sp|Q8VYA5|RSZ33_ARATH ----> Serine/arginine-rich splicing factor RS2Z33


Intron 1 GTATCTTTTA ... ACCTATATAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A121.81701920
A219.5470.725.39
A320.5842.716.35.7
A411.393572
A520.52055.3
A615.46260.751.344
A714.98379.36766.7
A816.97454.295.790
A916.2231751.771
A1015.0126846.748



>TRINITY_DN116991_c0_g3_i3 from sample A1 / Example spliced isoform
GAAGAATCGTATCTTTGCATGAAGATTGATTTGGGTTACAATTTTACAGTGGCTGAGTGGAAAGCAATTCGAAGGTGGCTGAGTGGAAAATATCTACATTTGTTCGAGGTTCCCTGGGTCTGCAGTCTTTACATAGGGACCACATGGAGTTGGTTGAACTTGAGAATATCTAGGAAGGGGCCCTCCACTTGGGTCTCGGA
AGTGCTTCAAATGTGGGAATGATGGCCATTGGGATTAATACGGTAAAGATGGGGATTGGAAAATTCAAAATCAACCAGTAGGGACCACGTGGAGTTGGTCGAACTTGAGAATATCTGGGAAGGGGCCTTCCACTTGGGTCTGAGCGGTGCTTCAATTGTGGGAAAGATGGCCATTGGGCTCAAGACTTTAAATCCGGGGA
TTGGAAAAATAAATGTCATCGTTGTGGTGAGTGGGTTCATATGGAAATAAATTTTCAAAATAGTCCAAAATCAACTAGCAGGTATGTCTTAGTACTTGTGTTTGGGCCGTGTCTGTGATCTCCATCTTCCTATGAACAAACAAAAATGTTTTTATTTTATTTAAATCCACAGGTTAAGCTTGATTCATAATGCATTGATG
ATTCATTTGGAAAACACTATTGTAATAAAGGTTGATAATATATATTGGTGTATTAATGTGCATGACGTGAAAATAATATATATTGGTGAGCTTGAAGAATGGGATAATATGTTGGTGGATATTGTTAGGTTTGCTCATTTACGGCTATCTCAGGATCATAAAGCATAGAAATAAAGGTTTGTCCTTGTGAATGAAGCTTT
AGAAGCACATGCTCATCTCTATAGAATCCCTTGTTGGACAGAAAAGCAGAGCTCTTTCCATGCTGAAAGGTTTCTACAATTCTAAC


>TRINITY_DN116991_c0_g3_i5 from sample A1 / Example unspliced isoform:
GAAGAATCGTATCTTTGCATGAAGATTGATTTGGGTTACAATTTTACAGTGGCTGAGTGGAAAGCAATTCGAAGGTGGCTGAGTGGAAAATATCTACATTTGTTCGAGGTTCCCTGGGTCTGCAGTCTTTACATAGGAGCCCAGTTATTCTTGTCATGCAGATGAAGCAAGATACTATCTTAATGGAAGAGATCTGGATG
GGAGATTCATTCTTGTGGAGTTTACAAGATGGGGACCACATGGAGTTGGTTGAACTTGAGAATATCTAGGAAGGGGCCCTCCACTTGGGTCTCGGAAGTGCTTCAAATGTGGGAATGATGGCCATTGGGATTAATACGGTAAAGATGGGGATTGGAAAATTCAAAATCAACCAGTAGgtatgttttagtacttgtgtttg
ggccacgtctgtgagccccatcttctggcccagagagtttgcatttttgcaagtttaatttttatccatgaaaaattaccttagcaagatatttgtggttgtttatacctaattttgatcattgttggattccttcagttgatttatatatcatgttttattacttacctatatag
GGACCACGTGGAGTTGGTCGAACT
TGAGAATATCTGGGAAGGGGCCTTCCACTTGGGTCTGAGCGATGCTTCAATTGTGGGAAATATGGCCATTGGGCTCAAGACTGTAAATCCGAGGATTGGAAAAATAAATGTTATCGTTGTGGTGAGTGGGTTCATATGGAAATAAATTTTCAAAATAGTCCAAAATCAACTAGCAGGTATGTCTTAGTACTTGTGTTTGG
GCCGTGTCTGTGATCTCCATCTTCCTATGAACAAACAAAAATGTTTTTATTTTATTTAAATCCACAGGTTAAGCTTGATTCATAATGCATTGATGATTCATTTGGAAAACACTATTGTAATAAAGGTTGATAATATATATTGGTGTATTAATGTGCATGACGTGAAAATAATATATATTGGTGAGCTTGAAGAATGGGAT
AATATGTTGGTGGATATTGTTAGGTTTGCTCATTTACGGCTATCTCAGGATCATAAAGCATAGAAATAAAGGTTTGTCCTTGTGAATGAAGCTTTAGAAGCACATGCTCATCTCTATAGAATCCCTTGTTGGACAGAAAAGCAGAGCTCTTTCCATGCTGAAAGGTTTCTACAATTCTAAC