sp|Q9FX99|Y1497_ARATH ----> Probable receptor-like protein kinase At1g49730

Intron 1 GTACTCTCCA ... TGATACACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	62.04	52	92	78
A2	68.42	24	61	43
A3	69.57	28	70	58
A4	75.61	15	54	39
A5	70.59	10	30	18
A6	64.78	28	59	44
A7	64.25	74	153	113
A8	61.31	59	109	78
A9	65.7	59	126	100
A10	65.61	72.3	158	118

>TRINITY_DN116257_c0_g1_i2 from sample A1 / Example spliced isoform

TAATGATTCAGCGCATTAAGTTGTCTCGTCGGACCGAGACAACACTGAAACGGCTCTACGGAATAATTGGACGCGAATATTAATATTTAATGCTACGAAGGGATCGTTCACATGGCCCACCGCGAAGACGACTGTTAAGAAGGAATAGGACGTCTAGGGGTTTCGTGGGGTTCCCGGTCCCGGTTTCGAATCCTGCCAAG
GACAACCACGGCACATTTTGTAGGCGTCGTCCGAGCTTCCGCACTTGAAAAGCTTGCCGGTCTGAACCTATAAGCACACTGTATTATGGGTTTGTCAGACGTCCGGACCGTTGCAGATTATTTATTTGAAAATAAAAGCTTTAAATATGCGGATTTTCCAGGCCAGATGAAGTTGACAAGCATGGCCGCATGTGCGGTTT
CCAGCAACGTATGGACATGGGCTGAACGGACAGAAAATTGCCTCCGCACAATATATACGCAACATCGGGAAGTATATACATCGGGGACGTGTACCAAGGCTTCACTGTGCGTCCGTGGTTTTTAGCTTTATTATTCAGTATATCCCATCTTTAATCACGCTTCTGGAACATTTGTTCGACTTTCTGGACGGAGTGGCTTT
GATTCTTGACCTCGCATGGCCAGTCTTTTGGTACTCAGAACGCTTTTGTCTTTGAAGCAGAGAGAATGCAGCTTAGTTTGCAGTGCAGGACGCCTGTTGACGGTTAAATGTAATGATCTTTAGGCGATGGAAGAGGAATGGGAAGAACCTGTAAAGCTTTTAGGCATCGGCATTTTTTCGAGCAGTTTAGATACGAGGAT
TTAGTGTGCTGAAGCTTGAGGTCAGCCAGTGTAGTGTGTTGAGCCTTTCTTTGTGGACATTTCACCTCAGAAATGCGAGGAATGACGTTCAAGCGGCTGATTCTCAGTGTCTTTATTCTGTGGCGCCTGGAAAGGAACTGTTGCCTTGCAGTTGACACTGGTTGCCCCCTTGACTTTGGCAACTTGAACTTCACAACAGT
AAAATCTGCATGCTTTACTCCAGACAGAGGAAGATGTTGTCGATTTGTAAATGCTGTAGTAGCCATTTCTATGTCACGATACACAAACATCACAAGTGAGCTTGCAGTTCCTTCATCCTCTTCCGCGATATGTCTTGAGACAATATCAGACACTTTGCAGTCAAATGGAATTTCGCCCGATGTAATGGCATTCTGTGGCT
TGGGTACAAAGATTGCTGCTGATTTTCATTGTAAAGGTCGTACAAATGTTGAGGAGATGGAGGGCACGCCATATTTCAGGGATGTGCAGATGAGCTGTGTGCAATCACTAGCATCATTTGAGAGTTGCAAGAGATGCTTGAATGCCAGTTTTACATTTCTTCACAACCTTGAAGGTGTAGATGATAATGTGACTATAAGT
AGATGCAGGGATGCTACCTTTGTTACTATTGTAAGCTATGGTGATTCAGACTTTGCAAACGACAAAGCAAGCTGTTTTTTTAATGCTAAAGGCCTTGAACAATCGGTCTCAAAAGGAAAAGGGAAGGTACTTGCACCAGCGCCTTCAGCATCAATATCTTCTAGTCCAAGCCCAGAGAAAATGAGAGAATTGGAGAACTC
AGATGCTGCAAATCAATCTCAATGGAATAGAACTTTGAGTTCACGTACACGCAGGAACTTACATGAATGGAACAAAGGGCCACCATCCACCTTTAGACGTTTCAGCCGCAGGGAGATTAGAATTGCAACAGATGATTTTAGCACAATTATTGGCAAGGGAGGATTTGGCACCGTTTATAAAGCTCGATTTAAAGATGGAC
TTGTAGCTGCTGTGAAGCGAATGAACAAGATTGCTCAACAAGATGAATTCTGTAAAGAGATGGAGCTGTTAGGGCGGTTGCATCATCGGCATCTTGTCACATTAATAGGATTTTGTGCAGAACAGCATGAAAGGTTTCTTGTTTATGAATACATGGAAAATGGAAGTCTAAAAGAGCATCTTCAAGCTCCCATAAAGACT
CCCTTGAATTGGCGAATCAGAATTCAAATTGCCATAGATGTGGCTGCAGCTATGGAGTACCTTCATTTTTATTGTGATCCACCTCTATGCCATAGAGACATTAAATCCAGTAATATTTTGTTGGACGAGAACTTTGTTGCTAAGGTATCTGATTTTGGTCTTGCTCATGCTGCACCTTGTGGTTCCAGCAATTTTGAGCC
AGTTAATACAGATGTCCGTGGGACCCCAGGGTACATGGACCCAGAATACCTTGTCACTCAAGAATTAACAGAAAAGAGTGATGTATATAGTTATGGCGTCTTGCTTCTTGAAATCATCACTGCTCGACAGGCAGTTCAAGATAACAAAAACCTGGTAGAATGGGCTCAAAAATACATTTTGGAGGACTGCAACTTGTCTG
AGATGGTAGATCCTAATTTGGAAAATATATATGATTACGAACAACTTCAAAGTTTTGTCAACATTGTAAGAATGTGCACTCAAAGGGAGGGTAAATCAAGGCCTTCCATAAGGCAGGTTCTGCAACTTCTGTATGATAGACTAGACATAACCTGTCCTAACTCTGCATTGATAGCTCCAGAAGAAGATGAAGATGAAGAC
AATAATGCCAGGAGCATAAGCAAGGGGAAGATACAGATAATGTCATTTGTAAATGGAAACAACTTCAGTGGTGAGCTAAGGTGCATAGAGTCTTCTCCTAAATCTTCAGTGTCTTATTGCAGCAAAAGTTTTCTGCTGGAGTCCACTTCTCCCAGCTCACAGTAAAAGCACGGCAAGTTGTATTAATTTCTAAATTCAAC
TTGCTTCATATTGCCAAAAGATCAGCTTTGCAAGATTGCTGTCCATTACTGTTACATCTATTTTTGGTGTCTATAAGTATCTGTCATTTTCCTGCAGCATTGTTTGGAACTTGCACAGGTCAGAAATTAGAATATGATTCTGAATGAAGTGCTGGTAATCTTGTATGATATAATTCTGAAAAGGATCTGTAAGATTCCAG
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>TRINITY_DN116257_c0_g1_i1 from sample A1 / Example unspliced isoform:

TAATGATTCAGCGCATTAAGTTGTCTCGTCGGACCGAGACAACACTGAAACGGCTCTACGGAATAATTGGACGCGAATATTAATATTTAATGCTACGAAGGGATCGTTCACATGGCCCACCGCGAAGACGACTGTTAAGAAGGAATAGGACGTCTAGGGGTTTCGTGGGGTTCCCGGTCCCGGTTTCGAATCCTGCCAAG
GACAACCACGGCACATTTTGTAGGCGTCGTCCGAGCTTCCGCACTTGAAAAGCTTGCCGGTCTGAACCTATAAGCACACTGTATTATGGGTTTGTCAGACGTCCGGACCGTTGCAGATTATTTATTTGAAAATAAAAGCTTTAAATATGCGGATTTTCCAGGCCAGATGAAGTTGACAAGCATGGCCGCATGTGCGGTTT
CCAGCAACGTATGGACATGGGCTGAACGGACAGAAAATTGCCTCCGCACAATATATACGCAACATCGGGAAGTATATACATCGGGGACGTGTACCAAGGCTTCACTGTGCGTCCGTGGTTTTTAGCTTTATTATTCAGTATATCCCATCTTTAATCACGCTTCTGGAACATTTGTTCGACTTTCTGGACGGAGTGGCTTT
GATTCTTGACCTCGCATGGCCAGTCTTTTGGTACTCAGAACGCTTTTGTCTTTGAAGCAGAGAGAATGCAGCTTAGTTTGCAGTGCAGGACGCCTGTTGACGGTTAAATGTAATGATCTTTAGGCGATGGAAGAGGAATGGGAAGAACCTGTAAAGCTTTTAGGCATCGGCATTTTTTCGAGCAGTTTAGATACGAGGAT
TTAGTGTGCTGAAGCTTGAGGTCAGCCAGTGTAGTGTGTTGAGCCTTTCTTTGTGGACATTTCACCTCAGAAATGCGAGGAATGACGTTCAAGCGGCTGATTCTCAGTGTCTTTATTCTGTGGCGCCTGGAAAGGAACTGTTGCCTTGCAGTTGACACTGGTTGCCCCCTTGACTTTGGCAACTTGAACTTCACAACAGT
AAAATCTGCATGCTTTACTCCAGACAGAGGAAGATGTTGTCGATTTGTAAATGCTGTAGTAGCCATTTCTATGTCACGATACACAAACATCACAAGTGAGCTTGCAGTTCCTTCATCCTCTTCCGCGATATGTCTTGAGACAATATCAGACACTTTGCAGTCAAATGGAATTTCGCCCGATGTAATGGCATTCTGTGGCT
TGGGTACAAAGATTGCTGCTGATTTTCATTGTAAAGGTCGTACAAATGTTGAGGAGATGGAGGGCACGCCATATTTCAGGGATGTGCAGATGAGCTGTGTGCAATCACTATCATCATTTGATAGTTGCAAGAGATGCTTGAATGCCAGTTTTACATTTCTTCACAACCTTGAAGGTGTAGATGATAATGTGACTATAAGT
AGATGCAGGGATGCTACCTTTGTTACTATTGTAAGCTATGGTGATTCAGACTTTGCAAACGACAAAGCAAGCTGTTTTTTTAATGCTAAAGGCCTTGAACAATCGGTCTCAAAAGGAAAAGGGAAGGTACTTGCACCAGCGCCTTCAGCATCAATATCTTCTAGTCCAAGCCCAGAgtactctccaattcctgctcattc
aagtgttgctctcataaagaagccccactcctcgtcgcatttggcagtcattcttggagttggaattggagttacagcagtgtcactttcacttttatttctattgatacttttgatacacagGAAAATGAGAGAATTGGAGAACTCAGATGCTGCAAATCAATCTCAATGGAATAGAACTTTGAGTTCACGTACACGCA
GGAACTTACATGAATGGAACAAAGGGCCACCATCCACCTTTAGACGTTTCAGCCGCAGGGAGATTAGAATTGCAACAGATGATTTTAGCACAATTATTGGCAAGGGAGGATTTGGCACCGTTTATAAAGCTCGATTTAAAGATGGACTTGTAGCTGCTGTGAAGCGAATGAACAAGATTGCTCAACAAGATGAATTCTGT
AAAGAGATGGAGCTGTTAGGGCGGTTGCATCATCGGCATCTTGTCACATTAATAGGATTTTGTGCAGAACAGCATGAAAGGTTTCTTGTTTATGAATACATGGAAAATGGAAGTCTAAAAGAGCATCTTCAAGCTCCCATAAAGACTCCCTTGAATTGGCGAATCAGAATTCAAATTGCCATAGATGTGGCTGCAGCTAT
GGAGTACCTTCATTTTTATTGTGATCCACCTCTATGCCATAGAGACATTAAATCCAGTAATATTTTGTTGGACGAGAACTTTGTTGCTAAGGTATCTGATTTTGGTCTTGCTCATGCTGCACCTTGTGGTTCCAGCAATTTTGAGCCAGTTAATACAGATGTCCGTGGGACCCCAGGGTACATGGACCCAGAATACCTTG
TCACTCAAGAATTAACAGAAAAGAGTGATGTATATAGTTATGGCGTCTTGCTTCTTGAAATCATCACTGCTCGACAGGCAGTTCAAGATAACAAAAACCTGGTAGAATGGGCTCAAAAATACATTTTGGAGGACTGCAACTTGTCTGAGATGGTAGATCCTAATTTGGAAAATATATATGATTACGAACAACTTCAAAGT
TTTGTCAACATTGTAAGAATGTGCACTCAAAGGGAGGGTAAATCAAGGCCTTCCATAAGGCAGGTTCTGCAACTTCTGTATGATAGACTAGACATAACCTGTCCTAACTCTGCATTGATAGCTCCAGAAGAAGATGAAGATGAAGACAATAATGCCAGGAGCATAAGCAAGGGGAAGATACAGATAATGTCATTTGTAAA
TGGAAACAACTTCAGTGGTGAGCTAAGGTGCATAGAGTCTTCTCCTAAATCTTCAGTGTCTTATTGCAGCAAAAGTTTTCTGCTGGAGTCCACTTCTCCCAGCTCACAGTAAAAGCACGGCAAGTTGTATTAATTTCTAAATTCAACTTGCTTCATATTGCCAAAAGATCAGCTTTGCAAGATTGCTGTCCATTACTGTT
ACATCTATTTTTGGTGTCTATAAGTATCTGTCATTTTCCTGCAGCATTGTTTGGAACTTGCACAGGTCAGAAATTAGAATATGATTCTGAATGAAGTGCTGGTAATCTTGTATGATATAATTCTGAAAAGGATCTGTAAGATTCCAGGTAATCAAAGTTCAATTTACAGTGGCAGTTGCTAATAATAGGATTAATGATTT
TCAGACACATCCTTCAATATACTAACACAGCCCTGTTGATTCTTACCCCCTATTTCTCATTATTGCTGATTGACATTTACAAACACAGTGCAGCAAGCATTGATTGGTCAGTGTTATCTGTTTTTAGTAAAATAACCAGTGGCATATTTTGTCGAAGAAAAAAACAGGTAGTCTTCTTGACGAACACTTAATGTAGGAAT
TGTATTTAATTGATGGCTACATCATTTGTGGAACTGTTCAAAGTTCAAACTTTAAATGTTCAGATGAAATGACATTATCCG