sp|Q9FMY5|U2AFB_ARATH ----> Splicing factor U2af small subunit B

Intron 1 GTTTGTTCCT ... AGTTTTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	49.32	75	91	55
A2	39.46	79	63	40
A3	38.29	83	87	16
A4	47.12	55	66	32
A5	39.01	43	39	16
A6	31.55	677	436	188
A7	34.4	451	299	174
A8	32.78	407	252	145
A9	32.6	398	263	122
A10	32.45	358	199	145

>TRINITY_DN124054_c1_g1_i1 from sample A1 / Example spliced isoform

CATAGTGGATTTCTCTCCTGTTACCGACTTCCGTGAAGCAACATGTAGGCAATATGAAGAGGATACATGCAATCGTGGTGGCTACTGTAACTTTATGCACCTTAAGAAGATCAGCAGGGAGCTGAGGCGGCAATTATTTGGAAGGTATAGACGACATGGGCGTGGTTATAGTAGAAGCCGGAGTCGAAGTCTTAGCCCTC
GGCTGTCTGCAGAAAGACAGCGTGGTTATGATGATCGTCCTCGTGGTGGCCGTGGGTATGATGATCGTCCTCGTGGCGGCCGTGGATATGATGATCGTCTGCATGGTGGTCGTGGTTATGATGACCGTCCCCGTGGTGGTCGTGGTTATGGTAGGAGAAATGAGAGGGATTCTGGTTATCAGGATTATAGAAATGGGCGA
AGGCCACGCAGCCGCAGTCCAGGTCATAGACGAGGTCGGAGCAGGAGCCGCAGCCCTAGGAGGAACAGAAGTCCAGTGCGAGAAGGCAGTGCAGAGAGGAGAGCTAAAATTGAACAGTGGAATAGAGAAAGAGAACAAAAAGAAGCATCTTCCAATGCTAACCAGTCCATGCAAAATGGAGGGGAATAGAGAAAGAGAAC
AAAAAGAAGCATCTTCCAATGCTAACCAGTCCATGGAAAATGGAGGGGCGCATTATCAACCTGGCGATGACTATTAGCTGTGAATGATCACCGTTGTTCTGGTTCATGTATCCCTGCTTCTCAGGATGGAGTTCACTTGTATGCAGCTTACATGAGATTTGTGTACAGGTGCATTTGCTGCTTCTTCAATGTTATTGGTG
TATGGAGTTTTTCAAAGTTTCTGGAGATGGTAGAGCTGTGTGTGCAGGAAAAGAATTATGGAGACCGCAATGGTCTTCATTATGTAGGGGAAATGAAGGCTATACATGTCTCTGATTCAGGTACATGGTTTAAAATGGTTCTAGCTTACAGATCTAACAGTATGCAATGACTGGATTCTCTATGTTTGGAATTTATATAC
CTGTATTCGTCAGGATTTATTTCGATACAGAGACATTTGACTGGTATTCCATTGTGGAATATTTTTGTTAACTAGAATTGATGTTTTGTGCAATATACAATTTGACTCGTATTCCATTGTGGAATATTTTTGTTAACTAGAATTGATGTTTTGTGCAATATACAATTTGACTCGTATTCCATTGTGG

>TRINITY_DN124054_c1_g1_i4 from sample A1 / Example unspliced isoform:

CATAGTGGATTTCTCTCCTGTTACCGACTTCCGTGAAGCAACATGTAGGCAATATGAAGAGGATACATGCAATCGTGGTGGCTACTGTAACTTTATGCACCTTAAGAAGATCAGCAGGGAGCTGAGGCGGCAATTATTTGGAAGGTATAGACGACATGGGCGTGGTTATAGTAGAAGCCGGAGTCGAAGTCTTAGCCCTC
GGCTGTCTGCAGAAAGACAGCGTGGTTATGATGATCGTCCTCGTGGTGGCCGTGGGTATGATGATCGTCCTCGTGGCGGCCGTGGATATGATGATCGTCTGCATGGTGGTCGTGGTTATGATGACCGTCCCCGTGGTGGTCGTGGTTATGGTAGGAGAAATGAGAGGGATTCTGGTTATCAGGATTATAGAAATGGGCGA
AGGCCACGCAGCCGCAGTCCAGGTCATAGACGAGGTCGGAGCAGGAGCCGCAGCCCTAGGAGGAACAGAAGTCCAGTGCGAGAAGGCAGTGCAGAGAGGAGAGCTAAAATTGAACAGTGGAATAGAGAAAGAGAACAAAAAGAAGCATCTTCCAATGCTAACCAGTCCATGCAAAATGGAGGGGAATAGAGAAAGAGAAC
AAAAAGAAGCATCTTCCAATGCTAACCAGTCCATGGAAAATGGAGGGGCGCATTATCAACCTGGCGATGACTATTAGCTGTGAATGATCACCGTTGTTCTGgtttgttcctctctttcttctgaagtcctccattgtaccttgtcaggtgcataggttgcatttctcagtcgtcatgtaaacatagcttacaaaacattt
tacattgtgcaggtggtgtgcaggttcacaaatgtgttctctcaaaagtaaaatctttccattttttattagagtcatatggtagtgagaacatgttagttgatctgtgcattatgcattttgtttgttgtccatggatgtgtgaagtgcatatatagctggtccaaaacataaacatttaacacaataaatattgcaga
aaaacctgaaaaataaatagcttcctgcggaagaaaatttgaatatcaagaacatgttagtcaatgtctgcattatgcattgtgtttgttgttcatgaatatttctcattattttttgttttgttttgtggttatggtagtgaaaatattttagttaatgcttgcattatgcattgtgttttgcatcggttgagattctg
ttgagcctaactgaagtcattcaccttatgtaatgtaaagagtcttgtttgtcaccatgttctgggtgcatacatgtctctctgtttttcaacttagtatgcataatatgtatatgtttcttgcaagatatttctttagttcaggctgcttgtctgcaaaatgcgagcttacagtctcgcatgagttttgcagGTTCATG
TATCCCTGCTTCTCAGGATGGAGTTCACTTGTATGCAGCTTACATGAGATTTGTGTACAGGTGCATTTGCTGCTTCTTCAATGTTATTGGTGTATGGAGTTTTTCAAAGTTTCTGGAGATGGTAGAGCTGTGTGTGCAGGAAAAGAATTATGGAGACCGCAATGGTCTTCATTATGTAGGGGAAATGAAGGCTATACATG
TCTCTGATTCAGGTTCATCTTTTGCCGGCATAGGTCTTTTGCCTATAAAATTAGGCTTATATTATTTGTGCAGGCACTGGGGACATAGAACCATGGTTCCTTCTTAAAGGTGAAAAAGTGTTATTGCAGGTACATGGTTTAAAATGGTTCTAGCTTACAGATCTAACAGTATGCAATGACTGGATTCTCTATGTTTGGAA
TTTATATACCTGTATTCGTCAGGATTTATTTCGATACAGAGACATTTGACTGGTATTCCATTGTGGAATATTTTTGTTAACTAGAATTGATGTTTTGTGCAATATACAATTTGACTCGTATTCCATTGTGGAATATTTTTGTTAACTAGAATTGATGTTTTGTGCAATATACAATTTGACTCGTATTCCATTGTGG

Intron 2 GTTCATCTTT ... GTTATTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	59.61	90	146.7	119
A2	65.36	56	133.3	78
A3	72.19	42	126	92
A4	72.46	42	140	81
A5	66.11	37	92	52.3
A6	66.72	704	1649.7	1173
A7	67.88	327	816.3	566
A8	66.28	458	1021	779.3
A9	67.29	291	669.3	528
A10	70.03	165	471.3	300

>TRINITY_DN124054_c1_g1_i1 from sample A1 / Example spliced isoform

CATAGTGGATTTCTCTCCTGTTACCGACTTCCGTGAAGCAACATGTAGGCAATATGAAGAGGATACATGCAATCGTGGTGGCTACTGTAACTTTATGCACCTTAAGAAGATCAGCAGGGAGCTGAGGCGGCAATTATTTGGAAGGTATAGACGACATGGGCGTGGTTATAGTAGAAGCCGGAGTCGAAGTCTTAGCCCTC
GGCTGTCTGCAGAAAGACAGCGTGGTTATGATGATCGTCCTCGTGGTGGCCGTGGGTATGATGATCGTCCTCGTGGCGGCCGTGGATATGATGATCGTCTGCATGGTGGTCGTGGTTATGATGACCGTCCCCGTGGTGGTCGTGGTTATGGTAGGAGAAATGAGAGGGATTCTGGTTATCAGGATTATAGAAATGGGCGA
AGGCCACGCAGCCGCAGTCCAGGTCATAGACGAGGTCGGAGCAGGAGCCGCAGCCCTAGGAGGAACAGAAGTCCAGTGCGAGAAGGCAGTGCAGAGAGGAGAGCTAAAATTGAACAGTGGAATAGAGAAAGAGAACAAAAAGAAGCATCTTCCAATGCTAACCAGTCCATGCAAAATGGAGGGGAATAGAGAAAGAGAAC
AAAAAGAAGCATCTTCCAATGCTAACCAGTCCATGGAAAATGGAGGGGCGCATTATCAACCTGGCGATGACTATTAGCTGTGAATGATCACCGTTGTTCTGGTTCATGTATCCCTGCTTCTCAGGATGGAGTTCACTTGTATGCAGCTTACATGAGATTTGTGTACAGGTGCATTTGCTGCTTCTTCAATGTTATTGGTG
TATGGAGTTTTTCAAAGTTTCTGGAGATGGTAGAGCTGTGTGTGCAGGAAAAGAATTATGGAGACCGCAATGGTCTTCATTATGTAGGGGAAATGAAGGCTATACATGTCTCTGATTCAGGTACATGGTTTAAAATGGTTCTAGCTTACAGATCTAACAGTATGCAATGACTGGATTCTCTATGTTTGGAATTTATATAC
CTGTATTCGTCAGGATTTATTTCGATACAGAGACATTTGACTGGTATTCCATTGTGGAATATTTTTGTTAACTAGAATTGATGTTTTGTGCAATATACAATTTGACTCGTATTCCATTGTGGAATATTTTTGTTAACTAGAATTGATGTTTTGTGCAATATACAATTTGACTCGTATTCCATTGTGG

>TRINITY_DN124054_c1_g1_i3 from sample A1 / Example unspliced isoform:

CATAGTGGATTTCTCTCCTGTTACCGACTTCCGTGAAGCAACATGTAGGCAATATGAAGAGGATACATGCAATCGTGGTGGCTACTGTAACTTTATGCACCTTAAGAAGATCAGCAGGGAGCTGAGGCGGCAATTATTTGGAAGGTATAGACGACATGGGCGTGGTTATAGTAGAAGCCGGAGTCGAAGTCTTAGCCCTC
GGCTGTCTGCAGAAAGACAGCGTGGTTATGATGATCGTCCTCGTGGTGGCCGTGGGTATGATGATCGTCCTCGTGGCGGCCGTGGATATGATGATCGTCTGCATGGTGGTCGTGGTTATGATGACCGTCCCCGTGGTGGTCGTGGTTATGGTAGGAGAAATGAGAGGGATTCTGGTTATCAGGATTATAGAAATGGGCGA
AGGCCACGCAGCCGCAGTCCAGGTCATAGACGAGGTCGGAGCAGGAGCCGCAGCCCTAGGAGGAACAGAAGTCCAGTGCGAGAAGGCAGTGCAGAGAGGAGAGCTAAAATTGAACAGTGGAATAGAGAAAGAGAACAAAAAGAAGCATCTTCCAATGCTAACCAGTCCATGCAAAATGGAGGGGAATAGAGAAAGAGAAC
AAAAAGAAGCATCTTCCAATGCTAACCAGTCCATGGAAAATGGAGGGGCGCATTATCAACCTGGCGATGACTATTAGCTGTGAATGATCACCGTTGTTCTGGTTCATGTATCCCTGCTTCTCAGGATGGAGTTCACTTGTATGCAGCTTACATGAGATTTGTGTACAGGTGCATTTGCTGCTTCTTCAATGTTATTGGTG
TATGGAGTTTTTCAAAGTTTCTGGAGATGGTAGAGCTGTGTGTGCAGGAAAAGAATTATGGAGACCGCAATGGTCTTCATTATGTAGGGGAAATGAAGGCTATACATGTCTCTGATTCAGgttcatcttttgccggcataggtcttttgcctataaaattaggcttatattatttgtgcaggcactggggacatagaacc
atggttccttcttaaaggtgaaaaagtgttattgcagGTACATGGTTTAAAATGGTTCTAGCTTACAGATCTAACAGTATGCAATGACTGGATTCTCTATGTTTGGAATTTATATACCTGTATTCGTCAGGATTTATTTCGATACAGAGACATTTGACTGGTATTCCATTGTGGAATATTTTTGTTAACTAGAATTGATG
TTTTGTGCAATATACAATTTGACTCGTATTCCATTGTGGAATATTTTTGTTAACTAGAATTGATGTTTTGTGCAATATACAATTTGACTCGTATTCCATTGTGG

Intron 3 GTTTGTTCCT ... TTGTGTACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	48.65	95	91	89
A2	41.57	97	63	75
A3	34.38	125	87	44
A4	43.04	88	66	67
A5	40.87	68	39	55
A6	33.55	940	436	513
A7	36.52	597	299	388
A8	37.9	575	252	450
A9	35.55	533	263	325
A10	37.85	367	199	248

>TRINITY_DN124054_c1_g1_i6 from sample A1 / Example spliced isoform

GGAATAGAGAAAGAGAACAAAAAGAAGCATCTTCCAATGCTAACCAGTCCATGCAAAATGGAGGAGAGCTAAAATTGAACAGTGGAATAGAGAAAGAGAACAAAAAGAAGCATCTTCCAATGCTAACCAGTCCATGGAAAATGGAGGGGCGCATTATCAACCTGGCGATGACTATTAGCTGTGAATGATCACCGTTGTTC
TGGTGCATTTGCTGCTTCTTCAATGTTATTGGTGTATGGAGTTTTTCAAAGTTTCTGGAGATGGTAGAGCTGTGTGTGCAGGAAAAGAATTATGGAGACCGCAATGGTCTTCATTATGTAGGGGAAATGAAGGCTATACATGTCTCTGATTCAGGTTCATCTTTTGCCGGCATAGGTCTTTTGCCTATAAAATTAGGCTT
ATATTATTTGTGCAGGCACTGGGGACATAGAACCATGGTTCCTTCTTAAAGGTGAAAAAGTGTTATTGCAGGTACATGGTTTAAAATGGTTCTAGCTTACAGATCTAACAGTATGCAATGACTGGATTCTCTATGTTTGGAATTTATATACCTGTATTCGTCAGGATTTATTTCGATACAGAGACATTTGACTGGTATTC
CATTGTGGAATATTTTTGTTAACTAGAATTGATGTTTTGTGCAATATACAATTTGACTCGTATTCCATTGTGGAATATTTTTGTTAACTAGAATTGATGTTTTGTGCAATATACAATTTGACTCGTATTCCATTGTGG

>TRINITY_DN124054_c1_g1_i4 from sample A1 / Example unspliced isoform:

CATAGTGGATTTCTCTCCTGTTACCGACTTCCGTGAAGCAACATGTAGGCAATATGAAGAGGATACATGCAATCGTGGTGGCTACTGTAACTTTATGCACCTTAAGAAGATCAGCAGGGAGCTGAGGCGGCAATTATTTGGAAGGTATAGACGACATGGGCGTGGTTATAGTAGAAGCCGGAGTCGAAGTCTTAGCCCTC
GGCTGTCTGCAGAAAGACAGCGTGGTTATGATGATCGTCCTCGTGGTGGCCGTGGGTATGATGATCGTCCTCGTGGCGGCCGTGGATATGATGATCGTCTGCATGGTGGTCGTGGTTATGATGACCGTCCCCGTGGTGGTCGTGGTTATGGTAGGAGAAATGAGAGGGATTCTGGTTATCAGGATTATAGAAATGGGCGA
AGGCCACGCAGCCGCAGTCCAGGTCATAGACGAGGTCGGAGCAGGAGCCGCAGCCCTAGGAGGAACAGAAGTCCAGTGCGAGAAGGCAGTGCAGAGAGGAGAGCTAAAATTGAACAGTGGAATAGAGAAAGAGAACAAAAAGAAGCATCTTCCAATGCTAACCAGTCCATGCAAAATGGAGGGGAATAGAGAAAGAGAAC
AAAAAGAAGCATCTTCCAATGCTAACCAGTCCATGGAAAATGGAGGGGCGCATTATCAACCTGGCGATGACTATTAGCTGTGAATGATCACCGTTGTTCTGgtttgttcctctctttcttctgaagtcctccattgtaccttgtcaggtgcataggttgcatttctcagtcgtcatgtaaacatagcttacaaaacattt
tacattgtgcaggtggtgtgcaggttcacaaatgtgttctctcaaaagtaaaatctttccattttttattagagtcatatggtagtgagaacatgttagttgatctgtgcattatgcattttgtttgttgtccatggatgtgtgaagtgcatatatagctggtccaaaacataaacatttaacacaataaatattgcaga
aaaacctgaaaaataaatagcttcctgcggaagaaaatttgaatatcaagaacatgttagtcaatgtctgcattatgcattgtgtttgttgttcatgaatatttctcattattttttgttttgttttgtggttatggtagtgaaaatattttagttaatgcttgcattatgcattgtgttttgcatcggttgagattctg
ttgagcctaactgaagtcattcaccttatgtaatgtaaagagtcttgtttgtcaccatgttctgggtgcatacatgtctctctgtttttcaacttagtatgcataatatgtatatgtttcttgcaagatatttctttagttcaggctgcttgtctgcaaaatgcgagcttacagtctcgcatgagttttgcaggttcatg
tatccctgcttctcaggatggagttcacttgtatgcagcttacatgagatttgtgtacagGTGCATTTGCTGCTTCTTCAATGTTATTGGTGTATGGAGTTTTTCAAAGTTTCTGGAGATGGTAGAGCTGTGTGTGCAGGAAAAGAATTATGGAGACCGCAATGGTCTTCATTATGTAGGGGAAATGAAGGCTATACATG
TCTCTGATTCAGGTTCATCTTTTGCCGGCATAGGTCTTTTGCCTATAAAATTAGGCTTATATTATTTGTGCAGGCACTGGGGACATAGAACCATGGTTCCTTCTTAAAGGTGAAAAAGTGTTATTGCAGGTACATGGTTTAAAATGGTTCTAGCTTACAGATCTAACAGTATGCAATGACTGGATTCTCTATGTTTGGAA
TTTATATACCTGTATTCGTCAGGATTTATTTCGATACAGAGACATTTGACTGGTATTCCATTGTGGAATATTTTTGTTAACTAGAATTGATGTTTTGTGCAATATACAATTTGACTCGTATTCCATTGTGGAATATTTTTGTTAACTAGAATTGATGTTTTGTGCAATATACAATTTGACTCGTATTCCATTGTGG

Intron 4 GTTCATGTAT ... TTGTGTACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	45.65	95	77.7	82
A2	43.76	97	80	71
A3	33.86	125	84	44
A4	39.31	88	56	58
A5	40.78	68	43.7	50
A6	39.64	940	679.7	555
A7	41.59	597	454.3	396
A8	43.43	575.3	410.3	473
A9	41.25	533	400.3	348
A10	46.1	367	360.7	267

>TRINITY_DN124054_c1_g1_i6 from sample A1 / Example spliced isoform

GGAATAGAGAAAGAGAACAAAAAGAAGCATCTTCCAATGCTAACCAGTCCATGCAAAATGGAGGAGAGCTAAAATTGAACAGTGGAATAGAGAAAGAGAACAAAAAGAAGCATCTTCCAATGCTAACCAGTCCATGGAAAATGGAGGGGCGCATTATCAACCTGGCGATGACTATTAGCTGTGAATGATCACCGTTGTTC
TGGTGCATTTGCTGCTTCTTCAATGTTATTGGTGTATGGAGTTTTTCAAAGTTTCTGGAGATGGTAGAGCTGTGTGTGCAGGAAAAGAATTATGGAGACCGCAATGGTCTTCATTATGTAGGGGAAATGAAGGCTATACATGTCTCTGATTCAGGTTCATCTTTTGCCGGCATAGGTCTTTTGCCTATAAAATTAGGCTT
ATATTATTTGTGCAGGCACTGGGGACATAGAACCATGGTTCCTTCTTAAAGGTGAAAAAGTGTTATTGCAGGTACATGGTTTAAAATGGTTCTAGCTTACAGATCTAACAGTATGCAATGACTGGATTCTCTATGTTTGGAATTTATATACCTGTATTCGTCAGGATTTATTTCGATACAGAGACATTTGACTGGTATTC
CATTGTGGAATATTTTTGTTAACTAGAATTGATGTTTTGTGCAATATACAATTTGACTCGTATTCCATTGTGGAATATTTTTGTTAACTAGAATTGATGTTTTGTGCAATATACAATTTGACTCGTATTCCATTGTGG

>TRINITY_DN124054_c1_g1_i1 from sample A1 / Example unspliced isoform:

CATAGTGGATTTCTCTCCTGTTACCGACTTCCGTGAAGCAACATGTAGGCAATATGAAGAGGATACATGCAATCGTGGTGGCTACTGTAACTTTATGCACCTTAAGAAGATCAGCAGGGAGCTGAGGCGGCAATTATTTGGAAGGTATAGACGACATGGGCGTGGTTATAGTAGAAGCCGGAGTCGAAGTCTTAGCCCTC
GGCTGTCTGCAGAAAGACAGCGTGGTTATGATGATCGTCCTCGTGGTGGCCGTGGGTATGATGATCGTCCTCGTGGCGGCCGTGGATATGATGATCGTCTGCATGGTGGTCGTGGTTATGATGACCGTCCCCGTGGTGGTCGTGGTTATGGTAGGAGAAATGAGAGGGATTCTGGTTATCAGGATTATAGAAATGGGCGA
AGGCCACGCAGCCGCAGTCCAGGTCATAGACGAGGTCGGAGCAGGAGCCGCAGCCCTAGGAGGAACAGAAGTCCAGTGCGAGAAGGCAGTGCAGAGAGGAGAGCTAAAATTGAACAGTGGAATAGAGAAAGAGAACAAAAAGAAGCATCTTCCAATGCTAACCAGTCCATGCAAAATGGAGGGGAATAGAGAAAGAGAAC
AAAAAGAAGCATCTTCCAATGCTAACCAGTCCATGGAAAATGGAGGGGCGCATTATCAACCTGGCGATGACTATTAGCTGTGAATGATCACCGTTGTTCTGgttcatgtatccctgcttctcaggatggagttcacttgtatgcagcttacatgagatttgtgtacagGTGCATTTGCTGCTTCTTCAATGTTATTGGTG
TATGGAGTTTTTCAAAGTTTCTGGAGATGGTAGAGCTGTGTGTGCAGGAAAAGAATTATGGAGACCGCAATGGTCTTCATTATGTAGGGGAAATGAAGGCTATACATGTCTCTGATTCAGGTACATGGTTTAAAATGGTTCTAGCTTACAGATCTAACAGTATGCAATGACTGGATTCTCTATGTTTGGAATTTATATAC
CTGTATTCGTCAGGATTTATTTCGATACAGAGACATTTGACTGGTATTCCATTGTGGAATATTTTTGTTAACTAGAATTGATGTTTTGTGCAATATACAATTTGACTCGTATTCCATTGTGGAATATTTTTGTTAACTAGAATTGATGTTTTGTGCAATATACAATTTGACTCGTATTCCATTGTGG

Intron 5 GCAAGCTTAT ... TCCTATGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	8.28	155	0	14
A2	9.88	146	0	16
A3	7.43	137	0	11
A4	7.84	94	0	8
A5	14.52	53	0	9
A6	12.53	356	0	51
A7	10.5	324	0	38
A8	11.46	224	0	29
A9	9.28	264	0	27
A10	13.68	246	0	39

>TRINITY_DN124054_c1_g1_i2 from sample A1 / Example spliced isoform

CATAGTGGATTTCTCTCCTGTTACCGACTTCCGTGAAGCAACATGTAGGCAATATGAAGAGAATACATGCAACCGTGGTGGCTACTGTAATTTCATGCACCTTAAGAAGATCAGCAGGGAGCTGAGGCGACAATTATTCGGAAGGTATAGACGACATGGCCATGGTTACAGTAGAAGCCGGAGTCGAAGTATTAGCCCTC
GGCTGTCTGTAGAAAGAAACCGTGGTTATGATGATCGTCCTCGTGGTGGCCGTGGGTATGATGATCGTCCTTATGGTGGTCGTGGTTATGGTAGGAGAAATGAAAGGGATTATCCTGGTTATCATGATGATAGACATGGGCGAAGGCCACGGAGCCGCAGTCCAGGTCATAGACGAGGTCGGAGCAGGAGCCGCAGCCCT
AGGAGGAACAGAAGTCCAGTGCGAGAAGGCAGTGCAGAGAGGAGAGCTAAAATTGAACAGTGGAATAGAGAAAGAGAACAAAAAGAAGCATCTTCCAATGCTAACCAGTCCATGCAAAATGGAGGGGCATATTCGTATCAACCTGGCTATGACTATTAGCCGTGAATGACCACTGTCCTTTTGGTTTGTTCCACTCTTTC
TTCTAAAGCCCTCCACGGAATAGAGAAAGAGAACAAAAAGAAGCATCTTCCAATGCTAACCAGTCCATGGAAAATGGAGGGGCGCATTATCAACCTGGCGATGACTATTAGCTGTGAATGATCACCGTTGTTCTGGTTGTACCTTGTCAGGTGCATAGGTTGCATTTCTCAGTTGTCATGTAAACCTAGCTTACAAATCA
TTTTACACTGTGCAGGTGGTGTGCAGGTTCACGAATATGTTCTCTCAAAAGCAAAATCTTTCCATTTTTGTTTAGGGTCATATGGTAGTGAGAATGTGTTAGTTAATCTGTGTGCATTTTGCATTGTATTTGTTGTCCATGAATGTCTTCTCCGAAGCAGTGAATGGCTGGTCCAAAACATTGACAATCATGTGCATTTA
ACACAGGAAACACTCCAGAAAAACCTGTAGAAAATCCTGTGGAAGAAAAATTGAGTAACAAGAACATGTTTGTTAGTGTGTGCATCATGCATTGTGTTTGTTGTGCATAAATGTGTTGTCAGTAGTCAGTACTTTT

>TRINITY_DN124054_c1_g1_i5 from sample A1 / Example unspliced isoform:

TGCACCTTAAGAAGATCAGCAGgcaagcttatcagatctatatctatgattctatagatcctttgatatatgagtttagtactcttggctgaagaaatcttggttgtagtttgcatctgacttcgttcctatgcagGGAGCTGAGGCGACAATTATTCGGAAGGTATAGACGACATGGCCATGGTTACAGTAGAAGCCGG
AGTCGAAGTATTAGCCCTCGGCTGTCTGTAGAAAGAAACCGTGGTTATGATGATCGTCCTCGTGGTGGCCGTGGGTATGATGATCGTCCTTATGGTGGTCGTGGTTATGGTAGGAGAAATGAAAGGGATTATCCTGGTTATCATGATGATAGACATGGGCGAAGGCCACGGAGCCGCAGTCCAGGTCATAGACGAGGTCG
GAGCAGGAGCCGCAGCCCTAGGAGGAACAGAAGTCCAGTGCGAGAAGGCAGTGCAGAGAGGAGAGCTAAAATTGAACAGTGGAATAGAGAAAGAGAACAAAAAGAAGCATCTTCCAATGCTAACCAGTCCATGCAAAATGGAGGGGCATATTCGTATCAACCTGGCTATGACTATTAGCCGTGAATGACCACTGTCCTTT
TGGTTTGTTCCACTCTTTCTTCTAAAGCCCTCCACGGAATAGAGAAAGAGAACAAAAAGAAGCATCTTCCAATGCTAACCAGTCCATGGAAAATGGAGGGGCGCATTATCAACCTGGCGATGACTATTAGCTGTGAATGATCACCGTTGTTCTGGTTGTACCTTGTCAGGTGCATAGGTTGCATTTCTCAGTTGTCATGT
AAACCTAGCTTACAAATCATTTTACACTGTGCAGGTGGTGTGCAGGTTCACGAATATGTTCTCTCAAAAGCAAAATCTTTCCATTTTTGTTTAGGGTCATATGGTAGTGAGAATGTGTTAGTTAATCTGTGTGCATTTTGCATTGTATTTGTTGTCCATGAATGTCTTCTCCGAAGCAGTGAATGGCTGGTCCAAAACAT
TGACAATCATGTGCATTTAACACAGGAAACACTCCAGAAAAACCTGTAGAAAATCCTGTGGAAGAAAAATTGAGTAACAAGAACATGTTTGTTAGTGTGTGCATCATGCATTGTGTTTGTTGTGCATAAATGTGTTGTCAGTAGTCAGTACTTTT