NA ----> NA
Intron 1 GTAATTCATT ... TATTATATAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 25.56 | 298.5 | 126 | 79 |
| A2 | 17.09 | 291.5 | 70 | 50 |
| A3 | 13 | 348 | 63 | 41 |
| A4 | 13.14 | 221.5 | 45 | 22 |
| A5 | 22.41 | 168 | 58 | 39 |
| A6 | 6.15 | 588 | 60 | 17 |
| A7 | 4.93 | 1330 | 99 | 39 |
| A8 | 5.02 | 1119.5 | 94 | 24 |
| A9 | 4.15 | 832.5 | 58 | 14 |
| A10 | 5 | 1010 | 88 | 18 |
>TRINITY_DN111971_c1_g1_i2 from sample A5 / Example spliced isoformATTTGCCAGAGCCGTGGAGGGATTGGCCACGCCGAGGAGGGATTTGCCAGAGTCGTGGAGGGATTGGCCACGCCAAGGATTGGCTAGGCCGACCTGAGCCAGAGCCGAGAAGGAAAGAGGATTTAAGAGGGATTGGCCAGAACCACGCCAGAAGAGAGGCAGTTAGGGTTTGGCCAGAGCCACGCCAGAAGAGAGGCAGT
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>TRINITY_DN111971_c1_g1_i7 from sample A5 / Example unspliced isoform:ATTTGCCAGAGCCGTGGAGGGATTGGCCACGCCGAGGAGGGATTTGCCAGAGTCGTGGAGGGATTGGCCACGCCAAGGATTGGCTAGGCCGACCTGAGCCAGAGCCGAGAAGGAAAGAGGATTTAAGAGGGATTGGCCAGAACCACGCCAGAAGAGAGGCAGTTAGGGTTTGGCCAGAGCCACGCCAGAAGAGAGGCAGT
TAGGGTTTGGCCAGAGCCACGCCGAGTCGAGCCAAGAAAGGAAGAGGATAGAGCCGAGGAGAGTTTAGTATCTGGGAGTTATTTGTAATTTTGTTGGTTTACATTATTTTTGTGTCAAGATTGAAGCATGGCCATGCTGTTATTTGTTTTTATCTGTTTTTTTTGTTTTGGGTTTTCTTTAGTTTTTTCATTTTAATTTT
TTAAATTTTATTTTGGTTATGTTTTGTTTATTTGAGTCTGTTTCTTTGTGTTTTGGGTCTGTATTTGGATTGTGGAGGTGGGTCTGTGTTTGGATTGTGAGAGTGGAGTGATAAGGTGACGCAGTAGATAACAGCAGATCAGGTGTTTCTTAGCCATCCCAAATACTCTTAAGgtaattcatttgtttttaatttttggt
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AATCCACATAATGTTGCAGCCCG