NA ----> NA
Intron 1 GTACTGTGGA ... TTTAAATTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 100 | 0 | 4 | 13 |
| A2 | 100 | 0 | 1 | 4 |
| A3 | 73.91 | 3 | 0 | 17 |
| A4 | 57.89 | 4 | 1 | 10 |
| A5 | 63.64 | 4 | 4 | 10 |
| A6 | 52.38 | 5 | 6 | 5 |
| A7 | 54.39 | 13 | 21 | 10 |
| A8 | 50 | 7 | 3 | 11 |
| A9 | 61.54 | 10 | 17 | 15 |
| A10 | 50 | 24 | 29 | 19 |
>TRINITY_DN48430_c2_g1_i10 from sample A10 / Example spliced isoformAAACGTTTTATGTAAAAGCGGTCTTGATGTAATAAAAAAGCGGTGAAACCAATCAATTTGAATTTTAAAAACGTTTGATGTGATGGAAGTTATTGGATAGCATAAGGGTTAGGTTTGCATTCAAACGTTATTCGAATCCTCTCTTCCCTTTTTGCATCCTCGCCGGCCACTTCACAGGAAAAAAACGAAAAAGGCGATGA
CAACGATGAAGATGAAGGAAGCCTCCGTCCGCCTAAGTTGGGCTCTCTCAGTTCCAGATGTTGGAATACTATTGAAACAGGCAGCCATGATGCCATTTATAGGAGACTCGGCACTCTACAGAGGGTTGATGCCCTTTTCCACGAGACGGCTGACTACATCTTGAATCTTCAAAGGCAAGTTCACGCCATGGAAGTCCTCG
TAGAACTTTACACGATCAACTCTGCAGTGGTTAGGATTGAAATTTCAGATAGTTCAAAGAGCTTTGGCATTTACACTCGGTGACTTCCTATGATAGTCGGGAGGATTATCTGAACTGTGAACCCCAAGTAAAGAAGAAAATAATGGATTGGGTTGTATCATCAGATCTGTTCCTTCGCATGAATTCCTGAGGCGCAGCCC
CAACCGAAGTATTGAGCTGCAACTTGGAGCCGCAGTATTAGCATGGACAATTAAGGAGAGCAGAGCTGATCCCCAAAGCTTCTGTCACATATGTCGCCGGAATTTATTGGACAGCATTAGGTTAGGTTTGCAGGATGAAGGAAATCGACAAATGGGATTCAAGGCTGTGGGTAATTTCTTGTAAAGGGTTTCAGCAACAG
GACCTGTGCTCTTTGATCTACACCCTCTGGGATTTTTTTGTTTTTAGGTTTTTGTCAGTATTCTTGGCACTTGGCATCGATGTTAACGATCGATTAATGGATGACGCCCTTCCCTTGCAGCTCTCCAGAATATAGGTAAAAAATACTTTACAGATTTGATTTGATTTTCTTTGGTTGATTTTGAACTTTGAAATGAATGT
ATTATTACTCCGGTTCATCAACTACTGGGGCTGCTTTAAGAACTCCTACAAAAGAAGGTGAAACTGGAGAGGCTGGTTCAACAGGTGCTGATTCAGCTAATTCTGCTGGTAAAGCTGGGGCTGCTAAAACTAGGACTTCTGAGGAGGCTTCTCCTAGAGATGCTGAAACAATTGCTGCTAGGACTGCTGGTTCAACTGGG
AATACTGAGACTGCAGGGACTGAAGCTTCTGGGGAGGCAGGTTCAATTAGTACTAGAAAGAAAGCTACTTCAACAGGTGATGCTAGGGCTTATAATCCTGGTTATGCTGGTAATTCAACTGGGAATGCTTGGAATGATGAGGCTGGTGATGCTGGTTCAACTGCTCATGGGGATGCTATTGGTAATAAAGCTGCTGGAAA
TTAGGCTGCCATAAATGCTAGAAATGAGGAAAATACTTTACAGATTTGATTTGATTTTCTTTGGTTGATTTTGAACTTTGAAATGAATGTATTATTACTCCACAGACAATTCTAGATAGAAATATTTGTTTCCATCTGCTCATCTCATCCTTCGTAAGTGGAGGTCACAAGAAGCAGAGTGCAACCATGAAAGATGATGA
AGAGAATCATAGCTGGATAGAGACTATTGTAGAGGTAGTCATGCTGTGTGAAGGAGCCCTCCTCTTTCTATTTGTTATGCATGTTCCTTATTTCTTGAAAAGCTACTAAAATTGGGGCTCAACTCGACCGATATTGATCTCGAAAAGCATTTTAAAGCGTGCTTGGTAGGAATTATGCTCCTTTATTTTACATGTTGTTT
TAAGTGGCG
>TRINITY_DN48430_c2_g1_i4 from sample A10 / Example unspliced isoform:AAACGTTTTATGTAAAAGCGGTCTTGATGTAATAAAAAAGCGGTGAAACCAATCAATTTGAATTTTAAAAACGTTTGATGTGATGGAAGTTATTGGATAGCATAAGGGTTAGGTTTGCATTCAAACGTTATTCGAATCCTCTCTTCCCTTTTTGCATCCTCGCCGGCCACTTCACAGGAAAAAAACGAAAAAGGCGATGA
CAACGATGAAGATGAAGGAAGCCTCCGTCCGCCTAAGTTGGGCTCTCTCAGTTCCAGATGTTGGAATACTATTGAAACAGGCAGCCATGATGCCATTTATAGGAGACTCGGCACTCTACAGAGGGTTGATGCCCTTTTCCACGAGACGGCTGACTACATCTTGAATCTTCAAAGGCAAGTTCACGCCATGGAAGTCCTCG
TAGAACTTTACACGATCAACTCTGCAGgtactgtggacgattccatcacacaacagcagcaggaatcaactgggatgggcttatcctgttatgttaactaattcgtctccctattagctttgattgtttgatcatttagacagctacatagattcaattaagcgcatctgtgtccattagggctgaccttggagtagaaa
ataatgcgtttctctattttaatggctctgcttccattatcctgttgttatctctgtttgttttcatgtgaatttgtggctggcacttgggtaatttctgttttatttttaaattagTGGTTAGGATTGAAATTTCAGATAGTTCAAAGAGCTTTGGCATTTACACTCGGTGACTTCCTATGATAGTCGGGAGGATTATC
TGAACTGTGAACCCCAAGTAAAGAAGAAAATAATGGATTGGGTTGTATCATCAGATCTGTTCCTTCGCATGAATTCCTGAGGCGCAGCCCCAACCGAAGTATTGAGCTGCAACTTGGAGCCGCAGTATTAGCATGGACAATTAAGGAGAGCAGAGCTGATCCCCAAAGCTTCTGTCACATATGTCGCCGGAATTTATTGG
ACAGCATTAGGTTAGGTTTGCAGGATGAAGGAAATCGACAAATGGGATTCAAGGCTGTGGGTAATTTCTTGTAAAGGGTTTCAGCAACAGGACCTGTGCTCTTTGATCTACACCCTCTGGGATTTTTTTGTTTTTAGGTTTTTGTCAGTATTCTTGGCACTTGGCATCGATGTTAACGATCGATTAATGGATGACGCCCT
TCCCTTGCAGCTCTCCAGAATATAGGTAAAAAATACTTTACAGATTTGATTTGATTTTCTTTGGTTGATTTTGAACTTTGAAATGAATGTATTATTACTCCGGTTCATCAACTACTGGGGCTGCTTTAAGAACTCCTACAAAAGAAGGTGAAACTGGAGAGGCTGGTTCAACAGGTGCTGATTCAGCTAATTCTGCTGGT
AAAGCTGGGGCTGCTAAAACTAGGACTTCTGAGGAGGCTTCTCCTAGAGATGCTGAAACAATTGCTGCTAGGACTGCTGGTTCAACTGGGAATACTGAGACTGCAGGGACTGAAGCTTCTGGGGAGGCAGGTTCAATTAGTACTAGAAAGAAAGCTACTTCAACAGGTGATGCTAGGGCTTATAATCCTGGTTATGCTGG
TAATTCAACTGGGAATGCTTGGAATGATGAGGCTGGTGATGCTGGTTCAACTGCTCATGGGGATGCTATTGGTAATAAAGCTGCTGGAAATTAGGCTGCCATAAATGCTAGAAATGAGGAAAATACTTTACAGATTTGATTTGATTTTCTTTGGTTGATTTTGAACTTTGAAATGAATGTATTATTACTCCACAGACAAT
TCTAGATAGAAATATTTGTTTCCATCTGCTCATCTCATCCTTCGTAAGTGGAGGTCACAAGAAGCAGAGTGCAACCATGAAAGATGATGAAGAGAATCATAGCTGGATAGAGACTATTGTAGAGGTAGTCATGCTGTGTGAAGGAGCCCTCCTCTTTCTATTTGTTATGCATGTTCCTTATTTCTTGAAAAGCTACTAAA
ATTGGGGCTCAACTCGACCGATATTGATCTCGAAAAGCATTTTAAAGCGTGCTTGGTAGGAATTATGCTCCTTTATTTTACATGTTGTTTTAAGTGGCG