NA ----> NA
Intron 1 GTGAGGGAAG ... TATTTTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 50.23 | 53 | 44 | 63 |
| A2 | 60 | 27 | 29 | 52 |
| A3 | 50.32 | 39 | 26 | 53 |
| A4 | 54.13 | 25 | 22 | 37 |
| A5 | 47.37 | 10 | 9 | 9 |
| A6 | 43.88 | 172 | 105 | 164 |
| A7 | 51.22 | 259 | 226 | 318 |
| A8 | 48.03 | 376 | 290 | 405 |
| A9 | 49.35 | 137 | 115 | 152 |
| A10 | 46.62 | 170 | 108 | 189 |
>TRINITY_DN123042_c4_g1_i1 from sample A1 / Example spliced isoformATAAAGCCAGATGTCGCCATTCTCTGATACACCGCCTTTTCTTTTGTATATCTTAATTAAGGGGGATGTTGGTGGTTACGATAATGCTGCAGAAGATGATTTTATCAAGAATTACAAGCACGAAGATCCTCTTGATGTTTTGAGGATGCCAGAAGATCACAAAGAATCGTTACTATCATCTAGAAAAGAAGGAAACGGCT
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ATCGCTCAATTATTTACTAAAATGGGAGACCTTCTACCAATATAAGAAGCATGTATTTCCAATCGAAAGTGGGGGAATAGAGACTCAGCAGAATGGAAGAACTTCTTCTCTCCAC
>TRINITY_DN123042_c4_g1_i3 from sample A1 / Example unspliced isoform:ATAAAGCCAGATGTCGCCATTCTCTGATACACCGCCTTTTCTTTTGTATATCTTAATTAAGGGGGATGTTGGTGGTTACGATAATGCTGCAGAAGATGATTTTATCAAGAATTACAAGCACGAAGATCCTCTTGATGTTTTGAGGATGCCAGAAGATCACAAAGAATCGTTACTATCATCTAGAAAAGAAGGAAACGGCT
TGATGTTTGTTGAGGATCTTCATCACAAGGAAAAAATAGCCGAGCTATGGGCATGTTAAGAAGTACTCATTTGTCACAAATATTTGTTGGGTAATGCTAAGGCAGTAAGTAAATGCAAAGAATACCACCTTGCATCATAAACTCTATCCTAACACAGGTTGTTTGCAGTCCACATTGATATGTACAGTTAATTGGTTTGT
TGAGCACATGACGCAGATCAACAGTTGCGTCGATTAAGGCGACGAAATTGCAGAGATACAATATTGGTTACGCTCAAGAACGGAGAACATATGGTGAATTCATGAAGTAAAACAAAAGGGAAAATTCTTATCTTTGTTTTATTTTATCCTTCAGAATATTGATATGCTTATCATCATATTAACAGAGCTCACGCTGTATC
TTTCTTTTGGTTGTTTCATATATATATTTGATGTGCATGTTTCATGAGGATTTCAATATGGTTAATTTATTTTTATTGCCTTGCAGGGACTTCCTTTTGTGAGGTTAACGCGCTCCAAACATTGAAAATGGAACATTGAATGCAACGCAGAGATCACTGAAAATAAGTACAGTCATTGCGAATAATCACCATGCAATTTG
ATATGGAAATATTAACGGGAGGACGCCGGATCGGAGTACGAAGGTGAAGTTACTGAGATTAATCTGCCAGTTCACTTGGTTAAAAGACCATGGGCTTGCGCAAgtgagggaagtcttgatcacgtttccattctttttaatggttctcttggttatattatttctttcatatagattgagtggaaggattataataaatt
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GAATAGAGACTCAGCAGAATGGAAGAACTTCTTCTCTCCAC