sp|Q93Z92|RING4_ARATH ----> E3 ubiquitin-protein ligase At4g11680
Intron 1 GTAAAGCTTC ... CCTTACACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 60.97 | 32.7 | 50.3 | 9 |
| A2 | 62.47 | 14.7 | 24.3 | 2 |
| A3 | 68.91 | 14 | 30.7 | 0 |
| A4 | 60.24 | 23.5 | 35.7 | 9 |
| A5 | 68.84 | 8.3 | 18.3 | 0 |
| A6 | 47.24 | 96.5 | 86.7 | 11 |
| A7 | 47.6 | 96.2 | 87 | 28 |
| A8 | 48.81 | 83 | 79 | 21 |
| A9 | 52.08 | 62.7 | 67.3 | 20 |
| A10 | 47.66 | 84.5 | 77 | 15 |
>TRINITY_DN47235_c2_g1_i1 from sample A7 / Example spliced isoformAGCTCACAATAAAAAACATCTTTCGAACAATGCGAGAAATTAACTGATACGGCAAAACATTTAACCGAGAGAAATTGCCGGAATGCCACAAATGAATCGACGCACCAATGGCCTCTGCAACGCCATTGGAGGTTTCTTGCCTGCTTTCCATGTTTTCTTTGAATTGGCGCAAGCGAAGCAGCCTTCAGTCTTACTTAGCC
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>TRINITY_DN47235_c2_g1_i4 from sample A7 / Example unspliced isoform:AGCTCACAATAAAAAACATCTTTCGAACAATGCGAGAAATTAACTGATACGGCAAAACATTTAACCGAGAGAAATTGCCGGAATGCCACAAATGAATCGACGCACCAATGGCCTCTGCAACGCCATTGGAGGTTTCTTGCCTGCTTTCCATGTTTTCTTTGAATTGGCGCAAGCGAAGCAGCCTTCAGTCTTACTTAGCC
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ACAGGTCCTGAGGTAACCCTCAAGTTCACAGGGCATTGATCTGTTACTTTTTACACAGGTGTATTTATTACATGACTTCATTAATAATTTTCAATTATTATTTTGACATTGGTTTGCACATTGGAAAATGGACACAAATAGTCAATGAATGTTTCTAAAAATATTTTTTTAGGAGATTCTTGTAGTTTGTGCTATTTCAA
CAGGTGTGTGACTCTTTTTCTAACTTATATTGATGTGGATACGGCACTTCTTAAACGTGTGATGTATTTTGAAGTGGAAACAATGTAGTTGTTGCATCAGCTACAAACTCAATGGTAGCTTTCTTAGCAGAAGACTATTTATCAAACTGCATCTTCTTTCAACACTTTCTACATCTTTTCATAAATTATTTGAATTGTCC
AGCTAGGGATCACAAATTACATGACAATATCGTCAATATGTTTCCCATATGGATCCCAATCAACTGCC