NA ----> NA


Intron 1 ATCATGATTC ... GACTCTCAAC

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A147.83665
A2754204
A368.423103
A466.67131
A538.46414
A648.05607833
A754.97346419
A850.49516836
A944.05474925
A1042.31453729



>TRINITY_DN46526_c0_g3_i2 from sample A10 / Example spliced isoform
TTAAATTGTGGTTAAGGTTCTAAAAATTGTTTCTTTTGTGACCTTACCATTTGACCATTTTCAGATCATGATTCATTAGGCAGCACAGGAAGCTGATAAATTATGCAGAGTGTTGTGAACATGCATGATTTTCATAAACAATCATGATTCATTAGGCATCACAGGAAGCCGATAAATTATGTGGTCGGTAAGCTTGTTTG
ATGGATACGCCTAAAAGGAGACCCTTGTCACTAGAATTAAGCATTCTAGAGTCATGCGGATTGCTTGGTACATGCTCCCTCACATCAATGTATCTCTAGCGATCCACTAATAGAGAAAGAATTGGTGCATCCTCGTTCCAAAAAAATGTGATAACAGTCCCTGGATTACCTTCATCTATATCTTGTCTCTTTGCTTGTTC
ATCGAGTTGAGACAGTCCTCTATTATATTCTTTTACCCTCTCAATTCGTAATAAATATAGGGTTAACATGGACCTTTTTAGAATTTCTTGTGGCTATTAGTTATTTATGTCTTAGTCTGATCATTTGTTTTCCCAATCAAGAATTTCTCTTTGACAGTTCTTTATGAATGCAAC


>TRINITY_DN46526_c0_g3_i6 from sample A10 / Example unspliced isoform:
TAAATCGGATCGTTTTGCTTATTCCCTTTTGACATTGACAGGGTTGAAGCCTTCCTTTAGGTAATGAATAATCATCGTCACTGTCTTCGCGAGATTACAAGCGTAGGCATAGGGTTTCAATGGAGCTCTGTTCATTTCTTTGAGAGGCAGAGTGTTGTAAACATGCATGATTTTCATAAACAatcatgattcattaggca
gcacaggaagctgataaattatgaaatatcttgtaccttggaagttatctttgtagttgtctttagatgctacaacaaaggagcctacaaattggtgatttttagaagagcacacattgttagcaaattctggtgtatggtgtctcaacttctggctggcgagcgaacagacatattattagcttgattgtggtatctgg
catcatttttagtatgccatgctataatccttgatgatttagtagcatcctctcatcaacactctcaaattctgtagaatccaagctgtggacagagacgatatttttgtatctgaagttatactgtatattccccttttgcagactaaaattatttttctggactctcaac
ATCATGATTCATTAGGCAGCACAGGAAG
CTGATAAATTATGTGGTCGGTAAGCTTGTTTGATGGATACGCCTAAAAGGAGACCCTTGTCACTAGAATTAAGCATTCTAGAGTCATGCGGATTGCTTGGTACATGCTCCCTCACATCAATGTATCTCTAGCGATCCACTAATAGAGAAAGAATTGGTGCATCCTCGTTCCAAAAAAATGTGATAACAGTCCCTGGATTA
CCTTCATCTATATCTTGTCTCTTTGCTTGTTCATCGAGTTGAGACAGTCCTCTATTATATTCTTTTACCCTCTCAATTCGTAATAAATATAGGGTTAACATGGACCTTTTTAGAATTTCTTGTGGCTATTAGTTATTTATGTCTTAGTCTGATCATTTGTTTTCCCAATCAAGAATTTCTCTTTGACAGTTCTTTATGAA
TGCAAC




Intron 2 GTGAGTATTG ... AACTATATAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A126.32714
A222.22704
A325302
A460112
A529.41605
A619.19801325
A720.61521017
A813.7772320
A914.7158614
A107.965227



>TRINITY_DN40159_c0_g1_i7 from sample A6 / Example spliced isoform
CCGTCGAACATGCTATACGCCCCAGAAAAAGAAAATGCAGGAAGCTTACCATTTTGAGAGGTCTTAACTGACCTAGAGGAGGAAGGGACTTTGAGATTAGGGTTTCTGTGCCAATTCTAAGTGGAGGAGAGGATTTTGATTCTAGTGCAATCCACACCCATCACAAGCATATGGAATTCCCTTATGTGCAGTAGCATAAA
TTGCAAAAAGTTGAGATTGCCTCAAGCGAGACCTCCTTAATCCAGGTATGTATGTACATAAATTGCAAGTAGTCGCGATATGCTAGTTAGTAGGGAAAGAGAGAAAAGCAATCCATCTCAAAGAAGGAATGCACCTTTGGATTGGATCTCAACCTGCTAATCCAGTCGATCTTCCTTCCCAACCCCCAATAATGAATTTA
TGTCTCTGGCTGCATTGTAAAAAGAAATAAATCGGATCGTTTTGCTTATTCCCTTTTGACATTGACAGGGTTGAAGCCTTCCTTGAGGTAATGAATAATCATCGTCACTGTCCTCGCGAGATTACAAGCGTAGGCATAGGGTTTCAATGGAGCTCTGTTCATTTCTTTGAGAGGCAGAGTGTTGTAAACATGCATGATTT
TCATAAACAATCATGATTCATTAGGCAGCACAGGAAGCTGATAAATTATGCAGAGTGTTGTGAACATGCATGATTTTCATAAACAATCATGATTCATTAGGCATCACAGGAAGCCGATAAATTATGTGGTCGGTAAGCTTGTTTGATGGATACGCCTAAAAGGAGACCCTTGTCACTAGAATTAAGCATTCTAGAGTCAT
GCGGATTGCTTGGTACATGCTCCCTCACATCAATGTATCTCTAGCGATCCACTAATAGAGAAAGAATTGGTGCATCCTCGTTCCAAAAAAATGTGATAACAGTCCCTGGATTACCTTCATCTATATCTTGTCTCTTTGCTTGTTCATCGAGTTGAGACAGTCCTCTATTATATTCTTTTACCCTCTCAATTCGTAATAAA
TATAGGGTTAACATGGACCTTTTTAGAATTTCTTGTGGCTATTAGTTATTTATGTCTTAGTCTGATCATTTGTTTTCCCAATCAAGAATTTCTCTTTGACAGTTCTTTATGAATGCAACTTTTTGATTTTACATAGTAAAATCCTCAAAAGATAGTTTCTTCTTACCTCTTCCTCTGCATTATTTCCTAACTACAAACCA
TCCTCATGGAAATGATTGATCATTTCAAAGGAAAAACAATGAAAGATTATTTGGTGTGGATATTTCTTTCAACGAGGATATCTTACCTCATCCTATGAAGTCTATCCTAACTACGAAGGATACTAATGGAAACGTTGTACCATTTCAAGTGCAAATCAAACTCAATTGCCGTGG


>TRINITY_DN40159_c0_g1_i6 from sample A6 / Example unspliced isoform:
CCGTCGAACATGCTATACGCCCCAGAAAAAGAAAATGCAGGAAGCTTACCATTTTGAGAGGTCTTAACTGACCTAGAGGAGGAAGGGACTTTGAGATTAGGGTTTCTGTGCCAATTCTAAGTGGAGGAGAGGATTTTGATTCTAGTGCAATCCACACCCATCACAAGCATATGGAATTCCCTTATGTGCAGTAGCATAAA
TTGCAAAAAGTTGAGATTGCCTCAAGCGAGACCTCCTTAATCCAGGTATGTATGTACATAAATTGCAAGTAGTCGCGATATGCTAGTTAGTAGGGAAAGAGAGAAAAGCAATCCATCTCAAAGAAGGAATGCACCTTTGGATTGGATCTCAACCTGCTAATCCAGTCGATCTTCCTTCCCAACCCCCAATAATGAATTTA
TGTCTCTGGCTGCATTGTAAAAAGAAATAAATCGGATCGTTTTGCTTATTCCCTTTTGACATTGACAGGGTTGAAGCCTTCCTTGAGGTAATGAATAATCATCGTCACTGTCCTCGCGAGATTACAAGCGTAGGCATAGGGTTTCAATGGAGCTCTGTTCATTTCTTTGAGAGGCAGAGTGTTGTAAACATGCATGATTT
TCATAAACAATCATGATTCATTAGGCAGCACAGGAAGCTGATAAATTATGCAGAGTGTTGTGAACATGCATGATTTTCATAAACAATCATGATTCATTAGGCATCACAGGAAGCCGATAAATTATgtgagtattgcataatttatattatatgatgcatatttttatgatttttttcacaatttatgcataagtcttgga
aaagagttattgcaaagcttctaatattttttgaattttacaattatgatttagtatagccttaactatatag
GTGGTCGGTAAGCTTGTTTGATGGATACGCCTAAAAGGAGACCCTTGTCACTAGAATTAAGCATTCTAGAGTCATGCGGATTGCTTGGTACATGCTCCCTCACATCAATGTATCTCTAGCGATCCAC
TAATAGAGAAAGAATTGGTGCATCCTCGTTCCAAAAAAATGTGATAACAGTCCCTGGATTACCTTCATCTATATCTTGTCTCTTTGCTTGTTCATCGAGTTGAGACAGTCCTCTATTATATTCTTTTACCCTCTCAATTCGTAATAAATATAGGGTTAACATGGACCTTTTTAGAATTTCTTGTGGCTATTAGTTATTTA
TGTCTTAGTCTGATCATTTGTTTTCCCAATCAAGAATTTCTCTTTGACAGTTCTTTATGAATGCAACTTTTTGATTTTACATAGTAAAATCCTCAAAAGATAGTTTCTTCTTACCTCTTCCTCTGCATTATTTCCTAACTACAAACCATCCTCATGGAAATGATTGATCATTTCAAAGGAAAAACAATGAAAGATTATTT
GGTGTGGATATTTCTTTCAACGAGGATATCTTACCTCATCCTATGAAGTCTATCCTAACTACGAAGGATACTAATGGAAACGTTGTACCATTTCAAGTGCAAATCAAACTCAATTGCCGTGG




Intron 3 GTGAGTATTG ... AACTATATAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A126.32714
A222.22704
A325302
A460112
A529.41605
A619.19801325
A720.61521017
A813.7772320
A914.7158614
A107.965227



>TRINITY_DN47194_c0_g1_i7 from sample A7 / Example spliced isoform
TGCTATACGCCCCAGAAAAAGAAAATGCAGGAAGCTTACCATTTTGAGAGGTCTTAACTGACCTAGAGGAGGAAGGGACTTTGAGATTAGGGTTTCTGTGCCAATTCTAAGTGGAGGAGAGGATTTTGATTCTAGTGCAATCCACACCCATCACAAGCATATGGAATTCCCTTATGTGCAGTAGCATAAATTGCAAAAAG
TTGAGATTGCCTCAAGCGAGACCTCCTTAATCCAGGGTTGAAGCCTTCCTTTAGGTAATGAATAATCATCGTCACTGTCCTCGCGAGATTACAAGCGTAGGCATAGGGTTTCAATGGAGCTCTGTTCATTTCTTTGAGAGGCAGAGTGTTGTAAACATGCATGATTTTCATAAACAATCATGATTCATTAGGCAGCACAG
GAAGCTGATAAATTATGCAGAGTGTTGTGAACATGCATGATTTTCATAAACAATCATGATTCATTAGGCATCACAGGAAGCCGATAAATTATGTGGTCGGTAAGCTTGTTTGATGGATACGCCTAAAAGGAGACCCTTGTCACTAGAATTAAGCATTCTAGAGTCATGCGGATTGCTTGGTACATGCTCCCTCACGTCAA
AGTATCTCTAGCGACCCACTAATAGAGAAAGAATTGGTGCATCCTCGTTCCAAAAAAATGTGATAACAGTCCCTGGATTACCTTCATCCATATCTTGTCTCTTTGCTTGTTCATCGAGTTGAGACAGTCCTCTATTATATTCTTTTACCCTCTTAATTCGTAATATATATAGGGTTAACATGGACCTTTTTAGAATTTCT
TGTGGCTATTAGTTATTTATGTCTTAGTCTGATCATTTGTTTTCCCAATCAAGAATTTCTCTTTGACAGTTCTTTATGAATGCAACTTTTTGATTTTACATAGTAAAATCCTCAAAAGATAGTTTCTTCTTACCTCTTCCTCTGCATTATTTCCTAACTACAAACCATCCTCATGGAAATGATTGATCATTTCAAAGGAA
AAACAATGAAAGATTATTTGGTGTGGATATTTCTTTCAACGAGGATATCTTACCTCATCCTATGAAGTCTGTCCTAACTACGAAGGATACTAATGGAAACGTTGTACCATTTCAAGTGCAAATCAAACTCAATTGGTG


>TRINITY_DN47194_c0_g1_i10 from sample A7 / Example unspliced isoform:
TGCTATACGCCCCAGAAAAAGAAAATGCAGGAAGCTTACCATTTTGAGAGGTCTTAACTGACCTAGAGGAGGAAGGGACTTTGAGATTAGGGTTTCTGTGCCAATTCTAAGTGGAGGAGAGGATTTTGATTCTAGTGCAATCCACACCCATCACAAGCATATGGAATTCCCTTATGTGCAGTAGCATAAATTGCAAAAAG
TTGAGATTGCCTCAAGCGAGACCTCCTTAATCCAGGGTTGAAGCCTTCCTTTAGGTAATGAATAATCATCGTCACTGTCCTCGCGAGATTACAAGCGTAGGCATAGGGTTTCAATGGAGCTCTGTTCATTTCTTTGAGAGGCAGAGTGTTGTAAACATGCATGATTTTCATAAACAATCATGATTCATTAGGCAGCACAG
GAAGCTGATAAATTATGCAGAGTGTTGTGAACATGCATGATTTTCATAAACAATCATGATTCATTAGGCATCACAGGAAGCCGATAAATTATgtgagtattgcataatttatattatatgatgcatatttttatgatttttttcataatttatgcataagtcttggaaaagagttattgcaaagcttctaatattttttt
gaattttacaattatgatttagtatagccttaactatatag
GTGGTCGGTAAGCTTGTTTGATGGATACGCCTAAAAGGAGACCCTTGTCACTAGAATTAAGCATTCTAGAGTCATGCGGATTGCTTGGTACATGCTCCCTCACATCAATGTATCTCTAGCGATCCACTAATAGAGAAAGAATTGGTGCATCCTCGTTCC
AAAAAAATGTGATAACAGTCCCTGGATTACCTTCATCCATATCTTGTCTCTTTGCTTGTTCATCGAGTTGAGACAGTCCTCTATTATATTCTTTTACCCTCTCAATTCGTAATAAATATAGGGTTAACATGGACCTTTTTAGAATTTCTTGTGGCTATTAGTTATTTATGTCTTAGTCTGATCATTTGTTTTCCCAATCA
AGAATTTCTCTTTGACAGTTCTTTATGAATGCAACTTTTTGATTTTACATAGTAAAATCCTCAAAAGATAGTTTCTTCTTACCTCTTCCTCTGCATTATTTCCTAACTACAAACCATCCTCATGGAAATGATTGATCATTTCAAAGGAAAAACAATGAAAGATTATTTGGTGTGGATATTTCTTTCAACGAGGATATCTT
ACCTCATCCTATGAAGTCTGTCCTAACTACGAAGGATACTAATGGAAACGTTGTACCATTTCAAGTGCAAATCAAACTCAATTGGTG




Intron 4 ATGCATGATT ... TGTTGTGAAC

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A139.3913.58.59
A234.6916143
A333.976.52.54
A445.45341
A533.33312
A641.2792.57357
A741.372.56438
A838.16947046
A940.371.548.548
A1038.6467.54540



>TRINITY_DN40159_c0_g1_i4 from sample A6 / Example spliced isoform
CCGTCGAACATGCTATACGCCCCAGAAAAAGAAAATGCAGGAAGCTTACCATTTTGAGAGGTCTTAACTGACCTAGAGGAGGAAGGGACTTTGAGATTAGGGTTTCTGTGCCAATTCTAAGTGGAGGAGAGGATTTTGATTCTAGTGCAATCCACACCCATCACAAGCATATGGAATTCCCTTATGTGCAGTAGCATAAA
TTGCAAAAAGTTGAGATTGCCTCAAGCGAGACCTCCTTAATCCAGGTATGTATGTACATAAATTGCAAGTAGTCGCGATATGCTAGTTAGTAGGGAAAGAGAGAAAAGCAATCCATCTCAAAGAAGGAATGCACCTTTGGATTGGATCTCAACCTGCTAATCCAGTCGATCTTCCTTCCCAACCCCCAATAATGAATTTA
TGTCTCTGGCTGCATTGTAAAAAGAAATAAATCGGATCGTTTTGCTTATTCCCTTTTGACATTGACAGGGTTGAAGCCTTCCTTGAGGTAATGAATAATCATCGTCACTGTCCTCGCGAGATTACAAGCGTAGGCATAGGGTTTCAATGGAGCTCTGTTCATTTCTTTGAGAGGCAGAGTGTTGTAAACATGCATGATTT
TCATAAACAATCATGATTCATTAGGCAGCACAGGAAGCTGATAAATTATGTGGTCGGTAAGCTTGTTTGATGGATACGCCTAAAAGGAGACCCTTGTCACTAGAATTAAGCATTCTAGAGTCATGCGGATTGCTTGGTACATGCTCCCTCACATCAATGTATCTCTAGCGATCCACTAATAGAGAAAGAATTGGTGCATC
CTCGTTCCAAAAAAATGTGATAACAGTCCCTGGATTACCTTCATCTATATCTTGTCTCTTTGCTTGTTCATCGAGTTGAGACAGTCCTCTATTATATTCTTTTACCCTCTCAATTCGTAATAAATATAGGGTTAACATGGACCTTTTTAGAATTTCTTGTGGCTATTAGTTATTTATGTCTTAGTCTGATCATTTGTTTT
CCCAATCAAGAATTTCTCTTTGACAGTTCTTTATGAATGCAACTTTTTGATTTTACATAGTAAAATCCTCAAAAGATAGTTTCTTCTTACCTCTTCCTCTGCATTATTTCCTAACTACAAACCATCCTCATGGAAATGATTGATCATTTCAAAGGAAAAACAATGAAAGATTATTTGGTGTGGATATTTCTTTCAACGAG
GATATCTTACCTCATCCTATGAAGTCTATCCTAACTACGAAGGATACTAATGGAAACGTTGTACCATTTCAAGTGCAAATCAAACTCAATTGCCGTGG


>TRINITY_DN40159_c0_g1_i8 from sample A6 / Example unspliced isoform:
CCGTCGAACATGCTATACGCCCCAGAAAAAGAAAATGCAGGAAGCTTACCATTTTGAGAGGTCTTAACTGACCTAGAGGAGGAAGGGACTTTGAGATTAGGGTTTCTGTGCCAATTCTAAGTGGAGGAGAGGATTTTGATTCTAGTGCAATCCACACCCATCACAAGCATATGGAATTCCCTTATGTGCAGTAGCATAAA
TTGCAAAAAGTTGAGATTGCCTCAAGCGAGACCTCCTTAATCCAGGGTTGAAGCCTTCCTTGAGGTAATGAATAATCATCGTCACTGTCCTCGCGAGATTACAAGCGTAGGCATAGGGTTTCAATGGAGCTCTGTTCATTTCTTTGAGAGGCAGAGTGTTGTAAACatgcatgattttcataaacaatcatgattcatta
ggcagcacaggaagctgataaattatgcagagtgttgtgaac
ATGCATGATTTTCATAAACAATCATGATTCATTAGGCATCACAGGAAGCCGATAAATTATGTGGTCGGTAAGCTTGTTTGATGGATACGCCTAAAAGGAGACCCTTGTCACTAGAATTAAGCATTCTAGAGTCATGCGGATTGCTTGGTACATGCTCC
CTCACATCAATGTATCTCTAGCGATCCACTAATAGAGAAAGAATTGGTGCATCCTCGTTCCAAAAAAATGTGATAACAGTCCCTGGATTACCTTCATCTATATCTTGTCTCTTTGCTTGTTCATCGAGTTGAGACAGTCCTCTATTATATTCTTTTACCCTCTCAATTCGTAATAAATATAGGGTTAACATGGACCTTTT
TAGAATTTCTTGTGGCTATTAGTTATTTATGTCTTAGTCTGATCATTTGTTTTCCCAATCAAGAATTTCTCTTTGACAGTTCTTTATGAATGCAACTTTTTGATTTTACATAGTAAAATCCTCAAAAGATAGTTTCTTCTTACCTCTTCCTCTGCATTATTTCCTAACTACAAACCATCCTCATGGAAATGATTGATCAT
TTCAAAGGAAAAACAATGAAAGATTATTTGGTGTGGATATTTCTTTCAACGAGGATATCTTACCTCATCCTATGAAGTCTATCCTAACTACGAAGGATACTAATGGAAACGTTGTACCATTTCAAGTGCAAATCAAACTCAATTGCCGTGG




Intron 5 GTTCGTGCTT ... CTCCCGGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A120411
A231.251164
A342.86442
A40500
A5-1000
A6101804
A79.382915
A813.923447
A916.982218
A10162144



>TRINITY_DN39702_c0_g1_i6 from sample A9 / Example spliced isoform
GCCATTCCCTGGGAAGCCCCGTCGAACATGCTATACGCCCCAGAAAAAGAAAATGCAGGAAGCTTACCATTTTGAGAGGTCTTAACTGACCTAGAGGAGGAAGGGACTTTGAGATTAGGGTTTCTGTGCCAATTCTAAGTGGAGGAGAGGATTTTGATTCTAGTGCAATCCACACCCATCACAAGCATATGGAATTCCCT
TATGTGCAGTAGCATAAATTGCAAAAAGTTGAGATTGCCTCAAGCGAGACCTCCTTAATCCAGGGTTGAAGCCTTCCTTTAGGTAATGAATAATCATCGTCACTGTCTTCGCGAGATTACAAGCGTAGGCATAGGGTTTCAATGGAGCTCTGTTCATTTCTTTGAGAGGAAATATCTTGTACCTTGGAAGTTATCTTTGT
AGTTGTCTTTAGATGCTACAACAAAGGAGCCTACAAATTGGTGATTTTTAGAAGAGCACACATTGTTAGCAAATTCTGGTGTATGGTGTCTCAACTTCTGGCTGGCGAGCGAACAGACATATTATTAGCTTGATTGTGGTATCTGGCATCATTTTTAGTATGCCATGCTATAATCCTTGATGATTTAGTAGCATCCTCTC
ATCAACACTCTCAAATTCTGTAGAATCCAAGCTGTGGACAGAGACGATATTTTTGTATCTGAAGTTATACTGTATATTCCCCTTTTGCAGACTAAAATTATTTTTCTGGACTCTCAACTTACCCAGGTCTAAAGCTATCTTTTAAAAGCTCATGACATGTCCAATTGTCCAAAAGGCCTTGGCAAGTGAAATCAGTTCTC
CATATCCCAATTCACTTAAAAGAGATAAATTGGAACACATCCCTTTGAAATACAAATTATT


>TRINITY_DN39702_c0_g1_i4 from sample A9 / Example unspliced isoform:
GCCATTCCCTGGGAAGCCCCGTCGAACATGCTATACGCCCCAGAAAAAGAAAATGCAGGAAGCTTACCATTTTGAGAGGTCTTAACTGACCTAGAGGAGGAAGGGACTTTGAGATTAGGGTTTCTGTGCCAATTCTAAGTGGAGGAGAGGATTTTGATTCTAGTGCAATCCACACCCATCACAAGCATATGGAATTCCCT
TATGTGCAGgttcgtgcttcgtgaagaccaaaacaattagtcacaatttatttttatcattcttgaaatgatgaccaagggctttgtataatttatttttcctcccggcagTAGCATAAATTGCAAAAAGTTGAGATTGCCTCAAGCGAGACCTCCTTAATCCAGGGTTGAAGCCTTCCTTGAGGTAATGAATAATCATC
GTCACTGTCTTCGCGAGATTACAAGCGTAGGCATAGGGTTTCAATGGAGCTCTGTTCATTTCTTTGAGAGGAAATATCTTGTACCTTGGAAGTTATCTTTGTAGTTGTCTTTAGATGCTACAACAAAGGAGCCTACAAATTGGTGATTTTTAGAAGAGCACACATTGTTAGCAAATTCTGGTGTATGGTGTCTCAACTTC
TGGCTGGCGAGCGAACAGACATATTATTAGCTTGATTGTGGTATCTGGCATCATTTTTAGTATGCCATGCTATAATCCTTGATGATTTAGTAGCATCCTCTCATCAACACTCTCAAATTCTGTAGAATCCAAGCTGTGGACAGAGACGATATTTTTGTATCTGAAGTTATACTGTATATTCCCCTTTTGCAGACTAAAAT
TATTTTTCTGGACTCTCAACTTACCCAGGTCTAAAGCTATCTTTTAAAAGCTCATGACATGTCCAATTGTCCAAAAGGCCTTGGCAAGTGAAATCAGTTCTCCATATCCCAATTCACTTAAAAGAGATAAATTGGAACACATCCCTTTGAAATACAAATTATT




Intron 6 GCAGAGTGTT ... AACTATATAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A128.571044
A223.81814
A327.27412
A460112
A530715
A626.09853525
A727.74562617
A821.03922920
A921.31722514
A1017.8669237



>TRINITY_DN40159_c0_g1_i4 from sample A6 / Example spliced isoform
CCGTCGAACATGCTATACGCCCCAGAAAAAGAAAATGCAGGAAGCTTACCATTTTGAGAGGTCTTAACTGACCTAGAGGAGGAAGGGACTTTGAGATTAGGGTTTCTGTGCCAATTCTAAGTGGAGGAGAGGATTTTGATTCTAGTGCAATCCACACCCATCACAAGCATATGGAATTCCCTTATGTGCAGTAGCATAAA
TTGCAAAAAGTTGAGATTGCCTCAAGCGAGACCTCCTTAATCCAGGTATGTATGTACATAAATTGCAAGTAGTCGCGATATGCTAGTTAGTAGGGAAAGAGAGAAAAGCAATCCATCTCAAAGAAGGAATGCACCTTTGGATTGGATCTCAACCTGCTAATCCAGTCGATCTTCCTTCCCAACCCCCAATAATGAATTTA
TGTCTCTGGCTGCATTGTAAAAAGAAATAAATCGGATCGTTTTGCTTATTCCCTTTTGACATTGACAGGGTTGAAGCCTTCCTTGAGGTAATGAATAATCATCGTCACTGTCCTCGCGAGATTACAAGCGTAGGCATAGGGTTTCAATGGAGCTCTGTTCATTTCTTTGAGAGGCAGAGTGTTGTAAACATGCATGATTT
TCATAAACAATCATGATTCATTAGGCAGCACAGGAAGCTGATAAATTATGTGGTCGGTAAGCTTGTTTGATGGATACGCCTAAAAGGAGACCCTTGTCACTAGAATTAAGCATTCTAGAGTCATGCGGATTGCTTGGTACATGCTCCCTCACATCAATGTATCTCTAGCGATCCACTAATAGAGAAAGAATTGGTGCATC
CTCGTTCCAAAAAAATGTGATAACAGTCCCTGGATTACCTTCATCTATATCTTGTCTCTTTGCTTGTTCATCGAGTTGAGACAGTCCTCTATTATATTCTTTTACCCTCTCAATTCGTAATAAATATAGGGTTAACATGGACCTTTTTAGAATTTCTTGTGGCTATTAGTTATTTATGTCTTAGTCTGATCATTTGTTTT
CCCAATCAAGAATTTCTCTTTGACAGTTCTTTATGAATGCAACTTTTTGATTTTACATAGTAAAATCCTCAAAAGATAGTTTCTTCTTACCTCTTCCTCTGCATTATTTCCTAACTACAAACCATCCTCATGGAAATGATTGATCATTTCAAAGGAAAAACAATGAAAGATTATTTGGTGTGGATATTTCTTTCAACGAG
GATATCTTACCTCATCCTATGAAGTCTATCCTAACTACGAAGGATACTAATGGAAACGTTGTACCATTTCAAGTGCAAATCAAACTCAATTGCCGTGG


>TRINITY_DN40159_c0_g1_i6 from sample A6 / Example unspliced isoform:
CCGTCGAACATGCTATACGCCCCAGAAAAAGAAAATGCAGGAAGCTTACCATTTTGAGAGGTCTTAACTGACCTAGAGGAGGAAGGGACTTTGAGATTAGGGTTTCTGTGCCAATTCTAAGTGGAGGAGAGGATTTTGATTCTAGTGCAATCCACACCCATCACAAGCATATGGAATTCCCTTATGTGCAGTAGCATAAA
TTGCAAAAAGTTGAGATTGCCTCAAGCGAGACCTCCTTAATCCAGGTATGTATGTACATAAATTGCAAGTAGTCGCGATATGCTAGTTAGTAGGGAAAGAGAGAAAAGCAATCCATCTCAAAGAAGGAATGCACCTTTGGATTGGATCTCAACCTGCTAATCCAGTCGATCTTCCTTCCCAACCCCCAATAATGAATTTA
TGTCTCTGGCTGCATTGTAAAAAGAAATAAATCGGATCGTTTTGCTTATTCCCTTTTGACATTGACAGGGTTGAAGCCTTCCTTGAGGTAATGAATAATCATCGTCACTGTCCTCGCGAGATTACAAGCGTAGGCATAGGGTTTCAATGGAGCTCTGTTCATTTCTTTGAGAGGCAGAGTGTTGTAAACATGCATGATTT
TCATAAACAATCATGATTCATTAGGCAGCACAGGAAGCTGATAAATTATgcagagtgttgtgaacatgcatgattttcataaacaatcatgattcattaggcatcacaggaagccgataaattatgtgagtattgcataatttatattatatgatgcatatttttatgatttttttcacaatttatgcataagtcttgga
aaagagttattgcaaagcttctaatattttttgaattttacaattatgatttagtatagccttaactatatag
GTGGTCGGTAAGCTTGTTTGATGGATACGCCTAAAAGGAGACCCTTGTCACTAGAATTAAGCATTCTAGAGTCATGCGGATTGCTTGGTACATGCTCCCTCACATCAATGTATCTCTAGCGATCCAC
TAATAGAGAAAGAATTGGTGCATCCTCGTTCCAAAAAAATGTGATAACAGTCCCTGGATTACCTTCATCTATATCTTGTCTCTTTGCTTGTTCATCGAGTTGAGACAGTCCTCTATTATATTCTTTTACCCTCTCAATTCGTAATAAATATAGGGTTAACATGGACCTTTTTAGAATTTCTTGTGGCTATTAGTTATTTA
TGTCTTAGTCTGATCATTTGTTTTCCCAATCAAGAATTTCTCTTTGACAGTTCTTTATGAATGCAACTTTTTGATTTTACATAGTAAAATCCTCAAAAGATAGTTTCTTCTTACCTCTTCCTCTGCATTATTTCCTAACTACAAACCATCCTCATGGAAATGATTGATCATTTCAAAGGAAAAACAATGAAAGATTATTT
GGTGTGGATATTTCTTTCAACGAGGATATCTTACCTCATCCTATGAAGTCTATCCTAACTACGAAGGATACTAATGGAAACGTTGTACCATTTCAAGTGCAAATCAAACTCAATTGCCGTGG




Intron 7 GTATGTATGT ... ACATTGACAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A152.935.706.4
A227.1411.60.54.8
A350.725.80.56
A454.533.31.63.7
A535.331.440.8
A649.0427.65.626.4
A742.5940.65.730.2
A844.6829.58.323.4
A951.240.23.142
A1046.232.45.628.5



>TRINITY_DN40159_c0_g1_i8 from sample A6 / Example spliced isoform
CCGTCGAACATGCTATACGCCCCAGAAAAAGAAAATGCAGGAAGCTTACCATTTTGAGAGGTCTTAACTGACCTAGAGGAGGAAGGGACTTTGAGATTAGGGTTTCTGTGCCAATTCTAAGTGGAGGAGAGGATTTTGATTCTAGTGCAATCCACACCCATCACAAGCATATGGAATTCCCTTATGTGCAGTAGCATAAA
TTGCAAAAAGTTGAGATTGCCTCAAGCGAGACCTCCTTAATCCAGGGTTGAAGCCTTCCTTGAGGTAATGAATAATCATCGTCACTGTCCTCGCGAGATTACAAGCGTAGGCATAGGGTTTCAATGGAGCTCTGTTCATTTCTTTGAGAGGCAGAGTGTTGTAAACATGCATGATTTTCATAAACAATCATGATTCATTA
GGCAGCACAGGAAGCTGATAAATTATGCAGAGTGTTGTGAACATGCATGATTTTCATAAACAATCATGATTCATTAGGCATCACAGGAAGCCGATAAATTATGTGGTCGGTAAGCTTGTTTGATGGATACGCCTAAAAGGAGACCCTTGTCACTAGAATTAAGCATTCTAGAGTCATGCGGATTGCTTGGTACATGCTCC
CTCACATCAATGTATCTCTAGCGATCCACTAATAGAGAAAGAATTGGTGCATCCTCGTTCCAAAAAAATGTGATAACAGTCCCTGGATTACCTTCATCTATATCTTGTCTCTTTGCTTGTTCATCGAGTTGAGACAGTCCTCTATTATATTCTTTTACCCTCTCAATTCGTAATAAATATAGGGTTAACATGGACCTTTT
TAGAATTTCTTGTGGCTATTAGTTATTTATGTCTTAGTCTGATCATTTGTTTTCCCAATCAAGAATTTCTCTTTGACAGTTCTTTATGAATGCAACTTTTTGATTTTACATAGTAAAATCCTCAAAAGATAGTTTCTTCTTACCTCTTCCTCTGCATTATTTCCTAACTACAAACCATCCTCATGGAAATGATTGATCAT
TTCAAAGGAAAAACAATGAAAGATTATTTGGTGTGGATATTTCTTTCAACGAGGATATCTTACCTCATCCTATGAAGTCTATCCTAACTACGAAGGATACTAATGGAAACGTTGTACCATTTCAAGTGCAAATCAAACTCAATTGCCGTGG


>TRINITY_DN40159_c0_g1_i7 from sample A6 / Example unspliced isoform:
CCGTCGAACATGCTATACGCCCCAGAAAAAGAAAATGCAGGAAGCTTACCATTTTGAGAGGTCTTAACTGACCTAGAGGAGGAAGGGACTTTGAGATTAGGGTTTCTGTGCCAATTCTAAGTGGAGGAGAGGATTTTGATTCTAGTGCAATCCACACCCATCACAAGCATATGGAATTCCCTTATGTGCAGTAGCATAAA
TTGCAAAAAGTTGAGATTGCCTCAAGCGAGACCTCCTTAATCCAGgtatgtatgtacataaattgcaagtagtcgcgatatgctagttagtagggaaagagagaaaagcaatccatctcaaagaaggaatgcacctttggattggatctcaacctgctaatccagtcgatcttccttcccaacccccaataatgaattta
tgtctctggctgcattgtaaaaagaaataaatcggatcgttttgcttattcccttttgacattgacag
GGTTGAAGCCTTCCTTGAGGTAATGAATAATCATCGTCACTGTCCTCGCGAGATTACAAGCGTAGGCATAGGGTTTCAATGGAGCTCTGTTCATTTCTTTGAGAGGCAGAGTGTTGTAAACATGCATGATTT
TCATAAACAATCATGATTCATTAGGCAGCACAGGAAGCTGATAAATTATGCAGAGTGTTGTGAACATGCATGATTTTCATAAACAATCATGATTCATTAGGCATCACAGGAAGCCGATAAATTATGTGGTCGGTAAGCTTGTTTGATGGATACGCCTAAAAGGAGACCCTTGTCACTAGAATTAAGCATTCTAGAGTCAT
GCGGATTGCTTGGTACATGCTCCCTCACATCAATGTATCTCTAGCGATCCACTAATAGAGAAAGAATTGGTGCATCCTCGTTCCAAAAAAATGTGATAACAGTCCCTGGATTACCTTCATCTATATCTTGTCTCTTTGCTTGTTCATCGAGTTGAGACAGTCCTCTATTATATTCTTTTACCCTCTCAATTCGTAATAAA
TATAGGGTTAACATGGACCTTTTTAGAATTTCTTGTGGCTATTAGTTATTTATGTCTTAGTCTGATCATTTGTTTTCCCAATCAAGAATTTCTCTTTGACAGTTCTTTATGAATGCAACTTTTTGATTTTACATAGTAAAATCCTCAAAAGATAGTTTCTTCTTACCTCTTCCTCTGCATTATTTCCTAACTACAAACCA
TCCTCATGGAAATGATTGATCATTTCAAAGGAAAAACAATGAAAGATTATTTGGTGTGGATATTTCTTTCAACGAGGATATCTTACCTCATCCTATGAAGTCTATCCTAACTACGAAGGATACTAATGGAAACGTTGTACCATTTCAAGTGCAAATCAAACTCAATTGCCGTGG




Intron 8 GCATAGGGTT ... TCTTTGAGAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
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A571.43123
A663.3519.52740
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A960.86192831
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>TRINITY_DN47194_c0_g1_i1 from sample A7 / Example spliced isoform
TGCTATACGCCCCAGAAAAAGAAAATGCAGGAAGCTTACCATTTTGAGAGGTCTTAACTGACCTAGAGGAGGAAGGGACTTTGAGATTAGGGTTTCTGTGCCAATTCTAAGTGGAGGAGAGGATTTTGATTCTAGTGCAATCCACACCCATCACAAGCATATGGAATTCCCTTATGTGCAGTAGCATAAATTGCAAAAAG
TTGAGATTGCCTCAAGCGAGACCTCCTTAATCCAGGGTTGAAGCCTTCCTTGAGGTAATGAATAATCATCGTCACTGTCCTCGCGAGATTACAAGCGTAGGAAATATCTTGTACCTTGGAAGTTATCTTTGTAGTTGTCTTTAGATGCTACAACAAAGGAGCCTACAAATTGGTGATTTTTAGAAGAGCACACATTGTTA
GCAAATTCTGGTGTATGGTGTCTCAACTTCTGGCTGGCGAGCGAACAGACATATTATTAGCTTGATTGTGGTATCTGGCATCATTTTTAGTATGCCATGCTATAATCCTTGATGATTTAGTAGCATCCTCTCATCAACACTCTCAAATTCTGTAGAATCCAAGCTGTGGACAGAGACGATATTTTTGTATCTGAAGTTAT
ACTGTATATTCCCCTTTTGCAGACTAAAATTATTTTTCTGGACTCTCAACTTACCCAGGTCTAAAGCTATCTTTTAAAAGCTCATGACATGTCCAATTGTCCAAAAGGCCTTGGCAAGTGAAATCAGTTCTCCATATCCCAATTCACTTAAAAGAGATAAATTGGAACACATCCCTTTGAAATACAAATTATTCAAACAT
ATTCAAAATCTGACTAGCATAGACATATCGATACAAAAAAATATATCCTTGAATGGATATTTTATTAGTACTAGTAGACCCTGGGAAAAATTCAAAAACAACAGTAATATTGGTTGGTCATACTGCAAGTTACCTAATGAGGATGGC


>TRINITY_DN47194_c0_g1_i8 from sample A7 / Example unspliced isoform:
TGCTATACGCCCCAGAAAAAGAAAATGCAGGAAGCTTACCATTTTGAGAGGTCTTAACTGACCTAGAGGAGGAAGGGACTTTGAGATTAGGGTTTCTGTGCCAATTCTAAGTGGAGGAGAGGATTTTGATTCTAGTGCAATCCACACCCATCACAAGCATATGGAATTCCCTTATGTGCAGTAGCATAAATTGCAAAAAG
TTGAGATTGCCTCAAGCGAGACCTCCTTAATCCAGGGTTGAAGCCTTCCTTGAGGTAATGAATAATCATCGTCACTGTCCTCGCGAGATTACAAGCGTAGgcatagggtttcaatggagctctgttcatttctttgagagGAAATATCTTGTACCTTGGAAGTTATCTTTGTAGTTGTCTTTAGATGCTACAACAAAGGA
GCCTACAAATTGGTGATTTTTAGAAGAGCACACATTGTTAGCAAATTCTGGTGTATGGTGTCTCAACTTCTGGCTGGCGAGCGAACAGACATATTATTAGCTTGATTGTGGTATCTGGCATCATTTTTAGTATGCCATGCTATAATCCTTGATGATTTAGTAGCATCCTCTCATCAACACTCTCAAATTCTGTAGAATCC
AAGCTGTGGACAGAGACGATATTTTTGTATCTGAAGTTATACTGTATATTCCCCTTTTGCAGACTAAAATTATTTTTCTGGACTCTCAACTTACCCAGGTCTAAAGCTATCTTTTAAAAGCTCATGACATGTCCAATTGTCCAAAAGGCCTTGGCAAGTGAAATCAGTTCTCCATATCCCAATTCACTTAAAAGAGATAA
ATTGGAACACATCCCTTTGAAATACAAATTATTCAAACATATTCAAAATCTGACTAGCATAGACATATCGATACAAAAAAATATATCCTTGAATGGATATTTTATTAGTACTAGTAGACCCTGGGAAAAATTCAAAAACAACAGTAATATTGGTTGGTCATACTGCAAGTTACCTAATGAGGATGGC




Intron 9 GCAGAGTGTT ... AACTATATAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A128.571044
A223.81814
A327.27412
A460112
A530715
A626.09853525
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A821.03922920
A921.31722514
A1017.8669237



>TRINITY_DN47194_c0_g1_i5 from sample A7 / Example spliced isoform
TGCTATACGCCCCAGAAAAAGAAAATGCAGGAAGCTTACCATTTTGAGAGGTCTTAACTGACCTAGAGGAGGAAGGGACTTTGAGATTAGGGTTTCTGTGCCAATTCTAAGTGGAGGAGAGGATTTTGATTCTAGTGCAATCCACACCCATCACAAGCATATGGAATTCCCTTATGTGCAGTAGCATAAATTGCAAAAAG
TTGAGATTGCCTCAAGCGAGACCTCCTTAATCCAGGGTTGAAGCCTTCCTTTAGGTAATGAATAATCATCGTCACTGTCCTCGCGAGATTACAAGCGTAGGCATAGGGTTTCAATGGAGCTCTGTTCATTTCTTTGAGAGGCAGAGTGTTGTAAACATGCATGATTTTCATAAACAATCATGATTCATTAGGCAGCACAG
GAAGCTGATAAATTATGTGGTCGGTAAGCTTGTTTGATGGATACGCCTAAAAGGAGACCCTTGTCACTAGAATTAAGCATTCTAGAGTCATGCGGATTGCTTGGTACATGCTCCCTCACATCAATGTATCTCTAGCGATCCACTAATAGAGAAAGAATTGGTGCATCCTCGTTCCAAAAAAATGTGATAACAGTCCCTGG
ATTACCTTCATCCATATCTTGTCTCTTTGCTTGTTCATCGAGTTGAGACAGTCCTCTATTATATTCTTTTACCCTCTCAATTCGTAATAAATATAGGGTTAACATGGACCTTTTTAGAATTTCTTGTGGCTATTAGTTATTTATGTCTTAGTCTGATCATTTGTTTTCCCAATCAAGAATTTCTCTTTGACAGTTCTTTA
TGAATGCAACTTTTTGATTTTACATAGTAAAATCCTCAAAAGATAGTTTCTTCTTACCTCTTCCTCTGCATTATTTCCTAACTACAAACCATCCTCATGGAAATGATTGATCATTTCAAAGGAAAAACAATGAAAGATTATTTGGTGTGGATATTTCTTTCAACGAGGATATCTTACCTCATCCTATGAAGTCTGTCCTA
ACTACGAAGGATACTAATGGAAACGTTGTACCATTTCAAGTGCAAATCAAACTCAATTGGTG


>TRINITY_DN47194_c0_g1_i10 from sample A7 / Example unspliced isoform:
TGCTATACGCCCCAGAAAAAGAAAATGCAGGAAGCTTACCATTTTGAGAGGTCTTAACTGACCTAGAGGAGGAAGGGACTTTGAGATTAGGGTTTCTGTGCCAATTCTAAGTGGAGGAGAGGATTTTGATTCTAGTGCAATCCACACCCATCACAAGCATATGGAATTCCCTTATGTGCAGTAGCATAAATTGCAAAAAG
TTGAGATTGCCTCAAGCGAGACCTCCTTAATCCAGGGTTGAAGCCTTCCTTTAGGTAATGAATAATCATCGTCACTGTCCTCGCGAGATTACAAGCGTAGGCATAGGGTTTCAATGGAGCTCTGTTCATTTCTTTGAGAGGCAGAGTGTTGTAAACATGCATGATTTTCATAAACAATCATGATTCATTAGGCAGCACAG
GAAGCTGATAAATTATgcagagtgttgtgaacatgcatgattttcataaacaatcatgattcattaggcatcacaggaagccgataaattatgtgagtattgcataatttatattatatgatgcatatttttatgatttttttcataatttatgcataagtcttggaaaagagttattgcaaagcttctaatattttttt
gaattttacaattatgatttagtatagccttaactatatag
GTGGTCGGTAAGCTTGTTTGATGGATACGCCTAAAAGGAGACCCTTGTCACTAGAATTAAGCATTCTAGAGTCATGCGGATTGCTTGGTACATGCTCCCTCACATCAATGTATCTCTAGCGATCCACTAATAGAGAAAGAATTGGTGCATCCTCGTTCC
AAAAAAATGTGATAACAGTCCCTGGATTACCTTCATCCATATCTTGTCTCTTTGCTTGTTCATCGAGTTGAGACAGTCCTCTATTATATTCTTTTACCCTCTCAATTCGTAATAAATATAGGGTTAACATGGACCTTTTTAGAATTTCTTGTGGCTATTAGTTATTTATGTCTTAGTCTGATCATTTGTTTTCCCAATCA
AGAATTTCTCTTTGACAGTTCTTTATGAATGCAACTTTTTGATTTTACATAGTAAAATCCTCAAAAGATAGTTTCTTCTTACCTCTTCCTCTGCATTATTTCCTAACTACAAACCATCCTCATGGAAATGATTGATCATTTCAAAGGAAAAACAATGAAAGATTATTTGGTGTGGATATTTCTTTCAACGAGGATATCTT
ACCTCATCCTATGAAGTCTGTCCTAACTACGAAGGATACTAATGGAAACGTTGTACCATTTCAAGTGCAAATCAAACTCAATTGGTG