sp|Q8RVL2|DEK1_ARATH ----> Calpain-type cysteine protease DEK1
Intron 1 GTAAACATTG ... CCAATTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 16.46 | 33 | 6 | 7 |
| A2 | 32.35 | 23 | 7 | 15 |
| A3 | 32.14 | 19 | 9 | 9 |
| A4 | 30.77 | 36 | 8 | 24 |
| A5 | 33.33 | 15 | 7 | 8 |
| A6 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A7 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A8 | 33.33 | 1 | 0 | 1 |
| A9 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A10 | 0 | 4 | 0 | 0 |
>TRINITY_DN101464_c0_g2_i6 from sample A5 / Example spliced isoformATCTAAGCCTAGAAAGCTGGGTTTTTGCAAGGAAATGGCCATCATTTCTTCAAGGTCCACAGTTGAGTGCAGTCTCAGGGTTTTTATCACTCGTAGCTTGGGCTGTTGTTCTTTCACCAATAGTTGTGGTAATTGCTTGGGGTACTAGGTTGATGATTATTTTAGATCGAGATATAATTGGGCTGGCAGTTATCATGGCT
GGAACGGCTCTGCTCTTGGCATTTTATGCTATCATGCTTTGGTGGAGAACTCAGTGGCAGAGTTCAAGAGCTGTTGCAATACTGCTGCTCTTGGCCATTTCATTACTTTGTGGATACGAAATTTCGGCTGTTTATGTAACAGCAGGCAGGAATGTATATTCAGCATCTGGGTTTTTCTTTGGTGTTTCGGCAATAGCTCT
AGCAATCAACATGCTTTTTATATGCAGAATGGTTTTTCATGGAGCAGGTCTAGATGTAGATGAATATGTCCGGAGGTCCTATAAGTTTGCTTATGCGGATGGTATTGAAGTTGGTCCGGTTGCCTGTTTACCAGAACCTCCAAATCTCAATGATTCTTTAATACGAAAGCCAAACAGAACTTCCCACTTGGGGTGTCTAT
ACTTTGGGTCTCTGGTTGTACTTCTTGTGTATTCCATTCTATATGGTCTGACTGCCCAGAAGGCACGCTGGTTGGGAGTAATAACATCAATTACAGTTGTTGTTCTGGATTCAAATGTGGGAGCATGTTTATTTGGGTTTGAGCTTCTCAAAAGTCGAATTGCTGCTTTGTTTGTGGCCGGAATATACAGGGTTTTCTTA
ATATGCTTTGGAGTACATTATTGGTATCTTGGTCATTGCATTAGCTATGCAGTGGTGGCTTCAGTGTTGTTAGGGGCAGCTGTTACTCGCCATTTATCAGTTTTGAGTCCATCAGCTGCAAGGAGAGATGCATTGGAGAGCACTGTAATTCGTCTGAGGGAGGGATTTAGGAGGAAAAGTCCTGGCAGTTCTTCAAGTTT
CTCTGAAGGTTGTGAATCAAGTGCAAAGCGTAGCAGTAGTGTTGAAGCTGCTCAAATTGGAACTGCAATTGAAGCTATCTGCAGTAGTAATGTGCAAGGTCAAAGTGATAGTGGGGCAGCTTGGAATGGTATGACACATGCTGGAGCTGAAGATTCTCAAGAGGACGTAAATAGTGCCAAGAGCTTGGATAGTGGAAGGC
CAAGTTTGGCATTACACAATAGTTCTTGTCCTTCCACTGCCCTTGAATCTGACAATGGAATAACTTCAGTGGATCAGCAACCAGAAAGACACTGCTCAGAACGCAACAAGCATCCAGCAGTTTGTTCAAGTAGTGGAACCGAAAGTCACGGGTTTGAGTCAAATACATCAGGAGGGACTTCGGATAATCAGCAAAGCCTG
GATTTGACATTAGCAAGGGTTTTCCAGGAAAGATTGAATGATCCAAGGATTAGTTCAATGTTAAAACTCAAAGCAAGACAAGGAGATCAGGAATTAACCAGTCTTTTGCAGGATAAAGGGCTTGATCCTAATTTTGCTGTGATGCTTAAGGAGAAGGGCCTTGACCCAACAATTCTAGCATTGCTGCAGAGAAGCAGTCT
TGATGCAGATAGAGATCACAGAGATAACACAGAAGATGCAGGCATTGATCCAAATACAATGGAAAATGCTGTTTTGAATCAACTTTCATGGTCAGAGGAGCTAAGGCGACAGGGATTTGAAAAATGGATTCAAACTATTCGTTTTGTAGTGAGACAGTTGGCAGGCACTCCAGAGCGTGCTTGGGTCCTTTTCAGCTTTA
TTTTTATCTTGGAAACAATTACTGTAGCTATATTCCGTCCAAAAATTGTAAAAATAATAAATGCTACTCATGAACAGTTTGAATTTGGCTTTTCAGCATTGCTGCTGTCTCCGGTTTTTTGTTCAGTCATGGCTTTCATTCGTTCACTTCAAGCAGAAGATATGGCAATGACATCTAAGCCTAGAAAGTATTGCTTCATT
GCATGGCTCATGAGCACCTGTGTTGGCTTGCTTCTCTCCTTCTTAAGTAAATCTTCTATTCTCCTTGGCTTGGCATTAACAGTGCCGCTGATGGTGGCATGCCTTTCTGTAGCGATTCCAATTTGGATAAACAATGGATATCGTTTTTGCATGCCTCCCACAGATCAAACAAGCAATATGCAAGGCTGCTGTCGTAAGTC
AAAAGAGGGTCTTGCCATGGGGATATCTGTAACCATATTCATTTTTTCTGTTATAGCCTTGGGTACTATAATATCTGTTAAACCTTTAGATGATCTGGGCTACCGTGGTTGGAATGGTGACGAAGAGAGTTTCACTTCTCCATATACATCATCTTTTTACTTGGGCTGGGCTATTGCATCTGCTTTTGCTCTAGCCATCA
CTGGCATTCTCCCAGTGGTTTCTTGTTTTGCGACTTACCGTTTTTTCCTTTCATCGGCTATTTGTGTGGGCC
>TRINITY_DN101464_c0_g2_i5 from sample A5 / Example unspliced isoform:ATCTAAGCCTAGAAAGCTGGGTTTTTGCAAGGAAATGGCCATCATTTCTTCAAGGTCCACAGTTGAGTGCAGTCTCAGGGTTTTTATCACTCGTAGCTTGGGCTGTTGTTCTTTCACCAATAGTTGTGGTAATTGCTTGGGGTACTAGGTTGATGATTATTTTAGATCGAGATATAATTGGGCTGGCAGTTATCATGGCT
GGAACGGCTCTGCTCTTGGCATTTTATGCTATCATGCTTTGGTGGAGAACTCAGTGGCAGAGTTCAAGAGCTGTTGCAATACTGCTGCTCTTGGCCATTTCATTACTTTGTGGATACGAAATTTCGGCTGTTTATGTAACAGCAGGCAGGAATGTATATTCAGCATCTGGGTTTTTCTTTGGTGTTTCGGCAATAGCTCT
AGCAATCAACATGCTTTTTATATGCAGAATGGTTTTTCATGgtaaacattgtttgcgaatctgctgttttgttatctcttctacatgtcattattactctcattctctgatcaatttaagaataagttgaagtgttagtttttttcttcttcataatttccaattgcagGAGCAGGTCTAGATGTAGATGAATATGTCCG
GAGGTCCTATAAGTTTGCTTATGCGGATGGTATTGAAGTTGGTCCGGTTGCCTGTTTACCAGAACCTCCAAATCTCAATGATTCTTTAATACGAAAGCCAAACAGAACTTCCCACTTGGGGTGTCTATACTTTGGGTCTCTGGTTGTACTTCTTGTGTATTCCATTCTATATGGTCTGACTGCCCAGAAGGCACGCTGGT
TGGGAGTAATAACATCAATTACAGTTGTTGTTCTGGATTCAAATGTGGGAGCATGTTTATTTGGGTTTGAGCTTCTCAAAAGTCGAATTGCTGCTTTGTTTGTGGCCGGAATATACAGGGTTTTCTTAATATGCTTTGGAGTACATTATTGGTATCTTGGTCATTGCATTAGCTATGCAGTGGTGGCTTCAGTGTTGTTA
GGGGCAGCTGTTACTCGCCATTTATCAGTTTTGAGTCCATCAGCTGCAAGGAGAGATGCATTGGAGAGCACTGTAATTCGTCTGAGGGAGGGATTTAGGAGGAAAAGTCCTGGCAGTTCTTCAAGTTTCTCTGAAGGTTGTGAATCAAGTGCAAAGCGTAGCAGTAGTGTTGAAGCTGCTCAAATTGGAACTGCAATTGA
AGCTATCTGCAGTAGTAATGTGCAAGGTCAAAGTGATAGTGGGGCAGCTTGGAATGGTATGACACATGCTGGAGCTGAAGATTCTCAAGAGGACGTAAATAGTGCCAAGAGCTTGGATAGTGGAAGGCCAAGTTTGGCATTACACAATAGTTCTTGTCCTTCCACTGCCCTTGAATCTGACAATGGAATAACTTCAGTGG
ATCAGCAACCAGAAAGACACTGCTCAGAACGCAACAAGCATCCAGCAGTTTGTTCAAGTAGTGGAACCGAAAGTCACGGGTTTGAGTCAAATACATCAGGAGGGACTTCGGATAATCAGCAAAGCCTGGATTTGACATTAGCAAGGGTTTTCCAGGAAAGATTGAATGATCCAAGGATTAGTTCAATGTTAAAACTCAAA
GCAAGACAAGGAGATCAGGAATTAACCAGTCTTTTGCAGGATAAAGGGCTTGATCCTAATTTTGCTGTGATGCTTAAGGAGAAGGGCCTTGACCCAACAATTCTAGCATTGCTGCAGAGAAGCAGTCTTGATGCAGATAGAGATCACAGAGATAACACAGAAGATGCAGGCATTGATCCAAATACAATGGAAAATGCTGT
TTTGAATCAACTTTCATGGTCAGAGGAGCTAAGGCGACAGGGATTTGAAAAATGGATTCAAACTATTCGTTTTGTAGTGAGACAGTTGGCAGGCACTCCAGAGCGTGCTTGGGTCCTTTTCAGCTTTATTTTTATCTTGGAAACAATTACTGTAGCTATATTCCGTCCAAAAATTGTAAAAATAATAAATGCTACTCATG
AACAGTTTGAATTTGGCTTTTCAGCATTGCTGCTGTCTCCGGTTTTTTGTTCAGTCATGGCTTTCATTCGTTCACTTCAAGCAGAAGATATGGCAATGACATCTAAGCCTAGAAAGTATTGCTTCATTGCATGGCTCATGAGCACCTGTGTTGGCTTGCTTCTCTCCTTCTTAAGTAAATCTTCTATTCTCCTTGGCTTG
GCATTAACAGTGCCGCTGATGGTGGCATGCCTTTCTGTAGCGATTCCAATTTGGATAAACAATGGATATCGTTTTTGCATGCCTCCCACAGATCAAACAAGCAATATGCAAGGCTGCTGTCGTAAGTCAAAAGAGGGTCTTGCCATGGGGATATCTGTAACCATATTCATTTTTTCTGTTATAGCCTTGGGTACTATAAT
ATCTGTTAAACCTTTAGATGATCTGGGCTACCGTGGTTGGAATGGTGACGAAGAGAGTTTCACTTCTCCATATACATCATCTTTTTACTTGGGCTGGGCTATTGCATCTGCTTTTGCTCTAGCCATCACTGGCATTCTCCCAGTGGTTTCTTGTTTTGCGACTTACCGTTTTTTCCTTTCATCGGCTATTTGTGTGGGCC
Intron 2 GCAAGTGCAG ... TCATTCACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 23.64 | 21 | 10 | 3 |
| A2 | 38.64 | 27 | 23 | 11 |
| A3 | 35.29 | 22 | 15 | 9 |
| A4 | 21.43 | 33 | 15 | 3 |
| A5 | 25.49 | 19 | 7 | 6 |
| A6 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A7 | 0 | 3 | 0 | 0 |
| A8 | 33.33 | 2 | 2 | 0 |
| A9 | 33.33 | 1 | 0 | 1 |
| A10 | 33.33 | 1 | 0 | 1 |
>TRINITY_DN101464_c0_g2_i6 from sample A5 / Example spliced isoformATCTAAGCCTAGAAAGCTGGGTTTTTGCAAGGAAATGGCCATCATTTCTTCAAGGTCCACAGTTGAGTGCAGTCTCAGGGTTTTTATCACTCGTAGCTTGGGCTGTTGTTCTTTCACCAATAGTTGTGGTAATTGCTTGGGGTACTAGGTTGATGATTATTTTAGATCGAGATATAATTGGGCTGGCAGTTATCATGGCT
GGAACGGCTCTGCTCTTGGCATTTTATGCTATCATGCTTTGGTGGAGAACTCAGTGGCAGAGTTCAAGAGCTGTTGCAATACTGCTGCTCTTGGCCATTTCATTACTTTGTGGATACGAAATTTCGGCTGTTTATGTAACAGCAGGCAGGAATGTATATTCAGCATCTGGGTTTTTCTTTGGTGTTTCGGCAATAGCTCT
AGCAATCAACATGCTTTTTATATGCAGAATGGTTTTTCATGGAGCAGGTCTAGATGTAGATGAATATGTCCGGAGGTCCTATAAGTTTGCTTATGCGGATGGTATTGAAGTTGGTCCGGTTGCCTGTTTACCAGAACCTCCAAATCTCAATGATTCTTTAATACGAAAGCCAAACAGAACTTCCCACTTGGGGTGTCTAT
ACTTTGGGTCTCTGGTTGTACTTCTTGTGTATTCCATTCTATATGGTCTGACTGCCCAGAAGGCACGCTGGTTGGGAGTAATAACATCAATTACAGTTGTTGTTCTGGATTCAAATGTGGGAGCATGTTTATTTGGGTTTGAGCTTCTCAAAAGTCGAATTGCTGCTTTGTTTGTGGCCGGAATATACAGGGTTTTCTTA
ATATGCTTTGGAGTACATTATTGGTATCTTGGTCATTGCATTAGCTATGCAGTGGTGGCTTCAGTGTTGTTAGGGGCAGCTGTTACTCGCCATTTATCAGTTTTGAGTCCATCAGCTGCAAGGAGAGATGCATTGGAGAGCACTGTAATTCGTCTGAGGGAGGGATTTAGGAGGAAAAGTCCTGGCAGTTCTTCAAGTTT
CTCTGAAGGTTGTGAATCAAGTGCAAAGCGTAGCAGTAGTGTTGAAGCTGCTCAAATTGGAACTGCAATTGAAGCTATCTGCAGTAGTAATGTGCAAGGTCAAAGTGATAGTGGGGCAGCTTGGAATGGTATGACACATGCTGGAGCTGAAGATTCTCAAGAGGACGTAAATAGTGCCAAGAGCTTGGATAGTGGAAGGC
CAAGTTTGGCATTACACAATAGTTCTTGTCCTTCCACTGCCCTTGAATCTGACAATGGAATAACTTCAGTGGATCAGCAACCAGAAAGACACTGCTCAGAACGCAACAAGCATCCAGCAGTTTGTTCAAGTAGTGGAACCGAAAGTCACGGGTTTGAGTCAAATACATCAGGAGGGACTTCGGATAATCAGCAAAGCCTG
GATTTGACATTAGCAAGGGTTTTCCAGGAAAGATTGAATGATCCAAGGATTAGTTCAATGTTAAAACTCAAAGCAAGACAAGGAGATCAGGAATTAACCAGTCTTTTGCAGGATAAAGGGCTTGATCCTAATTTTGCTGTGATGCTTAAGGAGAAGGGCCTTGACCCAACAATTCTAGCATTGCTGCAGAGAAGCAGTCT
TGATGCAGATAGAGATCACAGAGATAACACAGAAGATGCAGGCATTGATCCAAATACAATGGAAAATGCTGTTTTGAATCAACTTTCATGGTCAGAGGAGCTAAGGCGACAGGGATTTGAAAAATGGATTCAAACTATTCGTTTTGTAGTGAGACAGTTGGCAGGCACTCCAGAGCGTGCTTGGGTCCTTTTCAGCTTTA
TTTTTATCTTGGAAACAATTACTGTAGCTATATTCCGTCCAAAAATTGTAAAAATAATAAATGCTACTCATGAACAGTTTGAATTTGGCTTTTCAGCATTGCTGCTGTCTCCGGTTTTTTGTTCAGTCATGGCTTTCATTCGTTCACTTCAAGCAGAAGATATGGCAATGACATCTAAGCCTAGAAAGTATTGCTTCATT
GCATGGCTCATGAGCACCTGTGTTGGCTTGCTTCTCTCCTTCTTAAGTAAATCTTCTATTCTCCTTGGCTTGGCATTAACAGTGCCGCTGATGGTGGCATGCCTTTCTGTAGCGATTCCAATTTGGATAAACAATGGATATCGTTTTTGCATGCCTCCCACAGATCAAACAAGCAATATGCAAGGCTGCTGTCGTAAGTC
AAAAGAGGGTCTTGCCATGGGGATATCTGTAACCATATTCATTTTTTCTGTTATAGCCTTGGGTACTATAATATCTGTTAAACCTTTAGATGATCTGGGCTACCGTGGTTGGAATGGTGACGAAGAGAGTTTCACTTCTCCATATACATCATCTTTTTACTTGGGCTGGGCTATTGCATCTGCTTTTGCTCTAGCCATCA
CTGGCATTCTCCCAGTGGTTTCTTGTTTTGCGACTTACCGTTTTTTCCTTTCATCGGCTATTTGTGTGGGCC
>TRINITY_DN101464_c0_g2_i2 from sample A5 / Example unspliced isoform:ATCTAAGCCTAGAAAGCTGGGTTTTTGCAAGGAAATGGCCATCATTTCTTCAAGGTCCACAGTTGAGTGCAGTCTCAGGGTTTTTATCACTCGTAGCTTGGGCTGTTGTTCTTTCACCAATAGTTGTGGTAATTGCTTGGGGTACTAGGTTGATGATTATTTTAGATCGAGATATAATTGGGCTGGCAGTTATCATGGCT
GGAACGGCTCTGCTCTTGGCATTTTATGCTATCATGCTTTGGTGGAGAACTCAGTGGCAGAGTTCAAGAGCTGTTGCAATACTGCTGCTCTTGGCCATTTCATTACTTTGTGGATACGAAATTTCGGCTGTTTATGTAACAGCAGGCAGGAATGTATATTCAGCATCTGGGTTTTTCTTTGGTGTTTCGGCAATAGCTCT
AGCAATCAACATGCTTTTTATATGCAGAATGGTTTTTCATGGAGCAGGTCTAGATGTAGATGAATATGTCCGGAGGTCCTATAAGTTTGCTTATGCGGATGGTATTGAAGTTGGTCCGGTTGCCTGTTTACCAGAACCTCCAAATCTCAATGATTCTTTAATACGAAAGCCAAACAGgcaagtgcagcctttggtggttt
aaagatttgatacatttggtctgatttgattaatagagaattttttgacacaattatcacttattggtatacaatacttttgtcattggacatggagaataataattaggttttcttaatctgcattgttcctccatgatggttttagagtaagttattcatgtagaattctaacctgatatggtcattcacagAACTTC
CCACTTGGGGTGTCTATACTTTGGGTCTCTGGTTGTACTTCTTGTGTATTCCATTCTATATGGTCTGACTGCCCAGAAGGCACGCTGGTTGGGAGTAATAACATCAATTACAGTTGTTGTTCTGGATTCAAATGTGGGAGCATGTTTATTTGGGTTTGAGCTTCTCAAAAGTCGAATTGCTGCTTTGTTTGTGGCCGGAA
TATACAGGGTTTTCTTAATATGCTTTGGAGTACATTATTGGTATCTTGGTCATTGCATTAGCTATGCAGTGGTGGCTTCAGTGTTGTTAGGGGCAGCTGTTACTCGCCATTTATCAGTTTTGAGTCCATCAGCTGCAAGGAGAGATGCATTGGAGAGCACTGTAATTCGTCTGAGGGAGGGATTTAGGAGGAAAAGTCCT
GGCAGTTCTTCAAGTTTCTCTGAAGGTTGTGAATCAAGTGCAAAGCGTAGCAGTAGTGTTGAAGCTGCTCAAATTGGAACTGCAATTGAAGCTATCTGCAGTAGTAATGTGCAAGGTCAAAGTGATAGTGGGGCAGCTTGGAATGGTATGACACATGCTGGAGCTGAAGATTCTCAAGAGGACGTAAATAGTGCCAAGAG
CTTGGATAGTGGAAGGCCAAGTTTGGCATTACACAATAGTTCTTGTCCTTCCACTGCCCTTGAATCTGACAATGGAATAACTTCAGTGGATCAGCAACCAGAAAGACACTGCTCAGAACGCAACAAGCATCCAGCAGTTTGTTCAAGTAGTGGAACCGAAAGTCACGGGTTTGAGTCAAATACATCAGGAGGGACTTCGG
ATAATCAGCAAAGCCTGGATTTGACATTAGCAAGGGTTTTCCAGGAAAGATTGAATGATCCAAGGATTAGTTCAATGTTAAAACTCAAAGCAAGACAAGGAGATCAGGAATTAACCAGTCTTTTGCAGGATAAAGGGCTTGATCCTAATTTTGCTGTGATGCTTAAGGAGAAGGGCCTTGACCCAACAATTCTAGCATTG
CTGCAGAGAAGCAGTCTTGATGCAGATAGAGATCACAGAGATAACACAGAAGATGCAGGCATTGATCCAAATACAATGGAAAATGCTGTTTTGAATCAACTTTCATGGTCAGAGGAGCTAAGGCGACAGGGATTTGAAAAATGGATTCAAACTATTCGTTTTGTAGTGAGACAGTTGGCAGGCACTCCAGAGCGTGCTTG
GGTCCTTTTCAGCTTTATTTTTATCTTGGAAACAATTACTGTAGCTATATTCCGTCCAAAAATTGTAAAAATAATAAATGCTACTCATGAACAGTTTGAATTTGGCTTTTCAGCATTGCTGCTGTCTCCGGTTTTTTGTTCAGTCATGGCTTTCATTCGTTCACTTCAAGCAGAAGATATGGCAATGACATCTAAGCCTA
GAAAGTATTGCTTCATTGCATGGCTCATGAGCACCTGTGTTGGCTTGCTTCTCTCCTTCTTAAGTAAATCTTCTATTCTCCTTGGCTTGGCATTAACAGTGCCGCTGATGGTGGCATGCCTTTCTGTAGCGATTCCAATTTGGATAAACAATGGATATCGTTTTTGCATGCCTCCCACAGATCAAACAAGCAATATGCAA
GGCTGCTGTCGTAAGTCAAAAGAGGGTCTTGCCATGGGGATATCTGTAACCATATTCATTTTTTCTGTTATAGCCTTGGGTACTATAATATCTGTTAAACCTTTAGATGATCTGGGCTACCGTGGTTGGAATGGTGACGAAGAGAGTTTCACTTCTCCATATACATCATCTTTTTACTTGGGCTGGGCTATTGCATCTGC
TTTTGCTCTAGCCATCACTGGCATTCTCCCAGTGGTTTCTTGTTTTGCGACTTACCGTTTTTTCCTTTCATCGGCTATTTGTGTGGGCC