sp|Q9SSG5|BOR5_ARATH ----> Putative boron transporter 5

Intron 1 GCATGTGCAC ... TATTTTTTAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	75	4	12	3
A2	54.55	5	6	1
A3	63.64	4	7	0
A4	82.35	3	14	1
A5	100	0	2	0
A6	100	0	10	0
A7	62.5	6	10	2
A8	-1	0	0	2
A9	55.56	4	5	2
A10	50	5	5	4

>TRINITY_DN45022_c0_g2_i3 from sample A9 / Example spliced isoform

TCACAATCAGGTAAAAACGCATACACCAGAGACAATTCGCGGATTCAAGATAATTAAACCGTCAGGAGTTTTCTCGTTTTCTTCACTCCAATTATCCCAATCGATGTGACCAAGAACATCTATTTTCATGACCAGGGCTTGTGTGTGGACGATGTTGCTTCTATGCCTTCTAGTTATTTTCGGTGCCTGTTCAATCGTCA
ACAAGAATAGTTGGGGAGCTATTTGGCATGTTGATTGTTTTCTTGTTCATTCATGAAGGGAGCTATCAAGGGACTGAGAACGATCATGGAAAAGAGCCTCATGGTGTATGGGTATGTCACCGGTGTGGGTGGACGTATCCTAATCCACATCCAAGTGCTAAGCACCGGAGGAACCACAT

>TRINITY_DN45022_c0_g2_i1 from sample A9 / Example unspliced isoform:

TCACAATCAGGTAAAAACGCATACACCAGAGACAATTCGCGGATTCAAGATAATTAAACCGTCAGGAGTTTTCTCGTTTTCTTCACTCCAATTATCCCAATCGATGTGACCAAGAACATCTATTTTCATGACCAGGGCTTGTGTGTGGACGATGTTGCTTCTATGCCTTCTAGTTATTTTCGGTGCCTGTTCAATCGTCA
ACAAGAATAGTTGGGGAGCTATTTGGCATGTTGATTGTTTTCTTGTTCATTCATGAAGGGAGCTATCAAGgcatgtgcacttaccattcctatatctggggaccaagttttcaatattttactgaaattttgtattgaaagaaccccgttgaaattgtgttttcagggtttgatagatgaatatcatatgccctaaaatg
agaacccctatgccgatcatttcaaatttccttgtggtttcacaaatgggttatttggaagtgttttatcttttggtctactactggcaaccttaaaagaaaaagggcttgatcatggcgatatggcattggtagagtttctttcttattgctaatttagagtctatgatgatgataacgttgctgccatatgttaatct
aatggataaatttgtcaacagcttggttgagaagtttttgtgcagattatggtgtacccctgatgattgtggtatggaaaactatctcatatagtgctggaattcctagaagactttctagtcctaatccctagtctcctggagcatcatccaattgtgcaataattctttaggagaattgtgagaattgagaaccttac
tattttttttctttatttaatgaagtatttgattatgatctctttaaagtctgtcactgatgacattaaattggaaatgttagtaggatatgcacaaagttccaaccctctacattctagctgcatttatccctgcaattatgatagtggggctctattttttctatcacagtgtggaagctcaaatggctcaacataaa
taatttaatttgagaaatccaccagcttaccattatgtcttacttttattgggtattatggtgtgtcatgatttgtctccaggattaagttttggtttccaagtgatgtattgtgtagtatattgatgttgcaactgacttttctacaatttattatggatttgattcccttaatgcgggtatttatatgtggattattt
tgaatccctccatctaatggtgtattgccacaatcctcaatgcatacaaatatctttgcaactctgaagtggcaggtaggttaatgtacttattaagaactcatattaggaagtcttctctcttggatttacattgtataggtctaatcacaatatttcatttgtgtcctgtatatgtttcactaactagtattttttag


GGACTGAGAACGATCATGGAAAAGAGCCTCATGGTGTATGGGTATGTCACCGGTGTGGGTGGACGTATCCTAATCCACATCCAAGTGCTAAGCACCGGAGGAACCACAT

Intron 2 GCATGTGCAC ... GTGTTTTCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	63.16	7	12	12
A2	52.38	5	6	5
A3	43.75	9	7	7
A4	55	9	14	8
A5	55.56	4	2	8
A6	90.91	1	10	10
A7	68.42	3	10	3
A8	45.45	3	0	5
A9	33.33	8	5	3
A10	52.94	8	5	13

>TRINITY_DN45022_c0_g2_i2 from sample A9 / Example spliced isoform

TCACAATCAGGTAAAAACGCATACACCAGAGACAATTCGCGGATTCAAGATAATTAAACCGTCAGGAGTTTTCTCGTTTTCTTCACTCCAATTATCCCAATCGATGTGACCAAGAACATCTATTTTCATGACCAGGGCTTGTGTGTGGACGATGTTGCTTCTATGCCTTCTAGTTATTTTCGGTGCCTGTTCAATCGTCA
ACAAGAATAGTTGGGGAGCTATTTGGCATGTTGATTGTTTTCTTGTTCATTCATGAAGGGAGCTATCAAGGGTTTGATAGATGAATATCATATGCCCTAAAATGAGAACCCCTATGCCGATCATTTCAAATTTCCTTGTGGTTTCACAAATGGGTTATTTGGAAGTGTTTTATCTTTTGGTCTACTACTGGCAACCTTAA
AAGAAAAAGGGCTTGATCATGGCGATATGGCATTGGTAGAGTTTCTTTCTTATTGCTAATTTAGAGTCTATGATGATGATAACGTTGCTGCCATATGTTAATCTAATGGATAAATTTGTCAACAGCTTGGTTGAGAAGTTTTTGTGCAGATTATGGTGTACCCCTGATGATTGTGGTATGGAAAACTATCTCATATAGTG
CTGGAATTCCTAGAAGACTTTCTAGTCCTAATCCCTAGTCTCCTGGAGCATCATCCAATTGTGCAATAATTCTTTAGGAGAATTGTGAGAATTGAGAACCTTACTATTTTTTTTCTTTATTTAATGAAGTATTTGATTATGATCTCTTTAAAGTCTGTCACTGATGACATTAAATTGGAAATGTTAGTAGGATATGCACA
AAGTTCCAACCCTCTACATTCTAGCTGCATTTATCCCTGCAATTATGATAGTGGGGCTCTATTTTTTCTATCACAGTGTGGAAGCTCAAATGGCTCAACATAAATAATTTAATTTGAGAAATCCACCAGCTTACCATTATGTCTTACTTTTATTGGGTATTATGGTGTGTCATGATTTGTCTCCAGGATTAAGTTTTGGT
TTCCAAGTGATGTATTGTGTAGTATATTGATGTTGCAACTGACTTTTCTACAATTTATTATGGATTTGATTCCCTTAATGCGGGTATTTATATGTGGATTATTTTGAATCCCTCCATCTAATGGTGTATTGCCACAATCCTCAATGCATACAAATATCTTTGCAACTCTGAAGTGGCAGGTAGGTTAATGTACTTATTAA
GAACTCATATTAGGAAGTCTTCTCTCTTGGATTTACATTGTATAGGTCTAATCACAATATTTCATTTGTGTCCTGTATATGTTTCACTAACTAGTATTTTTTAGGGACTGAGAACGATCATGGAAAAGAGCCTCATGGTGTATGGGTATGTCACCGGTGTGGGTGGACGTATCCTAATCCACATCCAAGTGCTAAGCACC
GGAGGAACCACAT

>TRINITY_DN45022_c0_g2_i1 from sample A9 / Example unspliced isoform:

TCACAATCAGGTAAAAACGCATACACCAGAGACAATTCGCGGATTCAAGATAATTAAACCGTCAGGAGTTTTCTCGTTTTCTTCACTCCAATTATCCCAATCGATGTGACCAAGAACATCTATTTTCATGACCAGGGCTTGTGTGTGGACGATGTTGCTTCTATGCCTTCTAGTTATTTTCGGTGCCTGTTCAATCGTCA
ACAAGAATAGTTGGGGAGCTATTTGGCATGTTGATTGTTTTCTTGTTCATTCATGAAGGGAGCTATCAAGgcatgtgcacttaccattcctatatctggggaccaagttttcaatattttactgaaattttgtattgaaagaaccccgttgaaattgtgttttcagGGTTTGATAGATGAATATCATATGCCCTAAAATG
AGAACCCCTATGCCGATCATTTCAAATTTCCTTGTGGTTTCACAAATGGGTTATTTGGAAGTGTTTTATCTTTTGGTCTACTACTGGCAACCTTAAAAGAAAAAGGGCTTGATCATGGCGATATGGCATTGGTAGAGTTTCTTTCTTATTGCTAATTTAGAGTCTATGATGATGATAACGTTGCTGCCATATGTTAATCT
AATGGATAAATTTGTCAACAGCTTGGTTGAGAAGTTTTTGTGCAGATTATGGTGTACCCCTGATGATTGTGGTATGGAAAACTATCTCATATAGTGCTGGAATTCCTAGAAGACTTTCTAGTCCTAATCCCTAGTCTCCTGGAGCATCATCCAATTGTGCAATAATTCTTTAGGAGAATTGTGAGAATTGAGAACCTTAC
TATTTTTTTTCTTTATTTAATGAAGTATTTGATTATGATCTCTTTAAAGTCTGTCACTGATGACATTAAATTGGAAATGTTAGTAGGATATGCACAAAGTTCCAACCCTCTACATTCTAGCTGCATTTATCCCTGCAATTATGATAGTGGGGCTCTATTTTTTCTATCACAGTGTGGAAGCTCAAATGGCTCAACATAAA
TAATTTAATTTGAGAAATCCACCAGCTTACCATTATGTCTTACTTTTATTGGGTATTATGGTGTGTCATGATTTGTCTCCAGGATTAAGTTTTGGTTTCCAAGTGATGTATTGTGTAGTATATTGATGTTGCAACTGACTTTTCTACAATTTATTATGGATTTGATTCCCTTAATGCGGGTATTTATATGTGGATTATTT
TGAATCCCTCCATCTAATGGTGTATTGCCACAATCCTCAATGCATACAAATATCTTTGCAACTCTGAAGTGGCAGGTAGGTTAATGTACTTATTAAGAACTCATATTAGGAAGTCTTCTCTCTTGGATTTACATTGTATAGGTCTAATCACAATATTTCATTTGTGTCCTGTATATGTTTCACTAACTAGTATTTTTTAG
GGACTGAGAACGATCATGGAAAAGAGCCTCATGGTGTATGGGTATGTCACCGGTGTGGGTGGACGTATCCTAATCCACATCCAAGTGCTAAGCACCGGAGGAACCACAT