NA ----> NA
Intron 1 GTTTGTTGCT ... TTGTTTATAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 37.5 | 5 | 6 | 0 |
| A2 | 33.33 | 8 | 6 | 2 |
| A3 | 42.86 | 4 | 6 | 0 |
| A4 | 0 | 1 | 0 | 0 |
| A5 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A6 | 39.13 | 14 | 5 | 13 |
| A7 | 58.02 | 17 | 32 | 15 |
| A8 | 37.29 | 37 | 29 | 15 |
| A9 | 34.88 | 14 | 9 | 6 |
| A10 | 36.36 | 7 | 8 | 0 |
>TRINITY_DN38240_c0_g1_i1 from sample A8 / Example spliced isoformCTGTCCAATGTGTCAATCAGATGGAAGCCCCTAGTCCTTTCCTTTTCTTAGATTGACAACTGGCTAGTTTGAAAGGTTGGGAATGGGTCCAAAGGTAGAATTGGGGCTGATCCATGGGTTGGAGGAGGTGATTCTTACATATTACCAATAGAGGTGATTGACACTCTCCAGCTTCAAGGCATCTTCACCTTGGCTCAAGC
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GGGGTTGAATAAAAAAATATCAAA
>TRINITY_DN38240_c0_g1_i4 from sample A8 / Example unspliced isoform:CTGTCCAATGTGTCAATCAGATGGAAGCCCCTAGTCCTTTCCTTTTCTTAGATTGACAACTGGCTAGTTTGAAAGGTTGGGAATGGGTCCAAAGGTAGAATTGGGGCTGATCCATGGGTTGGAGGAGGTGATTCTTACATATTACCAATAGAGGTGATTGACACTCTCCAGCTTCAAGGCATCTTCACCTTGGCTCAAGC
AGCAAATCCTTTAACAATTTCAATCTGGTCTCAAGGTTGGAAGTCTGCAATCATGTTGAGATTAGAAGGTAATTCTGCTGCTAGTTGGGAAGCTTTTGTTAGAAGCTTGCAGCAGAGTCACAAAAGAGTCAAATATGAGGAGGATCACTTGGTGTAGTCAGAAAACTTCTCAGGGAAATACACAGCTCAACTTGGATACA
AAGCCATGTTCTTGGAAGAGGCTCAAGGGGGTAGAATCTAGATTATGGTGGTGGAAGTCAATTTGGAAGAATAAAGCCCCCATGAAGACTTTCTTTTCTTGTGGCTGTCCTTGTCCAACGAGGCCTTGACTTGGGATGTTTTATAAAATAAAATTGGCAACGTCCAGGGTTCTGTCCTTTGTGCAGGAATGCTGAAGAAA
CTATTAACTACAACTTGATTCACTGTCCCTTTGCTCAGGCTGTGTGGTCTGAAGCCATTTCTCTCTCAAGTGACCCAGGGGCTTGGCAAGGCATCTCTGTGAAGGCATGCCTGCATTCCTGGTTTGAAAATGAATATTAAAAGAGCACAGAGCCCTACCTTGTGTTGTTTCCTGGGCAATCTGGTTAGCTAGAAATGCCA
CCCTCTTCCAAGACAAATCTGTCCCATACTTCAAGCGATGTCCCAAATTAGATTCAGTTATCAGGGCATTTGGTCTGCCATCATGGTTAAGCATGTAGACAAATGAAGACTTGATGATAGACAAATATCAGGCATGGGGTTGTTTGATGGTGCCTTGAAGGTGATACAGGTTTTTGTGGTTCTGGTGGTATATTATTCTT
TTCTGGCACTCATTTTATAAGTTTCAAAGCAAGGTTAGGGAATGGTTCGAACTTCCAACAACTTTGCAGAATTGTCAGgtttgttgcttgtgtttaaatgtgctggaaataggaatgtatttcacttgcaaattttttgttacttgcttctttctcctctttatgatcacattaaaaaaattaaaactcagctggtttct
gtttcttattctcttgtttatagAGAACGTAATATACAGGATGACTCATGATCAAAAGAGGCTCAGATTGTTGATTCCGGTATTGTTCTTGAGGTAGAAGACAGGGAAGGCGAGAAGCTTCCAGCTGTCTCCAGGCCTATTCATGCACAGATTCCTTAAATTTAAGTTCTATTCTAGCTTATGCAGCTGTTCATGGAGAT
CTTGAAGTTATTTCCAGCCCAGTTTATGCCGCTGTTCACAGAGATCTTGAAGTCATTTCCAGCCCAGGCTTCAAAATTTCAGTTCTGATCAAGCTTACGCAGATGTTTACAAAGGTTTTGAAGTCATTTCCAGCTCTGATCCAGTTTTCTTTCTGTGATGCTCTCTTTTGTGGCTTCTAGCCTTTTTTGGTGTATATGGG
AACATGTTGTATCTTTACCTGCTATGATATGTTATCGACAGTACAGTATATGCTCCAAGGCATGACTTTCTTAGCTTCTTGAGATGATTATGCATTCGGTTAGACTACTTCATGCTGTTATTTATTGTCATATTGGGACAGTATGCCCTCAGGTCTAGTAGTTCTCCAGGACACACTGATTTTGAATATTCTGAAACGCT
TTGATGCCTTGTGAAGGTTAATTTTTGTGTGCACTCAGCACTTGCGAAACACTTTCCTAAGCATTATGAAATAGAATTTGTGATTTTTATGTTGGGAAAATAAATCAAGAGGAGTGAAATACTGAATACTCTTCTATAGCAAAAGGGGGTTGAATAAAAAAATATCAAA