sp|Q9SYM5|RHM1_ARATH ----> Trifunctional UDP-glucose 4,6-dehydratase/UDP-4-keto-6-deoxy-D-glucose 3,5-epimerase/UDP-4-keto-L-rhamnose-reductase RHM1


Intron 1 GTATTCTCTT ... TAGCCAACAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A166.2381515411656
A264.5685816451481
A363.4397616601725
A465.8682215771595
A562.75514902830
A663.8667211051270
A763.61113019322018
A863.75319524598
A962.5103116391798
A1063.7108118451949



>TRINITY_DN44816_c0_g2_i1 from sample A9 / Example spliced isoform
TGCAAATAGGTTGGAGGATTCTCAAGTGAAACATTTAAAAAGGTGTGCCAAAAACCGCATTGGATTTTAAGAGGCATGCAAACTTCCATTGACAAGGAATCGTTCTTGGAAATGATTATGGTCACTTCAAACAAACAAGTTAAAAGTCACGAGGTTTGCTTGCTTGGCATCCTTGTTTTTTCCCTTGCTCAAGGAATTAA
TTTAGTAGTTCTTGGCGTGAAGAAACCTGCAATTGAAATATTTAAAATATATATAATGTTAAATCATGTTGCACATGTATAAAGGCTTTACTTCTAGAGATTATCGATTGGGTTTAGTTCGAACGTAGTCACTGGCGCCACTCAAGGTCTGGTAATTTGGTAAATTAATTAACACCAGAGGAAGTGGATATTTATTTCTT
TTCTGGTTCGTTGTGTGGGCATATTAAATACAGTGTCAGTTGCATGCGTGTTTATCTGGGATTGGCTTAATTGAATTAAATTTCTCACCAAAATCAATATGTAAGGCGAGCAAGCGAACTTGGATCATTTCTATAGGCACCCATTCCTATATATAGAAAGGAAGGGGGCTTGCATCACCCTGCATCAATCTGAGGGGAGC
CAGCAAACTGAATAATTCTTATATATATATATATAGGGACGGGTTTGCATCATCCTGCATCGATCTTTGGGCCATAGGCATTGGCAGTGGGCGAAATCTGAGGTCACCCACATTCTTGAGTTCTTGTTTCTGTGGGCCTCTGGATTGCATTGCACCTGTCGAGGCTGGTGCTGTCAGTCCAAGATCTAGGCGTATTTGCA
TCTAGTTTTGCATCTGGGCTGGTGAGAAAATACCCACAATACAAGATTGTGGTATTGGACAAGCTGGACTATTGTTCAAATCTGAAGAATCTCTTTCCTTCCAGGCCTTCTCCCAATTTCAAGTTTGTGAAGGGAGATATTGGGAGTGCAGATCTGGTAAATTATCTGCTGATCACAGAACAGATTGATACTATAATGCA
TTATGCAGCACAAACCCATGTGGACAATTCATTTGGGAACAGCTTCGAGTTCACCAAGAACAACATCTATGGTACCCATGTCCTTCTTGAAGCATGCAAGGTTACTGGATTGATCAGAAGATTCATTCATGTGAGCACTGATGAAGTTTATGGTGAAACAGAGAAGGATGCCATTGAGGGCAATCATGAGGCCTGTCAGC
TCCTGCCTACCAATCCTTACTCTGCAACCAAGGCAGGAGCAGAGATGCTGGTCATGGCCTATGGGAGATCCTACGATTTGCCTGTGATCACCACAAGAGGTAACAATGTATATGGGCCTAATCAGTTTCCGGAAAAACTGATACCCAAGTTCATTCTTCTGGCAATGCAAGGTAAGTCGCTCCCAATCCACGGCGATGGA
TCTAATGTTAGGAGTTATTTGTACTGTGAGGATGTAGCTGAGGCTTTTGAAGTGGTTCTGCATAAAGGTGAAGTGGGGCATGTGTATAATATTGGTACACAGAAGGAGAGAAGGGTCATTGATGTGGCTAAGGATATCTGTAGGCTCTTTTCATTGGATGCAGAGAATGTTATAAAGTTTGTAGATAACAGGCCCTTCAA
TGATCAGAGATATTATCTGGACGATAAGAAACTCAAGGATTTGGGGTGGTCTGAGAGGACTAAATGGGAAGAAGGCTTGAAGAAAACAATCGATTGGTACATTAGCCACCCTGATTGGTGGGGTGATGTGTCCGGTGCTCTGCTTCCTCATCCAAGGATGCTCACAATGGCAGGAGTTGAGAGGTATACAGAAG


>TRINITY_DN44816_c0_g2_i3 from sample A9 / Example unspliced isoform:
TGCAAATAGGTTGGAGGATTCTCAAGTGAAACATTTAAAAAGGTGTGCCAAAAACCGCATTGGATTTTAAGAGGCATGCAAACTTCCATTGACAAGGAATCGTTCTTGGAAATGATTATGGTCACTTCAAACAAACAAGTTAAAAGTCACGAGGTTTGCTTGCTTGGCATCCTTGTTTTTTCCCTTGCTCAAGGAATTAA
TTTAGTAGTTCTTGGCGTGAAGAAACCTGCAATTGAAATATTTAAAATATATATAATGTTAAATCATGTTGCACATGTATAAAGGCTTTACTTCTAGAGATTATCGATTGGGTTTAGTTCGAACGTAGTCACTGGCGCCACTCAAGGTCTGGTAATTTGGTAAATTAATTAACACCAGAGGAAGTGGATATTTATTTCTT
TTCTGGTTCGTTGTGTGGGCATATTAAATACAGTGTCAGTTGCATGCGTGTTTATCTGGGATTGGCTTAATTGAATTAAATTTCTCACCAAAATCAATATGTAAGGCGAGCAAGCGAACTTGGATCATTTCTATAGGCACCCATTCCTATATATAGAAAGGAAGGGGGCTTGCATCACCCTGCATCAATCTGAGGGGAGC
CAGCAAACTGAATAATTCCTATATATATATAGAAAGGGACGGGTTTGCATCATCCTGCATCGATCTTTGGGCCATAGGCATTGGCAGTGGGCGAAATCTGAGGTCACCCACATTCTTGAGTTCTTGTTTCTGTGGGCCTCTGGATTGCATTGCACCTGTCGAGGCTGGTGCTGTCAGTCCAAGATCTAGGCGTATTTGCA
TCTAGTTTTGCATCTGGgtattctctttttcttttcttctgattggctgttattcatagtgtgatctgttggaaaaatggagaatggcaatggggtatatgtccccaagaacattctgatcactggtgctgcaggattcatcgcatctcatgtagccaacagGCTGGTGAGAAAATACCCACAATACAAGATTGTGGTAT
TGGACAAGCTGGACTATTGTTCAAATCTGAAGAATCTCTTTCCTTCCAGGCCTTCTCCCAATTTCAAGTTTGTGAAGGGAGATATTGGGAGTGCAGATCTGGTAAATTATCTGCTGATCACAGAACAGATTGATACTATAATGCATTATGCAGCACAAACCCATGTGGACAATTCATTTGGGAACAGCTTCGAGTTCACC
AAGAACAACATCTATGGTACCCATGTCCTTCTTGAAGCATGCAAGGTTACTGGATTGATCAGAAGATTCATTCATGTGAGCACTGATGAAGTTTATGGTGAAACAGAGAAGGATGCCATTGAGGGCAATCATGAGGCCTGTCAGCTCCTGCCTACCAATCCTTACTCTGCAACCAAGGCAGGAGCAGAGATGCTGGTCAT
GGCCTATGGGAGATCCTACGATTTGCCTGTGATCACCACAAGAGGTAACAATGTATATGGGCCTAATCAGTTTCCGGAAAAACTGATACCCAAGTTCATTCTTCTGGCAATGCAAGGTAAGTCGCTCCCAATCCACGGCGATGGATCTAATGTTAGGAGTTATTTGTACTGTGAGGATGTAGCTGAGGCTTTTGAAGTGG
TTCTGCATAAAGGTGAAGTGGGGCATGTGTATAATATTGGTACACAGAAGGAGAGAAGGGTCATTGATGTGGCTAAGGATATCTGTAGGCTCTTTTCATTGGATGCAGAGAATGTTATAAAGTTTGTAGATAACAGGCCCTTCAATGATCAGAGATATTATCTGGACGATAAGAAACTCAAGGATTTGGGGTGGTCTGAG
AGGACTAAATGGGAAGAAGGCTTGAAGAAAACAATCGATTGGTACATTAGCCACCCTGATTGGTGGGGTGATGTGTCCGGTGCTCTGCTTCCTCATCCAAGGATGCTCACAATGGCAGGAGTTGAGAGGTATACAGAAGCCCATGATGTGGTTGAGACGAAGTCTCCAGTGCTAGAGAATGGCATCCATCAGAATCACAT
GCTAGAGACCTCCAACGGCCATATTCAGAAATCTGCCTTCAAGTTCTTGATCTATGGGCGAAATGGCTGGATTGGAGGGCTTCTTGGGCAGATATGCGAAAAGCAGGGCATAACCTATGAATATGGAAATGGGAGATTGGAGGACAGGTCTCAGATCCAAACGGACATACAGAACATCAAGCCTACTCATGTTTTTAATG
CCGCAGGTGTGACGGGTCGTCCTAATGTGGATTGGTGTGAATCCCACAAACCCGAGACTATTAGAACCAATGTGGCTGGAACTTTGAATTTGGCTGATATTTGCAGGGAGCATGGTCTTCTGCTTATGAATTTTGCAACTGGCTGTATTTTTGAATATTGTGATGTTTATCCTGAGGGAAGTGGTATTGGATTTAAGGAG
GAAGACAAACCCAACTTCACTGGGTCCTTCTATTCGAAGACCAAGGCCATGGTAAGGTTTAAACTCGATCTGGAAATCTTTTGTTTCCAGGATTTTCGACCTATTTTATAATAGTTTGGTTTCTTTAATTACTTTACTGGATGAAAATGTTTCTACGGTTAAGGTTTAGTTTGATTGCATTGTATTTATTTAAAAGTGTG
TTGAACCCCATCCCATGTTTATTGCATTGGCATGTGGTATTCTCAAGAGTATTGCTCATGGACTTCTGAGGGCCTGCTTTGCTTTTATCGCATTCTTCATGTGTACATTTTGAACAAATCTGGGTCAATTTTGCTTTTTTGGTTCCAGTATTTTCTACCTATTTCAGAAAGAGTATGGTTTGCTTTAATTACTTTATTTA
TAGGACAACGCTTTTTGAGATAAGGTCTGGTTTGATTGCATTGAATCTATCCAATATTAAGTAAAACCACATCCCCTGTTTATTGCACCGGCATCAGGTCTGATCAAGAGTACTGCTCATGATCTTCTCGGGACCTGCTCTGTTTTTACCGCATTCTTCATGTGCCCATTTTGGACAAATCTAGGTCAATTTTGATATTT
TGGTTTCACCACTTTCTACCTATTTTAGAAAGAGAGTACAGGTATGCTTTCATTACTTCTTTTTAATGAGAATGTTGTTTGAGTGGACTTTTGGTTTGATTTATTCACTAGTGATTTGAACCCTCTTCCCATGTTTATTACATTGGCATCTGGTATCATCAAAAGTATTGCTCACAGTCTTCTCAGGGACTGCTCTGTTT
TTATTCTACATGGTCTTCTCAGGGCCTGTTCTGCTTTTTTTGTATTTTTCATGTGCTTATTTTGAACAGATCTGGGTCAATTTCGACATAGCTCG




Intron 2 GTATTCTCTT ... GGTGCTGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A162.9996415411740
A262.7696416451604
A361.49109216601827
A461.82101515771710
A561.18573902904
A663.9269011051340
A763.07118119322102
A863.03330524601
A960.66112916391842
A1062.18119218452074



>TRINITY_DN116690_c0_g1_i1 from sample A3 / Example spliced isoform
GGTGTGCCAAAAACCGCATTGGATTTTAAGAGGCATGCAAACTTCCATTGACAAGGAATCGTTCTTGGAAATGATTATGGTCACTTCAAACAAACAAGTTAAAAGTCACGAGGTTTGCTTGCTTGGCATCCTTGTTTTTTTCCCTTGCTCAAGGAATTAATTTAGTAGTTCTTGGCGTGAAGAAACCTGCAATTGAAATA
TTTAAAATATATATAATGTTAAATCATGTTGCACATGTATAAGGCTTTACTTCTACAGATTATCGATTGGGTTTAGTTCGAACGTAGTCACTGGCGCCACTCAAGGTCTGGTAATTTGGTAAATTAATTAACACCAGAGGAAGTGGATATTTATTTCTTTTCTGGTTCGTTGTGTGGGCATATTAAATACAGTGTCAGTT
GCATGCGTGTTTATCTGGGATTGGCTTAATTGAATTAAATTTCTCACCAAAATCAATATGTAAGGCGAGCAAGCGAACTTGGATCATTTCTATAGGCACCCATTCCTATATATAGAAAGGAAGGGGGCTTGCATCACCCTGCATCAATCTGAGGGGAGCCAGCAAACTGAATAATTCTTATATATATATATATAGGGACG
GGTTTGCATCATCCTGCATAGATCTTTGGGCCATAGGCATTGGCAGTGGGCGAAATCTGAGGTCACCCACATTCTTGAGTTCTTGTTTCTGTGGGCCTCTGGATTGCATTGCACCTGTCGAGGCTGGTGCTGTCAGTCCAAGATCTAGGCGTATTTGCATCTAGTTTTGCATCTGGGATTCATCGCATCTCATGTGGCCA
ACAGGCTGGTGAGAAAATACCCACAATACAAGATTGTGGTATTGGACAAGCTGGACTATTGTTCAAATCTGAAGAATCTCTTTCCTTCCAGGCCTTCTCCCAATTTCAAGTTTGTGAAGGGAGATATTGGGAGTGCAGATCTGGTAAATTATCTGCTGATCACAGAACAGATTGATACTATAATGCATTATGCAGCACAA
ACCCATGTGGACAATTCATTTGGGAACAGCTTCGAGTTCACCAAGAACAACATCTATGGTACCCATGTCCTTCTTGAAGCATGCAAGGTTACTGGATTGATCAGAAGATTCATTCATGTGAGCACTGATGAAGTTTATGGTGAAACAGAGAAGGATGCCATTGAGGGCAATCATGAGGCCTGTCAGCTCCTGCCTACCAA
TCCTTACTCTGCAACCAAGGCAGGAGCAGAGATGCTGGTCATGGCCTATGGGAGATCCTACGATTTGCCTGTGATCACCACAAGAGGTAACAACGTATATGGGCCTAATCAGTTTCCGGAAAAACTGATACCCAAGTTCATTCTCCTGGCAATGCAAGGTAAGTCGCTCCCAATCCACGGCGATGGATCTAATGTTAGGA
GTTATTTGTACTGTGAGGATGTAGCTGAGGCTTTTGAAGTGGTTCTGCATAAAGGTGAAGTGGGGCATGTGTATAATATTGGTACACAGAAGGAGAGAAGGGTCATTGATGTGGCTAAGGATATCTGTAGGCTCTTTTCATTGGATGCAGAGAATGTTATAAAGTTTGTAGATAACAGGCCCTTCAATGATCAGAGATAT
TATCTGGACGATAAGAAACTCAAGGATCTGGGGTGGTCTGAGAGGACTAAATGGGAAGAAGGCTTGAAGAAAACAATCGATTGGTACATTAGCCACCCTGATTGGTGGGGTGATGTGTCCGGTGCTCTGCTTCCTCATCCAAGGATGCTCACAATGGCAGGAGTTGAGAGGTATACAGAAGCCCATGATGTGGTTGAGAC
GAAGTCTCCAGTGCTAGAGAATGGCATCCATCAGAATCACATGCTAGAGACCTCCAACGGCCATATTCAGAAATCTGCCTTCAAGTTCTTGATCTATGGGCGAAATGGCTGGATTGGAGGGCTTCTTGGGCAGATATGCGAAAAGCAGGGCATAACCTATGAATATGGAAATGGGAGATTGGAGGACAGGTCTCAGATCC
AAACGGACATACAGAACATCAAGCCTACTCATGTTTTTAATGCCGCAGGTGTGACGGGTCGTCCTAATGTGGATTGGTGTGAATCCCACAAACCCGAGACTATTAGAACCAATGTGGCTGGAACTTTGAATTTGGCTGATATTTGCAGGGAGCATGGTCTTCTGCTTATGAATTTTGCAACTGGCTGTATTTTTGAATAT
TGTGATGTTTATCCTGAGGGAAGTGGTATTGGATTTAAGGAGGAAGACAAACCCAACTTCACTGGGTCCTTCTATTCGAAGACTAAGGCCATGGTTGAAGAGCTCCTACACAGTTTTGAAAATGTTTGCACTCTCAGGGTTAGAATGCCCATCTCTTCGGACCTGAATAACCCCCGCAATTTCATCACAAAGATCACTAG
ATATGAGAAAGTGGTAAATATACCAAACAGCATGACAGTCCTTGATGAGTTGCTGCCAATCTCGATTGAAATGGCAAAAAGGAATTGCACTGGCATATGGAACTTTACAAACCCAGGTGTTGTGAGCCATAATGAAATCTTGGAGATGTACAGAGAATATATTGATCCCACTTTCAAGTGGACAAACTTCAATCTTGAAG
AACAGGCAAAAGTCATAGTTGCTCCTCGAAGTAATAATGAACTGGACGCTACCAAGTTGAAGACAGAATTTCCACAGTTGCTGTCAA


>TRINITY_DN116690_c0_g1_i2 from sample A3 / Example unspliced isoform:
GGTGTGCCAAAAACCGCATTGGATTTTAAGAGGCATGCAAACTTCCATTGACAAGGAATCGTTCTTGGAAATGATTATGGTCACTTCAAACAAACAAGTTAAAAGTCACGAGGTTTGCTTGCTTGGCATCCTTGTTTTTTTCCCTTGCTCAAGGAATTAATTTAGTAGTTCTTGGCGTGAAGAAACCTGCAATTGAAATA
TTTAAAATATATATAATGTTAAATCATGTTGCACATGTATAAGGCTTTACTTCTACAGATTATCGATTGGGTTTAGTTCGAACGTAGTCACTGGCGCCACTCAAGGTCTGGTAATTTGGTAAATTAATTAACACCAGAGGAAGTGGATATTTATTTCTTTTCTGGTTCGTTGTGTGGGCATATTAAATACAGTGTCAGTT
GCATGCGTGTTTATCTGGGATTGGCTTAATTGAATTAAATTTCTCACCAAAATCAATATGTAAGGCGAGCAAGCGAACTTGGATCATTTCTATAGGCACCCATTCCTATATATAGAAAGGAAGGGGGCTTGCATCACCCTGCATCAATCTGAGGGGAGCCAGCAAACTGAATAATTCCTATATATATATAGAAAGGGACG
GGTTTGCATCATCCTGCATAGATCTTTGGGCCATAGGCATTGGCAGTGGGCGAAATCTGAGGTCACCCACATTCTTGAGTTCTTGTTTCTGTGGGCCTCTGGATTGCATTGCACCTGTCGAGGCTGGTGCTGTCAGTCCAAGATCTAGGCGTATTTGCATCTAGTTTTGCATCTGGgtattctctttttcttttcttctg
attggctgttattcatagtgtgatctgttggaaaaatggagaatggcaatggggtatatgtccccaagaacattctgatcactggtgctgcag
GATTCATCGCATCTCATGTGGCCAACAGGCTGGTGAGAAAATACCCACAATACAAGATTGTGGTATTGGACAAGCTGGACTATTGTTCAAATCTGAAGAATCTCTTT
CCTTCCAGGCCTTCTCCCAATTTCAAGTTTGTGAAGGGAGATATTGGGAGTGCAGATCTGGTAAATTATCTGCTGATCACAGAACAGATTGATACTATAATGCATTATGCAGCACAAACCCATGTGGACAATTCATTTGGGAACAGCTTCGAGTTCACCAAGAACAACATCTATGGTACCCATGTCCTTCTTGAAGCATG
CAAGGTTACTGGATTGATCAGAAGATTCATTCATGTGAGCACTGATGAAGTTTATGGTGAAACAGAGAAGGATGCCATTGAGGGCAATCATGAGGCCTGTCAGCTCCTGCCTACCAATCCTTACTCTGCAACCAAGGCAGGAGCAGAGATGCTGGTCATGGCCTATGGGAGATCCTACGATTTGCCTGTGATCACCACAA
GAGGTAACAACGTATATGGGCCTAATCAGTTTCCGGAAAAACTGATACCCAAGTTCATTCTCCTGGCAATGCAAGGTAAGTCGCTCCCAATCCACGGCGATGGATCTAATGTTAGGAGTTATTTGTACTGTGAGGATGTAGCTGAGGCTTTTGAAGTGGTTCTGCATAAAGGTGAAGTGGGGCATGTGTATAATATTGGT
ACACAGAAGGAGAGAAGGGTCATTGATGTGGCTAAGGATATCTGTAGGCTCTTTTCATTGGATGCAGAGAATGTTATAAAGTTTGTAGATAACAGGCCCTTCAATGATCAGAGATATTATCTGGACGATAAGAAACTCAAGGATCTGGGGTGGTCTGAGAGGACTAAATGGGAAGAAGGCTTGAAGAAAACAATCGATTG
GTACATTAGCCACCCTGATTGGTGGGGTGATGTGTCCGGTGCTCTGCTTCCTCATCCAAGGATGCTCACAATGGCAGGAGTTGAGAGGTATACAGAAGCCCATGATGTGGTTGAGACGAAGTCTCCAGTGCTAGAGAATGGCATCCATCAGAATCACATGCTAGAGACCTCCAACGGCCATATTCAGAAATCTGCCTTCA
AGTTCTTGATCTATGGGCGAAATGGCTGGATTGGAGGGCTTCTTGGGCAGATATGCGAAAAGCAGGGCATAACCTATGAATATGGAAATGGGAGATTGGAGGACAGGTCTCAGATCCAAACGGACATACAGAACATCAAGCCTACTCATGTTTTTAATGCCGCAGGTGTGACGGGTCGTCCTAATGTGGATTGGTGTGAA
TCCCACAAACCCGAGACTATTAGAACCAATGTGGCTGGAACTTTGAATTTGGCTGATATTTGCAGGGAGCATGGTCTTCTGCTTATGAATTTTGCAACTGGCTGTATTTTTGAATATTGTGATGTTTATCCTGAGGGAAGTGGTATTGGATTTAAGGAGGAAGACAAACCCAACTTCACTGGGTCCTTCTATTCGAAGAC
TAAGGCCATGGTTGAAGAGCTCCTACACAGTTTTGAAAATGTTTGCACTCTCAGGGTTAGAATGCCCATCTCTTCGGACCTGAATAACCCCCGCAATTTCATCACAAAGATCACTAGATATGAGAAAGTGGTAAATATACCAAACAGCATGACAGTCCTTGATGAGTTGCTGCCAATCTCGATTGAAATGGCAAAAAGGA
ATTGCACTGGCATATGGAACTTTACAAACCCAGGTGTTGTGAGCCATAATGAAATCTTGGAGATGTACAGAGAATATATTGATCCCACTTTCAAGTGGACAAACTTCAATCTTGAAGAACAGGCAAAAGTCATAGTTGCTCCTCGAAGTAATAATGAACTGGACGCTACCAAGTTGAAGACAGAATTTCCACAGTTGCTG
TCAATAAAAGATTCATTATTGAAGTATGTCTTTGAGCCGAACAGGAAGAACAAGTTAGCCTATGGAGTCTAGTCCTTGTTAGGATCAATTTTTTTATTTGTTGTAGTTGCGTTTTACTATGCTTAGGCAGGCAAAGCATCCATATGCTCAGTTGGGGGACTATTCACTACTTCATTATTTTTAGTTCACCGGTGGAGTAG
CTTATTAGGTAGAATATTCTAGATATGATCTACGATTCTTCTTCTGTTTTTACATTTTAGCTCACCATTGGAGGAGCTTACTAGCTAGGATATTCTAGATAGGTTCTGTTATTCTTCTTCTGTTTTTATTTTTTTCATTCCTTCTATGAATGTGAGTCTACTTGCAATGTTAATGTCACTGAATTTATGCTTCCAATGAA
TTCTACTAGTTGGAGTATATACATCTTTGACAAGACAGTACTCTTCTTGTATGAAATAAGTTCTTACACTTTTATAAGGTAACTGCTCCAGCTTTTTGTTTGGAAAAAAA