sp|Q84J78|SSBP_ARATH ----> Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial


Intron 1 GTATGAAATA ... TGTGGAGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
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A226371412
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A1022.881505534



>TRINITY_DN35061_c0_g1_i6 from sample A6 / Example spliced isoform
TACAAACATGAAAAGGCCCAACCGGGACTTCCCATCTTACAAATCTTTTAAACCCTGGCGATCATAAAACCCTACATACCGCATGCTGTCCTTATGCTAAGTAATAATTACAGGTTTGTGTTCACTCACATATCTGGAATTTAGGCTTGCCCAATACTAGCATGGTTCCGAACTTTACACACATCGTTCCCAAGGAGTTG
CTGTTAACACGAAGCTTTTAAATCATTCCCTCAAAATTTGAGGAGGCAGGATTGTTAAGTTAGCCAAAATTCAAATACACCGTGAGGGGTTACCATATTCAACTTCGTCAGTCTCGTTTCCTGCAGCAGGATTGTTAAGTTAGCCAAAATTCAAATACACCGTGAGGGGGTACCATATTCAACTTCGTCAGTCTCGTTTC
CTGCAGCAGGACAGCTACATATTCTGTTTGCTCACTGGTTATCATCCATATAAGTGCATGGCATCACGTTTGATAAATTTATTGAATCCTCTGAATAGGATGCTTGGAAGAATCGAGATATCCCCTGGGTTACTTGGATCACTAAAGCCAGGATACTGTACTGTTGGTTACAAATCTAACGAAGAGGAGGCAATAGAAGA
TGTCCAGGAGAGTGAACAAACTCAGGAGGCAATAGAAGATGTCCAGGAGAGTGAACAAACTCTGCGGAGAGAACCACAGCCACAGGGTGTAGACCCCAAAAAGGGATGGGGTTTTCGTGGTGTTCATAAGGCGATTATTTGTGGAAAAGTGGGACGACTACCAGTACAGAAATTATTGAGGAATGGTCGAACTGTGACCA
TATTTACTGTAGGAACTTCTGGCATGTTTGACCAAAGAACTCTGGGGATGGACAGATCCAGCAGACCTATTCAATGGCATAGGATTGCTGTTCATAATGAACCACTTGGAGCATATGTTGTTCAGCAGCTGATTAAAGACGCATCTGTTTATGTTGAAGGAGATATTGAGACCAGAGTCTACAATGACAGCATTAACGGC
ACAGTTAAACATGTTCCAGAAATATGTGTTCGACGAGATGGTAGAGTGCGTCTAATTAATGCATCAGAACCAGTCAATGAGATCACTTTGGAAGGACTAAGGAATACGTTATTCTGAAGGAGTTGTGCCATTAATAATATATCCTGAGGCATTTGAGACAACATATAATTCAAGATGCTCATGTCAAGATGGAACTTTAG
TCCACATTGTTTATGTTTCTTCTCACACATGTTCTTATCTTTATGCAAGCCTGTGACAAGATAAATTACACATCACTGGGAAAGTCCTATAGATCTAGTCTCTGTTGAGGTTGATGGTGAGATGCATGCTTAGCAAGAATAATATCTGCACTAGTTTTGAAAACTACTGGCTGCTGCTGGGATATATATATATGAAGGGA
ACATAATTCGTTTGTTTATTTGCCCGTGCCTTTATTGTTGGCATTTATTTGACACTTTTCAATGTCTATCCATCTACTATAGAACAGATCCATAAAATGTTCTAGGGAACGACGATAAGTGTAGGGTTTTAATTAATGTAGTGTATATTTTGTGTAGATATTTATGGTTTTGATCAAACCCTGGGAAGACTGGGCCAAAA
GCTTTGATCATACCAACATATGTTTGCTTCCTGTTGAAACATGAAATCTTTTCTTAAATAGTGTACAAGGAAATCAGGAGTTTCAACTTGCACCCTAATGATATGAACATCGTTTTGGAAAGAATGTCCAATGGGTTCTTTAGCTGTAAACCTTTTTGCATCAATTAGGATGCCAACACAGAGTACTTCATTGGTTTGTG
GGTACCTAGATGTTTTATTTGTAGATCCTACCTGCATATTAATTTGTGGTGATTACATAGACGGAAATATTACAGAATACGTGAAGGTCAAGGTAATGTGATCAGATCTTCTTAAAGTGGGATGAAACGTTGTATTCTTTTGGTATACTTAGTCAATGCAAACCAAATCGATGTTTATGAAATGGAGGGTAAATTGCTAA
GGAAGAAATTGTACAAATAAGAACTTATTTCCAAGGAAAATGGGTCACTTGTCTGTACTATATTATCCTTGGAATAAAAGAGTTCCCTGTGATGATCCCTTGTTGGATCCATTAACAGGGGTTACTGAGAAGATGATATGTGTTTCCTTTATTGATGTTTTCTCTGCTCTTTATGTTCCCACACATGCCAAACAGGTTTA
TTCTGCATCGAATCATGTATAGGTGTAGAAGAACCTTGAATCTCATTTATTTTTATTTTTATGGAAGCTACATTTGCTTGCGTCTTTTTCTTGAAAGTTCATAATGAATCAGGGTCACCACACCTGGCCATAGCGTATTCCAATGCTTTTACCAGACAAAATGTAAATGCAAAATATAGTATTTTGAGTGTCTTATAGGC
TCACAACAGATCTTCTAATACTTGATCTTTTGAACTGTATCATAATTGCTTGCCCTTTTCAAGAAGTCCAACAG


>TRINITY_DN35061_c0_g1_i1 from sample A6 / Example unspliced isoform:
TACAAACATGAAAAGGCCCAACCGGGACTTCCCATCTTACAAATCTTTTAAACCCTGGCGATCATAAAACCCTACATACCGCATGCTGTCCTTATGCTAAGTAATAATTACAGGTTTGTGTTCACTCACATATCTGGAATTTAGGCTTGCCCAATACTAGCATGGTTCCGAACTTTACACACATCGTTCCCAAGGAGTTG
CTGTTAACACGAAGCTTTTAAATCATTCCCTCAAAATTTGAGGAGGCAGGATTGTTAAGTTAGCCAAAATTCAAATACACCGTGAGGGGTTACCATATTCAACTTCGTCAGTCTCGTTTCCTGCAGCAGGATTGTTAAGTTAGCCAAAATTCAAATACACCGTGAGGGGGTACCATATTCAACTTCGTCAGTCTCGTTTC
CTGCAGCAGGACAGCTACATATTCTGTTTGCTCACTGGTTATCATCCATATAAGTGCATGGCATCACGTTTGATAAATTTATTGAATCCTCTGAATAGGATGCTTGGAAGAATCGAGATATCCCCTGGGTTACTTGGATCACTAAAGCCAGGATACTGTACTGTTGGTTACAAATCTAACGAAGAGGAGGCAATAGAAGA
TGTCCAGGAGAGTGAACAAACTCAGGAGGCAATAGAAGATGTCCAGGAGAGTGAACAAACTCTGCGGAGAGAACCACAGCCACAGGGTGTAGACCCCAAAAAGGGATGGGGTTTTCGTGGTGTTCATAAGGCGATTATTTGTGGAAAAGTGGGACGACTACCAGTACAGAAATTATTGAGGAATGGTCGAACTGTGACCA
TATTTACTGTAGGAACTTCTGGCATGTTTGACCAAAGAACTCTGGGGATGGACAGATCCAGCAGACCTATTCAATGGCATAGGATTGCTGTTCATAATGAACCACTTGGAGCATATGTTGTTCAGCAGCTGATTAAAGACGCATCTGTTTATGTTGAAGGAGATATTGAGACCAGAGTCTACAATGACAGCATTAACGGC
ACAGTTAAACATGTTCCAGAAATATGTGTTCGACGAGATGGTAGAGTGCGTCTAATTAATGCATCAGAACCAGTCAATGAGATCACTTTGGAAGGACTAAgtatgaaatattagttagcattttgtcaatttaatatgcgttcttttgttttccttatttatatttgagcatatggtcgatggtacaaatatggcttcta
cagaacggtgaattgctttgtatagatttttgtctcttttcttgtacctgcttctgttcataataacctccgtgtatgtggagcagGGAATACGTTATTCTGAAGGAGTTGTGCCATTAATAATATATCCTGAGGCATTTGAGACAACATATAATTCAAGATGCTCATGTCAAGATGGAACTTTAGTCCACATTGTTTAT
GTTTCTTCTCACACATGTTCTTATCTTTATGCAAGCCTGTGACAAGATAAATTACACATCACTGGGAAAGTCCTATAGATCTAGTCTCTGTTGAGGTTGATGGTGAGATGCATGCTTAGCAAGAATAATATCTGCACTAGTTTTGAAAACTACTGGCTGCTGCTGGGATATATATATATGAAGGGAACATAATTCGTTTG
TTTATTTGCCCGTGCCTTTATTGTTGGCATTTATTTGACACTTTTCAATGTCTATCCATCTACTATAGAACAGATCCATAAAATGTTCTAGGGAACGACGATAAGTGTAGGGTTTTAATTAATGTAGTGTATATTTTGTGTAGATATTTATGGTTTTGATCAAACCCTGGGAAGACTGGGCCAAAAGCTTTGATCATACC
AACATATGTTTGCTTCCTGTTGAAACATGAAATCTTTTCTTAAATAGTGTACAAGGAAATCAGGAGTTTCAACTTGCACCCTAATGATATGAACATCGTTTTGGAAAGAATGTCCAATGGGTTCTTTAGCTGTAAACCTTTTTGCATCAATTAGGATGCCAACACAGAGTACTTCATTGGTTTGTGGGTACCTAGATGTT
TTATTTGTAGATCCTACCTGCATATTAATTTGTGGTGATTACATAGACGGAAATATTACAGAATACGTGAAGGTCAAGGTAATGTGATCAGATCTTCTTAAAGTGGGATGAAACGTTGTATTCTTTTGGTATACTTAGTCAATGCAAACCAAATCGATGTTTATGAAATGGAGGGTAAATTGCTAAGGAAGAAATTGTAC
AAATAAGAACTTATTTCCAAGGAAAATGGGTCACTTGTCTGTACTATATTATCCTTGGAATAAAAGAGTTCCCTGTGATGATCCCTTGTTGGATCCATTAACAGGGGTTACTGAGAAGATGATATGTGTTTCCTTTATTGATGTTTTCTCTGCTCTTTATGTTCCCACACATGCCAAACAGGTTTATTCTGCATCGAATC
ATGTATAGGTGTAGAAGAACCTTGAATCTCATTTATTTTTATTTTTATGGAAGCTACATTTGCTTGCGTCTTTTTCTTGAAAGTTCATAATGAATCAGGGTCACCACACCTGGCCATAGCGTATTCCAATGCTTTTACCAGACAAAATGTAAATGCAAAATATAGTATTTTGAGTGTCTTATAGGCTCACAACAGATCTT
CTAATACTTGATCTTTTGAACTGTATCATAATTGCTTGCCCTTTTCAAGAAGTCCAACAG



Intron 2 GTAGCACAAG ... GACTCCAAAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A131.5852240
A216.1352102
A329.9175320
A417.314390
A5201230
A627.49124470
A723.5166510
A820.51124320
A925.71182632
A1025.78190660



>TRINITY_DN34566_c0_g1_i4 from sample A9 / Example spliced isoform
ATAAATTCTCTCCGCAAAATACACCGAAAGACAACAAAACGATATTTGAATGAAAAACAAAAGTCTCTTCCGCCAAGGTCTACAAACATGAAAAGGCCCAACCGGGACTTCCCATCTTACAAATCTTTTAAACCCTGGCGATCATAAAACCCTACATACCGCATGCTGTCCTTATGCTAAGTAATAATTACAGGTTTGTG
TTCACTCACATATCTGGAATTTAGGCTTGCCCAATACTAGCATGGTTCCGAACTTTACACACATCGTTCCCAAGGAGTTGCTGTTAACACGAAGCTTTTAAATCATTCCCTCAAAATTTGAGGAGGCAGGATTGTTAAGTTAGCCAAAATTCAAATACACCGTGAGGGGGTACCATATTCAACTTCGTCAGTCTCGTTTC
CTGCAGCAGGATTGTTAAGTTAGCCAAAATTCAAATACACCGTGAGGGGGTACCATATTCAACTTCGTCAGTCTCGTTTCCTGCAGCAGGACAGCTACATATTCTGTTTGCTCACTGGTTATCATCCATATAAGTGCATGGCATCACGTTTGATAAATTTATTGAATCCTCTGAATAGGATGCTTGGAAGAATCGAGATA
TCCCCTGGGTTACTTGGATCACTAAAGCCAGGATACTGTACTGTTGGTTACAAATCTAACGAAGAGGAGGCAATAGAAGATGTCCAGGAGAGTGAACAAACTCAGGAGGCAATAGAAGATGTCCAGGAGAGTGAACAAACTCTGCGGAGAGAACCACAGCCACAGGGTGTAGACCCCAAAAAGGGATGGGGTTTTCGTGG
TGTTCATAAGGCGATTATTTGTGGAAAAGTGGGACGACTACCAGTACAGAAATTATTGAGGAATGGTCGAACTGTGACCATATTTACTGTAGGAACTTCTGGCATGTTTGACCAAAGAACTCTGGGGATGGACAGATCCAGCAGACCTATTCAATGGCATAGGATTGCTGTTCATAATGAACCACTTGGAGCATATGTTG
TTCAGCAGCTGATTAAAGACGCATCTGTTTATGTTGAAGGAGATATTGAGACCAGAGTCTACAATGACAGCATTAACGGCACAGTTAAACATGTTCCAGAAATATGTGTTCGACGAGATGGTAGAGTGCGTCTAATTAATGCATCAGAACCAGTCAATGAGATCACTTTGGAAGGACTAAGTATGAAATATTAGTTAGCA
TTTTGTCAATTTAATATGCGTTCTTTTGTTTTCCTTATTTATATTTGAGCATATGGTCGATGGTACAAATATGGCTTCTACAGAACGGTGAATTGCTTTGTATAGATTTTTGTCTCTTTTCTTGTACCTGCTTCTGTTCATAATAACCTCCGTGTATGTGGAGCAGGGAATACGTTATTCTGAAGGAGTTGTGCCATTAA
TAATATATCCTGAGGCATTTGAGACAACATATAATTCAAGATGCTCATGTCAAGATGGAACTTTAGTCCACATTGTTTATGTTTCTTCTCACACATGTTCTTATCTTTATGCAAGCCTGTGACAAGATAAATTACACATCACTGGGAAAGTCCTATAGATCTAGTCTCTGTTGAGGTTGATGGTGAGATGCATGCTTAGC
AAGAATAATATCTGCACTAGTTTTGAAAACTACTGGCTGCTGCTGGGATATATATATATGAAGGGAACATAATTCGTTTGTTTATTTGCCCGTGCCTTTATTGTTGGCATTTATTTGACACTTTTCAATGTCTATCCATCTACTATAGAACAGATCCATAAAATGTTCTAGGGAACGACGATAAGTGTAGGGTTTTAATT
AATGTAGTGTATATTTTGTGTAGATATTTATGGTTTTGATCAAACCCTGGGAAGACTGGGCCAAAAGCTTTGATCATACCAACATATGTTTGCTTCCTGTTGAAACATGAAATCTTTTCTTAAATAGTGTACAAGGAAATCAGGAGTTTCAACTTGCACCCTAATGATATGAACATCGTTTTGGAAAGAATGTCCAATGG
GTTCTTTAGCTGTAAACCTTTTTGCATCAATTAGGATGCCAACACAGAGTACTTCATTGGTTTGTGGGTACCTAGATGTTTTATTTGTAGATCCTACCTGCATATTAATTTGTGGTGATTACATAGACGGAAATATTACAGAATACGTGAAGGTCAAGGTAATGTGATCAGATCTTCTTAAAGTGGGATGAAACGTTGTA
TTCTTTTGGTATACTTAGTCAATGCAAACCAAATCGATGTTTATGAAATGGAGGGTAAATTGCTAAGGAAGAAATTGTACAAATAAGAACTTATTTCCAAGGAAAATGGGTCACTTGTCTGTACTATATTATCCTTGGAATAAAAGAGTTCCCTGTGATGATCCCTTGTTGGATCCATTAACAGGGGTTACTGAGAAGAT
GATATGTGTTTCCTTTATTGATGTTTTCTCTGCTCTTTATGTTCCCACACATGCCAAACAGGTTTATTCTGCATCGAATCATGTATAGGTGTAGAAGAACCTTGAATCTCATTTATTTTTATTTTTATGGAAGCTACATTTGCTTGCGTC


>TRINITY_DN34566_c0_g1_i5 from sample A9 / Example unspliced isoform:
ATAAATTCTCTCCGCAAAATACACCGAAAGACAACAAAACGATATTTGAATGAAAAACAAAAGTCTCTTCCGCCAAGGTCTACAAACATGAAAAGGCCCAACCGGGACTTCCCATCTTACAAATCTTTTAAACCCTGGCGATCATAAAACCCTACATACCGCATGCTGTCCTTATGCTGTCCTTATGCTAAGTAATAATT
ACAGGTTTGTGTTCACTCACATATCTGGAATTTAGGCTTGCCCAATACTAGCATGGTTCCGAACTTTACACACATCGTTCCCAAGGAGTTGCTGTTAACACGAAGCTTTTAAATCATTCCCTCAAAATTTGAGGAGGCAGGATTGTTAAGTTAGCCAAAATTCAAATACACCGTGAGGGGGTACCATATTCAACTTCGTC
AGTCTCGTTTCCTGCAGCAGGATTGTTAAGTTAGCCAAAATTCAAATACACCGTGAGGGGGTACCATATTCAACTTCGTCAGTCTCGTTTCCTGCAGCAGGACAGCTACATATTCTGTTTGCTCACTGGTTATCATCCATATAAGTGCATGGCATCACGTTTGATAAATTTATTGAATCCTCTGAATAGGATGCTTGGAA
GAATCGAGATATCCCCTGgtagcacaagctcctgctagcttcagtcacagactcacaaggaaataaagaagcccgaagcatcatcacttgtgagaccagtatttcttccttcctattgtctactaaagatcattcaaagaacaaaatatattgcaatcatctgctcccatcagagcctgctaatgaggagtcgagactcc
aaagGGTTACTTGGAT