sp|Q8LA32|LUL4_ARATH ----> Probable E3 ubiquitin-protein ligase LUL4
Intron 1 GTACATGATC ... CTTTATTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 15.45 | 52 | 1 | 18 |
| A2 | 13.95 | 37 | 7 | 5 |
| A3 | 10.42 | 43 | 5 | 5 |
| A4 | 16.81 | 47 | 10 | 9 |
| A5 | 10.2 | 22 | 5 | 0 |
| A6 | 25 | 6 | 1 | 3 |
| A7 | 15.79 | 32 | 5 | 7 |
| A8 | 24.53 | 20 | 11 | 2 |
| A9 | 16.67 | 25 | 6 | 4 |
| A10 | 0 | 19 | 0 | 0 |
>TRINITY_DN40130_c0_g1_i1 from sample A8 / Example spliced isoformGTCATGATTCAAAGAATGCTTCCCTATGCTTTCTACAACCTCAAGTTCGTGACTTATTTGAGAATGAACAGAAGGCAAAGTCAGTTGTGTTGGGTACCTCAGCGATTGATCATACTCATGTCTTTCTCAAGGAAAGCTGCAGAAAAGCATCCTCTAAATTCAATTCCACTGAAAAAGAAAGTTTAATGGCATCAGTATCA
AAATGTAATGGTGAACTGCCTTGTGGTGCTGTTGTGGGAAAATCTATTGATAGCCATGCTGATAATACTTGTAGTCAGTGTACCGCAGAAGAAAGCTGCCAATTGGAAAGTTCAGAGAATTCACACAGAATTCACATGTCATCTTTTTCTTGTCAAGAGAAAGCTTTAGTCTCAAAGATTGAAGAGACCATGCATCCCAG
ACAACAACATTTCCATGCTTTTATTGATATCGTTTTGTCACAGGCTACATCGGCCATATCTCTAATATCTGAAGCTATTGCATTAGATATTAATGATACACAAGCTAATGATGATACATGCAGTACTGTTTCCGATCAACATTCTAAGGCTTCACCTAGGCTGTTTGGAAACAAGTTCACTAATGTGAAATTTCAGTGTG
GAGGTGGTTCAACTAAGTCAGTTGTCTCAATCAGACACAGTTGGTTTGCAGCTCTTGGTGTTCTTGGAGATGTATTTTGTGATCTTGCAAAGCATCTAGAAAGTTTTGCTGGATGTGGGCTAGCTGACAGGTCCATATTAAAAGATGATATTGGGCAGCCATGGAAAGCAAGTGATAACAGTTTCAAAATGTTAAATAAG
CATCTGGACTTGAGAAGTCGCTTTATATCAAAAGATGATTCACACACACATGAAGAAATGCACGATAAGCCATGGTGGGAAGCTTTGTCATCAGAAAAACACTGCACAGGGCTTCCTTTATTGCTGAAGACTGCTATAATGGCTGTTCTAAGTGCATTATCCAAGATTGAAGATGTTGACACTGTTATTTGGTCTCTTCA
AGCTCTTCCCAATCTCTATACTGCATGGGGGACTGTGTGTATAGGCATATCAGCAGTGGAAAATCATCAAGAAATTAAGAAGACCTTATGGGGTGATGGTGATGTGGGTGTGAAAAAACTAGTTGATCTCCTTAGCCATTGGACTGAACAGAACAGATTGGACGTGATGATCTTTGCCCTTCATGCTATTTACTGTGCAA
GTAACTCTATAGCCACAGTCTGTGAAATAGAGGATGTTTTTGGGCTTTCCCAGTGTGGTATGCAGGCTGTCCTTGGTGCTCTGCAGAAAGCTTTGAGCCCTAGTGTTAGTATACAACAAAGGAGAAAGCTAATACAACTATCATGCTATGTCTTGAGTGCTATTTGCAGCTATAGTGTTCGTTCACAATTTTCTTTTGCT
ATAAGTGGTGGAGCAGATTTAGTTATTGCAGCTTTGGTTCGCTATGGTGATGATGAACAGACATATGCAAGTGGATTACAAGCACTTGGCATTGATCCCCAGTCGAAAACTAATTTTAGTAAATTACTGAATGCTGCAGTCTCAAGAAATATGACAGGTAGCAGTGGAAAATCTGGTAGGCGGAAAAAGAGTGGCTCCAC
TGCAGGCAATGGTACAATAGGGCTTAAACATGTTTTCAAGGAATCCACTGTTATTGGATCATCCTCAGCATCAAAACTCCCTAGTAAATCTGACTTCAAGGATGGCAATGAAAGCGGGCGATATAAGAAAGAGAAATGGACACCTCAGTTAGAAAAGCTGTTTAGTAATGGGAAAGAACAAATGGGTGTTTTACAGACAT
TGCTTATTGCAAGTCCGGGTTGTGGGGGTCTTCTGTTTGCTGTAGAGTTGCTAAAGAGCCTCAATGAGGAATCCCAAAGGGGAATAATAGCTGCTGAGGCACAAGCTCATGTTTGCATAGTGATTAGCTACATGGCAGATAGTGATTCAAATTGGCGTAAGGAGCTCATTAATGAAGGAGCTATTGAGGCTGTTTTGCTG
ACTATGGGATTTGCATTCAGGTGGAGGGATGAAGAAATTTATAGTTTTCACATGATTCGTGATGGAGTGGAGATCTACATGGAACCTGGTCTGGAAATAAAAAAAAATGCTTCAGAGGCACTCTCTATAGATAGGGGAAACCAGGTCTCTTCTGATTGTTCAGGTGAAGCAATGATTAGCGAGAAAAAAGTTTTGCTAGA
TGCATCAGTACAATGTGCAGCATGTTGGGCTCTTGCGAACTTGGCAAAGGATCATGGGAGTTGCTTCTCTACTGAATCACTTAATATGATTCAGGCAGTTGCAGCTGCTCTTCGCAGATATGGAGGGCTAACTCATCGAACTTCTGGTTCAACCACAGTTCTATCACATACCGAGGTTTGCATACCTGCCAGACTAGTCC
TTGCACGGCTTGGTGTTACAAGGATTGATAATCAGCTTCTATCTCACAAGGCACTGGAGGCAGGCGACATTATGTGTCTTGGGGCGCTTGTGAGCAAAGGTGTAGACATATCTGTACCAGATGATTCTGGGCGAACAGCATTATGGTATGCTGAAAAATCTGGACACACCCATATTTTGCATTATGTAAGGACATATGGT
CATTCTCATGGAAGGAAAAGAGCTAGGGGAAAGACAATATCAAAATGTAAACATGGCAATCAGCAAGAAAGGCAGCATGAAAATATAAATTCTTCTGTGAATCAGGATATTGGAAATGCTCAACTAGAAGAGATTGAGAATTTGCAAAATGAACATATTTTGAACACTGCCTCTTGTATATCCAATGTATCCACAAAGAA
TTCTGAACAATCTGAGTTGAAAACAGAAGCGAGCCATGAAAAAAGTGAAAGCAGAAAGCATCTACCTGAAGCTTTAGGTATTGAGTCCATCTGTGATGAAAATCTTGTAAAAAGTGAAGTTGACACTGAAGTACAGGAAATTGCCATGAAAAAAACAATCAACATTCTGAAGAAACAGAAAAACTGTAAAAAGAACAAAA
AGGTCCATATGAATCACAGAGAAGAATCAGATGATAAAGCAATTTTTGAAAAGCAAAGTCTTGATGCAATGGAAGGTCATGCTAGGGGGCAAGTAAATGACGTGATGACAGTAGAGGAATCTCCTTCCTTGGATTCAGAATTGGATGCCAAGCAACTGAACTTAATGCTACGTGAAGCTATGGCATCAGGAAACATAGAA
AAACTCGAAGCTGCTCTAAGAACTTGCACTCCACTTGCCTGCAATGCTGACAAGGACTTGGTAAAAAAGGTTAAGGCTGCTCTTCAGAAAAGGTTGAGGCGTATGGAAAAGTGTGTTGCATTGGATAATGAGCTTTGTTCTGCCATGAAAGAAGGGAATAAGTCTCAACTTAATGCGGCTATTGCTGAGATTGAGTCTGT
GCCAAGGTTTGCAGCTGCCTTGCAGGAAAAACTGAATGCTGCTAGGCAAGAGCTTAATAATGTTGAAATGAGAGAAAGAATGATGGTCACGGATATTCAGATAGCTTCTGAATGTAGCAGTGAGATGGATGAACTGCCATCTGTGACAAAACAGAGTAATTTAGGTGCTACTGATAAGATTTTGCATAGTGTTGTCATGC
AGGGGGAAGGGAGAGAATTTGGAAAAAATATGGTCTGCATTGTAGATGTAGAAAGCAAAACCAAAAATGCTTTGACTGAAGTTAGTACAAGCATTGAACAGAATATGTGCTTCAAGAATGCTGTAAGTGACGAGGGAACAATTAATAAGGTGGTACAGACCGGAAGTGAGAGAAGCTTGCATGAAGAGGTTAACAATATT
TTCATGAATGGGAAAATGCCGAGCAAACTCGGGAACATCCAGAGTGTGGTTCCACAACATTCATCAAATCTCAAAACAGAATCCGAAGGCGAATTTCAAAGAATGCCTGTATCGCAGTGTCAAATGATTTCTTTTGAACAGGTTCAGTCAGTTCAGAATGCTTCACTTGAAGCAACCCCGTTGTTGGGAACATTGCATGT
TTCTCGTTCTCATGGAACATGTCAATCTGTCATCAAGCCTCCACATCCTAAAAATCCTCTGACAATGGAATCGACAGAACATTATCCAATTACTTCACAGTTATTCCCAGCCTCAGGTGGAGACCCATTAGGTTATGGATCCCATGTCAAACAACGTGATGTTTGGAACAGGGACACATATTTTGATAACCTACGAAGTT
TCAATGGTTCTTTTGCAGACACATCAGAGTTCGTCTCCTCTCCAAATTCCCATGCTGACACTTATTTTGATTATTTCCAACAGGAACGTCAAGTGGGTGATTTTGATGAACCAGGACACTCTCCTTTTTCTCCCACTGCTTCGGTTGTTGGAGTTGCAATGTGTGTGCCAAGTTTGTTCCATCAAACTATGGAGAATCAA
TCTTTGGGATCTTCAGATAATGTGCCAGATGAATTATCATCTCCTTTGGATTCATTCCTTCATTATTGGAATCCTCCCAATATGAAGTCTGAGAGTTATTCTTTCTTGTTCCCTGCAGAACCTATTAGAAGTATTAATCATCCATGTCCAGAGACAGACAGTGAAAGATACATCTCTGATAATTTCAAATGCAATAATCA
TCATATATCAAGAGGTCCTTTCTCACAGCACACGGATCAGTCATGGTTCCATTTTCAGGATCAGTTGCAGAACAGTTGTGGGGCTAATACTGCTGGTTTATATTCATTTTCTAGGGTTGTAGCTCCGCCTCCATCGGAACCTCTTACTGAACCTGCATGTGATAGGTTAGCAAAAATGCTTCACAGGGTTACCCTAAATG
ATGCATATATTGGTGAAACTTGTTCAATTTGCGAGCAAACAACTAAAGATGCTGTATTAGTTCCCTGTGGCCATTGTATGTGTAAAGTTTGTGCAGACAATGTACAGTTGATTAATTGTCATTGTCCAGTATGCAACCGTTTCATATCTGCAATTCATTCACTGTCTTGATATATTTATATGTTCAGATCCAAAGTCTTA
AATAGGCAGTAAAGCCCGAGTTTTGATCTCTGTTTCTCCCAAGGTTTCATGTACTTGTAGGAATACATAGATTATAGTTCCACGGAGTTATATTATTATGCTATGATGGATGTTCCTTTATTACTAAAGCAGGAAACACATCTCAGAAGAATGTTTTCAGGCAAAATAATTTGGTATGGCAGTATAGCACAAGCAATCGA
TAACTTTTACTTCAAAGAGTTTCATTTAATTGAAAATTAGTGTGTTTGATAAATCCCAAATTATTAACCGTACAAGTGAAAACATTAGTGCATTATCTGAAAACACTCTTGAATAAGGCAATATACAAGTCTTTCTATCCTGGTGCTTAGATCTATGTCTTGTCGTCCAAATTTATCCAACAAGGTTGGTGAATGATGTC
CAGCTGGGCATTGTGAATCGCTATGCAAGTACTAGCTGCTGCCTCGACTCTTTGTGAAATGAAAGGATAGGGAGATATCACACAGCGAGGCCAAAGTGATTGAAAGCTATGTTTATGATGACGTACAAACATATGAAATTTCTTGCTTTAGATGTATGTTTGCTTTTGGTGTAGTTTTAAGTCCATAAAATTCTTGGGAC
TGACCAGGTCAAAGTTTAAATATGACATTATCTATTTTGTTCTTGGCCAGGAGTAAGCCTATCTATAGAGGCAAATGCAAAATTCTGAGACGTGTTGATTTTGAGGGTCGTTGTGGATTCCATGTGATTTGTGATGACTTACTTTTTCCAAACTCGTGGTATTCTTTAAAA
>TRINITY_DN40130_c0_g1_i2 from sample A8 / Example unspliced isoform:ATTGGTGATTTCTTACACAGGCAGTTGCAGCTGCTCTTCGCAGATATGGAGGGCTAACTCATCGAACTTCTGGTTCAACCACAGTTCTATCACATACCGAGGTTTGCATACCTGCCAGACTAGTCCTTGCACGGCTTGGTGTTACAAGgtacatgatcattaaccatttattaacattttctcccagaagaatggacaga
atgtacccatgtgatggctctttttgttggaatcttggcaaatgatattttttctttctcctgctaggctaaccttccttgctttcatttgcaatcaatgcccgtaaaacttagaaggggtttccttttcacactaaaggatcaaaggtagtctcaatttttttgatggtgtttgacatgatctgatttctttattcagG
ATTGATAATCAGCTTCTATCTCACAAGGCACTGGAGGCAGGCGACATTATGTGTCTTGGGGCGCTTGTGAGCAAAGGTGTAGACATATCTGTACCAGATGATTCTGGGCGAACAGCATTATGGTATGCTGAAAAATCTGGACACACCCATATTTTGCATTATGTAAGGACATATGGTCATTCTCATGGAAGGAAAAGAGC
TAGGGGAAAGACAATATCAAAATGTAAACATGGCAATCAGCAAGAAAGGCAGCATGAAAATATAAATTCTTCTGTGAATCAGGATATTGGAAATGCTCAACTAGAAGAGATTGAGAATTTGCAAAATGAACATATTTTGAACACTGCCTCTTGTATATCCAATGTATCCACAAAGAATTCTGAACAATCTGAGTTGAAAA
CAGAAGCGAGCCATGAAAAAAGTGAAAGCAGAAAGCATCTACCTGAAGCTTTAGGTATTGAGTCCATCTGTGATGAAAATCTTGTAAAAAGTGAAGTTGACACTGAAGTACAGGAAATTGCCATGAAAAAAACAATCAACATTCTGAAGAAACAGAAAAACTGTAAAAAGAACAAAAAGGTCCATATGAATCACAGAGAA
GAATCAGATGATAAAGCAATTTTTGAAAAGCAAAGTCTTGATGCAATGGAAGGTCATGCTAGGGGGCAAGTAAATGACGTGATGACAGTAGAGGAATCTCCTTCCTTGGATTCAGAATTGGATGCCAAGCAACTGAACTTAATGCTACGTGAAGCTATGGCATCAGGAAACATAGAAAAACTCGAAGCTGCTCTAAGAAC
TTGCACTCCACTTGCCTGCAATGCTGACAAGGACTTGGTAAAAAAGGTTAAGGCTGCTCTTCAGAAAAGGTTGAGGCGTATGGAAAAGTGTGTTGCATTGGATAATGAGCTTTGTTCTGCCATGAAAGAAGGGAATAAGTCTCAACTTAATGCGGCTATTGCTGAGATTGAGTCTGTGCCAAGGTTTGCAGCTGCCTTGC
AGGAAAAACTGAATGCTGCTAGGCAAGAGCTTAATAATGTTGAAATGAGAGAAAGAATGATGGTCACGGATATTCAGATAGCTTCTGAATGTAGCAGTGAGATGGATGAACTGCCATCTGTGACAAAACAGAGTAATTTAGGTGCTACTGATAAGATTTTGCATAGTGTTGTCATGCAGGGGGAAGGGAGAGAATTTGGA
AAAAATATGGTCTGCATTGTAGATGTAGAAAGCAAAACCAAAAATGCTTTGACTGAAGTTAGTACAAGCATTGAACAGAATATGTGCTTCAAGAATGCTGTAAGTGACGAGGGAACAATTAATAAGGTGGTACAGACCGGAAGTGAGAGAAGCTTGCATGAAGAGGTTAACAATATTTTCATGAATGGGAAAATGCCGAG
CAAACTCGGGAACATCCAGAGTGTGGTTCCACAACATTCATCAAATCTCAAAACAGAATCCGAAGGCGAATTTCAAAGAATGCCTGTATCGCAGTGTCAAATGATTTCTTTTGAACAGGTTCAGTCAGTTCAGAATGCTTCACTTGAAGCAACCCCGTTGTTGGGAACATTGCATGTTTCTCGTTCTCATGGAACATGTC
AATCTGTCATCAAGCCTCCACATCCTAAAAATCCTCTGACAATGGAATCGACAGAACATTATCCAATTACTTCACAGTTATTCCCAGCCTCAGGTGGAGACCCATTAGGTTATGGATCCCATGTCAAACAACGTGATGTTTGGAACAGGGACACATATTTTGATAACCTACGAAGTTTCAATGGTTCTTTTGCAGACACA
TCAGAGTTCGTCTCCTCTCCAAATTCCCATGCTGACACTTATTTTGATTATTTCCAACAGGAACGTCAAGTGGGTGATTTTGATGAACCAGGACACTCTCCTTTTTCTCCCACTGCTTCGGTTGTTGGAGTTGCAATGTGTGTGCCAAGTTTGTTCCATCAAACTATGGAGAATCAATCTTTGGGATCTTCAGATAATGT
GCCAGATGAATTATCATCTCCTTTGGATTCATTCCTTCATTATTGGAATCCTCCCAATATGAAGTCTGAGAGTTATTCTTTCTTGTTCCCTGCAGAACCTATTAGAAGTATTAATCATCCATGTCCAGAGACAGACAGTGAAAGATACATCTCTGATAATTTCAAATGCAATAATCATCATATATCAAGAGGTCCTTTCT
CACAGCACACGGATCAGTCATGGTTCCATTTTCAGGATCAGTTGCAGAACAGTTGTGGGGCTAATACTGCTGGTTTATATTCATTTTCTAGGGTTGTAGCTCCGCCTCCATCGGAACCTCTTACTGAACCTGCATGTGATAGGTTAGCAAAAATGCTTCACAGGGTTACCCTAAATGATGCATATATTGGTGAAACTTGT
TCAATTTGCGAGCAAACAACTAAAGATGCTGTATTAGTTCCCTGTGGCCATTGTATGTGTAAAGTTTGTGCAGACAATGTACAGTTGATTAATTGTCATTGTCCAGTATGCAACCGTTTCATATCTGCAATTCATTCACTGTCTTGATATATTTATATGTTCAGATCCAAAGTCTTAAATAGGCAGTAAAGCCCGAGTTT
TGATCTCTGTTTCTCCCAAGGTTTCATGTACTTGTAGGAATACATAGATTATAGTTCCACGGAGTTATATTATTATGCTATGATGGATGTTCCTTTATTACTAAAGCAGGAAACACATCTCAGAAGAATGTTTTCAGGCAAAATAATTTGGTATGGCAGTATAGCACAAGCAATCGATAACTTTTACTTCAAAGAGTTTC
ATTTAATTGAAAATTAGTGTGTTTGATAAATCCCAAATTATTAACCGTACAAGTGAAAACATTAGTGCATTATCTGAAAACACTCTTGAATAAGGCAATATACAAGTCTTTCTATCCTGGTGCTTAGATCTATGTCTTGTCGTCCAAATTTATCCAACAAGGTTGGTGAATGATGTCCAGCTGGGCATTGTGAATCGCTA
TGCAAGTACTAGCTGCTGCCTCGACTCTTTGTGAAATGAAAGGATAGGGAGATATCACACAGCGAGGCCAAAGTGATTGAAAGCTATGTTTATGATGACGTACAAACATATGAAATTTCTTGCTTTAGATGTATGTTTGCTTTTGGTGTAGTTTTAAGTCCATAAAATTCTTGGGACTGACCAGGTCAAAGTTTAAATAT
GACATTATCTATTTTGTTCTTGGCCAGGAGTAAGCCTATCTATAGAGGCAAATGCAAAATTCTGAGACGTGTTGATTTTGAGGGTCGTTGTGGATTCCATGTGATTTGTGATGACTTACTTTTTCCAAACTCGTGGTATTCTTTAAAA