sp|Q39008|M3K1_ARATH ----> Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1
Intron 1 GTGATATACA ... TATCCTGAAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 15.31 | 37 | 5 | 8.7 |
| A2 | 40 | 15 | 9 | 11 |
| A3 | 10.69 | 32 | 5 | 2.7 |
| A4 | 27.71 | 29 | 16 | 6.4 |
| A5 | 15.05 | 8 | 1 | 2.1 |
| A6 | 7.29 | 18 | 2 | 0.9 |
| A7 | 9.63 | 53 | 8 | 3.4 |
| A8 | 5.23 | 36 | 0 | 4.3 |
| A9 | 11.62 | 37 | 5 | 5.1 |
| A10 | 7.83 | 26 | 2 | 2.6 |
>TRINITY_DN121951_c0_g1_i11 from sample A1 / Example spliced isoformCCCCATATTGCGTTTCGCCGTGCGCCAACGATCGCTATCCTCAGGCAAGAGTGTTGAGAAATATTGCATTGCTATGAAACATCCATTGGTCAACAAGATGGCATGGCATGGAATGATGCCATCCATGACCTTTCAAGTTTCATCCATGACAACACAACTGCACAGGACTCGCTATCCAACAACATAAATCATAAATAAAT
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>TRINITY_DN121951_c0_g1_i3 from sample A1 / Example unspliced isoform:CCCCATATTGCGTTTCGCCGTGCGCCAACGATCGCTATCCTCAGGCAAGAGTGTTGAGAAATATTGCATTGCTATGAAACATCCATTGGTCAACAAGATGGCATGGCATGGAATGATGCCATCCATGACCTTTCAAGTTTCATCCATGACAACACAACTGCACAGGACTCGCTATCCAACAACATAAATCATAAATAAAT
CCCCGTTAATGACGACGACACGGCATTAGAGTTCTCCAGAGTTGAATGTCGAAATTCAGACACAATTGCATTCAACACCAGCGAAAGTCGGCTCCTCTCTTATTTGTAGTCAACCTCATCTCTTCCCCCAAATTATTAGTCCCTTCATTCACATAATGATCCTGGGTTGACTTATTGTAATGCTTGTCAGAGAGTTGAGT
CGGATCTTGTGAAATTGCGTTAGAGTTCTCCAGAGTTGAATGTCGAAATTCAGACACAATTGCATTCAACACCAGCGAAAGTCGGCTCCTCTCTTATTTGTAGTCAACCTCATCTCTTCCCCCAAATTATTAGTCCCTTCATTCACATAATGATCCTGGGTTGACTTATTGTAATGCTTCCGAGAGAGTTGAGTCGGATC
TTGTGAAATTTAATGGAGCCCCAAATTATTCAGTAGGACTCTGCGAATCGAGTATAACAGAAATTAGCAGGGTTTCAGAGATTTAATGGAGTTTGACAAAATTTAGTAGTATATTTGCTGAGTTTTGATGGAGCCTGTGGGCCGTCAACAGAAAATAAAGCTCCAGAGGACGAACGCGCAGAAGCGCATAGACTACAATG
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AGAACGCTAAGCAGGCGCAGCCCTTTGGGAAATGAAGGGCTTTCTCGGGAAAGTGAAGGGCAGCCGCGCAACGTTAGTTCATTTTCGTCCCCGGAACGCTCCAGCCCTAATGGAAACGAGGTCTCTGCGGTGTCCACGCCTTTGCTATCAGAGGCTCCGTCTGTGTCGGCGTCCGATGTCCCCGGAGAGAGCGAGGGCAG
GGGTTTTGAAAGAAGCGGGTTGGAGGGTGGGCGTGAGCTCGTTGTTTCGGTTCGCACAAGAGGGAGCTGTTGCAGTATTAAACCCCTCTCTGATGCCACGGTTTCTTCGGCCTGTGTCCAGTCGTTTACCCTGGCTCCGCCGCCTTCCATGTCTTTGAAGGTTTCGAATGACAAAGCTGCTTCGACTTGGGATATTGTGA
AGTCTTTTGCTCCCGAGGGGGATGGCGTTAGCCAGCCTTTCAATGAGAGGGTTTGGACTCCAAATTCACCGGAAAGTGATGATGGCAGTGATAGCGATGACGAATCTGAGGATGAAAAACAAGAGGAGGATGGTAGGGGTGCAGAGGTCGAGCGTGGCAGATCGTGGGCATTGTCGTCGAGCTCAAGCGGGGGTGATTCA
TTCACCTCGTCAATTGAGAACGCGGTGTATGCTGTTTCCAAGGAAGCAAAGTTCAAGATCCCGTTCAAATCTTGGATTAAAGGGCAGATGCTCGGGCGGGGATCATTTGGAACTGTTTACGAGGGAATTAGCGATGCTGGAGTCTTCTTTGCAGTTAAGGAGGTTTCTCTTGTAGATCAAGGTCTTGATGCAAAACAGTG
CATTTCTCAACTGCAACAGGAGATTGCTCTTTTAAGTCAATTTGAACATGAAAACATTGTTCAGTATCTTGGCACCGACCAGGAATCCGAAAAGTTATATATTTTCCTTGAGCTGGTAACACAGGGTTCACTGTCATCACTTTACCAGAAGTACCGCTTAATAGATTCTCAAGTACGTGCATATACAAGACAAATACTAA
CTGGACTAAAGTACCTTCATGATAGAAATGTTATGCACAGgtgatatacagtttttgagtttggcttcttaatatttgtgctaaaactgcatgcactctaaaagagttaaaaacatattatctttacgtaagttttacgctaatgtcatgattgagctatttaactttgttctgtatctgaataaattggatcatggcct
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GTTGCACAGTGTTGGAGATGCTAACTCGGAGACCTCCCAATGGTGATTTAGAATGGCATCGAGCCTTTTGGAAAGTTGGACATGGTGAGGTGCCACATATACCTGATACACTATCTAGAGATGCCAAGGACTTGATACAACGATGTTTAAAATTTGAGGCTGCGGATCGACCATCAGCAGCAGAGCTCCTAGATCATCCT
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ATTGCTCCGGCCATGGATTATTTGTCAATACTTTTGTCAGTCTGAGGAAAAATCATTATGTGAATGGAGTATACCCTTTACCGCTTTGGACAGTTCTCAAATGGTTGTCGGTTTCCCATTAAACATTGACAGATGAGATTATTCACGGAAGGAAATAAGCATATATTCAATTCATTGTGAGGGTATCCAGATGTTTGTGT
ATTTTCAGATATTTTTTAAAGTTCCTCTTTGGTATAAAGGTTTGATCCTTACGAATTGAACAGATATCCCTTTTTGACGGAGCTGTTCTTAATTGAGAATGCAGAGGATAGTTCAACAGTGGTACCTGTGTGAAATTGCAGGATCTATTGAATAGTGGAGCTGTTCTTAATTGAGAATGCAGAGGATAGTTCAACAGTGG
TACCTGTGTGAAATTGCAGGATCTATTGAATAAGGGATTATGGTTCAGAGTGGATGCTATCACAAGGCTTGGACAAAGTAGATTGCAGAGGACAGTTCATCAGCGGTACCTGTGTGGAATTGCATGAGCTATTGAATAAGGGATTATGGTTAAGAGTGGTTTCTGTGTGGAGAAACAAATTTGGATTCCAGTTATTGGTA
GGAAATGGTGATAGAGGGAAGATACATTTTGCTTGGAACTGGCTCCACTCAGCTTCTCAGATTTCCTCCCACGAATGGTCGAAGCCATGCACAAGTAGTAGTGACTGCACTCTTCTATGAGGGGATTTTGTTCCACATTAATACTCTTCCATGGAGTAACTTCCATCCTTTTCTCATCCTTGCTTGTTGCCTCCACCTAA
ATTTCTTATATGTAATTTATCTCTAATTTTTAAGTTGGTATGAAATTGTGCTAAAAGCGTGGGGCATGTTGCTAATTGAGTTATTAACACAGAGGGTGAGCACAATAGTTCTAAATGTACATAGGCATTCTTTGATTGTTCATTGACGGTCAATATTTTTTCAGCTGGTTCTCTTTGTTATGGAGTTGATATTCTGATAT
GTATGATAAAGCGGCCATTGTTTATAACAAATAAATGATCTAAAAGTTACTTAGCAATGAGACCACTGAACTTTTCGAGGAGCAAATTCTCAAGTATTTCTGAGCATTGTTGCCAAAACAGCTCTAAAGAAAATCTGAAATGTTTAATCTAACAGTAGCTATTTTTCTCTGAAACTTGCATGTTGAATATAAACTTACTA
CACATTCTAATATAGGCA