sp|Q9FFF9|APC1_ARATH ----> Anaphase-promoting complex subunit 1
Intron 1 GTACACTTGA ... CCCTCATCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 62.5 | 6 | 2 | 18 |
| A2 | 100 | 0 | 1 | 0 |
| A3 | 90.48 | 1 | 8 | 11 |
| A4 | 54.29 | 8 | 4 | 15 |
| A5 | 50.91 | 5 | 1 | 9.4 |
| A6 | 60 | 1 | 1 | 2 |
| A7 | 91.3 | 1 | 8 | 13 |
| A8 | 81.82 | 1 | 3 | 6 |
| A9 | 77.78 | 3 | 8 | 13 |
| A10 | 73.33 | 4 | 7 | 15 |
>TRINITY_DN103504_c0_g1_i16 from sample A4 / Example spliced isoformCGCGGGATGTTTATTGGATGTCTTCAAATATATCTGAATTCCCTTTACAGGAAATAACTAACATTAAATTGTTGGAGAGTCTTCTGCTCTGCAAGTCGTTTTTGTTCGGCTCTTACATAAAAAAACGAACAAGCAGGAGTTGTTTGTTTAGCCTTCCACAAAGATGGGCGTAGGAGTGCGTACAGTGGCCGTGCTCAAAG
AATTTGAGCCATTCGGTTTAACAGTGGAGGCCGCTGATAATGGCAGCAACAGAAAGCGTAAGGATGGAAAGTACCAGTACATGCTATTCAATCCACAAATTTTAAGGCCCCGAGACGATGATAGCTGTCTGCACGTAGATGACTGCGAGCATGAACTCTTTATTCGTGGAAAGCATTTAATATGGAGCTCGGGACCCCAA
GTTTTCAAGCGTTTTAGTGCACCATCAACAATCATTAAGGCTTGCTGGTGCCGCTTGGAGTCTATATCTGAGCCACTTCTGTGTGTTTTGCATCTTGATTCCCTAACAGCATACACACCATCTGGTGAAATGGTTTCAATTCCAGTACCTCCTGCTACTGCATCAATCTGGCCTGTTCCATTTGGATTGCTGTTACAAAA
GGCAGCTGACAGAAATCATCTATGTACCAGTGGAACTTTTGCTGCATTTCCATCCATGCCATCTACGCAAGAATTGGGCCGTATTATTAGGGAGGGTTCTGGAACTCCCATTAGCAGTGTTTTGTCTCCTAATTTTCAATGGCCAAATTATGGTTGTGGAGCCAATTTCTCACACTACATTCTGAAGCATACTTTGGAAG
AGCCTCAGGCTTTATTAGTTGAAGAGAGAGGGAAAGCATCTGCAATGAATGATCCAGAGGAACAGATACTGTGGACGAGTGAAACCATTCCCTACATTGTGTCCTATCACAGGGGAAGTATGCGACATTCTGTATGGTATCTGAAGATGTCTAGTTCCAAAGTAGAAACGATGCCTGTTGTTTCAATCCAAAGTGAAGTA
TATGCAGAGGAACAAACCAATGTTTTGAGCTTACATCGGATCTGGCAGGATAAATGTGTTCAGCCAATTGCTAATCAGGTGTTTTTGGCAACAGATGATGATGGGGTGCCACTTATTTGCTATATGCTGAAAGGGAAAAGGAGTTTAATCTCTCTAAGGCTGCCAGATGTTCTGTCCGAAAAAATTGATGTAAGCTGCAG
TATTCCTGCAGTTGCCGCAGCACCAGTTATGATAACTCGTCCTAGACAAAGGAGATGGGGGGTTGACCACTTTGATCTGCTTATCTTATCCCCAGATGGCGACCTTTCTTTATATGTGGGGCGCCATTGTCTCTGTCAGTATATATTGCCACTAGGTGTTCTTAAAGATCTAACAATGCAAGATACATCTCCGAAACAAA
GGCACAAGGCCATAAGTGTGGACGTGCTAGAGGAAAAGGTGGAAATAGTGGGATTATCTGATGCAATTCGAGGTCGGTTAAACTTGATAACTGCTTCTGGACAGGTATTTAGATGTGCTTTGAGGCCTGCTCCAGTTTCCATGATTACAGAAGATTGTATTAGTGCTCTGGCAGAAGGACTTAGCCCTATGTTGTTTAAG
CAGTTTCGGAAATCACTCTGGAGCTACGAGTGTTCTACTCCACTATCCAGCTTGGACTTCAAATTTGATGCTGAATGGGAGACCTTTTCTAGTCTGATAATGGGGTGGATAAGAAACGTGAATTCTGCATATTTAAAACAAGAGGAGGTCAAGATAAATTCAGCCTGGGAGTTTTTGATGTGCAGTAAAATGCACAAGAA
TTATTTGAAGGCTCCTTGCTTCAGCGGCCTTTCTCTTCCACCTGCTCTTCAGCCATCCACACATTCCACTCAGACTGAACTGGTATCGACTGCAGTGCCAACTGAAGATCCATCCTTCCATAAACAAATTTTGCTGGAGATGCTAGACATCTTACATGCTATCTATGAAGACTACAAGCTAGATATTCTTCACAGCCAGG
ATTTGCAGCGGCTTGTTCCTTTAGTAAATAGTATAGCAGCTTGCCTAGGGGAGGCAAACTTTGTCGATTACTATGCTCGTGATTTTCCAGGGCTGTTTCGACATTTTCCTGTCCTCAGTATGACAACTGGGCTCAGGAATCCACCTAATTTGTTACAGTGGCTGCAGAACTGTTTAAAATATGGATGCAGTTCCAGAGAT
AGGGAAGGCCTTCCTTATTTGCTTTGTAAAGAAGGAAATTTTGCAGTAGATTGGTCCAGAAAAGTTGTGGCATTTTATGGACTTCTTTTAGGCTGTGAAAGGAGTGGCCAATGCCTTGCTTCAGGTGTGCCTTTTAATGTCGCCAGTGGCACTGCTAACTCTCCAGAACACTGGACTGTGTTGTCTATGGTTGCTGAAAA
TTTTGGGTTGCAACAGTTGGATCGATTACCTTATGGAGTCTCCCTTCCCCTGCGACATGCACTTGATAGATGCCGAGAATCTCTGCCAGTTGATTGGCCTGCGGCTGCTTATGTGCTTGTTGGGCGTGAAGATTTGGCATTAACCACCATGGGCCATTCAACCTCAGTAAAATCCCCACCTAAAGTTGAAAGTGTGTCAA
ACCATCTTAATCTTTTGCATATGTCTTCACCATACACATTGCATCTGCACCCACTGATTGTTCCATCATCTACTACTGATCTACATGAGGGTGTTGGCCCTGGGATGGAGAGAGTGGATTCTGTTCCTGATTCAATTATTGATGGCATGGAGCATATGTTCAACACAACTACACAGCTGCGATTTGGCCGTGATTTGCGG
CTTAGTGAGGTTAGGCGCCTCCTCTGTTCAGCAACACCTGTAGTTATTCATTCAGCACATGGTCCCGTTGATGAAGACCAACAGGGACATTTGTGGCATCTTACACCGCGAACCACCGCCCTCCCATTTGGACGTGGTGCATTTACCCTTGCTTCGACGTGTTCTCTCTTGACTGAGGCAATGACAATTCCAGCACTAGA
TGTGTCAGGACGCGTGGCAGTCATGAATAATTCGATTGCAAAAATGTCACGTACATGGATACAATATAACAAGCCAGATGAACCAAACTTTTCTCATGCAGGGTTTCTGATGGCCTTGGGTTTGCATGGACACTTGAGAGTTCTTGCACGAAGTGACATATATGAATACCTTACACAGACCCATGAGGCTACAATGATTG
GCACAATGCTTGGCTTGGCAGCATCCCATAGAGGCACTATGCATCCTACAATTTCAAAGATGCTTTATGTGCATATTCCTTCTCGACACCCACCTTCATTTCCAGAGTTGGAGTTACCAACACATGTGCAGTCAGCGGCAATAATGGCAGTGGGACTTCTCTATCAGGAATCGGCACATCCAATGACTATGAAAATTCTT
CTTGATGAAATTGGTCGTAGAAGTGGTGGTGGTAACGTTCTTGAAAGGGAACGCTATGCTATTGCTGCAGGCTTTGCCTTTGGCTTAGTAACATTGGGACGAGGGAATGATGCATCCGGATTTGCAGAACCTATGGTTGATCGTCTATTTCAGTACATGTCAGGTTGCAGTGAACCGCAGAATGAATCATATGCTATGGA
GTATGTATTGGATCCAGCTAGTGGTAATCAAGTAATGGATGGATTGATGGTGAACATTGATGTGACTGCACCTGCTGCAACAGTTGCACTAGCTCTAATGTACTTGAAGACAGAATGTGAAGAAGTGGCATCAAGGCTTTCCATTCCAGATACTCATTATAGTCTGCAGTTTGTGAGGCCTGATTTCATTTTGTTGCGTG
TTATTGCTCGCAACTTGATCTTGTGGGAAAGAATCAACCCAAGCAAGGCTTGGATACAAGGTCAGATTCCTGATATCGTCAAGGAAGGCGTTAGAATTATGGCAGATAATTCAGATGACATATCAGACAATATAGATATGGAAGCATTGGTTCAATCATTTGCTAATATTATTTGCGGAGCTTGTTTTTCAATAGGGTTG
AGGTATGCAGGGACAGGAAATGCAGATGCTCAAGAATTATTGTATTCCTATTCTATATATTTTTTAAATGAGATTAAACCTGTTGCATCATCAAATTCGGGTAGACATCCTAAAGGGCTTTCAAAATATGTTGAGCGGGCAACTTTAGAGACATGTCTTAGTGTATTGGTTCTTTCCCTCTCTCTGGTGATGGCAGGCAC
TGGACACTTGCAGACATTTCGACTACTACGATATCTTCATAGTCGGATAGATGCTCATGGAAATATCAAATATGGGAACCACATGGCTGTCAGCATGGCAATGGGCTTCCTGTTTCTTGGAGGGGGCATGCGTACCTTTGCAACTAACAAGGGTGCAATTGCTGCATTATTGATTTCTTTGTATCCAGTATTTCCAACAA
AACCAACTGACAACAATACCCATCTTCAGGCTTTCCGCCACCTCTATGTCCTCGCCACTGAGGCACGTTGTGTTCAAGCAGTTGATGTAGACACTGGCCGAGATGTATATGTTCCACTGGAGATAACAATCAAAGAAACAAACCATCATGTAGAAACAACATATTGTCGAGTGACTCCTTGCATTTTGCCTGAACGTTCA
ATTTTGAAGCGGGTAAGAGTTTGTGGACCTCGGTACTGGCCTCAAGATATTGAACTTTCTCCTATAGATGACCCATGGTGGGAGCCAAGGGATAAGGATAACCCATTCAATGGACGTACACTTTATGTCAAACGCAAAGTTGGAGTATGTTCATACAATGATGATCCAACAGGTTGTCAGTCTTTGCTGTCGCGTGTGAT
GCACAAGGTTTCTGACGGAAGCAAAAAATTAAGTTCTGGTACTAGCTTAGGCAAAAGCTGTGGATCTGGACTCTCCAAGGTCGATCAGCTAGTTAGTACATTTTCAGCTGATCCTAGCCTATTGGCATTTGCACAACTTTGCTGTGACAGTGCCTGGAAATACGGGACTGAAAATGATTTCCAAGAGTTTTGCATACAAG
TGCTGTTTGAATGTGTCAGCACAGACCGGCCAGCCCTTCTGCAGACATATCTTTACCTGTACACAACAGTTGCATCACTTGCCGAAAATGCACTAAGTCAGCACACTATGTGCAGTGATGCCTTGGCTCTTTCCAGTTTGAAGGTGGCAGTAGCTTATTCTGGGGCACTGGTCGATGGTAAACTACAGCCTGTCAGTGGG
GAACTCATTCAATCCAATTTCCTTGCTGCTCTTGCAAAGCGCGTGGAAGATTTACTTAATTATTGGCAATCTAGAAGGATGGACGGAGCTAATCATTACAATGATCTTGTTAATTACTTGACCAATGGAAAATGGCCACCTCCAGCTGAACCGTATCAAAGTGACTCACTACCTAGCATGTTTCTTTCCTTCTATCTTAG
GTGGTATGACATGCCACCTGCCTCTGTTGTAAATTCAGCTATGCAAAGGTTAGAGAACTTTCCTAGAGCTTTTGTCTCCTCAAAACATAATCCCAGGATGCCTCTCTTGGCGTTGATGCTACCAGGGACAAATTCCCATGCCCTTGCTCTTGTAGATGAATCTTATCCTCGTGGGTGA
>TRINITY_DN103504_c0_g1_i15 from sample A4 / Example unspliced isoform:CGCGGGATGTTTATTGGATGTCTTCAAATATATCTGAATTCCCTTTACAGGAAATAACTAACATTAAATTGTTGGAGAGTCTTCTGCTCTGCAAGTCGTTTTTGTTCGGCTCTTACATAAAAAAACGAACAAGCAGGAGTTGTTTGTTTAGCCTTCCACAAAGATGGGCGTAGGAGTGCGTACAGTGGCCGTGCTCAAAG
AATTTGAGCCATTCGGTTTAACAGTGGAGGCCGCTGATAATGGCAGCAACAGAAAGCGTAAGGATGGAAAGTACCAGTACATGCTATTCAATCCACAAATTTTAAGGCCCCGAGACGATGATAGCTGTCTGCACGTAGATGACTGCGAGCATGAACTCTTTATTCGTGGAAAGCATTTAATATGGAGCTCGGGACCCCAA
GTTTTCAAGCGTTTTAGTGCACCATCAACAATCATTAAGGCTTGCTGGTGCCGCTTGGAGTCTATATCTGAGCCACTTCTGTGTGTTTTGCATCTTGATTCCCTAACAGCATACACACCATCTGGTGAAATGGTTTCAATTCCAGTACCTCCTGCTACTGCATCAATCTGGCCTGTTCCATTTGGATTGCTGTTACAAAA
GGCAGCTGACAGAAATCATCTATGTACCAGTGGAACTTTTGCTGCATTTCCATCCATGCCATCTACGCAAGAATTGGGCCGTATTATTAGGGAGGGTTCTGGAACTCCCATTAGCAGTGTTTTGTCTCCTAATTTTCAATGGCCAAATTATGGTTGTGGAGCCAATTTCTCACACTACATTCTGAAGCATACTTTGGAAG
AGCCTCAGGCTTTATTAGTTGAAGAGAGAGGGAAAGCATCTGCAATGAATGATCCAGAGGAACAGATACTGTGGACGAGTGAAACCATTCCCTACATTGTGTCCTATCACAGGGGAAGTATGCGACATTCTGTATGGTATCTGAAGATGTCTAGTTCCAAAGTAGAAACGATGCCTGTTGTTTCAATCCAAAGTGAAGTA
TATGCAGAGGAACAAACCAATGTTTTGAGCTTACATCGGATCTGGCAGGATAAATGTGTTCAGCCAATTGCTAATCAGGTGTTTTTGGCAACAGATGATGATGGGGTGCCACTTATTTGCTATATGCTGAAAGGGAAAAGGAGTTTAATCTCTCTAAGGCTGCCAGATGTTCTGTCCGAAAAAATTGATGTAAGCTGCAG
TATTCCTGCAGTTGCCGCAGCACCAGTTATGATAACTCGTCCTAGACAAAGGAGATGGGGGGTTGACCACTTTGATCTGCTTATCTTATCCCCAGATGGCGACCTTTCTTTATATGTGGGGCGCCATTGTCTCTGTCAGTATATATTGCCACTAGGTGTTCTTAAAGATCTAACAATGCAAGATACATCTCCGAAACAAA
GGCACAAGGCCATAAGTGTGGACGTGCTAGAGGAAAAGGTGGAAATAGTGGGATTATCTGATGCAATTCGAGGTCGGTTAAACTTGATAACTGCTTCTGGACAGGTATTTAGATGTGCTTTGAGGCCTGCTCCAGTTTCCATGATTACAGAAGATTGTATTAGTGCTCTGGCAGAAGGACTTAGCCCTATGTTGTTTAAG
CAGTTTCGGAAATCACTCTGGAGCTACGAGTGTTCTACTCCACTATCCAGCTTGGACTTCAAATTTGATGCTGAATGGGAGACCTTTTCTAGTCTGATAATGGGGTGGATAAGAAACGTGAATTCTGCATATTTAAAACAAGAGGAGGTCAAGATAAATTCAGCCTGGGAGTTTTTGATGTGCAGTAAAATGCACAAGAA
TTATTTGAAGGCTCCTTGCTTCAGCGGCCTTTCTCTTCCACCTGCTCTTCAGCCATCCACACATTCCACTCAGACTGAACTGGTATCGACTGCAGTGCCAACTGAAGATCCATCCTTCCATAAACAAATTTTGCTGGAGATGCTAGACATCTTACATGCTATCTATGAAGACTACAAGCTAGATATTCTTCACAGCCAGG
ATTTGCAGCGGCTTGTTCCTTTAGTAAATAGTATAGCAGCTTGCCTAGGGGAGGCAAACTTTGTCGATTACTATGCTCGTGATTTTCCAGGGCTGTTTCGACATTTTCCTGTCCTCAGTATGACAACTGGGCTCAGGAATCCACCTAATTTGTTACAGTGGCTGCAGAACTGTTTAAAATATGGATGCAGTTCCAGAGAT
AGGGAAGGCCTTCCTTATTTGCTTTGTAAAGAAGGAAATTTTGCAGTAGATTGGTCCAGAAAAGTTGTGGCATTTTATGGACTTCTTTTAGGCTGTGAAAGGAGTGGCCAATGCCTTGCTTCAGGTGTGCCTTTTAATGTCGCCAGTGGCACTGCTAACTCTCCAGAACACTGGACTGTGTTGTCTATGGTTGCTGAAAA
TTTTGGGTTGCAACAGTTGGATCGATTACCTTATGGAGTCTCCCTTCCCCTGCGACATGCACTTGATAGATGCCGAGAATCTCTGCCAGTTGATTGGCCTGCGGCTGCTTATGTGCTTGTTGGGCGTGAAGATTTGGCATTAACCACCATGGGCCATTCAACCTCAGTAAAATCCCCACCTAAAGTTGAAAGTGTGTCAA
ACCATCTTAATCTTTTGCATATGTCTTCACCATACACATTGCATCTGCACCCACTGATTGTTCCATCATCTACTACTGATCTACATGAGGGTGTTGGCCCTGGGATGGAGAGAGTGGATTCTGTTCCTGATTCAATTATTGATGGCATGGAGCATATGTTCAACACAACTACACAGCTGCGATTTGGCCGTGATTTGCGG
CTTAGTGAGGTTAGGCGCCTCCTCTGTTCAGCAACACCTGTAGTTATTCATTCAGCACATGGTCCCGTTGATGAAGACCAACAGGGACATTTGTGGCATCTTACACCGCGAACCACCGCCCTCCCATTTGGACGTGGTGCATTTACCCTTGCTTCGACGTGTTCTCTCTTGACTGAGGCAATGACAATTCCAGCACTAGA
TGTGTCAGGACGCGTGGCAGTCATGAATAATTCGATTgtacacttgaacattactactggaactgtgggtgatttaatctcttggcctgagtttcataatggtgttgctgcaggcttaaagattgcccctcatcagGCAAAAATGTCACGTACATGGATACAATATAACAAGCCAGATGAACCAAACTTTTCTCATGCAG
GGTTTCTGATGGCCTTGGGTTTGCATGGACACTTGAGAGTTCTTGCACGAAGTGACATATATGAATACCTTACACAGACCCATGAGGCTACAATGATTGGCACAATGCTTGGCTTGGCAGCATCCCATAGAGGCACTATGCATCCTACAATTTCAAAGATGCTTTATGTGCATATTCCTTCTCGACACCCACCTTCATTT
CCAGAGTTGGAGTTACCAACACATGTGCAGTCAGCGGCAATAATGGCAGTGGGACTTCTCTATCAGGAATCGGCACATCCAATGACTATGAAAATTCTTCTTGATGAAATTGGTCGTAGAAGTGGTGGTGGTAACGTTCTTGAAAGGGAACGCTATGCTATTGCTGCAGGCTTTGCCTTTGGCTTAGTAACATTGGGACG
AGGGAATGATGCATCCGGATTTGCAGAACCTATGGTTGATCGTCTATTTCAGTACATGTCAGGTTGCAGTGAACCGCAGAATGAATCATATGCTATGGAGTATGTATTGGATCCAGCTAGTGGTAATCAAGTAATGGATGGATTGATGGTGAACATTGATGTGACTGCACCTGCTGCAACAGTTGCACTAGCTCTAATGT
ACTTGAAGACAGAATGTGAAGAAGTGGCATCAAGGCTTTCCATTCCAGATACTCATTATAGTCTGCAGTTTGTGAGGCCTGATTTCATTTTGTTGCGTGTTATTGCTCGCAACTTGATCTTGTGGGAAAGAATCAACCCAAGCAAGGCTTGGATACAAGGTCAGATTCCTGATATCGTCAAGGAAGGCGTTAGAATTATG
GCAGATAATTCAGATGACATATCAGACAATATAGATATGGAAGCATTGGTTCAATCATTTGCTAATATTATTTGCGGAGCTTGTTTTTCAATAGGGTTGAGGTATGCAGGGACAGGAAATGCAGATGCTCAAGAATTATTGTATTCCTATTCTATATATTTTTTAAATGAGATTAAACCTGTTGCATCATCAAATTCGGG
TAGACATCCTAAAGGGCTTTCAAAATATGTTGAGCGGGCAACTTTAGAGACATGTCTTAGTGTATTGGTTCTTTCCCTCTCTCTGGTAAGGCAGCTTTCCCTTTATTAGTTTTGATAATTACTCTAGATGTAGTATATGATGTTTTCTGATGTTAGATTAGATACCCAATAAAATTTTACATGTACCTAGATGTGTTCCT
TTTTGTAAAATGAAGGTGTCAGCGAT
Intron 2 GTACTATTCA ... TGCAAAACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 36.37 | 18.3 | 10 | 1 |
| A2 | 15.16 | 11.3 | 2 | 0.5 |
| A3 | 15.38 | 11 | 2 | 2.5 |
| A4 | 10.84 | 16.5 | 2 | 1.8 |
| A5 | 14.88 | 5.8 | 1 | 0.5 |
| A6 | 20.15 | 40 | 10 | 2.3 |
| A7 | 16.66 | 30.3 | 6 | 2.5 |
| A8 | 22.28 | 28 | 8 | 4 |
| A9 | 8.35 | 22 | 2 | 2 |
| A10 | 19.54 | 12.5 | 3 | 0.8 |
>TRINITY_DN43039_c4_g1_i2 from sample A8 / Example spliced isoformTGGCATTTTTTGGACTTCTTGTAGGCTGTGAAAGGAGTGGCCAATGCCTTGCTTCAGGTGTGCCTTTTAATGTCGCCAGTGGCACTGCTAACTCTCCAGAACACTGGACTGTGTTGTCTATGGTTGCTGAAAATTTTGGGTTGCAACAGTTGGATCGATTACCTTATGGAGTCTCCCTTCCCCTGCGACATGCACTTGAT
AGATGCCGAGAATCTCTGCCAGTTGATTGGCCTGCGGCTGCTTATGTGCTTGTTGGGCGTGAAGATTTGGCATTAACCACCATGGGCCATTCAACCTCAGTAAAATCCCCACCTAAAGTTGAAAGTGTGTCAAACCATCTTAATCTTTTGCATATGTCTTCACCATACACATTGCATCTGCACCCACTGATTGTTCCATC
ATCTACTACTGATCTACATGAGGGTGTTGGCCCTGGGATGGAGAGAGTGGATTCTGTTCCTGATTCAATTATTGATGGCATGGAGCATATGTTCAACACAACTACACAGCTGCGATTTGGCCGTGATTTGCGGCTTAGTGAGGTTAGGCGCCTCCTCTGTTCAGCAACACCTGTAGTTATTCATTCAGCACATGGTCCCG
TTGATGAAGACCAACAGGGACATTTGTGGCATCTTACACCGCGAACCACCGCCCTCCCATTTGGACGTGGTGCATTTACCCTTGCTTCGACGTGTTCTCTCTTGACTGAGGCAATGACAATTCCAGCACTAGATGTGTCAGGACGCGTGGCAGTCATGAATAATTCGATTGTACACTTGAACATTACTACTGGAACTGTG
GGTGATTTAATCTCTTGGCCTGAGTTTCATAATGGTGTTGCTGCAGGCTTAAAGATTGCCCCTCATCAGGCAAAAATGTCACGTACATGGATACAATATAACAAGCCAGATGAACCAAACTTTTCTCATGCAGGGTTTCTGATGGCCTTGGGTTTGCATGGACACTTGAGAGTTCTTGCACGAAGTGACATATATGAATA
CCTTACACAGACCCATGAGGCTACAATGATTGGCACAATGCTTGGCTTGGCAGCATCCCATAGAGGCACTATGCATCCTACAATTTCAAAGATGCTTTATGTGCATATTCCTTCTCGACACCCACCTTCATTTCCAGAGTTGGAGTTACCAACACATGTGCAGTCAGCGGCAATAATGGCAGTGGGACTTCTCTATCAGG
AATCGGCACATCCAATGACTATGAAAATTCTTCTTGATGAAATTGGTCGTAGAAGTGGTGGTGGTAACGTTCTTGAAAGGGAACGCTATGCTATTGCTGCAGGCTTTGCCTTTGGCTTAGTAACATTGGGACGAGGGAATGATGCATCCGGATTTGCAGAACCTATGGTTGATCGTCTATTTCAGTACATGTCAGGTTGC
AGTGAACCGCAGAATGAATCATATGCTATGGAGTATGTATTGGATCCAGCTAGTGGTAATCAAGTAATGGATGGATTGATGGTGAACATTGATGTGACTGCACCTGCTGCAACAGTTGCACTAGCTCTAATGTACTTGAAGACAGAATGTGAAGAAGTGGCATCAAGGCTTTCCATTCCAGATACTCATTATAGTCTGCA
GTTTGTGAGGCCTGATTTCATTTTGTTGCGTGTTATTGCTCGCAACATGATCTTGTGGGAAAGAATCAACCCAAGCAAGGCTTGGATACAAGGTCAGATTCCTGATATCGTCAAGGAAGGCGTTAGAATTATGGCAGATAATTCAGATGACATATCAGACAATATAGATATGGAAGCATTGGTTCAATCATTTGCTAATA
TTATTTGCGGAGCTTGTTTTTCAATAGGGTTGAGGTATGCAGGGACAGGAAATGCAGATGCTCAAGAATTATTGTATTCCTATTCTATATATTTTTTAAATGAGATTAAACCTGTTGCATCATCAAATTCGGGTAGACATCCTAAAGGGCTTTCAAAATATGTTGAGCGGGCAACTTTAGAGACATGTCTTAGTGTATTG
GTTCTTTCCCTCTCTCTGGTGATGGCAGGCACTGGACACTTGCAGACATTTCGACTACTACGATATCTTCATAGTCGGATAGATGCTCATGGAAATATCAAATATGGGAACCACATGGCTGTCAGCATGGCAATGGGCTTCCTGTTTCTTGGAGGGGGCATGCGTACCTTTGCAACTAACAAGGGTGCAATTGCTGCATT
ATTGATTTCTTTGTATCCAGTATTTCCAACAAAACCAACTGACAACAATACCCATCTTCAGGCTTTCCGCCACCTCTATGTCCTCGCCACTGAGGCACGTTGTGTTCAAGCAGTTGATGTAGACACTGGCCGAGATGTATATGTTCCACTGGAGATAACAATCAAAGAAACAAACCATCATGTAGAAACAACATATTGTC
GAGTGACTCCTTGCATTTTGCCTGAACGTTCAATTTTGAAGCGGGTAAGAGTTTGTGGACCTCGGTACTGGCCTCAAGATATTGAACTTTCTCCTATAGATGACCCATGGTGGGAGCCAAGGGATAAGGATAACCCATTCAATGGACGTACACTTTATGTCAAACGCAAAGTTGGAGTATGTTCATACAATGATGATCCA
ACAGGTTGTCAGTCTTTGCTGTCGCGTGTGATGCACAAGGTTTCTGACGGAAGCAAAAAATTAAGTTCTGGTACTAGCTTAGGCAAAAGCTGTGGATCTGGACTCTCCAAGGTCGATCAGCTAGTTAGTACATTTTCAGCTGATCCTAGCCTATTGGCATTTGCACAACTTTGCTGTGACAGTGCCTGGAAATACGGGAC
TGAAAATGATTTCCAAGAGTTTTGCATACAAGTGCTGTTTGAATGTGTCAGCACAGACCGGCCAGCCCTTCTGCAGACATATCTTTACCTGTACACAACAGTTGCATCACTTGCCGAAAATGCACTAAGTCAGCACACTATGTGCAGTGATGCCTTGGCTCTTTCCAGTTTGAAGGTTTTTTTACCATTAAGTCGTGGAC
TATTGATGTTTTATTAAGTACATGGACCTTTGGAATGTTCCTAGCATTTATGCAATTGACTATTTTAAATGAATGTTGGAATGATGATCTATTCCTTCAAAAAGGTTCATATATTCTAAATTTCCTTGCAGGTGGCAGTAGCTTATTCTGGGGCACTGGTCGATGGTAAACTACAGCCTGTCAGTGGGGAACTCATTCAA
TCCAATTTCCTTGCTGCTCTTGCAAAGCGCGTGGAAGATTTACTTAATTATTGGCAATCTAGAAGGATGGACGGAGCTAATCATTACAATGATCTTGTTAATTACTTGACCAATGGAAAATGGCCACCTCCAGCTGAACCGTATCAAAGTGACTCACTACCTAGCATGTTTCTTTCCTTCTATCTTAGGTGGTATGACAT
GCCACCTGCCTCTGTTGTAAATTCAGCTATGCAAAGGTTAGAGAACTTTCCTAGAGCTTTTGTCTCCTCAAAACATAATCCCAGGATGCCTCTCTTGGCGTTGATGCTACCAGGGACAAATTCCCATGCCCTTGCTCTTGTAGATGAATCTTATCCTCGTGGGTGTTAAGTTTCCAGGAAATTTTTCTTTCTTGGCCACT
ATATTTTTCTGCCTAGTCGCTTTTCTGATATTATATTGACAAAGGATAAGATATCAACCCTTTCATTTCATTGATAGGTTCCTAGAGAACTTTAGGTGGGGTGGATGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTTTATCTGGAGATGACATAATGGGGAGGATTTGCTCTTTGTTGAAAACAATTATGCTGGTGAAT
TGCTGGAATTGCGAAGGAGTGAGCTATGTAGAGTATTGTAAGGACACAGCCTTTGAGTGGGTAATCCTTCAAGGCAGCTAGCTGTGAGGGACCTCAATGAAGTGGGCTAATGCTTGGCAGAGTGGACACAAGCCTTCATCCAGTCTTGTCAAAACCCTAGGCTCTGTTTTTTGGAATTAAGAGTACTTATCTTTTCTCTG
TTGCAACAAATGAGTCATGGATTTCAGCAAACCTGAGGCTGATTCTATTACTATAAAGTATAAACAGTTTACTTTGTTACAGCTTGGATGCCATTTTGACAGCTTTCAAGTGTCAATGATGTATCTTGTACTTTTACATTGTATGTAAACCTTTCCGTCTGTAGGCCAGTTGGTCCTGTGGACGTTCTAATAAAATTCAA
TTCAATTCTCTCTCTTCTCTCTTGCACATGTACACACAAACTTCTTTATAAGTGTCAATGTAGTCTAAATATTTTATGTTTTCAACCTTTTC
>TRINITY_DN43039_c4_g1_i6 from sample A8 / Example unspliced isoform:CCATCATGTAGAAACAACATATTGTCGAGTGACTCCTTGCATTTTGCCTGAACGTTCAATTTTGAAGCGGGTAAGAGTTTGTGGACCTCGGTACTGGCCTCAAGATATTGAACTTTCTCCTATAGATGACCCATGGTGGGAGCCAAGGGATAAGGATAACCCATTCAATGGACGTACACTTTATGTCAAACGCAAAGTTG
GAGTATGTTCATACAATGATGATCCAACAGGTTGTCAGTCTTTGCTGTCGCGTGTGATGCACAAGGTTTCTGACGGAAGCAAAAAATTAAGTTCTGGTACTAGCTTAGGCAAAAGCTGTGGATCTGGACTCTCCAAGGTCGATCAGCTAGTTAGTACATTTTCAGCTGATCCTAGCCTATTGGCATTTGCACAACTTTGC
TGTGACAGTGCCTGGAAATACGGGACTGAAAATGATTTCCAAGAGTTTTGCATACAAGTGCTGTTTGAATGTGTCAGCACAGACCGGCCAGCCCTTCTGCAGgtactattcatttcactatagttttcatggacttggtatattaaaatgttctctttctcttctgaaaattgttctgacatgtgggtgattttgttcca
tttcaatgcaaaacagACATATCTTTACCTGTACACAACAGTTGCATCACTTGCCGAAAATGCACTAAGTCAGCACACTATGTGCAGTGATGCCTTGGCTCTTTCCAGTTTGAAGGT
Intron 3 GTTGCAGTGA ... TCATTTTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 31.48 | 37 | 0 | 17 |
| A2 | 26.09 | 34 | 0 | 12 |
| A3 | 10.53 | 34 | 0 | 4 |
| A4 | 28.57 | 10 | 0 | 4 |
| A5 | 0 | 7 | 0 | 0 |
| A6 | 18.18 | 18 | 0 | 4 |
| A7 | 19.35 | 25 | 0 | 6 |
| A8 | 0 | 9 | 0 | 0 |
| A9 | 21.43 | 33 | 0 | 9 |
| A10 | 22.22 | 21 | 0 | 6 |
>TRINITY_DN43039_c4_g1_i2 from sample A8 / Example spliced isoformTGGCATTTTTTGGACTTCTTGTAGGCTGTGAAAGGAGTGGCCAATGCCTTGCTTCAGGTGTGCCTTTTAATGTCGCCAGTGGCACTGCTAACTCTCCAGAACACTGGACTGTGTTGTCTATGGTTGCTGAAAATTTTGGGTTGCAACAGTTGGATCGATTACCTTATGGAGTCTCCCTTCCCCTGCGACATGCACTTGAT
AGATGCCGAGAATCTCTGCCAGTTGATTGGCCTGCGGCTGCTTATGTGCTTGTTGGGCGTGAAGATTTGGCATTAACCACCATGGGCCATTCAACCTCAGTAAAATCCCCACCTAAAGTTGAAAGTGTGTCAAACCATCTTAATCTTTTGCATATGTCTTCACCATACACATTGCATCTGCACCCACTGATTGTTCCATC
ATCTACTACTGATCTACATGAGGGTGTTGGCCCTGGGATGGAGAGAGTGGATTCTGTTCCTGATTCAATTATTGATGGCATGGAGCATATGTTCAACACAACTACACAGCTGCGATTTGGCCGTGATTTGCGGCTTAGTGAGGTTAGGCGCCTCCTCTGTTCAGCAACACCTGTAGTTATTCATTCAGCACATGGTCCCG
TTGATGAAGACCAACAGGGACATTTGTGGCATCTTACACCGCGAACCACCGCCCTCCCATTTGGACGTGGTGCATTTACCCTTGCTTCGACGTGTTCTCTCTTGACTGAGGCAATGACAATTCCAGCACTAGATGTGTCAGGACGCGTGGCAGTCATGAATAATTCGATTGTACACTTGAACATTACTACTGGAACTGTG
GGTGATTTAATCTCTTGGCCTGAGTTTCATAATGGTGTTGCTGCAGGCTTAAAGATTGCCCCTCATCAGGCAAAAATGTCACGTACATGGATACAATATAACAAGCCAGATGAACCAAACTTTTCTCATGCAGGGTTTCTGATGGCCTTGGGTTTGCATGGACACTTGAGAGTTCTTGCACGAAGTGACATATATGAATA
CCTTACACAGACCCATGAGGCTACAATGATTGGCACAATGCTTGGCTTGGCAGCATCCCATAGAGGCACTATGCATCCTACAATTTCAAAGATGCTTTATGTGCATATTCCTTCTCGACACCCACCTTCATTTCCAGAGTTGGAGTTACCAACACATGTGCAGTCAGCGGCAATAATGGCAGTGGGACTTCTCTATCAGG
AATCGGCACATCCAATGACTATGAAAATTCTTCTTGATGAAATTGGTCGTAGAAGTGGTGGTGGTAACGTTCTTGAAAGGGAACGCTATGCTATTGCTGCAGGCTTTGCCTTTGGCTTAGTAACATTGGGACGAGGGAATGATGCATCCGGATTTGCAGAACCTATGGTTGATCGTCTATTTCAGTACATGTCAGGTTGC
AGTGAACCGCAGAATGAATCATATGCTATGGAGTATGTATTGGATCCAGCTAGTGGTAATCAAGTAATGGATGGATTGATGGTGAACATTGATGTGACTGCACCTGCTGCAACAGTTGCACTAGCTCTAATGTACTTGAAGACAGAATGTGAAGAAGTGGCATCAAGGCTTTCCATTCCAGATACTCATTATAGTCTGCA
GTTTGTGAGGCCTGATTTCATTTTGTTGCGTGTTATTGCTCGCAACATGATCTTGTGGGAAAGAATCAACCCAAGCAAGGCTTGGATACAAGGTCAGATTCCTGATATCGTCAAGGAAGGCGTTAGAATTATGGCAGATAATTCAGATGACATATCAGACAATATAGATATGGAAGCATTGGTTCAATCATTTGCTAATA
TTATTTGCGGAGCTTGTTTTTCAATAGGGTTGAGGTATGCAGGGACAGGAAATGCAGATGCTCAAGAATTATTGTATTCCTATTCTATATATTTTTTAAATGAGATTAAACCTGTTGCATCATCAAATTCGGGTAGACATCCTAAAGGGCTTTCAAAATATGTTGAGCGGGCAACTTTAGAGACATGTCTTAGTGTATTG
GTTCTTTCCCTCTCTCTGGTGATGGCAGGCACTGGACACTTGCAGACATTTCGACTACTACGATATCTTCATAGTCGGATAGATGCTCATGGAAATATCAAATATGGGAACCACATGGCTGTCAGCATGGCAATGGGCTTCCTGTTTCTTGGAGGGGGCATGCGTACCTTTGCAACTAACAAGGGTGCAATTGCTGCATT
ATTGATTTCTTTGTATCCAGTATTTCCAACAAAACCAACTGACAACAATACCCATCTTCAGGCTTTCCGCCACCTCTATGTCCTCGCCACTGAGGCACGTTGTGTTCAAGCAGTTGATGTAGACACTGGCCGAGATGTATATGTTCCACTGGAGATAACAATCAAAGAAACAAACCATCATGTAGAAACAACATATTGTC
GAGTGACTCCTTGCATTTTGCCTGAACGTTCAATTTTGAAGCGGGTAAGAGTTTGTGGACCTCGGTACTGGCCTCAAGATATTGAACTTTCTCCTATAGATGACCCATGGTGGGAGCCAAGGGATAAGGATAACCCATTCAATGGACGTACACTTTATGTCAAACGCAAAGTTGGAGTATGTTCATACAATGATGATCCA
ACAGGTTGTCAGTCTTTGCTGTCGCGTGTGATGCACAAGGTTTCTGACGGAAGCAAAAAATTAAGTTCTGGTACTAGCTTAGGCAAAAGCTGTGGATCTGGACTCTCCAAGGTCGATCAGCTAGTTAGTACATTTTCAGCTGATCCTAGCCTATTGGCATTTGCACAACTTTGCTGTGACAGTGCCTGGAAATACGGGAC
TGAAAATGATTTCCAAGAGTTTTGCATACAAGTGCTGTTTGAATGTGTCAGCACAGACCGGCCAGCCCTTCTGCAGACATATCTTTACCTGTACACAACAGTTGCATCACTTGCCGAAAATGCACTAAGTCAGCACACTATGTGCAGTGATGCCTTGGCTCTTTCCAGTTTGAAGGTTTTTTTACCATTAAGTCGTGGAC
TATTGATGTTTTATTAAGTACATGGACCTTTGGAATGTTCCTAGCATTTATGCAATTGACTATTTTAAATGAATGTTGGAATGATGATCTATTCCTTCAAAAAGGTTCATATATTCTAAATTTCCTTGCAGGTGGCAGTAGCTTATTCTGGGGCACTGGTCGATGGTAAACTACAGCCTGTCAGTGGGGAACTCATTCAA
TCCAATTTCCTTGCTGCTCTTGCAAAGCGCGTGGAAGATTTACTTAATTATTGGCAATCTAGAAGGATGGACGGAGCTAATCATTACAATGATCTTGTTAATTACTTGACCAATGGAAAATGGCCACCTCCAGCTGAACCGTATCAAAGTGACTCACTACCTAGCATGTTTCTTTCCTTCTATCTTAGGTGGTATGACAT
GCCACCTGCCTCTGTTGTAAATTCAGCTATGCAAAGGTTAGAGAACTTTCCTAGAGCTTTTGTCTCCTCAAAACATAATCCCAGGATGCCTCTCTTGGCGTTGATGCTACCAGGGACAAATTCCCATGCCCTTGCTCTTGTAGATGAATCTTATCCTCGTGGGTGTTAAGTTTCCAGGAAATTTTTCTTTCTTGGCCACT
ATATTTTTCTGCCTAGTCGCTTTTCTGATATTATATTGACAAAGGATAAGATATCAACCCTTTCATTTCATTGATAGGTTCCTAGAGAACTTTAGGTGGGGTGGATGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTTTATCTGGAGATGACATAATGGGGAGGATTTGCTCTTTGTTGAAAACAATTATGCTGGTGAAT
TGCTGGAATTGCGAAGGAGTGAGCTATGTAGAGTATTGTAAGGACACAGCCTTTGAGTGGGTAATCCTTCAAGGCAGCTAGCTGTGAGGGACCTCAATGAAGTGGGCTAATGCTTGGCAGAGTGGACACAAGCCTTCATCCAGTCTTGTCAAAACCCTAGGCTCTGTTTTTTGGAATTAAGAGTACTTATCTTTTCTCTG
TTGCAACAAATGAGTCATGGATTTCAGCAAACCTGAGGCTGATTCTATTACTATAAAGTATAAACAGTTTACTTTGTTACAGCTTGGATGCCATTTTGACAGCTTTCAAGTGTCAATGATGTATCTTGTACTTTTACATTGTATGTAAACCTTTCCGTCTGTAGGCCAGTTGGTCCTGTGGACGTTCTAATAAAATTCAA
TTCAATTCTCTCTCTTCTCTCTTGCACATGTACACACAAACTTCTTTATAAGTGTCAATGTAGTCTAAATATTTTATGTTTTCAACCTTTTC
>TRINITY_DN43039_c4_g1_i10 from sample A8 / Example unspliced isoform:CGTCTATTTCAGTACATGTCAGgttgcagtgaaccgcagaatgtatgtttataataatgattggtcagtttgggacactgtttactgtggagaaacacgagaataaccttgaaaatagcaatgatgctaataaattggataacattcactattacagcatgaactcagggatattatttcagtcagtttctttaaacaaa
attctcaaatcgtcattttcagGTTGCAGTGAACCGCAGAATGAATCATATGCTATGGAGTATGTATTGGATCCAGCTAGTGGTAATCAAGTAATGGATGGATTGATGGTGAACATTGATGTGACTGCACCTGCTGCAACAGTTGCACTAGCTCTAATGTACTTGAAGACAGAATGTGAAGAAGTGGCATCAAGGCTTTC
CATTCCAGATACTCATTATAGTCTGCAGTTTGTGAGGCCTGATTTCATTTTGTTGCGTGTTATTGCTCGCAACATGATCTTGTGGGAAAGAATCAACCCAAGCAAGGCTTGGATACAAGGTCAGATTCCTGATATCGTCAAGGAAGGCGTTAGAATTATGGCAGATAATTCAGATGACATATCAGACAATATAGATATGG
AAGCATTGGTTCAATCATTTGCTAATATTATTTGCGGAGCTTGTTTTTCAATAGGGTTGAGGTATGCAGGGACAGGAAATGCAGATGCTCAAGAATTATTGTATTCCTATTCTATATATTTTTTAAATGAGATTAAACCTGTTGCATCATCAAATTCGGGTAGACATCCTAAAGGGCTTTCAAAATATGTTGAGCGGGCA
ACTTTAGAGACATGTCTTAGTGTATTGGTTCTTTCCCTCTCTCTGGTGATGGCAGGCACTGGACACTTGCAGACATTTCGACTACTACGATATCTTCATAGTCGGATAGATGCTCATGGAAATATCAAATATGGGAACCACATGGCTGTCAGCATGGCAATGGGCTTCCTGTTTCTTGGAGGGGGCATGCGTACCTTTGC
AACTAACAAGGGTGCAATTGCTGCATTATTGATTTCTTTGTATCCAGTATTTCCAACAAAACCAACTGACAACAATACCCATCTTCAGGCTTTCCGCCACCTCTATGTCCTCGCCACTGAGGCACGTTGTGTTCAAGCAGTTGATGTAGACACTGGCCGAGATGTATATGTTCCACTGGAGATAACAATCAAAGAAACAA
A
Intron 4 GTAATGCTGG ... TGTGTAAAAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 24.24 | 25 | 6 | 10 |
| A2 | 25.71 | 13 | 2 | 7 |
| A3 | 25 | 24 | 6 | 10 |
| A4 | 14.29 | 33 | 5 | 6 |
| A5 | 28.57 | 10 | 4 | 4 |
| A6 | 0 | 4 | 0 | 0 |
| A7 | 33.33 | 2 | 0 | 2 |
| A8 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A9 | 20 | 4 | 0 | 2 |
| A10 | 0 | 3 | 0 | 0 |
>TRINITY_DN117065_c5_g1_i5 from sample A3 / Example spliced isoformGTCGTTTTTGTTCGGCTCTTACATAAAAAAACGAACAAGCAGGAGTTGTTTGTTTAGCCTTCCACAAAGATGGGCGTAGGAGTGCGTACAGTGGCCGTGCTCAAAGAATTTGAGCCATTCGGTTTAACAGTGGAGGCCGCTGATAATGGCAGCAACAGAAAGCGTAAGGATGGAAAGTACCAGTACATGTTATTCAATCC
ACAAATTTTAAGGCCCCGAGACGATGATAGCTGTCTGCACGTAGATGACTGCGAGCATGAACTCTTTATTCGTGGAAAGCATTTAATATGGAGCTCGGGACCCCAAGTTTTCAAGCGTTTTAGTGCACCATCAACAATCATTAAGGCTTGCTGGTGCCGCTTGGAGTCTATATCTGAGCCACTTCTGTGTGTTTTGCATC
TTGATTCCCTAACAGCATACACACCATCTGGTGAAATGGTTTCAATTCCAGTACCTCCTGCTACTGCATCAATCTGGCCTGTTCCATTTGGATTGCTGTTACAAAAGGCAGCTGACAGAAATCATCTATGTACCAGTGGAACTTTTGCTGCATTTCCATCCATGCCATCTACGCAAGAATTGGGCCGTATTATTAGGGAG
GGTTCTGGAACTCCCATTAGCAGTGTTTTGTCTCCTAATTTTCAATGGCCAAATTATGGTTGTGGAGCCAATTTCTCACACTACATTCTGAAGCATACTTTGGAAGAGCCTCAGGCTTTATTAGTTGAAGAGAGAGGGAAAGCATCTGCAATGAATGATCCAGAGGAACAGATACTGTGGACGAGTGAAACCATTCCCTA
CATTGTGTCCTATCACAGGGGAAGTATGCGACATTCTGTATGGTATCTGAAGATGTCTAGTTCCAAAGTAGAAACGATGCCTGTTGTTTCAATCCAAAGTGAAGTATATGCAGAGGAACAAACCAATGTTTTGAGCTTACATCGGATCTGGCAGGATAAATGTGTTCAGCCAATTGCTAATCAGGTGTTTTTGGCAACAG
ATGATGATGGGGTGCCACTTATTTGCTATATGCTGAAAGGGAAAAGGAGTTTAATCTCTCTAAGGCTGCCAGATGTTCTGTCCGAAAAAATTGATGTAAGCTGCAGTATTCCTGCAGTTGCCGCAGCACCAGTTATGATAACTCGTCCTAGACAAAGGAGATGGGGGGTTGACCACTTTGATCTGCTTATCTTATCCCCA
GATGGCGACCTTTCTTTATATGTGGGGCGCCATTGTCTCTGTCAGTATATATTGCCACTAGGTGTTCTTAAAGATCTAACAATGCAAGATACATCTCCGAAACAAAGGCACAAGGCCATAAGTGTGGACGTGCTAGAGGAAAAGGTGGAAATAGTGGGATTATCTGATGCAATTCGAGGTCGGTTAAACTTGATAACTGC
TTCTGGACAGGTATTTAGATGTGCTTTGAGGCCTGCTCCAGTTTCCATGATTACAGAAGATTGTATTAGTGCTCTGGCAGAAGGACTTAGCCCTATGTTGTTTAAGCAGTTTCGGAAATCACTCTGGAGCTACGAGTGTTCTACTCCACTATCCAGCTTGGACTTCAAATTTGATGCTGAATGGGAGACCTTTTCTAGTC
TGATAATGGGGTGGATAAGAAACGTGAATTCTGCATATTTAAAACAAGAGGAGGTCAAGATAAATTCAGCCTGGGAGTTTTTGATGTGCAGTAAAATGCACAAGAATTATTTGAAGGCTCCTTGCTTCAGCGGCCTTTCTCTTCCACCTGCTCTTCAGCCATCCACACATTCCACTCAGACTGAACTGGTATCGACTGCA
GTGCCAACTGAAGATCCATCCTTCCATAAACAAATTTTGCTGGAGATGCTAGACATCTTACATGCTATCTATGAAGACTACAAGCTAGATATTCTTCACAGCCAGGATTTGCAGCGGCTTGTTCCTTTAGTAAATAGTATAGCAGCTTGCCTAGGGGAGGCAAACTTTGTCGATTACTATGCTCGTGATTTTCCAGGGCT
GTTTCGACATTTTCCTGTCCTCAGTATGACAACTGGGCTCAGGAATCCACCTAATTTGTTACAGTGGCTGCAGAACTGTTTAAAATATGGATGCAGTTCCAGAGATAGGGAAGGCCTTCCTTATTTGCTTTGTAAAGAAGGAAATTTTGCAGTAGATTGGTCCAGAAAAGTTGTGGCATTTTATGGACTTCTTTTAGGCT
GTGAAAGGAGTGGCCAATGCCTTGCTTCAGGTGTGCCTTTTAATGTCGCCAGTGGCACTGCTAACTCTCCAGAACACTGGACTGTGTTGTCTATGGTTGCTGAAAATTTTGGGTTGCAACAGTTGGATCGATTACCTTATGGAGTCTCCCTTCCCCTGCGACATGCACTTGATAGATGCCGAGAATCTCTGCCAGTTGAT
TGGCCTGCGGCTGCTTATGTGCTTGTTGGGCGTGAAGATTTGGCATTAACCACCATGGGCCATTCAACCTCAGTAAAATCCCCACCTAAAGTTGAAAGTGTGTCAAACCATCTTAATCTTTTGCATATGTCTTCACCATACACATTGCATCTGCACCCACTGATTGTTCCATCATCTACTACTGATCTACATGAGGGTGT
TGGCCCTGGGATGGAGAGAGTGGATTCTGTTCCTGATTCAATTATTGATGGCATGGAGCATATGTTCAACACAACTACACAGCTGCGATTTGGCCGTGATTTGCGGCTTAGTGAGGTTAGGCGCCTCCTCTGTTCAGCAACACCTGTAGTTATTCATTCAGCACATGGTCCCGTTGATGAAGACCAACAGGGACATTTGT
GGCATCTTACACCGCGAACCACCGCCCTCCCATTTGGACGTGGTGCATTTACCCTTGCTTCGACGTGTTCTCTCTTGACTGAGGCAATGACAATTCCAGCACTAGATGTGTCAGGACGCGTGGCAGTCATGAATAATTCGATTGTACACTTGAACATTACTACTGGAACTGTGGGTGATTTAATCTCTTGGCCTGAGTTT
CATAATGGTGTTGCTGCAGGCTTAAAGATTGCCCCTCATCAGGCAAAAATGTCACGTACATGGATACAATATAACAAGCCAGATGAACCAAACTTTTCTCATGCAGGGTTTCTGATGGCCTTGGGTTTGCATGGACACTTGAGAGTTCTTGCACGAAGTGACATATATGAATACCTTACACAGACCCATGAGGCTACAAT
GATTGGCACAATGCTTGGTTTGGCAGCATCCCATAGAGGCACTATGCATCCTACAATTTCAAAGATGCTTTATGTGCATATTCCTTCTCGACACCCACCTTCATTTCCAGAGTTGGAGTTACCAACACATGTGCAGTCAGCGGCAATAATGGCAGTGGGACTTCTCTATCAGGAATCGGCACATCCAATGACTATGAAAA
TTCTTCTTGATGAAATTGGTCGTAGAAGTGGTGGTGGTAACGTTCTTGAAAGGGAACGCTATGCTATTGCTGCAGGCTTTGCCTTTGGCTTAGTAACATTGGGACGAGGGAATGATGCATCCGGATTTGCAGAACCTATGGTTGATCGTCTATTTCAGTACATGTCAGGTTGCAGTGAACCGCAGAATGAATCATATGCT
ATGGAGTATGTATTGGATCCAGCTAGTGGTAATCAAGTAATGGATGGATTGATGGTGAACATTGATGTGACTGCACCTGCTGCAACAGTTGCACTAGCTCTAATGTACTTGAAGACAGAATGTGAAGAAGTGGCATCAAGGCTTTCCATTCCAGATACTCATTATAGTCTGCAGTTTGTGAGGCCTGATTTCATTTTGTT
GCGTGTTATTGCTCGCAACATGATCTTGTGGGAAAGAATCAACCCAAGCAAGGCTTGGATACAAGGTCAGATTCCTGATATCGTCAAGGAAGGCGTTAGAATTATGGCAGATAATTCAGATGACATATCAGACAATATAGATATGGAAGCATTGGTTCAATCATTTGCTAATATTATTTGCGGAGCTTGTTTTTCAATAG
GGTTGAGGTATGCAGGGACAGGAAATGCAGATGCTCAAGAATTATTGTATTCCTATTCTATATATTTTTTAAATGAGATTAAACCTGTTGCATCATCAAATTCGGGTAGACATCCTAAAGGGCTTTCAAAATATGTTGAGCGGGCAACTTTAGAGACATGTCTTAGTGTATTGGTTCTTTCCCTCTCTCTGGTGATGGCA
GGCACTGGACACTTGCAGACATTTCGACTACTACGATATCTTCATAGTCGGATAGATGCTCATGGAAATATCAAATATGGGAACCACATGGCTGTCAGCATGGCAATGGGCTTCCTGTTTCTTGGAGGGGGCATGCGTACCTTTGCAACTAACAAGGGTGCAATTGCTGCATTATTGATTTCTTTGTATCCAGTATTTCC
AACAAAACCAACTGACAACAATACCCATCTTCAGGCTTTCCGCCACCTCTATGTCCTCGCCACTGAGGCACGTTGTGTTCAAGCAGTTGATGTAGACACTGGCCGAGATGTATATGTTCCACTGGAGATAACAATCAAAGAAACAAACCATCATGTAGAAACAACATATTGTCGAGTGACTCCTTGCATTTTGCCTGAAC
GTTCAATTTTGAAGCGGGTAAGAGTTTGTGGACCTCGGTACTGGCCTCAAGATATTGAACTTTCTCCTATAGATGACCCATGGTGGGAGCCAAGGGATAAGGATAACCCATTCAATGGACGTACACTTTATGTCAAACGCAAAGTTGGAGTATGTTCATACAATGATGATCCAACAGGTTGTCAGTCTTTGCTGTCGCGT
GTGATGCACAAGGTTTCTGACGGAAGCAAAAAATTAAGTTCTGGTACTAGCTTAGGCAAAAGCTGTGGATCTGGACTCTCCAAGGTCGATCAGCTAGTTAGTACATTTTCAGCTGATCCTAGCCTATTGGCATTTGCACAACTTTGCTGTGACAGTGCCTGGAAATACGGGACTGAAAATGATTTCCAAGAGTTTTGCAT
ACAAGTGCTGTTTGAATGTGTCAGCACAGACCGGCCAGCCCTTCTGCAGACATATCTTTACCTGTACACAACAGTTGCATCACTTGCCGAAAATGCACTAAGTCAGCACACTATGTGCAGTGATGCCTTGGCTCTTTCCAGTTTGAAGGTGGCAGTAGCTTATTCTGGGGCACTGGTCGATGGTAAACTACAGCCTGTCA
GTGGGGAACTCATTCAATCCAATTTCCTTGCTGCTCTTGCAAAGCGCGTGGAAGATTTACTTAATTATTGGCAATCTAGAAGGATGGACGGAGCTAATCATTACAATGATCTTGTTAATTACTTGACCAATGGAAAATGGCCACCTCCAGCTGAACCGTATCAAAGTGACTCACTACCTAGCATGTTTCTTTCCTTCTAT
CTTAGGTGGTATGACATGCCACCTGCCTCTGTTGTAAATTCAGCTATGCAAAGGTTAGAGAACTTTCCTAGAGCTTTTGTCTCCTCAAAACATAATCCCAGGATGCCTCTCTTGGCGTTGATGCTACCAGGGACAAATTCCCATGCCCTTGCTCTTGTAGATGAATCTTATCCTCGTGGGTGTTAAGTTTCCAGGAAATT
TTTCTTTCTTGGCCACTATATTTTTCTGCCTAGTCGCTTTTCTGATATTATATTGACAAAGGATAAGATATCAACCCTTTCATTTCATTGATAGGTTCCTAGAGAACTTTAGGTGGGGTGGATGCTCTCTCTCCC
>TRINITY_DN117065_c5_g1_i7 from sample A3 / Example unspliced isoform:GTCGTTTTTGTTCGGCTCTTACATAAAAAAACGAACAAGCAGGAGTTGTTTGTTTAGCCTTCCACAAAGATGGGCGTAGGAGTGCGTACAGTGGCCGTGCTCAAAGAATTTGAGCCATTCGGTTTAACAGTGGAGGCCGCTGATAATGGCAGCAACAGAAAGCGTAAGGATGGAAAGTACCAGTACATGTTATTCAATCC
ACAAATTTTAAGGCCCCGAGACGATGATAGCTGTCTGCACGTAGATGACTGCGAGCATGAACTCTTTATTCGTGGAAAGCATTTAATATGGAGCTCGGGACCCCAAGTTTTCAAGCGTTTTAGTGCACCATCAACAATCATTAAGGCTTGCTGGTGCCGCTTGGAGTCTATATCTGAGCCACTTCTGTGTGTTTTGCATC
TTGATTCCCTAACAGCATACACACCATCTGGTGAAATGGTTTCAATTCCAGTACCTCCTGCTACTGCATCAATCTGGCCTGTTCCATTTGGATTGCTGTTACAAAAGGCAGCTGACAGAAATCATCTATGTACCAGTGGAACTTTTGCTGCATTTCCATCCATGCCATCTACGCAAGAATTGGGCCGTATTATTAGGGAG
GGTTCTGGAACTCCCATTAGCAGTGTTTTGTCTCCTAATTTTCAATGGCCAAATTATGGTTGTGGAGCCAATTTCTCACACTACATTCTGAAGCATACTTTGGAAGAGCCTCAGGCTTTATTAGTTGAAGAGAGAGGGAAAGCATCTGCAATGAATGATCCAGAGGAACAGATACTGTGGACGAGTGAAACCATTCCCTA
CATTGTGTCCTATCACAGGGgtaatgctggttttttgtatcctatcagcatttggttgttattaggccacgggagaaacattatttgtggctatgctcattttatttgagagcttactgcatcaagattctagcttagaattttttatcatttaattagtaattagaccatgccttttcattggtactctatggttaact
gatattaaccggggactcattgtgtaaaagGAAGTATGCGACATTCTGTATGGTATCTGAAGATGTCTAGTTCCAAAGTAGAAACGATGCCTGTTGTTTCAATCCAAAGTGAAGTATATGCAGAGGAACAAACCAATGTTTTGAGCTTACATCGGATCTGGCAGGATAAATGTGTTCAGCCAATTGCTAATCAGGTACTA
ATATCTATTTTTCCAATGCAAAGGACCTTCTAGAGGTTGGATACTCATTAGGTTGAATGATTTGCTGGCAAATTGGTTAGAAATTTATTTTCTTTTGTATTTTAAGG
Intron 5 GTTTTTTTAC ... TTCCTTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 22.22 | 21 | 5.6 | 6 |
| A2 | 12 | 22 | 1.8 | 3 |
| A3 | 30.77 | 9 | 1.8 | 4 |
| A4 | 23.08 | 20 | 4.6 | 6 |
| A5 | 14.29 | 6 | 3.6 | 1 |
| A6 | 21.21 | 26 | 7.1 | 7 |
| A7 | 33.93 | 37 | 2.8 | 19 |
| A8 | 30.77 | 27 | 9.6 | 12 |
| A9 | 16.13 | 26 | 8 | 5 |
| A10 | 38.3 | 29 | 0 | 18 |
>TRINITY_DN44590_c0_g1_i2 from sample A7 / Example spliced isoformGCTGATAATGGCAGCAACAGAAAGCGTAAGGATGGAAAGTACCAGTACATGCTATTCAATCCACAAATTTTAAGGCCCCGAGACGATGATAGCTGTCTGCACGTAGATGACTGCGAGCATGAACTCTTTATTCGTGGAAAGCATTTAATATGGAGCTCGGGACCCCAAGTTTTCAAGCGTTTTAGTGCACCATCAACAAT
CATTAAGGCTTGCTGGTGCCGCTTGGAGTCTATATCTGAGCCACTTCTGTGTGTTTTGCATCTTGATTCCCTAACAGCATACACACCATCTGGTGAAATGGTTTCAATTCCAGTACCTCCTGCTACTGCATCAATCTGGCCTGTTCCATTTGGATTGCTGTTACAAAAGGCAGCTGACAGAAATCATCTATGTACCAGTG
GAACTTTTGCTGCATTTCCATCCATGCCATCTACGCAAGAATTGGGCCGTATTATTAGGGAGGGTTCTGGAACTCCCATTAGCAGTGTTTTGTCTCCTAATTTTCAATGGCCAAATTATGGTTGTGGAGCCAATTTCTCACACTACATTCTGAAGCATACTTTGGAAGAGCCTCAGGCTTTATTAGTTGAAGAGAGAGGG
AAAGCATCTGCAATGAATGATCCAGAGGAACAGATACTGTGGACGAGTGAAACCATTCCCTACATTGTGTCCTATCACAGGGGAAGTATGCGACATTCTGTATGGTATCTGAAGATGTCTAGTTCCAAAGTAGAAACGATGCCTGTTGTTTCAATCCAAAGTGAAGTATATGCAGAGGAACAAACCAATGTTTTGAGCTT
ACATCGGATCTGGCAGGATAAATGTGTTCAGCCAATTGCTAATCAGGTGTTTTTGGCAACAGATGATGATGGGGTGCCACTTATTTGCTATATGCTGAAAGGGAAAAGGAGTTTAATCTCTCTAAGGCTGCCAGATGTTCTGTCCGAAAAAATTGATGTAAGCTGCAGTATTCCTGCAGTTGCCGCAGCACCAGTTATGA
TAACTCGTCCTAGACAAAGGAGATGGGGGGTTGACCACTTTGATCTGCTTATCTTATCCCCAGATGGCGACCTTTCTTTATATGTGGGGCGCCATTGTCTCTGTCAGTATATATTGCCACTAGGTGTTCTTAAAGATCTAACAATGCAAGATACATCTCCGAAACAAAGGCACAAGGCCATAAGTGTGGACGTGCTAGAG
GAAAAGGTGGAAATAGTGGGATTATCTGATGCAATTCGAGGTCGGTTAAACTTGATAACTGCTTCTGGACAGGTATTTAGATGTGCTTTGAGGCCTGCTCCAGTTTCCATGATTACAGAAGATTGTATTAGTGCTCTGGCAGAAGGACTTAGCCCTATGTTGTTTAAGCAGTTTCGGAAATCACTCTGGAGCTACGAGTG
TTCTACTCCACTATCCAGCTTGGACTTCAAATTTGATGCTGAATGGGAGACCTTTTCTAGTCTGATAATGGGGTGGATAAGAAACGTGAATTCTGCATATTTAAAACAAGAGGAGGTCAAGATAAATTCAGCCTGGGAGTTTTTGATGTGCAGTAAAATGCACAAGAATTATTTGAAGGCTCCTTGCTTCAGCGGCCTTT
CTCTTCCACCTGCTCTTCAGCCATCCACACATTCCACTCAGACTGAACTGGTATCGACTGCAGTGCCAACTGAAGATCCATCCTTCCATAAACAAATTTTGCTGGAGATGCTAGACATCTTACATGCTATCTATGAAGACTACAAGCTAGATATTCTTCACAGCCAGGATTTGCAGCGGCTTGTTCCTTTAGTAAATAGT
ATAGCAGCTTGCCTAGGGGAGGCAAACTTTGTCGATTACTATGCTCGTGATTTTCCAGGGCTGTTTCGACATTTTCCTGTCCTCAGTATGACAACTGGGCTCAGGAATCCACCTAATTTGTTACAGTGGCTGCAGAACTGTTTAAAATATGGATGCAGTTCCAGAGATAGGGAAGGCCTTCCTTATTTGCTTTGTAAAGA
AGGAAATTTTGCAGTAGATTGGTCCAGAAAAGTTGTGGCATTTTATGGACTTCTTTTAGGCTGTGAAAGGAGTGGCCAATGCCTTGCTTCAGGTGTGCCTTTTAATGTCGCCAGTGGCACTGCTAACTCTCCAGAACACTGGACTGTGTTGTCTATGGTTGCTGAAAATTTTGGGTTGCAACAGTTGGATCGATTACCTT
ATGGAGTCTCCCTTCCCCTGCGACATGCACTTGATAGATGCCGAGAATCTCTGCCAGTTGATTGGCCTGCGGCTGCTTATGTGCTTGTTGGGCGTGAAGATTTGGCATTAACCACCATGGGCCATTCAACCTCAGTAAAATCCCCACCTAAAGTTGAAAGTGTGTCAAACCATCTTAATCTTTTGCATATGTCTTCACCA
TACACATTGCATCTGCACCCACTGATTGTTCCATCATCTACTACTGATCTACATGAGGGTGTTGGCCCTGGGATGGAGAGAGTGGATTCTGTTCCTGATTCAATTATTGATGGCATGGAGCATATGTTCAACACAACTACACAGCTGCGATTTGGCCGTGATTTGCGGCTTAGTGAGGTTAGGCGCCTCCTCTGTTCAGC
AACACCTGTAGTTATTCATTCAGCACATGGTCCCGTTGATGAAGACCAACAGGGACATTTGTGGCATCTTACACCGCGAACCACCGCCCTCCCATTTGGACGTGGTGCATTTACCCTTGCTTCGACGTGTTCTCTCTTGACTGAGGCAATGACAATTCCAGCACTAGATGTGTCAGGACGCGTGGCAGTCATGAATAATT
CGATTGTACACTTGAACATTACTACTGGAACTGTGGGTGATTTAATCTCTTGGCCTGAGTTTCATAATGGTGTTGCTGCAGGCTTAAAGATTGCCCCTCATCAGGCAAAAATGTCACGTACATGGATACAATATAACAAGCCAGATGAACCAAACTTTTCTCATGCAGGGTTTCTGATGGCCTTGGGTTTGCATGGACAC
TTGAGAGTTCTTGCACGAAGTGACATATATGAATACCTTACACAGACCCATGAGGCTACAATGATTGGCACAATGCTTGGCTTGGCAGCATCCCATAGAGGCACTATGCATCCTACAATTTCAAAGATGCTTTATGTGCATATTCCTTCTCGACACCCACCTTCATTTCCAGAGTTGGAGTTACCAACACATGTGCAGTC
AGCGGCAATAATGGCAGTGGGACTTCTCTATCAGGAATCGGCACATCCAATGACTATGAAAATTCTTCTTGATGAAATTGGTCGTAGAAGTGGTGGTGGTAACGTTCTTGAAAGGGAACGCTATGCTATTGCTGCAGGCTTTGCCTTTGGCTTAGTAACATTGGGACGAGGGAATGATGCATCCGGATTTGCAGAACCTA
TGGTTGATCGTCTATTTCAGTACATGTCAGGTTGCAGTGAACCGCAGAATGAATCATATGCTATGGAGTATGTATTGGATCCAGCTAGTGGTAATCAAGTAATGGATGGATTGATGGTGAACATTGATGTGACTGCACCTGCTGCAACAGTTGCACTAGCTCTAATGTACTTGAAGACAGAATGTGAAGAAGTGGCATCA
AGGCTTTCCATTCCAGATACTCATTATAGTCTGCAGTTTGTGAGGCCTGATTTCATTTTGTTGCGTGTTATTGCTCGCAACTTGATCTTGTGGGAAAGAATCAACCCAAGCAAGGCTTGGATACAAGGTCAGATTCCTGATATCGTCAAGGAAGGCGTTAGAATTATGGCAGATAATTCAGATGACATATCAGACAATAT
AGATATGGAAGCATTGGTTCAATCATTTGCTAATATTATTTGCGGAGCTTGTTTTTCAATAGGGTTGAGGTATGCAGGGACAGGAAATGCAGATGCTCAAGAATTATTGTATTCCTATTCTATATATTTTTTAAATGAGATTAAACCTGTTGCATCATCAAATTCGGGTAGACATCCTAAAGGGCTTTCAAAATATGTTG
AGCGGGCAACTTTAGAGACATGTCTTAGTGTATTGGTTCTTTCCCTCTCTCTGGTGATGGCAGGCACTGGACACTTGCAGACATTTCGACTACTACGATATCTTCATAGTCGGATAGATGCTCATGGAAATATCAAATATGGGAACCACATGGCTGTCAGCATGGCAATGGGCTTCCTGTTTCTTGGAGGGGGCATGCGT
ACCTTTGCAACTAACAAGGGTGCAATTGCTGCATTATTGATTTCTTTGTATCCAGTATTTCCAACAAAACCAACTGACAACAATACCCATCTTCAGGCTTTCCGCCACCTCTATGTCCTCGCCACTGAGGCACGTTGTGTTCAAGCAGTTGATGTAGACACTGGCCGAGATGTATATGTTCCACTGGAGATAACAATCAA
AGAAACAAACCATCATGTAGAAACAACATATTGTCGAGTGACTCCTTGCATTTTGCCTGAACGTTCAATTTTGAAGCGGGTAAGAGTTTGTGGACCTCGGTACTGGCCTCAAGATATTGAACTTTCTCCTATAGATGACCCATGGTGGGAGCCAAGGGATAAGGATAACCCATTCAATGGACGTACACTTTATGTCAAAC
GCAAAGTTGGAGTATGTTCATACAATGATGATCCAACAGGTTGTCAGTCTTTGCTGTCGCGTGTGATGCACAAGGTTTCTGACGGAAGCAAAAAATTAAGTTCTGGTACTAGCTTAGGCAAAAGCTGTGGATCTGGACTCTCCAAGGTCGATCAGCTAGTTAGTACATTTTCAGCTGATCCTAGCCTATTGGCATTTGCA
CAACTTTGCTGTGACAGTGCCTGGAAATACGGGACTGAAAATGATTTCCAAGAGTTTTGCATACAAGTGCTGTTTGAATGTGTCAGCACAGACCGGCCAGCCCTTCTGCAGACATATCTTTACCTGTACACAACAGTTGCATCACTTGCCGAAAATGCACTAAGTCAGCACACTATGTGCAGTGATGCCTTGGCTCTTTC
CAGTTTGAAGGTGGCAGTAGCTTATTCTGGGGCACTGGTCGATGGTAAACTACAGCCTGTCAGTGGGGAACTCATTCAATCCAATTTCCTTGCTGCTCTTGCAAAGCGCGTGGAAGATTTACTTAATTATTGGCAATCTAGAAGGATGGACGGAGCTAATCATTACAATGATCTTGTTAATTACTTGACCAATGGAAAAT
GGCCACCTCCAGCTGAACCGTATCAAAGTGACTCACTACCTAGCATGTTTCTTTCCTTCTATCTTAGGTGGTATGACATGCCACCTGCCTCTGTTGTAAATTCAGCTATGCAAAGGTTAGAGAACTTTCCTAGAGCTTTTGTCTCCTCAAAACATAATCCCAGGATGCCTCTCTTGGCGTTGATGCTACCAGGGACAAAT
TCCCATGCCCTTGCTCTTGTAGATGAATCTTATCCTCGTGGGTGTTAAGTTTCCAGGAAATTTTTCTTTCTTGGCCACTATATTTTTCTGCCTAGTCGCTTTTCTGATATTATATTGACAAAGGATAAGATATCAACCCTTTCATTTCATTGATAGGTTCCTAGAGAACTTTAGGTGGGGTGGATGCTCTCTCTCTCTCT
CTCTCTCTCTTTCTTTATCTGGAGATGACATAATGGGGAGGATTTGCTCTTTGTTGAAAACAATTATGCTGGTGAATTGCTGGAATTGCGAAGGAGTGAGCTATGTAGAGTATTGTAAGGACACAGCCTTTGAGTGGGTAATCCTTCAAGGTAGCTAGCTGTGAGGGACCTCAATGAAGTGGGCTAATGCTTGGCAGAGT
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>TRINITY_DN44590_c0_g1_i1 from sample A7 / Example unspliced isoform:GGTGATTTTGTTCCATTTCAATGCAAAACAGACATATCTTTACCTGTACACAACAGTTGCATCACTTGCCGAAAATGCACTAAGTCAGCACACTATGTGCAGTGATGCCTTGGCTCTTTCCAGTTTGAAGgtttttttaccattaagtcgtggactattgatgttttattaagtacatggacctttggaatgttcctagc
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