sp|Q38953|DEAH5_ARATH ----> Probable pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DEAH5


Intron 1 GTAAGCTTCT ... GGACACACAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A169.238188
A277.786213
A368.426134
A490.912205
A566.67243
A678.579334
A760.4238588
A864.1427514
A969.8116378
A1064.7731577



>TRINITY_DN42213_c0_g1_i1 from sample A8 / Example spliced isoform
GGACCACTTAACTTTATTAGCTGTGTATGAGGCCTGGAAGGAAAAAAACTTCTCAAGTCCCTGGTGTTTTGAGAATTTTGTACAGTCTCGCTCTTTAAGGAGATCCCAGGATGTGAGAAAGCAACTTCTTACCATTATGGAGAGGAAGTCTTGGTTGACAAGGCCATCCATGTTGTAGTAGTACAATCTCTTTCTCTTCA
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GAAACCGGTAGGCTTACCTTGATCATTGTGATATGCTGTCGATGCTATGCACTTGGATGTATCTCGGTGCTTGTCATTTGGATAGGTGCCCTTCAGTTTTGTGCAGTGGATAATATTCAACATGCA


>TRINITY_DN42213_c0_g1_i7 from sample A8 / Example unspliced isoform:
GGACCACTTAACTTTATTAGCTGTGTATGAGGCCTGGAAGGAAAAAAACTTCTCAAGTCCCTGGTGTTTTGAGAATTTTGTACAGTCTCGCTCTTTAAGGAGATCCCAGGATGTGAGAAAGCAACTTCTTACCATTATGGAGAGGAAGTCTTGGTTGACAAGGCCATCCATGTTGTAGTAGTACAATCTCTTTCTCTTCA
AAATTCACAACAGCCGAATGCTATAGAAAACTGCATGAAGCCAGAGTTATTTGGTGAAGACTTCTCAACATCTCTTGACAATTTCCTCCCGGTGGCTATGAGGGGTATTTCAAAATTTAGTAGCCAAGGTGGGTGTTTGGTGTGGGAGGATGTTGGTGGTCTGTTTGAGACTCACAATGCCAGCAAGGAGgtaagcttct
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tatctttagagcaatttgaagtctctgaatgttttagattatcgtttttcttaatcaaatcatctccattgtaatagtaagaaagtagtgaacttgtattgatcccctttcctgtaaacattgaagtattagactcatcccctggagttgttgtggtttcactgctttttatttcagatcaagagtatcaaagaaaatat
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gtgaatattagaacaaggaatcactggcaagttgatttgtctcaaatcttctgcgaattaatccttactggcacttggcattctctttgacagtttgttctttcaattttcattattgatactacaatattgcctggaatttggactaattctcgcatgcttctctttgctggctatgatggacacacag
GAATCCTCTT
GAAACCGGTAGGCTTACCTTGATCATTGTGATATGCTGTCGATGCTATGCACTTGGATGTATCTCGGTGCTTGTCATTTGGATAGGTGCCCTTCAGTTTTGTGCAGTGGATAATATTCAACATGCATGTGGTAAGTAACTATAAAATAGCATTGTACCTGGTAATTGTAAAATAGTGAACATGGCATTTTTGGCACTGTA
GTTGGTAATTTTACCATTGAAAGCTGGCATTATAGTAGCTGGGTGATTTGATTTGTTAACGCGACATTTCTTTTCAATTTATGCACTTAGTGGCCTTGGTCCAGTTTATTATTAAGCGGATAAATGGCATTTTAGTTATAAATCATACATAAAGAACGATGCATATTGGTTAATTCGAACTAATTAATCTTCCCAATGGG
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AATGCTTGTCTTGGCACTCGGGCGATTGATTTAACATGGCTATGGAAGCTTAATGTTACGTATGTACTAAGGTGGAAATGGTCTAAAAAGACCAAATATATTTTAATTCCTTAGCGTTTAAAATGCTTTGCCCAATGCTTGTCTTGGCACTTGGGCGATTGATTTAACATGGCTATGGAAGCTTAATGTTATGGACTAAG
ATGGAAATGGTCTAAAAAGACCCAATATATTTTAGTTCCTTAGCGTTTAATATGCTTTTCCCAATGCTTGTCTTGGCACTCGGGCGATTGATTTAACATGGCTA