sp|Q501D1|Y1490_ARATH ----> Hypothetical protein At1g04090


Intron 1 GTTTGTTGAT ... TGTTTTATAG

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>TRINITY_DN111659_c0_g1_i12 from sample A4 / Example spliced isoform
GTGGGAATCCCTCCGTCAAAACTCTAACATCGTTTCTCTCGATTTCCTTCGGGATTTAACGGAGACTCTGACGTACGCAGCACGAACGAAGTAGAAAGCAACATTTATTCGAGCGGAGAGCAACCCTGGGGCATTTTAGGTGCCCTATTTGCTGTAAGTTTTCGTCGTTCTCATTAAATTCGGATCGATATTCTTCTGAT
TTCGTTGCAGTGCAGCCGTTGGATGATTGCGGAATTATTTCAGGCAACTGGTTTGCGGATGAAGCATTTTGTGGCATCCGTTGAGAAGTATTGAGCATTAGACGGCCCTGGCACAATGTTTGAAGCTCATGTTTTGCATTTGCTTCGTAGATATCTGGGAGAGTATGTGCACGGTCTTTCAACTGAGGCTTTGAAGATCA
GTGTCTGGAAAGGTGATGTGGTATTAAGAGATTTGCATCTAAAGGCTGAGGCACTGAATGCTTTGAAGTTGCCCATTACAGTGAAAGCTGGCTTCCTGGGTTCTGTGACACTTAAGGTTCCTTGGAAGAGCCTCGGAAAAGAACCAGTTATTGTTCTCATTGACCGTGTGTTTGTACTTGCAGAACCAGCACAAGATGAA
TGCTCTTTCACGGATGAAGCAAAGGAAAGGCTTTTTGAAGCAAAACGACGAAAAATTGAGGAAGCAGAGGTGGCAATGCTGGAAGCAAAAGATAAGAGGAAAACAAAAATGGAAAATTCATCAGAAACAAATTCGTGGATAGGTTCTCTAATTGCGACAGTGGTTGGAAATTTAAAAATTTCTATCAGTAATGTACATAT
ACGCTATGAGGACACAGTGAGCAACTCAGGACATCCATTTTGTTCTGGTATAACTTTGGCAAAGCTTGCTGCTGTGACAACTGATGAGCATGGTGTGGAAACTTTTGATACTAGTGGAGCATTAGACAGGCTACGCAAGTCATTGCAGCTTGAGCGTTTTGCAGTTTACCATGATTCTGATAGCGTCCCATGGAAGTTGG
ATAAGAGATTGGAAGAATTGACTGCTGATGAATGGAGCAAGATTTTTGAAGCTGGCATTCAAGAGTCAGAAAATGAGAGAAATTCAGTATCAAAATGGGCCCTAGGGCGCCAGTATTTGCTATATCCTATTAATGGAACTCTCAAGTATTATCGTTTTGGAAAGCAAGATAAGCGGGATCCAAGTGTTCCCTCTCAGAAA
ATGTCCCTCACTCTAAACGATGTGTCAGTGACAGTCTCAGAGGCTCAGTATTGTGATGGAATGAAACTATTGGAAGGAGTTTCAAGATATCGAACCCGCATTGAGGTCTCCCATTTCCGGCCATTGGTCTCCGTGTCTAAAGACACTCGAGTTTGGTGGCGTTATGCTTGTCAGGCAAGCCTACATCGGCAAAACAAAAT
GTGGCACCGTCTGTCATGGGAAAATGTTTCTCGTCTGTGTCAACATCGTAGGAAGTATGTTCGGCTTTATGCAGTGTATTTGCAACAAATACCCAGACTGGATAACAAAGAAATCAGAGAAATTGAGGAGGAGCTAGATGCAAAGGTTATCCTTCTATGGAGGCTACTTGCTCATGCCAGAGTTGAGAGTGCAAGATCAA
AGGAAATGGCCTTAGAGAGGGCACGTGCAAGGAAATCTAGTTGGTGGTCTTTTGGATGGCGGTCAACAGCATCAGACTCAAACCCATCTAATGCTTCTGAAGATTCGGAAGGGGTTACTGACATGCCACATCTAGGACAGTTGACAAAAGAGGAGTGGAAGAAGCTTAATGAACTTTTAAGCTACAATTCTGCAAAGAAC
TTCTTTCTGCTTTCTGATAAGGAGCCTCCAGACATGCTACAGTACTCCTTGGATGCTACTGTTGGGAAAAGTGCAGCTCGAATTGTAAACAACCAAAATTTGGAAATCATCTGTGGGAAGTTTGAGAGTCTTCATGTTGGTCTTAGAAGTTATCCCAAGAGCACTCATTGTGATACAAAACTGAAGTTATATGGTGTTTC
TGCTCCTGAAGGATCCCTTATACAGAGTGTCAGCAGTGAAGAGAAGGAATATGCACTTGCTGCTACATTTGTACACTCTCCTATTGGAGAAAACTTAGATTGGAAACTCTCTGCAACCGTGTCTCCTTGTCATGTCACGGTTTGGATGACAAGCTTTGAACGTTGTCTACAATTCCTGAGGAGGAGTAGTTCTGTCAGTC
CTGAGGTAGCATTGGAAACTGCAGCAGCTTTGCAGATGAAGTTGGAGAAAGTGACTCGACGAGCACAGGAACAATTTCAGCTTGTATTAAAAGAACAAAGCAGGTTTTCTCTTGACATTGATTTGGATGCTCCAATACTGAGACTTCCGTTTCAGAGAGCAGAGTGTTCTGGAAGTTGCAGTCAGCTTGTAGTAGATTTT
GGTCATTTTACATTGCGTACAGTGAACGAAGATGATGTTCATCCCCAAATACCAAGTCTTTACTCGCGGTTTCACATATCAGGAAGAGACACCGCTGCCTTTTTCATGGATGGAATCTTTGATTGGACAGAGCTTAAACATGTTTATCTAGACTCTGCACATATAATGAATAACTCTGAAGTACTTCCTAACCCAAAGAA
TCGATCTAAACTATTCCCCGTCCTTGACAAATGTGGCATGCTAGCTGTTATTGACCAGATTAAACTTCAGCACCCAAAATACCCTGCTACACGAGTTTCGATTCAAGTGCCAAACCTTGGCTTGCACTTTTCACCTTCAAGATATAGTAGGATTATGAATCTCTTAGCAATATTTGATGAGAGAGATGCGAGAAAGGATG
GATTAACTCCTGCAGATCTTGCAGGAGATGCTAGGGTTCTCTTTTGGGGGGGAATTGGTAATTCTATTGCCGAGTGGCAATCTTGTTGGCTAGTCCTTGATGGGTCTTACTTATATATCTTGGAGTCCAAAACATCTAAAACTTATCAGCGGTGCTGCAGCATGAGTGCTAGGCAAGTTATGGAGATCCCCCCAGCAAGT
GTTGGTGGATCAGAATTCACTGTTGCCATAAGCAACAGAGGCTTTGATATACAAAAGGCGTTGGAATCATCTAGCACCGTTATCCTGCAGTTCAAAGATGAAAATGCGAAGGCAGAATGGATGAAGTCTTTTGTTCATGCTACATATAAAGCATCTGCTCCTCTGTCCATGTGCATACCTGGAAATCTTAGTGGCAATGA
ATCTGAAGACGAAAGCTGTCAACCAGTGGTTGTGTCAGAAAAGATAAACTTGTCTGTTGTTGGTACTCTGGTTGAAATGAAACTTCTAATCTATGGGAAGGAAGAAGAGGAAAATGACAGAGTTGGTGAAGAAAGAATGCTTTTGGAACTATTTGCTGGTGGAGGCAAGGTGAACCTTATACAGCAGGAGAATGATTTGA
CTGTGAGGATGAAATTGCATTCCCTAAAGATAGAAGATAAGCTTCAAGGTTGTGTGTCTACAACATGCAAGTATATTGCTCGTTCTGTGCTGGAAAATGATAGTCAATATCTGGTTGAGGAGGTCGACGATAAATGTAGCACAGCATTAGTAGAAAACATTTCAGAGGAGGATGAGTTTTTTAAAGATGCATTGCCAGAT
TTTAGTTGCCCTTCTGACTATGCTTCTGTTCCCCAAAGCAACTTAAGCTCTTTCCCCTTAAAAGCAAGGGAAAATTCATCACATGACTTTGGAACCCCTGTTACAAATTCCAAATATGAACTTTTTGATTGGAATTTGGCCCTCGGAGAAGAACAAACTGAAGACGTAGATGTGTCTGATTTTGTGAGTGTTACATTTGT
TAGAAGGCAGCCCAATTCTCCCCACTATGATGGAACAGACACCCAGATGAGCATTCGCATGACAAAGCTTGATTTCTTCTGCAACAGACTTACTGTTGTTTCTTTGATTGACTTTGGCATGGAACTGAGTGAGTTAATGGAGGTCATAGATGAGAAAGCATCTCCACAGAATGATATGGCAGGTTATGCTGTTTTGCCAA
GTGAAAATAAAGAAGGCACTGATCGTTTATTTGTTAAAGGGCTATTGGGTACTGGAAAATCTAGAGTTGTGTTTCAGCTGAAGATGAATGTAGACAGTGTTTGTATTTTCCTTAACAAGGATGATGGTTCTCAGTTGGCCATGTTGGTACAAGAGAAGTTTCAGATGGATTTGAGAGTAAGTAGTTCTTGTATACTTGTA
ATTTTTACACTCCATCAAAATATCAGGATTAGTTGTTGGCTCTCTCTCCTATTCGACTTTGTATCACGTATGTTAGGTCTATTTAAT


>TRINITY_DN111659_c0_g1_i5 from sample A4 / Example unspliced isoform:
AAAGATTCTCATGGTGACTAACATTTGTTGGTTCCCTGATTGTTATATGTAGGCTACTTGCTCATGCCAGAGTTGAGAGTGCAAGATCAAAGGAAATGGCCTTAGAGAGGGCACGTGCAAGGAAATCTAGTTGGTGGTCTTTTGGATGgtttgttgatgtttgattggtgcacctagtttcaaattaatatgcacaagat
tggtcttagttatttgcgggattctttcctaataatatttcttctaatagaaatgctatgtttataaacaaaatactctgttttatagGCGGTCAACAGCATCAGACTCAAACCCATCTAATGCTTCTGAAGATTCGGAAGGGGTTACTGACATGCCACATCTAGGACAGTTGACAAAAGAGGAGTGGAAGAAGCTTAAT
GAACTTTTAAGCTACAATTCTGCAAAGAACTTCTTTCTGCTTTCTGATAAGGAGCCTCCAGACATGCTACAGTACTCCTTGGATGCTACTGTTGGGAAAAGTGCAGCTCGAATTGTAAACAACCAAAATTTGGAAATCATCTGTGGGAAGTTTGAGAGTCTTCATGTTGGTCTTAGAAGTTATCCCAAGAGCACTCATTG
TGATACAAAACTGAAGTTATATGGTGTTTCTGCTCCTGAAGGATCCCTTATACAGAGTGTCAGCAGTGAAGAGAAGGAATATGCACTTGCTGCTACATTTGTACACTCTCCTATTGGAGAAAACTTAGATTGGAAACTCTCTGCAACCGTGTCTCCTTGTCATGTCACGGTTTGGATGACAAGCTTTGAACGTTGTCTAC
AATTCCTGAGGAGGAGTAGTTCTGTCAGTCCTGAGGTAGCATTGGAAACTGCAGCAGCTTTGCAGATGAAGTTGGAGAAAGTGACTCGACGAGCACAGGAACAATTTCAGCTTGTATTAAAAGAACAAAGCAGGTTTTCTCTTGACATTGATTTGGATGCTCCAATACTGAGACTTCCGTTTCAGAGAGCAGAGTGTTCT
GGAAGTTGCAGTCAGCTTG



Intron 2 GTAAGTTTTC ... ATTATTTCAG

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A8-1000
A9100001
A10-1000



>TRINITY_DN111659_c0_g1_i2 from sample A4 / Example spliced isoform
GTGGGAATCCCTCCGTCAAAACTCTAACATCGTTTCTCTCGATTTCCTTCGGGATTTAACGGAGACTCTGACGTACGCAGCACGAACGAAGTAGAAAGCAACATTTATTCGAGCGGAGAGCAACCCTGGGGCATTTTAGGTGCCCTATTTGCTGCAACTGGTTTGCGGATGAAGCATTTTGTGGCATCCGTTGAGAAGTA
TTGAGCATTAGACGGCCCTGGCACAATGTTTGAAGCTCATGTTTTGCATTTGCTTCGTAGATATCTGGGAGAGTATGTGCACGGTCTTTCAACTGAGGCTTTGAAGATCAGTGTCTGGAAAGGTGATGTGGTATTAAGAGATTTGCATCTAAAGGCTGAGGCACTGAATGCTTTGAAGTTGCCCATTACAGTGAAAGCTG
GCTTCCTGGGTTCTGTGACACTTAAGGTTCCTTGGAAGAGCCTCGGAAAAGAACCAGTTATTGTTCTCATTGACCGTGTGTTTGTACTTGCAGAACCAGCACAAGATGAATGCTCTTTCACGGATGAAGCAAAGGAAAGGCTTTTTGAAGCAAAACGACGAAAAATTGAGGAAGCAGAGGTGGCAATGCTGGAAGCAAAA
GATAAGAGGAAAACAAAAATGGAAAATTCATCAGAAACAAATTCGTGGATAGGTTCTCTAATTGCGACAGTGGTTGGAAATTTAAAAATTTCTATCAGTAATGTACATATACGCTATGAGGACACAGTGAGCAACTCAGGACATCCATTTTGTTCTGGTATAACTTTGGCAAAGCTTGCTGCTGTGACAACTGATGAGCA
TGGTGTGGAAACTTTTGATACTAGTGGAGCATTAGACAGGCTACGCAAGTCATTGCAGCTTGAGCGTTTTGCAGTTTACCATGATTCTGATAGCGTCCCATGGAAGTTGGATAAGAGATTGGAAGAATTGACTGCTGATGAATGGAGCAAGATTTTTGAAGCTGGCATTCAAGAGTCAGAAAATGAGAGAAATTCAGTAT
CAAAATGGGCCCTAGGGCGCCAGTATTTGCTATATCCTATTAATGGAACTCTCAAGTATTATCGTTTTGGAAAGCAAGATAAGCGGGATCCAAGTGTTCCCTCTCAGAAAATGTCCCTCACTCTAAACGATGTGTCAGTGACAGTCTCAGAGGCTCAGTATTGTGATGGAATGAAACTATTGGAAGGAGTTTCAAGATAT
CGAACCCGCATTGAGGTCTCCCATTTCCGGCCATTGGTCTCCGTGTCTAAAGACACTCGAGTTTGGTGGCGTTATGCTTGTCAGGCAAGCCTACATCGGCAAAACAAAATGTGGCACCGTCTGTCATGGGAAAATGTTTCTCGTCTGTGTCAACATCGTAGGAAGTATGTTCGGCTTTATGCAGTGTATTTGCAACAAAT
ACCCAGACTGGATAACAAAGAAATCAGAGAAATTGAGGAGGAGCTAGATGCAAAGGTTATCCTTCTATGGAGGCTACTTGCTCATGCCAGAGTTGAGAGTGCAAGATCAAAGGAAATGGCCTTAGAGAGGGCACGTGCAAGGAAATCTAGTTGGTGGTCTTTTGGATGGCGGTCAACAGCATCAGACTCAAACCCATCTA
ATGCTTCTGAAGATTCGGAAGGGGTTACTGACATGCCACATCTAGGACAGTTGACAAAAGAGGAGTGGAAGAAGCTTAATGAACTTTTAAGCTACAATTCTGCAAAGAACTTCTTTCTGCTTTCTGATAAGGAGCCTCCAGACATGCTACAGTACTCCTTGGATGCTACTGTTGGGAAAAGTGCAGCTCGAATTGTAAAC
AACCAAAATTTGGAAATCATCTGTGGGAAGTTTGAGAGTCTTCATGTTGGTCTTAGAAGTTATCCCAAGAGCACTCATTGTGATACAAAACTGAAGTTATATGGTGTTTCTGCTCCTGAAGGATCCCTTATACAGAGTGTCAGCAGTGAAGAGAAGGAATATGCACTTGCTGCTACATTTGTACACTCTCCTATTGGAGA
AAACTTAGATTGGAAACTCTCTGCAACCGTGTCTCCTTGTCATGTCACGGTTTGGATGACAAGCTTTGAACGTTGTCTACAATTCCTGAGGAGGAGTAGTTCTGTCAGTCCTGAGGTAGCATTGGAAACTGCAGCAGCTTTGCAGATGAAGTTGGAGAAAGTGACTCGACGAGCACAGGAACAATTTCAGCTTGTATTAA
AAGAACAAAGCAGGTTTTCTCTTGACATTGATTTGGATGCTCCAATACTGAGACTTCCGTTTCAGAGAGCAGAGTGTTCTGGAAGTTGCAGTCAGCTTGTAGTAGATTTTGGTCATTTTACATTGCGTACAGTGAACGAAGATGATGTTCATCCCCAAATACCAAGTCTTTACTCGCGGTTTCACATATCAGGAAGAGAC
ACCGCTGCCTTTTTCATGGATGGAATCTTTGATTGGACAGAGCTTAAACATGTTTATCTAGACTCTGCACATATAATGAATAACTCTGAAGTACTTCCTAACCCAAAGAATCGATCTAAACTGTTCCCTGTCCTTGACAAATGTGGCATGCTAGCTGTTATTGACCAGATTAAACTTCAGCACCCAAAATACCCTGCTAC
ACGAGTTTCGATTCAAGTGCCAAACCTTGGCTTGCACTTTTCACCTTCAAGATATAGTAGGATTATGAATCTCTTAGCAATATTTGATGAGAGAGATGCGAGAAAGGATGGATTAACTCCTGCAGATCTTGCAGGAGATGCTAGGGTTCTCTTTTGGGGGGGAATTGGTAATTCTATTGCCGAGTGGCAATCTTGTTGGC
TAGTCCTTGATGGGTCTTACTTATATATCTTGGAGTCCAAAACATCTAAAACTTATCAGCGGTGCTGCAGCATGAGTGCTAGGCAAGTTATGGAGATCCCCCCAGCAAGTGTTGGTGGATCAGAATTCACTGTTGCCATAAGCAACAGAGGCTTTGATATACAAAAGGCGTTGGAATCATCTAGCACCGTTATCCTGCAG
TTCAAAGATGAAAATGCGAAGGCAGAATGGATGAAGTCTTTTGTTCATGCTACATATAAAGCATCTGCTCCTCTGTCCATGTGCATACCTGGAAATCTTAGTGGCAATGAATCTGAAGACGAAAGCTGTCAACCAGTGGTTGTGTCAGAAAAGATAAACTTGTCTGTTGTTGGTACTCTGGTTGAAATGAAACTTCTAAT
CTATGGGAAGGAAGAAGAGGAAAATGACAGAGTTGGTGAAGAAAGAATGCTTTTGGAACTATTTGCTGGTGGAGGCAAGGTGAACCTTATACAGCAGGAGAATGATTTGACTGTGAGGATGAAATTGCATTCCCTAAAGATAGAAGATAAGCTTCAAGGTTGTGTGTCTACAACATGCAAGTATATTGCTCGTTCTGTGC
TGGAAAATGATAGTCAATATCTGGTTGAGGAGGTCGACGATAAATGTAGCACAGCATTAGTAGAAAACATTTCAGAGGAGGATGAGTTTTTTAAAGATGCATTGCCAGATTTTAGTTGCCCTTCTGACTATGCTTCTGTTCCCCAAAGCAACTTAAGCTCTTTCCCCTTAAAAGCAAGGGAAAATTCATCACATGACTTT
GGAACCCCTGTTACAAATTCCAAATATGAACTTTTTGATTGGAATTTGGCCCTCGGAGAAGAACAAACTGAAGACGTAGATGTGTCTGATTTTGTGAGTGTTACATTTGTTAGAAGGCAGCCCAATTCTCCCCACTATGATGGAACAGACACCCAGATGAGCATTCGCATGACAAAGCTTGATTTCTTCTGCAACAGACT
TACTGTTGTTTCTTTGATTGACTTTGGCATGGAACTGAGTGAGTTAATGGAGGTCATAGATGAGAAAGCATCTCCACAGAATGATATGGCAGGTTATGCTGTTTTGCCAAGTGAAAATAAAGAAGGCACTGATCGTTTATTTGTTAAAGGGCTATTGGGTACTGGAAAATCTAGAGTTGTGTTTCAGCTGAAGATGAATG
TAGACAGTGTTTGTATTTTCCTTAACAAGGATGATGGTTCTCAGTTGGCCATGTTGGTACAAGAGAAGTTTCAGATGGATTTGAGAGTAAGTAGTTCTTGTATACTTGTAATTTTTACACTCCATCAAAATATCAGGATTAGTTGTTGGCTCTCTCTCCTATTCGACTTTGTATCACGTATGTTAGGTCTATTTAAT


>TRINITY_DN111659_c0_g1_i12 from sample A4 / Example unspliced isoform:
GTGGGAATCCCTCCGTCAAAACTCTAACATCGTTTCTCTCGATTTCCTTCGGGATTTAACGGAGACTCTGACGTACGCAGCACGAACGAAGTAGAAAGCAACATTTATTCGAGCGGAGAGCAACCCTGGGGCATTTTAGGTGCCCTATTTGCTgtaagttttcgtcgttctcattaaattcggatcgatattcttctgat
ttcgttgcagtgcagccgttggatgattgcggaattatttcagGCAACTGGTTTGCGGATGAAGCATTTTGTGGCATCCGTTGAGAAGTATTGAGCATTAGACGGCCCTGGCACAATGTTTGAAGCTCATGTTTTGCATTTGCTTCGTAGATATCTGGGAGAGTATGTGCACGGTCTTTCAACTGAGGCTTTGAAGATCA
GTGTCTGGAAAGGTGATGTGGTATTAAGAGATTTGCATCTAAAGGCTGAGGCACTGAATGCTTTGAAGTTGCCCATTACAGTGAAAGCTGGCTTCCTGGGTTCTGTGACACTTAAGGTTCCTTGGAAGAGCCTCGGAAAAGAACCAGTTATTGTTCTCATTGACCGTGTGTTTGTACTTGCAGAACCAGCACAAGATGAA
TGCTCTTTCACGGATGAAGCAAAGGAAAGGCTTTTTGAAGCAAAACGACGAAAAATTGAGGAAGCAGAGGTGGCAATGCTGGAAGCAAAAGATAAGAGGAAAACAAAAATGGAAAATTCATCAGAAACAAATTCGTGGATAGGTTCTCTAATTGCGACAGTGGTTGGAAATTTAAAAATTTCTATCAGTAATGTACATAT
ACGCTATGAGGACACAGTGAGCAACTCAGGACATCCATTTTGTTCTGGTATAACTTTGGCAAAGCTTGCTGCTGTGACAACTGATGAGCATGGTGTGGAAACTTTTGATACTAGTGGAGCATTAGACAGGCTACGCAAGTCATTGCAGCTTGAGCGTTTTGCAGTTTACCATGATTCTGATAGCGTCCCATGGAAGTTGG
ATAAGAGATTGGAAGAATTGACTGCTGATGAATGGAGCAAGATTTTTGAAGCTGGCATTCAAGAGTCAGAAAATGAGAGAAATTCAGTATCAAAATGGGCCCTAGGGCGCCAGTATTTGCTATATCCTATTAATGGAACTCTCAAGTATTATCGTTTTGGAAAGCAAGATAAGCGGGATCCAAGTGTTCCCTCTCAGAAA
ATGTCCCTCACTCTAAACGATGTGTCAGTGACAGTCTCAGAGGCTCAGTATTGTGATGGAATGAAACTATTGGAAGGAGTTTCAAGATATCGAACCCGCATTGAGGTCTCCCATTTCCGGCCATTGGTCTCCGTGTCTAAAGACACTCGAGTTTGGTGGCGTTATGCTTGTCAGGCAAGCCTACATCGGCAAAACAAAAT
GTGGCACCGTCTGTCATGGGAAAATGTTTCTCGTCTGTGTCAACATCGTAGGAAGTATGTTCGGCTTTATGCAGTGTATTTGCAACAAATACCCAGACTGGATAACAAAGAAATCAGAGAAATTGAGGAGGAGCTAGATGCAAAGGTTATCCTTCTATGGAGGCTACTTGCTCATGCCAGAGTTGAGAGTGCAAGATCAA
AGGAAATGGCCTTAGAGAGGGCACGTGCAAGGAAATCTAGTTGGTGGTCTTTTGGATGGCGGTCAACAGCATCAGACTCAAACCCATCTAATGCTTCTGAAGATTCGGAAGGGGTTACTGACATGCCACATCTAGGACAGTTGACAAAAGAGGAGTGGAAGAAGCTTAATGAACTTTTAAGCTACAATTCTGCAAAGAAC
TTCTTTCTGCTTTCTGATAAGGAGCCTCCAGACATGCTACAGTACTCCTTGGATGCTACTGTTGGGAAAAGTGCAGCTCGAATTGTAAACAACCAAAATTTGGAAATCATCTGTGGGAAGTTTGAGAGTCTTCATGTTGGTCTTAGAAGTTATCCCAAGAGCACTCATTGTGATACAAAACTGAAGTTATATGGTGTTTC
TGCTCCTGAAGGATCCCTTATACAGAGTGTCAGCAGTGAAGAGAAGGAATATGCACTTGCTGCTACATTTGTACACTCTCCTATTGGAGAAAACTTAGATTGGAAACTCTCTGCAACCGTGTCTCCTTGTCATGTCACGGTTTGGATGACAAGCTTTGAACGTTGTCTACAATTCCTGAGGAGGAGTAGTTCTGTCAGTC
CTGAGGTAGCATTGGAAACTGCAGCAGCTTTGCAGATGAAGTTGGAGAAAGTGACTCGACGAGCACAGGAACAATTTCAGCTTGTATTAAAAGAACAAAGCAGGTTTTCTCTTGACATTGATTTGGATGCTCCAATACTGAGACTTCCGTTTCAGAGAGCAGAGTGTTCTGGAAGTTGCAGTCAGCTTGTAGTAGATTTT
GGTCATTTTACATTGCGTACAGTGAACGAAGATGATGTTCATCCCCAAATACCAAGTCTTTACTCGCGGTTTCACATATCAGGAAGAGACACCGCTGCCTTTTTCATGGATGGAATCTTTGATTGGACAGAGCTTAAACATGTTTATCTAGACTCTGCACATATAATGAATAACTCTGAAGTACTTCCTAACCCAAAGAA
TCGATCTAAACTATTCCCCGTCCTTGACAAATGTGGCATGCTAGCTGTTATTGACCAGATTAAACTTCAGCACCCAAAATACCCTGCTACACGAGTTTCGATTCAAGTGCCAAACCTTGGCTTGCACTTTTCACCTTCAAGATATAGTAGGATTATGAATCTCTTAGCAATATTTGATGAGAGAGATGCGAGAAAGGATG
GATTAACTCCTGCAGATCTTGCAGGAGATGCTAGGGTTCTCTTTTGGGGGGGAATTGGTAATTCTATTGCCGAGTGGCAATCTTGTTGGCTAGTCCTTGATGGGTCTTACTTATATATCTTGGAGTCCAAAACATCTAAAACTTATCAGCGGTGCTGCAGCATGAGTGCTAGGCAAGTTATGGAGATCCCCCCAGCAAGT
GTTGGTGGATCAGAATTCACTGTTGCCATAAGCAACAGAGGCTTTGATATACAAAAGGCGTTGGAATCATCTAGCACCGTTATCCTGCAGTTCAAAGATGAAAATGCGAAGGCAGAATGGATGAAGTCTTTTGTTCATGCTACATATAAAGCATCTGCTCCTCTGTCCATGTGCATACCTGGAAATCTTAGTGGCAATGA
ATCTGAAGACGAAAGCTGTCAACCAGTGGTTGTGTCAGAAAAGATAAACTTGTCTGTTGTTGGTACTCTGGTTGAAATGAAACTTCTAATCTATGGGAAGGAAGAAGAGGAAAATGACAGAGTTGGTGAAGAAAGAATGCTTTTGGAACTATTTGCTGGTGGAGGCAAGGTGAACCTTATACAGCAGGAGAATGATTTGA
CTGTGAGGATGAAATTGCATTCCCTAAAGATAGAAGATAAGCTTCAAGGTTGTGTGTCTACAACATGCAAGTATATTGCTCGTTCTGTGCTGGAAAATGATAGTCAATATCTGGTTGAGGAGGTCGACGATAAATGTAGCACAGCATTAGTAGAAAACATTTCAGAGGAGGATGAGTTTTTTAAAGATGCATTGCCAGAT
TTTAGTTGCCCTTCTGACTATGCTTCTGTTCCCCAAAGCAACTTAAGCTCTTTCCCCTTAAAAGCAAGGGAAAATTCATCACATGACTTTGGAACCCCTGTTACAAATTCCAAATATGAACTTTTTGATTGGAATTTGGCCCTCGGAGAAGAACAAACTGAAGACGTAGATGTGTCTGATTTTGTGAGTGTTACATTTGT
TAGAAGGCAGCCCAATTCTCCCCACTATGATGGAACAGACACCCAGATGAGCATTCGCATGACAAAGCTTGATTTCTTCTGCAACAGACTTACTGTTGTTTCTTTGATTGACTTTGGCATGGAACTGAGTGAGTTAATGGAGGTCATAGATGAGAAAGCATCTCCACAGAATGATATGGCAGGTTATGCTGTTTTGCCAA
GTGAAAATAAAGAAGGCACTGATCGTTTATTTGTTAAAGGGCTATTGGGTACTGGAAAATCTAGAGTTGTGTTTCAGCTGAAGATGAATGTAGACAGTGTTTGTATTTTCCTTAACAAGGATGATGGTTCTCAGTTGGCCATGTTGGTACAAGAGAAGTTTCAGATGGATTTGAGAGTAAGTAGTTCTTGTATACTTGTA
ATTTTTACACTCCATCAAAATATCAGGATTAGTTGTTGGCTCTCTCTCCTATTCGACTTTGTATCACGTATGTTAGGTCTATTTAAT



Intron 3 GTAATTTTGA ... TTGTCTGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A125.6419010
A226.8249424
A324.4925112
A433.7530318.5
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A6-1000.5
A7-1000
A8-1000
A9-1000
A10-1000



>TRINITY_DN112086_c0_g1_i27 from sample A5 / Example spliced isoform
GCGGTGGGAATCCCTCCGTCAAAACTCTAACATCGTTTCTCTCGATTTCCTTCGGGATTTAACGGAGACTCTGACGTACGCAGCACGAACGAAGTAGAAAGCAACATTTATTCGAGCGGAGAGCAACCCTGGGGCATTTTAGGTGCCCTATTTGCTGTAAGTTTTCGTCGTTCTCATTAAATTCGGATCGATATTCTTCT
GATTTCGTTGCAGTGCAGCCGTTGGATGATTGCGGAATTATTTCAGGTTTTTTTTGAGTTATTTCGGCTCATCTTAAGGGCAACTGGTTTGCGGATGAAGCATTTTGTGGCATCCGTTGAGAAGTATTGAGCATTAGACGGCCCTGGCACAATGTTTGAAGCTCATGTTTTGCATTTGCTTCGTAGATATCTGGGAGAGT
ATGTGCACGGTCTTTCAACTGAGGCTTTGAAGATCAGTGTCTGGAAAGGTGATGTGGTATTAAGAGATTTGCATCTAAAGGCTGAGGCACTGAATGCTTTGAAGTTGCCCATTACAGTGAAAGCTGGCTTCCTGGGTTCTGTGACACTTAAGGTTCCTTGGAAGAGCCTCGGAAAAGAACCAGTTATTGTTCTCATTGAC
CGTGTGTTTGTACTTGCAGAACCAGCACAAGATGAATGCTCTTTCACGGATGAAGCAAAGGAAAGGCTTTTTGAAGCAAAACGACGAAAAATTGAGGAAGCAGAGGTGGCAATGCTGGAAGCAAAAGATAAGAGGAAAACAAAAATGGAAAATTCATCAGAAACAAATTCGTGGATAGGTTCTCTAATTGCGACAGTGGT
TGGAAATTTAAAAATTTCTATCAGTAATGTACATATACGCTATGAGGACACAGTGAGCAACTCAGGACATCCATTTTGTTCTGGTATAACTTTGGCAAAGCTTGCTGCTGTGACAACTGATGAGCATGGTGTGGAAACTTTTGATACTAGTGGAGCATTAGACAGGCTACGCAAGTCATTGCAGCTTGAGCGTTTTGCAG
TTTACCATGATTCTGATAGCGTCCCATGGAAGTTGGATAAGAGATTGGAAGAATTGACTGCTGATGAATGGAGCAAGGTTTTTTTTATCTTTCATGAATATGCTTCGATATATCTCTACTTTCTCACTGATTGGCCTTTTTATTATGTTTCTTTTCTAACATCCGGC


>TRINITY_DN112086_c0_g1_i15 from sample A5 / Example unspliced isoform:
GCGGTGGGAATCCCTCCGTCAAAACTCTAACATCGTTTCTCTCGATTTCCTTCGGGATTTAACGGAGACTCTGACGTACGCAGCACGAACGAAGTAGAAAGCAACATTTATTCGAGCGGAGAGCAACCCTGGGGCATTTTAGGTGCCCTATTTGCTGTAAGTTTTCGTCGTTCTCATTAAATTCGGATCGATATTCTTCT
GATTTCGTTGCAGTGCAGCCGTTGGATGATTGCGGAATTATTTCAGGTTTTTTTTGAGTTATTTCGGCTCATCTTAAGGgtaattttgatcagatcgctgtggtcttttggaggtggcgtttaggagatgttttgcatcgactttacttgtttcaagtcgatttttacttgaaccggtattgattttgtctgcagGCAAC
TGGTTTGCGGATGAAGCATTTTGTGGCATCCGTTGAGAAGTATTGAGCATTAGACGGCCCTGGCACAATGTTTGAAGCTCATGTTTTGCATTTGCTTCGTAGATATCTGGGAGAGTATGTGCACGGTCTTTCAACTGAGGCTTTGAAGATCAGTGTCTGGAAAGGTGATGTGGTATTAAGAGATTTGCATCTAAAGGCTG
AGGCACTGAATGCTTTGAAGTTGCCCATTACAGTGAAAGCTGGCTTCCTGGGTTCTGTGACACTTAAGGTTCCTTGGAAGAGCCTCGGAAAAGAACCAGTTATTGTTCTCATTGACCGTGTGTTTGTACTTGCAGAACCAGCACAAGATGAATGCTCTTTCACGGATGAAGCAAAGGAAAGGCTTTTTGAAGCAAAACGA
CGAAAAATTGAGGAAGCAGAGGTGGCAATGCTGGAAGCAAAAGATAAGAGGAAAACAAAAATGGAAAATTCATCAGAAACAAATTCGTGGATAGGTTCTCTAATTGCGACAGTGGTTGGAAATTTAAAAATTTCTATCAGTAATGTACATATACGCTATGAGGACACAGTGAGCAACTCAGGACATCCATTTTGTTCTGG
TATAACTTTGGCAAAGCTTGCTGCTGTGACAACTGATGAGCATGGTGTGGAAACTTTTGATACTAGTGGAGCATTAGACAGGCTACGCAAGTCATTGCAGCTTGAGCGTTTTGCAGTTTACCATGATTCTGATAGCGTCCCATGGAAGTTGGATAAGAGATTGGAAGAATTGACTGCTGATGAATGGAGCAAGGTTTTTT
TTATCTTTCATGAATATGCTTCGATATATCTCTACTTTCTCACTGATTGGCCTTTTTATTATGTTTCTTTTCTAACATCCGGC



Intron 4 GTAATGGTTC ... TTGTATGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A117.2448128
A225.2537196
A317.953286
A422.4145188
A529.4124164
A60100
A70100
A8-1000
A9-1000
A10-1000



>TRINITY_DN112086_c0_g1_i10 from sample A5 / Example spliced isoform
GCGGTGGGAATCCCTCCGTCAAAACTCTAACATCGTTTCTCTCGATTTCCTTCGGGATTTAACGGAGACTCTGACGTACGCAGCACGAACGAAGTAGAAAGCAACATTTATTCGAGCGGAGAGCAACCCTGGGGCATTTTAGGTGCCCTATTTGCTGTAAGTTTTCGTCGTTCTCATTAAATTCGGATCGATATTCTTCT
GATTTCGTTGCAGTGCAGCCGTTGGATGATTGCGGAATTATTTCAGGCAACTGGTTTGCGGATGAAGCATTTTGTGGCATCCGTTGAGAAGTATTGAGCATTAGACGGCCCTGGCACAATGTTTGAAGCTCATGTTTTGCATTTGCTTCGTAGATATCTGGGAGAGTATGTGCACGGTCTTTCAACTGAGGCTTTGAAGA
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TGGATAAGAGATTGGAAGAATTGACTGCTGATGAATGGAGCAAGATTTTTGAAGCTGGCATTCAAGAGTCAGAAAATGAGAGAAATTCAGTATCAAAATGGGCCCTAGGGCGCCAGTATTTGCTATATCCTATTAATGGAACTCTCAAGTATTATCGTTTTGGAAAGCAAGATAAGCGGGATCCAAGTGTTCCCTCTCAG
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TTCTGCTCCTGAAGGATCCCTTATACAGAGTGTCAGCAGTGAAGAGAAGGAATATGCACTTGCTGCTACATTTGTACACTCTCCTATTGGAGAAAACTTAGATTGGAAACTCTCTGCAACCGTGTCTCCTTGTCATGTCACGGTTTGGATGACAAGCTTTGAACGTTGTCTACAATTCCTGAGGAGGAGTAGTTCTGTCA
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AGTGTTGGTGGATCAGAATTCACTGTTGCCATAAGCAACAGAGGCTTTGATATACAAAAGGCGTTGGAATCATCTAGCACCGTTATCCTGCAGTTCAAAGATGAAAATGCGAAGGCAGAATGGATGAAGTCTTTTGTTCATGCTACATATAAAGCATCTGCTCCTCTGTCCATGTGCATACCTGGAAATCTTAGTGGCAA
TGAATCTGAAGACGAAAGCTGTCAACCAGTGGTTGTGTCAGAAAAGATAAACTTGTCTGTTGTTGGTACTCTGGTTGAAATGAAACTTCTAATCTATGGGAAGGAAGAAGAGGAAAATGACAGAGTTGGTGAAGAAAGAATGCTTTTGGAACTATTTGCTGGTGGAGGCAAGGTGAACCTTATACAGCAGGAGAATGATT
TGACTGTGAGGATGAAATTGCATTCCCTAAAGATAGAAGATAAGCTTCAAGGTTGTGTGTCTACAACATGCAAGTATATTGCTCGTTCTGTGCTGGAAAATGATAGTCAATATCTGGTTGAGGAGGTCGACGATAAATGTAGCACAGCATTAGTAGAAAACATTTCAGAGGAGGATGAGTTTTTTAAAGATGCATTGCCA
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TGTTAGAAGGCAGCCCAATTCTCCCCACTATGATGGAACAGACACCCAGATGAGCATTCGCATGACAAAGCTTGATTTCTTCTGCAACAGACTTACTGTTGTTTCTTTGATTGACTTTGGCATGGAACTGAGTGAGTTAATGGAGGTCATAGATGAAAAAGCATCTCCACAGAATGATATGGCAGGTTATGCTGTTTTGC
CAAGTGAAAACAAAGAAGGCACTGATCGTTTATTTGTTAAAGGGCTATTGGGTACTGGAAAATCTAGAGTTGTGTTTCAGCTGAAGATGAATGTAGACAGTGTTTGTATTTTCCTTAACAAGGATGATGGTTCTCAGTTGGCCATGTTGGTACAAGAGAAGTTTCAGATGGATTTGAGAGTTCATCCAAATTCTATTTCC
ATTGAGGGGTTGTTAGGGAACCTGAGGATCTGTGACATGTCCCTTGGTCCAGATCACTGGTGGGGATGGCTTTGTGACATACGTGACACAGGTTCTGATTCGCTTGTAAAGTGGAAGTTTCAGTCTTTCAGTAGAGATGATGATGACTTTGAAGGCCATGATTACAGTCTCATTGCAAGACTTTCAGCTGTACGGATTGT
TTTTCTGTACAGGTTCATTCAGGAGGTAACTGCCTATTTCACAGGCTTGGCAACACCCCAAGCTCAACATGCAATCCAAGTTGTTGATAAAGTTGGAGGAATGGAGTGGCTTATTCAACAATCAGAAATTGATGGATCACCTTCATTGAAACTGGATGTTTCCCTGGACACTCCTATTATTATTATGCCACAGAATTCTA
TGAGCAAAAATTTCATGCAGCTGGACCTGGGTCGTCTTCAAATGTCTAACAATTTTGAGTGGCATGGTTGTAAGGAAAATGATCCATCTGCCGTACATCTTGATGTCCTTCATGCAGAGATAATGGGCATGAATATGGTTGTTGGGATTGATGGGCGACTGGGAAAACCAATGATACAAGAAGCTTGTGGATTGCATATT
AAAGTGTGTCGTTCGCTACGGGATGTTTTCAAAAAGGTTCCCGAGGTGGCAGTTGACATACAGATCGACTTATTGCATGGAGTAATGTCTGACAAGGAATACATGGTTATCATAGATTGTGCTTCTTCAAATATATCTGAAGAGGCAGACCTTCCTCCAAATGTTAGAGATATTCCAGAAAGGCAATTGGATTGTCTACA
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GTTCACGATTGGGGGAGCTCATATATTTAAGTAATGATAGCAGTTATTGTGCCTCTGTAGAAGACGGTGTGATTTTTGATGATTTAAATGATGAAGAATGCTCTTTTGACACTGATGGAATAAGGAATAAGGGCCAACGTCCATCTCTTGTTTCAGAAGAACATGGCACCAATTTTGATGGAGCAAACAATTTCATTATT
GAAGTACAGGCTGTGGCTCCAGAACTTACATTCTATGACAGCACAAAATGGTCTTCAGAGAATATCTTGAACGGGGAAAAGTTGCTTCGGGCAAAACTGGACATCAATTTAATGTACGCTGCAAAAGAAAATGATAGATGGATCCGTGCATTTGTTAAAGGCCTTACAGTTGAAAGCGGTTCTGGTCTTGTTGTACTCGA
TCCAGTGGATATATCAGGCGAATACACCTGTGTTCAGGATAAGACTAGTTTTTCAGTTATGACAACTGATATTTATGTTCATCTTTCTCTGAGTGTTTTGCGCCTATTACTTCGGTTGCAAGATGAAACAGTTGCAGCATTGCAATTTGGAAGTGCAAATGCCTTATCCCGTTGCACCCATTTTGATAGAATTTGGATTG
ATAAAAGAGGAAATGGTTCTAATAAGCATATAGCTATTTGGAGACCTCGTCCTCCTTCAAATTATGTTATTCTTGGTGACTGTGTTACATTGGGATCTGTGCCTCCATCCCAAGCTGTGATGGCGGTCAGCAATACTTATGGCCGTGTGAAAAAACCTCTTGGCTTTCAGCTAGTTTGGTCATTCTCTAGTTTAAATCAT
CTGGGAGCAGAATCCCAAAATCCTGATGGTGATGTAGAGTGTTCAGTGTGGATGCCTATAGCGCCTATGGGATATACTGTTCTTGGTTGTGTTGCACAAATTGGCAAAGCTCGTCCATCCACTAGTATTGTTAATTGTATTCGATCTGATCTTCTAACTTCTGCTATGTTCTCTGATTGTATATACTACATTCCTCCTAA
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AGCATGGGGTAGATAGCAGACCAAGCATGCCTCGATGGGATAGAACAGCATCCATAGCAAAATTGGCTCGTTATTTGTCAACCTCACAATTTGATCTCATATGGTGGGACAAGGGCAGTGAATCTAGATCTGCAGTTTCTATTTGGCGACCTGTACCACCTCCTGGTTATGCTATTATTGGTGACAGCATTGTTGAAGGG
TTGGACCCACCGAGTTTGGGTGTAGTTCTGAGGGATGACGATTCTGGACGCCTTGAGAAGCCTGCTAAGTTTAAGAAAACACAAATACCAGGGAAGGGTCCTGAAGATGCTTTTATGTTGTTCCCTGTTGCTCCTGCTGGTTATGTATCTTTAGGTTGTATAGCTTCAAGATCAGCGACTCTACCTCCCTTAGACACAGT
GCGTTGTGTGCGTATGGACCTTGTAAACCAGGCAAATATGTCCAAGAAAGCTGTTTGGAGCATGCCAGGTCTGAAAGGATCATCTGGTTGTAGCTTATGGAGAGTTGAAAACCAGGCTAGCACATTTATTGCAATGCCTGACCTGAAAAGACCAGCAAGTCGGATGGCATATGGGCTTGCAGAGACTGGGAGACAAAAAT
TGCATGAAAACTTTAGTGGTGAAATGAAGATCGGCTGTTTATCAGTAACACTTTTGGATAATCTGCGTGGAATGGTGACACCTCTAGTGGACAATACACTAACAAATATAAATCTCGCTGCACATGGTCGACCAGAGGCATTGAATGTGGTAGTTGTCTCATCAGTAGCTGCTTCCACTTTCAATCCGGAGTTGGAAGCA
TGGGAGCCTCTAATTGAACCTTTTGACGGAATTTTCAAGTATGAAGCATATGATGCAAATTCTGATTTGCCATTGAGAGTTGGGAAACGCATTCGAATTACAGCAACAAATGTTGTAAATTTGAATATCACATCAGCAAATGTAGAAACACTTATAGGATCAATACTTGCTTGGAGAAAACAAGTAGATCATGAACAGCA
GGCCCGTATGGCAATGCAGCTTGAAAAGGATATTAATGAATATGGCAGACCTGTATTGAATCGGAATGCATCTGCTCTAGAAGTAGATGATTCTGAGAAATTAGTCATTGAAAATAGACTTGGATGTAATTTGTATATCCGACAGTACAGAGACAATTTTGAAGATATTAAGCTATTGAAGCCTGACAGTAATGTTCTTG
TGCACCTTCCACCTCCAAGGTTTCCTGACAGATTGAATGCTGTCACAGAGACAAAGGCTTCTCGATACTATGTTGCTGTTCATATTTTAGATGCAAGGGAGTTAATGTTGACTGAAGATGGAAATGGGAAAAACTTCTTTTGTGCTCTCCGTTTAGTAACCACAACGCAAACATCAGAGGATCAAAAGCCTTTTCCTCAG
AGTGCAAGGTCTAGATGTGTTAGGCCATTGATGATAGAAACAAACAATCATGTAGTTGGTTCAGTAAACTGGAATGAAGTGTTTATATTTGAAGTTCCTCATCAGGGCTTAACAAGCTTGGAGGTTGTGGTAACAAATCTTTCAGCAAAAGCAGGAAAAGGGGAGGCTGTGGGAATGGTTTCTTTTCCTATGAAAAATGA
TACGAATTATTGGCCGTCACAAACATCACTTTCAAGATTCATGCAAAATTCTTCTGCTAGAAGTGCCCATACATTTGGCTTACAGCCATTAAAGAAAAAGTGTCCAAATGATGACGGGAGTGAATGTTCAAATTGTGGATTAATATCCCTCACTACTTTCTACTTCATTGCTGAAGGAGATAAGAGCTTGAAAGGGGACT
TTGGGAATACATTTAGCAATGGTGAAATTGGTTTGATGGTTGGGGTTAGCCCAGAAGGTCCTTGGACGAGCATACGTTCTGTCTTACCTCTATCTACAATACCAAAAGAGCTGAATGGAACTTTTGGTGTTGAAGTTGTAATGCAGAAGGGTCAGAAACATGCAATTTTACGAAGTCTTTTCAGCATCGTGAATAATACA
GATATTACTCTTGAAGTCTGTGTATGCCCTCTCTCTCTTTTAAATAGCACCGATGATCAACTAAGTTCTGATACAAATAGGACAGTTGTGGAAATTGAAGAGATCTTTGAGAACCAGCGCTATAATCCACTTTCAGGATGGGGCAACAAACGGCCTGGTCTTCTCATGTCAACTGATCCAGGCCGTTGGAGTAGAAATGA
CTACTCCTACTCGTCTAAGGACTTTTTTGACTCTCCGCTGCCCTCAAATTGGGTATGGACATCAGATTGGTTTGTTGACAAATCTCAGTTTGTTGATAGTGATGGTTGGGCATATGGTTCAGATTTTCAGAGTTTAAAATGGCCCCTTTCTTCTACAAAATCATCCAGGCGATCAGCTTTTGACTTTGTAAGACGACGCC
GTTGGGTACGTACTCGGCAGCAATCATCTGAGAGTAAGGAAAGGCATACAAGGGAAGTTGTAGCTGTACTAAAACCAGGGTGCTCTGTCCCTTTGCCCTGGAGTTGTACTACAAGTGATACTGATTTCTGTGTGCAAGTCCGCCCTTCCCCTCTGTCTGCACAGATGAGATATTTATGGGGACGTGTAATTTCAACCAGA
CGATCCAGCATCTCTGCTGGAAATGATCAAAATAACCTTGAAAAGGGCCAGTCATCTACAAGAAATTCTATTCGCCAAACAAAGGGTGGGAAATTAGTTTCACCATTTCTGTTGAATCAGCTAGAGAAAACAGAAGAACTACTTATCTGTGATCTAGTATCTGGCTTGAAGCAGTCTGTCTGGCTCAGCGTGGAAACAGA
TGCTAATATTTACTCACAATTGACCAATCCAGTTTATGATTGGAAGATTTCAGTTAAGGCTCCTCTCAAGTTAGACAATAAGCTTCCTTGTAATGCAGAATATATCATTTGGGAGAAAACTAATGAAGGAGGTAAAGCGAAGACGGAACGTGGTGTTGTTTTATCTGGAAGTTGTGCACACATATATTCTGTGGATGTCT
GTAAGCCTATTTATCTGACATGGTTAGCACAAGGTGGATGGAAACCAGAAAAGGAAGTTGTCCTTCTTTCTGATCCATCATCAGATTCTCTTCCTAGTTTCTTCTGGATGGTTCATCCACAAAGCAGAAGGAGATTGCGAGTCAGCATGGAGCGTGACTTTGGAGAAACAATTGCTACAGCCAAATCAGTTCGGTTGTTT
GTACCTTACTGGGTTTGCAATGATGCTGCCTTGCCATTAGCATATCGTTTAGTTGAGATTGAGCCTTCACACAGTTCCGAGACAGATTCTTTCTTGCTTTCAAGGGCCATTAAAGATGCCAAGCAGGCTTCAAATCATCCCTCAAATAGAATACAGAAGAGTAAAGCGAGTGTACATAAAGTTGTTCAAACTCTTGAAGT
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CTCACACTTTATTTGTTAACAGGGTTGGACGCCGGCTATTATTGCAGCAACATGGCAGTGCACAACTAGAATGGATTTATCCGACAGATCCTCCAAAAGTTCTCTTATGGCAATCTACTTTTGGAAGTGAACTTTTAAAGATCTGTGTTGATGGATACAAGTGGAGTCAGCCTTTCAGTGTTAATAGTGAAGGAATAATG
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TCAGACAGGCTCTGCTACATCATTTGCCTGGGAGGACCTTAATAGAGAACAGTTATTAGAAGTTTTGGTGGATGGAGCTGATCCCAAAAAATCTTCTAAATATAATATTGATGAAATAGCTGAGCATCAACCTGTTCCCTCTAAAACTGGGCCTGTGACACCTCTTCGTTTAACAGTTTATAAGGAAGGCAACACCAATG
TGGTAAAAGTGGCAGACTGGATGCCAAGCAATGAAGAATTGGCAATTGTGCCTGTTGGATTGTTGGAATCCTCTCCATGTGAACATACACTGTCAGCTGCGGGATCTGACAATCAATTTCATGTTATTGTTGAGCTTGCAGAGTTTGGGCTGTCTGTCGTGGATCATACTCCAGAGGAACTACTCTACTTGTCCATTCAA
AATCTCATCATGTCATATGGCACTGGTCTGGGTTCAGGAACTAGCCGGTTCAAATTACGTTTGGATGGGCTTCAAGTTGATAATCAGATACTTTTAACACCAATGCCTGTTCTATTTAGACCACAAATTGCCACTAACCAGCTTGAATTTCTGCTAAAGCTTACACTGACGATGCAAGATCGTGGATCACCGGATAATTA
CGTGTATTCTTATCTTGGTATACAGGTTCCAAGCTCTCCAAATGTTGTGCTAATGGTTAAAATTCATGAACCAATTATTTGGCGACTTCATGAGATGTTCCAAAAAAATGAACCTTGGCAGACTAACCACAAGTCAGACAACTGATGTTGCAATTGATCCTATTATACGAATCGGATTTCTGAATATCTCGGAGATCCGA
TTTAAAGTATCATTGGCTATGTTACCAACACAAAGACCAAGAGGAGTTCTTGGCTTCTGGTCATCTTTGATGATTGCATTGGGTAACACTGAGAACATGCCGGTTCGCATTACACCTCGCATACATGAGGATATTTGCATGCGCCAGAGCGCATTAATTGCTGCAGCAATTTCAAATATCCGTAAAGATCTTCTTAGTCA
GCCACTGCAATTGCTATATGGTGTTGATATTCTTGGAAATGCAAGCAGTGCGCTTGGACACATGAGCAAAGGTGTTGCAGCACTGTCAATGGATAAGAAATTTATACAAAGTCGCCAAAGACAGGAGAAAAAAGGCAACATAGAAGACATTGGTGATGTTATTCGGGAAGGTGGAGGGGCTTTTGCAAAAGGACTGTTTC
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CAGCTACTACGTCACAGGCTTCCTCGGGCAATTAACGGAGACCATGTTCTCAGACCTTATGATGAATATCGAGCTGAAGGCCAGGTTCTCCTACAACTTGCTGAGTGTGGTGCCTCATTTGGTCAAATAGACATTTTCAAAGTCCGTGGCAAGTTTGCCTTCTCAGATGTATATGAAGATCATTTTAACTTACCAAAGGG
AAGAACTGTTATGATCACCAATCATCGAGTAATGCTGCTACAACATCCAACACAAACGAGTGTCCAGAGAAAAATAGATCCATTAAGAGAGCCTTGTACAGTATTATGGGATGTAACATGGAATGATCTCTCAAAAGTAGAACCAAGGCGTGGGAAAAAGGACCCTCCAGGTTCCTCACCTTCGCAGTTGGTCGTTCACT
TACGTACTTCACCTCAAGACTCTAGAATATTTGAATCCAAGGAAACAACTCATGTGATCAAATGCCATTGTGAATCTCGACAGGCAGAAGAAATATTTTCTGCCATTCAGCAAGCTATGATTACTTATGGGTCCGATCGTTCAGTGGTTCAATATCAGGGACAGGAGAAGAAAATGGTAAGAAAACCATATGCTGGTGTG
GGAGCTGGTGCAGGGGCTGGAGCAACACTTGGAATGTTCACTGGATTTACAGCACCAATGGCCATTCCTGGCATGGCAACCTTTGCTTCTCTTTTAGGTACTACTGCAGGACAATCTATGGTTGACAGAGATACGGACTCACTTTCATACAGTGATTCAAAACGTTTGCAACGTAAAGACACAGAGCATGCATTAGCTGT
ATCAAGCTCTACATATGGTACCTTTGCCAGTGGAAAGTTTATAAACAAACTAACTCTTGTATGGTCTGACCAGAGAACACGTTGGAATAAGAATCATCACGTTTCAGTATGGCGTGCAATCTGTCCAAATGGATACATTTCAGTGGGAGATATTGTTTGCCGCTCTTCTGATCCGCCTACTAGTGTTATGGTGTACGCAA
ACAAATCTGATGGAAAATTTTTGCAGCCTTCAGGGTTTGATTTGGTATGGCGAAGTACAGATAGTGGCACAAGGGACCCGTTAACAATCTGGACACCTCGTGCCCCACCAGGTTATGTAGCTATCGGTTGTGTCATTGTTCCAGACTACTATGAGCCTGACCCAGGTGTGGTGTATTGTGTACGGAAAGATTGTGTGAAG
AATGTAGATTTTGAAAAGCAGCCTATATTAAGAGATCACAGAGATGCAGACCTTTGGAAATGTAGTCTTTGGCGAGTCCAAAATGATGCACACACTTTCATTGCTTGCCGGGACCACCAGCCACCTTCACTGAGCATTGCCTTTTCTGTACGGACATAATGTCTGAAACACATTAGTGGAAATTGGAATGTCTTGTAATT
TTCTGCTGAATTTTCCATATAGGCAGCTACAGAGGCACCTCTCAAGAAAGGTGCCATTGCTCAGAATGATACTCAAATGCTCAAGTTGGTCAGAGAATCTGTGTCAAATACAATTAATTTATGCAGGCATCTGATTTTTACCCCGAGTTCATCTTGTATCGTAAGTTTCTTGCACGGTGGTGAGGAGAATTTTGTATGAG
TTATTATGGAAGCCCAATTGGGCAGCTTCAATCAAAATGGTAGCTTGTTAATAATGCATTTGTATTAGTCATTTTCTCTTTGACAGGTGCACTGAGTTCTATGGTCC


>TRINITY_DN112086_c0_g1_i8 from sample A5 / Example unspliced isoform:
GCGGTGGGAATCCCTCCGTCAAAACTCTAACATCGTTTCTCTCGATTTCCTTCGGGATTTAACGGAGACTCTGACGTACGCAGCACGAACGAAGTAGAAAGCAACATTTATTCGAGCGGAGAGCAACCCTGGGGCATTTTAGGTGCCCTATTTGCTGTAAGTTTTCGTCGTTCTCATTAAATTCGGATCGATATTCTTCT
GATTTCGTTGCAGTGCAGCCGTTGGATGATTGCGGAATTATTTCAGGCAACTGGTTTGCGGATGAAGCATTTTGTGGCATCCGTTGAGAAGTATTGAGCATTAGACGGCCCTGGCACAATGTTTGAAGCTCATGTTTTGCATTTGCTTCGTAGATATCTGGGAGAGTATGTGCACGGTCTTTCAACTGAGGCTTTGAAGA
TCAGTGTCTGGAAAGGTGATGTGGTATTAAGAGATTTGCATCTAAAGGCTGAGGCACTGAATGCTTTGAAGTTGCCCATTACAGTGAAAGCTGGCTTCCTGGGTTCTGTGACACTTAAGGTTCCTTGGAAGAGCCTCGGAAAAGAACCAGTTATTGTTCTCATTGACCGTGTGTTTGTACTTGCAGAACCAGCACAAGAT
GAATGCTCTTTCACGGATGAAGCAAAGGAAAGGCTTTTTGAAGCAAAACGACGAAAAATTGAGGAAGCAGAGGTGGCAATGCTGGAAGCAAAAGATAAGAGGAAAACAAAAATGGAAAATTCATCAGAAACAAATTCGTGGATAGGTTCTCTAATTGCGACAGTGGTTGGAAATTTAAAAATTTCTATCAGTAATGTACA
TATACGCTATGAGGACACAGTGAGCAACTCAGGACATCCATTTTGTTCTGGTATAACTTTGGCAAAGCTTGCTGCTGTGACAACTGATGAGCATGGTGTGGAAACTTTTGATACTAGTGGAGCATTAGACAGGCTACGCAAGTCATTGCAGCTTGAGCGTTTTGCAGTTTACCATGATTCTGATAGCGTCCCATGGAAGT
TGGATAAGAGATTGGAAGAATTGACTGCTGATGAATGGAGCAAGATTTTTGAAGCTGGCATTCAAGAGTCAGAAAATGAGAGAAATTCAGTATCAAAATGGGCCCTAGGGCGCCAGTATTTGCTATATCCTATTAATGGAACTCTCAAGTATTATCGTTTTGGAAAGCAAGATAAGCGGGATCCAAGTGTTCCCTCTCAG
AAAATGTCCCTCACTCTAAACGATGTGTCAGTGACAGTCTCAGAGgtaatggttcttattctgatatctgttggcctctcccatatatatttgtaggtagtttcttagtatctaatttccgcaatctttctgaggatttctcttaattgtttatatatattagagttgatgaatatatccacttgatcacatctgaagct
gtgtggaactggacatacaactccctcctgcttgattttctgtgcttgctgttttcttgtcccatattagtattcttgtatgcagGCTCAGTATTGTGATGGAATGAAACTATTGGAAGGAGTTTCAAGATATCGAACCCGCATTGAGGTCTCCCATTTCCGGCCATTGGTCTCCGTGTCTAAAGACACTCGAGTTTGGT
GGCGTTATGCTTGTCAGGCAAGCCTACATCGGCAAAACAAAATGTGGCACCGTCTGTCATGGGAAAATGTTTCTCGTCTGTGTCAACATCGTAGGAAGTATGTTCGGCTTTATGCAGTGTATTTGCAACAAATACCCAGACTGGATAACAAAGAAATCAGAGAAATTGAGGAGGAGCTAGATGCAAAGGTTATCCTTCTA
TGGAGGCTACTTGCTCATGCCAGAGTTGAGAGTGCAAGATCAAAGGAAATGGCCTTAGAGAGGGCACGTGCAAGGAAATCTAGTTGGTGGTCTTTTGGATGGCGGTCAACAGCATCAGACTCAAACCCATCTAATGCTTCTGAAGATTCGGAAGGGGTTACTGACATGCCACATCTAGGACAGTTGACAAAAGAGGAGTG
GAAGAAGCTTAATGAACTTTTAAGCTACAATTCTGCAAAGAACTTCTTTGTGCTTTCTGATAAGGAGCCTCCAGACATGCTACAGTACTCCTTGGATGCTACTGTTGGGAAAAGTGCAGCTCGAATTGTAAACAACCAAAATTTGGAAATCATCTGTGGGAAGTTTGAGAGTCTTCATGTTGGTCTTAGAAGTTATCCCA
AGAGCACTCATTGTGATACAAAACTGAAGTTATATGGTGTTTCTGCTCCTGAAGGATCCCTTATACAGAGTGTCAGCAGTGAAGAGAAGGAATATGCACTTGCTGCTACATTTGTACACTCTCCTATTGGAGAAAACTTAGATTGGAAACTCTCTGCAACCGTGTCTCCTTGTCATGTCACGGTTTGGATGACAAGCTTT
GAACGTTGTCTACAATTCCTGAGGAGGAGTAGTTCTGTCAGTCCTGAGGTAGCATTGGAAACTGCAGCAGCTTTGCAGATGAAGTTGGAGAAAGTGACTCGACGAGCACAGGAACAATTTCAGCTTGTATTAAAAGAACAAAGCAGGTTTTCTCTTGACATTGATTTGGATGCTCCAATACTGAGACTTCCGTTTCAGAG
AGCAGAGTGTTCTGGAAGTTGCAGTCAGCTTGTAGTAGATTTTGGTCATTTTACATTGCGTACAGTGAACGAAGATGATGTTCATCCCCAAATACCAAGTCTTTACTCGCGGTTTCACATATCAGGAAGAGACACCGCTGCCTTTTTCATGGATGGAATCTTTGATTGGACAGAGCTTAAACATGTTTATCTAGACTCTG
CACATATAATGAATAACTCTGAAGTACTTCCTAACCCAAAGAATCGATCTAAACTATTCCCCGTCCTTGACAAATGTGGCATGCTAGCTGTTATTGACCAGATTAAACTTCAGCACCCAAAATACCCTGCTACACGAGTTTCGATTCAAGTGCCAAACCTTGGCTTGCACTTTTCACCTTCAAGATATAGTAGGATTATG
AATCTCTTAGCAATATTTGATGAGAGAGATGCGAGAAAGGATGGATTAACTCCTGCAGATCTTGCAGGAGATGCTAGGGTTCTCTTTTGGGGGGGAATTGGTAATTCTATTGCCGAGTGGCAATCTTGTTGGCTAGTCCTTGATGGGTCTTACTTATATATCTTGGAGTCCAAAACATCTAAAACTTATCAGCGGTGCTG
CAGCATGAGTGCTAGGCAAGTTATGGAGATCCCCCCAGCAAGTGTTGGTGGATCAGAATTCACTGTTGCCATAAGCAACAGAGGCTTTGATATACAAAAGGCGTTGGAATCATCTAGCACCGTTATCCTGCAGTTCAAAGATGAAAATGCGAAGGCAGAATGGATGAAGTCTTTTGTTCATGCTACATATAAAGCATCTG
CTCCTCTGTCCATGTGCATACCTGGAAATCTTAGTGGCAATGAATCTGAAGACGAAAGCTGTCAACCAGTGGTTGTGTCAGAAAAGATAAACTTGTCTGTTGTTGGTACTCTGGTTGAAATGAAACTTCTAATCTATGGGAAGGAAGAAGAGGAAAATGACAGAGTTGGTGAAGAAAGAATGCTTTTGGAACTATTTGCT
GGTGGAGGCAAGGTGAACCTTATACAGCAGGAGAATGATTTGACTGTGAGGATGAAATTGCATTCCCTAAAGATAGAAGATAAGCTTCAAGGTTGTGTGTCTACAACATGCAAGTATATTGCTCGTTCTGTGCTGGAAAATGATAGTCAATATCTGGTTGAGGAGGTCGACGATAAATGTAGCACAGCATTAGTAGAAAA
CATTTCAGAGGAGGATGAGTTTTTTAAAGATGCATTGCCAGATTTTAGTTGCCCTTCTGACTATGCTTCTGTTCCCCAAAGCAACTTAAGCTCCTTCCCCTTAAAAGCAAGGGAAAATTCATCACATGACTTTGGAACCCCTGTTACAAATTCCAAATATGAACTTTTTGATTGGAATTTGGCCCTCGGAGAAGAACAAA
CTGAAGACGTAGATGTGTCTGATTTTGTGAGTGTTACATTTGTTAGAAGGCAGCCCAATTCTCCCCACTATGATGGAACAGACACCCAGATGAGCATTCGCATGACAAAGCTTGATTTCTTCTGCAACAGACTTACTGTTGTTTCTTTGATTGACTTTGGCATGGAACTGAGTGAGTTAATGGAGGTCATAGATGAAAAA
GCATCTCCACAGAATGATATGGCAGGTTATGCTGTTTTGCCAAGTGAAAACAAAGAAGGCACTGATCGTTTATTTGTTAAAGGGCTATTGGGTACTGGAAAATCTAGAGTTGTGTTTCAGCTGAAGATGAATGTAGACAGTGTTTGTATTTTCCTTAACAAGGATGATGGTTCTCAGTTGGCCATGTTGGTACAAGAGAA
GTTTCAGATGGATTTGAGAGTTCATCCAAATTCTATTTCCATTGAGGGGTTGTTAGGGAACCTGAGGATCTGTGACATGTCCCTTGGTCCAGATCACTGGTGGGGATGGCTTTGTGACATACGTGACACAGGTTCTGATTCGCTTGTAAAGTGGAAGTTTCAGTCTTTCAGTAGAGATGATGATGACTTTGAAGGCCATG
ATTACAGTCTCATTGCAAGACTTTCAGCTGTACGGATTGTTTTTCTGTACAGGTTCATTCAGGAGGTAACTGCCTATTTCACAGGCTTGGCAACACCCCAAGCTCAACATGCAATCCAAGTTGTTGATAAAGTTGGAGGAATGGAGTGGCTTATTCAACAATCAGAAATTGATGGATCACCTTCATTGAAACTGGATGTT
TCCCTGGACACTCCTATTATTATTATGCCACAGAATTCTATGAGCAAAAATTTCATGCAGCTGGACCTGGGTCGTCTTCAAATGTCTAACAATTTTGAGTGGCATGGTTGTAAGGAAAATGATCCATCTGCCGTACATCTTGATGTCCTTCATGCAGAGATAATGGGCATGAATATGGTTGTTGGGATTGATGGGCGACT
GGGAAAACCAATGATACAAGAAGCTTGTGGATTGCATATTAAAGTGTGTCGTTCGCTACGGGATGTTTTCAAAAAGGTTCCCGAGGTGGCAGTTGACATACAGATCGACTTATTGCATGGAGTAATGTCTGACAAGGAATACATGGTTATCATAGATTGTGCTTCTTCAAATATATCTGAAGAGGCAGACCTTCCTCCAA
ATGTTAGAGATATTCCAGAAAGGCAATTGGATTGTCTACAAGTTGAAAATGAACAGGGAATATCCAATCAAAATATTCTCTCTCACGAGGATCAGATGAGCAGCCAAGATGGTTCATCCTATACACTAACACTAGTGACAGTTGAAATTCAATTTGCTTCATTAAAGTTATATAATGGAATTGATCGAGAGTCTCCTCTT
GCTAGAATGGATCTACAAGGGCTTTGGATTGCGTATAGAAGGTCCTCAATCTCAGAACTAGATCTCTATGTCACATTATCGAAATTGTCAGTTCTGGATCTGCGACCAAGTACGAAGCCTGAGATGCGCCGAATGCTTGGATCTATGACAGATGTTGATGGTGATGCACTTCATAATGAGTCAGGGGGACCAACAAAGTC
AGACATTCCTAAACTAACCATGTTAGTGATGGATTGGAGAGTCAAGACAGATTCCCAAGCATTTGTGGTTCGGATGCAGCAACCACGGCTGCTTGTTGTTCTGGACTTTTTGCTTGCTGTAGGTGAATATTTTGTGCCTGCACTGGGTGTAATTACTGGGCGAGAGGAAGCAATGGACATGCAAAATGATCCAGTAACCA
TGCATGGTCATGTTCGCCTAAATGCATCTCTCTATGAGCAGAAAGAAGACATCGTATTTTTATCTCCACATCGACAACTAATTGTAGATGCCTATGATGTAGATGAGTTTACATATGATGGATGTGGGAATACAATCTGTTTGATTGGAAAGGATAACTTGTCTTCGCCTAGCTTGCAGCCCCTTGTCATAATTGGATAT
GGGAAAAGGCTTCGTTTCAAGAATATAAGAATTAAGAATGGTTCACGATTGGGGGAGCTCATATATTTAAGTAATGATAGCAGTTATTGTGCCTCTGTAGAAGACGGTGTGATTTTTGATGATTTAAATGATGAAGAATGCTCTTTTGACACTGATGGAATAAGGAATAAGGGCCAACGTCCATCTCTTGTTTCAGAAGA
ACATGGCACCAATTTTGATGGAGCAAACAATTTCATTATTGAAGTACAGGCTGTGGCTCCAGAACTTACATTCTATGACAGCACAAAATGGTCTTCAGAGAATATCTTGAACGGGGAAAAGTTGCTTCGGGCAAAACTGGACATCAATTTAATGTACGCTGCAAAAGAAAATGATAGATGGATCCGTGCATTTGTTAAAG
GCCTTACAGTTGAAAGCGGTTCTGGTCTTGTTGTACTCGATCCAGTGGATATATCAGGCGAATACACCTGTGTTCAGGATAAGACTAGTTTTTCAGTTATGACAACTGATATTTATGTTCATCTTTCTCTGAGTGTTTTGCGCCTATTACTTCGGTTGCAAGATGAAACAGTTGCAGCATTGCAATTTGGAAGTGCAAAT
GCCTTATCCCGTTGCACCCATTTTGATAGAATTTGGATTGATAAAAGAGGAAATGGTTCTAATAAGCATATAGCTATTTGGAGACCTCGTCCTCCTTCAAATTATGTTATTCTTGGTGACTGTGTTACATTGGGATCTGTGCCTCCATCCCAAGCTGTGATGGCGGTCAGCAATACTTATGGCCGTGTGAAAAAACCTCT
TGGCTTTCAGCTAGTTTGGTCATTCTCTAGTTTAAATCATCTGGGAGCAGAATCCCAAAATCCTGATGGTGATGTAGAGTGTTCAGTGTGGATGCCTATAGCGCCTATGGGATATACTGTTCTTGGTTGTGTTGCACAAATTGGCAAAGCTCGTCCATCCACTAGTATTGTTAATTGTATTCGATCTGATCTTCTAACTT
CTGCTATGTTCTCTGATTGTATATACTACATTCCTCCTAATTCAAGGGACCAAGATGGCTTCAGTATTTGGTGTATAGAAAATGCTGTTGGCTCTTTTCTTGCACACACATCTGTTGAACCTCCTCCAAAATCTGTGGTCTGTGATCTGCGTGAGATGCTGAACAGAAATTTTACTAACTCTGATTTGCACGAGGAAACA
TCAAATTCTGAAATGAATGCAAAATCTGATGTTGGAAGCAAGCATGGGGTAGATAGCAGACCAAGCATGCCTCGATGGGATAGAACAGCATCCATAGCAAAATTGGCTCGTTATTTGTCAACCTCACAATTTGATCTCATATGGTGGGACAAGGGCAGTGAATCTAGATCTGCAGTTTCTATTTGGCGACCTGTACCACC
TCCTGGTTATGCTATTATTGGTGACAGCATTGTTGAAGGGTTGGACCCACCGAGTTTGGGTGTAGTTCTGAGGGATGACGATTCTGGACGCCTTGAGAAGCCTGCTAAGTTTAAGAAAACACAAATACCAGGGAAGGGTCCTGAAGATGCTTTTATGTTGTTCCCTGTTGCTCCTGCTGGTTATGTATCTTTAGGTTGTA
TAGCTTCAAGATCAGCGACTCTACCTCCCTTAGACACAGTGCGTTGTGTGCGTATGGACCTTGTAAACCAGGCAAATATGTCCAAGAAAGCTGTTTGGAGCATGCCAGGTCTGAAAGGATCATCTGGTTGTAGCTTATGGAGAGTTGAAAACCAGGCTAGCACATTTATTGCAATGCCTGACCTGAAAAGACCAGCAAGT
CGGATGGCATATGGGCTTGCAGAGACTGGGAGACAAAAATTGCATGAAAACTTTAGTGGTGAAATGAAGATCGGCTGTTTATCAGTAACACTTTTGGATAATCTGCGTGGAATGGTGACACCTCTAGTGGACAATACACTAACAAATATAAATCTCGCTGCACATGGTCGACCAGAGGCATTGAATGTGGTAGTTGTCTC
ATCAGTAGCTGCTTCCACTTTCAATCCGGAGTTGGAAGCATGGGAGCCTCTAATTGAACCTTTTGACGGAATTTTCAAGTATGAAGCATATGATGCAAATTCTGATTTGCCATTGAGAGTTGGGAAACGCATTCGAATTACAGCAACAAATGTTGTAAATTTGAATATCACATCAGCAAATGTAGAAACACTTATAGGAT
CAATACTTGCTTGGAGAAAACAAGTAGATCATGAACAGCAGGCCCGTATGGCAATGCAGCTTGAAAAGGATATTAATGAATATGGCAGACCTGTATTGAATCGGAATGCATCTGCTCTAGAAGTAGATGATTCTGAGAAATTAGTCATTGAAAATAGACTTGGATGTAATTTGTATATCCGACAGTACAGAGACAATTTT
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CACAACGCAAACATCAGAGGATCAAAAGCCTTTTCCTCAGAGTGCAAGGTCTAGATGTGTTAGGCCATTGATGATAGAAACAAACAATCATGTAGTTGGTTCAGTAAACTGGAATGAAGTGTTTATATTTGAAGTTCCTCATCAGGGCTTAACAAGCTTGGAGGTTGTGGTAACAAATCTTTCAGCAAAAGCAGGAAAAG
GGGAGGCTGTGGGAATGGTTTCTTTTCCTATGAAAAATGATACGAATTATTGGCCGTCACAAACATCACTTTCAAGATTCATGCAAAATTCTTCTGCTAGAAGTGCCCATACATTTGGCTTACAGCCATTAAAGAAAAAGTGTCCAAATGATGACGGGAGTGAATGTTCAAATTGTGGATTAATATCCCTCACTACTTTC
TACTTCATTGCTGAAGGAGATAAGAGCTTGAAAGGGGACTTTGGGAATACATTTAGCAATGGTGAAATTGGTTTGATGGTTGGGGTTAGCCCAGAAGGTCCTTGGACGAGCATACGTTCTGTCTTACCTCTATCTACAATACCAAAAGAGCTGAATGGAACTTTTGGTGTTGAAGTTGTAATGCAGAAGGGTCAGAAACA
TGCAATTTTACGAAGTCTTTTCAGCATCGTGAATAATACAGATATTACTCTTGAAGTCTGTGTATGCCCTCTCTCTCTTTTAAATAGCACCGATGATCAACTAAGTTCTGATACAAATAGGACAGTTGTGGAAATTGAAGAGATCTTTGAGAACCAGCGCTATAATCCACTTTCAGGATGGGGCAACAAACGGCCTGGTC
TTCTCATGTCAACTGATCCAGGCCGTTGGAGTAGAAATGACTACTCCTACTCGTCTAAGGACTTTTTTGACTCTCCGCTGCCCTCAAATTGGGTATGGACATCAGATTGGTTTGTTGACAAATCTCAGTTTGTTGATAGTGATGGTTGGGCATATGGTTCAGATTTTCAGAGTTTAAAATGGCCCCTTTCTTCTACAAAA
TCATCCAGGCGATCAGCTTTTGACTTTGTAAGACGACGCCGTTGGGTACGTACTCGGCAGCAATCATCTGAGAGTAAGGAAAGGCATACAAGGGAAGTTGTAGCTGTACTAAAACCAGGGTGCTCTGTCCCTTTGCCCTGGAGTTGTACTACAAGTGATACTGATTTCTGTGTGCAAGTCCGCCCTTCCCCTCTGTCTGC
ACAGATGAGATATTTATGGGGACGTGTAATTTCAACCAGACGATCCAGCATCTCTGCTGGAAATGATCAAAATAACCTTGAAAAGGGCCAGTCATCTACAAGAAATTCTATTCGCCAAACAAAGGGTGGGAAATTAGTTTCACCATTTCTGTTGAATCAGCTAGAGAAAACAGAAGAACTACTTATCTGTGATCTAGTAT
CTGGCTTGAAGCAGTCTGTCTGGCTCAGCGTGGAAACAGATGCTAATATTTACTCACAATTGACCAATCCAGTTTATGATTGGAAGATTTCAGTTAAGGCTCCTCTCAAGTTAGACAATAAGCTTCCTTGTAATGCAGAATATATCATTTGGGAGAAAACTAATGAAGGAGGTAAAGCGAAGACGGAACGTGGTGTTGTT
TTATCTGGAAGTTGTGCACACATATATTCTGTGGATGTCTGTAAGCCTATTTATCTGACATGGTTAGCACAAGGTGGATGGAAACCAGAAAAGGAAGTTGTCCTTCTTTCTGATCCATCATCAGATTCTCTTCCTAGTTTCTTCTGGATGGTTCATCCACAAAGCAGAAGGAGATTGCGAGTCAGCATGGAGCGTGACTT
TGGAGAAACAATTGCTACAGCCAAATCAGTTCGGTTGTTTGTACCTTACTGGGTTTGCAATGATGCTGCCTTGCCATTAGCATATCGTTTAGTTGAGATTGAGCCTTCACACAGTTCCGAGACAGATTCTTTCTTGCTTTCAAGGGCCATTAAAGATGCCAAGCAGGCTTCAAATCATCCCTCAAATAGAATACAGAAGA
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>TRINITY_DN112086_c0_g1_i1 from sample A5 / Example spliced isoform
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TACTGGGCGAGAGGAAGCAATGGACATGCAAAATGATCCAGTAACCATGCATGGTCATGTTCGCCTAAATGCATCTCTCTATGAGCAGAAAGAAGACATCGTATTTTTATCTCCACATCGACAACTAATTGTAGATGCCTATGATGTAGATGAGTTTACATATGATGGATGTGGGAATACAATCTGTTTGATTGGAAAGG
ATAACTTGTCTTCGCCTAGCTTGCAGCCCCTTGTCATAATTGGATATGGGAAAAGGCTTCGTTTCAAGAATATAAGAATTAAGAATGGTTCACGATTGGGGGAGCTCATATATTTAAGTAATGATAGCAGTTATTGTGCCTCTGTAGAAGACGGTGTGATTTTTGATGATTTAAATGATGAAGAATGCTCTTTTGACACT
GATGGAATAAGGAATAAGGGCCAACGTCCATCTCTTGTTTCAGAAGAACATGGCACCAATTTTGATGGAGCAAACAATTTCATTATTGAAGTACAGGCTGTGGCTCCAGAACTTACATTCTATGACAGCACAAAATGGTCTTCAGAGAATATCTTGAACGGGGAAAAGTTGCTTCGGGCAAAACTGGACATCAATTTAAT
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AGATGCTGAACAGAAATTTTACTAACTCTGATTTGCACGAGGAAACATCAAATTCTGAAATGAATGCAAAATCTGATGTTGGAAGCAAGCATGGGGTAGATAGCAGACCAAGCATGCCTCGATGGGATAGAACAGCATCCATAGCAAAATTGGCTCGTTATTTGTCAACCTCACAATTTGATCTCATATGGTGGGACAAG
GGCAGTGAATCTAGATCTGCAGTTTCTATTTGGCGACCTGTACCACCTCCTGGTTATGCTATTATTGGTGACAGCATTGTTGAAGGGTTGGACCCACCGAGTTTGGGTGTAGTTCTGAGGGATGACGATTCTGGACGCCTTGAGAAGCCTGCTAAGTTTAAGAAAACACAAATACCAGGGAAGGGTCCTGAAGATGCTTT
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CAC


>TRINITY_DN112086_c0_g1_i5 from sample A5 / Example unspliced isoform:
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Intron 6 GTTTTTTTTG ... TTGTCTGCAG

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>TRINITY_DN112086_c0_g1_i1 from sample A5 / Example spliced isoform
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GTCCTGAGGTAGCATTGGAAACTGCAGCAGCTTTGCAGATGAAGTTGGAGAAAGTGACTCGACGAGCACAGGAACAATTTCAGCTTGTATTAAAAGAACAAAGCAGGTTTTCTCTTGACATTGATTTGGATGCTCCAATACTGAGACTTCCGTTTCAGAGAGCAGAGTGTTCTGGAAGTTGCAGTCAGCTTGTAGTAGAT
TTTGGTCATTTTACATTGCGTACAGTGAACGTCAGTATCATGTTCATCAATAAATAGATGTACTGTTTTGCGGTTTTGGAATTGTCTATTTACTCCAATATGTTTACTTTCCTGCAGGAAGATGATGTTCATCCCCAAATACCAAGTCTTTACTCGCGGTTTCACATATCAGGAAGAGACACCGCTGCCTTTTTCATGGA
TGGAATCTTTGATTGGACAGAGCTTAAACATGTTTATCTAGACTCTGCACATATAATGAATAACTCTGAAGTACTTCCTAACCCAAAGAATCGATCTAAACTATTCCCCGTCCTTGACAAATGTGGCATGCTAGCTGTTATTGACCAGATTAAACTTCAGCACCCAAAATACCCTGCTACACGAGTTTCGATTCAAGTGC
CAAACCTTGGCTTGCACTTTTCACCTTCAAGATATAGTAGGATTATGAATCTCTTAGCAATATTTGATGAGAGAGATGCGAGAAAGGATGGATTAACTCCTGCAGATCTTGCAGGAGATGCTAGGGTTCTCTTTTGGGGGGGAATTGGTAATTCTATTGCCGAGTGGCAATCTTGTTGGCTAGTCCTTGATGGGTCTTAC
TTATATATCTTGGAGTCCAAAACATCTAAAACTTATCAGCGGTGCTGCAGCATGAGTGCTAGGCAAGTTATGGAGATCCCCCCAGCAAGTGTTGGTGGATCAGAATTCACTGTTGCCATAAGCAACAGAGGCTTTGATATACAAAAGGCGTTGGAATCATCTAGCACCGTTATCCTGCAGTTCAAAGATGAAAATGCGAA
GGCAGAATGGATGAAGTCTTTTGTTCATGCTACATATAAAGCATCTGCTCCTCTGTCCATGTGCATACCTGGAAATCTTAGTGGCAATGAATCTGAAGACGAAAGCTGTCAACCAGTGGTTGTGTCAGAAAAGATAAACTTGTCTGTTGTTGGTACTCTGGTTGAAATGAAACTTCTAATCTATGGGAAGGAAGAAGAGG
AAAATGACAGAGTTGGTGAAGAAAGAATGCTTTTGGAACTATTTGCTGGTGGAGGCAAGGTGAACCTTATACAGCAGGAGAATGATTTGACTGTGAGGATGAAATTGCATTCCCTAAAGATAGAAGATAAGCTTCAAGGTTGTGTGTCTACAACATGCAAGTATATTGCTCGTTCTGTGCTGGAAAATGATAGTCAATAT
CTGGTTGAGGAGGTCGACGATAAATGTAGCACAGCATTAGTAGAAAACATTTCAGAGGAGGATGAGTTTTTTAAAGATGCATTGCCAGATTTTAGTTGCCCTTCTGACTATGCTTCTGTTCCCCAAAGCAACTTAAGCTCCTTCCCCTTAAAAGCAAGGGAAAATTCATCACATGACTTTGGAACCCCTGTTACAAATTC
CAAATATGAACTTTTTGATTGGAATTTGGCCCTCGGAGAAGAACAAACTGAAGACGTAGATGTGTCTGATTTTGTGAGTGTTACATTTGTTAGAAGGCAGCCCAATTCTCCCCACTATGATGGAACAGACACCCAGATGAGCATTCGCATGACAAAGCTTGATTTCTTCTGCAACAGACTTACTGTTGTTTCTTTGATTG
ACTTTGGCATGGAACTGAGTGAGTTAATGGAGGTCATAGATGAAAAAGCATCTCCACAGAATGATATGGCAGGTTATGCTGTTTTGCCAAGTGAAAACAAAGAAGGCACTGATCGTTTATTTGTTAAAGGGCTATTGGGTACTGGAAAATCTAGAGTTGTGTTTCAGCTGAAGATGAATGTAGACAGTGTTTGTATTTTC
CTTAACAAGGATGATGGTTCTCAGTTGGCCATGTTGGTACAAGAGAAGTTTCAGATGGATTTGAGAGTTCATCCAAATTCTATTTCCATTGAGGGGTTGTTAGGGAACCTGAGGATCTGTGACATGTCCCTTGGTCCAGATCACTGGTGGGGATGGCTTTGTGACATACGTGACACAGGTTCTGATTCGCTTGTAAAGTG
GAAGTTTCAGTCTTTCAGTAGAGATGATGATGACTTTGAAGGCCATGATTACAGTCTCATTGCAAGACTTTCAGCTGTACGGATTGTTTTTCTGTACAGGTTCATTCAGGAGGTAACTGCCTATTTCACAGGCTTGGCAACACCCCAAGCTCAACATGCAATCCAAGTTGTTGATAAAGTTGGAGGAATGGAGTGGCTTA
TTCAACAATCAGAAATTGATGGATCACCTTCATTGAAACTGGATGTTTCCCTGGACACTCCTATTATTATTATGCCACAGAATTCTATGAGCAAAAATTTCATGCAGCTGGACCTGGGTCGTCTTCAAATGTCTAACAATTTTGAGTGGCATGGTTGTAAGGAAAATGATCCATCTGCCGTACATCTTGATGTCCTTCAT
GCAGAGATAATGGGCATGAATATGGTTGTTGGGATTGATGGGCGACTGGGAAAACCAATGATACAAGAAGCTTGTGGATTGCATATTAAAGTGTGTCGTTCGCTACGGGATGTTTTCAAAAAGGTTCCCGAGGTGGCAGTTGACATACAGATCGACTTATTGCATGGAGTAATGTCTGACAAGGAATACATGGTTATCAT
AGATTGTGCTTCTTCAAATATATCTGAAGAGGCAGACCTTCCTCCAAATGTTAGAGATATTCCAGAAAGGCAATTGGATTGTCTACAAGTTGAAAATGAACAGGGAATATCCAATCAAAATATTCTCTCTCACGAGGATCAGATGAGCAGCCAAGATGGTTCATCCTATACACTAACACTAGTGACAGTTGAAATTCAAT
TTGCTTCATTAAAGTTATATAATGGAATTGATCGAGAGTCTCCTCTTGCTAGAATGGATCTACAAGGGCTTTGGATTGCGTATAGAAGGTCCTCAATCTCAGAACTAGATCTCTATGTCACATTATCGAAATTGTCAGTTCTGGATCTGCGACCAAGTACGAAGCCTGAGATGCGCCGAATGCTTGGATCTATGACAGAT
GTTGATGGTGATGCACTTCATAATGAGTCAGGGGGACCAACAAAGTCAGACATTCCTAAACTAACCATGTTAGTGATGGATTGGAGAGTCAAGACAGATTCCCAAGCATTTGTGGTTCGGATGCAGCAACCACGGCTGCTTGTTGTTCTGGACTTTTTGCTTGCTGTAGGTGAATATTTTGTGCCTGCACTGGGTGTAAT
TACTGGGCGAGAGGAAGCAATGGACATGCAAAATGATCCAGTAACCATGCATGGTCATGTTCGCCTAAATGCATCTCTCTATGAGCAGAAAGAAGACATCGTATTTTTATCTCCACATCGACAACTAATTGTAGATGCCTATGATGTAGATGAGTTTACATATGATGGATGTGGGAATACAATCTGTTTGATTGGAAAGG
ATAACTTGTCTTCGCCTAGCTTGCAGCCCCTTGTCATAATTGGATATGGGAAAAGGCTTCGTTTCAAGAATATAAGAATTAAGAATGGTTCACGATTGGGGGAGCTCATATATTTAAGTAATGATAGCAGTTATTGTGCCTCTGTAGAAGACGGTGTGATTTTTGATGATTTAAATGATGAAGAATGCTCTTTTGACACT
GATGGAATAAGGAATAAGGGCCAACGTCCATCTCTTGTTTCAGAAGAACATGGCACCAATTTTGATGGAGCAAACAATTTCATTATTGAAGTACAGGCTGTGGCTCCAGAACTTACATTCTATGACAGCACAAAATGGTCTTCAGAGAATATCTTGAACGGGGAAAAGTTGCTTCGGGCAAAACTGGACATCAATTTAAT
GTACGCTGCAAAAGAAAATGATAGATGGATCCGTGCATTTGTTAAAGGCCTTACAGTTGAAAGCGGTTCTGGTCTTGTTGTACTCGATCCAGTGGATATATCAGGCGAATACACCTGTGTTCAGGATAAGACTAGTTTTTCAGTTATGACAACTGATATTTATGTTCATCTTTCTCTGAGTGTTTTGCGCCTATTACTTC
GGTTGCAAGATGAAACAGTTGCAGCATTGCAATTTGGAAGTGCAAATGCCTTATCCCGTTGCACCCATTTTGATAGAATTTGGATTGATAAAAGAGGAAATGGTTCTAATAAGCATATAGCTATTTGGAGACCTCGTCCTCCTTCAAATTATGTTATTCTTGGTGACTGTGTTACATTGGGATCTGTGCCTCCATCCCAA
GCTGTGATGGCGGTCAGCAATACTTATGGCCGTGTGAAAAAACCTCTTGGCTTTCAGCTAGTTTGGTCATTCTCTAGTTTAAATCATCTGGGAGCAGAATCCCAAAATCCTGATGGTGATGTAGAGTGTTCAGTGTGGATGCCTATAGCGCCTATGGGATATACTGTTCTTGGTTGTGTTGCACAAATTGGCAAAGCTCG
TCCATCCACTAGTATTGTTAATTGTATTCGATCTGATCTTCTAACTTCTGCTATGTTCTCTGATTGTATATACTACATTCCTCCTAATTCAAGGGACCAAGATGGCTTCAGTATTTGGTGTATAGAAAATGCTGTTGGCTCTTTTCTTGCACACACATCTGTTGAACCTCCTCCAAAATCTGTGGTCTGTGATCTGCGTG
AGATGCTGAACAGAAATTTTACTAACTCTGATTTGCACGAGGAAACATCAAATTCTGAAATGAATGCAAAATCTGATGTTGGAAGCAAGCATGGGGTAGATAGCAGACCAAGCATGCCTCGATGGGATAGAACAGCATCCATAGCAAAATTGGCTCGTTATTTGTCAACCTCACAATTTGATCTCATATGGTGGGACAAG
GGCAGTGAATCTAGATCTGCAGTTTCTATTTGGCGACCTGTACCACCTCCTGGTTATGCTATTATTGGTGACAGCATTGTTGAAGGGTTGGACCCACCGAGTTTGGGTGTAGTTCTGAGGGATGACGATTCTGGACGCCTTGAGAAGCCTGCTAAGTTTAAGAAAACACAAATACCAGGGAAGGGTCCTGAAGATGCTTT
TATGTTGTTCCCTGTTGCTCCTGCTGGTTATGTATCTTTAGGTTGTATAGCTTCAAGATCAGCGACTCTACCTCCCTTAGACACAGTGCGTTGTGTGCGTATGGACCTTGTAAACCAGGCAAATATGTCCAAGAAAGCTGTTTGGAGCATGCCAGGTCTGAAAGGATCATCTGGTTGTAGCTTATGGAGAGTTGAAAACC
AGGCTAGCACATTTATTGCAATGCCTGACCTGAAAAGACCAGCAAGTCGGATGGCATATGGGCTTGCAGAGACTGGGAGACAAAAATTGCATGAAAACTTTAGTGGTGAAATGAAGATCGGCTGTTTATCAGTAACACTTTTGGATAATCTGCGTGGAATGGTGACACCTCTAGTGGACAATACACTAACAAATATAAAT
CTCGCTGCACATGGTCGACCAGAGGCATTGAATGTGGTAGTTGTCTCATCAGTAGCTGCTTCCACTTTCAATCCGGAGTTGGAAGCATGGGAGCCTCTAATTGAACCTTTTGACGGAATTTTCAAGTATGAAGCATATGATGCAAATTCTGATTTGCCATTGAGAGTTGGGAAACGCATTCGAATTACAGCAACAAATGT
TGTAAATTTGAATATCACATCAGCAAATGTAGAAACACTTATAGGATCAATACTTGCTTGGAGAAAACAAGTAGATCATGAACAGCAGGCCCGTATGGCAATGCAGCTTGAAAAGGTTTCTATTTGAGATAACATACTTTCTTCCTAGTCAATGTCTAAGTGTTTTCTTGAAGCTGTTTCATATGATTGTTATATTTATG
CAC


>TRINITY_DN112086_c0_g1_i15 from sample A5 / Example unspliced isoform:
GCGGTGGGAATCCCTCCGTCAAAACTCTAACATCGTTTCTCTCGATTTCCTTCGGGATTTAACGGAGACTCTGACGTACGCAGCACGAACGAAGTAGAAAGCAACATTTATTCGAGCGGAGAGCAACCCTGGGGCATTTTAGGTGCCCTATTTGCTGTAAGTTTTCGTCGTTCTCATTAAATTCGGATCGATATTCTTCT
GATTTCGTTGCAGTGCAGCCGTTGGATGATTGCGGAATTATTTCAGgttttttttgagttatttcggctcatcttaagggtaattttgatcagatcgctgtggtcttttggaggtggcgtttaggagatgttttgcatcgactttacttgtttcaagtcgatttttacttgaaccggtattgattttgtctgcagGCAAC
TGGTTTGCGGATGAAGCATTTTGTGGCATCCGTTGAGAAGTATTGAGCATTAGACGGCCCTGGCACAATGTTTGAAGCTCATGTTTTGCATTTGCTTCGTAGATATCTGGGAGAGTATGTGCACGGTCTTTCAACTGAGGCTTTGAAGATCAGTGTCTGGAAAGGTGATGTGGTATTAAGAGATTTGCATCTAAAGGCTG
AGGCACTGAATGCTTTGAAGTTGCCCATTACAGTGAAAGCTGGCTTCCTGGGTTCTGTGACACTTAAGGTTCCTTGGAAGAGCCTCGGAAAAGAACCAGTTATTGTTCTCATTGACCGTGTGTTTGTACTTGCAGAACCAGCACAAGATGAATGCTCTTTCACGGATGAAGCAAAGGAAAGGCTTTTTGAAGCAAAACGA
CGAAAAATTGAGGAAGCAGAGGTGGCAATGCTGGAAGCAAAAGATAAGAGGAAAACAAAAATGGAAAATTCATCAGAAACAAATTCGTGGATAGGTTCTCTAATTGCGACAGTGGTTGGAAATTTAAAAATTTCTATCAGTAATGTACATATACGCTATGAGGACACAGTGAGCAACTCAGGACATCCATTTTGTTCTGG
TATAACTTTGGCAAAGCTTGCTGCTGTGACAACTGATGAGCATGGTGTGGAAACTTTTGATACTAGTGGAGCATTAGACAGGCTACGCAAGTCATTGCAGCTTGAGCGTTTTGCAGTTTACCATGATTCTGATAGCGTCCCATGGAAGTTGGATAAGAGATTGGAAGAATTGACTGCTGATGAATGGAGCAAGGTTTTTT
TTATCTTTCATGAATATGCTTCGATATATCTCTACTTTCTCACTGATTGGCCTTTTTATTATGTTTCTTTTCTAACATCCGGC



Intron 7 GTGATTTTCT ... TTATTTTCAG

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A10-1000



>TRINITY_DN112086_c0_g1_i1 from sample A5 / Example spliced isoform
GCGGTGGGAATCCCTCCGTCAAAACTCTAACATCGTTTCTCTCGATTTCCTTCGGGATTTAACGGAGACTCTGACGTACGCAGCACGAACGAAGTAGAAAGCAACATTTATTCGAGCGGAGAGCAACCCTGGGGCATTTTAGGTGCCCTATTTGCTGTAAGTTTTCGTCGTTCTCATTAAATTCGGATCGATATTCTTCT
GATTTCGTTGCAGTGCAGCCGTTGGATGATTGCGGAATTATTTCAGGCAACTGGTTTGCGGATGAAGCATTTTGTGGCATCCGTTGAGAAGTATTGAGCATTAGACGGCCCTGGCACAATGTTTGAAGCTCATGTTTTGCATTTGCTTCGTAGATATCTGGGAGAGTATGTGCACGGTCTTTCAACTGAGGCTTTGAAGA
TCAGTGTCTGGAAAGGTGATGTGGTATTAAGAGATTTGCATCTAAAGGCTGAGGCACTGAATGCTTTGAAGTTGCCCATTACAGTGAAAGCTGGCTTCCTGGGTTCTGTGACACTTAAGGTTCCTTGGAAGAGCCTCGGAAAAGAACCAGTTATTGTTCTCATTGACCGTGTGTTTGTACTTGCAGAACCAGCACAAGAT
GAATGCTCTTTCACGGATGAAGCAAAGGAAAGGCTTTTTGAAGCAAAACGACGAAAAATTGAGGAAGCAGAGGTGGCAATGCTGGAAGCAAAAGATAAGAGGAAAACAAAAATGGAAAATTCATCAGAAACAAATTCGTGGATAGGTTCTCTAATTGCGACAGTGGTTGGAAATTTAAAAATTTCTATCAGTAATGTACA
TATACGCTATGAGGACACAGTGAGCAACTCAGGACATCCATTTTGTTCTGGTATAACTTTGGCAAAGCTTGCTGCTGTGACAACTGATGAGCATGGTGTGGAAACTTTTGATACTAGTGGAGCATTAGACAGGCTACGCAAGTCATTGCAGCTTGAGCGTTTTGCAGTTTACCATGATTCTGATAGCGTCCCATGGAAGT
TGGATAAGAGATTGGAAGAATTGACTGCTGATGAATGGAGCAAGATTTTTGAAGCTGGCATTCAAGAGTCAGAAAATGAGAGAAATTCAGTATCAAAATGGGCCCTAGGGCGCCAGTATTTGCTATATCCTATTAATGGAACTCTCAAGTATTATCGTTTTGGAAAGCAAGATAAGCGGGATCCAAGTGTTCCCTCTCAG
AAAATGTCCCTCACTCTAAACGATGTGTCAGTGACAGTCTCAGAGGCTCAGTATTGTGATGGAATGAAACTATTGGAAGGAGTTTCAAGATATCGAACCCGCATTGAGGTCTCCCATTTCCGGCCATTGGTCTCCGTGTCTAAAGACACTCGAGTTTGGTGGCGTTATGCTTGTCAGGCAAGCCTACATCGGCAAAACAA
AATGTGGCACCGTCTGTCATGGGAAAATGTTTCTCGTCTGTGTCAACATCGTAGGAAGTATGTTCGGCTTTATGCAGTGTATTTGCAACAAATACCCAGACTGGATAACAAAGAAATCAGAGAAATTGAGGAGGAGCTAGATGCAAAGGTTATCCTTCTATGGAGGCTACTTGCTCATGCCAGAGTTGAGAGTGCAAGAT
CAAAGGAAATGGCCTTAGAGAGGGCACGTGCAAGGAAATCTAGTTGGTGGTCTTTTGGATGGCGGTCAACAGCATCAGACTCAAACCCATCTAATGCTTCTGAAGATTCGGAAGGGGTTACTGACATGCCACATCTAGGACAGTTGACAAAAGAGGAGTGGAAGAAGCTTAATGAACTTTTAAGCTACAATTCTGCAAAG
AACTTCTTTGTGCTTTCTGATAAGGAGCCTCCAGACATGCTACAGTACTCCTTGGATGCTACTGTTGGGAAAAGTGCAGCTCGAATTGTAAACAACCAAAATTTGGAAATCATCTGTGGGAAGTTTGAGAGTCTTCATGTTGGTCTTAGAAGTTATCCCAAGAGCACTCATTGTGATACAAAACTGAAGTTATATGGTGT
TTCTGCTCCTGAAGGATCCCTTATACAGAGTGTCAGCAGTGAAGAGAAGGAATATGCACTTGCTGCTACATTTGTACACTCTCCTATTGGAGAAAACTTAGATTGGAAACTCTCTGCAACCGTGTCTCCTTGTCATGTCACGGTTTGGATGACAAGCTTTGAACGTTGTCTACAATTCCTGAGGAGGAGTAGTTCTGTCA
GTCCTGAGGTAGCATTGGAAACTGCAGCAGCTTTGCAGATGAAGTTGGAGAAAGTGACTCGACGAGCACAGGAACAATTTCAGCTTGTATTAAAAGAACAAAGCAGGTTTTCTCTTGACATTGATTTGGATGCTCCAATACTGAGACTTCCGTTTCAGAGAGCAGAGTGTTCTGGAAGTTGCAGTCAGCTTGTAGTAGAT
TTTGGTCATTTTACATTGCGTACAGTGAACGTCAGTATCATGTTCATCAATAAATAGATGTACTGTTTTGCGGTTTTGGAATTGTCTATTTACTCCAATATGTTTACTTTCCTGCAGGAAGATGATGTTCATCCCCAAATACCAAGTCTTTACTCGCGGTTTCACATATCAGGAAGAGACACCGCTGCCTTTTTCATGGA
TGGAATCTTTGATTGGACAGAGCTTAAACATGTTTATCTAGACTCTGCACATATAATGAATAACTCTGAAGTACTTCCTAACCCAAAGAATCGATCTAAACTATTCCCCGTCCTTGACAAATGTGGCATGCTAGCTGTTATTGACCAGATTAAACTTCAGCACCCAAAATACCCTGCTACACGAGTTTCGATTCAAGTGC
CAAACCTTGGCTTGCACTTTTCACCTTCAAGATATAGTAGGATTATGAATCTCTTAGCAATATTTGATGAGAGAGATGCGAGAAAGGATGGATTAACTCCTGCAGATCTTGCAGGAGATGCTAGGGTTCTCTTTTGGGGGGGAATTGGTAATTCTATTGCCGAGTGGCAATCTTGTTGGCTAGTCCTTGATGGGTCTTAC
TTATATATCTTGGAGTCCAAAACATCTAAAACTTATCAGCGGTGCTGCAGCATGAGTGCTAGGCAAGTTATGGAGATCCCCCCAGCAAGTGTTGGTGGATCAGAATTCACTGTTGCCATAAGCAACAGAGGCTTTGATATACAAAAGGCGTTGGAATCATCTAGCACCGTTATCCTGCAGTTCAAAGATGAAAATGCGAA
GGCAGAATGGATGAAGTCTTTTGTTCATGCTACATATAAAGCATCTGCTCCTCTGTCCATGTGCATACCTGGAAATCTTAGTGGCAATGAATCTGAAGACGAAAGCTGTCAACCAGTGGTTGTGTCAGAAAAGATAAACTTGTCTGTTGTTGGTACTCTGGTTGAAATGAAACTTCTAATCTATGGGAAGGAAGAAGAGG
AAAATGACAGAGTTGGTGAAGAAAGAATGCTTTTGGAACTATTTGCTGGTGGAGGCAAGGTGAACCTTATACAGCAGGAGAATGATTTGACTGTGAGGATGAAATTGCATTCCCTAAAGATAGAAGATAAGCTTCAAGGTTGTGTGTCTACAACATGCAAGTATATTGCTCGTTCTGTGCTGGAAAATGATAGTCAATAT
CTGGTTGAGGAGGTCGACGATAAATGTAGCACAGCATTAGTAGAAAACATTTCAGAGGAGGATGAGTTTTTTAAAGATGCATTGCCAGATTTTAGTTGCCCTTCTGACTATGCTTCTGTTCCCCAAAGCAACTTAAGCTCCTTCCCCTTAAAAGCAAGGGAAAATTCATCACATGACTTTGGAACCCCTGTTACAAATTC
CAAATATGAACTTTTTGATTGGAATTTGGCCCTCGGAGAAGAACAAACTGAAGACGTAGATGTGTCTGATTTTGTGAGTGTTACATTTGTTAGAAGGCAGCCCAATTCTCCCCACTATGATGGAACAGACACCCAGATGAGCATTCGCATGACAAAGCTTGATTTCTTCTGCAACAGACTTACTGTTGTTTCTTTGATTG
ACTTTGGCATGGAACTGAGTGAGTTAATGGAGGTCATAGATGAAAAAGCATCTCCACAGAATGATATGGCAGGTTATGCTGTTTTGCCAAGTGAAAACAAAGAAGGCACTGATCGTTTATTTGTTAAAGGGCTATTGGGTACTGGAAAATCTAGAGTTGTGTTTCAGCTGAAGATGAATGTAGACAGTGTTTGTATTTTC
CTTAACAAGGATGATGGTTCTCAGTTGGCCATGTTGGTACAAGAGAAGTTTCAGATGGATTTGAGAGTTCATCCAAATTCTATTTCCATTGAGGGGTTGTTAGGGAACCTGAGGATCTGTGACATGTCCCTTGGTCCAGATCACTGGTGGGGATGGCTTTGTGACATACGTGACACAGGTTCTGATTCGCTTGTAAAGTG
GAAGTTTCAGTCTTTCAGTAGAGATGATGATGACTTTGAAGGCCATGATTACAGTCTCATTGCAAGACTTTCAGCTGTACGGATTGTTTTTCTGTACAGGTTCATTCAGGAGGTAACTGCCTATTTCACAGGCTTGGCAACACCCCAAGCTCAACATGCAATCCAAGTTGTTGATAAAGTTGGAGGAATGGAGTGGCTTA
TTCAACAATCAGAAATTGATGGATCACCTTCATTGAAACTGGATGTTTCCCTGGACACTCCTATTATTATTATGCCACAGAATTCTATGAGCAAAAATTTCATGCAGCTGGACCTGGGTCGTCTTCAAATGTCTAACAATTTTGAGTGGCATGGTTGTAAGGAAAATGATCCATCTGCCGTACATCTTGATGTCCTTCAT
GCAGAGATAATGGGCATGAATATGGTTGTTGGGATTGATGGGCGACTGGGAAAACCAATGATACAAGAAGCTTGTGGATTGCATATTAAAGTGTGTCGTTCGCTACGGGATGTTTTCAAAAAGGTTCCCGAGGTGGCAGTTGACATACAGATCGACTTATTGCATGGAGTAATGTCTGACAAGGAATACATGGTTATCAT
AGATTGTGCTTCTTCAAATATATCTGAAGAGGCAGACCTTCCTCCAAATGTTAGAGATATTCCAGAAAGGCAATTGGATTGTCTACAAGTTGAAAATGAACAGGGAATATCCAATCAAAATATTCTCTCTCACGAGGATCAGATGAGCAGCCAAGATGGTTCATCCTATACACTAACACTAGTGACAGTTGAAATTCAAT
TTGCTTCATTAAAGTTATATAATGGAATTGATCGAGAGTCTCCTCTTGCTAGAATGGATCTACAAGGGCTTTGGATTGCGTATAGAAGGTCCTCAATCTCAGAACTAGATCTCTATGTCACATTATCGAAATTGTCAGTTCTGGATCTGCGACCAAGTACGAAGCCTGAGATGCGCCGAATGCTTGGATCTATGACAGAT
GTTGATGGTGATGCACTTCATAATGAGTCAGGGGGACCAACAAAGTCAGACATTCCTAAACTAACCATGTTAGTGATGGATTGGAGAGTCAAGACAGATTCCCAAGCATTTGTGGTTCGGATGCAGCAACCACGGCTGCTTGTTGTTCTGGACTTTTTGCTTGCTGTAGGTGAATATTTTGTGCCTGCACTGGGTGTAAT
TACTGGGCGAGAGGAAGCAATGGACATGCAAAATGATCCAGTAACCATGCATGGTCATGTTCGCCTAAATGCATCTCTCTATGAGCAGAAAGAAGACATCGTATTTTTATCTCCACATCGACAACTAATTGTAGATGCCTATGATGTAGATGAGTTTACATATGATGGATGTGGGAATACAATCTGTTTGATTGGAAAGG
ATAACTTGTCTTCGCCTAGCTTGCAGCCCCTTGTCATAATTGGATATGGGAAAAGGCTTCGTTTCAAGAATATAAGAATTAAGAATGGTTCACGATTGGGGGAGCTCATATATTTAAGTAATGATAGCAGTTATTGTGCCTCTGTAGAAGACGGTGTGATTTTTGATGATTTAAATGATGAAGAATGCTCTTTTGACACT
GATGGAATAAGGAATAAGGGCCAACGTCCATCTCTTGTTTCAGAAGAACATGGCACCAATTTTGATGGAGCAAACAATTTCATTATTGAAGTACAGGCTGTGGCTCCAGAACTTACATTCTATGACAGCACAAAATGGTCTTCAGAGAATATCTTGAACGGGGAAAAGTTGCTTCGGGCAAAACTGGACATCAATTTAAT
GTACGCTGCAAAAGAAAATGATAGATGGATCCGTGCATTTGTTAAAGGCCTTACAGTTGAAAGCGGTTCTGGTCTTGTTGTACTCGATCCAGTGGATATATCAGGCGAATACACCTGTGTTCAGGATAAGACTAGTTTTTCAGTTATGACAACTGATATTTATGTTCATCTTTCTCTGAGTGTTTTGCGCCTATTACTTC
GGTTGCAAGATGAAACAGTTGCAGCATTGCAATTTGGAAGTGCAAATGCCTTATCCCGTTGCACCCATTTTGATAGAATTTGGATTGATAAAAGAGGAAATGGTTCTAATAAGCATATAGCTATTTGGAGACCTCGTCCTCCTTCAAATTATGTTATTCTTGGTGACTGTGTTACATTGGGATCTGTGCCTCCATCCCAA
GCTGTGATGGCGGTCAGCAATACTTATGGCCGTGTGAAAAAACCTCTTGGCTTTCAGCTAGTTTGGTCATTCTCTAGTTTAAATCATCTGGGAGCAGAATCCCAAAATCCTGATGGTGATGTAGAGTGTTCAGTGTGGATGCCTATAGCGCCTATGGGATATACTGTTCTTGGTTGTGTTGCACAAATTGGCAAAGCTCG
TCCATCCACTAGTATTGTTAATTGTATTCGATCTGATCTTCTAACTTCTGCTATGTTCTCTGATTGTATATACTACATTCCTCCTAATTCAAGGGACCAAGATGGCTTCAGTATTTGGTGTATAGAAAATGCTGTTGGCTCTTTTCTTGCACACACATCTGTTGAACCTCCTCCAAAATCTGTGGTCTGTGATCTGCGTG
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TGTAAATTTGAATATCACATCAGCAAATGTAGAAACACTTATAGGATCAATACTTGCTTGGAGAAAACAAGTAGATCATGAACAGCAGGCCCGTATGGCAATGCAGCTTGAAAAGGTTTCTATTTGAGATAACATACTTTCTTCCTAGTCAATGTCTAAGTGTTTTCTTGAAGCTGTTTCATATGATTGTTATATTTATG
CAC


>TRINITY_DN112086_c0_g1_i24 from sample A5 / Example unspliced isoform:
TCATGCTACATATAAAGCATCTgtgattttcttactcaccctatgattgaaatgaattgtgatctttctgtcccaattttttttattaaatttgttattttcagGCTCCTCTGTCCATGTGCATACCTGGAAATCTTAGTGGCAATGAATCTGAAGACGAAAGCTGTCAACCAGTGGTTGTGTCAGAAAAGATAAACTTG
TCTGTTGTTGGTACTCTGGTTGAAATGAAACTTCTAATCTATGGGAAGGAAGAAGAGGAAAATGACAGAGTTGGTGAAGAAAGAATGCTTTTGGAACTATTTGCTGGTGGAGGCAAGGTGAACCTTATACAGCAGGAGAATGATTTGACTGTGAGGATGAAATTGCATTCCCTAAAGATAGAAGATAAGCTTCAAGGTTG
TGTGTCTACAACATGCAAGTATATTGCTCGTTCTGTGCTGGAAAATGATAGTCAATATCTGGTTGAGGAGGTCGACGATAAATGTAGCACAGCATTAGTAGAAAACATTTCAGAGGAGGATGAGTTTTTTAAAGATGCATTGCCAGATTTTAGTTGCCCTTCTGACTATGCTTCTGTTCCCCAAAGCAACTTAAGCTCCT
TCCCCTTAAAAGCAAGGGAAAATTCATCACATGACTTTGGAACCCCTGTTACAAATTCCAAATATGAACTTTTTGATTGGAATTTGGCCCTCGGAGAAGAACAAACTGAAGACGTAGATGTGTCTGATTTTGTGAGTGTTACATTTGTTAGAAGGCAGCCCAATTCTCCCCACTATGATGGAACAGACACCCAGATGAGC
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TGGAAAATCTAGAGTTGTGTTTCAGCTGAAGATGAATGTAGACAGTGTTTGTATTTTCCTTAACAAGGATGATGGTTCTCAGTTGGCCATGTTGGTACAAGAGAAGTTTCAGATGGATTTGAGAGTTCATCCAAATTCTATTTCCATTGAGGGGTTGTTAGGGAACCTGAGGATCTGTGACATGTCCCTTGGTCCAGATC
ACTGGTGGGGATGGCTTTGTGACATACGTGACACAGGTTCTGATTCGCTTGTAAAG



Intron 8 GTCAGTATCA ... TTTCCTGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
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A7-1000
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A10-1000



>TRINITY_DN112086_c0_g1_i8 from sample A5 / Example spliced isoform
GCGGTGGGAATCCCTCCGTCAAAACTCTAACATCGTTTCTCTCGATTTCCTTCGGGATTTAACGGAGACTCTGACGTACGCAGCACGAACGAAGTAGAAAGCAACATTTATTCGAGCGGAGAGCAACCCTGGGGCATTTTAGGTGCCCTATTTGCTGTAAGTTTTCGTCGTTCTCATTAAATTCGGATCGATATTCTTCT
GATTTCGTTGCAGTGCAGCCGTTGGATGATTGCGGAATTATTTCAGGCAACTGGTTTGCGGATGAAGCATTTTGTGGCATCCGTTGAGAAGTATTGAGCATTAGACGGCCCTGGCACAATGTTTGAAGCTCATGTTTTGCATTTGCTTCGTAGATATCTGGGAGAGTATGTGCACGGTCTTTCAACTGAGGCTTTGAAGA
TCAGTGTCTGGAAAGGTGATGTGGTATTAAGAGATTTGCATCTAAAGGCTGAGGCACTGAATGCTTTGAAGTTGCCCATTACAGTGAAAGCTGGCTTCCTGGGTTCTGTGACACTTAAGGTTCCTTGGAAGAGCCTCGGAAAAGAACCAGTTATTGTTCTCATTGACCGTGTGTTTGTACTTGCAGAACCAGCACAAGAT
GAATGCTCTTTCACGGATGAAGCAAAGGAAAGGCTTTTTGAAGCAAAACGACGAAAAATTGAGGAAGCAGAGGTGGCAATGCTGGAAGCAAAAGATAAGAGGAAAACAAAAATGGAAAATTCATCAGAAACAAATTCGTGGATAGGTTCTCTAATTGCGACAGTGGTTGGAAATTTAAAAATTTCTATCAGTAATGTACA
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TGGATAAGAGATTGGAAGAATTGACTGCTGATGAATGGAGCAAGATTTTTGAAGCTGGCATTCAAGAGTCAGAAAATGAGAGAAATTCAGTATCAAAATGGGCCCTAGGGCGCCAGTATTTGCTATATCCTATTAATGGAACTCTCAAGTATTATCGTTTTGGAAAGCAAGATAAGCGGGATCCAAGTGTTCCCTCTCAG
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GGCGTTATGCTTGTCAGGCAAGCCTACATCGGCAAAACAAAATGTGGCACCGTCTGTCATGGGAAAATGTTTCTCGTCTGTGTCAACATCGTAGGAAGTATGTTCGGCTTTATGCAGTGTATTTGCAACAAATACCCAGACTGGATAACAAAGAAATCAGAGAAATTGAGGAGGAGCTAGATGCAAAGGTTATCCTTCTA
TGGAGGCTACTTGCTCATGCCAGAGTTGAGAGTGCAAGATCAAAGGAAATGGCCTTAGAGAGGGCACGTGCAAGGAAATCTAGTTGGTGGTCTTTTGGATGGCGGTCAACAGCATCAGACTCAAACCCATCTAATGCTTCTGAAGATTCGGAAGGGGTTACTGACATGCCACATCTAGGACAGTTGACAAAAGAGGAGTG
GAAGAAGCTTAATGAACTTTTAAGCTACAATTCTGCAAAGAACTTCTTTGTGCTTTCTGATAAGGAGCCTCCAGACATGCTACAGTACTCCTTGGATGCTACTGTTGGGAAAAGTGCAGCTCGAATTGTAAACAACCAAAATTTGGAAATCATCTGTGGGAAGTTTGAGAGTCTTCATGTTGGTCTTAGAAGTTATCCCA
AGAGCACTCATTGTGATACAAAACTGAAGTTATATGGTGTTTCTGCTCCTGAAGGATCCCTTATACAGAGTGTCAGCAGTGAAGAGAAGGAATATGCACTTGCTGCTACATTTGTACACTCTCCTATTGGAGAAAACTTAGATTGGAAACTCTCTGCAACCGTGTCTCCTTGTCATGTCACGGTTTGGATGACAAGCTTT
GAACGTTGTCTACAATTCCTGAGGAGGAGTAGTTCTGTCAGTCCTGAGGTAGCATTGGAAACTGCAGCAGCTTTGCAGATGAAGTTGGAGAAAGTGACTCGACGAGCACAGGAACAATTTCAGCTTGTATTAAAAGAACAAAGCAGGTTTTCTCTTGACATTGATTTGGATGCTCCAATACTGAGACTTCCGTTTCAGAG
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CAGCATGAGTGCTAGGCAAGTTATGGAGATCCCCCCAGCAAGTGTTGGTGGATCAGAATTCACTGTTGCCATAAGCAACAGAGGCTTTGATATACAAAAGGCGTTGGAATCATCTAGCACCGTTATCCTGCAGTTCAAAGATGAAAATGCGAAGGCAGAATGGATGAAGTCTTTTGTTCATGCTACATATAAAGCATCTG
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GGTGGAGGCAAGGTGAACCTTATACAGCAGGAGAATGATTTGACTGTGAGGATGAAATTGCATTCCCTAAAGATAGAAGATAAGCTTCAAGGTTGTGTGTCTACAACATGCAAGTATATTGCTCGTTCTGTGCTGGAAAATGATAGTCAATATCTGGTTGAGGAGGTCGACGATAAATGTAGCACAGCATTAGTAGAAAA
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CTGAAGACGTAGATGTGTCTGATTTTGTGAGTGTTACATTTGTTAGAAGGCAGCCCAATTCTCCCCACTATGATGGAACAGACACCCAGATGAGCATTCGCATGACAAAGCTTGATTTCTTCTGCAACAGACTTACTGTTGTTTCTTTGATTGACTTTGGCATGGAACTGAGTGAGTTAATGGAGGTCATAGATGAAAAA
GCATCTCCACAGAATGATATGGCAGGTTATGCTGTTTTGCCAAGTGAAAACAAAGAAGGCACTGATCGTTTATTTGTTAAAGGGCTATTGGGTACTGGAAAATCTAGAGTTGTGTTTCAGCTGAAGATGAATGTAGACAGTGTTTGTATTTTCCTTAACAAGGATGATGGTTCTCAGTTGGCCATGTTGGTACAAGAGAA
GTTTCAGATGGATTTGAGAGTTCATCCAAATTCTATTTCCATTGAGGGGTTGTTAGGGAACCTGAGGATCTGTGACATGTCCCTTGGTCCAGATCACTGGTGGGGATGGCTTTGTGACATACGTGACACAGGTTCTGATTCGCTTGTAAAGTGGAAGTTTCAGTCTTTCAGTAGAGATGATGATGACTTTGAAGGCCATG
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GCTAGAATGGATCTACAAGGGCTTTGGATTGCGTATAGAAGGTCCTCAATCTCAGAACTAGATCTCTATGTCACATTATCGAAATTGTCAGTTCTGGATCTGCGACCAAGTACGAAGCCTGAGATGCGCCGAATGCTTGGATCTATGACAGATGTTGATGGTGATGCACTTCATAATGAGTCAGGGGGACCAACAAAGTC
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GCCTTATCCCGTTGCACCCATTTTGATAGAATTTGGATTGATAAAAGAGGAAATGGTTCTAATAAGCATATAGCTATTTGGAGACCTCGTCCTCCTTCAAATTATGTTATTCTTGGTGACTGTGTTACATTGGGATCTGTGCCTCCATCCCAAGCTGTGATGGCGGTCAGCAATACTTATGGCCGTGTGAAAAAACCTCT
TGGCTTTCAGCTAGTTTGGTCATTCTCTAGTTTAAATCATCTGGGAGCAGAATCCCAAAATCCTGATGGTGATGTAGAGTGTTCAGTGTGGATGCCTATAGCGCCTATGGGATATACTGTTCTTGGTTGTGTTGCACAAATTGGCAAAGCTCGTCCATCCACTAGTATTGTTAATTGTATTCGATCTGATCTTCTAACTT
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TCAAATTCTGAAATGAATGCAAAATCTGATGTTGGAAGCAAGCATGGGGTAGATAGCAGACCAAGCATGCCTCGATGGGATAGAACAGCATCCATAGCAAAATTGGCTCGTTATTTGTCAACCTCACAATTTGATCTCATATGGTGGGACAAGGGCAGTGAATCTAGATCTGCAGTTTCTATTTGGCGACCTGTACCACC
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TAGCTTCAAGATCAGCGACTCTACCTCCCTTAGACACAGTGCGTTGTGTGCGTATGGACCTTGTAAACCAGGCAAATATGTCCAAGAAAGCTGTTTGGAGCATGCCAGGTCTGAAAGGATCATCTGGTTGTAGCTTATGGAGAGTTGAAAACCAGGCTAGCACATTTATTGCAATGCCTGACCTGAAAAGACCAGCAAGT
CGGATGGCATATGGGCTTGCAGAGACTGGGAGACAAAAATTGCATGAAAACTTTAGTGGTGAAATGAAGATCGGCTGTTTATCAGTAACACTTTTGGATAATCTGCGTGGAATGGTGACACCTCTAGTGGACAATACACTAACAAATATAAATCTCGCTGCACATGGTCGACCAGAGGCATTGAATGTGGTAGTTGTCTC
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GAAGATATTAAGCTATTGAAGCCTGACAGTAATGTTCTTGTGCACCTTCCACCTCCAAGGTTTCCTGACAGATTGAATGCTGTCACAGAGACAAAGGCTTCTCGATACTATGTTGCTGTTCATATTTTAGATGCAAGGGAGTTAATGTTGACTGAAGATGGAAATGGGAAAAACTTCTTTTGTGCTCTCCGTTTAGTAAC
CACAACGCAAACATCAGAGGATCAAAAGCCTTTTCCTCAGAGTGCAAGGTCTAGATGTGTTAGGCCATTGATGATAGAAACAAACAATCATGTAGTTGGTTCAGTAAACTGGAATGAAGTGTTTATATTTGAAGTTCCTCATCAGGGCTTAACAAGCTTGGAGGTTGTGGTAACAAATCTTTCAGCAAAAGCAGGAAAAG
GGGAGGCTGTGGGAATGGTTTCTTTTCCTATGAAAAATGATACGAATTATTGGCCGTCACAAACATCACTTTCAAGATTCATGCAAAATTCTTCTGCTAGAAGTGCCCATACATTTGGCTTACAGCCATTAAAGAAAAAGTGTCCAAATGATGACGGGAGTGAATGTTCAAATTGTGGATTAATATCCCTCACTACTTTC
TACTTCATTGCTGAAGGAGATAAGAGCTTGAAAGGGGACTTTGGGAATACATTTAGCAATGGTGAAATTGGTTTGATGGTTGGGGTTAGCCCAGAAGGTCCTTGGACGAGCATACGTTCTGTCTTACCTCTATCTACAATACCAAAAGAGCTGAATGGAACTTTTGGTGTTGAAGTTGTAATGCAGAAGGGTCAGAAACA
TGCAATTTTACGAAGTCTTTTCAGCATCGTGAATAATACAGATATTACTCTTGAAGTCTGTGTATGCCCTCTCTCTCTTTTAAATAGCACCGATGATCAACTAAGTTCTGATACAAATAGGACAGTTGTGGAAATTGAAGAGATCTTTGAGAACCAGCGCTATAATCCACTTTCAGGATGGGGCAACAAACGGCCTGGTC
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TCATCCAGGCGATCAGCTTTTGACTTTGTAAGACGACGCCGTTGGGTACGTACTCGGCAGCAATCATCTGAGAGTAAGGAAAGGCATACAAGGGAAGTTGTAGCTGTACTAAAACCAGGGTGCTCTGTCCCTTTGCCCTGGAGTTGTACTACAAGTGATACTGATTTCTGTGTGCAAGTCCGCCCTTCCCCTCTGTCTGC
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TCCTTCTGCGATTTGGAGAATAAGG


>TRINITY_DN112086_c0_g1_i1 from sample A5 / Example unspliced isoform:
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TCAGTGTCTGGAAAGGTGATGTGGTATTAAGAGATTTGCATCTAAAGGCTGAGGCACTGAATGCTTTGAAGTTGCCCATTACAGTGAAAGCTGGCTTCCTGGGTTCTGTGACACTTAAGGTTCCTTGGAAGAGCCTCGGAAAAGAACCAGTTATTGTTCTCATTGACCGTGTGTTTGTACTTGCAGAACCAGCACAAGAT
GAATGCTCTTTCACGGATGAAGCAAAGGAAAGGCTTTTTGAAGCAAAACGACGAAAAATTGAGGAAGCAGAGGTGGCAATGCTGGAAGCAAAAGATAAGAGGAAAACAAAAATGGAAAATTCATCAGAAACAAATTCGTGGATAGGTTCTCTAATTGCGACAGTGGTTGGAAATTTAAAAATTTCTATCAGTAATGTACA
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TTCTGCTCCTGAAGGATCCCTTATACAGAGTGTCAGCAGTGAAGAGAAGGAATATGCACTTGCTGCTACATTTGTACACTCTCCTATTGGAGAAAACTTAGATTGGAAACTCTCTGCAACCGTGTCTCCTTGTCATGTCACGGTTTGGATGACAAGCTTTGAACGTTGTCTACAATTCCTGAGGAGGAGTAGTTCTGTCA
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CAAACCTTGGCTTGCACTTTTCACCTTCAAGATATAGTAGGATTATGAATCTCTTAGCAATATTTGATGAGAGAGATGCGAGAAAGGATGGATTAACTCCTGCAGATCTTGCAGGAGATGCTAGGGTTCTCTTTTGGGGGGGAATTGGTAATTCTATTGCCGAGTGGCAATCTTGTTGGCTAGTCCTTGATGGGTCTTAC
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CAAATATGAACTTTTTGATTGGAATTTGGCCCTCGGAGAAGAACAAACTGAAGACGTAGATGTGTCTGATTTTGTGAGTGTTACATTTGTTAGAAGGCAGCCCAATTCTCCCCACTATGATGGAACAGACACCCAGATGAGCATTCGCATGACAAAGCTTGATTTCTTCTGCAACAGACTTACTGTTGTTTCTTTGATTG
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AGATGCTGAACAGAAATTTTACTAACTCTGATTTGCACGAGGAAACATCAAATTCTGAAATGAATGCAAAATCTGATGTTGGAAGCAAGCATGGGGTAGATAGCAGACCAAGCATGCCTCGATGGGATAGAACAGCATCCATAGCAAAATTGGCTCGTTATTTGTCAACCTCACAATTTGATCTCATATGGTGGGACAAG
GGCAGTGAATCTAGATCTGCAGTTTCTATTTGGCGACCTGTACCACCTCCTGGTTATGCTATTATTGGTGACAGCATTGTTGAAGGGTTGGACCCACCGAGTTTGGGTGTAGTTCTGAGGGATGACGATTCTGGACGCCTTGAGAAGCCTGCTAAGTTTAAGAAAACACAAATACCAGGGAAGGGTCCTGAAGATGCTTT
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TGTAAATTTGAATATCACATCAGCAAATGTAGAAACACTTATAGGATCAATACTTGCTTGGAGAAAACAAGTAGATCATGAACAGCAGGCCCGTATGGCAATGCAGCTTGAAAAGGTTTCTATTTGAGATAACATACTTTCTTCCTAGTCAATGTCTAAGTGTTTTCTTGAAGCTGTTTCATATGATTGTTATATTTATG
CAC



Intron 9 GTAACTTCTT ... AACGTTGCAG

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>TRINITY_DN111659_c0_g1_i12 from sample A4 / Example spliced isoform
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TTCGTTGCAGTGCAGCCGTTGGATGATTGCGGAATTATTTCAGGCAACTGGTTTGCGGATGAAGCATTTTGTGGCATCCGTTGAGAAGTATTGAGCATTAGACGGCCCTGGCACAATGTTTGAAGCTCATGTTTTGCATTTGCTTCGTAGATATCTGGGAGAGTATGTGCACGGTCTTTCAACTGAGGCTTTGAAGATCA
GTGTCTGGAAAGGTGATGTGGTATTAAGAGATTTGCATCTAAAGGCTGAGGCACTGAATGCTTTGAAGTTGCCCATTACAGTGAAAGCTGGCTTCCTGGGTTCTGTGACACTTAAGGTTCCTTGGAAGAGCCTCGGAAAAGAACCAGTTATTGTTCTCATTGACCGTGTGTTTGTACTTGCAGAACCAGCACAAGATGAA
TGCTCTTTCACGGATGAAGCAAAGGAAAGGCTTTTTGAAGCAAAACGACGAAAAATTGAGGAAGCAGAGGTGGCAATGCTGGAAGCAAAAGATAAGAGGAAAACAAAAATGGAAAATTCATCAGAAACAAATTCGTGGATAGGTTCTCTAATTGCGACAGTGGTTGGAAATTTAAAAATTTCTATCAGTAATGTACATAT
ACGCTATGAGGACACAGTGAGCAACTCAGGACATCCATTTTGTTCTGGTATAACTTTGGCAAAGCTTGCTGCTGTGACAACTGATGAGCATGGTGTGGAAACTTTTGATACTAGTGGAGCATTAGACAGGCTACGCAAGTCATTGCAGCTTGAGCGTTTTGCAGTTTACCATGATTCTGATAGCGTCCCATGGAAGTTGG
ATAAGAGATTGGAAGAATTGACTGCTGATGAATGGAGCAAGATTTTTGAAGCTGGCATTCAAGAGTCAGAAAATGAGAGAAATTCAGTATCAAAATGGGCCCTAGGGCGCCAGTATTTGCTATATCCTATTAATGGAACTCTCAAGTATTATCGTTTTGGAAAGCAAGATAAGCGGGATCCAAGTGTTCCCTCTCAGAAA
ATGTCCCTCACTCTAAACGATGTGTCAGTGACAGTCTCAGAGGCTCAGTATTGTGATGGAATGAAACTATTGGAAGGAGTTTCAAGATATCGAACCCGCATTGAGGTCTCCCATTTCCGGCCATTGGTCTCCGTGTCTAAAGACACTCGAGTTTGGTGGCGTTATGCTTGTCAGGCAAGCCTACATCGGCAAAACAAAAT
GTGGCACCGTCTGTCATGGGAAAATGTTTCTCGTCTGTGTCAACATCGTAGGAAGTATGTTCGGCTTTATGCAGTGTATTTGCAACAAATACCCAGACTGGATAACAAAGAAATCAGAGAAATTGAGGAGGAGCTAGATGCAAAGGTTATCCTTCTATGGAGGCTACTTGCTCATGCCAGAGTTGAGAGTGCAAGATCAA
AGGAAATGGCCTTAGAGAGGGCACGTGCAAGGAAATCTAGTTGGTGGTCTTTTGGATGGCGGTCAACAGCATCAGACTCAAACCCATCTAATGCTTCTGAAGATTCGGAAGGGGTTACTGACATGCCACATCTAGGACAGTTGACAAAAGAGGAGTGGAAGAAGCTTAATGAACTTTTAAGCTACAATTCTGCAAAGAAC
TTCTTTCTGCTTTCTGATAAGGAGCCTCCAGACATGCTACAGTACTCCTTGGATGCTACTGTTGGGAAAAGTGCAGCTCGAATTGTAAACAACCAAAATTTGGAAATCATCTGTGGGAAGTTTGAGAGTCTTCATGTTGGTCTTAGAAGTTATCCCAAGAGCACTCATTGTGATACAAAACTGAAGTTATATGGTGTTTC
TGCTCCTGAAGGATCCCTTATACAGAGTGTCAGCAGTGAAGAGAAGGAATATGCACTTGCTGCTACATTTGTACACTCTCCTATTGGAGAAAACTTAGATTGGAAACTCTCTGCAACCGTGTCTCCTTGTCATGTCACGGTTTGGATGACAAGCTTTGAACGTTGTCTACAATTCCTGAGGAGGAGTAGTTCTGTCAGTC
CTGAGGTAGCATTGGAAACTGCAGCAGCTTTGCAGATGAAGTTGGAGAAAGTGACTCGACGAGCACAGGAACAATTTCAGCTTGTATTAAAAGAACAAAGCAGGTTTTCTCTTGACATTGATTTGGATGCTCCAATACTGAGACTTCCGTTTCAGAGAGCAGAGTGTTCTGGAAGTTGCAGTCAGCTTGTAGTAGATTTT
GGTCATTTTACATTGCGTACAGTGAACGAAGATGATGTTCATCCCCAAATACCAAGTCTTTACTCGCGGTTTCACATATCAGGAAGAGACACCGCTGCCTTTTTCATGGATGGAATCTTTGATTGGACAGAGCTTAAACATGTTTATCTAGACTCTGCACATATAATGAATAACTCTGAAGTACTTCCTAACCCAAAGAA
TCGATCTAAACTATTCCCCGTCCTTGACAAATGTGGCATGCTAGCTGTTATTGACCAGATTAAACTTCAGCACCCAAAATACCCTGCTACACGAGTTTCGATTCAAGTGCCAAACCTTGGCTTGCACTTTTCACCTTCAAGATATAGTAGGATTATGAATCTCTTAGCAATATTTGATGAGAGAGATGCGAGAAAGGATG
GATTAACTCCTGCAGATCTTGCAGGAGATGCTAGGGTTCTCTTTTGGGGGGGAATTGGTAATTCTATTGCCGAGTGGCAATCTTGTTGGCTAGTCCTTGATGGGTCTTACTTATATATCTTGGAGTCCAAAACATCTAAAACTTATCAGCGGTGCTGCAGCATGAGTGCTAGGCAAGTTATGGAGATCCCCCCAGCAAGT
GTTGGTGGATCAGAATTCACTGTTGCCATAAGCAACAGAGGCTTTGATATACAAAAGGCGTTGGAATCATCTAGCACCGTTATCCTGCAGTTCAAAGATGAAAATGCGAAGGCAGAATGGATGAAGTCTTTTGTTCATGCTACATATAAAGCATCTGCTCCTCTGTCCATGTGCATACCTGGAAATCTTAGTGGCAATGA
ATCTGAAGACGAAAGCTGTCAACCAGTGGTTGTGTCAGAAAAGATAAACTTGTCTGTTGTTGGTACTCTGGTTGAAATGAAACTTCTAATCTATGGGAAGGAAGAAGAGGAAAATGACAGAGTTGGTGAAGAAAGAATGCTTTTGGAACTATTTGCTGGTGGAGGCAAGGTGAACCTTATACAGCAGGAGAATGATTTGA
CTGTGAGGATGAAATTGCATTCCCTAAAGATAGAAGATAAGCTTCAAGGTTGTGTGTCTACAACATGCAAGTATATTGCTCGTTCTGTGCTGGAAAATGATAGTCAATATCTGGTTGAGGAGGTCGACGATAAATGTAGCACAGCATTAGTAGAAAACATTTCAGAGGAGGATGAGTTTTTTAAAGATGCATTGCCAGAT
TTTAGTTGCCCTTCTGACTATGCTTCTGTTCCCCAAAGCAACTTAAGCTCTTTCCCCTTAAAAGCAAGGGAAAATTCATCACATGACTTTGGAACCCCTGTTACAAATTCCAAATATGAACTTTTTGATTGGAATTTGGCCCTCGGAGAAGAACAAACTGAAGACGTAGATGTGTCTGATTTTGTGAGTGTTACATTTGT
TAGAAGGCAGCCCAATTCTCCCCACTATGATGGAACAGACACCCAGATGAGCATTCGCATGACAAAGCTTGATTTCTTCTGCAACAGACTTACTGTTGTTTCTTTGATTGACTTTGGCATGGAACTGAGTGAGTTAATGGAGGTCATAGATGAGAAAGCATCTCCACAGAATGATATGGCAGGTTATGCTGTTTTGCCAA
GTGAAAATAAAGAAGGCACTGATCGTTTATTTGTTAAAGGGCTATTGGGTACTGGAAAATCTAGAGTTGTGTTTCAGCTGAAGATGAATGTAGACAGTGTTTGTATTTTCCTTAACAAGGATGATGGTTCTCAGTTGGCCATGTTGGTACAAGAGAAGTTTCAGATGGATTTGAGAGTAAGTAGTTCTTGTATACTTGTA
ATTTTTACACTCCATCAAAATATCAGGATTAGTTGTTGGCTCTCTCTCCTATTCGACTTTGTATCACGTATGTTAGGTCTATTTAAT


>TRINITY_DN111659_c0_g1_i13 from sample A4 / Example unspliced isoform:
GCATGCTAGCTGTTATTGACCAGgtaacttcttgtggatgtgatctcaaagcattttgtctgaggtttacctggttcatctctctgatgatgtatctagtttaacgttgcagATTAAACTTCAGCACCCAAAATACCCTGCTACACGAGTTTCGATTCAAGTGCCAAACCTTGGCTTGCACTTTTCACCTTCAAGATATA
GTAGGATTATGAATCTCTTAGCAATATTTGATGAGAGAGATGCGAGAAAGGATGGATTAACTCCTGCAGATCTTGCAGGAGATGCTAGGGTTCTCTTTTGGGGGGGAATTGGTAATTCTATTGCCGAGTGGCAATCTTGTTGGCTAGTCCTTGATGGGTCTTACTTATATATCTTGGAGTCCAAAACATCTAAAACTTAT
CAGCGGTGCTGCAGCATGAGTGCTAGGCAAGTTATGGAGATCCCCCCAGCAAGTGTTGGTGGATCAGAATTCACTGTTGCCATAAGCAACAGAGGCTTTGATATACAAAAGGCGTTGGAATCATCTAGCACCGTTATCCTGCAGTTCAAAGATGAAAATGCGAAGGCAGAATGGATGAAGTCTTTTGTTCATGCTACATA
TAAAGCATCTGCTCCTCTGTCCATGTGCATACCTGGAAATCTTAGTGGCAATGAATCTGAAGACGAAAGCTGTCAACCAGTGGTTGTGTCAGAAAAGATAAACTTGTCTGTTGTTGGTACTCTGGTTGAAATGAAACTTCTAATCTATGGGA



Intron 10 GTAATTGAAG ... TTGAGCACAG

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>TRINITY_DN111659_c0_g1_i12 from sample A4 / Example spliced isoform
GTGGGAATCCCTCCGTCAAAACTCTAACATCGTTTCTCTCGATTTCCTTCGGGATTTAACGGAGACTCTGACGTACGCAGCACGAACGAAGTAGAAAGCAACATTTATTCGAGCGGAGAGCAACCCTGGGGCATTTTAGGTGCCCTATTTGCTGTAAGTTTTCGTCGTTCTCATTAAATTCGGATCGATATTCTTCTGAT
TTCGTTGCAGTGCAGCCGTTGGATGATTGCGGAATTATTTCAGGCAACTGGTTTGCGGATGAAGCATTTTGTGGCATCCGTTGAGAAGTATTGAGCATTAGACGGCCCTGGCACAATGTTTGAAGCTCATGTTTTGCATTTGCTTCGTAGATATCTGGGAGAGTATGTGCACGGTCTTTCAACTGAGGCTTTGAAGATCA
GTGTCTGGAAAGGTGATGTGGTATTAAGAGATTTGCATCTAAAGGCTGAGGCACTGAATGCTTTGAAGTTGCCCATTACAGTGAAAGCTGGCTTCCTGGGTTCTGTGACACTTAAGGTTCCTTGGAAGAGCCTCGGAAAAGAACCAGTTATTGTTCTCATTGACCGTGTGTTTGTACTTGCAGAACCAGCACAAGATGAA
TGCTCTTTCACGGATGAAGCAAAGGAAAGGCTTTTTGAAGCAAAACGACGAAAAATTGAGGAAGCAGAGGTGGCAATGCTGGAAGCAAAAGATAAGAGGAAAACAAAAATGGAAAATTCATCAGAAACAAATTCGTGGATAGGTTCTCTAATTGCGACAGTGGTTGGAAATTTAAAAATTTCTATCAGTAATGTACATAT
ACGCTATGAGGACACAGTGAGCAACTCAGGACATCCATTTTGTTCTGGTATAACTTTGGCAAAGCTTGCTGCTGTGACAACTGATGAGCATGGTGTGGAAACTTTTGATACTAGTGGAGCATTAGACAGGCTACGCAAGTCATTGCAGCTTGAGCGTTTTGCAGTTTACCATGATTCTGATAGCGTCCCATGGAAGTTGG
ATAAGAGATTGGAAGAATTGACTGCTGATGAATGGAGCAAGATTTTTGAAGCTGGCATTCAAGAGTCAGAAAATGAGAGAAATTCAGTATCAAAATGGGCCCTAGGGCGCCAGTATTTGCTATATCCTATTAATGGAACTCTCAAGTATTATCGTTTTGGAAAGCAAGATAAGCGGGATCCAAGTGTTCCCTCTCAGAAA
ATGTCCCTCACTCTAAACGATGTGTCAGTGACAGTCTCAGAGGCTCAGTATTGTGATGGAATGAAACTATTGGAAGGAGTTTCAAGATATCGAACCCGCATTGAGGTCTCCCATTTCCGGCCATTGGTCTCCGTGTCTAAAGACACTCGAGTTTGGTGGCGTTATGCTTGTCAGGCAAGCCTACATCGGCAAAACAAAAT
GTGGCACCGTCTGTCATGGGAAAATGTTTCTCGTCTGTGTCAACATCGTAGGAAGTATGTTCGGCTTTATGCAGTGTATTTGCAACAAATACCCAGACTGGATAACAAAGAAATCAGAGAAATTGAGGAGGAGCTAGATGCAAAGGTTATCCTTCTATGGAGGCTACTTGCTCATGCCAGAGTTGAGAGTGCAAGATCAA
AGGAAATGGCCTTAGAGAGGGCACGTGCAAGGAAATCTAGTTGGTGGTCTTTTGGATGGCGGTCAACAGCATCAGACTCAAACCCATCTAATGCTTCTGAAGATTCGGAAGGGGTTACTGACATGCCACATCTAGGACAGTTGACAAAAGAGGAGTGGAAGAAGCTTAATGAACTTTTAAGCTACAATTCTGCAAAGAAC
TTCTTTCTGCTTTCTGATAAGGAGCCTCCAGACATGCTACAGTACTCCTTGGATGCTACTGTTGGGAAAAGTGCAGCTCGAATTGTAAACAACCAAAATTTGGAAATCATCTGTGGGAAGTTTGAGAGTCTTCATGTTGGTCTTAGAAGTTATCCCAAGAGCACTCATTGTGATACAAAACTGAAGTTATATGGTGTTTC
TGCTCCTGAAGGATCCCTTATACAGAGTGTCAGCAGTGAAGAGAAGGAATATGCACTTGCTGCTACATTTGTACACTCTCCTATTGGAGAAAACTTAGATTGGAAACTCTCTGCAACCGTGTCTCCTTGTCATGTCACGGTTTGGATGACAAGCTTTGAACGTTGTCTACAATTCCTGAGGAGGAGTAGTTCTGTCAGTC
CTGAGGTAGCATTGGAAACTGCAGCAGCTTTGCAGATGAAGTTGGAGAAAGTGACTCGACGAGCACAGGAACAATTTCAGCTTGTATTAAAAGAACAAAGCAGGTTTTCTCTTGACATTGATTTGGATGCTCCAATACTGAGACTTCCGTTTCAGAGAGCAGAGTGTTCTGGAAGTTGCAGTCAGCTTGTAGTAGATTTT
GGTCATTTTACATTGCGTACAGTGAACGAAGATGATGTTCATCCCCAAATACCAAGTCTTTACTCGCGGTTTCACATATCAGGAAGAGACACCGCTGCCTTTTTCATGGATGGAATCTTTGATTGGACAGAGCTTAAACATGTTTATCTAGACTCTGCACATATAATGAATAACTCTGAAGTACTTCCTAACCCAAAGAA
TCGATCTAAACTATTCCCCGTCCTTGACAAATGTGGCATGCTAGCTGTTATTGACCAGATTAAACTTCAGCACCCAAAATACCCTGCTACACGAGTTTCGATTCAAGTGCCAAACCTTGGCTTGCACTTTTCACCTTCAAGATATAGTAGGATTATGAATCTCTTAGCAATATTTGATGAGAGAGATGCGAGAAAGGATG
GATTAACTCCTGCAGATCTTGCAGGAGATGCTAGGGTTCTCTTTTGGGGGGGAATTGGTAATTCTATTGCCGAGTGGCAATCTTGTTGGCTAGTCCTTGATGGGTCTTACTTATATATCTTGGAGTCCAAAACATCTAAAACTTATCAGCGGTGCTGCAGCATGAGTGCTAGGCAAGTTATGGAGATCCCCCCAGCAAGT
GTTGGTGGATCAGAATTCACTGTTGCCATAAGCAACAGAGGCTTTGATATACAAAAGGCGTTGGAATCATCTAGCACCGTTATCCTGCAGTTCAAAGATGAAAATGCGAAGGCAGAATGGATGAAGTCTTTTGTTCATGCTACATATAAAGCATCTGCTCCTCTGTCCATGTGCATACCTGGAAATCTTAGTGGCAATGA
ATCTGAAGACGAAAGCTGTCAACCAGTGGTTGTGTCAGAAAAGATAAACTTGTCTGTTGTTGGTACTCTGGTTGAAATGAAACTTCTAATCTATGGGAAGGAAGAAGAGGAAAATGACAGAGTTGGTGAAGAAAGAATGCTTTTGGAACTATTTGCTGGTGGAGGCAAGGTGAACCTTATACAGCAGGAGAATGATTTGA
CTGTGAGGATGAAATTGCATTCCCTAAAGATAGAAGATAAGCTTCAAGGTTGTGTGTCTACAACATGCAAGTATATTGCTCGTTCTGTGCTGGAAAATGATAGTCAATATCTGGTTGAGGAGGTCGACGATAAATGTAGCACAGCATTAGTAGAAAACATTTCAGAGGAGGATGAGTTTTTTAAAGATGCATTGCCAGAT
TTTAGTTGCCCTTCTGACTATGCTTCTGTTCCCCAAAGCAACTTAAGCTCTTTCCCCTTAAAAGCAAGGGAAAATTCATCACATGACTTTGGAACCCCTGTTACAAATTCCAAATATGAACTTTTTGATTGGAATTTGGCCCTCGGAGAAGAACAAACTGAAGACGTAGATGTGTCTGATTTTGTGAGTGTTACATTTGT
TAGAAGGCAGCCCAATTCTCCCCACTATGATGGAACAGACACCCAGATGAGCATTCGCATGACAAAGCTTGATTTCTTCTGCAACAGACTTACTGTTGTTTCTTTGATTGACTTTGGCATGGAACTGAGTGAGTTAATGGAGGTCATAGATGAGAAAGCATCTCCACAGAATGATATGGCAGGTTATGCTGTTTTGCCAA
GTGAAAATAAAGAAGGCACTGATCGTTTATTTGTTAAAGGGCTATTGGGTACTGGAAAATCTAGAGTTGTGTTTCAGCTGAAGATGAATGTAGACAGTGTTTGTATTTTCCTTAACAAGGATGATGGTTCTCAGTTGGCCATGTTGGTACAAGAGAAGTTTCAGATGGATTTGAGAGTAAGTAGTTCTTGTATACTTGTA
ATTTTTACACTCCATCAAAATATCAGGATTAGTTGTTGGCTCTCTCTCCTATTCGACTTTGTATCACGTATGTTAGGTCTATTTAAT


>TRINITY_DN111659_c0_g1_i7 from sample A4 / Example unspliced isoform:
GTCTTTTGGAGGTGGCGTTTAGGAGATGTTTTGCATCGACTTTACTTGTTTCAAGTCGATTTTTACTTGAACCGGTATTGATTTTGTCTGCAGGCAACTGGTTTGCGGATGAAGCATTTTGTGGCATCCGTTGAGAAGTATTGAGCATTAGACGGCCCTGGCACAATGTTTGAAGCTCATGTTTTGCATTTGCTTCGTAG
ATATCTGGGAGAGTATGTGCACGGTCTTTCAACTGAGGCTTTGAAGATCAGTGTCTGGAAAGGTGATGTGGTATTAAGAGATTTGCATCTAAAGGCTGAGGCACTGAATGCTTTGAAGTTGCCCATTACAGTGAAAGCTGGCTTCCTGGGTTCTGTGACACTTAAGGTTCCTTGGAAGAGCCTCGGAAAAGAACCAGTTA
TTGTTCTCATTGACCGTGTGTTTGTACTTGCAGAACCAGCACAAGATGAATGCTCTTTCACGGATGAAGCAAAGGAAAGGCTTTTTGAAGCAAAACGACGAAAAATTGAGGAAGCAGAGGTGGCAATGCTGGAAGCAAAAGATAAGAGGAAAACAAAAATGGAAAATTCATCAGAAACAAATTCGTGGATAGGTTCTCTA
ATTGCGACAGTGGTTGGAAATTTAAAAATTTCTATCAGTAATGTACATATACGCTATGAGGACACAGTGAGCAACTCAGGACATCCATTTTGTTCTGGTATAACTTTGGCAAAGCTTGCTGCTGTGACAACTGATGAGCATGGTGTGGAAACTTTTGATACTAGTGGAGCATTAGACAGGCTACGCAAGTCATTGCAGCT
TGAGCGTTTTGCAGTTTACCATGATTCTGATAGCGTCCCATGGAAGTTGGATAAGAGATTGGAAGAATTGACTGCTGATGAATGGAGCAAGATTTTTGAAGCTGGCATTCAAGAGTCAGAAAATGAGAGAAATTCAGTATCAAAATGGGCCCTAGGGCGCCAGTATTTGCTATATCCTATTAATGGAACTCTCAAGTATT
ATCGTTTTGGAAAGCAAGATAAGCGGGATCCAAGTGTTCCCTCTCAGAAAATGTCCCTCACTCTAAACGATGTGTCAGTGACAGTCTCAGAGGCTCAGTATTGTGATGGAATGAAACTATTGGAAGGAGTTTCAAGATATCGAACCCGCATTGAGGTCTCCCATTTCCGGCCATTGGTCTCCGTGTCTAAAGACACTCGA
GTTTGGTGGCGTTATGCTTGTCAGGCAAGCCTACATCGGCAAAACAAAATGTGGCACCGTCTGTCATGGGAAAATGTTTCTCGTCTGTGTCAACATCGTAGGAAGTATGTTCGGCTTTATGCAGTGTATTTGCAACAAATACCCAGACTGGATAACAAAGAAATCAGAGAAATTGAGGAGGAGCTAGATGCAAAGGTTAT
CCTTCTATGGAGGCTACTTGCTCATGCCAGAGTTGAGAGTGCAAGATCAAAGGAAATGGCCTTAGAGAGGGCACGTGCAAGGAAATCTAGTTGGTGGTCTTTTGGATGGCGGTCAACAGCATCAGACTCAAACCCATCTAATGCTTCTGAAGATTCGGAAGGGGTTACTGACATGCCACATCTAGGACAGTTGACAAAAG
AGGAGTGGAAGAAGCTTAATGAACTTTTAAGCTACAATTCTGCAAAGAACTTCTTTCTGCTTTCTGATAAGGAGCCTCCAGACATGCTACAGTACTCCTTGGATGCTACTGTTGGGAAAAGTGCAGCTCGAATTGTAAACAACCAAAATTTGGAAATCATCTGTGGGAAGTTTGAGAGTCTTCATGTTGGTCTTAGAAGT
TATCCCAAGAGCACTCATTGTGATACAAAACTGAAGTTATATGGTGTTTCTGCTCCTGAAGGATCCCTTATACAGAGTGTCAGCAGTGAAGAGAAGGAATATGCACTTGCTGCTACATTTGTACACTCTCCTATTGGAGAAAACTTAGATTGGAAACTCTCTGCAACCGTGTCTCCTTGTCATGTCACGGTTTGGATGAC
AAGCTTTGAACGTTGTCTACAATTCCTGAGGAGGAGTAGTTCTGTCAGTCCTGAGGTAGCATTGGAAACTGCAGCAGCTTTGCAGgtaattgaagctaaaatcactgtctttgaagtttgaagagtttgttcagatgtaacacatttgaataatagttagttctataatgtttcctattagtcagcatctacctggcgag
ggttgcacaacatgaaagataatcttttatataattagatgtaatgtatgcttttgttataaattccttgcaagtttttcttatctatataatattttcacgtcctttaactctattttcagtgttcaccataaggtgttatttgagatattgtttatttgtacagtcatcataagtttttgttctattaatgtctgtat
tacctgtgaaaaatttacgaggatatgccctttgtggtggttgctccaaaaatagatgtccgtaatatattttacaaaatctggatagcctattgtttttattgccttctacatttacttttgagcacagATGAAGTTGGAGAAAGTGACTCGACGAGCACAGGAACAATTTCAGCTTGTATTAAAAGAACAAAGCAGGT
TTTCTCTTGACATTGATTTGGATGCTCCAATACTGAGACTTCCGTTTCAGAGAGCAGAGTGTTCTGGAAGTTGCAGTCAGCTTGTAGTAGATTTTGGTCATTTTACATTGCGTACAGTGAACGAAGATGATGTTCATCCCCAAATACCAAGTCTTTACTCGCGGTTTCACATATCAGGAAGAGACACCGCTGCCTTTTTC
ATGGATGGAATCTTTGATTGGACAGAGCTTAAACATGTTTATCTAGACTCTGCACATATAATGAATAACTCTGAAGTACTTCCTAACCCAAAGAATCGATCTAAACTGTTCCCTGTCCTTGACAAATGTGGCATGCTAGCTGTTATTGACCAGATTAAACTTCAGCACCCAAAATACCCTGCTACACGAGTTTCGATTCA
AGTGCCAAACCTTGGCTTGCACTTTTCACCTTCAAGATATAGTAGGATTATGAATCTCTTAGCAATATTTGATGAGAGAGATGCGAGAAAGGATGGATTAACTCCTGCAGATCTTGCAGGAGATGCTAGGGTTCTCTTTTGGGGGGGAATTGGTAATTCTATTGCCGAGTGGCAATCTTGTTGGCTAGTCCTTGATGGGT
CTTACTTATATATCTTGGAGTCCAAAACATCTAAAACTTATCAGCGGTGCTGCAGCATGAGTGCTAGGCAAGTTATGGAGATCCCCCCAGCAAGTGTTGGTGGATCAGAATTCACTGTTGCCATAAGCAACAGAGGCTTTGATATACAAAAGGCGTTGGAATCATCTAGCACCGTTATCCTGCAGTTCAAAGATGAAAAT
GCGAAGGCAGAATGGATGAAGTCTTTTGTTCATGCTACATATAAAGCATCTGCTCCTCTGTCCATGTGCATACCTGGAAATCTTAGTGGCAATGAATCTGAAGACGAAAGCTGTCAACCAGTGGTTGTGTCAGAAAAGATAAACTTGTCTGTTGTTGGTACTCTGGTTGAAATGAAACTTCTAATCTATGGGAAGGAAGA
AGAGGAAAATGACAGAGTTGGTGAAGAAAGAATGCTTTTGGAACTATTTGCTGGTGGAGGCAAGGTGAACCTTATACAGCAGGAGAATGATTTGACTGTGAGGATGAAATTGCATTCCCTAAAGATAGAAGATAAGCTTCAAGGTTGTGTGTCTACAACATGCAAGTATATTGCTCGTTCTGTGCTGGAAAATGATAGTC
AATATCTGGTTGAGGAGGTCGACGATAAATGTAGCACAGCATTAGTAGAAAACATTTCAGAGGAGGATGAGTTTTTTAAAGATGCATTGCCAGATTTTAGTTGCCCTTCTGACTATGCTTCTGTTCCCCAAAGCAACTTAAGCTCTTTCCCCTTAAAAGCAAGGGAAAATTCATCACATGACTTTGGAACCCCTGTTACA
AATTCCAAATATGAACTTTTTGATTGGAATTTGGCCCTCGGAGAAGAACAAACTGAAGACGTAGATGTGTCTGATTTTGTGAGTGTTACATTTGTTAGAAGGCAGCCCAATTCTCCCCACTATGATGGAACAGACACCCAGATGAGCATTCGCATGACAAAGCTTGATTTCTTCTGCAACAGACTTACTGTTGTTTCTTT
GATTGACTTTGGCATGGAACTGAGTGAGTTAATGGAGGTCATAGATGAGAAAGCATCTCCACAGAATGATATGGCAGGTTATGCTGTTTTGCCAAGTGAAAATAAAGAAGGCACTGATCGTTTATTTGTTAAAGGGCTATTGGGTACTGGAAAATCTAGAGTTGTGTTTCAGCTGAAGATGAATGTAGACAGTGTTTGTA
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