NA ----> NA

Intron 1 GTATGTTTTT ... GTAGTTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	51.57	19	19	21.5
A2	56.4	17	15	29
A3	28	9	4	3
A4	50	12	11	13
A5	36.8	12	7	7
A6	35.9	4	3	1.5
A7	4.84	14	0	1.5
A8	33.33	2	2	0
A9	30.3	4	0	3.5
A10	100	0	0	4

>TRINITY_DN114359_c0_g1_i2 from sample A1 / Example spliced isoform

CGTTTTCCATGACCCAATTGATAATTTGTTTCATGCTTTTCCCATCTGCCATGTGAGTGGGTTGGGTTTCTCCATTGATAATTCACAACTGTGCAGCCGCAGCCTATGATACGCTGAATTGTGGATTTTCTTTGGTTGTTTTCGGCTGCATGCAAGCTATGGTACCCATAGCATAACATGTGGCACACCGATTAAAAAAA
CAATATAGCTTATTCCGAATATCGTCCTGAAACTTTCTTGGTATTTTGATTCTATGGGTACGTCAAACGGACCCCGGTGAAAACTTATGCGGCTAATTTTGGGTACAAGTTCCAAGTCCTTAGTCGTGTAGTATGCTTCAATGGTTTGGCAACAGGGTGGGATATCAAACAAACAGAAAACTTGAACTTTCGACGAGCTC
TCAGAGGTGGGCGAGTTCCTTACAGATATCTACACCATGGTGGTGTGTAAATGCCACAAGGCAACACAGCTATATTGTTTCATGCACAAAGTCCCTGTCTGTGGAGATTGTGTATGCCTCCCTGAACATAGCACGTGTGAGGTTAAAACTTATTCAGAATGGATTGTGGATGGCTTTCATGAATCCTCCAGGTGTAGCTC
ATGCTCACAAACATTCAATAATACAAATGACCCTGTCATTCGGCTGAGCTGCTTACATGTTCTGCACACTCACTGTTTGCTTCAACTTTTGCAAAGGGCTCCATCTGCAGAAGGTTACACATGCCCTTCATGCACGTCAAAGATATGGCCTCTGAAGCAACATCTTGTCAAATCAAATTCCATGCTCTGCAAAAGAATTG
AGGAAGTTATTGTAAAGGACCTACAAATCTGACGTTTTCCTTGAAGATCAAGCACCACATATATGTTGAGAATTTTACCATGTCCTATATAGAGAAGCTTGCTGATTGCTGCAACAGTAATTCAGATAGTCTAATATACTTAAAACTCTCCCCTTTTTCCTGTTGCAGAGTACAACATTGAACAACAGAACTGATGCACT
GTTACAATTATCAGAACCATTACCCAATTTAACAGACACCCCTTTTGTGTCTGGCCAAGAGTGCCTGTTGCCTAATGTTACACCTCATACGGCAGATTCTACTTTGTTAACATCTTGTACAGCATTAAATGAGGAGCAGCCAATGCCAGAAATGCATTTAAACAACAATCACGGTGACCACTGTTTCCCAGCAGAGAACA
ATGACAAAGCTTCAATATTGAGCATAAAGATAGATATTGAAGCTGCAGATTCCAGTTCAACTGAAAATTTTGGTGCAAAGTCTGCTGGAAACCCAAAGTTTACAAAAGTCCTGTCTCGAAAATTTTCTAGAGGTGACAAAAGAACTAATGACTGTCCCGTTGAAGAAGAAACTGGCAGAGGGTCCAAGTATACACCAAAA
GGTCTACAAACAGAATTTCTTGAGTCTCTTTTGCCGTGCAATTCACCCAAAAAAGTGATCCTTCCTATAATGGCACCAGCACAACATAAGGAAACTGACTCTCGTAGCCGACAAGATTTAACTGATGGTCGATGGCGGAGATACAAGCGCTCTGCGTCATTGGATCCAAGGAAAATCCTTTTCACTTTTGCAACACTGTA
ATAACCTAACCTGATGCAGTGAGTTTTATTTTGTTTTTTAATTGTTGATTGGTCTCGCATTTACAATTTTTTTCTTATTTTTGCTTCTGCATTATTCACAT

>TRINITY_DN114359_c0_g1_i7 from sample A1 / Example unspliced isoform:

CGTTTTCCATGACCCAATTGATAATTTGTTTCATGCTTTTCCCATCTGCCATGTGAGTGGGTTGGGTTTCTCCATTGATAATTCACAACTGTGCAGCCGCAGCCTATGATACGCTGAATTGTGGATTTTCTTTGGTTGTTTTCGGCTGCATGCAAGCTATGGTACCCATAGCATAACATGTGGCACACCGATTAAAAAAA
CAATATAGCTTATTCCGAATATCGTCCTGAAACTTTCTTGGTATTTTGATTCTATGGGTACGTCAAACGGACCCCGGTGAAAACTTATGCGGCTAATTTTGGGTACAAGTTCCAAGTCCTTAGTCGTGTAGTATGCTTCAATGGTTTGGCAACAGGGTGGGATATCAAACAAACAGAAAACTTGAACTTTCGACGAGCTC
TCAGAGGTGGGCGAGTTCCTTACAGATATCTACACCATGGTGGTGTGTAAATGCCACAAGgtatgttttttctttctttaaattgttgggctattgatcttctgtccttgtttttaaatttgaattcatccactttcctttttcaataaaacaatactcagttcttgaattctgagatgtttacagctccaaatttgggc
tctaaccatgtatgtttgtaatttggaatgaaaaatcaccaaagaaatagcagcctgagattgcttgatgcgaacgaaaaaacaaaaagacaaacaccgtgattcacaatattacgttgggtaaatttttgaaagctggcagtaatttcaatacagatgttccctaaaagttcatggccatgagaaaccagagagtgtca
tcatttttccaatttgcgaacttatttccaacgctggattaatgccatcaatttatttttttctttcctgcttgggtctatttcttttgtcggtttagggtctgtttgtatatacccgttttgaaatctgaacatggcttatggcggaacataaagaacagtatgatgtacacagtatattaaatttaaatctatgtcat
tcgggcttagttggctgtagagcaggtgtgttgctattccccaccaagtttcaaatcatcccagaaaaatgttcaaatctcccagaaacatattagcccccgatacgctcatctgcttaattgcttccatgaattgtgagacatgtgtttcactgtaatatcccttgttgaaaggtgcagctgactggaaggttgtgaaa
aaataaaatctacaatttgagttcaataattgcgatctcagagagaaaagaaaaagggggaaaacaatactgttgcttgaatttaaaatactatctaatggtggggagaataatttgaatttttttatgaatgctatatttgacatgattggttgtagttgcagGCAACACAGCTATATTGTTTCATGCACAAAGTCCCT
GTCTGTGGAGATTGTGTATGCCTCCCTGAACATAGCACGTGTGAGGTATGACGGGCTTCTTTGGGCAAATGGTCATGCTTCTGAATAAAAGGAGTTATAATCTTCTGGATGTGTTTTTATTATCACCGCTTTTAATGTTTGTGATGATGCTTTACAACATTTTAATGGTTGGCACGGTCTCGTGTTATATCTGGTCTTGA
TGGGATTTCAGGTTAAAACTTATTCAGAATGGATTGTGGATGGCTTTCATGAATCCTCCAGGTGTAGCTCATGCTCACAAACATTCAATAATACAATGACCCTGTCATTCGGCTGAGCTGCTTACGTAAGTAGGCTTTCTTTTCATTTTAAAGCCTTCCCATTCCCATCTAAGGCATCCATGATACCTGAGACTTTATGT
TAATATGTAAGGCTTCTTATTGTCGAGTACAACATTAACAGGCAGTATTTTGCTC

Intron 2 GTAAGTAGGC ... TTTGCTCCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	24.13	18	8.5	3
A2	23.25	20	5	7.5
A3	40.66	7	4	5.5
A4	38.46	4	2	3
A5	0	7	0	0
A6	0	2	0	0
A7	66.66	3	6	0
A8	-1	0	0	0
A9	10	2	0.5	0
A10	-1	0	0	0

>TRINITY_DN107533_c0_g1_i3 from sample A2 / Example spliced isoform

CGCTTACCTGCCCAACTGAACAGGAACAGCTTTTCTTCAAGTCATTCATCTCTCTAGAGAGTCTAGACTATATTTTCCCTCCTTTCCAATCCCAGTGCTCCAATTTCCAATGGCTGTGGAATGACGTTTTTCCATGACCCAATTGATAATTTGTTTCATGCTTTTCCCATCTGCCATGTGAGTGGGTTGGGTTTCTCCAT
TGATGTAAGTATCAACTGTAAAATCCCCTTAGTTTCCGCTCGTAACCGTTTTACAGTCTGACTCTTTTTTTGAGGATTTTGTGAAAATCCCATGGAATATTGTGCTCTGTTTTGGCAGAATTCACAACTGTGCAGCCGCAGCCTATGATACGCTGAATTGTGGATTTTCTTTGGTTGTTTTCGGCTGCATGCAAGCTATG
GTACCCATAGCATAACATGTGGCACACCGATTAAAAAAACAATATAGCTTATTCCGAATATCGTCCTGAAACTTTCTTGGTATTTTGATTCTATGGGTACGTCAAACGGACCCCGGTGAAAACTTATGCGGCTAATTTTGGGTACAAGTTCCAAGTCCTTAGTCGTGTAGTATGCTTCAATGGTTTGGCAACAGGGTGGG
ATATCAAACAAACAGAAAACTTGAACTTTCGACGAGCTCTCAGAGGTGGGCGAGTTCCTTACAGATATCTACACCATGGTGGTGTGTAAATGCCACAAGGCAACACAGCTATATTGTTTCATGCACAAAGTCCCTGTCTGTGGAGATTGTGTATGCCTCCCTGAACATAGCACGTGTGAGGTTAAAACTTATTCAGAATG
GATTGTGGATGGCTTTCATGAATCCTCCAGGTGTAGCTCATGCTCACAAACATTCAATAATACAAATGACCCTGTCATTCGGCTGAGCTGCTTACATGTTCTGCACACTCACTGTTTGCTTCAACTTTTGCAAAGGGCTCCATCTGCAGAAGGTTACACATGCCCTTCATGCACGTCAAAGATATGGCCTCTGAAGCAAC
ATCTTGTCAAATCAAATTCCATGCTCTGCAAAAGAATTGAGGAAGTTATTGTAAAGGACCTACAAATCTGACGTTTTCCTTGAAGATCAAGCACCACATATATGTTGAGG

>TRINITY_DN107533_c0_g1_i5 from sample A2 / Example unspliced isoform:

CGCTTACCTGCCCAACTGAACAGGAACAGCTTTTCTTCAAGTCATTCATCTCTCTAGAGAGTCTAGACTATATTTTCCCTCCTTTCCAATCCCAGTGCTCCAATTTCCAATGGCTGTGGAATGACGTTTTTCCATGACCCAATTGATAATTTGTTTCATGCTTTTCCCATCTGCCATGTGAGTGGGTTGGGTTTCTCCAT
TGATGTAAGTATCAACTGTAAAATCCCCTTAGTTTCCGCTCGTAACCGTTTTACAGTCTGACTCTTTTTTTGAGGATTTTGTGAAAATCCCATGGAATATTGTGCTCTGTTTTGGCAGAATTCACAACTGTGCAGCCGCAGCCTATGATACGCTGAATTGTGGATTTTCTTTGGTTGTTTTCGGCTGCATGCAAGCTATG
GTACCCATAGCATAACATGTGGCACACCGATTAAAAAAACAATATAGCTTATTCCGAATATCGTCCTGAAACTTTCTTGGTATTTTGATTCTATGGGTACGTCAAACGGACCCCGGTGAAAACTTATGCGGCTAATTTTGGGTACAAGTTCCAAGTCCTTAGTCGTGTAGTATGCTTCAATGGTTTGGCAACAGGGTGGG
ATATCAAACAAACAGAAAACTTGAACTTTCGACGAGCTCTCAGAGGTGGGCGAGTTCCTTACAGATATCTACACCATGGTGGTGTGTAAATGCCACAAGGTATGTTTTTTCTTTCTTTAAATTGTTGGGCTATTGATCTTCTGTCCTTGTTTTTAAATTTGAATTCATCCACTTTCCTTTTTCAATAAAACAATACTCAG
TTCTTGAATTCTGAGATGTTTACAGCTCCAAATTTGGGCTCTAACCATGTATGTTTGTAATTTGGAATGAAAAATCACCAAAGAAATAGCAGCCTGAGATTGCTTGATGCGAACGAAAAAACAAAAAGACAAACACCGTGATTCACAATATTACGTTGGGTAAATTTTTGAAAGCTGGCAGTAATTTCAATACAGATGTT
CCCTAAAAGTTCATGGCCATGAGAAACCAGAGAGTGTCATCATTTTTCCAATTTGCGAACTTATTTCCAACGCTGGATTAATGCCATCAATTTATTTTTTTCTTTCCTGCTTGGGTCTATTTCTTTTGTCGGTTTAGGGCCTGTTTGTATATACCCGTTTTGAAATCTGAACATGGCTTATGGCGGAACATAAAGAACAG
TATGATGTACACAGTATATTAAATTTAAATCTATGTCATTCGGGCTTAGTTGGCTGTAGAGCAGGTGTGTTGCTATTCCCCACCAAGTTTCAAATCATCCCAGAAAAATGTTCAAATCTCCCAGAAACATATTAGCCCCCGATACGCTCATCTGCTTAATTGCTTCCATGAATTGTGAGACATGTGTTTCACTGTAATAT
CCCTTGTTGAAAGGTGCAGCTGACTGGAAGGTTGTGAAAAAATAAAATCTACAATTTGAGTTCAATAATTGCGATCTCAGAGAGAAAAGAAAAAGGGGGAAAACAATACTGTTGCTTGAATTTAAAATACTATCTAATGGTGGGGAGAATAATTTGAATTTTTTTATGAATGCTATATTTGACATGATTGGTTGTAGTTG
CAGGCAACACAGCTATATTGTTTCATGCACAAAGTCCCTGTCTGTGGAGATTGTGTATGCCTCCCTGAACATAGCACGTGTGAGGTTAAAACTTATTCAGAATGGATTGTGGATGGCTTTCATGAATCCTCCAGGTGTAGCTCATGCTCACAAACATTCAATAATACAAATGACCCTGTCATTCGGCTGAGCTGCTTACg
taagtaggctttcttttcattttaaagccttcccattcccatctaaggcatccatgatacctgagactttatgttaatatgtaaggcttcttattgtcgagtacaacattaacaggcagtattttgctccagATGTTCTGCACACTCACTGTTTGCTTCAACTTTTGCAAAGGGCTCCATCTGCAGAAGGTTACACATGC
CCTTCATGCACGTCAAAGGTAAATTTATCTCCACGTTTTTCAGGACATACAACACTGTTTATGGGTTTTCATGTGTGGGCCTGTTGCAGAAGCCTTGAGGATACATGTTAAATTTGACTCTTGCTGGTATTTGTATCCTTCATGGGTATTTTCATCTGTAGCTTGAATATAGTATAATGAACCATTCTTA

Intron 3 GTAAGTATCA ... GTTTTGGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	55.56	4	4	6
A2	85.95	1	7.3	5
A3	90	1.3	8.3	3
A4	61.68	6	7.8	11
A5	93.75	0.8	8.8	7
A6	100	0	1	1
A7	100	0	0	1
A8	-1	0	0	0
A9	25	0	0.3	0
A10	-1	0	0	0

>TRINITY_DN114359_c0_g1_i4 from sample A1 / Example spliced isoform

CGTTTTCCATGACCCAATTGATAATTTGTTTCATGCTTTTCCCATCTGCCATGTGAGTGGGTTGGGTTTCTCCATTGATAATTCACAACTGTGCAGCCGCAGCCTATGATACGCTGAATTGTGGATTTTCTTTGGTTGTTTTCGGCTGCATGCAAGCTATGGTACCCATAGCATAACATGTGGCACACCGATTAAAAAAA
CAATATAGCTTATTCCGAATATCGTCCTGAAACTTTCTTGGTATTTTGATTCTATGGGTACGTCAAACGGACCCCGGTGAAAACTTATGCGGCTAATTTTGGGTACAAGTTCCAAGTCCTTAGTCGTGTAGTATGCTTCAATGGTTTGGCAACAGGGTGGGATATCAAACAAACAGAAAACTTGAACTTTCGACGAGCTC
TCAGAGGTGGGCGAGTTCCTTACAGATATCTACACCATGGTGGTGTGTAAATGCCACAAGGTATGTTTTTTCTTTCTTTAAATTGTTGGGCTATTGATCTTCTGTCCTTGTTTTTAAATTTGAATTCATCCACTTTCCTTTTTCAATAAAACAATACTCAGTTCTTGAATTCTGAGATGTTTACAGCTCCAAATTTGGGC
TCTAACCATGTATGTTTGTAATTTGGAATGAAAAATCACCAAAGAAATAGCAGCCTGAGATTGCTTGATGCGAACGAAAAAACAAAAAGACAAACACCGTGATTCACAATATTACGTTGGGTAAATTTTTGAAAGCTGGCAGTAATTTCAATACAGATGTTCCCTAAAAGTTCATGGCCATGAGAAACCAGAGAGTGTCA
TCATTTTTCCAATTTGCGAACTTATTTCCAACGCTGGATTAATGCCATCAATTTATTTTTTTCTTTCCTGCTTGGGTCTATTTCTTTTGTCGGTTTAGGGTCTGTTTGTATATACCCGTTTTGAAATCTGAACATGGCTTATGGCGGAACATAAAGAACAGTATGATGTACACAGTATATTAAATTTAAATCTATGTCAT
TCGGGCTTAGTTGGCTGTAGAGCAGGTGTGTTGCTATTCCCCACCAAGTTTCAAATCATCCCAGAAAAATGTTCAAATCTCCCAGAAACATATTAGCCCCCGATACGCTCATCTGCTTAATTGCTTCCATGAATTGTGAGACATGTGTTTCACTGTAATATCCCTTGTTGAAAGGTGCAGCTGACTGGAAGGTTGTGAAA
AAATAAAATCTACAATTTGAGTTCAATAATTGCGATCTCAGAGAGAAAAGAAAAAGGGGGAAAACAATACTGTTGCTTGAATTTAAAATACTATCTAATGGTGGGGAGAATAATTTGAATTTTTTTATGAATGCTATATTTGACATGATTGGTTGTAGTTGCAGGCAACACAGCTATATTGTTTCATGCACAAAGTCCCT
GTCTGTGGAGATTGTGTATGCCTCCCTGAACATAGCACGTGTGAGGTTAAAACTTATTCAGAATGGATTGTGGATGGCTTTCATGAATCCTCCAGGTGTAGCTCATGCTCACAAACATTCAATAATACAAATGACCCTGTCATTCGGCTGAGCTGCTTACATGTTCTGCACACTCACTGTTTGCTTCAACTTTTGCAAAG
GGCTCCATCTGCAGAAGGTTACACATGCCCTTCATGCACGTCAAAGGTAAATTTATCTCCACGTTTTTCAGGACATACAACACTGTTTATGGGTTTTCATGTGTGG

>TRINITY_DN114359_c0_g1_i3 from sample A1 / Example unspliced isoform:

CGTTTTCCATGACCCAATTGATAATTTGTTTCATGCTTTTCCCATCTGCCATGTGAGTGGGTTGGGTTTCTCCATTGATgtaagtatcaactgtaaaatccccttagtttccgctcgtaaccgttttacagtctgactctttttttgaggattttgtgaaaatcccatggaatattgtgctctgttttggcagAATTCAC
AACTGTGCAGCCGCAGCCTATGATACGCTGAATTGTGGATTTTCTTTGGTTGTTTTCGGCTGCATGCAAGCTATGGTACCCATAGCATAACATGTGGCACACCGATTAAAAAAACAATATAGCTTATTCCGAATATCGTCCTGAAACTTTCTTGGTATTTTGATTCTATGGGTACGTCAAACGGACCCCGGTGAAAACTT
ATGCGGCTAATTTTGGGTACAAGTTCCAAGTCCTTAGTCGTGTAGTATGCTTCAATGGTTTGGCAACAGGGTGGGATATCAAACAAACAGAAAACTTGAACTTTCGACGAGCTCTCAGAGGTGGGCGAGTTCCTTACAGATATCTACACCATGGTGGTGTGTAAATGCCACAAGGTATGTTTTTTCTTTCTTTAAATTGT
TGGGCTATTGATCTTCTGTCCTTGTTTTTAAATTTGAATTCATCCACTTTCCTTTTTCAATAAAACAATACTCAGTTCTTGAATTCTGAGATGTTTACAGCTCCAAATTTGGGCTCTAACCATGTATGTTTGTAATTTGGAATGAAAAATCACCAAAGAAATAGCAGCCTGAGATTGCTTGATGCGAACGAAAAAACAAA
AAGACAAACACCGTGATTCACAATATTACGTTGGGTAAATTTTTGAAAGCTGGCAGTAATTTCAATACAGATGTTCCCTAAAAGTTCATGGCCATGAGAAACCAGAGAGTGTCATCATTTTTCCAATTTGCGAACTTATTTCCAACGCTGGATTAATGCCATCAATTTATTTTTTTCTTTCCTGCTTGGGTCTATTTCTT
TTGTCGGTTTAGGGTCTGTTTGTATATACCCGTTTTGAAATCTGAACATGGCTTATGGCGGAACATAAAGAACAGTATGATGTACACAGTATATTAAATTTAAATCTATGTCATTCGGGCTTAGTTGGCTGTAGAGCAGGTGTGTTGCTATTCCCCACCAAGTTTCAAATCATCCCAGAAAAATGTTCAAATCTCCCAGA
AACATATTAGCCCCCGATACGCTCATCTGCTTAATTGCTTCCATGAATTGTGAGACATGTGTTTCACTGTAATATCCCTTGTTGAAAGGTGCAGCTGACTGGAAGGTTGTGAAAAAATAAAATCTACAATTTGAGTTCAATAATTGCGATCTCAGAGAGAAAAGAAAAAGGGGGAAAACAATACTGTTGCTTGAATTTAA
AATACTATCTAATGGTGGGGAGAATAATTTGAATTTTTTTATGAATGCTATATTTGACATGATTGGTTGTAGTTGCAGGCAACACAGCTATATTGTTTCATGCACAAAGTCCCTGTCTGTGGAGATTGTGTATGCCTCCCTGAACATAGCACGTGTGAGGTATGACGGGCTTCTTTGGGCAAATGGTCATGCTTCTGAAT
AAAAGGAGTTATAATCTTCTGGATGTGTTTTTATTATCACCGCTTTTAATGTTTGTGATGATGCTTTACAACATTTTAATGGTTGGCACGGTCTCGTGTTATATCTGGTCTTGATGGGATTTCAGGTTAAAACTTATTCAGAATGGATTGTGGATGGCTTTCATGAATCCTCCAGGTGTAGCTCATGCTCACAAACATTC
AATAATACAATGACCCTGTCATTCGGCTGAGCTGCTTACGTAAGTAGGCTTTCTTTTCATTTTAAAGCCTTCCCATTCCCATCTAAGGCATCCATGATACCTGAGACTTTATGTTAATATGTAAGGCTTCTTATTGTCGAGTACAACATTAACAGGCAGTATTTTGCTC

Intron 4 GTATGACGGG ... GGGATTTCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	41.41	14.7	11	9
A2	34.59	14.3	11	3.7
A3	47.62	6.7	6	6
A4	68.38	6	16	2.3
A5	41.75	5.7	6	2
A6	0	1	0	0
A7	39.29	4.7	0	6
A8	-1	0	0	0
A9	20.32	2.3	1	0.2
A10	-1	0	0	0

>TRINITY_DN114359_c0_g1_i4 from sample A1 / Example spliced isoform

CGTTTTCCATGACCCAATTGATAATTTGTTTCATGCTTTTCCCATCTGCCATGTGAGTGGGTTGGGTTTCTCCATTGATAATTCACAACTGTGCAGCCGCAGCCTATGATACGCTGAATTGTGGATTTTCTTTGGTTGTTTTCGGCTGCATGCAAGCTATGGTACCCATAGCATAACATGTGGCACACCGATTAAAAAAA
CAATATAGCTTATTCCGAATATCGTCCTGAAACTTTCTTGGTATTTTGATTCTATGGGTACGTCAAACGGACCCCGGTGAAAACTTATGCGGCTAATTTTGGGTACAAGTTCCAAGTCCTTAGTCGTGTAGTATGCTTCAATGGTTTGGCAACAGGGTGGGATATCAAACAAACAGAAAACTTGAACTTTCGACGAGCTC
TCAGAGGTGGGCGAGTTCCTTACAGATATCTACACCATGGTGGTGTGTAAATGCCACAAGGTATGTTTTTTCTTTCTTTAAATTGTTGGGCTATTGATCTTCTGTCCTTGTTTTTAAATTTGAATTCATCCACTTTCCTTTTTCAATAAAACAATACTCAGTTCTTGAATTCTGAGATGTTTACAGCTCCAAATTTGGGC
TCTAACCATGTATGTTTGTAATTTGGAATGAAAAATCACCAAAGAAATAGCAGCCTGAGATTGCTTGATGCGAACGAAAAAACAAAAAGACAAACACCGTGATTCACAATATTACGTTGGGTAAATTTTTGAAAGCTGGCAGTAATTTCAATACAGATGTTCCCTAAAAGTTCATGGCCATGAGAAACCAGAGAGTGTCA
TCATTTTTCCAATTTGCGAACTTATTTCCAACGCTGGATTAATGCCATCAATTTATTTTTTTCTTTCCTGCTTGGGTCTATTTCTTTTGTCGGTTTAGGGTCTGTTTGTATATACCCGTTTTGAAATCTGAACATGGCTTATGGCGGAACATAAAGAACAGTATGATGTACACAGTATATTAAATTTAAATCTATGTCAT
TCGGGCTTAGTTGGCTGTAGAGCAGGTGTGTTGCTATTCCCCACCAAGTTTCAAATCATCCCAGAAAAATGTTCAAATCTCCCAGAAACATATTAGCCCCCGATACGCTCATCTGCTTAATTGCTTCCATGAATTGTGAGACATGTGTTTCACTGTAATATCCCTTGTTGAAAGGTGCAGCTGACTGGAAGGTTGTGAAA
AAATAAAATCTACAATTTGAGTTCAATAATTGCGATCTCAGAGAGAAAAGAAAAAGGGGGAAAACAATACTGTTGCTTGAATTTAAAATACTATCTAATGGTGGGGAGAATAATTTGAATTTTTTTATGAATGCTATATTTGACATGATTGGTTGTAGTTGCAGGCAACACAGCTATATTGTTTCATGCACAAAGTCCCT
GTCTGTGGAGATTGTGTATGCCTCCCTGAACATAGCACGTGTGAGGTTAAAACTTATTCAGAATGGATTGTGGATGGCTTTCATGAATCCTCCAGGTGTAGCTCATGCTCACAAACATTCAATAATACAAATGACCCTGTCATTCGGCTGAGCTGCTTACATGTTCTGCACACTCACTGTTTGCTTCAACTTTTGCAAAG
GGCTCCATCTGCAGAAGGTTACACATGCCCTTCATGCACGTCAAAGGTAAATTTATCTCCACGTTTTTCAGGACATACAACACTGTTTATGGGTTTTCATGTGTGG

>TRINITY_DN114359_c0_g1_i3 from sample A1 / Example unspliced isoform:

CGTTTTCCATGACCCAATTGATAATTTGTTTCATGCTTTTCCCATCTGCCATGTGAGTGGGTTGGGTTTCTCCATTGATGTAAGTATCAACTGTAAAATCCCCTTAGTTTCCGCTCGTAACCGTTTTACAGTCTGACTCTTTTTTTGAGGATTTTGTGAAAATCCCATGGAATATTGTGCTCTGTTTTGGCAGAATTCAC
AACTGTGCAGCCGCAGCCTATGATACGCTGAATTGTGGATTTTCTTTGGTTGTTTTCGGCTGCATGCAAGCTATGGTACCCATAGCATAACATGTGGCACACCGATTAAAAAAACAATATAGCTTATTCCGAATATCGTCCTGAAACTTTCTTGGTATTTTGATTCTATGGGTACGTCAAACGGACCCCGGTGAAAACTT
ATGCGGCTAATTTTGGGTACAAGTTCCAAGTCCTTAGTCGTGTAGTATGCTTCAATGGTTTGGCAACAGGGTGGGATATCAAACAAACAGAAAACTTGAACTTTCGACGAGCTCTCAGAGGTGGGCGAGTTCCTTACAGATATCTACACCATGGTGGTGTGTAAATGCCACAAGGTATGTTTTTTCTTTCTTTAAATTGT
TGGGCTATTGATCTTCTGTCCTTGTTTTTAAATTTGAATTCATCCACTTTCCTTTTTCAATAAAACAATACTCAGTTCTTGAATTCTGAGATGTTTACAGCTCCAAATTTGGGCTCTAACCATGTATGTTTGTAATTTGGAATGAAAAATCACCAAAGAAATAGCAGCCTGAGATTGCTTGATGCGAACGAAAAAACAAA
AAGACAAACACCGTGATTCACAATATTACGTTGGGTAAATTTTTGAAAGCTGGCAGTAATTTCAATACAGATGTTCCCTAAAAGTTCATGGCCATGAGAAACCAGAGAGTGTCATCATTTTTCCAATTTGCGAACTTATTTCCAACGCTGGATTAATGCCATCAATTTATTTTTTTCTTTCCTGCTTGGGTCTATTTCTT
TTGTCGGTTTAGGGTCTGTTTGTATATACCCGTTTTGAAATCTGAACATGGCTTATGGCGGAACATAAAGAACAGTATGATGTACACAGTATATTAAATTTAAATCTATGTCATTCGGGCTTAGTTGGCTGTAGAGCAGGTGTGTTGCTATTCCCCACCAAGTTTCAAATCATCCCAGAAAAATGTTCAAATCTCCCAGA
AACATATTAGCCCCCGATACGCTCATCTGCTTAATTGCTTCCATGAATTGTGAGACATGTGTTTCACTGTAATATCCCTTGTTGAAAGGTGCAGCTGACTGGAAGGTTGTGAAAAAATAAAATCTACAATTTGAGTTCAATAATTGCGATCTCAGAGAGAAAAGAAAAAGGGGGAAAACAATACTGTTGCTTGAATTTAA
AATACTATCTAATGGTGGGGAGAATAATTTGAATTTTTTTATGAATGCTATATTTGACATGATTGGTTGTAGTTGCAGGCAACACAGCTATATTGTTTCATGCACAAAGTCCCTGTCTGTGGAGATTGTGTATGCCTCCCTGAACATAGCACGTGTGAGgtatgacgggcttctttgggcaaatggtcatgcttctgaat
aaaaggagttataatcttctggatgtgtttttattatcaccgcttttaatgtttgtgatgatgctttacaacattttaatggttggcacggtctcgtgttatatctggtcttgatgggatttcagGTTAAAACTTATTCAGAATGGATTGTGGATGGCTTTCATGAATCCTCCAGGTGTAGCTCATGCTCACAAACATTC
AATAATACAATGACCCTGTCATTCGGCTGAGCTGCTTACGTAAGTAGGCTTTCTTTTCATTTTAAAGCCTTCCCATTCCCATCTAAGGCATCCATGATACCTGAGACTTTATGTTAATATGTAAGGCTTCTTATTGTCGAGTACAACATTAACAGGCAGTATTTTGCTC