sp|Q9FKQ1|DTX27_ARATH ----> Protein DETOXIFICATION 27

Intron 1 GTAAAATCCA ... TTATATTCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	33.81	46	27	20
A2	35.06	25	14	13
A3	23.33	46	19	9
A4	19.1	36	11	6
A5	44.19	12	11	8
A6	22.68	300	117	59
A7	24.95	194	79	50
A8	26.35	232	82	84
A9	25.96	241	108	61
A10	23.26	160	50	47

>TRINITY_DN47560_c0_g1_i4 from sample A7 / Example spliced isoform

CAACAAGGAAAAATCAGAACCAGGCTGATTTTAAAATGAAGATTACAGTCACTCATTCAGTCAGAAGGAAAAACGGATGAAATTGAAAATAGTTGGAGGAATTCCGGTGGATACTAAACTTTTTTGTTGCACAAATCCATCGGAGGCCAATATGGAAGAAGATCAAAAACTTCATAGTTCCCTCCTTCAAAATGCAAACG
ATGCAGAGGATTTCTTGAAACCGGACTTTGCCAGCCGGTTTTCGGCAGAGTCCAAATGGTTATGGAGGATTGCCGCGGGCTCTTTCGCCGGGGCACTAGCAAACATTGGATCATTTGGGATCACCAGCGCATTCGTAGGACACACCGGAAACTTAGAACTGGCCGCGGTTTCTCTGGTCGTGGGCGTTCTTGTTCCCTCC
GTTTCCATGATTTTGGTGGGAATGGCTAGTGCGCTGGGGACTCTATGTGGACAAGCCGTTGGCGCAAAGAAACACCACATGCTTGGAATATATTTGCAACGCTCTTGGATTGTACAAATTGGACTTGCAGTGCTTTTTCTTCCGAGCTTTGTCTTTACTGTCCCTATTCTCAGGTTCTTGGGGCAGCCTGAAGATATCGC
TGAATTATCAGGGAGAGTAGCACTATGGTGCATTCCTCTATATCTTTCGTTGCCTTTCAGTTGTACGATGTCGGGATATTTAAGTTCGCAATCCAAGAATGTGATCGTCGCAGGATCAGCTGCAGTTGGAGCAATAATCACTGTTTTCTTAGATTGGATGTTGGTCTTGACATGGAATATGGGCATTTGGGGTGCACTTG
TTTCACTAAACATTGGGTCCTGGCTGCATGCCATTTTGAGTTTCCTCTATGTTACGTGCGGCGGTTGTCCATTCACATGGACTGGATTTTCCATGGAAGCTTTTTGTGAACTCTGGCCATTACTAAAGCTCTCTGTGGCATCTGGTACCATGCTATGCTTGGACTTCCTGTATTACAGGATATTGGTTCTGATGACAGGA
CAAGTAAAAGACACTGAAATTGTGCTCGATTCACTTTCTATTTGCCTGGGCATCAATGCATTGGTGATGTCTATACCTCATGGCTTTCTTGCTGCAACCAGTGTGAGGGTTGCGAACCAGCTTGGCGCCGGGAAACTTAATGGGGCTAAATTTTCCATTGTTATCTCACTGGCATCTTCGTTTGTTGTGGCAATTATAAT
GTCGGTTGTTATTTTGTTTTTTCGTAATGATTTGGGTTATTTATTTACCAATAGTGCTTCTGTGCAACATGGTGTTGCCAAATTGGGCATTTTATTAGCCATTACAGTCATCCTCAATAGCATACAACAAGTGCTCATCGGTGTGGCCATTGGATCAGGCATGCAAGCTCAGGTCGTCCCAGTAAACCTTGTATGCTACT
ATTTGATCGGTGTTCCATTTGGCATGTTATTA

>TRINITY_DN47560_c0_g1_i3 from sample A7 / Example unspliced isoform:

CAACAAGGAAAAATCAGAACCAGGCTGATTTTAAAATGAAGATTACAGTCACTCATTCAGTCAGAAGGAAAAACGGATGAAATTGAAAATAGTTGGAGGAATTCCGGTGGATACTAAACTTTTTTGTTGCACAAATCCATCGGAGGCCAATATGGAAGAAGATCAAAAACTTCATAGTTCCCTCCTTCAAAATGCAAACG
ATGCAGAGGATTTCTTGAAACCGGACTTTGCCAGCCGGTTTTCGGCAGAGTCCAAATGGTTATGGAGGATTGCCGCGGGCTCTTTCGCCGGGGCACTAGCAAACATTGGATCATTTGGGATCACCAGCGCATTCGTAGGACACACCGGAAACTTAGAACTGGCCGCGGTTTCTCTGGTCGTGGGCGTTCTTGTTCCCTCC
GTTTCCATGATTTTGGTGGGAATGGCTAGTGCGCTGGGGACTCTATGTGGACAAGCCGTTGGCGCAAAGAAACACCACATGCTTGGAATATATTTGCAACGCTCTTGGATTGTACAAATTGGACTTGCAGTGCTTTTTCTTCCGAGCTTTGTCTTTACTGTCCCTATTCTCAGGTTCTTGGGGCAGCCTGAAGATATCGC
TGAATTATCAGGGAGAGTAGCACTATGGTGCATTCCTCTATATCTTTCGTTGCCTTTCAGTTGTACGATGTCGGGATATTTAAGTTCGCAATCCAAGAATGTGATCGTCGCAGGATCAGCTGCAGTTGGAGCAATAATCACTGTTTTCTTAGATTGGATGTTGGTCTTGACATGGAATATGGGCATTTGGGGTGCACTTG
TTTCACTAAACATTGGGTCCTGGCTGCATGCCATTTTGAGTTTCCTCTATGTTACGTGCGGCGGTTGTCCATTCACATGGACTGGATTTTCCATGGAAGCTTTTTGTGAACTCTGGCCATTACTAAAGCTCTCTGTGGCATCTGGTACCATGCTATGCTTGGACTTCCTGTATTACAGGATATTGGTTCTGATGACAGGA
CAAGTAAAAGACACTGAAATTGTGCTCGATTCACTTTCTATTTGCCTGGGCATCAATGCATTGGTGATGTCTATACCTCATGGCTTTCTTGCTGCAACCAGTGTGAGGGTTGCGAACCAGCTTGGCGCCGGGAAACTTAATGGGGCTAAATTTTCCATTGTTATCTCACTGGCATCTTCGTTTGTTGTGGCAATTATAAT
GTCGGTTGTTATTTTGTTTTTTCGTAATGATTTGGGTTATTTATTTACCAATAGTGCTTCTGTGCAACATGGTGTTGCCAAATTGGGCATTTTATTAGCCATTACAGTCATCCTCAACAGCATACAACAAGTGCTCATCGgtaaaatccaaaccacaatctcttcaatttttttatttgtatatgaaatctgacaggttt
aaattttaataactgtagtttgtgtatggaagttcatccttgataaattgatttgccttcatcatatacatgtccaaaataaatcgatctaagtgacagtttaggatattttattgtttaattatgaatcttttgcattgatgtgaacaatatcaatcttcactgagcaacagttttatcaaaaatcaccagcaaaagga
gctcctcagcttgctgtcctcgttacacttgttgactggataggccagagttttcaattttagtagctttgtttttagtttggaaacaataagcttggtgctattctatacatttttgggggcacttcttgtttttcatgaccaataaatccacggtcagaagttaacactttatgacagaaccgttagaactagaccca
gttaacttctttcccacatctacattcaaagttcatataattattaatagaatcctctaccttgtcaagattgtaatctgctaaatacatctggtttcaaaattcattccttctccctgtctgagcatgcctggttgccttattaccaaagcaaaagttgagaggccagcttcatcctttactctatggccccatgtatc
tgctttgatctgtctgagcatgcctggtttccttattaccaaagcaaaatgtgagagtccagcttcatcctttactctatggccccatgtatctgctttgatccatatactgatgaagattgtttggatttcccactattacatcgccctgggcagccaataaaaattctgttagcaatatatcctaaccatctgtcctt
cggctagtcattggctggatgtatcatgtaagatagaactctgttcattcccgtggtgaataggatctatgtgaagcacccattattgggctgatcatccacttttgattctcttttcttatatatttacacagggctccatgatgctcatgcttaagtactccagccccgacatccagattaagatgaatgttgttgac
aggatttataaagtgatatcgtttacctacatcgatgatttgggtaaaatatagaagttaaccaattaacattataagtagtgttgtgaaaaaacataaaacaacctaatagtgacaaatgtatctaggggtccaagctcttgtctagggtttgaattcataaccacttaccattataagcaatgttgggaaatgtgaca
actctgccactgaaacactttcaaaatgacttaatagtggtaggctaagtccaacacccagtggacacatgcatgtatctagcatggtgaaagatcataaccaagtccaccaaagaaacattttaaaagttactttggccatagggtaagtcaaacacccaatagacatagacctagaatgttcattgtaaagctaatgc
ccaaaaatccaaagctttcgattaggttttgccacactcacctagtatgctcattatgcagcttgtgcttaatgatcccatttttgaacttgtagccaattaccattaagagcagtgttgtcaaagatcattaccacctaagaatagaaaatcactttaaaattgacttgatagcctcaggctaaatccaacactcagtg
tacacatgcatccaactggctcatgatgaagttggtgacgaggaggccaaagctcttgccttgattttgtagagcctcattcaagtcatcgggatgggatggatccaacctcaccttcttagtctctgcacgtccatgcctcaatgtgtggcctatggatttgtttaaagggaaaaatgaaaatgcatgaattcctacct
catctttggctttcacactccatggagtttccatgatccattgttgatgtgggtttgattcatttgttgtaccaatgcaaataggtaaggattggcttcacagtatatcttcaccagttctccttgaatgggtggtggatactaatcctcatgtggttggtgaagttatgatgcccaaatgggttatgcaatctatcaat
tcaatcagataagacaaccaacatagctaatattatgaaaaaggagcttgtcaccctaccatgacatgtctcctagttgcagaccaaaggcattctgacatccagagaagggaagcataaaccaccatgataaaagaacttcgttatttgcataggctatgatctttggttgaagagtttgtcttgtttatcacatttaa
atactcaatatcagtgatttattaactttcggatattcatttatattcagGTGTGGCCATTGGATCAGGCATGCAAGCTCGGGTTGTCCCAGTAAACCTTGTATGCTACTATTTGATCGGTGTTCCATTTGGCATGTTATTATGTTTTCAATTTCATTTGGGAATAAAGGGCATTTGGATAGGACTACTTTGGGGAAATA
CAATTCAAATCAGTGTACTTGCATTTATTATATGGCTAATGGATTGGGATGAGAGGATTCATTGCAAATCGATTGAAAATGATGTCATCCATGACATCTTCTCCAAAGAGACAAAAGTATATATTTAATTTGAATTTCCTTAAAACAATACAAATGAAAAATGTGAAGTGATGTTGATTTTATTTTGTAACTTTCAATGT
CATCCATGACATCTTCTCCAAAGAGACAAAAGTACATATTTAATTTGAATTTCCTTAAACCAATACAAATGAAAAATGTGAAGTGATGTTGATTTTATTTTGTAACTTTCATGTTAGTAATATTTGTTGGCAACGTTTTCTATATCTCACTTTGTATTTAAGCATAATCATCAAAATATCATATTCATAATAAATGAAGA
TATGCCAAATATAAATTTCATTATTGAGCTTAGATTATGCCATTGGGAAGAAAGCCTTTCCTACCTTGGTTGTACAATATATATTTGTTTCTATCATACAAAATCTATTAGTTAGTTTGACTATATGAATTGACTTGCATTGATATAGTAAAATATAGTAAGA

Intron 2 GTAAGCAAAA ... TTTGTTCTAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	14.29	36	3	9
A2	14.78	49	8	9
A3	11.86	52	9	5
A4	14.71	29	6	4
A5	28	9	6	1
A6	15.55	258	40	55
A7	17.44	232	36	62
A8	17.62	374	56	104
A9	18.33	254	52	62
A10	17.67	191	38	44

>TRINITY_DN45023_c0_g1_i5 from sample A8 / Example spliced isoform

ATCAGAACCAGGCTGATTTTAAAATGAAGATTACAGTCACTCATTCAGTCAGAAGGAAAAACGGATGAAATTGAAAATAGTTGGAGGAATTCCGGTGGATACTAAACTTTTTTGTTGCACAAATCCATCGGAGGCCAATATGGAAGAAGATCAAAAACTTCATAGTTCCCTCCTTCAAAATGCAAACGATGCAGAGGATT
TCTTGAAACCGGACTTTGCCAGCCGGTTTTCGGCAGAGTCCAAATGGTTATGGAGGATTGCCGCGGGCTCTTTCGCCGGGGCACTAGCAAACATTGGATCATTTGGGATCACCAGCGCATTCGTAGGACACACCGGAAACTTAGAACTGGCCGCGGTTTCTCTGGTCGTGGGCGTTCTTGTTCCCTCCGTTTCCATGATT
TTGGTGGGAATGGCTAGTGCGCTGGGGACTCTATGTGGACAAGCCGTTGGCGCAAAGAAACACCACATGCTTGGAATATATTTGCAACGCTCTTGGATTGTACAAATTGGACTTGCAGTGCTTTTTCTTCCGAGCTTTGTCTTTACTGTCCCTATTCTCAGGTTCTTGGGGCAGCCTGAAGATATCGCTGAATTATCAGG
GAGAGTAGCACTATGGTGCATTCCTCTATATCTTTCGTTGCCTTTCAGTTGTACGATGTCGGGATATTTAAGTTCGCAATCCAAGAATGTGATCGTCGCAGGATCAGCTGCAGTTGGAGCAATAATCACTGTTTTCTTAGATTGGATGTTGGTCTTGACATGGAATATGGGCATTTGGGGTGCACTTGTTTCACTAAACA
TTGGGTCCTGGCTGCATGCCATTTTGAGTTTCCTCTATGTTACGTGCGGCGGTTGTCCATTCACATGGACTGGATTTTCCATGGAAGCTTTTTGTGAACTCTGGCCATTACTAAAGCTCTCTGTGGCATCTGGTACCATGCTATGCTTGGACTTCCTGTATTACAGGATATTGGTTCTGATGACAGGACAAGTAAAAGAC
ACTGAAATTGTGCTCGATTCACTTTCTATTTGCCTGGGCATCAATGCATTGGTGATGTCTATACCTCATGGCTTTCTTGCTGCAACCAGTGTGAGGGTTGCGAACCAGCTTGGCGCCGGGAAACTTAATGGGGCTAAATTTTCCATTGTTATCTCACTGGCATCTTCGTTTGTTGTGGCAATTATAATGTCGGTTGTTAT
TTTGTTTTTTCGTAATGATTTGGGTTATTTATTTACCAATAGTGCTTCTGTGCAACATGGTGTTGCCAAATTGGGCATTTTATTAGCCATTACAGTCATCCTCAATAGCATACAACAAGTGCTCATCGGTAAAATCCAAACCACAATCTCTTCAATTTTTTTATTTGTATATGAAATCTGACAGGTTTAAATTTTAATAA
CTGTAGTTTGTGTATGGAAGTTCATCCTTGATAAATTGATTTGCCTTCATCATATACATGTCCAAAATAAATCGATCTAAGTGACAGTTTAGGATATTTTATTGTTTAATTATGAATCTTTTGCATTGATGTGAACAATATCAATCTTCACTGAGCAACAGTTTTATCAAAAATCACCAGCAAAAGGAGCTCCTCAGCTT
GCTGTCCTCGTTACACTTGTTGACTGGATAGGCCAGAGTTTTCAATTTTAGTAGCTTTGTTTTTAGTTTGGAAACAATAAGCTTGGTGCTATTCTATACATTTTTGGGGGCACTTCTTGTTTTTCATGACCAATAAATCCACGGTCAGAAGTTAACACTTTATGACAGAACCGTTAGAACTAGACCCAGTTAACTTCTTT
CCCACATCTACATTCAAAGTTCATATAATTATTAATAGAATCCTCTACCTTGTCAAGATTGTAATCTGCTAAATACATCTGGTTTCAAAATTCATTCCTTCTCCCTGTCTGAGCATGCCTGGTTGCCTTATTACCAAAGCAAAAGTTGAGAGGCCAGCTTCATCCTTTACTCTATGGCCCCATGTATCTGCTTTGATCTG
TCTGAGCATGCCTGGTTTCCTTATTACCAAAGCAAAATGTGAGAGTCCAGCTTCATCCTTTACTCTATGGCCCCATGTATCTGCTTTGATCCATATACTGATGAAGATTGTTTGGATTTCCCACTATTACATCGCCCTGGGCAGCCAATAAAAATTCTGTTAGCAATATATCCTAACCATCTGTCCTTCGGCTAGTCATT
GGCTGGATGTATCATGTAAGATAGAACTCTGTTCATTCCCGTGGTGAATAGGATCTATGTGAAGCACCCATTATTGGGCTGATCATCCACTTTTGATTCTCTTTTCTTATATATTTACACAGGGCTCCATGATGCTCATGCTTAAGTACTCCAGCCCCGACATCCAGATTAAGATGAATGTTGTTGACAGGATTTATAAA
GTGATATCGTTTACCTACATCGATGATTTGGGTAAAATACAGAAGTTAACCAATTAACATTATAAGTAGTGTTGTGAAAAAACATAAAACAACCTAATAGTGACAAATGTATCTAGGGGTCCAAGCTCTTGTCTAGGGTTTGAATTCATAACCACTTACCATTATAAGCAATGTTGGGAAATGTGACAACTCTGCCACTG
AAACACTTTCAAAATGACTTAATAGTGGTAGGCTAAGTCCAACACCCAGTGGACACATGCATGTATCTAGCATGGTGAAAGATCATAACCAAGTCCACCAAAGAAACATTTTAAAAGTTACTTTGGCCATAGGGTAAGTCAAACACCCAATAGACATAGACCTAGAATGTTCATTGTAAAGCTAATGCCCAAAAATCCAA
AGCTTTCGATTAGGTTTTGCCACACTCACCTAGTATGCTCATTATGCAGCTTGTGCTTAATGATCCCATTTTTGAACTTGTAGCCAATTACCATTAAGAGCAGTGTTGTCAAAGATCATTACCACCTAAGAATAGAAAATCACTTTAAAATTGACTTGATAGCCTCAGGCTAAATCCAACACTCAGTGTACACATGCATC
CAACTGGCTCATGATGAAGTTGGTGACGAGGAGGCCAAAGCTCTTGCCTTGATTTTGTAGAGCCTCATTCAAGTCATCGGGATGGGATGGATCCAACCTCACCTTCTTAGTCTCTGCACGTCCATGCCTCAATGTGTGGCCTATGGATTTGTTTAAAGGGAAAAATGAAAATGCATGAATTCCTACCTCATCTTTGGCTT
TCACACTCCATGGAGTTTCCATGATCCATTGTTGATGTGGGTTTGATTCATTTGTTGTACCAATGCAAATAGGTAAGGATTGGCTTCACAGTATATCTTCACCAGTTCTCCTTGAATGGGTGGTGGATACTAATCCTCATGTGGTTGGTGAAGTTATGATGCCCAAATGGGTTATGCAATCTATCAATTCAATCAGATAA
GACAACCAACATAGCTAATATTATGAAAAAGGAGCTTGTCACCCTACCATGACATGTCTCCTAGTTGCTAGTTGCAGACCAAAGGCATTCTGACATCCAGAGAAGGGAAGCATAAACCACCATGATAAAAGAACTTCGTTATTTGCATAGGCTATGATCTTTGGTTGAAGAGTTTGTCTTGTTTATCACATTTAAATACT
CAATATCAGTGATTTATTAACTTTCGGATATTCATTTATATTCAGGTGTGGCCATTGGATCAGGCATGCAAGCTCAGGTCGTCCCAGTAAACCTTGTATGCTACTATTTGATCGGTGTTCCATTTGGCATGTTATTAGGTTTTCAATTTCACTTGGGAATAAAGGGCATTTGGATAGGACTACTTTGGGGAAATACAATT
CAAATCAGTGTACTTGCATTTATTATATGGCTAATGGATTGGGATGAGAGGATTCATTGCAAATCGATTGAAAATGATGTCATCCATGACATCTTCTCCAAAGAGACAAAAGTATATATTTAATTTGAATTTCCTTAAAACAATACAAATGAAAAATGTGAAGTGATGTTGATTTTATTTTGTAACTTTCAATGTCATCC
ATGACATCTTCTCCAAAGAGACAAAAGTACATATTTAATTTGAATTTCCTTAAAACAATACAAATGAAAAATGTGAAGTGATGTTGATTTTATTTTGTAACTTTCATGTTAGTAATATTTGTTGGCAACGTTTTCTATATCTCACTTTGTATTTAAGCATAATCATCAAAATATCATATTCATAATAAATGAAGATATGC
CAAATATAAATTTCATTATTGAGCTTAGATTATGCCATTGGGAAGAAAGCCTTTCCTACCTTGGTTGTACAATATATATTTGTTTCTATCATACAAAT

>TRINITY_DN45023_c0_g1_i7 from sample A8 / Example unspliced isoform:

ATCAGAACCAGGCTGATTTTAAAATGAAGATTACAGTCACTCATTCAGTCAGAAGGAAAAACGGATGAAATTGAAAATAGTTGGAGGAATTCCGGTGGATACTAAACTTTTTTGTTGCACAAATCCATCGGAGGCCAATATGGAAGAAGATCAAAAACTTCATAGTTCCCTCCTTCAAAATGCAAACGATGCAGAGGATT
TCTTGAAACCGGACTTTGCCAGCCGGTTTTCGGCAGAGTCCAAATGGTTATGGAGGATTGCCGCGGGCTCTTTCGCCGGGGCACTAGCAAACATTGGATCATTTGGGATCACCAGCGCATTCGTAGGACACACCGGAAACTTAGAACTGGCCGCGGTTTCTCTGGTCGTGGGCGTTCTTGTTCCCTCCGTTTCCATGATT
TTGGTGGGAATGGCTAGTGCGCTGGGGACTCTATGTGGACAAGCCGTTGGCGCAAAGAAACACCACATGCTTGGAATATATTTGCAACGCTCTTGGATTGTACAAATTGGACTTGCAGTGCTTTTTCTTCCGAGCTTTGTCTTTACTGTCCCTATTCTCAGGTTCTTGGGGCAGCCTGAAGATATCGCTGAATTATCAGG
GAGAGTAGCACTATGGTGCATTCCTCTATATCTTTCGTTGCCTTTCAGTTGTACGATGTCGGGATATTTAAGTTCGCAATCCAAGAATGTGATCGTCGCAGGATCAGCTGCAGTTGGAGCAATAATCACTGTTTTCTTAGATTGGATGTTGGTCTTGACATGGAATATGGGCATTTGGGGTGCACTTGTTTCACTAAACA
TTGGGTCCTGGCTGCATGCCATTTTGAGTTTCCTCTATGTTACGTGCGGCGGTTGTCCATTCACATGGACTGGATTTTCCATGGAAGCTTTTTGTGAACTCTGGCCATTACTAAAGCTCTCTGTGGCATCTGGTACCATGCTATGCTTGGACTTCCTGTATTACAGGATATTGGTTCTGATGACAGGACAAGTAAAAGAC
ACTGAAATTGTGCTCGATTCACTTTCTATTTGCCTGGGCATCAATGCATTGGTGATGTCTATACCTCATGGCTTTCTTGCTGCAACCAGTGTGAGGGTTGCGAACCAGCTTGGCGCCGGGAAACTTAATGGGGCTAAATTTTCCATTGTTATCTCACTGGCATCTTCGTTTGTTGTGGCAATTATAATGTCGGTTGTTAT
TTTGTTTTTTCGTAATGATTTGGGTTATTTATTTACCAATAGTGCTTCTGTGCAACATGGTGTTGCCAAATTGGGCATTTTATTAGCCATTACAGTCATCCTCAATAGCATACAACAAGTGCTCATCGGTAAAATCCAAACCACAATCTCTTCAATTTTTTTATTTGTATATGAAATCTGACAGGTTTAAATTTTAATAA
CTGTAGTTTGTGTATGGAAGTTCATCCTTGATAAATTGATTTGCCTTCATCATATACATGTCCAAAATAAATCGATCTAAGTGACAGTTTAGGATATTTTATTGTTTAATTATGAATCTTTTGCATTGATGTGAACAATATCAATCTTCACTGAGCAACAGTTTTATCAAAAATCACCAGCAAAAGGAGCTCCTCAGCTT
GCTGTCCTCGTTACACTTGTTGACTGGATAGGCCAGAGTTTTCAATTTTAGTAGCTTTGTTTTTAGTTTGGAAACAATAAGCTTGGTGCTATTCTATACATTTTTGGGGGCACTTCTTGTTTTTCATGACCAATAAATCCACGGTCAGAAGTTAACACTTTATGACAGAACCGTTAGAACTAGACCCAGTTAACTTCTTT
CCCACATCTACATTCAAAGTTCATATAATTATTAATAGAATCCTCTACCTTGTCAAGATTGTAATCTGCTAAATACATCTGGTTTCAAAATTCATTCCTTCTCCCTGTCTGAGCATGCCTGGTTGCCTTATTACCAAAGCAAAAGTTGAGAGGCCAGCTTCATCCTTTACTCTATGGCCCCATGTATCTGCTTTGATCTG
TCTGAGCATGCCTGGTTTCCTTATTACCAAAGCAAAATGTGAGAGTCCAGCTTCATCCTTTACTCTATGGCCCCATGTATCTGCTTTGATCCATATACTGATGAAGATTGTTTGGATTTCCCACTATTACATCGCCCTGGGCAGCCAATAAAAATTCTGTTAGCAATATATCCTAACCATCTGTCCTTCGGCTAGTCATT
GGCTGGATGTATCATGTAAGATAGAACTCTGTTCATTCCCGTGGTGAATAGGATCTATGTGAAGCACCCATTATTGGGCTGATCATCCACTTTTGATTCTCTTTTCTTATATATTTACACAGGGCTCCATGATGCTCATGCTTAAGTACTCCAGCCCCGACATCCAGATTAAGATGAATGTTGTTGACAGGATTTATAAA
GTGATATCGTTTACCTACATCGATGATTTGGGTAAAATACAGAAGTTAACCAATTAACATTATAAGTAGTGTTGTGAAAAAACATAAAACAACCTAATAGTGACAAATGTATCTAGGGGTCCAAGCTCTTGTCTAGGGTTTGAATTCATAACCACTTACCATTATAAGCAATGTTGGGAAATGTGACAACTCTGCCACTG
AAACACTTTCAAAATGACTTAATAGTGGTAGGCTAAGTCCAACACCCAGTGGACACATGCATGTATCTAGCATGGTGAAAGATCATAACCAAGTCCACCAAAGAAACATTTTAAAAGTTACTTTGGCCATAGGGTAAGTCAAACACCCAATAGACATAGACCTAGAATGTTCATTGTAAAGCTAATGCCCAAAAATCCAA
AGCTTTCGATTAGGTTTTGCCACACTCACCTAGTATGCTCATTATGCAGCTTGTGCTTAATGATCCCATTTTTGAACTTGTAGCCAATTACCATTAAGAGCAGTGTTGTCAAAGATCATTACCACCTAAGAATAGAAAATCACTTTAAAATTGACTTGATAGCCTCAGGCTAAATCCAACACTCAGTGTACACATGCATC
CAACTGGCTCATGATGAAGTTGGTGACGAGGAGGCCAAAGCTCTTGCCTTGATTTTGTAGAGCCTCATTCAAGTCATCGGGATGGGATGGATCCAACCTCACCTTCTTAGTCTCTGCACGTCCATGCCTCAATGTGTGGCCTATGGATTTGTTTAAAGGGAAAAATGAAAATGCATGAATTCCTACCTCATCTTTGGCTT
TCACACTCCATGGAGTTTCCATGATCCATTGTTGATGTGGGTTTGATTCATTTGTTGTACCAATGCAAATAGGTAAGGATTGGCTTCACAGTATATCTTCACCAGTTCTCCTTGAATGGGTGGTGGATACTAATCCTCATGTGGTTGGTGAAGTTATGATGCCCAAATGGGTTATGCAATCTATCAATTCAATCAGATAA
GACAACCAACATAGCTAATATTATGAAAAAGGAGCTTGTCACCCTACCATGACATGTCTCCTAGTTGCTAGTTGCAGACCAAAGGCATTCTGACATCCAGAGAAGGGAAGCATAAACCACCATGATAAAAGAACTTCGTTATTTGCATAGGCTATGATCTTTGGTTGAAGAGTTTGTCTTGTTTATCACATTTAAATACT
CAATATCAGTGATTTATTAACTTTCGGATATTCATTTATATTCAGGTGTGGCCATTGGATCAGGCATGCAAGCTCAGGTCGTCCCAGTAAACCTTGTATGCTACTATTTGATCGGTGTTCCATTTGGCATGTTATTAGGTTTTCAATTTCACTTGGGAATAAAGgtaagcaaaacttagatgagattattggttttatta
gtgtaagatttaaagttcaaataatattgtttttatttccatagaaagacctccttacatatatttaggtgttgatgatctctaaatgaaaggtcatataacatatttttgttactgtttccgatggttatctttttgttctagGGCATTTGGATAGGACTACTTTGGGGAAATACAATTCAAATCAGTGTACTTGCATT
TATTATATGGCTAATGGATTGGGATGAGAGGATTCATTGCAAATCGATTGAAAATGATGTCATCCATGACATCTTCTCC

Intron 3 GTAAAATCCA ... TTATATTCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	31.99	49.3	27	19.3
A2	26.66	32.3	14	9
A3	22.29	53.3	19	11.3
A4	17.59	40	11	6
A5	36.09	16	11	6.7
A6	21.31	336	118	63
A7	23.83	217.3	78	57.3
A8	24.37	272.7	83	91
A9	23.51	283.7	109	63.7
A10	21.37	192	50	53

>TRINITY_DN47560_c0_g1_i4 from sample A7 / Example spliced isoform

CAACAAGGAAAAATCAGAACCAGGCTGATTTTAAAATGAAGATTACAGTCACTCATTCAGTCAGAAGGAAAAACGGATGAAATTGAAAATAGTTGGAGGAATTCCGGTGGATACTAAACTTTTTTGTTGCACAAATCCATCGGAGGCCAATATGGAAGAAGATCAAAAACTTCATAGTTCCCTCCTTCAAAATGCAAACG
ATGCAGAGGATTTCTTGAAACCGGACTTTGCCAGCCGGTTTTCGGCAGAGTCCAAATGGTTATGGAGGATTGCCGCGGGCTCTTTCGCCGGGGCACTAGCAAACATTGGATCATTTGGGATCACCAGCGCATTCGTAGGACACACCGGAAACTTAGAACTGGCCGCGGTTTCTCTGGTCGTGGGCGTTCTTGTTCCCTCC
GTTTCCATGATTTTGGTGGGAATGGCTAGTGCGCTGGGGACTCTATGTGGACAAGCCGTTGGCGCAAAGAAACACCACATGCTTGGAATATATTTGCAACGCTCTTGGATTGTACAAATTGGACTTGCAGTGCTTTTTCTTCCGAGCTTTGTCTTTACTGTCCCTATTCTCAGGTTCTTGGGGCAGCCTGAAGATATCGC
TGAATTATCAGGGAGAGTAGCACTATGGTGCATTCCTCTATATCTTTCGTTGCCTTTCAGTTGTACGATGTCGGGATATTTAAGTTCGCAATCCAAGAATGTGATCGTCGCAGGATCAGCTGCAGTTGGAGCAATAATCACTGTTTTCTTAGATTGGATGTTGGTCTTGACATGGAATATGGGCATTTGGGGTGCACTTG
TTTCACTAAACATTGGGTCCTGGCTGCATGCCATTTTGAGTTTCCTCTATGTTACGTGCGGCGGTTGTCCATTCACATGGACTGGATTTTCCATGGAAGCTTTTTGTGAACTCTGGCCATTACTAAAGCTCTCTGTGGCATCTGGTACCATGCTATGCTTGGACTTCCTGTATTACAGGATATTGGTTCTGATGACAGGA
CAAGTAAAAGACACTGAAATTGTGCTCGATTCACTTTCTATTTGCCTGGGCATCAATGCATTGGTGATGTCTATACCTCATGGCTTTCTTGCTGCAACCAGTGTGAGGGTTGCGAACCAGCTTGGCGCCGGGAAACTTAATGGGGCTAAATTTTCCATTGTTATCTCACTGGCATCTTCGTTTGTTGTGGCAATTATAAT
GTCGGTTGTTATTTTGTTTTTTCGTAATGATTTGGGTTATTTATTTACCAATAGTGCTTCTGTGCAACATGGTGTTGCCAAATTGGGCATTTTATTAGCCATTACAGTCATCCTCAATAGCATACAACAAGTGCTCATCGGTGTGGCCATTGGATCAGGCATGCAAGCTCAGGTCGTCCCAGTAAACCTTGTATGCTACT
ATTTGATCGGTGTTCCATTTGGCATGTTATTA

>TRINITY_DN47560_c0_g1_i2 from sample A7 / Example unspliced isoform:

CAACAAGGAAAAATCAGAACCAGGCTGATTTTAAAATGAAGATTACAGTCACTCATTCAGTCAGAAGGAAAAACGGATGAAATTGAAAATAGTTGGAGGAATTCCGGTGGATACTAAACTTTTTTGTTGCACAAATCCATCGGAGGCCAATATGGAAGAAGATCAAAAACTTCATAGTTCCCTCCTTCAAAATGCAAACG
ATGCAGAGGATTTCTTGAAACCGGACTTTGCCAGCCGGTTTTCGGCAGAGTCCAAATGGTTATGGAGGATTGCCGCGGGCTCTTTCGCCGGGGCACTAGCAAACATTGGATCATTTGGGATCACCAGCGCATTCGTAGGACACACCGGAAACTTAGAACTGGCCGCGGTTTCTCTGGTCGTGGGCGTTCTTGTTCCCTCC
GTTTCCATGATTTTGGTGGGAATGGCTAGTGCGCTGGGGACTCTATGTGGACAAGCCGTTGGCGCAAAGAAACACCACATGCTTGGAATATATTTGCAACGCTCTTGGATTGTACAAATTGGACTTGCAGTGCTTTTTCTTCCGAGCTTTGTCTTTACTGTCCCTATTCTCAGGTTCTTGGGGCAGCCTGAAGATATCGC
TGAATTATCAGGGAGAGTAGCACTATGGTGCATTCCTCTATATCTTTCGTTGCCTTTCAGTTGTACGATGTCGGGATATTTAAGTTCGCAATCCAAGAATGTGATCGTCGCAGGATCAGCTGCAGTTGGAGCAATAATCACTGTTTTCTTAGATTGGATGTTGGTCTTGACATGGAATATGGGCATTTGGGGTGCACTTG
TTTCACTAAACATTGGGTCCTGGCTGCATGCCATTTTGAGTTTCCTCTATGTTACGTGCGGCGGTTGTCCATTCACATGGACTGGATTTTCCATGGAAGCTTTTTGTGAACTCTGGCCATTACTAAAGCTCTCTGTGGCATCTGGTACCATGCTATGCTTGGACTTCCTGTATTACAGGATATTGGTTCTGATGACAGGA
CAAGTAAAAGACACTGAAATTGTGCTCGATTCACTTTCTATTTGCCTGGGCATCAATGCATTGGTGATGTCTATACCTCATGGCTTTCTTGCTGCAACCAGTGTGAGGGTTGCGAACCAGCTTGGCGCCGGGAAACTTAATGGGGCTAAATTTTCCATTGTTATCTCACTGGCATCTTCGTTTGTTGTGGCAATTATAAT
GTCGGTTGTTATTTTGTTTTTTCGTAATGATTTGGGTTATTTATTTACCAATAGTGCTTCTGTGCAACATGGTGTTGCCAAATTGGGCATTTTATTAGCCATTACAGTCATCCTCAATAGCATACAACAAGTGCTCATCGgtaaaatccaaaccacaatctcttcaatttttttatttgtatatgaaatctgacaggttt
aaattttaataactgtagtttgtgtatggaagttcatccttgataaattgatttgccttcatcatatacatgtccaaaataaatcgatctaagtgacagtttaggatattttattgtttaattatgaatcttttgcattgatgtgaacaatatcaatcttcactgagcaacagttttatcaaaaatcaccagcaaaagga
gctcctcagcttgctgtcctcgttacacttgttgactggataggccagagttttcaattttagtagctttgtttttagtttggaaacaataagcttggtgctattctatacatttttgggggcacttcttgtttttcatgaccaataaatccacggtcagaagttaacactttatgacagaaccgttagaactagaccca
gttaacttctttcccacatctacattcaaagttcatataattattaatagaatcctctaccttgtcaagattgtaatctgctaaatacatctggtttcaaaattcattccttctccctgtctgagcatgcctggttgccttattaccaaagcaaaagttgagaggccagcttcatcctttactctatggccccatgtatc
tgctttgatctgtctgagcatgcctggtttccttattaccaaagcaaaatgtgagagtccagcttcatcctttactctatggccccatgtatctgctttgatccatatactgatgaagattgtttggatttcccactattacatcgccctgggcagccaataaaaattctgttagcaatatatcctaaccatctgtcctt
cggctagtcattggctggatgtatcatgtaagatagaactctgttcattcccgtggtgaataggatctatgtgaagcacccattattgggctgatcatccacttttgattctcttttcttatatatttacacagggctccatgatgctcatgcttaagtactccagccccgacatccagattaagatgaatgttgttgac
aggatttataaagtgatatcgtttacctacatcgatgatttgggtaaaatatagaagttaaccaattaacattataagtagtgttgtgaaaaaacataaaacaacctaatagtgacaaatgtatctaggggtccaagctcttgtctagggtttgaattcataaccacttaccattataagcaatgttgggaaatgtgaca
actctgccactgaaacactttcaaaatgacttaatagtggtaggctaagtccaacacccagtggacacatgcatgtatctagcatggtgaaagatcataaccaagtccaccaaagaaacattttaaaagttactttggccatagggtaagtcaaacacccaatagacatagacctagaatgttcattgtaaagctaatgc
ccaaaaatccaaagctttcgattaggttttgccacactcacctagtatgctcattatgcagcttgtgcttaatgatcccatttttgaacttgtagccaattaccattaagagcagtgttgtcaaagatcattaccacctaagaatagaaaatcactttaaaattgacttgatagcctcaggctaaatccaacactcagtg
tacacatgcatccaactggctcatgatgaagttggtgacgaggaggccaaagctcttgccttgattttgtagagcctcattcaagtcatcgggatgggatggatccaacctcaccttcttagtctctgcacgtccatgcctcaatgtgtggcctatggatttgtttaaagggaaaaatgaaaatgcatgaattcctacct
catctttggctttcacactccatggagtttccatgatccattgttgatgtgggtttgattcatttgttgtaccaatgcaaataggtaaggattggcttcacagtatatcttcaccagttctccttgaatgggtggtggatactaatcctcatgtggttggtgaagttatgatgcccaaatgggttatgcaatctatcaat
tcaatcagataagacaaccaacatagctaatattatgaaaaaggagcttgtcaccctaccatgacatgtctcctagttgctagttgcagaccaaaggcattctgacatccagagaagggaagcataaaccaccatgataaaagaacttcgttatttgcataggctatgatctttggttgaagagtttgtcttgtttatca
catttaaatactcaatatcagtgatttattaactttcggatattcatttatattcagGTGTGGCCATTGGATCAGGCATGCAAGCTCAGGTCGTCCCAGTAAACCTTGTATGCTACTATTTGATCGGTGTTCCATTTGGCATGTTATTAGGTTTTCAATTTCACTTGGGAATAAAGGGCATTTGGATAGGACTACTTTGG
GGAAATACAATTCAAATCAGTGTACTTGCATTTATTATATGGCTAATGGATTGGGATGAGAGGATTCATTGCAAATCGATTGAAAATGATGTCATCCATGACATCTTCTCCAAAGAGACAAAAGTATATATTTAATTTGAATTTCCTTAAAACAATACAAATGAAAAATGTGAAGTGATGTTGATTTTATTTTGTAACTT
TCAATGTCATCCATGACATCTTCTCCAAAGAGACAAAAGTACATATTTGATTTGAGTTTCTTTAAAACAATACAAATAAAATGTGAAGTGATGTTGATTTTATTTTGTAACTTTCATGTTAGTAATATTTGTTGGCAACGTTTTCTATATCTCACTTTGTATTTAAGCATAATCATCAAAATATCATATTCATAATAAAT
GAAGATATGCCAAATATAAATTTCATTATTGAGCTTAGATTATGCCATTGGGAAGAAAGCCTTTCCTACCTTGGTTGTACAATATATATTTGTTTCTATCATACAAAATCTATTAGTTAGTTTGACTATATGAATTGACTTGCATTGATATAGTAAAATATAGTAAGA

Intron 4 GTAATTCTGT ... GTATATGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	5.49	34	2.1	3.4
A2	12.23	23	3.3	5.4
A3	7.14	10	0.9	0
A4	13.04	16	3	2.9
A5	9.89	10	1.3	2.9
A6	6.89	94	7.7	8.6
A7	5.36	84	5.1	9
A8	4.42	87	4.3	9.7
A9	4.02	87	3.9	9.1
A10	4.29	63	3	5.1

>TRINITY_DN119961_c0_g1_i1 from sample A2 / Example spliced isoform

GGGTTCTGTTGTGATAGCGGGGGAACTTCTTTCAGTTTCTGTTGTTTTACCAGTTTTTCTTTCATCTTGTTTTCAAGTTTCAACTTTTTCATCTTGTTTTCAAGTTTCAACTTTGCTTCCAAATATGTTTTTCTTAATTTAAAAAACAAAAAATCAGTAACTTCAGTTTATTTCCATTATCGTTAACTCCACCACACGTC
GAAGTTGGCTTAGTTAGGCCTTTTATTTCTCCGCATTTAATTTGGCTTCACAGGTGGGAATGGCTAGTGCGCTGGGGACTCTATGTGGACAAGCCGTTGGCGCAAAGAAACACCACATGCTTGGAATATATTTGCAACGCTCTTGGATTGTACAAATTGGACTTGCAGTGCTTTTTCTTCCGAGCTTTGTCTTTACTGTC
CCTATTCTCAGGTTCTTGGGGCAGCCTGAAGATATCGCTGAATTATCAGGGAGAGTAGCACTATGGTGCATTCCTCTATATCTTTCGTTGCCTTTCAGTTGTACGATGTCGGGATATTTAAGTTCGCAATCCAAGAATGTGATCGTCGCAGGATCAGCTGCAGTTGGAGCAATAATCACTGTTTTCTTAGATTGGATGTT
GATCTTGAAATGGAATATGGGCATCTGGGGTGCACTTGTTTCACTAAACATTGGGTCCTGGCTGCATGCCATTTTGAGTTTCCTCTATGTTACGTGCGGCGGTTGTCCATTCACATGGACTGGATTTTCCATGGAAGCTTTTTGTGAACTCTGGCCATTACTAAAGCTCTCTGTGGCATCTGGTACCATGCTATGCTTGG
ACTTCCTGTATTACAGGATATTGGTTCTGATGACAGGACAAGTAAAAGACACTGAAATTGTACTCGATTCACTTTCTATTTGCCTGGGCATCAATGCATTGGTGATGTCTATACCTCATGGCTTTCTTGCTGCAACCAGTGTGAGGGTTGCGAACCAGCTTGGAGCCGGGAAACTTAATGGGGCTAAATTTTCCATTGTT
ATCTCACTGGCATCTTCGTTTGTTGTGGCAATTATAATGTCGGTTGTTATTTTGTTTTTTCGTAATGATTTGGGTTATTTATTTACCAATAGTGCTTCTGTGCAACATGGTGTTGCCAAATTGGGCATTTTATTAGCCATTACAGTCATCCTCAATAGCATACAACAAGTGCTCATCGGTGTGGCCATTGGATCAGGCAT
GCAAGCTCAGGTCGTCCCAGTAAACCTTGTATGCTACTATTTGATCGGTGTTCCATTTGGCATGTTATTAGGTTTTCAATTTCACTTGGGAATAAAGGGCATTTGGATAGGACTACTCTGGGGAAATACAATTCAAATCAGTGTACTTGCATTTATTATATGGCTAATGGATTGGGATGAGAGGATTCATTGCAAATCGA
TTGAAAATGATGTCATCCATGACATCTTCTCCAAAGAGACAAAAGTACATATTT

>TRINITY_DN119961_c0_g1_i5 from sample A2 / Example unspliced isoform:

CTTTCTTGCTGCAACCAGgtaattctgtgtctgtaattttagactagagcttgcagcttgttatgttatagtgaagagtagttgtaattatctcttaaagatcattctcacttgcctgtgtatatgcagTGTGAGGGTTGCGAACCAGCTTGGAGCCGGGAAACTTAATGGGGCTAAATTTTCCATTGTTATCTCACTGG
CATCTTCGTTTGTTGTGGCAATTATAATGTCGGTTGTTATTTTGTTTTTTCGTAATGATTTGGGTTATTTATTTACCAATAGTGCTTCTGTGCAACATGGTGTTGCCAAATTGGGCATTTTATTAGCCATTACAGTCATCCTCAATAGCATACAACAAGTGCTCATCGGTAAAATCCAAACCACAATCTCTTCAATTTTT
TTATTTGTATATGAAATCTGAC

Intron 5 GTTAGTATAA ... CTGTGAACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	16.28	54	11	10
A2	14.29	27	5	4
A3	12.62	45	5	8
A4	27.27	32	8	16
A5	20	36	13	5
A6	22.25	166	57	38
A7	19.11	127	38	22
A8	20.57	112	27	31
A9	18.88	116	31	23
A10	23.46	62	22	16

>TRINITY_DN106509_c0_g1_i9 from sample A4 / Example spliced isoform

TTTTCAAGTTTCAACTTTGCTTCAAAATATGTTTTTCTTTAAGTTTATGGAATTTGCTCATTTTTTAAAACTGTGACACAGTGAAAATTTAAAAACAGTTCTAGTCTTGGACCTTAATGATGGCAGCAAGAATCACCTTACTGATAACAGCAAGGATTGTACATTCTGTTTTGATCTCTGTTCATTATGGGTTCTGTTGT
GATAGCGGGGGAACTTCTTTCAGTTTCTGTTGTTTTACCAGTTTTTCTTTCATCTTGTTTTCAAGTTTCAACTTTTTCATCTTGTTTTCAAGTTTCAACTTTGCTTCAAAATATGTTTTTCTTTAAGTTTATGGAATTTGCTCATTTTTTTTAAACTGTGAGACAGTGAAAATTTAAAAACAGTAATAGGCTTGGACCTT
AATGATGGCAGCAAGAATCACCTTACTGATAACAGCAAGGATTGTACATTCTGTTTTGATCTCTGTTCATTATGGGTTCTGTTGTGATAGTGGGGAACTTCTTTCAGTTTCTGTTGTTTTACCAGTTTTTCTTTCATCTTGTTTTCAAGTTTCAACTTTGCTTCCAAATATGTTTTTCTTAATTTAAAAAACAAAAAATC
AGTAACTTCAGTTTATTTCCATTATCGTTAACTCCACCACACGTCGAAGTTGGCTTAGTTAGGCCTTTTATTTCTCCGCATTTAATTTGGCTTCACAGGTGGGAATGGCTAGTGCGCTGGGGACTCTATGTGGACAAGCCGTTGGCGCAAAGAAACACCACATGCTTGGAATATATTTGCAACGCTCTTGGATTGTACAA
ATTGGACTTGCAGTGCTTTTTCTTCCGAGCTTTGTCTTTACTGTCCCTATTCTCAGGTTCTTGGGGCAGCCTGAAGATATCGCTGAATTATCAGGGAGAGTAGCACTATGGTGCATTCCTCTATATCTTTCGTTGCCTTTCAGTTGTACGATGTCGGGATATTTAAGTTCGCAATCCAAGAATGTGATCGTCGCAGGATC
AGCTGCAGTTGGAGCAATAATCACTGTTTTCTTAGATTGGATGTTGGTCTTGAAATGGAATATGGGCATTTGGGGTGCACTTGTTTCACTAAACATTGGGTCCTGGCTGCATGCCATTTTGAGTTTCCTCTATGTTACGTGCGGCGGTTGTCCATTCACATGGACTGGATTTTCCATGGAAGCTTTTTGTGAACTCTGGC
CATTACTAAAGCTCTCTGTGGCATCTGGTACCATGCTATGCTTGGACTTCCTGTATTACAGGATATTGGTTTTGATGACAGGACAAGTAAAAGACACTGAAATTGTACTCGATTCACTTTCTATTTGCCTGGGCATCAATGCATTGGTGATGTCTATACCTCTTGGCTTTCTTGCTGCAACCAGTGTGAGGGTTGCGAAC
CAGCTTGGAGCCGGGAAACTTAATGGGGCTAAATTTTCCATTGTTATCTCACTGGCATCTTCGTTTGTTGTGGCAATTATAATGTCGGTTGTTATTTTGTTTTTTCGTAATGATTTGGGTTATTTATTTACCAATAGTGCTTCTGTGCAACATGGTGTTGCCAAATTGGGCATTTTATTAGCCATTACAGTCATCCTCAA
TAGCATACAACAAGTGCTCATCGGTGTGGCCATTGGATCAGGCATGCAAGCTCAGGTCGTCCCAGTAAACCTTGTATGCTACTATTTGATCGGTGTTCCATTTGGCATGTTATTAGGTTTTCAATTTCACTTGGGAATAAAGGGCATTTGGATAGGACTACTCTGGGGAAATACAATTCAAATCAGTGTACTTGCATTTA
TTATATGGCTAATGGATTGGGATGAGAGGATTCATTGCAAATCGATTGAAAATGATGTCATCCATGACATCTTCTCCAAAGAGACAAAAGTACATATTTAATTTGAATTTCCTTAAAACAATACAAATGAAAAATGTGAAGTGATGTTGATTTTATTTTGTAACTTTCAATGTCATCCATGACATCTTCTCC

>TRINITY_DN106509_c0_g1_i1 from sample A4 / Example unspliced isoform:

GCGGGGGAGGCTGATTTTAAAATGAAGATTACAGTCACTCATTCAGTCAGAAGGAAAAACGGATGAAATTGAAAATAGTTGGAGGAATTCCGGTGGATACTAAACTTTTTTGTTGCACAAATCCATCGGAGGCCAATATGGAAGAAGATCAAAAACTTCATAGTTCCCTCCTTCAAAATGCAAACGATGCAGAGGATTTC
TTGAAACCGGACTTTGCCAGCCGGTTTTCGGCAGAGTCCAAATGGTTATGGAGGATTGCCGCGGGCTCTTTCGCCGGGGCACTAGCAAACATTGGATCATTTGGGATCACCAGCGCATTCGTAGGACACACCGGAAACTTAGAACTGGCCGCGTTTTCTCTGGTCGTGGGCGTTCTTGTTCCCTCCGTTTCCATGATTTT
GGTGGGAATGGCTAGTGCGCTGGGGACTCTATGTGGACAAGCCGTTGGCGCAAAGAAACACCACATGCTTGGAATATATTTGCAACGCTCTTGGATTGTACAAATTGGACTTGCAGTGCTTTTTCTTCCGAGCTTTGTCTTTACTGTCCCTATTCTCAGGTTCTTGGGGCAGCCTGAAGATATCGCTGAATTATCAGGGA
GAGTAGCACTATGGTGCATTCCTCTATATCTTTCGTTGCCTTTCAGTTGTACGATGTCGGGATATTTAAGTTCGCAATCCAAGAATGTGATCGTCGCAGGATCAGCTGCAGTTGGAGCAATAATCACTGTTTTCTTAGATTGGATGTTGGTCTTGAAATGGAATATGGGCATTTGGGGTGCACTTGTTTCACTAAACATT
GGGTCCTGGCTGCATGCCATTTTGAGTTTCCTCTATGTTACGTGCGGCGGTTGTCCATTCACATGGACTGGATTTTCCATGGAAGCTTTTTGTGAACTCTGGCCATTACTAAAGCTCTCTGTGGCATCTGGTACCATGCTATGgttagtataacttctatttggtaagaaatcgaatacaaataagttcctgtagatgtg
tacaaatggcaaaacttatgggggttatgcatagctaagaagttctaatattttgccttctgtgaacagCTTGGACTTCCTGTATTACAGGATATTGGTTTTGATGACAGGACAAGTAAAAGACACTGAAATTGTACTCGATTCACTTTCTATTTGCCTGGGCATCAATGCATTGGTGATGTCTATACCTCTTGGCTTTC
TTGCTGCAACCAGTGTGAGGGTTGCGAACCAGCTTGGAGCCGGGAAACTTAATGGGGCTAAATTTTCCATTGTTATCTCACTGGCATCTTCGTTTGTTGTGGCAATTATAATGTCGGTTGTTATTTTGTTTTTTCGTAATGATTTGGGTTATTTATTTACCAATAGTGCTTCTGTGCAACATGGTGTTGCCAAATTGGGC
ATTTTATTAGCCATTACAGTCATCCTCAATAGCATACAACAAGTGCTCATCGGTGTGGCCATTGGATCAGGCATGCAAGCTCAGGTCGTCCCAGTAAACCTTGTATGCTACTATTTGATCGGTGTTCCATTTGGCATGTTATTAGGTTTTCAATTTCACTTGGGAATAAAGGGCATTTGGATAGGACTACTCTGGGGAAA
TACAATTCAAATCAGTGTACTTGCATTTATTATATGGCTAATGGATTGGGATGAGAGGATTCATTGCAAATCGATTGAAAATGATGTCATCCATGACATCTTCTCCAAAGAGACAAAAGTACATATTTAATTTGAATTTCCTTAAAACAATACAAATGAAAAATGTGAAGTGATGTTGATTTTATTTTGTAACTTTCAAT
GTCATCCATGACATCTTCTCC