NA ----> NA
Intron 1 GTAATGCATT ... AATGCTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 66.67 | 6 | 12 | 8 |
| A2 | 66.67 | 1 | 2 | 0 |
| A3 | 43.75 | 9 | 7 | 3.5 |
| A4 | 87.5 | 0.5 | 3 | 0 |
| A5 | 83.33 | 1 | 5 | 2 |
| A6 | 56.67 | 19.5 | 25.5 | 3 |
| A7 | 40.74 | 16 | 11 | 11 |
| A8 | 60 | 6 | 9 | 5 |
| A9 | 58.14 | 18 | 25 | 2 |
| A10 | 55.26 | 17 | 21 | 1 |
>TRINITY_DN41609_c0_g1_i3 from sample A7 / Example spliced isoformGAGGAAATGCCGCCGTTTGGTCCATTGGTTGGGGAACTAAATTGCTTGCCGCTGTTTATAGTGTAAGAACTAACAATTTTTTTTTTCTTTTTTAATGGAGTTACTGATCCAGCTAAGGCATAGTATAAAAGTTCTTAAAGCTTGACGGTGGCAGCATCCAGATTAAACATCTGGCAAACGTACCAATGCACTTGCGCTTC
AAAGTTCTAGCGATTTCTTTTCGTCTGGTGATTATTCGAGGTCTTAGATCTGTTTAGAGTTTATGTATCTCCGAGAGGGTTTGATGTTAGGGTTTGAACTTCAATGCTCGGCTGAGCACTGTACATTTTTGCAGGGGTGCAAGGGTTTAACAGTATTGAGATTGCTTGGTAACATTTCAAATGGTGAATAAGTTTAATTT
ACTTTTAAATTGAAGCCATGGCTGAAAGCAGATCTCCCTCATGTGAAGAGGACTTTAGATGAAGCAACCTCCTGCATATTTACGGCCATTCCTCGAGCAGGGCCTAGGTTCACCCACTATACATACTTTTTATTTACTCTGAAACTGCTAATGCCGACAGCGTTAAGTCGGTCGATTTTTATAATTAAAACTGCAGTTGA
GAGTTAGTACAAGTAAAAGTCATACTCGAAACAGGCATAGTTTATCACATACTGCCTGTGAAGGGGCTAATCCCAAATGCTTGTTCATTTGTGTGTATTGTATTTTTTTTAAAGGAACAAGTCAATACGGCCAGTTGGGTCCTCAACTTACAGTCAATATATAAATCGTAGAGAGTGTTTTCATAATTTATTTGGTCGGG
CAGAGGTAAAATTGCGGTTACCATCACATGTGAACCAATTTCTGACAATGTACTATATATACGTTTAAAAACAGTTAGGGTATTGTCCTTAAAGTTTGATTCAATAAATAATTTATCATTGTC
>TRINITY_DN41609_c0_g1_i4 from sample A7 / Example unspliced isoform:GAGGAAATGCCGCCGTTTGGTCCATTGGTTGGGGAACTAAATTGCTTGCCGCTGTTTATAGTGTAAGAACTAACAATTTTTTTTTTCTTTTTTAATGGAGTTACTGATCCAGCTAAGGCATAGTATAAAAGTTCTTAAAGCTTGACGGTGGCAGCATCCAGATTAAACATCTGGCAAACGTACCAATGCACTTGCGCTTC
AAAGTTCTAGCGATTTCTTTTCGTCTGGTGATTATTCGAGGTCTTAGATCTGTTTAGAGTTTATGTATCTCCGAGAGGGTTTGATGTTAGGGTTTGAACTTCAATGCTCGGCTGAGCACTGTACATTTTTGCAGGGGTGCAAGGGTTTAACAGTATTGAGATTGCTTGGTAACATTTCAAATGGTGAATAAGTTTAATTT
ACTTTTAAATTGAAGCCATGGCTGAAAGCAGATCTCCCTCATGTGAAGAGGACTTTAGATGAAGCAACCTCCTGCATATTTACGGCCATTCCTCGgtaatgcattacacctccattattttcagttattttataaagtgtatcttctgttaatgaatttgctttccagattgagtacaatttttgacctgggagtctatt
tgcttaatttttttttattaacctggctcataatgctgcagAGCAGGGCCTAGGTTCACCCACTATACATACTTTTTATTTACTCTGAAACTGCTAATGCCGACAGCGTTAAGTCGGTCGATTTTTATAATTAAAACTGCAGTTGAGAGTTAGTACAAGTAAAAGTCATACTCGAAACAGGCATAGTTTATCACATACTG
CCTGTGAAGGGGCTAATCCCAAATGCTTGTTCATTTGTGTGTATTGTATTTTTTTTAAAGGAACAAGTCAATACGGCCAGTTGGGTCCTCAACTTACAGTCAATATATAAATCGTAGAGAGTGTTTTCATAATTTATTTGGTCGGGCAGAGGTAAAATTGCGGTTACCATCACATGTGAACCAATTTCTGACAATGTACT
ATATATACGTTTAAAAACAGTTAGGGTATTGTCCTTAAAGTTTGATTCAATAAATAATTTATCATTGTC