NA ----> NA
Intron 1 GTAGGTTCAC ... TTCTGTATAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 68.42 | 6 | 0 | 13 |
| A2 | 44.44 | 5 | 1 | 4 |
| A3 | 57.58 | 14 | 2 | 19 |
| A4 | 50 | 2 | 0 | 2 |
| A5 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A6 | 55.56 | 8 | 0 | 10 |
| A7 | 44 | 14 | 9 | 11 |
| A8 | 44.44 | 10 | 9 | 8 |
| A9 | 59.09 | 9 | 1 | 13 |
| A10 | 57.69 | 11 | 3 | 15 |
>TRINITY_DN36468_c0_g1_i4 from sample A8 / Example spliced isoformATTGAGTTCCACCCCTCCAAAGCCACCTAGTCTATATATATACGGAGGGTTAACTTCTCGCGAGTCAATATCGAACTCTTTGAATTCCCTTCCCTTCTCTCTGCCCCACCCAATTGAATTCAAAAACACAACTTGCAGAGGGGAGGAAGAGTGGGGAGGAGCATACGAATATTATTCCAATAACACCCAAATGAAGATGG
GAGTAGAAGGGGGAGCAGACATAAATGGTGAACTGTCCAGCGAGCTCAGCAACCATTGCAATGCACAAATCTACTCCATGATTGGACCTTCCACTTCCCAAGTCTCTGTGCTTTCCTTCCAGCTGGAATTAGCCCACCGATCCATTAGAAAGTTGGGCGAACAGGTTTCCAATTTGCAGCATCAACTAAGCGAGAAAGAT
TATCAGCTCAAGGTCACCACCGAGAGGCACGCCAAAGCCAGGGACGAGGCCACACAGAATGCACTTGCATTGAAGAAACATATAGCAATATGTGAAGAGTTAAGGAATGAATGCGAGCAATTTCGGCGTGATAGAGATTCATTTGAAGAGCAAATAGTAGAGGCTCATGAGCAAAGGGAATTGGCAGAGAAGCGAGCCGC
TGAAGCAGAAATGCATGAAAAACTAGCACAGCGTCGCTTAGAAAAAGCCTTGCATGTTTCTTCAATGACCAATCTTGAGAGAAAACGGAATGGTTATTTGGAAGAAATGCTTCCAAACTGTATTAGTAATGAACGTGCAGTTGCTTTGCGTAATAAACCACAGACACAGAGGGTTATGAGAAAAAAAATTGCTGCTCCTT
TAGCTCCTGTGGCCTCAAGTGGTTTGATTCATGGACATCAAGAGGATGAGCGTTTGGGACAGCCAACTCCCAAAAAGAAAGTCAAGTCTGAAGGGCCTAATTCATGCAATGAGTCACCTATTGACCGCAGAAAGCTGTTCTCCTGCCATAATGATAGCAGTTTTCATGCAGGCCAAGTTCTTGCCACTGCTGGAAAATTT
GAGGTCCGAGAAAATGATTATTTCCTGTTAACAATCTGCAACTGATACAGATCCGATAAAATGGTTGTTTCCTGTCAATAATCTGCAACTGATACAGTTCCACGAAATTGGTTATTTCCTTTCAGCAATCGAGCTGCTTAAAGCATTCAAAATTTGTTAGTGAAAGAGGGGAAAACGAGACATAGCAAGTCATAATTTGC
AGCTCCTGAGAGCTTATAGACAAACCCTAATCAACTCGCTCGGGTGTTTGACTTCTAAGTTGACTTTATTGTAAGGTGTCCTTTGAAGGACATTATTGTAAGGTGGGTTTTTTAAGAAGGTGTTGGTGGTGTTGAAAGACATGGCGTTGAACATCAATTTCATTTTCTTCTCTACAGTCTCTGTCCTACAGCTAATGGAT
CTACCTGTGTGGTCCTTATGGCCTCACTCCTTATTTCCTACTGTTTGAAAACTATTGTTGCAAGATGACTATATAATGGATATGCATCTTTCCAGCATGTCTATATGTTGAAGTGTGCTGGTATGATGGCATCCTAATTATCTTGCAATGGCAGAGACAGTTGTTTGAAGCCTCAGTTAGTGTCCCCATACAGTCCTTAA
TTGATCATTCTTTCAGCACTGTGCTTTCTTTTTTCTTTTTTGTTTCATTCTATTTTTCATTTTTCTCTTACCTTTTATGATTTTTCTTATTTTAGTTCATTTGGATATGCACAAAGGCTTGTAGAGTTTCACTTGTCTGAAAATGATCTATCTGCCATGTTTTTACTTTCTTAATGTAATTCCAATGGTCCTGTCTCTGT
ATTTATCTTGCGGATAGTGTATTAATTGCTATGATGGTGACCTCGACACTCTAAATATTTTGTATAGTCTACAAATGGTTCTTTACTGAAGTCTGAAGATAAGTTGTTACTTCAACTGGTATAGTCTGAAGATAAGTTTTTAATTCTATTATTAGTTTGAAGATAAAATTTTA
>TRINITY_DN36468_c0_g1_i2 from sample A8 / Example unspliced isoform:CGGTGCCCTTACCTTCCAAATCTTTGTCCACCACCACCTGACCTCCCTCACTGCAGTAGTCATTGTAACTTCATAACACAGTTTAGCTGTATAACAACCATCAGTCTTATTCCTGATCCAAATGATCTCATCCTGCTCAGCTTTCAACTTGATGTGTCCATTGCTTAATAAGTAAATTCTATTCAGTATTTTGTCTAAGT
ATCAATTAAAACATCATCTAAACCAACTTGTATATTGCTAAATTATTACTGATGACTTGTTAAGACCAAAATCAATTCATATTTCTTAGATTGGGAAGACCAAAATCAATTCATATTTCTTATCTATCTATTTATCTATCTATCTATATATAATATGCAGAATAATGGAATGCCCCTTGCCAATGTTGATTTAGTCACAC
AGAAACCCTTGCTCTATCAATTTTGGCGTTGCATTAAACAAATGGCATGCAATGTTTTTCAATAGATATACCATATGTGTATGGGGATGCATGCATGTATCTCATGAGTTTTTATGGCCTTGGGAAAAGCCCCCTAAACTGAGTATGCTCTGCAACTGATACAGGTCCGAGAAAATGATTATTTCCTGTTAACAATCTGC
AACTGATACAGATCCGATAAAATGGTTGTTTCCTGTCAATAATCTGCAACTGATACAGTTCCACGAAATTGGTTATTTCCTTTCAGCAATCGAGCTGCTTAAAGCATTCAAAATTTGTTAgtaggttcacagatcaaaactttttggtttagttagctgtttccactttcaaggcttttgagcattcaaggtagccagct
tctttgggtcatgggaaaaaattgacaaatgatgttggatttgtaatctcatctaaatgaactggggtgtatttgtgattctgtatagGTGAAAGAGGGGAAAACGAGACATAGCAAGTCATAATTTGCAGCTCCTGAGAGCTTATAGACAAACCCTAATCAACTCGCTCGGGTGTTTGACTTCTAAGTTGACTTTATTG
TAAGGTGTCCTTTGAAGGACATTATTGTAAGGTGGGTTTTTTAAGAAGGTGTTGGTGGTGTTGAAAGACATGGCGTTGAACATCAATTTCATTTTCTTCTCTACAGTCTCTGTCCTACAGCTAATGGATCTACCTGTGTGGTCCTTATGGCCTCACTCCTTATTTCCTACTGTTTGAAAACTATTGTTGCAAGATGACTA
TATAATGGATATGCATCTTTCCAGCATGTCTATATGTTGAAGTGTGCTGGTATGATGGCATCCTAATTATCTTGCAATGGCAGAGACAGTTGTTTGAAGCCTCAGTTAGTGTCCCCATACAGTCCTTAATTGATCATTCTTTCAGCACTGTGCTTTCTTTTTTCTTTTTTGTTTCATTCTATTTTTCATTTTTCTCTTAC
CTTTTATGATTTTTCTTATTTTAGTTCATTTGGATATGCACAAAGGCTTGTAGAGTTTCACTTGTCTGAAAATGATCTATCTGCCATGTTTTTACTTTCTTAATGTAATTCCAATGGTCCTGTCTCTGTATTTATCTTGCGGATAGTGTATTAATTGCTATGATGGTGACCTCGACACTCTAAATATTTTGTATAGTCTA
CAAATGGTTCTTTACTGAAGTCTGAAGATAAGTTGTTACTTCAACTGGTATAGTCTGAAGATAAGTTTTTAATTCTATTATTAGTTTGAAGATAAAATTTTA
Intron 2 GTACATTATT ... GATATGACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 22.27 | 185 | 53 | 24.5 |
| A2 | 24.35 | 205 | 66 | 28 |
| A3 | 18.85 | 198 | 46 | 21.5 |
| A4 | 18.62 | 153 | 35 | 21 |
| A5 | 24.04 | 79 | 25 | 8.5 |
| A6 | 16.93 | 417 | 85 | 46 |
| A7 | 18.24 | 986 | 220 | 108 |
| A8 | 19.14 | 1031 | 244 | 93 |
| A9 | 20.12 | 965 | 243 | 89 |
| A10 | 18.5 | 793 | 180 | 80 |
>TRINITY_DN36468_c0_g1_i1 from sample A8 / Example spliced isoformATTGAGTTCCACCCCTCCAAAGCCACCTAGTCTATATATATACGGAGGGTTAACTTCTCGCGAGTCAATATCGAACTCTTTGAATTCCCTTCCCTTCTCTCTGCCCCACCCAATTGAATTCAAAAACACAACTTGCAGAGGGGAGGAAGAGTGGGGAGGAGCATACGAATATTATTCCAATAACACCCAAATGAAGATGG
GAGTAGAAGGGGGAGCAGACATAAATGGTGAACTGTCCAGCGAGCTCAGCAACCATTGCAATGCACAAATCTACTCCATGATTGGACCTTCCACTTCCCAAGTCTCTGTGCTTTCCTTCCAGCTGGAATTAGCCCACCGATCCATTAGAAAGTTGGGCGAACAGGTTTCCAATTTGCAGCATCAACTAAGCGAGAAAGAT
TATCAGCTCAAGGTCACCACCGAGAGGCACGCCAAAGCCAGGGACGAGGCCACACAGAATGCACTTGCATTGAAGAAACATATAGCAATATGTGAAGAGTTAAGGAATGAATGCGAGCAATTTCGGCGTGATAGAGATTCATTTGAAGAGCAAATAGTAGAGGCTCATGAGCAAAGGGAATTGGCAGAGAAGCGAGCCGC
TGAAGCAGAAATGCATGAAAAACTAGCACAGCGTCGCTTAGAAAAAGCCTTGCATGTTTCTTCAATGACCAATCTTGAGAGAAAACGGAATGGTTATTTGGAAGAAATGCTTCCAAACTGTATTAGTAATGAACGTGCAGTTGCTTTGCGTAATAAACCACAGACACAGAGGGTTATGAGAAAAAAAATTGCTGCTCCTT
TAGCTCCTGTGGCCTCAAGTGGTTTGATTCATGGACATCAAGAGGATGAGCGTTTGGGACAGCCAACTCCCAAAAAGAAAGTCAAGTCTGAAGGGCCTAATTCATGCAATGAGTCACCTATTGACCGCAGAAAGCTGTTCTCCTGCCATAATGATAGCAGTTTTCATGCAGGCCAAGTTCTTGCCACTGCTGGAAAATTT
GAGATTGAGGAAAAGCCCCCTGCGAACGATTTAAGTAGCATGCAAGAAAAATTGGGATCCTCTGTCAGTGAAATCCAGAACTAGACCATCTGAAGCACAGTTTTATTGTTTTGTTCCACTTTTATAATTATCACAGCTCTTTTCTTGAGCGGGTTTCTTCATTGAATGTTTTACCTGTAAGGAGGTCGAGCAGCTGAAGA
TGGTACCGAAGGTTTGCCAACAATACCTTATTAAAGCTGAGGTAGAGGTAACCTTGTCTGAAAGAAGTTGACATCAGAAAGTGTCTTTTAGATGATAGGTTTGGCTTCATTTTGTCCCTTTGCTCTTTAGAGTGATGCAGCTTTTCATGTGAAGACAGTGCTGGTCATATGCTACCTTGCCTGATTATTTGACAGGATGC
CATTTCATATCAAAAAAGTAATCAGTTTAGGTGATTGATTGAGGACTTTTTTTATCTCCTCACGTGACTCTATGGAATCTGTAGGCATTCCAGAAACATGTACCTAAGTTTTTGGGAGAATCGTCAATGTGGCAATTGGGAAATGTAAATTGAACAGGGCTTCATTGATTAGTCCTTGCTAAGCTTATATCAAATTATAG
ATAAACTCATTTTTAAATTAAATGATTAAATTACGGAAGTTGTGATATGTTTTAGCCATTGGTTTGTGTTTTTTCTTGGTGTGTTTTTTAATACCTACTCAGGTTCTGAATAGCAATGTACAGTACATGGGAAAATTGTTGTAGTATTGAATTTGTTCTTATGGACATTCACTATTAATACCAAGTATTATGGTGTTATG
ATTGATAAAAA
>TRINITY_DN36468_c0_g1_i3 from sample A8 / Example unspliced isoform:ATTGAGTTCCACCCCTCCAAAGCCACCTAGTCTATATATATACGGAGGGTTAACTTCTCGCGAGTCAATATCGAACTCTTTGAATTCCCTTCCCTTCTCTCTGCCCCACCCAATTGAATTCAAAAACACAACTTGCAGAGGGGAGGAAGAGTGGGGAGGAGCATACGAATATTATTCCAATAACACCCAAATGAAGATGG
GAGTAGAAGGGGGAGCAGACATAAATGGTGAACTGTCCAGCGAGCTCAGCAACCATTGCAATGCACAAATCTACTCCATGATTGGACCTTCCACTTCCCAAGTCTCTGTGCTTTCCTTCCAGCTGGAATTAGCCCACCGATCCATTAGAAAGTTGGGCGAACAGGTTTCCAATTTGCAGCATCAACTAAGCGAGAAAGAT
TATCAGCTCAAGGTCACCACCGAGAGGCACGCCAAAGCCAGGGACGAGGCCACACAGAATGCACTTGCATTGAAGAAACATATAGCAATATGTGAAGAGTTAAGGAATGAATGCGAGCAATTTCGGCGTGATAGAGATTCATTTGAAGAGCAAATAGTAGAGGCTCATGAGCAAAGGGAATTGGCAGAGAAGCGAGCCGC
TGAAGCAGAAATGCATGAAAAACTAGCACAGCGTCGCTTAGAAAAAGCCTTGCATGTTTCTTCAATGACCAATCTTGAGAGAAAACGGAATGGTTATTTGGAAGAAATGCTTCCAAACTGTATTAGTAATGAACGTGCAGTTGCTTTGCGTAATAAACCACAGACACAGAGGGTTATGAGAAAAAAAATTGCTGCTCCTT
TAGCTCCTGTGGCCTCAAGTGGTTTGATTCATGGACATCAAGAGGATGAGCGTTTGGGACAGCCAACTCCCAAAAAGAAAGTCAAGTCTGAAGGGCCTAATTCATGCAATGAGTCACCTATTGACCGCAGAAAGCTGTTCTCCTGCCATAATGATAGCAGTTTTCATGCAGGCCAAGTTCTTGCCACTGCTGGAAAATTT
GAGgtacattattgattttccaaactctgcttgcacttgttttatctagaatgcgctgcaaaatttctactttacttttgctattgtttgtgtcatctctttcaagtatcttatctggaatgatatgacagATTGAGGAAAAGCCCCCTGCGAACGATTTAAGTAGCATGCAAGAAAAATTGGGATCCTCTGTCAGTGAA
ATCCAGAACTAGACCATCTGAAGCACAGTTTTATTGTTTTGTTCCACTTTTATAATTATCACAGCTCTTTTCTTGAGCGGGTTTCTTCATTGAATGTTTTACCTGTAAGGAGGTCGAGCAGCTGAAGATGGTACCGAAGGTTTGCCAACAATACCTTATTAAAGCTGAGGTAGAGGTAACCTTGTCTGAAAGAAGTTGAC
ATCAGAAAGTGTCTTTTAGATGATAGGTTTGGCTTCATTTTGTCCCTTTGCTCTTTAGAGTGATGCAGCTTTTCATGTGAAGACAGTGCTGGTCATATGCTACCTTGCCTGATTATTTGACAGGATGCCATTTCATATCAAAAAAGTAATCAGTTTAGGTGATTGATTGAGGACTTTTTTTATCTCCTCACGTGACTCTA
TGGAATCTGTAGGCATTCCAGAAACATGTACCTAAGTTTTTGGGAGAATCGTCAATGTGGCAATTGGGAAATGTAAATTGAACAGGGCTTCATTGATTAGTCCTTGCTAAGCTTATATCAAATTATAGATAAACTCATTTTTAAATTAAATGATTAAATTACGGAAGTTGTGATATGTTTTAGCCATTGGTTTGTGTTTT
TTCTTGGTGTGTTTTTTAATACCTACTCAGGTTCTGAATAGCAATGTACAGTACATGGGAAAATTGTTGTAGTATTGAATTTGTTCTTATGGACATTCACTATTAATACCAAGTATTATGGTGTTATGATTGATAAAAA