCAGATTGCTCTTTTGGATCCCTGGGCAATGGAACCAGCAGATTGTTGTTTCAGAGCTTGGAACCCATCTCATGATCTCAGCTGTCTTTGGGTTGACCTTTATTTTTAAGATTGTCGTCAGTTTCGGGGGGGGATTATGGAATCCCTTCCTGTGGAGGTA
ATAGGGATTATACTGTCTCGTCTTGCTGCTGCTAGGGATGTTATGCTAGCGTCGGCAACTTGCAGAAAATGGAGAGAAGCAACGAGAAAACATTTGCATTCCCTTTCATTCAATTTGTCTGACTGGCCTATGTACCGTGAACTTAGCACAAGCAGGTTGGAAATTCTTATTACTCAGACAATTTTTCAGACAACAGGTTT
ACAGAATCTACGCATTTGCATGGGCGATGCGGATGAATTTTCAGCAGCTTCGGTCATTGCCTGGCTTATGTATACAAGAGAGACCTTGCGCAGTCTTGTGTATATGATGCATACAAATCCTAATGTGAATATCTTTGAAAAATGTGGAAGGCAAAAATTGGAGGAACTAGTTTCAGGATTCACTTCGATTTCTGGTGTGG
ATCCAAGCTACCAACGATTTCCATGTTTAAAATCTCTCACCCTTCATAGTGTGAATATTTCTGCATTGGATTTGAGCCTTTTGTTGACTGCATGCCCTAAGCTTGAGTCCTTTTCGCTTATAAACCCGGAAATTGCCATGTCTGATGCTCAAGCAGTGATGGAGTTGACTAGCCCAAGTTTGAAAAAGCTATATGTGGAA
GAAATAAGCTTGGACAAATTTGTTCTTGAGGCAGATAATTTAGAAAGCCTTCATTTGAAGGATTCAACAGTTGAACTTTTTGAGCTTATAAGTAAGGGGAGTCTGAAACACCTTAGGATGGATGATGTGAGTATAATTCATCTCGATATTGGGGAGACCACTGATCTCTTAGAGGTAGTGGATGTAAGTGACTTCACAAT
CATGTGGCCAAAGTTCTACCAGATGATTTCGAGAGCTACTAAGCTGAGAAGATTAAGGCTTTGGGGTATAGTATTTGACTCAGAAGATGAGGTAATGGAATTGGAAACCATAGCAGTATGCTTTCCTAAACTAAACCATCTCTCGCTGAGTTATGATCTGAGAGATGGTCTTCTTCAACATGTCTTAAGAGGGTCATCAT
TGCTGGAAAATGTGGTGGTGCTGAAGTTGGGATCTACAGTGATTAATGATTTGTTTGCTCAATGGATAGCAGGGTTGCTTGAAAGATGCCCTAGTCTCAAGCGGCTAATTATCCATGGTTTTGTCTCCGAGACAAAAAATCGGGATGAATGTGCAACTCTGGCAAGGTTTACCTCTTCTGTTgtgagtctcatgagaagg
tttatgcatgttgatgtgcagtttgattttcaatgatatttttacagtttgtctggattgatatttgagctggattgttcagTCCACTGGAGCATTACCAGTACACCAGCACCAGCGTTGGATTGCACACAGCTCGATCCAATAGAATTTTTCAAGAGAAGTTTTTTTGGGGTATGTCTGAAGTTATATATATTTGATCT
TGTAGCATGTCTTTACTGTTGTGTCGGTGGCTAGCCAAATTCATTGAAAGGGATTTTGTTAAAGTTGCTATTCCATCTAAACTGTTCTGGTCAGGATATTTTGGCTGGAGATACCAGAAGATGGATAGGGAGTTGAATTTTTTTTAGAGAGCCTCGGTAAAGTTGGCTCAGTAAAAATCCAGGTGCACTATTTATTGTTT
GGTCTCATGTTGTACTGCTCAACATTGTGATCTGCAGTGAATTAAATTTGGATGCTACCATTTCTTGCTTCAGTCTTTGATTATTGTAATCTCATTTTTTTATCAATGCTACTAGGATGAGTTATGGATTTGTTAAAGATTACTGTCCAACAACATTTACAATAACCAAGCTGATTTCCGTGATGCTGAAATTATCCAAG
CACTAAAATTGGTTATCTTGTTTCCTGACCTACAAGTTTTATTTGTCAACAATGTCTTTTGTTTGCAATACAATATTACACCTC
Intron 2 GTAAATATAT ... TGATTTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 50.34 | 36.8 | 11.3 | 37.3 |
| A2 | 52.3 | 49.3 | 8.5 | 54 |
| A3 | 53.5 | 44.8 | 7 | 51.5 |
| A4 | 48.9 | 52.3 | 4 | 50 |
| A5 | 50.5 | 25.5 | 5 | 26 |
| A6 | 54.27 | 91 | 1.5 | 108 |
| A7 | 54.93 | 99.5 | 4 | 121.3 |
| A8 | 50.14 | 44 | 2 | 44.3 |
| A9 | 53.95 | 116.5 | 0 | 136.5 |
| A10 | 55.42 | 83.5 | 0 | 103.8 |
>TRINITY_DN115286_c0_g2_i2 from sample A1 / Example spliced isoformACTAAATAAAGTTTTAGAAAATTGGGTTGCCTTGGTGGCTCCTATGATTCCTCCCCACGACTCCAAATAGCTGTTGAATTAGATAGGAAAAATAGTTGGGAACGATGATGACGGCCTGCCTCTGCCACTGGGATGCTTCCTTTTAATTTCTTTAATCGTTGTTGGTTTTCTTGTAATCGATTGAAGAATTTGCTGAGGAT
CTCTTCTCCGAATTGTTTGGTAAATGTTACCAGATTGCTCTTTTGGATCCCTGGGCAATGGAACCAGCAGATTGTTGTTTCAGAGCTTGGAACCCATCTCATGATCTCAGCTGTCTTTGGGTTGACCTTTATTTTTAAGATTGATGTATTTAGGATGGGAGATGTGGAGCTTTTGTGTGTGTTTATTGTAAATTTTGAAA
ACTGCCCAAATTGTCGTCAGTTTCGGGGGGGAATTATGGAATCCCTTCCTGTGGAGGTAATAGGGATTATACTGTCTCGTCTTGCTGCTGCTAGGGATGTTATGCTAGCGTCGGCAACTTGCAGAAAATGGAGAGAAGCAACGAGAAAACATTTGCATTCCCTTTCATTCAATTTGTCTGACTGGCCTATGTACCGTGAA
CTTAGCACAAGCAGGTTGGAAATTCTTATTACTCAGACAATTTTTCAGACAACAGGTTTACAGAATCTACGCATTTGCATGGGCGATGCGGATGAATTTTCAGCAGCTTCGGTCATTGCCTGGCTTATGTATACAAGAGAGACCTTGCGCAGTCTTGTGTATATGATGCATACAAATCCTAATGTGAATATCTTTGAAAA
ATGTGGAAGGCAAAAATTGGAGGAACTAGTTTCAGGATTCACTTCGATTTCTGGTGTGGATCCAAGCTACCAACGATTTCCATGTTTAAAATCTCTCACCCTTCATAGTGTGAATATTTCTGCATTGGATTTGAGCCTTTTGTTGACTGCATGCCCTAAGCTTGAGTCCTTTTCGCTTATAAACCCGGAAATTGCCATGT
CTGATGCTCAAGCAGTGATGGAGTTGACTAGTCCAAGTTTGAAAAAGCTATATGTGGAAGAAATAAGCTTGGACAAATTTGTTCTTGAGGCAGATAATTTAGAAAGCCTTCATTTGAAGGATTCAACAGTTGAACTTTTTGAGCTTATAAGTAAGGGGAGTCTGAAACACCTTAGGATGGATGATGTGAGTATAATTCAT
CTCGATATTGGGGAGACCACTGATCTCTTAGAGGTAGTGGATGTAAGTGACTTCACAATCATGTGGCCAAAGTTCTACCAGATGATTTCGAGAGCTACTAAGCTGAGAAGATTAAGGCTTTGGGGTATAGTATTTGACTCAGAAGATGAGGTAATGGAATTGGAAACCATAGCAGTATGCTTTCCTAAACTAAACCATCT
CTCGCTGAGTTATGATCTGAGAGATGGTCTTCTTCAACATGTCTTAAGAGGGTCATCATTGCTGGAAAATGTGGTGGTGCTGAAGTTGGGATCTACAGTGATTAATGATTTGTTTGCTCAATGGATAGCAGGGTTGCTTGAAAGATGCCCTAGTCTCAAGCGGCTAATTATCCATGGTTTTGTCTCCGAGACAAAAAATC
GGGATGAATGTGCAACTCTGGCAAGGTTTACCTCTTCTGTTGTGAGTCTCATGAGAAGGTTTATGCATGTTGATGTGCAGTTTGATTTTCAATGATATTTTTACAGTTTGTCTGGATTGATATTTGAGCTGGATTGTTCAGTCCACTGGAGCATTACCAGTACACCAGCGTTGGATTGCACACAGCTCGATCCAATAGAA
TTTTTCAAGAGAAGTTTTTTTGGGATATGTCTGAAGTTATATATATTTGATCTTGTAGCATGTCTTTACTGTTGTGTCGGTGGCTAGCCAAATTCATTGAAAGGGATTTTGTTAAAGTTGCTATTCCATCTAAACTGTTCTGGTCAGGATATTTTGGCTGGAGATACCAGAAGATGGATAGGGAGTTGAATTTTTTTTAG
AGAGCCTCGGTAAAGTTGGCTCAGTAAAAATCCAGGTGCACTATTTATTGTTTGGTCTCATGTTGTACTGCTCAACATTGTGATCTGCAGTGAATTAAATTTGGATGCTACCATTTCTTGCTTCAGTCTTTGATTATTGTAATCTCATTTTTTTATCAATGCTACTAGGATGAGTTATGGATTTGTTAAAGATTACTGTC
CAACAACATTTACAATAACCAAGCTGATTTCCGTGATGCTGAAATTATCCAAGCACTAAAATTGGTTATCTTGTTTCCTGACCTACAAGTTTTATTTGTCAACAATGTCTTTTGTTTGCAATACAATATTACACCTTCTGGAGTTTTGGTTTTAAATTTACCCAAGCAATACCATCTGTATGCTGTTCTACGCTTCAGTT
GCCGTGTAAATAAATCAATCTCTGGACTTGGCTAATCCCCAACCATGATTACTTTTGGGGTTCAATTTATGAGTATCTTCATCAGCAATGGCCATTGAGGCCATGACAGTGAAATAGCTTCAACTGTAAGATTTTGTTTTGTTTTTTCAACTTTTTTACCAAGGAAAACCTTGCGGGATTCTCTCCTCCTTGGAATATCT
GGATGGAGGGTGGCTCAATTGCTAACCACAATATGGATGGTAAC
>TRINITY_DN115286_c0_g2_i1 from sample A1 / Example unspliced isoform:GTACCGAGTCTTCTAGGATTTCCCTCTCTGAGCGCTAGGTTTTCGTATGTTTATGATTTGCAGATTGATGTATTTAGGATGGGAGATGTGGAGCTTTTGTGTGTGTTTATTGTAAATTTTGAAAACTGCCCAAgtaaatatatgtgtggaaatccatgcaccttgtgatttctctgatttgtgttcttagtactgagaat
attctagggttttcccttttgatcccccgaggttttcatatgtttgtgatttgcagATTGTCGTCAGTTTCGGGGGGGAATTATGGAATCCCTTCCTGTGGAGGTAATAGGGATTATACTGTCTCGTCTTGCTGCTGCTAGGGATGTTATGCTAGCGTCGGCAACTTGCAGAAAATGGAGAGAAGCAACGAGAAAACATT
TGCATTCCCTTTCATTCAATTTGTCTGACTGGCCTATGTACCGTGAACTTAGCACAAGCAGGTTGGAAATTCTTATTACTCAGACAATTTTTCAGACAACAGGTTTACAGAATCTACGCATTTGCATGGGCGATGCGGATGAATTTTCAGCAGCTTCGGTCATTGCCTGGCTTATGTATACAAGAGAGACCTTGCGCAGT
CTTGTGTATATGATGCATACAAATCCTAATGTGAATATCTTTGAAAAATGTGGAAGGCAAAAATTGGAGGAACTAGTTTCAGGATTCACTTCGATTTCTGGTGTGGATCCAAGCTACCAACGATTTCCATGTTTAAAATCTCTCACCCTTCATAGTGTGAATATTTCTGCATTGGATTTGAGCCTTTTGTTGACTGCATG
CCCTAAGCTTGAGTCCTTTTCGCTTATAAACCCGGAAATTGCCATGTCTGATGCTCAAGCAGTGATGGAGTTGACTAGTCCAAGTTTGAAAAAGCTATATGTGGAAGAAATAAGCTTGGACAAATTTGTTCTTGAGGCAGATAATTTAGAAAGCCTTCATTTGAAGGATTCAACAGTTGAACTTTTTGAGCTTATAAGTA
AGGGGAGTCTGAAACACCTTAGGATGGATGATGTGAGTATAATTCATCTCGATATTGGGGAGACCACTGATCTCTTAGAGGTAGTGGATGTAAGTGACTTCACAATCATGTGGCCAAAGTTCTACCAGATGATTTCGAGAGCTACTAAGCTGAGAAGATTAAGGCTTTGGGGTATAGTATTTGACTCAGAAGATGAGGTA
ATGGAATTGGAAACCATAGCAGTATGCTTTCCTAAACTAAACCATCTCTCGCTGAGTTATGATCTGAGAGATGGTCTTCTTCAACATGTCTTAAGAGGGTCATCATTGCTGGAAAATGTGGTGGTGCTGAAGTTGGGATCTACAGTGATTAATGATTTGTTTGCTCAATGGATAGCAGGGTTGCTTGAAAGATGCCCTAG
TCTCAAGCGGCTAATTATCCATGGTTTTGTCTCCGAGACAAAAAATCGGGATGAATGTGCAACTCTGGCAAGGTTTACCTCTTCTGTTGTGAGTCTCATGAGAAGGTTTATGCATGTTGATGTGCAGTTTGATTTTCAATGATATTTTTACAGTTTGTCTGGATTGATATTTGAGCTGGATTGTTCAGTCCACTGGAGCA
TTACCAGTACACCAGCGTTGGATTGCACACAGCTCGATCCAATAGAATTTTTCAAGAGAAGTTTTTTTGGGATATGTCTGAAGTTATATATATTTGATCTTGTAGCATGTCTTTACTGTTGTGTCGGTGGCTAGCCAAATTCATTGAAAGGGATTTTGTTAAAGTTGCTATTCCATCTAAACTGTTCTGGTCAGGATATT
TTGGCTGGAGATACCAGAAGATGGATAGGGAGTTGAATTTTTTTTAGAGAGCCTCGGTAAAGTTGGCTCAGTAAAAATCCAGGTGCACTATTTATTGTTTGGTCTCATGTTGTACTGCTCAACATTGTGATCTGCAGTGAATTAAATTTGGATGCTACCATTTCTTGCTTCAGTCTTTGATTATTGTAATCTCATTTTTT
TATCAATGCTACTAGGATGAGTTATGGATTTGTTAAAGATTACTGTCCAACAACATTTACAATAACCAAGCTGATTTCCGTGATGCTGAAATTATCCAAGCACTAAAATTGGTTATCTTGTTTCCTGACCTACAAGTTTTATTTGTCAACAATGTCTTTTGTTTGCAATACAATATTACACCTTCTGGAGTTTTGGTTTT
AAATTTACCCAAGCAATACCATCTGTATGCTGTTCTACGCTTCAGTTGCCGTGTAAATAAATCAATCTCTGGACTTGGCTAATCCCCAACCATGATTACTTTTGGGGTTCAATTTATGAGTATCTTCATCAGCAATGGCCATTGAGGCCATGACAGTGAAATAGCTTCAACTGTAAGATTTTGTTTTGTTTTTTCAACTT
TTTTACCAAGGAAAACCTTGCGGGATTCTCTCCTCCTTGGAATATCTGGATGGAGGGTGGCTCAATTGCTAACCACAATATGGATGGTAAC