sp|P31843|RRPO_OENBE ----> RNA-directed DNA polymerase homolog
Intron 1 GTGCCTCCTT ... GGGCTTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 35.44 | 174 | 85 | 106 |
| A2 | 37.09 | 95 | 60 | 52 |
| A3 | 35.71 | 72 | 32 | 48 |
| A4 | 38.21 | 76 | 37 | 57 |
| A5 | 36.51 | 60 | 32 | 37 |
| A6 | 35.29 | 11 | 3 | 9 |
| A7 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A8 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A9 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A10 | 33.33 | 2 | 0 | 2 |
>TRINITY_DN125780_c18_g1_i4 from sample A2 / Example spliced isoformCAAAAGTTTTTTTTGTTAATTTCAGAAATGAATATTGTTATAATTATTAGGTAGCTCTATAACAAAAGAAGGGCAAACGCAATCTTAACATTTTGTAAGTGTCGTGCTTGAAGGTAAGCACCTTAATTGGTGCTTGTATTTCATGAATTATATTATTGTGATGAGTGCCATGAATGGGGAATGAGAGCATGCTCATCACA
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GGTCCATTATATGTGTGGCCTTGTTGGCTTGACTAGCCTCTCCTTGCGTGTGTTTTTGGATGGTAGTGGCCCTTTGGCTTGGTACGAGCACTTCCCTTGGTGAGAGAGGTGGACTAAACCAAGCCCCCTTCCCTTGGACTCAACTATCGCCCCCCCCAAAAAAAAACAAATTATGGTAGGTGGGCAGGTGTGCGCGATCC
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TTGGATGCACATCGAAAGGTAGGAATGCAACTATCCTCAATTATCTGACATTCCTTGTGAGCTCAAATACCTTGGGCAACAATAAAAATTAGGATTTGAAATTCTTTAAGCTCTAGCCTCTAGCTTCTACCAGTGAGTGAAGTACTTTGTAATTGACTTGAACCTTTCCATCCTCTTCTCACCCTTGTTTATCTGTCCAA
TTCTTCCCAAACTTGTCTAGCATATGCACATAAAATTAGCCATTGATGTATGGTTTTCTCCCACTCTTTGCATAAGACACTCGCTAGGACCATGCTTTTTACTTCCCTATAGAGCATCCCAGGTGATATAGAGCTTTCCATGTGAGGGCCTTGCGTCGGGCCTTATTCTTTTACAACTAACCGTATACAGATTCTTACCT
TCTATGGAGACTTGATTTTCCAAACTGGGTTTCTACCGCCATTAAAACTCTTCGGGCCTATCACTTTCACACATGTATTTGTATCCTAGTTATGGAGTGTATATTCCTAGAGTAGAATTCTTGGGCCCAACCAATTATTTGTCCACCTCCTTAATTCCAAGATGACTTACCTTCAATTTTGTTGTATATGCCTACCACAA
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TCTTCGTTTCCATTTTTACACACTAGCCAATTCCCCATTAGCGGGAAGGCTAAAGCCATGCACTTCCATACTATTTACGCAATTTGAAAGCTTTTTGAGGGTCTACTAATCCATCTTGCTATAGTATTAGGGTAAATGTATTTATGGGTGATAACTTGTCTCTATATATCATCATTTCTTGTGAATCTCTAAAGGCCTTG
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GGGCTCTATTAACTCTCCCACCCGCCCTCTCTATTCCTCCCTCTGCGATGGCTCGCCCTCCCCATTTGCCTGAAGCTCTGAGTTGCCTCTCCCTCGGCGAGCTTGACACCCCTCCTCCCCGTCTCTTGCTGGCTCAGGCGTATAATTGGGAAATAATGCAGTCCGTGATGGCGGCCATAGCCGCTCTGAGCAGAACGTTG
GTGGACATAAAGTTTGCAGTTCGTAATACCTATGATGCGGTTTGCTCCAATGTTAACCAGAATGCAGAGATGGCGTCGGACATTACTCATGTGTGCTCACAGCTCTCCTGCCAGGACTCCAGGATTGACGACCTGGAACGAAATTTATTCGAATTAATGGGGAAAGTTGACAGGTTGCAGGAAGATATGGCCGTTTTTAC
TGGAGCAACTCAGGGGAGTTGGGTGCATGAAAACCCCACGGTTAATCAGGAAATTAATCAGGTTATGGTGGATGCTTCTTCTGCTCAGCCAAAGAAGTATGGCTAGGACACAGCACAACCCAGGTTTCAACAATTTTGCTCATTTTGGTCAATGCATTTTTGTATAATCCTTTGTAGACAGTTTGTTAAGGTTGATTCCA
GCTCTATGCTGGATAATTTCAGGAAAACAAAGCTCAGAGCTTGTAATGTAATGCAGATAGAAAATATAGTGTTAGTAGGCCCAGACATTTCTGCACTGTTAAGACTCCTTCTGAAAGTTTGTAATGAATAGCTGTGCACAGCTTTATAAATATAATCCTTTACTCTGTTACTGTTAAAAATTAAAAAAAAAAGATCTCCT
TATCCTTATACATTTTACAAATCCCATTCTTGTTACTTATAGTAAAGATCACATGAGCCCTTTAGCTGCTATTAGAAATAGCAGAGGTGATAAAGGGTGTCCCTGTGTTAGCCCTTTTGCCTTGTTTCAATGCTTTTGATGGTATACTAAAAGTGGATGTTGATCCGTTGATTAAGCCTGCAAACAATACTGATGTCATG
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ACAAATCTTTTTGGGTATAAACCCCCGGACAAAACCCAAGATGGGAAAACCGGTGCAGCAGTCTGAGAAGAATTTTATTGTGAAG
>TRINITY_DN125780_c18_g1_i5 from sample A2 / Example unspliced isoform:CAAAAGTTTTTTTTGTTAATTTCAGAAATGAATATTGTTATAATTATTAGGTAGCTCTATAACAAAAGAAGGGCAAACGCAATCTTAACATTTTGTAAGTGTCGTGCTTGAAGGTAAGCACCTTAATTGGTGCTTGTATTTCATGAATTATATTATTGTGATGAGTGCCATGAATGGGGAATGAGAGCATGCTCATCACA
TCCTTGAACCTTATGTAGACTCTCCTTCATATTGTTTAATTTCCTTCATCTTTGCCATTCCCTGTTGCTCTGATTTAGGTAGTTGAAATTCTGAGAAAAAATGCTTGTTTACCTCTTGCAAGGTGAGAGGCCGAACATTATCAAGACGGTCCACAAACATAATATACCATTGGAAAGCTGAGCTAGTGGGAATGGAAAGG
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CCTGGATCTGCTTGGTCAATGCCGAGATCTGTGTTTGAAATTGCATCATATCAGGGGTTGGGCTTGCAGgtgcctccttaactagctataaatgcgttggacttgagatgatttattacactggatctgcttggtcaatgccgagatctgtgtttgaaattgcatcatatcaggggttgggcttgcagGTGCCTCCTTAA
CTAGCTATAAATGCGTTGGACTTAAGATGATTTATTACAATATTTCTTACAAGAGATATGATAACTCAAGTATTAGATTTTCAATCGTCATTCTCTAATATTTCCACAACAATCTCTCAAGCTAGTGAGCCAGTGATGGACCTAGCCGAATGGAGTTCAAAACATTAAAGCTTCAGGTCATTACACCAAACCATTCTCAA
TAACCGCCATGGTTGGTTGTAAGTTTCAGTTGACCAGGGGCACCTGATTCCCTCTAGAGTTAGAGGCAGGATAATTCTTTGACACCCCTCCTTTCCATTCTTCTAGCCTGATTGAGTTTTTTAGGGAATCCTTTAAAGCATGTATGAAACAAGAGAAGCACCAATTAAATATATTTTGTAGGCATAGAGAGAAGTGTTCC
AAGGTCCAAAAGGAATGCCACTGAAGAGGGAAGTGGAGCATGGAATTCAATTATTGCTAAACTCTCAATTTATAAATGTAGGAATGTATAGACAACATATATTAGAGTTAGATGAAGTGAAGAATTAATTGTAGTAATTGTTGGAGTAAGGAGTCATAAGGATAAGTACCTCACCATGTGGTTCCCTATTCATTTAGGTA
GCAAAGAGGGAGGGATTTGGAGAATGTGTATTTATTATAGAGATCCAAACAAAATTGCTATTAAGAATCCATTCTCTTTACCTAAGATGATTAATTTTTAGGTCATTTGAAGCATTTAAGTATTTCACCAAGCTAGATTTCAAATCTAGATATCATCAAGTCTAGATCAAGGAGTAAGACAACTCGAAAACTACATTTAA
GATGAAACAAGCTTGATAGGAGTGGTTAGTAATGACTTTTAATTTGAGTAATGCACCAACTACTTTTATTTGTATAATTAATGATTACGTGATGTAACTTCAGAATCATCCTTTTTCATTAGATTGAGAAAGGGGATGTGTGTGTGCTTTAGATCATTTAAACCACTTTTGCATCACAAAGGAAAACTTGAAGGAAGACC
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TTCTATGTGGGCGGGTCCTTATATCATTAAGCACTTCCTTAGTAAAGGTGCTTATGAATCGGTTCAATTCCTAGGTCTGCTTCGTTAGTAAAGGGGCTTATAAATCTGTTCAATTCCTAGGTCCATTATATGTGTGGCCTTGTTGGCTTGACTAGCCTCTCCTTGCGTGTGTTTTTGGATGGTAGTGGCCCTTTGGCTTG
GTACGAGCACTTCCCTTGGTGAGAGAGGTGGACTAAACCAAGCCCCCTTCCCTTGGACTCAACTATCGCCCCCCCCAAAAAAAAACAAATTATGGTAGGTGGGCAGGTGTGCGCGATCCTCCATATATTTTGCACGATCCTCCATAAATTTTGATTTGCTCCTATAACGATGCTTTGTGACTTCCATCAATCTAACACTC
GCAGTATTGAAAACTGTAGAGCCCTCCAAGCTTTGCCAGACCACTTTGAATCATGATCAAGTTGTCTTTGAGGCATACTTTTTCGAGGGTACTTGTAGCCAACAATGACTAACCTACATTTGGATGCACATCGAAAGGTAGGAATGCAACTATCCTCAATTATCTGACATTCCTTGTGAGCTCAAATACCTTGGGCAACA
ATAAAAATTAGGATTTGAAATTCTTTAAGCTCTAGCCTCTAGCTTCTACCAGTGAGTGAAGTACTTTGTAATTGACTTGAACCTTTCCATCCTCTTCTCACCCTTGTTTATCTGTCCAATTCTTCCCAAACTTGTCTAGCATATGCACATAAAATTAGCCATTGATGTATGGTTTTCTCCCACTCTTTGCATAAGACACT
CGCTAGGACCATGCTTTTTACTTCCCTATAGAGCATCCCAGGTGATATAGAGCTTTCCATGTGAGGGCCTTGCGTCGGGCCTTATTCTTTTACAACTAACCGTATACAGATTCTTACCTTCTATGGAGACTTGATTTTCCAAACTGGGTTTCTACCGCCATTAAAACTCTTCGGGCCTATCACTTTCACACATGTATTTG
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GCTTGAACTAGGTTAAGGATGCCTTTTCTTTGAGGTGTTGTTGGTAGATTGTTAGGAAGTTGAAACTTGATATAGAATTTTTTCTCCCTAGCCATCGATCTATTCCCATCCTAACTTTTTCTTCGTTTCCATTTTTACACACTAGCCAATTCCCCATTAGCGGGAAGGCTAAAGCCATGCACTTCCATACTATTTACGCA
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ATTAATAATGCTTCAATATAGCTTGAATATCTCCTTCAAAAAAGCATCTCTCCTTGAACCATTATAGAGTAAAAGATCATCCGGAAAAAGGAAATGAGTCAATGTAAGAGATCTCCTTATCCTTATTGGGGTGGCAGGTGCGGGTGGGATTCTTTTTGATCCCGGAGGAAATAAAATTGCAGCCTTCTCGTGGGGATTAG
GTAGGAAAACTAATAATGAGGCAGAATGGTTAGCTCTCATTCTCTCTTTAGATATGGCCTCCAACTACAGCATAGACAATCTCAGAATCTATGGAGACTCCAGGCACGTCATTCAAATCATGAGAAGAGGGTATGCCTCGCCAGGCTCAAAAGCCGACAGATACATGCAAAGAATTAAAACCAATGCAATCCTCTCAAGG
GCATCCTTCTTCCACATCCGTCGAGAGAACAATAGGATGGCTGATATAGCGGCTAACCATGGAATTATGCTCGAAGTCGGGCGCGTCAAGGATCACAATGGAGTTTTGGGGTATCATTACATCCCTTAATGTTCAATGCCTAGGTTCATCGTTTTCATGGTTGGTTCTTTGGTTAGGGCCTTGGTCATGAGGGACCACCC
CTTCCCTTTCATAAGCCATGGTTATATTTCCCCTCCCCCCTCCGAATCTTCACCCACACGCCTCCCTGATCGCTCCTCCACCTGTCACTTCGTCCTCCCTCTTGGTGTCTGCTCCCACGGGGCTCTATTAACTCTCCCACCCGCCCTCTCTATTCCTCCCTCTGCGATGGCTCGCCCTCCCCATTTGCCTGAAGCTCTGA
GTTGCCTCTCCCTCGGCGAGCTTGACACCCCTCCTCCCCGTCTCTTGCTGGCTCAGGCGTATAATTGGGAAATAATGCAGTCCGTGATGGCGGCCATAGCCGCTCTGAGCAGAACGTTGGTGGACATAAAGTTTGCAGTTCGTAATACCTATGATGCGGTTTGCTCCAATGTTAACCAGAATGCAGAGATGGCGTCGGAC
ATTACTCATGTGTGCTCACAGCTCTCCTGCCAGGACTCCAGGATTGACGACCTGGAACGAAATTTATTCGAATTAATGGGGAAAGTTGACAGGTTGCAGGAAGATATGGCCGTTTTTACTGGAGCAACTCAGGGGAGTTGGGTGCATGAAAACCCCACGGTTAATCAGGAAATTAATCAGGTTATGGTGGATGCTTCTTC
TGCTCAGCCAAAGAAGTATGGCTAGGACACAGCACAACCCAGGTTTCAACAATTTTGCTCATTTTGGTCAATGCATTTTTGTATAATCCTTTGTAGACAGTTTGTTAAGGTTGATTCCAGCTCTATGCTGGATAATTTCAGGAAAACAAAGCTCAGAGCTTGTAATGTAATGCAGATAGAAAATATAGTGTTAGTAGGCC
CAGACATTTCTGCACTGTTAAGACTCCTTCTGAAAGTTTGTAATGAATAGCTGTGCACAGCTTTATAAATATAATCCTTTACTCTGTTACTGTTAAAAATTAAAAAAAAAAGATCTCCTTATCCTTATACATTTTACAAATCCCATTCTTGTTACTTATAGTAAAGATCACATGAGCCCTTTAGCTGCTATTAGAAATAG
CAGAGGTGATAAAGGGTGTCCCTGTGTTAGCCCTTTTGCCTTGTTTCAATGCTTTTGATGGTATACTAAAAGTGGATGTTGATCCGTTGATTAAGCCTGCAAACAATACTGATGTCATGCAATTTATTATCGAGTTCAGTAAATGCACATAAAAACAAATTTGTATCAACATCAACCTCAAATACAACTAGTTTGCCCAA
TCATATGCTTTATAAAGATTAAAGTTTAGAACCATAGTCGAGAATTTTTTTGTTTCAATAGTATGCTTCCTTTCTTGTGCCACTCCTATAGCATCGTGTATTTATTTACTATGGAGGAGCACAAATTACACTTTTGAAATTGTTTGATAGCATATTCTTTACTCTTTGTAAATTTCCTTAAAATCCACTCTAGGGCTAGA
GTATGCTGGATTAATTAATTAAACCCAAATTATTACTGTTAACCACACATGGATTTCTTCACCAAAATAAAATGCAGCGGAAATAAAACACTGAGAGAAATATCAATCACACAATAGACACAAATCTTTTTGGGTATAAACCCCCGGACAAAACCCAAGATGGGAAAACCGGTGCAGCAGTCTGAGAAGAATTTTATTGT
GAAG