sp|Q8H0T9|KTN84_ARATH ----> Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1 homolog KTN80.4
Intron 1 GTTGATTTTA ... CTTATTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 20.75 | 63 | 19 | 14 |
| A2 | 17.28 | 67 | 13 | 15 |
| A3 | 14.59 | 79 | 9 | 18 |
| A4 | 19.13 | 74 | 22 | 13 |
| A5 | 6.25 | 30 | 2 | 2 |
| A6 | 15.34 | 218 | 27 | 52 |
| A7 | 16.37 | 258 | 39 | 62 |
| A8 | 12.11 | 156 | 16 | 27 |
| A9 | 16.56 | 257 | 36 | 66 |
| A10 | 14.4 | 214 | 35 | 37 |
>TRINITY_DN48625_c0_g3_i3 from sample A7 / Example spliced isoformCCCTTTCTCCACCCCACAACATAACCACTTTGTATAGCTTTTAAATAGCCGAACAGGTCCTTTCAGGAAAGGAAATCAACAGGACGCATATGTTATTAAATTCGTGGAAATCCGTCCGAAGTCCGAAGGCTTCTGTTCTCTTTAACGGCCGCAGGCGTTTACTTATTTTCCCAACCCCGCAGCTGATGAGCTAGCGACTG
AACATCATCGACACTCAAATTCTCTGAGCAACCGAGGCTTTGCTCGTGGAAGTTTGAGTTGCTTGGAGTAGATGGCACAATTTCAATGGGAGTATGAAAATATGGTAGAAGAGGCTGACATGAGTGACTCTGAAGATGGGCATGGGTTGAGAGGCGATGCTATTGAGACTGACTCAGATGATGATATTGATTTCAAGTAT
TTAGATACTACAGCCATGCAAGCTCGACATGGAAAAGACATTCAGGGAATTCCTTGGGAAAGGTTACATTTCACAAGAGAAACATATCGTCAGACACGATTAAAGCAGTATAAGAATTATAAAAGCCTAAACATGCCACATGATGCGCTGGATAAGGAGTGCAAGCCTGTTCGGAAGGATGGGAATTTTTTTGATTTTCA
CTACAACACAAGATCAGTGAGATCTACATTTGTCCATTTTCAGCTGAGGAATCTGGTTTGGGCCACTTCCAAGCATGATGTATACTTGATAAGTAATTACACTGTTATGCATCGGTGTTCATTGAGCCGGAGAAGCACAGAAGTTCTCAATGTTGCTGAACGATTGACTGCAGCTCCCGAGGTACAGAAAAATCCCTGGG
CTGTGCAGCAAGGTCTCGGCCGGATACAGATTAGTACAATGTGTGTTGAGGGAAATCTTCTGGTTGCTGGTGGATTTCAGGGAGAACTGATTGCCAAGAATTTGGATCGCTCTGGAGTTTTATACTGTGCAAAGATCAGTCATGATGAGAATGCTATCACTAATGCCATTGAGATCTATGAGAGTGCAAGTGGTGCGAAA
CAATTGATGACCTCAAATAATGACTCGGTTGTACGCATTTTTGATGCCGAGTCCTTCTATATCCTCCGGAGTAATACTTTTCCATGGCCTGTAAATCATACTTCTATTAGCCCAGATAAAACACTCGTGGTAGTGGTTGGAGATCATGCTGATGGACTGCTTGTGGATCAACAGACAGGGAAGGTTGTTGATAGTCTAAG
AGGGCATCTGGACTACTCATTTGCATCTGCATGGCATCCGGATGGTAGATATTTTGCTACGGGAAATCAGGATACCAGCTGTAGAATCTGGGACATTAGAAACCTAAGCTCATCTGTAGCTGTCTTGAAAGGATACATTGGTGCAGTGCGGTCACTGAGGTTCTCATCAGATGGCTGTTTTCTAGCAATGGCTGAGCCAG
CAGATTTTGTACATGTCTTCGATGCTAAGCGCAATTATGATCAATGTCAAGAGATTGATCTTTTTGGTGAAATTGGTGGCATATCATTTAGTCCAGACACACAGGCACTTTTTATTGGAATAGCTGATCGAACATATGGGAGCTTGCTAGAGTACAATCGATGCCATGCTAATAGATATCTAGATTCCTTGATCTAGGAG
TCAAATTGTTCCACTATACGCCTTAAGATGGGAGGTCTCAAAGAGTTTAAAGGTAGGTGTGAATTCTTTTATCGCTTTTGTGGAATGAACTCTCACTCCAAGGCTTTTTGGTGGTTAATTCAAACTACGGGTTTTGCTGGAACGATGGTGTGGCCTGCAAGTCTTAAGTCGGCAAGGTTGAGTCATGTTAGGGCCTCCTG
TCCATATATATTCAAAATATATCTGGACCTCTGAAAACCATGTAAATAAGATGTAAAGTAAGCAGTTATGTATGCTGTCCATATTGATGGTTCCAGCCGTAGAATGGAGAAATCGAACCCTTCTGGGTATGTCAAATAGATTTTTTTCCTTGGCTATTTATGAACTTAAAGGATGTGCTCTTACTTTGGTCTGTTTGTCA
TATTGTTTTGTTTAAAATCCTGTTAAGTGCGGACCTTACCATTGATTGCACTGAGAGTAGTGAGGTGCTTACAACCCAGCATGTGGGAGATGTTGTTACGTTTGTCACGTTTGTTATGTAACGTAACGTTTCCATGTTGGC
>TRINITY_DN48625_c0_g3_i4 from sample A7 / Example unspliced isoform:CCCTTTCTCCACCCCACAACATAACCACTTTGTATAGCTTTTAAATAGCCGAACAGGTCCTTTCAGGAAAGGAAATCAACAGGACGCATATGTTATTAAATTCGTGGAAATCCGTCCGAAGTCCGAAGGCTTCTGTTCTCTTTAACGGCCGCAGGCGTTTACTTATTTTCCCAACCCCGCAGCTGATGAGCTAGCGACTG
AACATCATCGACACTCAAATTCTCTGAGCAACCGAGGCTTTGCTCGTGGAAGTTTGAGTTGCTTGGAGTAGATGGCACAATTTCAATGGGAGTATGAAAATATGGTAGAAGAGGCTGACATGAGTGACTCTGAAGATGGGCATGGGTTGAGAGGCGATGCTATTGAGACTGACTCAGATGATGATATTGATTTCAAGTAT
TTAGATACTACAGCCATGCAAGCTCGACATGGAAAAGACATTCAGGGAATTCCTTGGGAAAGGTTACATTTCACAAGAGAAACATATCGTCAGACACGATTAAAGCAGTATAAGAATTATAAAAGCCTAAACATGCCACATGATGCGCTGGATAAGGAGTGCAAGCCTGTTCGGAAGGATGGGAATTTTTTTGATTTTCA
CTACAACACAAGATCAGTGAGATCTACATTTGTCCATTTTCAGCTGAGGAATCTGGTTTGGGCCACTTCCAAGCATGATGTATACTTGATAAGTAATTACACTGTTATGCATCGGTGTTCATTGAGCCGGAGAAGCACAGAAGTTCTCAATGTTGCTGAACGATTGACTGCAGCTCCCGAGgttgattttatatcatttg
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GTGGATTTCAGGGAGAACTGATTGCCAAGAATTTGGATCGCTCTGGAGTTTTATACTGTGCAAAGATCAGTCATGATGAGAATGCTATCACTAATGCCATTGAGATCTATGAGAGTGCAAGTGGTGCGAAACAATTGATGACCTCAAATAATGACTCGGTTGTACGCATTTTTGATGCCGAGTCCTTCTATATCCTCCGG
AGTAATACTTTTCCATGGCCTGTAAATCATACTTCTATTAGCCCAGATAAAACACTCGTGGTAGTGGTTGGAGATCATGCTGATGGACTGCTTGTGGATCAACAGACAGGGAAGGTTGTTGATAGTCTAAGAGGGCATCTGGACTACTCATTTGCATCTGCATGGCATCCGGATGGTAGATATTTTGCTACGGGAAATCA
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AAATTGGTGGCATATCATTTAGTCCAGACACACAGGCACTTTTTATTGGAATAGCTGATCGAACATATGGGAGCTTGCTAGAGTACAATCGATGCCATGCTAATAGATATCTAGATTCCTTGATCTAGGAGTCAAATTGTTCCACTATACGCCTTAAGATGGGAGGTCTCAAAGAGTTTAAAGGTAGGTGTGAATTCTTT
TATCGCTTTTGTGGAATGAACTCTCACTCCAAGGCTTTTTGGTGGTTAATTCAAACTACGGGTTTTGCTGGAACGATGGTGTGGCCTGCAAGTCTTAAGTCGGCAAGGTTGAGTCATGTTAGGGCCTCCTGTCCATATATATTCAAAATATATCTGGACCTCTGAAAACCATGTAAATAAGATGTAAAGTAAGCAGTTAT
GTATGCTGTCCATATTGATGGTTCCAGCCGTAGAATGGAGAAATCGAACCCTTCTGGGTATGTCAAATAGATTTTTTTCCTTGGCTATTTATGAACTTAAAGGATGTGCTCTTACTTTGGTCTGTTTGTCATATTGTTTTGTTTAAAATCCTGTTAAGTGCGGACCTTACCATTGATTGCACTGAGAGTAGTGAGGTGCT
TACAACCCAGCATGTGGGAGATGTTGTTACGTTTGTCACGTTTGTTATGTAACGTAACGTTTCCATGTTGGC
Intron 2 GTATATTGCT ... CTGCAAACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 10 | 72 | 0 | 8 |
| A2 | 13.24 | 59 | 1 | 9 |
| A3 | 18.95 | 77 | 0 | 18 |
| A4 | 12.94 | 74 | 1 | 11 |
| A5 | 16.28 | 36 | 0 | 7 |
| A6 | 15.6 | 119 | 0 | 22 |
| A7 | 17.99 | 196 | 0 | 43 |
| A8 | 7.61 | 85 | 0 | 7 |
| A9 | 14.95 | 182 | 0 | 32 |
| A10 | 16.76 | 149 | 0 | 30 |
>TRINITY_DN107190_c2_g1_i3 from sample A4 / Example spliced isoformCACCCCACAACATAACCACTTTGTATAGCTTTTAAATAGCCGAACAGGTCCTTTCAGGAAAGGAAATCAACAGGACGCATATGTTATTAAATTCGTGGAAATCCGTCCGAAGTCCGAAGGCTTCTGTTCTCTTTAACGGCCGCAGGCGTTTACTTATTTTCCCAACCCCGCAGCTGATGAGCTAGCGACTGAACATCATC
GACACTCAAATTCTCTGAGCAACCGAGGCTTTGCTCGTGGAAGTTTGAGTTGCTTGGAGTAGATGGCACAATTTCAATGGGAGTATGAAAATATGGTAGAAGAGGCTGACATGAGTGACTCTGAAGATGGGCATGGGTTGAGAGGCGATGCTATTGAGACTGACTCAGATGATGATATTGATTTCAAGTATTTAGATACT
ACAGCCATGCAAGCTCGACATGGAAAAGACATTCAGGGAATTCCTTGGGAAAGGTTACATTTCACAAGAGAAACATATCGTCAGACACGATTAAAGCAGTATAAGAATTATAAAAGCCTAAACATGCCACATGATGCGCTGGATAAGGAGTGCAAGCCTGTTCGGAAGGATGGGAATTTTTTTGATTTTCACTACAACAC
AAGATCAGTGAGATCTACATTTGTCCATTTTCAGCTGAGGAATCTGGTTTGGGCCACTTCCAAGCATGATGTATACTTGATAAGTAATTACACTGTTATGCATCGGTGTTCATTGAGCCGGAGAAGCACAGAAGTTCTCAATGTTGCTGAACGATTGACTGCAGCTCCCGAGGTACAGAAAAATCCCTGGGCTGTGCAGC
AAGGTCTCGGCCGGATACAGATTAGTACAATGTGTGTTGAGGGAAATCTTCTGGTTGCTGGTGGATTTCAGGGAGAACTGATTGCCAAGAATTTGGATCGCTCTGGAGTTTTATACTGTGCAAAGATCAGTCATGATGAGAATGCTATCACTAATGCCATTGAGATCTATGAGAGTGCAAGTGGTGCGAAACAATTGATG
ACCTCAAATAATGACTCGGTTGTACGCATTTTTGATGCCGAGTCCTTCTATATCCTCCGGAGTAATACTTTTCCATGGCCTGTAAATCATACTTCTATTAGCCCAGATAAAACACTCGTGGTAGTGGTTGGAGATCATGCTGATGGACTGCTTGTGGATCAACAGACAGGGAAGGTTGTTGATAGTCTAAGAGGGCATCT
GGACTACTCATTTGCATCTGCATGGCATCCGGATGGTAGATATTTTGCTACGGGAAATCAGGATACCAGCTGTAGAATCTGGGACATTAGAAACCTAAGCTCATCTGTAGCTGTCTTGAAAGGATACATTGGTGCAGTGCGGTCACTGAGGTTCTCATCAGATGGCTGTTTTCTAGCAATGGCTGAGCCAGCAGATTTTG
TACATGTCTTCGATGCTAAGCGCAATTATGATCAATGTCAAGAGATTGATCTTTTTGGTGAAATTGGTGGCATATCATTTAGTCCAGACACACAGGCACTTTTTATTGGAATAGCTGATCGAACATATGGGAGCTTGCTAGAGTACAATCGATGCCATGCTAATAGATATCTAGATTCCTTGATCTAGGAGTCAAATTGT
TCCACTATACGCCTTAAGATGGGAGGTCTCAAAGAGTTTAAAGGTAGGTGTGAATTCTTTTATCGCTTTTGTGGAATGAACTCTCACTCCAAGGCTTTTTGGTGGTTAATTCAAACTACGGGTTTTGCTGGAACGATGGTGTGGCCTGCAAGTCTTAAGTCGGCAAGGTTGAGTCATGTTAGGGCCTCCTGTCCATATAT
ATTCAAAATATATCTGGACCTCTGAAAACCATGTAAATAAGATGTAAAGTAAGCAGTTATGTATGCTGTCCATATTGATGGTTCCAGCCGTAGAATGGAGAAATCGAACCCTTCTGGGTATGTCAAATAGATTTTTTTCCTTGGCTATTTATGAACTTAAAGGATGTGCTCTTACTTTGGTCTGTTTGTCATATTGTTTT
GTTTAAAATCCTGTTAAGTGCGGACCTTACCATTGATTGCACTGAGAGTAGTGAGGTGCTTACAACCCAGCATGTGGGAGATGTTGTTACGTTTGTCACGTTTGTTATGTAACGTAACGTTTCCATGTTGGCTCG
>TRINITY_DN107190_c2_g1_i2 from sample A4 / Example unspliced isoform:GCCACATGATGCGCTGGATAAGgtatattgctttatgccaatatctgtggttacctctaaagttttgaaacttccatcttatgtttgtattgatgttgtgagaagaaagcagtctgaattttttctttaccttacaaatctttacgactttaccccaacaaattgttgtgaatcctctgcaaacagGAGTGCAAGCCTGT
TCGGAAGGATGGGAATTTTTTTGATTTTCACTACAACACAAGATCAGTGAGATCTACATTTGTCCATTTTCAGCTGAGGAATCTGGTTTGGGCCACTTCCAAGCATGATGTATACTTGATAAGTAATTACACTGTTATGCATCGGTGTTCATTGAGCCGGAGAAGCACAGAAGTTCTCAATGTTGCTGAACGATTGACTG
CAGCTCCCGAGGTACAGAAAAATCCCTGGGCTGTGCAGCAAGGTCTCGGCCGGATACAGATTAGTACAATGTGTGTTGAGGGAAATCTTCTGGTTGCTGGTGGATTTCAGGGAGAACTGATTGCCAAGAATTTGGATCGCTCTGGAGTTTTATACTGTGCAAAGATCAGTCATGATGAGAATGCTATCACTAATGCCATT
GAGATCTATGAGAGTGCAAGTGGTGCGAAACAATTGATGACCTCAAATAATGACTCGGTTGTACGCATTTTTGATGCCGAGTCCTTCTATATCCTCCGGAGTAATACTTTTCCATGGCCTGTAAATCATACTTCTATTAGCCCAGATAAAACACTCGTGGTAGTGGTTGGAGATCATGCTGATGGACTGCTTGTGGATCA
ACAGACAGGGAAGGTTGTTGATAGTCTAAGAGGGCATCTGGACTACTCATTTGCATCTGCATGGCATCCGGATGGTAGATATTTTGCTACGGGAAATCAGGATACCAGCTGTAGAATCTGGGACATTAGAAACCTAAGCTCATCTGTAGCTGTCTTGAAAGGATACATTGGTGCAGTGCGGTCACTGAGGTTCTCATCAG
ATGGCTGTTTTCTAGCAATGGCTGAGCCAGCAGATTTTGTACATGTCTTCGATGCTAAGCGCAATTATGATCAATGTCAAGAGATTGATCTTTTTGGTGAAATTGGTGGCATATCATTTAGTCCAGACACACAGGCACTTTTTATTGGAATAGCTGATCGAACATATGGGAGCTTGCTAGAGTACAATCGATGCCATGCT
AATAGATATCTAGATTCCTTGATCTAGGAGTCAAATTGTTCCACTATACGCCTTAAGATGGGAGGTCTCAAAGAGTTTAAAGGTAGGTGTGAATTCTTTTATCGCTTTTGTGGAATGAACTCTCACTCCAAGGCTTTTTGGTGGTTAATTCAAACTACGGGTTTTGCTGGAACGATGGTGTGGCCTGCAAGTCTTAAGTC
GGCAAGGTTGAGTCATGTTAGGGCCTCCTGTCCATATATATTCAAAATATATCTGGACCTCTGAAAACCATGTAAATAAGATGTAAAGTAAGCAGTTATGTATGCTGTCCATATTGATGGTTCCAGCCGTAGAATGGAGAAATCGAACCCTTCTGGGTATGTCAAATAGATTTTTTTCCTTGGCTATTTATGAACTTAAA
GGATGTGCTCTTACTTTGGTCTGTTTGTCATATTGTTTTGTTTAAAATCCTGTTAAGTGCGGACCTTACCATTGATTGCACTGAGAGTAGTGAGGTGCTTACAACCCAGCATGTGGGAGATGTTGTTACGTTTGTCACGTTTGTTATGTAACGTAACGTTTCCATGTTGGCTCG