sp|Q67VS7|CSLA9_ORYSJ ----> Probable glucomannan 4-beta-mannosyltransferase 9

Intron 1 GTATCCTTTT ... TCTTGTTTAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	100	0	3	2
A2	100	0	5	0
A3	100	0	5	4
A4	100	0	3	1
A5	-1	0	0	0
A6	100	0	19	13
A7	94.52	2	51	18
A8	100	0	34	21
A9	100	0	35	18
A10	100	0	36	28

>TRINITY_DN49154_c2_g1_i18 from sample A7 / Example spliced isoform

CTGGACTTTGGTTTCAGTCTTCAACTATGGATGAACCCTAACCCGTTTCGGAGCTACATGATCTTTTAAAACCATGGATGTCCGGGTTGCCGACGACATGGGGGACAACGTCCGAGTACAAACCCGCAAACTTCCATGACGGAGAGTGTAATGTCGTTGATTATAGTTTAATTAAATCGTACCTGTCCAATATGTATAAG
AACGCCTGG

>TRINITY_DN49154_c2_g1_i14 from sample A7 / Example unspliced isoform:

GTGTATGGTTATGACGAATACTCTCTCACATGCATATGATTTTGGGAGAGCTCTGCTGGACTTTGGTTTCAGTCTTCAACTATGGATGAACCCTAACCCGTTTCGGAGCTACATGATCTTTTAAAACCATGGATGTCCGGGTTGCCGACGACATGgtatccttttaacaagttacgacctagcttattgcgctctagatc
gataggttgtcatcttgtttagGGGGACAACGTCCGAGTACAAACCCGCAAACTTCCATGACGGAGAGTGTAATGTCGTTGATTATAGTTGTGAGTAAAAGCTTAAATACTCATAGAAATATGATTGAATAAGGGATAGGTATGGTCGTTTTTGTTTAATACTAATTTATGCACATTTTCACTATTTAATAGTTTTATTG
AGCTGCTTCCATGAATTGTTTGTATATTCTGCTGGAAGTATTGATGTAATTTTTAATAGTTTTATTGAGCCG

Intron 2 GTGAGTAAAA ... CTATTTCCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	80.65	3	10	15
A2	73.68	5	11	17
A3	90.91	1	6	14
A4	46.15	7	5	7
A5	36.84	6	2	5
A6	27.27	12	4	5
A7	76	3	9	10
A8	54.84	7	10	7
A9	33.33	11	2	9
A10	33.33	4	1	3

>TRINITY_DN49154_c2_g1_i19 from sample A7 / Example spliced isoform

GTTTACGTGTACGGGTTGTTTCCATGACGAAGAGTATATGTTCGTTGATAATTGTTCTTGCTTCTCTGTCAAGTAAACAATATCTATCTTCTACCCTACAGGAGAGAGGATTCGGGAGAAGGTAATGGTCATATCAACTGTCTCTATATTTTGATGGGTATTGCAACGCACATGTGATTGTCATTGGATTTATAACTGTT
AGTGTGTGCGTGTAGTAATTCATAAGTGTTGTTGTGTGCGTACAGTAATTCATTGTCCAATATGTATAAGAATTTTAGGGTTTGCCTGTAGTTTGAAATTCAATGTAACCTGTTATTGTTACTGCTTTTCTCATTCAGATTTGATGTTATATATTGTTTTTAAAAAGCCTGGATTTCAGATATGTTATTAGGTTTGTTGA
TTTTG

>TRINITY_DN49154_c2_g1_i13 from sample A7 / Example unspliced isoform:

GTTTACGTGTACGGGTTGTTTCCATGACGAAGAGTATATGTTCGTTGATAATTGTTgtgagtaaaatagaaatttgattgaataaaggttctatatggtcgttttagcataataataatttatgcacattttcactatttccagCTTGCTTCTCTGTCAAGTAAACAATATCTATCTTCTACCCTACAGGAGAGAGGATT
CGGGAGAAGGTAATGGTCATATCAACTGTCTCTATATTTTGATGGGTATTGCAACGCACATGTGATTGTCATTGGATTTCATAACTGTTAGTGTGTGCGTGTAGTAATTCATAAGTGTTGTTGTGTGCGTACAGTAATTCATTGTCCAATATGTATAAGAATTTTAGGGTTTGCCTGTAGTTTGAAATTCAATGTAACCT
GTTATTGTTACTGCTTTTCTCATTCAGATTTGATGTTATATATTGTTTTTAAAAAGCCTGGATTTCAGATATGTTATTAGGTTTGTTGATTTTG

Intron 3 GTTTTTGTGC ... CTCTAACCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	37.62	16	14.7	4.7
A2	18.6	16	5.3	2
A3	24.87	11	4.7	2.7
A4	32	9	6.7	2
A5	7.41	4	0.7	0
A6	46.87	16	17.3	11
A7	52.59	27	39.3	20.7
A8	33.64	23	16.3	7.3
A9	39.3	21	18	11
A10	27.91	44	24.3	10.3

>TRINITY_DN49154_c2_g1_i8 from sample A7 / Example spliced isoform

AGTTGGTGAATGCCCCATCGGCAGAGAAGAGGGAGTTGAATCCTGAGTTATATTTGGTTTCCAGTTACCTCGATGCTTCCTGAGTTAAACTTCCTGCACTATCAGGGTTTCTTTTCCCTGGGTCGGTGTATGGTTATGACGAATACTCTCTCAAATGCATATGATTTTGGGAGAGCTCTGGTCGACTTTGGTTTCAGTCT
TCAACTATGGATGAACGCTAACCCGTTTCGGAGCTACATGATCTTTTAAAACCATGGATGTCCGGGTTGCCGAGGACATGGTATCCTTTTAACAAGTTACGACCTAGCTTATTGCGTTCTATATCGAATTTTTGAGTTATAGTCATGAATATTGATAGGTTGTCATCTTGATAGACAAACCCACGAAGAGTGTAATGTGG
TTGATTATTGTTGTGAGTAAAAGCTTAAATACTCATAGAAATATGATTGAATAAGGGATAGGTATGGTCGTTTTTGTTTAATACTAATTTATGCACATTTTCACTATTTCCAGCTTGCTTCTCTGTCAAGTAAACAATATCTATCTTCTACCCTACAGGAGAGAGGATTCGGGAGAAGGTAATGGTCATATCAACTGTCT
CTATATTTTGATGGGTATTGCAACGCACATGTGATTGTCATTGGATTTCATAACTGTTAGTGTGTGCGTGTAGTAATTCATAAGTGTTGTTGTGTGCGTACAGTAATTCATTGTCCAATATGTATAAGAATTTTAGGGTTTGCCTGTAGTTTGAAATTCAATGTAACCTGTTATTGTTACTGCTTTTCTCATTCAGATTT
GATGTTATATATTGTTTTTAAAAAGCCTGGATTTCAGATATGTTATTAGGTTTGTTGATTTTG

>TRINITY_DN49154_c2_g1_i10 from sample A7 / Example unspliced isoform:

GCAAAAAGCTAACGGTGATTTATCGGAAGAAAAATCCTGTAAGCTAGCCTGCAGTTTGAAATTCAAACAGTTAGGTTAAGGAAAACAGACTTGGCCGAGAAGATATTAGGGTCTCCGTGAATGCAGGCCAGGGGAGTGCTTCCTTACATAGAACCGACTTGGCCGATGGGGCCTGTTTAAAGATCTGATGGAGAGGGCCG
AGAAGAAGATCGCCTCTGCTATATCTGCCCGAATGCGCCAGTGGCCTTGGCGCGTTCGAATTCCAACCATATGGAGGGACTGCTTGATGAATCTGAAGTATCTGAAGAATCAAATAAGATAACTTCTCTTCCGCCATAGATCGCCTACATGAGATCTGATTTAACCGTCCTGAAGCCGAATGACGTGGGTGACTCCCAAG
TACGTCGGTGACTAGTAATCGAAGTGGCTGAACGGTGCGAGGAATTCAAATATTTAAGAACAAGTAGTTGGTGAATGCCCCATCGGCAGAGAAGAGGGATTGAATTCATATCAAATTTCCTTTGCATTATGTATAGAAGTTGAATCCTGAGTTATATTTGGTTTCCAGTTACCTCGATGCTTCCTGAGTTAAACTTCCTG
CACTATCAGgtttttgtgcttgagctgccgattcgtgttctctaaccagGGTTTCTTTTCCCTGGGTCGGTGTATGGTTATGACGAATACTCTCTCA