sp|Q65XA0|DHAR1_ORYSJ ----> Probable glutathione S-transferase DHAR1, cytosolic


Intron 1 GTAAGTTGTT ... TGTCCAACAG

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A924.112448174
A1024.95376145105



>TRINITY_DN99763_c0_g1_i6 from sample A4 / Example spliced isoform
TTAACCTAAACGTTCCCCACACGTCTGGGGCCTTACCGACTCTCTAACTCGTAACGTTCTGTTAGTTTAGTGACTTTAAATTTATCATGCCTTTCACATATTAAATGGCAGCAGAATAACCGTTAACTTTTTTCGTGTGTAAAAAATGCGGTTCAATAGGTTATTTTATTAATAGAAATGCGTAGAAAAGAAGTTTAAGA
TGGGGTTTTAGGGTAGGAGCTAGCTGTGAGGTTTTATGACTGATGTAATGAAGATCCAGCATCAATTTTGCATGTGGTAGATTGTTCCATTCAACACTAAGGTTGATTCCTGTAAATAATTACTATGAAGTTGTATGACTCATTCAAGTTGTATCACTGATTCAGTGAAGATCCACTGCAAAGGATAGATGCATCCAACA
CCAGGGCCAACTCCGACTCCTCGTAAATAACTGCTGTATAAAGTCATGAATAATGCTTAGCTCTACAACTAAGTTTGGTGGGCCTATCTATATTTGTCATCATCTAAGATTTTCTAATATTGGTGGCAACGTGTTCAAGCATAACCGTCACAACTCACCATGAACAAATCATGGGGATATGTGGAACCCAAATAAGGCAG
TACCGTTTCGGCCATTACTATTATCATACCCGCTGTTTGTTCGTGGCAATGTAAGAGATCGATGGCCGGCTTTTTGATAGTCAACCGGGATTGCGATTAGATTCGATCAAAATATACCGAAGTATGAGGGAGATGTTTACGATGATAAATTCTCCTTTCCCTTTTAATTCTCATCCCATTGCCTTTTAATGGCGGTGGAG
AGCGTGAGTGGAGAGGAGGGTACAGGCGGAGGTAATTTGAAGGTTGACGAACGAAGAAACCCTTTTCTTTAGCTGTTTAGAGAGGGTTTAAATTGTCGGAGCTGCAATCAGATTGTTTTCACGGTTTAGATTGGGGTTTATCGAAGACAAATTAATTGGGATGCAGCTTTATACAAGGGTGTTGTTCCTAGGTTCGGAAT
GTCGGGACTATGCAGCTCTAATAACCTTTCATAGTTGACAGACTACTGCAGCTTTAGTCTGCTTCACGAGCTCCGGTAAATCATCTCCAATCCTGATTCCCATACTTTTTCCATCAGATCCAAAGCTGGTCTGAGATGGGTTCCTGTTTTTCAAAGAAAAAGGATGACGCTGTGCCGTCCCACGCTGTAAAAGGCCAACC
TATGGTTAGGTTGTTTGGATCTGAATTATGTCCGTTTACATCACGTATTTCGATTGCTTTGCAATGTAAAGGTGTTGATGTGCATGTTGTGTGGCTAACTTCGGACGATGACGTGAGAGACAAGAAGTTGGAATTGCTTGCTTCCATAAGACCAGATGTAAAGTTGCCCATCCTTCAGTATGGGTTGGACACAATTGTTG
GGTCTTCTGATGCCATATTGCAGTACATTGAAGCAAAATTTCCGAATCCACGTTTGGTTCCAGATGGACCCATGGCTGATATCACTTTAGATTGGGTGGTTTATGTTCGGGATATTTTCTCACCATTAGTACTAGAACTTCTTTATAACAGTAATCCACTGGCGCGGCAGGAACTACAGCGGAAGCTTGAAACATCGTTT
GCAAGGTTGAATGGGGGAATTATGGAATACAGTAACAGGGGACCTTATTTCTTTGGTAATGTTTTTAGTCTGGCAGATGTATATCTTATCCCTTTTCTTTATCTGGCATTCCCCTTGCAGCATTTCAGAGGAATTGAAATCAGTCCAGTGCATTCTCACCTGGAGAATTATAGCAGAAAAATGTTGTCCTTTTCCTTTTA
TCACCCTGTTAAAATCGACATGGACTTGCTAGTGAGTTCTATTTCCAAAACCTTGGCTGAAAGGGCGCCCCCTTCACTTGTGACATTGACGGCTCTGCAACATAAGAGCATTCTGTGCCACATGGAGAAGCTCGTTCGCTTTGCAGATGAATTAGCTGTGTCCAAGAAAGAAGGGTTAAAGGGTATAGATTCTACCAGGG
GAAGTATTGCTATGCAAATAAAAAGGTTGTCGAAAAATTATGCACAGCTTGTGGATTTGATGCAGGAACACGCTCAAATGGAAGAACGAATTATTTTCCCTGCTCTAGAAAGGGCAGATAAAGGTATTACTCAACTTGCAAATGATGAACACGCACGAGATTTTCCAATAATGAATGGCATCCGTGAACAGCTGAAAACA
GTAACAGTTCTGGAAGCTGGTAGCCCAGATCGTAGTCAAGCTCTGCTTAGACTTTCTGTGAAGCTTAGGACATTGCAGGCTCACTGTATGGAACACTTTCAAGAAGAGGAGCAGAGTCTACTCCCTCTCCTAGAGGCTGCAGAATTGGGCAGTAGAGAACAAGAAGCCTTACTGAGTAGTTGTTTCAGTGTGATGGAATT
ATCTCACTCGCAACATTTTCCATATTTGTTGTCAGGGTTGCTTCCGCATGAAATTCAAGAATACTTGCAAGTAGCTCAACGGTGCCAGGAAAAAGAGAAGATCCAGGGAATGATTCAGTCACTTCGGTCAGCTGATGATGAATGTAAAACCCAATTGGCCATAGTGCAGAAAAGACTTCCCGCACTTATAGAGTCTGGTT
ACAGTGCTTCTTGACAGTAGTAGTGAACCGTTGGCATGCCACATATTTTATGGTAATCAGCTCAGTTCATCCGTGAATGGCATTTGAAATCCAGGTTGCGTTTCGTGGAATCAAGAACAAGGCAAAACAGAGTGCCTGATTTTCTCAATTAGGTTGAAGATTATGCACAATGTCATTTCATGGTATTTCAATTTATAGAC
AAAGCAACTAGTTAGCCAAAGAAGGTGCAAACAAGTTAAAGTTTATGTACGTGATAACTAAGTTGCTGATTCACCCTTGCTTTAGAAGGAGCCCTCAGGAGTCAGAACTGCCTATGATGTTTAATGTTGCAACCTTTTGTGATTTTGACTTTACATGGCATTGCCTTTAATCCTGACTTTCTAAGAAGCTCCATCCATAA
TATTGCCATTTTCCTATTGGTCCTTGCATAGTTCCCAATGATACCAAAATCTGAAAGCTTGTACTGATATCATGCTGCGGGGTTATCAAATGTGTCTTCACTCTGTTTTGCTTGATCACTTGTATACTATTCCAGTTTTGGTGGGAAAATTTCCACCTTTAGATATATTGTCTACTGTGAAGAGTGTATAGAGTTACATA
CTGCTACTGAAAATTTATATTCTAAGACTAGAAATTGTCTTGCTGTAAGGTTATATCAAGTCATTTATGGGTTCAACTTTCAACTTATAGGTTTGATACTCATGTATCAGTGCGATAATTCAGTATGAGCCAATAGTTATAATGGCTTTTAATTTAAGATGGTTTTGTTATGCTGTTTGATATGAATTATCATGTTATGT
TGCCGGTTCCACCTTCGGCTGATCTGGATCCGCTCAATATGTATTTCC


>TRINITY_DN99763_c0_g1_i3 from sample A4 / Example unspliced isoform:
TTAACCTAAACGTTCCCCACACGTCTGGGGCCTTACCGACTCTCTAACTCGTAACGTTCTGTTAGTTTAGTGACTTTAAATTTATCATGCCTTTCACATATTAAATGGCAGCAGAATAACCGTTAACTTTTTTCGTGTGTAAAAAATGCGGTTCAATAGGTTATTTTATTAATAGAAATGCGTAGAAAAGAAGTTTAAGA
TGGGGTTTTAGGGTAGGAGCTAGCTGTGAGGTTTTATGACTGATGTAATGAAGATCCAGCATCAATTTTGCATGTGGTAGATTGTTCCATTCAACACTAAGGTTGATTCCTGTAAATAATTACTATGAAGTTGTATGACTCATTCAAGTTGTATCACTGATTCAGTGAAGATCCACTGCAAAGGATAGATGCATCCAACA
CCAGGGCCAACTCCGACTCCTCGTAAATAACTGCTGTATAAAGTCATGAATAATGCTTAGCTCTACAACTAAGTTTGGTGGGCCTATCTATATTTGTCATCATCTAAGATTTTCTAATATTGGTGGCAACGTGTTCAAGCATAACCGTCACAACTCACCATGAACAAATCATGGGGATATGTGGAACCCAAATAAGGCAG
TACCGTTTCGGCCATTACTATTATCATACCCGCTGTTTGTTCGTGGCAATGTAAGAGATCGATGGCCGGCTTTTTGATAGTCAACCGGGATTGCGATTAGATTCGATCAAAATATACCGAAGTATGAGGGAGATGTTTACGATGATAAATTCTCCTTTCCCTTTTAATTCTCATCCCATTGCCTTTTAATGGCGGTGGAG
AGCGTGAGTGGAGAGGAGGGTACAGGCGGAGGTAATTTGAAGGTTGACGAACGAAGAAACCCTTTTCTTTAGCTGTTTAGAGAGGGTTTAAATTGTCGGAGCTGCAATCAGATTGTTTTCACGGTTTAGATTGGGGTTTATCGAAGACAAgtaagttgtttctctttcgaattctgcgtttcttccgctgtgttttggct
ctgtttcggtgtattttcataggattttgctcggctttgtttttttgtgatggttttcttccgtttctgtgcaatcgttctttctggtcggctttctgcttttgttttttcaattttgttctaaccttggagcttatgtttttgcctttttaattttgttttaacctcggaaattatggagaattttgcataatttttgt
ttttcaattttgttctaacctcggagcttatgtttttgcctttttaatttagttataacctcagaaattgcggagaattttgcagtagtttggtttatatattgcggccttcggataatttctgtgttttctcttccttcttctgctggatcactttataatacctattggacgtttttcttggttttttttccctaatg
tccgtgactgttttcttcaagaattatggtttaacgctcgatgttttgatttctcgcattttctcagtagtgataaacggttgatatttgtttgttttccttatgtttcagtatttagaggaattgtttcttatcctgttttattttaactaggttaagttcgtttatggtgcacctcgggtttcttgattatatttcat
tgtattctttgtccttacttgcgtgctttttagatttgtcttcactttatatttctgggccaatcttctgctaaaaaccgttgtaatttgagttcaattttagtttccttgcgaattttggtacaattttttgaatttgaagtcgaaatttgttcttagtctctcttgttcgttcctgggtattactggatcctttatcg
tggctttgcctttgccttccactgagttgaaagcttctgttagcacagctattgaggattttaagtattaattttatttttataaattctggtctcatttagtgttctgtctctttatttttgacggtgtcattctattttctacgaacttagtcttttctttaactggaacatttgatagtcctttctaaagtaagttt
tattgaacatatcgctcaatttctaactatgttagaataaggcctgagtatttcttctaacgaatgtaatatttattgaacgtttcgatcagtttggttttatatttgttgctgtttgacctttgtctttgattgtgtttgtccaacagATTAATTGGGATGCAGCTTTATACAAGGGTGTTGTTCCTAGGTTCGGAATG
TCGGGACTATGCAGCTCTAATAACCTTTCATAGTTGACAGACTACTGCAGCTTTAGTCTGCTTCACGAGCTCCGGTAAATCATCTCCAATCCTGATTCCCATACTTTTTCCATCAGATCCAAAGCTGGTCTGAGATGGGTTCCTGTTTTTCAAAGAAAAAGGATGACGCTGTGCCGTCCCACGCTGTAAAAGGCCAACCT
ATGGTTAGGTTGTTTGGATCTGAATTATGTCCGTTTACATCACGTATTTCGATTGCTTTGCAATGTAAAGGTGTTGATGTGCATGTTGTGTGGCTAACTTCGGACGATGACGTGAGAGACAAGAAGTTGGAATTGCTTGCTTCCATAAGACCAGATGTAAAGTTGCCCATCCTTCAGTATGGGTTGGACACAATTGTTGG
GTCTTCTGATGCCATATTGCAGTACATTGAAGCAAAATTTCCGAATCCACGTTTGGTTCCAGATGGACCCATGGCTGATATCACTTTAGATTGGGTGGTTTATGTTCGGGATATTTTCTCACCATTAGTACTAGAACTTCTTTATAACAGTAATCCACTGGCGCGGCAGGAACTACAGCGGAAGCTTGAAACATCGTTTG
CAAGGTTGAATGGGGGAATTATGGAATACAGTAACAGGGGACCTTATTTCTTTGGTAATGTTTTTAGTCTGGCAGATGTATATCTTATCCCTTTTCTTTATCTGGCATTCCCCTTGCAGCATTTCAGAGGAATTGAAATCAGTCCAGTGCATTCTCACCTGGAGAATTATAGCAGAAAAATGTTGTCCTTTTCCTTTTAT
CACCCTGTTAAAATCGACATGGACTTGCTAGTGAGTTCTATTTCCAAAACCTTGGCTGAAAGGGCGCCCCCTTCACTTGTGACATTGACGGCTCTGCAACATAAGAGCATTCTGTGCCACATGGAGAAGCTCGTTCGCTTTGCAGATGAATTAGCTGTGTCCAAGAAAGAAGGGTTAAAGGGTATAGATTCTACCAGGGG
AAGTATTGCTATGCAAATAAAAAGGTTGTCGAAAAATTATGCACAGCTTGTGGATTTGATGCAGGAACACGCTCAAATGGAAGAACGAATTATTTTCCCTGCTCTAGAAAGGGCAGATAAAGGTATTACTCAACTTGCAAATGATGAACACGCACGAGATTTTCCAATAATGAATGGCATCCGTGAACAGCTGAAAACAG
TAACAGTTCTGGAAGCTGGTAGCCCAGATCGTAGTCAAGCTCTGCTTAGACTTTCTGTGAAGCTTAGGACATTGCAGGCTCACTGTATGGAACACTTTCAAGAAGAGGAGCAGAGTCTACTCCCTCTCCTAGAGGCTGCAGAATTGGGCAGTAGAGAACAAGAAGCCTTACTGAGTAGTTGTTTCAGTGTGATGGAATTA
TCTCACTCGCAACATTTTCCATATTTGTTGTCAGGGTTGCTTCCGCATGAAATTCAAGAATACTTGCAAGTAGCTCAACGGTGCCAGGAAAAAGAGAAGATCCAGGGAATGATTCAGTCACTTCGGTCAGCTGATGATGAATGTAAAACCCAATTGGCCATAGTGCAGAAAAGACTTCCCGCACTTATAGAGTCTGGTTA
CAGTGCTTCTTGACAGTAGTAGTGAACCGTTGGCATGCCACATATTTTATGGTAATCAGCTCAGTTCATCCGTGAATGGCATTTGAAATCCAGGTTGCGTTTCGTGGAATCAAGAACAAGGCAAAACAGAGTGCCTGATTTTCTCAATTAGGTTGAAGATTATGCACAATGTCATTTCATGGTATTTCAATTTATAGACA
AAGCAACTAGTTAGCCAAAGAAGGTGCAAACAAGTTAAAGTTTATGTACGTGATAACTAAGTTGCTGATTCACCCTTGCTTTAGAAGGAGCCCTCAGGAGTCAGAACTGCCTATGATGTTTAATGTTGCAACCTTTTGTGATTTTGACTTTACATGGCATTGCCTTTAATCCTGACTTTCTAAGAAGCTCCATCCATAAT
ATTGCCATTTTCCTATTGGTCCTTGCATAGTTCCCAATGATACCAAAATCTGAAAGCTTGTACTGATATCATGCTGCGGGGTTATCAAATGTGTCTTCACTCTGTTTTGCTTGATCACTTGTATACTATTCCAGTTTTGGTGGGAAAATTTCCACCTTTAGATATATTGTCTACTGTGAAGAGTGTATAGAGTTACATAC
TGCTACTGAAAATTTATATTCTAAGACTAGAAATTGTCTTGCTGTAAGGTTATATCAAGTCATTTATGGGTTCAACTTTCAACTTATAGGTTTGATACTCATGTATCAGTGCGATAATTCAGTATGAGCCAATAGTTATAATGGCTTTTAATTTAAGATGGTTTTGTTATGCTGTTTGATATGAATTATCATGTTATGTT
GCCGGTTCCACCTTCGGCTGATCTGGATCCGCTCAATATGTATTTCC



Intron 2 GTGTTTCTCT ... TTCATGGCAG

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A619.523018957
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>TRINITY_DN122069_c1_g1_i9 from sample A2 / Example spliced isoform
CGCGAAATAAAATTGTGTAGAAATAAAACTCCCTTTGGACGCTCAATTGTCTGTCTCTTTGCTTTGCTTCTACGAAGGGTTTCAGTTGCTTGTATCCATCAAAGCTCGGCTTCTGTACTTGTGTTTTGTTCGGGAAGAAATCGCATTGCATTGAGATCTATTTGAGAATACCAGGCTTCAGAATTTGTTTAGGTTTATCA
GTTGCACATATCAATATAGGTCGGTCAAGAAAGTGCTGATCCGGAGTCAATCTTGATCCAATCCAAGTTCAGGGTTTCTCATATAGGATATTGAAATGATGTAAATAACAATTAATTGGGATGCAGCTTTATACAAGGGTGTTGTTCCTAGGTTCGGAATGTCGGGACTATGCAGCTCTAATAACCTTTCATAGTTGACA
GACTACTGCAGCTTTAGTCTGCTTCACGAGCTCCGGTAAATCATCTCCAATCCTGATTCCCATACTTTTTCCATCAGATCCAAAGCTGGTCTGAGATGGGTTCCTGTTTTTCAAAGAAAAAGGATGACGCTGTGCCGTCCCACGCTGTAAAAGGCCAACCTATGGTTAGGTTGTTTGGATCTGAATTATGTCCGTTTACA
TCACGTATTTCGATTGCTTTGCAATGTAAAGGTGTTGATGTGCATGTTGTGTGGCTAACTTCGGACGATGACGTGAGAGACAAGAAGTTGGAATTGCTTGCTTCCATAAGACCAGATGTAAAGTTGCCCATCCTTCAGTATGGGTTGGACACAATTGTTGGGTCTTCTGATGCCATATTGCAGTACATTGAAGCAAAATT
TCCGAATCCACGTTTGGTTCCAGATGGACCCATGGCTGATATCACTTTAGATTGGGTGGTTTATGTTCGGGATATTTTCTCACCATTAGTACTAGAACTTCTTTATAACAGTAATCCACTGGCGCGGCAGGAACTACAGCGGAAGCTTGAAACATCGTTTGCAAGGTTGAATGGGGGAATTATGGAATACAGTAACAGGG
GACCTTATTTCTTTGGTAATGTTTTTAGTCTGGCAGATGTATATCTTATCCCTTTTCTTTATCTGGCATTCCCCTTGCAGCATTTCAGAGGAATTGAAATCAGTCCAGTGCATTCTCACCTGGAGAATTATAGCAGAAAAATGTTGTCCTTTTCCTTTTATCACCCTGTTAAAATCGACATGGACTTGCTAGTGAGTTCT
ATTTCCAAAACCTTGGCTGAAAGGGCGCCCCCTTCACTTGTGACATTGACGGCTCTGCAACATAAGAGCATTCTGTGCCACATGGAGAAGCTCGTTCGCTTTGCAGATGAATTAGCTGTGTCCAAGAAAGAAGGGTTAAAGGGTATAGATTCTACCAGGGGAAGTATTGCTATGCAAATAAAAAGGTTGTCGAAAAATTA
TGCACAGCTTGTGGATTTGATGCAGGAACACGCTCAAATGGAAGAACGAATTATTTTCCCTGCTCTAGAAAGGGCAGATAAAGGTATTACTCAACTTGCAAATGATGAACACGCACGAGATTTTCCAATAATGAATGGCATCCGTGAACAGCTGAAAACAGTAACAGTTCTGGAAGCTGGTAGCCCAGATCGTAGTCAAG
CTCTGCTTAGACTTTCTGTGAAGCTTAGGACATTGCAGGCTCACTGTATGGAACACTTTCAAGAAGAGGAGCAGAGTCTACTCCCTCTCCTAGAGGCTGCAGAATTGGGCAGTAGAGAACAAGAAGCCTTACTGAGTAGTTGTTTCAGTGTGATGGAATTATCTCACTCGCAACATTTTCCATATTTGTTGTCAGGGTTG
CTTCCGCATGAAATTCAAGAATACTTGCAAGTAGCTCAACGGTGCCAGGAAAAAGAGAAGATCCAGGGAATGATTCAGTCACTTCGGTCAGCTGATGATGAATGTAAAACCCAATTGGCCATAGTGCAGAAAAGACTTCCCGCACTTATAGAGTCTGGTTACAGTGCTTCTTGACAGTAGTAGTGAACCGTTGGCATGCC
ACATATTTTATGGTAATCAGCTCAGTTCATCCGTGAATGGCATTTGAAATCCAGGTTGCGTTTCGTGGAATCAAGAACAAGGCAAAACAGAGTGCCTGATTTTCTCAATTAGGTTGAAGATTATGCACAATGTCATTTCATGGTATTTCAATTTATAGACAAAGCAACTAGTTAGCCAAAGAAGGTGCAAACAAGTTAAA
GTTTATGTACGTGATAACTAAGTTGCTGATTCACCCTTGCTTTAGAAGGAGCCCTCAGGAGTCAGAACTGCCTATGATGTTTAATGTTGCAACCTTTTGTGATTTTGACTTTACATGGCATTGCCTTTAATCCTGACTTTCTAAGAAGCTCCATCCATAATATTGCCATTTTCCTATTGGTCCTTGCATAGTTCCCAATG
ATACCAAAATCTGAAAGCTTGTACTGATATCATGCTGCGGGGTTATCAAATGTGTCTTCACTCTGTTTTGCTTGATCACTTGTATACTATTCCAGTTTTGGTGGGAAAATTTCCACCTTTAGATATATTGTCTACTGTGAAGAGTGTATAGAGTTACATACTGCTACTGAAAATTTATATTCTAAGACTAGAAATTGTCT
TGCTGTAAGGTTATATCAAGTCATTTATGGGTTCAACTTTCAACTTATAGGTTTGATACTCATGTATCAGTGCGATAATTCAGTATGAGCCAATAGTTATAATGGCT


>TRINITY_DN122069_c1_g1_i3 from sample A2 / Example unspliced isoform:
TTTTGATTTTTTCCTTTTTAACCTAAACGTTCCCCACACGTCTGGGGCCTTACCGACTCTCTAACTCGTAACGTTCTGTTAGTTTAGTGACTTTAAATTTATCATGCCTTCCACATATTAAATGGCAGCAGAATAACCGTTAACTTTTTTCGTGTGTAAAAAATGCGGTTCAATAGGTTATTTTATTAATAGAAATGCGT
AGAAAAGAAGTTTAAGATGGGGTTTTAGGGTAGGAGCTAGCTGTGAGGTTTTATGACTGATGTAATGAAGATCCAGCATCAATTTTGCATGTGGTAGATTGTTCCATTCAACACTAAGGTTGATTCCTGTAAATAATTACTATGAAGTTGTATGACTCATTCAAGTTGTATCACTGATTCAGTGAAGATCCACTGCAAAG
GATAGATGCATCCAACACCAGGGCCAACTCCGACTCCTCGTAAATAATTGCTGTATAAAGTCATGAATAATGCTTAGCTCTACAACTAAGTTTGGTGGGCCTATCTATATTTGTCATCATCTAAGATTTTCTAATATTGGTGGCAACGTGTTCAAGCATAACCGTCACAACTCACCATGAACAAATCATGGGGATATGTG
GAACCCAAATAAGGCAGTACCGTTTCGGCCATTACTATTATCATACCCGCTGTTTGTTCGTGGCAATGTAAGAGATCGATGGCCGGCTTTTTGATAGTCAACCGGGATTGCGATTAGATTCGATCAAAATATACCGAAGTATGAGGGAGATGTTTACGATGATAAATTCTCCTTTCCCTTTTAATTCTCATCCCATTGCC
TTTTAATGGCGGTGGAGAGCGTGAGTGGAGAGGAGGGTACAGGCGGAGGTAATTTGAAGGTTGACGAACGAAGAAACCCTTTTCTTTAGCTGTTTAGAGAGGGTTTAAATTGTCGGAGCTGCAATCAGATTGTTTTCACGGTTTAGATTGGGGTTTATCGAAGACAAATTAATTGGGATGCAGCTTTATACAAGGGTGTT
GTTCCTAGGTTCGGAATGTCGGGACTATGCAGCTCTAATAACCTTTCATAGTTGACAGACTACTGCAGCTTTAGTCTGCTTCACGAGCTCCGGTAAATCATCTCCAATCCTGATTCCCATACTTTTTCCATCAGATCCAAAGCTGGTCTGAGATGGGTTCCTGTTTTTCAAAGAAAAAGGATGACGCTGTGCCGTCCCAC
GCTGTAAAAGGCCAACCTATGGTTAGGTTGTTTGGATCTGAATTATGTCCGTTTACATCACGTATTTCGATTGCTTTGCAATGTAAAGGTGTTGATGTGCATGTTGTGTGGCTAACTTCGGACGATGACGTGAGAGACAAGAAGTTGGAATTGCTTGCTTCCATAAGACCAGATGTAAAGTTGCCCATCCTTCAGTATGG
GTTGGACACAATTGTTGGGTCTTCTGATGCCATATTGCAGTACATTGAAGCAAAATTTCCGAATCCACGTTTGGTTCCAGATGGACCCATGGCTGATATCACTTTAGATTGGGTGGTTTATGTTCGGGATATTTTCTCACCATTAGTACTAGAACTTCTTTATAACAGTAATCCACTGGCGCGGCAGGAACTACAGCGGA
AGCTTGAAACATCGTTTGCAAGGTTGAATGGGGGAATTATGGAATACAGTAACAGGGGACCTTATTTCTTTGGTAATGTTTTTAGTCTGGCAGATGTATATCTTATCCCTTTTCTTTATCTGGCATTCCCCTTGCAGCATTTCAGAGGAATTGAAATCAGTCCAGTGCATTCTCACCTGGAGAATTATAGCAGAAAAATG
TTGTCCTTTTCCTTTTATCACCCTGTTAAAATCGACATGGACTTGCTAGTGAGTTCTATTTCCAAAACCTTGGCTGAAAGGGCGCCCCCTTCACTTGTGACATTGACGGCTCTGCAACATAAGAGCATTCTGTGCCACATGGAGAAGCTCGTTCGCTTTGCAGATGAATTAGCTGTGTCCAAGAAAGAAGGGTTAAAGGG
TATAGATTCTACCAGGGGAAGTATTGCTATGCAAATAAAAAGGTTGTCGAAAAATTATGCACAGCTTGTGGATTTGATGCAGGAACACGCTCAAATGGAAGAACGAATTATTTTCCCTGCTCTAGAAAGGGCAGATAAAGGTATTACTCAACTTGCAAATGATGAACACGCACGAGATTTTCCAATAATGAATGGCATCC
GTGAACAGCTGAAAACAGTAACAGTTCTGGAAGCTGGTAGCCCAGATCGTAGTCAAGCTCTGCTTAGACTTTCTGTGAAGCTTAGGACATTGCAGgtgtttctctcttctacatcaatccttgcttggtggctacgcgtgttcttagctgtaggattgtactatttatttctgttattgagcctcagaattagttgttat
ctggtccaaatgcattttgtagctgtagcactacctgacagtgcaatgattcatggcagGCTCACTGTATGGAACACTTTCAAGAAGAGGAGCAGAGTCTACTCCCTCTCCTAGAGGCTGCAGAATTGGGCAGTAGAGAACAAGAAGCCTTACTGAGTAGTTGTTTCAGTGTGATGGAATTATCTCACTCGCAACATTTT
CCATATTTGTTGTCAGGGTTGCTTCCGCATGAAATTCAAGAATACTTGCAAGTAGCTCAACGGTGCCAGGAAAAAGAGAAGATCCAGGGAATGATTCAGTCACTTCGGTCAGCTGATGATGAATGTAAAACCCAATTGGCCATAGTGCAGAAAAGACTTCCCGCACTTATAGAGTCTGGTTACAGTGCTTCTTGACAGTA
GTAGTGAACCGTTGGCATGCCACATATTTTATGGTAATCAGCTCAGTTCATCCGTGAATGGCATTTGAAATCCAGGTTGCGTTTCGTGGAATCAAGAACAAGGCAAAACAGAGTGCCTGATTTTCTCAATTAGGTTGAAGATTATGCACAATGTCATTTCATGGTATTTCAATTTATAGACAAAGCAACTAGTTAGCCAA
AGAAGGTGCAAACAAGTTAAAGTTTATGTACGTGATAACTAAGTTGCTGATTCACCCTTGCTTTAGAAGGAGCCCTCAGGAGTCAGAACTGCCTATGATGTTTAATGTTGCAACCTTTTGTGATTTTGACTTTACATGGCATTGCCTTTAATCCTGACTTTCTAAGAAGCTCCATCCATAATATTGCCATTTTCCTATTG
GTCCTTGCATAGTTCCCAATGATACCAAAATCTGAAAGCTTGTACTGATATCATGCTGCGGGGTTATCAAATGTGTCTTCACTCTGTTTTGCTTGATCACTTGTATACTATTCCAGTTTTGGTGGGAAAATTTCCACCTTTAGATATATTGTCTACTGTGAAGAGTGTATAGAGTTACATACTGCTACTGAAAATTTATA
TTCTAAGACTAGAAATTGTCTTGCTGTAAGGTTATATCAAGTCATTTATGGGTTCAACTTTCAACTTATAGGTTTGATACTCATGTATCAGTGCGATAATTCAGTATGAGCCAATAGTTATAATGGCT



Intron 3 GTAAATATTG ... ATTTTTGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
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A108.39874214.780



>TRINITY_DN120449_c0_g2_i5 from sample A1 / Example spliced isoform
TGCGGTTCAATAGGTTATTTTATTAATAGAAATGCGTAGAAAAGAAGTTTAAGATGGGGTTTTAGGGTAGGAGCTAGCTGTGAGGTTTTATGACTGATGTAATGAAGATCCAGCATCAATTTTGCATGTGGTAGATTGTTCCATTCAACACTAAGGTTGATTCCTGTAAATAATTACTATGAAGTTGTATGACTCATTCA
AGTTGTATCACTGATTCAGTGAAGATCCACTGCAAAGGATAGATGCATCCAACACCAGGGCCAACTCCGACTCCTCGTAAATAATTGCTGTATAAAGTCATGAATAATGCTTAGCTCTACAACTAAGTTTGGTGGGCCTATCTATATTTGTCATCATCTAAGATTTTCTAATATTGGTGGCAACGTGTTCAAGCATAACC
GTCACAACTCACCATGAACAAATCATGGGGATATGTGGAACCCAAATAAGGCAGTACCGTTTCGGCCATTACTATTATCATACCCGCTGTTTGTTCGTGGCAATGTAAGAGATCGATGGCCGGCTTTTTGATAGTCAACCGGGATTGCGATTAGATTCGATCAAAATATACCGAAGTATGAGGGAGATGTTTACGATGAT
AAATTCTCCTTTCCCTTTTAATTCTCATCCCATTGCCTTTTAATGGCGGTGGAGAGCGTGAGTGGAGAGGAGGGTACAGGCGGAGGTAATTTGAAGGTTGACGAACGAAGAAACCCTTTTCTTTAGCTGTTTAGAGAGGGTTTAAATTGTCGGAGCTGCAATCAGATTGTTTTCACGGTTTAGATTGGGGTTTATCGAAG
ACAAATTAATTGGGATGCAGCTTTATACAAGGGTGTTGTTCCTAGGTTCGGAATGTCGGGACTATGCAGCTCTAATAACCTTTCATAGTTGACAGACTACTGCAGCTTTAGTCTGCTTCACGAGCTCCGGTAAATCATCTCCAATCCTGATTCCCATACTTTTTCCATCAGATCCAAAGCTGGTCTGAGATGGGTTCCTG
TTTTTCAAAGAAAAAGGATGACGCTGTGCCGTCCCACGCTGTAAAAGGCCAACCTATGGTTAGGTTGTTTGGATCTGAATTATGTCCGTTTACATCACGTATTTCGATTGCTTTGCAATGTAAAGGTGTTGATGTGCATGTTGTGTGGCTAACTTCGGACGATGACGTGAGAGACAAGAAGTTGGAATTGCTTGCTTCCA
TAAGACCAGATGTAAAGTTGCCCATCCTTCAGTATGGGTTGGACACAATTGTTGGGTCTTCTGATGCCATATTGCAGTACATTGAAGCAAAATTTCCGAATCCACGTTTGGTTCCAGATGGACCCATGGCTGATATCACTTTAGATTGGGTGGTTTATGTTCGGGATATTTTCTCACCATTAGTACTAGAACTTCTTTAT
AACAGTAATCCACTGGCGCGGCAGGAACTACAGCGGAAGCTTGAAACATCGTTTGCAAGGTTGAATGGGGGAATTATGGAATACAGTAACAGGGGACCTTATTTCTTTGGTAATGTTTTTAGTCTGGCAGATGTATATCTTATCCCTTTTCTTTATCTGGCATTCCCCTTGCAGCATTTCAGAGGAATTGAAATCAGTCC
AGTGCATTCTCACCTGGAGAATTATAGCAGAAAAATGTTGTCCTTTTCCTTTTATCACCCTGTTAAAATCGACATGGACTTGCTAGTGAGTTCTATTTCCAAAACCTTGGCTGAAAGGGCGCCCCCTTCACTTGTGACATTGACGGCTCTGCAACATAAGAGCATTCTGTGCCACATGGAGAAGCTCGTTCGCTTTGCAG
ATGAATTAGCTGTGTCCAAGAAAGAAGGGTTAAAGGGTATAGATTCTACCAGGGGAAGTATTGCTATGCAAATAAAAAGGTTGTCGAAAAATTATGCACAGCTTGTGGATTTGATGCAGGAACACGCTCAAATGGAAGAACGAATTATTTTCCCTGCTCTAGAAAGGGCAGATAAAGGTATTACTCAACTTGCAAATGAT
GAACACGCACGAGATTTTCCAATAATGAATGGCATCCGTGAACAGCTGAAAACAGTAACAGTTCTGGAAGCTGGTAGCCCAGATCGTAGTCAAGCTCTGCTTAGACTTTCTGTGAAGCTTAGGACATTGCAGGCTCACTGTATGGAACACTTTCAAGAAGAGGAGCAGAGTCTACTCCCTCTCCTAGAGGCTGCAGAATT
GGGCAGTAGAGAACAAGAAGCCTTACTGAGTAGTTGTTTCAGTGTGATGGAATTATCTCACTCGCAACATTTTCCATATTTGTTGTCAGGGTTGCTTCCGCATGAAATTCAAGAATACTTGCAAGTAGCTCAACGGTGCCAGGAAAAAGAGAAGATCCAGGGAATGATTCAGTCACTTCGGTCAGCTGATGATGAATGTA
AAACCCAATTGGCCATAGTGCAGAAAAGACTTCCCGCACTTATAGAGTCTGGTTACAGTGCTTCTTGACAGTAGTAGTGAACCGTTGGCATGCCACATATTTTATGGTAATCAGCTCAGTTCATCCGTGAATGGCATTTGAAATCCAGGTTGCGTTTCGTGGAATCAAGAACAAGGCAAAACAGAGTGCCTGATTTTCTC
AATTAGGTTGAAGATTATGCACAATGTCATTTCATGGTATTTCAATTTATAGACAAAGCAACTAGTTAGCCAAAGAAGGTGCAAACAAGTTAAAGTTTATGTACGTGATAACTAAGTTGCTGATTCACCCTTGCTTTAGAAGGAGCCCTCAGGAGTCAGAACTGCCTATGATGTTTAATGTTGCAACCTTTTGTGATTTT
GACTTTACATGGCATTGCCTTTAATCCTGACTTTCTAAGAAGCTCCATCCATAATATTGCCATTTTCCTATTGGTCCTTGCATAGTTCCCAATGATACCAAAATCTGAAAGCTTGTACTGATATCATGCTGCGGGGTTATCAAATGTGTCTTCACTCTGTTTTGCTTGATCACTTGTATACTATTCCAGTTTTGGTGGGA
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>TRINITY_DN120449_c0_g2_i1 from sample A1 / Example unspliced isoform:
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