sp|Q84JN2|TIN1_ARATH ----> Protein TUNICAMYCIN INDUCED 1


Intron 1 GTATGTATGT ... GATTTTACAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
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A107.35542043



>TRINITY_DN89397_c0_g1_i3 from sample A4 / Example spliced isoform
TATCTGACGACAAATTTTAAATCTCGGCGTCGGCGTGATTGTAGTGAATCTCTCGGGAAGCCATGGCGGTCCAGATATTCCACATGAAAATGTGGGTATAACGAAATCTGGCAAAGTAATTAAATAATTTCCGTTCTTCACCCCCTCCTGTTATTCTCTGGGTCGGGTTCCGGATGCACGACCTCTGCCCGTGCCTCTCC
ATTCCTTGATTGATGTGAAGCGGGAAAGAAGAAGAAGACGACAACGACGATGCTCCGTCTGTGGATTTTCATTTGGTTTCCAGTAGTATTCTCACCGATTTCACTCGCAACCTCCAACAATTCGACCGCAGATCAAATCCCCGCCGCTTCCCTGAATTCGCTTTCGGAAGTGATCCAGGTGATATCCGCAGCGCAAGACT
GGAATTCGGAGGAAGTAGCGGTGTCCAACATAGACACCGCGGGGGCTAAATTTGGCAAGACGCAAAGCTACGAGCTGGACGTGCAAGTGGGGGAGAAAGTTTTCCCCGCCAGATTTGTCGACGAATTAACTTCTTCGAGGTATTCAGAGGAAAAGGAGACGGGAATTGATGGGGAGAATTCATTTGGGGGTTTGATGGAG
TCCGCTAATTTGGCGGCGGAGGCGGTGCTTCTGCCGTTTCAGATGCAGGGGCCGCTGGAAGTGTGGATCGAGCAAGCCGATAACTTGCAGTTGGTTATGCCGGATAATAACAACATTGGAGGTTTCAAGCACTTGATTTTGGCTGAGGGTGCAGTTGTAACTGTTGAAGGAGCTCGAGAAGTAAGCCTTGCCCACCCAGT
GGATTTTCCCTCATCACTGAACACAAGCTTTCCTGTCAGTGGCCCTGGAAGCAACCTTTGGGCTCTTTCTTTATCTTTGAGACATGCAATGCAGTTAGAAGGCAGACGTTTAGTGGCATTACGTATTATTGGTCCAACATTGATGGTTGTGGCTGCATTAGGGAACCAGGAGACAACTGAAAGTAACGTGGAAGCAAATT
TTTTTGCTCCAGGTGCTCTAGAACTGTTCATAAATAGAACAGAAATCAATTCACCTTCTCGAATTGGCAACCTATCTGATCAGCAAATGTGGCCTCTGCCTTCTCTGTATAGTTCAGATCTGAAGTTGTTGTTTCTGGAGAAATTGCTGATAAGATATCTTGGTAATCGAGCTTACAGGGAAGGCTCTTTTAGAATCATT
AGAGCTAGTGCGACAGCATCCGTGTTTGTAAAAATACAGCTAGAGTTGGAGAAAAAACTTAGCAATGACAGTTTTGATTCAGATTTATGGCCTGCATGGAGGACAAGGCCCACTGTGCAGAGGCTTCATTTTGAGGTCCTGGCAAGAGTGGAGGGGAAGAAACTGAAGCCTATACTCATCAAAAGGCGGAAGCCATTTGT
TAAGGTCGAAACACACTCATGGAGTGACTTGATGTCTAATGTGTCATTTACTAGTTTTCCATCTGTACTTATTCCTTGTAGTCCATTGACTCTTGATGTAGAGTGGTAAGAGACCGTTACTTCCATGTACATTATTATTGTATTTCAATTGGTGGATGGCTTTTATGTTTTTCCAAATGCAGATTGTATTCTTGGGTGAA
AATTAAGGCTTTAAGGATGATATTGGCATTGCCTCCTTTACAAATGATATCTCTTAATATGGGACCTGACGCTGACTTGATTTTATGTAGAAACTTAGAAAGAATATGTTTGCCTATTGTATCATTCCTGATTAGTGAAGTTC


>TRINITY_DN89397_c0_g1_i2 from sample A4 / Example unspliced isoform:
ATGGGAGGATTTTACAGGAAGTGGATTCCCTGAATTCGCTTTCGgtatgtatgttgtaaagtttgattaatatattagtttgggggaaaattcgagcacagattttaatgggaggattttacagGAAGTGATCCAGGTGATATCCGCAGCGCAAGACTGGAATTCGGAGGAAGTAGCGGTGTCCAACATAGACACCGCGG
GGGCTAAATTTGGCAAGACGCAAAGCTACGAGCTGGACGTGCAAGTGGGGGAGAAAGTTTTCCCCGCCAGATTTGTCGACGAATTAACTTCTTCGAGGTATTCAGAGGAAAAGGAGACGGGAATTGATGGGGAGAATTCATTTGGGGGTTTGATGGAGTCCGCTAATTTGGCGGCGGAGGCGGTGCTTCTGCCGTTTCAG
ATGCAGGGGCCGCTGGAAGTGTGGATCGAGCAAGCCGATAACTTGCAGTTGGTTATGCCGGATAATAACAACATTGGAGGTTTCAAGCACTTGATTTTGGCTGAGGGTGCAGTTGTAACTGTTGAAGGAGCTCGAGAAGTAAGCCTTGCCCACCCAGTGGATTTTCCCTCATCACTGAACACAAGCTTTCCTGTCAGTGG
CCCTGGAAGCAACCTTTGGGCTCTTTCTTTATCTTTGAGACATGCAATGCAGTTAGAAGGCAGACGTTTAGTGGCATTACGTATTATTGGTCCAACATTGATGGTTGTGGCTGCATTAGGGAACCAGGAGACAACTGAAAGTAACGTGGAAGCAAATTTTTTTGCTCCAGGTGCTCTAGAACTGTTCATAAATAGAACAG
AAATCAATTCACCTTCTCGAATTGGCAACCTATCTGATCAGCAAATGTGGCCTCTGCCTTCTCTGTATAGTTCAGATCTGAAGTTGTTGTTTCTGGAGAAATTGCTGATAAGATATCTTGGTAATCGAGCTTACAGGGAAGGCTCTTTTAGAATCATTAGAGCTAGTGCGACAGCATCCGTGTTTGTAAAAATACAGCTA
GAGTTGGAGAAAAAACTTAGCAATGACAGTTTTGATTCAGATTTATGGCCTGCATGGAGGACAAGGCCCACTGTGCAGAGGCTTCATTTTGAGGTCCTGGCAAGAGTGGAGGGGAAGAAACTGAAGCCTATACTCATCAAAAGGCGGAAGCCATTTGTTAAGGTCGAAACACACTCATGGAGTGACTTGATGTCTAATGT
GTCATTTACTAGTTTTCCATCTGTACTTATTCCTTGTAGTCCATTGACTCTTGATGTAGAGTGGTAAGAGACCGTTACTTCCATGTACATTATTATTGTATTTCAATTGGTGGATGGCTTTTATGTTTTTCCAAATGCAGATTGTATTCTTGGGTGAAAATTAAGGCTTTAAGGATGATATTGGCATTGCCTCCTTTACA
AATGATATCTCTTAATATGGGACCTGACGCTGACTTGATTTTATGTAGAAACTTAGAAAGAATATGTTTGCCTATTGTATCATTCCTGATTAGTGAAGTTC



Intron 2 GTATGTATGT ... GATTTTACAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A112.5140220
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A414.62111219
A56.2512008
A69.56785083
A710.4586068
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A910.4543063
A107.35542043



>TRINITY_DN90243_c0_g1_i2 from sample A2 / Example spliced isoform
GTGCAATGTACTTAGCCACCAATCTATCCGAAATAACTATAAATTATGTAAAACAAAAATATAATTAAATAGGACAAAAGAGTACAGTTATCTGACGACAAATTTTAAATCTCGGCGTCGGCGTGATTGTAGTGAATCTCTCGGGAAGCCATGGCGGTCCAGATATTCCACATGAAAATGTGGGTATAACGAAATCTGGC
AAAGTAATTAAATAATTTCCGTTCTTCACCCCCTCCTGTTATTCTCTGGGTCGGGTTCCGGATGCACGACCTCTGCCCGTGCCTCTCCATTCCTTGATTGATGTGAAGCGGGAAAGAAGAAGAAGACGACAACGACGATGCTCCGTCTGTGGATTTTCATTTGGTTTCCAGTAGTATTCTCACCGATTTCACTCGCAACC
TCCAACAATTCGACCGCAGATCAAATCCCCGCCGCTTCCCTGAATTCGCTTTCGGAAGTGATCCAGGTGATATCCGCAGCGCAAGACTGGAATTCGGAGGAAGTAGCGGTGTCCAACATAGACACCGCGGGGGCTAAATTTGGCAAGACGCAAAGCTACGAGCTGGACGTGCAAGTGGGGGAGAAAGTTTTCCCCGCCAG
ATTTGTCGACGAATTAACTTCTTCGAGGTATTCAGAGGAAAAGGAGACGGGAATTGATGGGGAGAATTCATTTGGGGGTTTGATGGAGTCCGCTAATTTGGCGGCGGAGGCGGTGCTTCTGCCGTTTCAGATGCAGGGGCCGCTGGAAGTGTGGATCGAGCAAGCCGATAACTTGCAGTTGGTTATGCCGGTATGTCTCT
GACTAAACAATTCCTCTTAATTTAGCCGAAACCCTCATTATAATTTCAGTACAAATGGTCTGAATTTTCTCTTGAGATATCTTTACTTAGGAAATTAATAATAATAATAATGCGGCCTTCATTCAGCTCAAGCTTTGTTCCAGATGACTCTTAATCGTCTTTAGTCGTTTAATGATGATATCTAAATCAGGGTATGGTAA
TTAGGCCTACTGGTATGATAGTAGTTCTAGATTTATGCCTATTGGGTTGCGG


>TRINITY_DN90243_c0_g1_i1 from sample A2 / Example unspliced isoform:
GGGAAAATTCGAGCACAGATTTTAATGGGAGGATTTTACAGGAAGTGGATTCCCTGAATTCGCTTTCGgtatgtatgttgtaaagtttgattaatatattagtttgggggaaaattcgagcacagattttgggtatgtatgttgtaaagtttgattaatatattagtttgggggaaaattcgagcacagattttaatggg
aggattttacagGAAGTGATCCAGGTGATATCCGCAGCGCAAGACTGGAATTCGGAGGAAGTAGCGGTGTCCAACATAGACACCGCGGGGGCTAAATTTGGCAAGACGCAAAGCTACGAGCTGGACGTGCAAGTGGGGGAGAAAGTTTTCCCCGCCAGATTTGTCGACGAATTAACTTCTTCGAGGTATTCAGAGGAAAA
GGAGACGGGAATTGATGGGGAGAATTCATTTGGGGGTTTGATGGAGTCCGCTAATTTGGCGGCGGAGGCGGTGCTTCTGCCGTTTCAGATGCAGGGGCCGCTGGAAGTGTGGATCGAGCAAGCCGATAACTTGCAGTTGGTTATGCCGGATAATAACAACATTGGAGGTTTCAAGCACTTGATTTTGGCTGAGGGTGCAG
TTGTAACTGTTGAAGGAGCTCGAGAAGTAAGCCTTGCCCACCCAGTGGATTTTCCCTCATCACTGAACACAAGCTTTCCTGTCAGTGGCCCTGGAAGCAACCTTTGGGCTCTTTCTTTATCTTTGAGACATGCAATGCAGTTAGAAGGCAGACGTTTAGTGGCATTACGTATTATTGGTCCAACATTGATGGTTGTGGCT
GCATTAGGGAACCAGGAGACAACTGAAAGTAACGTGGAAGCAAATTTTTTTGCTCCAGGTGCTCTAGAACTGTTCATAAATAGAACAGAAATCAATTCACCTTCTCGAATTGGCAACCTATCTGATCAGCAAATGTGGCCTCTGCCTTCTCTGTATAGTTCAGATCTGAAGTTGTTGTTTCTGGAGAAATTGCTGATAAG
ATATCTTGGTAATCGAGCTTACAGGGAAGGCTCTTTTAGAATCATTAGAGCTAGTGCGACAGCATCCGTGTTTGTAAAAATACAGCTAGAGTTGGAGAAAAAACTTAGCAATGACAGTTTTGATTCAGATTTATGGCCTGCATGGAGGACAAGGCCCACTGTGCAGAGGCTTCATTTTGAGGTCCTGGCAAGAGTGGAGG
GGAAGAAACTGAAGCCTATACTCATCAAAAGGCGGAAGCCATTTGTTAAGGTCGAAACACACTCATGGAGTGACTTGATGTCTAATGTGTCATTTACTAGTTTTCCATCTGTACTTATTCCTTGTAGTCCATTGACTCTTGATGTAGAGTGGTAAGAGACCGTTACTTCCATGTACATTATTATTGTATTTCAATTGGTG
GATGGCTTTTATGTTTTTCCAAATGCAGATTGTATTCTTGGGTGAAAATTAAGGCTTTAAGGATGATATTGGCATTGCCTCCTTTACAAATGATATCTCTTAATATGGGACCTGACGCTGACTTGATTTTATGTAGAAACTTAGAAAGAATATGTTTGCCTATTGTATCATTCCTGATTAGTGAAGTTAAATTTCAGTTT
GTAAAAGAACTGCTCATTTGTAGGCTGTTTCAATGTGATATTTTTAT