NA ----> NA
Intron 1 GTTTAGAAGA ... TATTTTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 26.44 | 225.5 | 9 | 81 |
| A2 | 27.64 | 191.5 | 8 | 73 |
| A3 | 17.73 | 199.5 | 3 | 43 |
| A4 | 20.56 | 174 | 3 | 45 |
| A5 | 15.4 | 72 | 1 | 13 |
| A6 | 18.21 | 157.5 | 14 | 35 |
| A7 | 16.92 | 216 | 14 | 44 |
| A8 | 19.27 | 109 | 7 | 26 |
| A9 | 19.16 | 262 | 17 | 62 |
| A10 | 16.73 | 214 | 29 | 43 |
>TRINITY_DN47000_c0_g2_i4 from sample A7 / Example spliced isoformAAAAAAACGAGTTTTACCAATAATCCTTGGCCGACAAGAAACATGATGATGAGAGGTTAATTATCGAAGGAGCCTCTTTTCGCTACCCAGCCCAAATTTCTTTTGTTAACTTCATGACTTTCAACCATCAGGCTGCTCGGGAAAAGGTTTTTTCTAGCAATTTCCTTCAGTTTGCTGCACTGGATTGATTGCTGTCCAAA
TTAATTACACATCACATTGCATATCTGCTGCAAAATGTCGAAGTCCCAATAATGGTGGGATGTTGACCCATCATCACAGTTTCGATCTATTGGCCTCTTGGCTTCCAGATCGACAGAGAATGAGATTTGACCTCAGATTGGTTCCGTGCAAAAACAGAATTGGTGGCCGACTGTTCGATCCCGTTCATATCTAAGGTCGG
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ACTTGCTTTACAGCCTACAAGGGGGTCTGATATTCTTCTTCAAACCCGAGAATGGTTTCCTCCTGCAAGAGCATTGGTAGCTCTCTCCGGATTTAGAACCACTCGTCTTGCCTTTGCAAGTGGAAAAAGTAATACATCTGATGATGTTGATCAAGGACTTGGCGATGATCCTTTGGCAGCTTCAAGTGGACAAGTAATAG
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ACAAGGAGGCATCCTCTGATGTCACAGCTGTCCTTGCTGAGTTGGAAGTTACGAAACTGACAACAAATGCGACAGCAGAGTCCATGTTTATTGGAGTGGAGGGGTTTGAAGGAGACTATGGAGGAATTGAGTTTGGGAATGAGGAGGCAACGCTATCTGAGGCATTTGAAGGGCTAGATGATGCCTTTGGTGGAGGTTTA
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TAAAGGGTCAGTACTTAAAAAGATTGGACTTCAGGGTATATTGTACTTGAAAACTACTTCCCCAAAAGACTCTGGTGGTAAGGATATTGAATTTTCATTTAGGCTTGATGGTACAGCTGGCATCAAGAGTGCTATCATGAAGGATGCAATTGTTAGCACCCTAGGAAAGGGTTTGTTTCATGTTCGAACTCCAGCATCAG
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TCTCCAAAGGCTACTTTGAACCGGCATAGTCAAGAATTAAGATGGCATATTCCGGAGATCCAATTACATGGTCGTCCAGGACGTTTAAGAGTTCAGATGCCAGTCAGCTCTCAGGATTCCACAGATGAGGCTTCTCACAGGAAAGAACCAAATGTAAAAGGTCGCATAGAGTTCTCTGTTCAGGGACACACACTTTCTGG
AATCTCAGTCTGTCCTGTTTCTGAAGGGAATTCTGAGTTTAATATCGGTGAAAATAGCTGCAAAACAGGTCATTATCTCTGTAAAGCATAAGAGAGTGTTGAAAAAGGGATAATGTTATTTTATTTGTAAATCATTCTGAGTTAAAGGTCGTGGGATCTTGTAGAATTAAAGTCACATGTCAATAGTCTGGGTTTGAATG
AATTTCCTGGATTTTTCTCGCATTTGTGTTTGTCAAAATATCAGGAGTTGTCAATTACATCATTCTGCATATCCTATTTGTTTGGGCACCTCGCTACTATATATTGTAAGGTTTGGTTTTCAGACCTTTTTTGTTATGTTTTGAAACCCTATATAAGTAGGACTTTACAAACTTTATACATTTTACAATGAATTTTGACT
TTAAATGTCATTATATTATGATGCATTTGTATTATTTTCA
>TRINITY_DN47000_c0_g2_i6 from sample A7 / Example unspliced isoform:GTGGGATATTGAGCTTGAGACAACTTGGTTTACTGCATGGATTTTAAATGTGGAAGACACATGTTCCATACTTCTTTGTTTGGATTATCACATTTAGTTGTTGATTTTAATTGAATGATGGATAGTAGGACAAGTCACAAGATGTAAGGTTGGATTAGCTGTTTCAGAGTTCTGCAGATCTTTGACATGATTCATATAGC
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aacatttaactcgtagttaaataggaactatagagggacatactacctatatatcagtacatctaattataagaaatggatattttattttgcagCATACATACTCAGTCTTAGATAGAACCTTTCAAGTTTGAATGAAACTGTTATTTAGGAGTCAGTTGCAATATGGCATGTTTAGCACTTGCTTTACAGCCTACAAG
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GGATAGTATACCGTTTGGTGAATAGCATTTATGTCCTTGGCATTACAAGTGCAGATCAGGATGTTAATGTAAACAATGTTTTTGAATGTACTGGAATTGTAAATCAAGCAGTAAGTGTAGTTGTAGCAGCTTGTAGAGGGGTTGATGTTACTTCTGACAAGCTTCATCGCAAGTATACAGAAATTTACATGGCTTTAGAT
ATAGTTTTGCGTGGGGTAAGCAGCACAAGGCTTGCCACTATTTTGACATCTATACATGGGGAAGGTATTGCTAAGATGGTTCTTTCTGCTATTGATGCAGAGAATCGTGCACGTGGTGCAGATAACTGGAATCAGGTAGAAGGGCAGTCCGTTGAGCATCAGGCAAATGTACAAGTTCTCTCACAGGCTTCTTTTGAGTT
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ACTATTGAGCAAGCTAAACCCAAAGGGCTTGGAGGCCTTGAAGAGCTGGAGACTGGACAGACATCATCAAAACCATCACTGCCAGGGGCAACTCCACCTGGTGTAACTCTGGCCACAGGGAAGGCTTCTGAAAACAAGGGTCCCTTATTATACATGTCTGAGGAGATCCATGCTGAGTTTAAAGGGTCAGTACTTAAAAA
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AATATCGTCTTCAACCCCGTTTTACTCCATTGCCTTTGAGGGTTCGTTTGGTCACACGTCAAAGTGGGACCTTGCTTTCAGTAATGATACAGTATGTAGCCAATCCATTTTTACCTTCACCCCTTAAAGA
Intron 2 GTAATCTGAA ... TATTTTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 20.73 | 227.7 | 38 | 81 |
| A2 | 19.29 | 195 | 20 | 73 |
| A3 | 19.33 | 198.3 | 52 | 43 |
| A4 | 19.29 | 171.7 | 37 | 45 |
| A5 | 20.18 | 69.7 | 22 | 13 |
| A6 | 15.84 | 159.7 | 25 | 35 |
| A7 | 18.97 | 215.7 | 57 | 44 |
| A8 | 15.1 | 109.7 | 13 | 26 |
| A9 | 16.81 | 265 | 45 | 62 |
| A10 | 18.28 | 212.3 | 52 | 43 |
>TRINITY_DN44273_c0_g1_i3 from sample A8 / Example spliced isoformCTGGGGTTTTCTACCTATTGTTTGGTCCTTCTGTGGTATCAGCAATAAGGGAAGGGGAAACCGTCCATATTTTTTCTGGATCTGCGTGTTTCTCTTTAGTTTTAGGTTAGTAATTCGCATTTTGGGAAACTGAGTTCATCCTTCACGGAGCTTACCTTATGTCTGCGTTTGGGCGGCCTCCATCATTGAACCAAGATCGC
GGGACATCTCTGCAGCGACCTCCATTGCTGGACGGGATTCATAGAGCTGTGATCTCGCGGGAAATCTCTGCAGCGACCTCCATTGTTGGACGGGGTTCATAGAAGCAACTTGCAGCAAGGACACAAGTTGGCTCATTCAGTCAAGTCTGAGAATGGTTCCTTTTAAAGAAATACCTAATAGATACAGCATACATACTCAG
TCTTAGATAGAACCTTTCAAGTTTGAATGAAACTGTTATTTAGGAGTCAGTTGCAATATGGCATGTTTAGCACTTGCTTTACAGCCTACAAGGGGGTCTGATATTCTTCTTCAAACCCGAGAATGGTTTCCTCCTGCAAGAGCATTGGTAGCTCTCTCCGGATTTAGAACCACTCGTCTTGCCTTTGCAAGTGGAAAAAG
TAATACATCTGATGATGTTGATCAAGGACTTGGCGATGATCCTTTGGCAGCTTCAAGTGGACAAGTAATAGTTGGAAAGGAAAGCAAATATCGGATAGTATACCGTTTGGTGAATAGCATTTATGTCCTTGGCATTACAAGTGCAGATCAGGATGTTAATGTAAACAATGTTTTTGAATGTACTGGAATTGTAAATCAAG
CAGTAAGTGTAGTTGTAGCAGCTTGTAGAGGGGTTGATGTTACTTCTGACAAGCTTCATCGCAAGTATACAGAAATTTACATGGCTTTAGATATAGTTTTGCGTGGGGTAAGCAGCACAAGGCTTGCCACTATTTTGACATCTATACATGGGGAAGGTATTGCTAAGATGGTTCTTTCTGCTATTGATGCAGAGAATCGT
GCACGTGGTGCAGATAACTGGAATCAGGTAGAAGGGCAGTCCGTTGAGCATCAGGCAAATGTACAAGTTCTCTCACAGGCTTCTTTTGAGTTGCCAGAAGAGACCTTATCTGCTGGGGATGAGGTGGCGGCAACTTTTGCTCCTGCCCAACAGAACACTGCAGCTCAGGCTTCTCAACAGCAGTCGGTGGATAAACCAGA
AAATGAAGACCCATTTGCTGTTAGTGATACTGTGAATAAGCAAGATGAACTTGCCGGTGGTTTTAAGAAGAACAAGGAGGCATCCTCTGATGTCACAGCTGTCCTTGCTGAGTTGGAAGTTACAAAACTGACAACAAATGCGACAGCAGAGTCCATGTTTATTGGAGTGGAGGGGTTTGAAGGAGACTATGGAGGAATTG
AGTTTGGGAATGAGGAGGCAACGCTATCTGAGGCATTTGAAGGGCTAGATGATGCCTTTGGTGGAGGTTTAGATGCATCTGAATTTGGAGCAACTATTGAGCAAGCTAAACCCAAAGGGCTTGGAGGCCTTGAAGAGCTGGAGACTGGACAGACATCATCAAAACCATCACTGCCAGGGGCAACTCCACCTGGTGTAACT
CTGGCCACAGGGAAGGCTTCTGAAAACAAGGGTCCCTTATTATACATGTCTGAGGAGATCCATGCTGAGTTTAAAGGGTCAGTACTTAAAAAGATTGGACTTCAGGGTATATTGTACTTGAAAACTACTTCCCCAAAAGACTCTGGTGGTAAGGATATTGAATTTTCATTTAGGCTTGATGGTACAGCTGGCATCAAGAG
TGCTATCATGAAGGATGCAATTGTTAGCACCCTAGGAAAGGGTTTGTTTCATGTTCGAACTCCAGCATCAGATAATCCTATTACAGTTTTGAAATATCGTCTTCAACCCCGTTTTACTCCATTGCCTTTGAGGGTTCGTTTGGTCACACGTCAAAGTGGGACCTTGCTTTCAGTAATGATACAGTATGTAGCCAATCCAT
TTTTACCTTCACCCCTTAAAGACATGGTTTTTATTTTGAAATTACCAGAGGATCCTACTTTATTGAAAGTCTCTCCAAAGGCTACCTTGAACCGGCATAGTCAAGAATTAAGATGGCATATTCCGGAGATCCAATTGCATGGTCGTCCAGGACGTTTAAGAGTTCAGATGCCAGTCAGCTCTCAGGATTCCACAGATGAG
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AATCATTCTGAGTTAAAGGTCGTGGGATCTTGTAGAATTAAAGTCACATGTCAATAGTCTGGGTTTGAATGAATTTCCTGGATTTTTCTCGCATTTGTGTTTGTCAAAATATCAGGAGTTGTCAATTACATCATATCCTATTTGTTTGGGCACCTCGCTACTATATATTGTAAGGTTTGGTTTTCAGACCTTTTTTGTTA
TGTTTTGAAACCCTATATAAGTAGGACTTTACAAACTTTATACATTTTACAATGAATTTTGACTTTAAATGTCATTATATTATGATGCATTTGTATTATTTTCACTGGTAATTCCTTCTCCAGATTGCCTAGTCTTTTCAATAATATCATGC
>TRINITY_DN44273_c0_g1_i10 from sample A8 / Example unspliced isoform:CGGCCGACAAGAAACATGATGATGAGAGGTTAATTATCGAAGGAGCCTCTTTTCGCTACCCAGCCCAAATTTCTTTTGTTAACTTCATGACTTTCAACCATCAGGCTGCTCGGGAAAAGGTTTTTTCTAGCAATTTCCTTCAGTTTGCTGCACTGGATTGATTGCTGTCCAAATTAATTACACATCACATTGCATATCTG
CTGCAAAATGTCGAAGTCCCAATAATGGTGGGATGTTGACCCATCATCACAGTTTCGATCTATTGGCCTCTTGGCTTCCAGATCGACAGAGAATGAGATTTGACCTCAGATTGGTTCCGTGCAAAAACAGAATTGGTGGCCGACTGTTCGATCCCGTTCATATCTAAGGTCGGGAGCAAGATTTTAAAACCGTTTCAGAC
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AGCACTTGCTTTACAGCCTACAAGGGGGTCTGATATTCTTCTTCAAACCCGAGAATGGTTTCCTCCTGCAAGAGCATTGGTAGCTCTCTCCGGATTTAGAACCACTCGTCTTGCCTTTGCAAGTGGAAAAAGTAATACATCTGATGATGTTGATCAAGGACTTGGCGATGATCCTTTGGCAGCTTCAAGTGGACAAGTAA
TAGTTGGAAAGGAAAGCAAATATCGGATAGTATACCGTTTGGTGAATAGCATTTATGTCCTTGGCATTACAAGTGCAGATCAGGATGTTAATGTAAACAATGTTTTTGAATGTACTGGAATTGTAAATCAAGCAGTAAGTGTAGTTGTAGCAGCTTGTAGAGGGGTTGATGTTACTTCTGACAAGCTTCATCGCAAGTAT
ACAGAAATTTACATGGCTTTAGATATAGTTTTGCGTGGGGTAAGCAGCACAAGGCTTGCCACTATTTTGACATCTATACATGGGGAAGGTATTGCTAAGATGGTTCTTTCTGCTATTGATGCAGAGAATCGTGCACGTGGTGCAGATAACTGGAATCAGGTAGAAGGGCAGTCCGTTGAGCATCAGGCAAATGTACAAGT
TCTCTCACAGGCTTCTTTTGAGTTGCCAGAAGAGACCTTATCTGCTGGGGATGAGGTGGCGGCAACTTTTGCTCCTGCCCAACAGGGCACTGCAGCTCAGGCTTCTCAACAGCAGTCGGTGGATAAACCAGAAAATGAAGACCCATTTGCTGTTAGTGATACTGTGAATAAGCAAGATGAACTTGCCGGTGGTTTTAAGA
AGAACAAGGAGGCATCCTCTGATGTCACAGCTGTCCTTGCTGAGTTGGAAGTTACAAAACTGACAACAAATGCGACAGCAGAGTCCATGTTTATTGGAGTGGAGGGGTTTGAAGGAGACTATGGAGGAATTGAGTTTGGGAATGAGGAGGCAACGCTATCTGAGGCATTTGAAGGGCTAGATGATGCCTTTGGTGGAGGT
TTAGATGCATCTGAATTTGGAGCAACTATTGAGCAAGCTAAACCCAAAGGGCTTGGAGGCCTTGAAGAGCTGGAGACTGGACAGACATCATCAAAACCATCACTGCCAGGGGCAACTCCACCTGGTGTAACTCTGGCCACAGGGAAGGCTTCTGAAAACAAGGGTCCCTTATTATACATGTCTGAGGAGATCCATGCTGA
GTTTAAAGGGTCAGTACTTAAAAAGATTGGACTTCAGGGTATATTGTACTTGAAAACTACTTCCCCAAAAGACTCTGGTGGTAAGGATATTGAATTTTCATTTAGGCTTGATGGTACAGCTGGCATCAAGAGTGCTATCATGAAGGATGCAATTGTTAGCACCCTAGGAAAGGGTTTGTTTCATGTTCGAACTCCAGCAT
CAGATAATCCTATTACAGTTTTGAAATATCGTCTTCAACCCCGTTTTACTCCATTGCCTTTGAGGGTTCGTTTGGTCACACGTCAAAGTGGGACCTTGCTTTCAGTAATGATACAGTATGTAGCCAATCCATTTTTACCTTCACCCCTTAAAGACATGGTTTTTATTTTGAAATTACCAGAGGATCCTACTTTATTGAAA
GTCTCTCCAAAGGCTACCTTGAACCGGCATAGTCAAGAATTAAGATGGCATATTCCGGAGATCCAATTGCATGGTCGTCCAGGACGTTTAAGAGTTCAGATGCCAGTCAGCTCTCAGGATTCCACAGATGAGGCTTCTCACAGGAAAAAACCAAATGTAAAAGGTCGCATAGAGTTCTCTGTTCAGGGACACACACTTTC
TGGAATCTCAGTCTGTCCTGTTTCTGAAGGGAATTCTGAGTTTAATGTGGGTGAAAATAGCTGCAAAACAGGTCATTATCTCTGTAAAGCATAAGAGAGTGTTGAAAAAGGGATAATGTTATTTTATTTGTAAATCATTCTGAGTTAAAGGTCGTGGGATCTTGTAGAATTAAAGTCACATGTCAATAGTCTGGGTTTGA
ATGAATTTCCTGGATTTTTCTCGCATTTGTGTTTGTCAAAATATCAGGAGTTGTCAATTACATCATATCCTATTTGTTTGGGCACCTCGCTACTATATATTGTAAGGTTTGGTTTTCAGACCTTTTTTGTTATGTTTTGAAACCCTATATAAGTAGGACTTTACAAACTTTATACATTTTACAATGAATTTTGACTTTAA
ATGTCATTATATTATGATGCATTTGTATTATTTTCACTGGTAATTCCTTCTCCAGATTGCCTAGTCTTTTCAATAATATCATGC