NA ----> NA

Intron 1 GCAGATCCTG ... AATGGAAAAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	20.76	229	0	60
A2	25.49	307	0	105
A3	21.65	409	0	113
A4	26.18	234	1	83
A5	28.49	241	0	96
A6	24.98	3159	4	1052
A7	25.28	2314	4	783
A8	25.88	1495	3	522
A9	24.13	2251	3	716
A10	27.01	2032	4	752

>TRINITY_DN32916_c0_g2_i2 from sample A6 / Example spliced isoform

AGAAAATGTGCGCAAGGATGATTTTACCATTCAGTATATTTATACTGACGATCGTAGCGTATACGACGGGTATATCGACACTTGTAGCGTATACAAGAAGTAGACGTAGGCGTATCTGTGTCAGTGATCCTTGTTGTCGGTTTATTAAGACGCATTGACGGCTCCCGTAGGTCCTTTTCTGGCCGATCACATGTTGCGGT
CGCAAAAGCTCTGCGGGCTTCCATCGCTGCGGAATCGGACGAGGGTCTCCTGAACAGGACGAGGGTTTCTGTGCAGTTATTGACGAAGAGGTTTTCTGTTGTTTGTTTACTGTTCTAAGCCATGAGCCTTGCATGTATAGTATGCCATGGTGTAGGGAATTCAACTGATTCATTCAGGAGCTATTCAACCTCCTCAGATT
CTGAGAGTGATGCTCGATGTGGAGCAATAGGAAATTGCTGGCTGAAAAAGACTCCTGCAGTGGCTACTAATAGCACGATGAGCTCGAAGGTGGCTCCCCAACCTGCTGTAACACCTCGTTTGTTACGTTGTCCTGCCTTGCGAAGGGATATCTTTAGGGACTGGCAATTTGAAGAGATGGCTATGGAAGGCCGTCAGTTG
CGTCGATAAAGGAAATTGTTTGTTGTTAGGTGGACTGGTCTTGCTCTAGGATGGATTTGGGTAAAATTCTGTATTCTTGTTTTCAAGCATGAATCTCTTTGTTGTATTAATGTATACCATTGCTTCTTTTTCTATAAGAAGCTTTATATCTTGGTGCGGTACTTGAAAATTGGATATAGTATACAGAAGTTAATTACCCT
TCTGAGAGTGGACTTGATTTGCTTTCAAGCAGTTTTTACTTGACTGCTCCACACATTTTGAAATCCTGTTTATCTTTTCTTTTACGAATGAAAATGTGTGTGTGGCACTCGTGCTTGTTTAACGTGCATCCTGAGTAATACAATTAGATTTGGCAAACTGGGTTAACTTTGAAGTATTAAAACAAACCAGTGTCAAATTT
CTTGCGGTGCTCTCTTCTTCAACCATATCATTTTTGTTTGTAATGTGCAATTTCTATTTTTAAAAGAGATGAAGTCGACTTTCCACGAATCGGATCTTTATAATCTTTTAAAATGTGTTTTGAACAGAAA

>TRINITY_DN32916_c0_g2_i1 from sample A6 / Example unspliced isoform:

TGCAGTTATTGACGAAGAGgcagatcctggcttttcaaaaatctggcgaatctgtattctgatccgtatctgtatcctcgtaacatagcgcttaattgtaaccttggaactcttaggaatccttcgttgtcgatctagcctaagcctgggtgcttggatcaacctttggaaagaaaaaaagacacttaaatggaaaagGT
TTTCTGTTGTTTGTTTACTGTTCTAAGCCATGAGCCTTGCATGTATAGTATGCCATGGTGTAGGGAATTCAACTGATTCATTCAGGAGCTATTCAACCTCCTCAGATTCTGAGAGTGATGCTCGATGTGGAGCAATAGGAAATTGCTGGCTGAAAAAGACTCCTGCAGTGGCTACTAATAGCACGATGAGCTCGAAGGTG
GCTCCCCAACCTGCTGTAACACCTCGTTTGTTACGTTGTCCTGCCTTGCGAAGGGATATCTTTAGGGACTGGCAATTTGAAGAGATGGCTATGGAAGGCCGTCAGTTGCGTCGATAAAGGAAATTGTTTGTTGTTAGGTGGACTGGTCTTGCTCTAGGATGGATTTGG