sp|Q8VYB9|JMJ27_ARATH ----> Lysine-specific demethylase JMJ27


Intron 1 GTAGGTACTC ... TTTTGAACAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A119.86113283
A225.411384717
A323.58942910
A418.4653122
A526.8330114
A615.32188348
A718.892926813
A814.563115311
A917.01283588
A1019.372044910



>TRINITY_DN118301_c4_g1_i3 from sample A2 / Example spliced isoform
CTATGATCGTTTTTGCATTTACATGATCCTCGTCTTGGGTGTAGCATCCATACCACTGCATTTAAGTGAGGAATTTATAATTTATTTTCATTCCATATTTCAGGTAAATGTCTTGACACATACAGCTGAAGTCAAGTTCCCACGTTGGCAAGCATCTATAATAGAAAAAAAGAAGAAAACGTACAGGGCACAAGATATGA
GAGAACTTTATGGGGAGACTGATGGGATCAAGAAATCAATCAGTGAAGAACGGCATGAGATACTGGATAAGGTGGAGTCAGAAGCAGATGAAGTTGGTGTTTCAGGATCCCAAGGAGTCATGAAGGAAGAAACATCTCCATCGCCTCCTCCCTTGGAACGATCTCCATCACCTCCTCCCCTGGAGCAACATGTTAATTGT
GAGGAAAGTGAATCTAAAGTGATTAGTAATCTAGATGCTGACTTGGAAGGATGTGATCTAGATAATGTGGAAAATCAGTCCAATGGTCTACCAGAGAGGCGAGATGAAAATGATAAATCTCCAGAAGTTAGTACCAAGCATTCAGAAAAGAAAAAGGATTTTGGTAGCACAGAAAACAATTCAGAGACCAACTATGGGGG
GGCTCTATGGGACATCTTCCGCAGAGAGGATGTACCAAAGTTGCAAGATTATCTGCGGAAGCATTGGAAAGAGTTTAGGCATATTGGTGGTGCTCCGGTCAATTCTGTTGTACATCCCATTCATGATCAGACACTTTTCTTGAATGAAAAGCATAAGAGGAAGCTGAAGGAGGAGTTCCAAATAGAACCATGGACATTTG
AGCAGTATCCTGGTGAAGCAGTTTTTATTCCGGCCGGATGTCCTCACCAAGTTAGAAATCGGAAGTCATGTATTAAAGTGGCAATGGACTTTGTGTCGCCTGAAAATGTACAAGAATGTGTGCGTTTGACAGAGGAATTCCGCTTGCTCCCAAAGAATCATAGGGCCAGAGAAGACAAGTTAGAGGTAAAGAAGATGACG
CTATATGCAGCCAGCCTAGCAGCGAGAGAACTCCAAAAATTGATATCAGATTCAAAGACCTAAGACAGTAGTTTCAAAGAAAATACATTATTTATGGTCACAAATGAGGGTGGAGAGTGCACAAGTTGGCGCTGATATTATAAAATGCTGGACAGATAGACAAAATAATAACTGCTAACTCTCTCTTTGTACTCCTTTAT
GCAAATGGCATTAGCATATAGTTGCGTAAAAGCAGAGTTATGTGCATATTACGACCTGCTGAAAGATTATGTATTTCATTTTCTTGTCAGTTCAAGGAGCAGACCAATGACAATTTTTGCAAGTATTGTTTCCACACCACACAGTATTGCCCCCCCCCCAACCCCCGCCCTCCGACTATTTTGTAAAGAATTGCTGTTTC
TTTGTCGAAGAATGTTCTTTTTCAGTCCAGCGATTGTGGACCATCTTTTTCTAACTTGAAAAGAACTAGAGGAAAGTTCCTCAGTAAATCCATCACAAGTCAGCTTGAAATCACTAATTTATTCCAGTTAAAGGACTAGATTGGTTTGTGCACCTGATAAGAATAATTTAGACTCATTAGTCCTGAATGATAAATGACAT
AGAGTTCCCTGGGTAGACTTTGAATTAGTTTGGAACTTTCCAAAAGCTAAAGATAAACTTCCCAAGTCCTGAGACGATGTGTCCATTGAGAATTAAGTTTTAAATGTAGTATAGCTTGCAAGATGTTTTCAACTAATAATTTGCTTATATACACAGCAAGAACTTAATTGGCTTGAAGTTAGCTGGTATGCCTTTTCATG
CTAAGAAACATAATATGCCATTTTACTGGATGTATCATCTAGTCCCATTGACCCACTTTTGTGGTCATTTGGACATTAATAAAATTGTATTATCTTAT


>TRINITY_DN118301_c4_g1_i4 from sample A2 / Example unspliced isoform:
GTTGAAGTTGAAGGATTGGCCTCCATCAAACTTATTTGAAGAGCGCTTACCTCGACATGGATCTGAGTTCATTACTGCATTGCCCTATCATGAGTATACTCATCCTAAGTGTGGTCTGTTAAATCTGGCCACAAAGCTTCCTGATACCTGTTTGAAGCCTGATCTAGGACCAAAAACATACATTGCGTATGGAACCCTTG
ATGAGCTTGGCAGAGGCGATTCAGTAACTAAATTACACTGTGATATGTCTGATGCGGTAAATGTCTTGACACATACAGCTGAAGTCAAGTTCCCACGTTGGCAAGCATCTATAATAGAAAAAAAGAAGAAAACGTACAGGGCACAAGATATGAGAGAACTTTATGGGGAGACTGATGGGATCAAGAAATCAATCAGTGAA
GAACGGCATGAGATACTGGATAAGGTGGAGTCAGAAGCAGATGAAGTTGGTGTTTCAGGATCCCAAGGAGTCATGAAGGAAGAAACATCTCCATCGCCTCCTCCCTTGGAACGATCTCCATCACCTCCTCCCCTGGAGCAACATGTTAATTGTGAGGAAAGTGAATCTAAAGTGATTAGTAATCTAGATGCTGACTTGGA
AGGATGTGATCTAGATAATGTGGAAAATCAGTCCAATGGTCTACCAGAGAGGCGAGATGAAAATGATAAATCTCCAGAAGTTAGTACCAAGCATTCAGAAAAGAAAAAGGATTTTGGTAGCACAGAAAACAATTCAGAGACCAACTATGGGGGGGCTCTATGGGACATCTTCCGCAGAGAGGATGTACCAAAGTTGCAAG
ATTATCTGCGGAAGCATTGGAAAGAGTTTAGGCATATTGGTGGTGCTCCGGTCAATTCTGTTGTACATCCCATTCATGATCAGACACTTTTCTTGAATGAAAAGCATAAGAGGAAGCTGAAGGAGGAGTTCCAAATAGAACCATGGACATTTGAGCAGTATCCTGGTGAAGCAGTTTTTATTCCGGCCGGATGTCCTCAC
CAAGTTAGAAATCGGAAGTCATGTATTAAAGTGGCAATGGACTTTGTGTCGCCTGAAAATGTACAAGAATGTGTGCGTTTGACAGAGGAATTCCGCTTGCTCCCAAAGAATCATAGGGCCAGAGAAGACAAGTTAGAGgtaggtactcttttacctaggaatttgttatggagattgaactaatttcctagatttttccc
ccttgattcttctcaaatagacgaatgtcgtctgagttggttctttttgaacagGTAAAGAAGATGACGCTATATGCAGCCAGCCTAGCAGCGAGAGAACTCCAAAAATTGATATCAGATTCAAAGACCTAAGACAGTAGTTTCAAAGAAAATACATTATTTATGTAAGCTGAATAATTTATTATCTGGATCTGTGGACT
TTATTATGAAGATTTATGTTATGTCATGTGTTATCAGTCATCTAATCAATCGCTGGTTTCAGGGTCACAAATGAGGGTGGAGAGTGCACAAGTTGGCGCTGATATTATAAAATGCTGGACAGATAGACAAAATAATAACTGCTAACTCTCTCTTTGTACTCCTTTATGCAAATGGCATTAGCATATAGTTGCGTAAAAGC
AGAGTTATGTGCATATTACGACCTGCTGAAAGATTATGTATTTCATTTTCTTGTCAGTTCAAGGAGCAGACCAATGACAATTTTTGCAAGTATTGTTTCCACACCACACAGTATTGCCCCCCCCCCAACCCCCGCCCTCCGACTATTTTGTAAAGAATTGCTGTTTCTTTGTCGAAGAATGTTCTTTTTCAGTCCAGCGA
TTGTGGACCATCTTTTTCTAACTTGAAAAGAACTAGAGGAAAGTTCCTCAGTAAATCCATCACAAGTCAGCTTGAAATCACTAATTTATTCCAGTTAAAGGACTAGATTGGTTTGTGCACCTGATAAGAATAATTTAGACTCATTAGTCCTGAATGATAAATGACATAGAGTTCCCTGGGTAGACTTTGAATTAGTTTGG
AACTTTCCAAAAGCTAAAGATAAACTTCCCAAGTCCTGAGACGATGTGTCCATTGAGAATTAAGTTTTAAATGTAGTATAGCTTGCAAGATGTTTTCAACTAATAATTTGCTTATATACACAGCAAGAACTTAATTGGCTTGAAGTTAGCTGGTATGCCTTTTCATGCTAAGAAACATAATATGCCATTTTACTGGATGT
ATCATCTAGTCCCATTGACCCACTTTTGTGGTCATTTGGACATTAATAAAATTGTATTATCTTAT



Intron 2 GTAAGCTGAA ... CTGGTTTCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A120.83852916
A223.268939.415
A324.527837.714
A421.123810.410
A526.392816.14
A614.9316032.424
A715.0526355.938
A813.652626321
A916.972547134
A1014.7620457.714



>TRINITY_DN114413_c0_g2_i4 from sample A1 / Example spliced isoform
AAATCATAGTTGCGTTATCCACATAAACACATTCATATTGAAATCGACATGCATCAATTTTTTCATTTTGAAAAAGATAGATAGTTGAAGGATTGGCCTCCATCAAACTTATTTGAAGAGCGCTTACCTCGACATGGATCTGAGTTCATTACTGCATTGCCCTATCATGAGTATACTCATCCTAAGTGTGGTCTGTTAAA
TCTGGCCACAAAGCTTCCTGATACCTGTTTGAAGCCTGATCTAGGACCAAAAACATACATTGCGTATGGAACCCTTGATGAGCTTGGCAGAGGCGATTCAGTAACTAAATTACACTGTGATATGTCTGATGCGGTAAATGTCTTGACACATACAGCTGAAGTCAAGTTCCCACGTTGGCAAGCATCTATAATAGAAAAAA
AGAAGAAAACGTACAGGGCACAAGATATGAGAGAACTTTATGGGGAGACTGATGGGATCAAGAAATCAATCAGTGAAGAACGGCATGAGATACTGGATAAGGTGGAGTCAGAAGCAGATGAAGTTGGTGTTTCAGGATCCCAAGGAGTCATGAAGGAAGAAACATCTCCATCGCCTCCTCCCTTGGAACGATCTCCATCA
CCTCCTCCCCTGGAGCAACATGTTAATTGTGAGGAAAGTGAATCTAAAGTGATTAGTAATCTAGATGCTGACTTGGAAGGATGTGATCTAGATAATGTGGAAAATCAGTCCAATGGTCTACCAGAGAGGCGAGATGAAAATGATAAATCTCCAGAAGTTAGTACCAAGCATTCAGAAAAGAAAAAGGATTTTGGTAGCAC
AGAAAACAATTCAGAGACCAACTATGGGGGGGCTCTATGGGACATCTTCCGCAGAGAGGATGTACCAAAGTTGCAAGATTATCTGCGGAAGCATTGGAAAGAGTTTAGGCATATTGGTGGTGCTCCGGTCAATTCTGTTGTACATCCCATTCATGATCAGACACTTTTCTTGAATGAAAAGCATAAGAGGAAGCTGAAGG
AGGAGTTCCAAATAGAACCATGGACATTTGAGCAGTATCCTGGTGAAGCAGTTTTTATTCCGGCCGGATGTCCTCACCAAGTTAGAAATCGGAAGTCATGTATTAAAGTGGCAATGGACTTTGTGTCGCCTGAAAATGTACAAGAATGTGTGCGTTTGACAGAGGAATTCCGCTTGCTCCCAAAGAATCATAGGGCCAGA
GAAGACAAGTTAGAGGTAAAGAAGATGACGCTATATGCAGCCAGCCTAGCAGCGAGAGAACTCCAAAAATTGATATCAGATTCAAAGACCTAAGACAGTAGTTTCAAAGAAAATACATTATTTATGGTCACAAATGAGGGTGGAGAGTGCACAAGTTGGCGCTGATATTATAAAATGCTGGACAGATAGACAAAATAATA
ACTGCTAACTCTCTCTTTGTACTCCTTTATGCAAATGGCATTAGCATATAGTTGCGTAAAAGCAGAGTTATGTGCATATTACGACCTGCTGAAAGATTATGTATTTCATTTTCTTGTCAGTTCAAGGAGCAGACCAATGACAATTTTTGCAAGTATTGTTTCCACACCACACAGTATTGCCCCCCCCCCAACCCCCGCCC
TCCGACTATTTTGTAAAGAATTGCTGTTTCTTTGTCGAAGAATGTTCTTTTTCAGTCCAGCGATTGTGGACCATCTTTTTCTAACTTGAAAAGAACTAGAGGAAAGTTCCTCAGTAAATCCATCACAAGTCAGCTTGAAATCACTAATTTATTCCAGTTAAAGGACTAGATTGGTTTGTGCACCTGATAAGAATAATTTA
GACTCATTAGTCCTGAATGATAAATGACATAGAGTTCCCTGGGTAGACTTTGAATTAGTTTGGAACTTTCCAAAAGCTAAAGATAAACTTCCCAAGTCCTGAGACGATGTGTCCATTGAGAATTAAGTTTTAAATGTAGTATAGCTTGCAAGATGTTTTCAACTAATAATTTGCTTATATACACAGCAAGAACTTAATTG
GCTTGAAGTTAGCTGGTATGCCTTTTCATGCTAAGAAACATAATATGCCATTTTACTGGATGTATCATCTAGTCCCATTGACCCACTTTTGTGGTCATTTGGACATTAATAAAATTGTATTATCTTAT


>TRINITY_DN114413_c0_g2_i2 from sample A1 / Example unspliced isoform:
GCTAAAATGCCATTCCGAATTTTGGAGGTGGCCTCGTGATTTTTTAATATTAAAGTTGTAAATACTAAAAATATCATTAAATTCATTCTTTATTTTTGAGTCATTAAAAAGACATATATCTTAAGATGTTTTTGAACAATATATGATCTTCTAACTTCTTTTTAGGAATGATAACAAATTGCTTAATTCTCTTTACAAAC
TTGATGTTGAATTTTATCATTGTTTTTTCAAAGCAATTATTTTCCAAATTTGATTGTACCAAGTGAGAAAGAACATGCCTCTCCTTGGGAGTTTCTTGCAACACAGTTTATAGCTGTCCTACTAGAAAATATTTTGACATTCAACAAAAACAAGGAAGAGCATCAGTGGTCCCTGGGATAGGTGAAGAAGGTGTGACTTA
TCCTCCCACCAAAACTGGAAGTTTAAGGTCTCTTGTTTCGGGAGAGGGCATGTTGATCCTAAGAGAGTGGAAAGGACCCGTTAGTGATGTACGAAGTTTCCTTGGATTTTGCAAGTTTCTATGTGAAGTTTGTGGCTGTTTTTTTTCTCAAATAGCAACACCTTTAAGAGAGTTATTGAAAAAGACAAATAAATTTGCAT
GGACATGAAAGCACAAGATAGTTTTGACTACTGAAGAGGGAGTTGATAGAAGCTCTGGTTCTTTTTCCGTCAAAGCCCTTTCAACTTTCATGGTTGTTACTCATGCTAGTGGAACAGCAATAGGGTTAGGATTATCACAGGTTGGTATTGCTGTAGCTTACGAAAGTAGAAAGATGATTGCCATTGCTAAAACCATGTGG
CTTATGAAAGCAGAAAGATCATTGCCTTTTAAAATTATGCAACATCTGAAATAACAAAGATGTTTGCCATCGAGAAAAGATGTCTTATATTTTATAAAAGAACTCACCTTTAAGTTTTAACAGAGTTTTGAAAAAGATAAACAAATTTGCTTAGAGATAAGCATGAGATAGTTTTGACTACTGAAAGGGAGTTGAGAGAA
GCTTTGGTTCTAACCCCATCAAAGCCCTTTAAACTTTCTTGGTTCTTACTCATGCTAGTGGAGTAGCCGTAGGGTCAATATTATCTCAGGTTGTTATTGCTGTAGCTTATGAAAGTAGAAAGATGATTGCTACTGATAAAACCATGTGGCTTATGAAAATAGAAAGATGATTACCATTGATAAGTCTAAGCAGCTATGAA
ATTACAAATATGTTTGCCATTGAGGAAAGATGTCTTAATTTTACGGAAAGAGCTTTTGATAGTTTTCCATGCCTTCAAAACATGAAAGATTATCATAAGAATAATGACTCAATAATTCTTCTTTTTATTTTTCCTCTCTAAAGGTGAAAAGAGCTCTTGATAGTTTTCCATGTCTTCAAAACATGAAAGATTATCATAAG
AATAATGACTCAATAATTCTTCTTTTTATTTTCCTTTCTAAAGGAGAACTTGCTCCTTGGCAATTTAAATGAGAAATATAAACCAAACATAATATATGGTGTTGGAAAAAAATAAGGTTAAGGATGTGTCTATGCAGTATTCATGTACCTGGGAGGATCAATGTAACCTTGTATCTGTGCATTATTAACTTTGGAAACTT
AGATTTTATAAAACACATCCTTAATTTTTCTTAACCTCATCATTCTTTTGTTTTCATTCCTTGTTACATAAGGGTAGAGTTAAATTTTCATATTAAATTCACATGTATGCCCCATGCCCCTTAAGCAGGGAGAATGGGCAATGCAATACTGCCCTAGCGCCCTAACTCTGAATCTTAATCAAACTTTTATCGATTGTGGT
TAAGTTTATCTTTCCTACCGTAGAGCCATCTGTGCACACAGCTATTTACTTAAAACTTGTGTTGGTATTGCAGTCATGTATTAAAGTGGCAATGGACTTTGTGTCGCCTGAAAATGTACAAGAATGTGTGCGTTTGACAGAGGAATTCCGCTTGCTCCCAAAGAATCATAGGGCCAGAGAAGACAAGTTAGAGGTAAAGA
AGATGACGCTATATGCAGCCAGCCTAGCAGCGAGAGAACTCCAAAAATTGATATCAGATTCAAAGACCTAAGACAGTAGTTTCAAAGAAAATACATTATTTATgtaagctgaataatttattatctggatctgtggactttattatgaagatttatgttatgtcatgtgttatcagtcatctaatcaatcgctggtttca
gGGTCACAAATGAGGGTGGAGAGTGCACAAGTTGGCGCTGATATTATAAAATGCTGGACAGATAGACAAAATAATAACTGCTAACTCTCTCTTTGTACTCCTTTATGCAAATGGCATTAGCATATAGTTGCGTAAAAGCAGAGTTATGTGCATATTACGACCTGCTGAAAGATTATGTATTTCATTTTCTTGTCAGTTCA
AGGAGCAGACCAATGACAATTTTTGCAAGTATTGTTTCCACACCACACAGTATTGCCCCCCCCCCAACCCCCGCCCTCCGACTATTTTGTAAAGAATTGCTGTTTCTTTGTCGAAGAATGTTCTTTTTCAGTCCAGCGATTGTGGACCATCTTTTTCTAACTTGAAAAGAACTAGAGGAAAGTTCCTCAGTAAATCCATC
ACAAGTCAGCTTGAAATCACTAATTTATTCCAGTTAAAGGACTAGATTGGTTTGTGCACCTGATAAGAATAATTTAGACTCATTAGTCCTGAATGATAAATGACATAGAGTTCCCTGGGTAGACTTTGAATTAGTTTGGAACTTTCCAAAAGCTAAAGATAAACTTCCCAAGTCCTGAGACGATGTGTCCATTGAGAATT
AAGTTTTAAATGTAGTATAGCTTGCAAGATGTTTTCAACTAATAATTTGCTTATATACACAGCAAGAACTTAATTGGCTTGAAGTTAGCTGGTATGCCTTTTCATGCTAAGAAACATAATATGCCATTTTACTGGATGTATCATCTAGTCCCATTGACCCACTTTTGTGGTCATTTGGACATTAATAAAATTGTATTATC
TTAT