sp|Q9SK02|RA51B_ARATH ----> DNA repair protein RAD51 homolog 2

Intron 1 GTAATTGAAG ... CATGGTACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	46.67	4	3	4
A2	55	9	8	14
A3	42.11	11	3	13
A4	80.65	3	12	13
A5	-1	0	0	0
A6	52.17	44	35	61
A7	48.52	61	34	81
A8	51.46	58	46	77
A9	50	49	32	66
A10	48.57	36	21	47

>TRINITY_DN42597_c0_g1_i2 from sample A7 / Example spliced isoform

TATATTTACTCAACAACTTATATAACAAACGTCGAATTGTCTTCTCAGGAGAAACTCCTTGCTTCAAAGAAATGGCAGGGAAGCTTATTAGCACAATGGGCCTGGACCAACACATCTCTCACATCTTTTCAGCTCGCAATATCTTAACTGCCAAGGATGCCCTGTGTAGAACAGAGTTGGAACTAATGGAGCTATTAGAT
GTGTCACTAGATGCAGTATCTGCAGCTGTAGCGCACATTAGTGAACATGCATCTCCACCTTGCCACACGGCATTTTCACTCATGAGGGAGCGAATTGTTAATGAACAATTACATGGTCATTTTCGAACACGTTTAATTGGTCTAGACGAGGCTTTATGTGGCGGCATCCCTTTTGGTGCAGTGACAGAGGTTGTTGGTCC
AGCAGGAATTGGGAAAACACAATTATGCCTCATGCTTTCAGTATTAGCAGCAATGCCAGAGAGTTATGGGGGTCTTGATGGAAATGTTGTCTATATTGACACAGAACACAAATTTAACTCAGGAAGGATGATTGAAATTGCAAAGTCCAGCTTTCCAGAGATCTTTTGCAAAGAAGGAATGGTGCAGGAACTTGCTGCTC
GAGTGTTGGTCTTGCAGATGACATCATTAACTGAGCTGACAGAAAGCTTGCAGCAAATGGAAGCATTGATTTCCCAACATCGTGTAAAACTGCTGATTATTGATAGCATGGCTGCGCTTGTGTCAAGTGAACAGGGACAGGATCAGACAACTCTTAGACATGATACGATAGGCCGCCAAGCATCGTTTTTAAAATCTATG
GCAGAATTTTCAAGGATACCTGTTGTGGTGACTAATCAAGTAAGACTGCAAAGCATGCAAGATGACAAGCGGCTAATTTACCCATTTGAAGCAGGGAAGAAGAGTGATCTGACTACAAAAGCTGAAAATTTTGAGCAACACCTGACGGCAGCTTTAGGAACAAGTTGGGCTCATGCTGTTAACATCCGCCTGATTCTTGA
ATCTTATGCAGGTCAGAGGTATATGAAGATTGCTAAATCCCCAATGTCTCCCACTTTAGCATTTCCATTTGTTATCACTACCTCTGGTGTTGCATTACAAGGCACTGAGGCTATGAGGATATTTTCACAAAGGAAGCATGATGATGGATATAGAGCCTTCATAACTTGAGTCAAGACTCAATATCACATGATCCCTTCAA
GAAAAAATTATGAAGAGGAATCCAGACAGATGCATATGTTCCTTGAGCACTGAACAGAATCGAGGAACGCCATTAAGTGTTCATTAGTTCTTTGGTGCAATTTAAGTACTGGAAAATGTCCTATCAAAAGTCTGGTCTTAATACTGAAACCAGCCATTGAGAACTTCTCTTTCCCCGGTTTTAGAAATGTAGGCAAACAG
TCTGAGTTATTTGGTGACACAAAAATAGTTGATTTTCTAGGACAACCCTTGTCAGTTGCTTCAGATTTTACAAGCCTCTTTCTGAATAAATTTCATCTGACAAATTGGTAGAGTTTTGAACAAAAGTAAGTTTTACTTGTATCCTTTAAATGATTACATTTTTACATTCTAATCCACAGCCTCCTTTGCATTGTGATTGT
TCATGGGCACTGTGCTGGGTAGACCTGCCTCTCGAAATAAACACTCTCAGAGGACACACACATATACACATGAGAGCAGTGTTATACTTATTGGCGATATATTGCCAGTGAGTTGATATATTGCGAGTTAAACCCCATGCCGATATTATTGCCACAATTTATTGCAATAATTTCATCTTTAGAAATTATCGCAATAAATT
CAAATTATCACGATTTTCAGTGAATATCACAAGTTAATGGAATTTATTGCTCTGTCCA

>TRINITY_DN42597_c0_g1_i4 from sample A7 / Example unspliced isoform:

TATATTTACTCAACAACTTATATAACAAACGTCGAATTGTCTTCTCAGGAGAAACTCCTTGCTTCAAAGAAATGGCAGGGAAGCTTATTAGCACAATGGGCCTGGACCAACACATCTCTCACATCTTTTCAGCTCGCAATATCTTAACTGCCAAGTTATGCCTCATGCTTTCAGTATTAGCAGCAATGCCAGAGAGTTAT
GGGGGTCTTGATGGAAATGTTGTCTATATTGACACAGAACACAAATTTAACTCAGGAAGGATGATTGAAATTGCAAAGTCCAGCTTTCCAGAGATCTTTTGCAAAGAAGGAATGGTGCAGGAACTTGCTGCTCGAGTGTTGGTCTTGCAGATGACATCATTAACTGAGCTGACAGAAAGCTTGCAGCAAATGGAAGCATT
GATTTCCCAACATCGTGTAAAACTGCTGATTATTGATAGCATGGCTGCGCTTGTGTCAAGTGAACAGGGACAGGATCAGACAACTCTTAGACATGATACGATAGGCCGCCAAGCATCGTTTTTAAAATCTATGGCAGAATTTTCAAGGATACCTGTTGTGGTGACTAATCAAGTAAGACTGCAAAGCATGCAAGATGACA
AGCGGCTAATTTACCCATTTGAAGCAGGGAAGAAGAGTGATCTGACTACAAAAGCTGAAAATTTTGAGCAACACCTGACGGCAGCTTTAGGAACAAGTTGGGCTCATGCTGTTAACATCCGCCTGATTCTTGAATCTTATGCAGGTCAGAGGTATATGAAGATTGCTAAATCCCCAATGTCTCCCACTTTAGCATTTCCA
TTTGTTATCACTACCTCTGGTGTTGCATTACAAGGCACTGAGgtaattgaagtaaccggccgggatataaacagtattcatggtacagGCTATGAGGATATTTTCACAAAGGAAGCATGATGATGGATATAGAGCCTTCATAACTTGAGTCAAGACTCAATATCACATGATCCCTTCAAGAAAAAATTATGAAGAGGAAT
CCAGACAGATGCATATGTTCCTTGAGCACTGAACAGAATCGAGGAACGCCATTAAGTGTTCATTAGTTCTTTGGTGCAATTTAAGTACTGGAAAATGTCCTATCAAAAGTCTGGTCTTAATACTGAAACCAGCCATTGAGAACTTCTCTTTCCCCGGTTTTAGAAATGTAGGCAAACTCTGTGAAGACAGTCTGAGTTAT
TTGGTGACACAAAAATAGTTGATTTTCTAGGACAACCCTTGTCAGTTGCTTCAGATTTTACAAGCCTCTTTCTGAATAAATTTCATCTGACAAATTGGTAGAGTTTTGAACAAAAGTAAGTTTTACTTGTATCCTTTAAATGATTACATTTTTACATTCTAATCCACAGCCTCCTTTGCATTGTGATTGTTCATGGGCAC
TGTGCTGGGTAGACCTGCCTCTCGAAATAAACACTCTCAGAGGACACACACATATACACATGAGAGCAGTGTTATACTTATTGGCGATATATTGCCAGTGAGTTGATATATTGCGAGTTAAACCCCATGCCGATATTATTGCCACAATTTATTGCAATAATTTCATCTTTAGAAATTATCGCAATAAATTCAAATTATCA
CGATTTTCAGTGAATATCACAAGTTAATGGAATTTATTGCTCTGTCCA