NA ----> NA
Intron 1 GTTAATGAAA ... TGAGATTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 82.85 | 1.5 | 6 | 8 |
| A2 | 69.06 | 5 | 15 | 7 |
| A3 | 28.2 | 4.5 | 3 | 0.5 |
| A4 | 75.72 | 1 | 3 | 3.5 |
| A5 | 30.95 | 4 | 3 | 0.5 |
| A6 | 59.21 | 6 | 10 | 7.5 |
| A7 | 57.74 | 8.5 | 15 | 8.3 |
| A8 | 63.89 | 9.5 | 8 | 23.5 |
| A9 | 54.42 | 8.3 | 7 | 12 |
| A10 | 61.53 | 5 | 5 | 11 |
>TRINITY_DN40353_c0_g2_i3 from sample A6 / Example spliced isoformCTCGTCGTGGTTTCTCCGAAAGAACTCCCAATTGTTCACAGAATTTTGAGAGATCTCGAGACAAAGACAGTCGTCCTTGGATTCAATCGAGACCGGAAATGGATGAGCACGTGGAGTTTAAGAGGCAGTGTAATACTCTAGTTGAGATTGCGGGCGCAGAGTTATCTCATGTTTGTTCAGAGGATGAGAGATGGAAACTG
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>TRINITY_DN40353_c0_g2_i2 from sample A6 / Example unspliced isoform:CTCGTCGTGGTTTCTCCGAAAGAACTCCCAATTGTTCACAGAATTTTGAGAGATCTCGAGACAAAGACAGTCGTCCTTGGATTCAATCGAGACCGGAAATGGATGAGCACGTGGAGTTTAAGAGGCAGTGTAATACTCTAGTTGAGATTGCGGGCGCAGAGTTATCTCATGTTTGTTCAGAGGATGAGAGATGGAAACTG
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taatgaaattgattatgcgcaaggtggattgggttggaaagtgtggggtgcaggtttaattttatcatggcgccttctagcattaaagaatatgattcgtggaaaggaaatcctagaacttggaagtggttgtggtctttgtgggttgctacttgccaagttgggtgccgccaaggttgtcttgaccgataacatttcag
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ttagattggatggaggactctaccttggcatcacataatttatcaattgagattcagGGCGTGATTCGGCGTCGCTTATTGAATTCTAACAGCAGAGCTCTCATTGTAAATCCAGTTCGAGAAAAAGACTTATTAGAACAATTTTTGAAAGAAGTGACTAGATTAGGCTTGACAACCAATGTAGAGCAAGTAGATCAACA
AGAATGGACAAATTGTAAGCTTGCAACATGTGGAGAAGATGGTGATGATGATCTTGATGAATATTGTACAATGTATAATATGGAGCACTATGAAGGAGGAATAGTGGCTTTATACATAACACTCAAGAATGAGAGTTAGGTACATGTTTCTCAATATGTGTGCATGTTTAGTGTTGAATTGAGAATTGGTGACTTTAGTT
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AGAATTGGTGACCTCGGTTTTTAAATAAATGTTATTGGTTTTTAAATAAATGTTACGAGTTGTAAAAGATCTAACAACCAATATTTGGGAACTGCTATTGTTTTAAATGGAGAGAGCTTAAAAGTCCAC