sp|Q9FPH3|THA2_ARATH ----> Probable low-specificity L-threonine aldolase 2

Intron 1 GTAAGTTTAC ... ATGGAACCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	65.13	34	48	79
A2	50.82	30	26	36
A3	45.02	69	48	65
A4	46.67	36	22	41
A5	49.43	22	13	30
A6	54.78	116	148	133
A7	59.18	80	115	117
A8	49.28	70	71	65
A9	57.6	92	122	128
A10	52.02	89	88	105

>TRINITY_DN45927_c0_g2_i6 from sample A8 / Example spliced isoform

CTGTCTATCACCCCCAGTCCAGTCCAGTGTCATTTCATTTCATAATATTTCACCTCCAATTTCTTTTCATTTCCAGGACGTTGAGATTCCATTCTCATTCTCTCCTCTACATGCTCTGCTCTGCTCTGCTTCCCAGTTGCTGCTTGCATGCGCCTAATCCTTAATGCTTTTTACTCAATAACCCCAGCTTTAGCCTCTGG
CACTTTGAAGCTGTTTGGCAGATCGAACCCATATTCTCACAACCTTTTCATCAGATCCAGTTGCCAATGCAAATCTGCGGGAATCGAAATCTGCACCTCGGGTTGTCGATCTCCGTTCCGACACAGTGACTAAGCCGACCGATGCCATGCGAGCCGCAATGGCGAAGGCTGAAGTGGACGATAACCTCCTGGGTTCGGAT
CCCACGGCGGTGCAGTTAGAGCACCAGGTTTCCAAGTTAATGGGCAAAGAGGCCGGTTTGTTCGTGGCCTCCGGCACCATGGGGAACCTTATCAGCGTTCTTGTTCATTGCGAGGTGAGGGGCAGTGAAGTGATACTTGGTTCAGAAAGCCACATACACGTATTAGAACATGGTGGAATTTCAACAATTGGTAATGTCCA
TCCCAGAGTTGTTCCTAACAAAGAGGATGGAACAATGGACCTCGGACAAATTGAAGCTTCCATCCGGCCTGCAGTCAAAGAGTTAGAGTCATTTTTCCCTACGACACGCCTCATATGCATAGAGAACACGCATAATGCTTGTGGTGGCAGATGCATTACGGCAGAATATACAGACAAGTTAGGGGAGTTAGCTAAGTCAT
ATGGACTGAAGCTTCATATAGATGGAGCTCGCATATTTAATGCTTCCACGGCATTGGGGGTTCCTGTTGGCAGGCTTGTTAGTGCTGCTGATTCTGTTTCGGTGTGCTTGTCAAAGGGTTTGGGAGCTCCAGTCGGATCAGTCATTGTGGGTTCACAAGCATTCATTGCAAAGGCAAAGAGGCTTAGGAACACTTTAGGA
GGAGGGATGAGACAAGTTGGAGTATTGTGTGCCGCTGGCCTTGTCGCATTGCATGATATGGTTGGTCGGCTTAAAGATGACCATCATAACTGTCGGATTTTAGCTGAAGGTTTGAATAGCATTGATGGGCTCCATGTGGATCTTGATGCTGTTCATACAAATATCGTCTTTGTCAATATAACTGCCGATTTAGCGCCTTC
GGCAGAAGAGCTTTATGGAGCCATGCAGCATGAAGGTGTTCTTGCAATTCCTATGAGTCGTACCAGATTCAGATTGGTCACTCATCATGAGATCTCAGAGGATGATATTCGATACACAGTAGCATGTTTTAAGAATCATTTGCAGGGTACTTCGTTACGGTCGCTAGCAGTAAGTGAAATTGCATGAGGTTTCGAAAAAA
ATAGTACAATTTGACTTACCATGTATATCTGTTAAGCTGTTAATAAGCAGTGGTTTGTAAGCTTCTTGCAACCAAGCGTGTGATTATTTCCTTCTGAGAAAATTACGAGACTTTTAGAACTTTCATGAAAACTTAGTGTTGTTTCATTGGCATATATTATTTGGGTAAAATTTAAAACATTGATGTAATTGCCTGTGTGA
TTCTCTCAAAGGAAATGGTGTGATTCCTAATGCCCGAGAGGTTATTCAAGCTCAATATAATTCTAGCATTTCTTGCTCTTTAGATCCTGTTTTCCTCTTGTTTTTTATAAGAAATTAATTAGAATGAAAAGCTGTGCCTTTTTTTTTGTAATATGAAGAACATGGGAAGGGAACACGTCTCAACTAAGATATGATACATA
AGACTTGACTTCATATACTTGTACAACAATTGTGAAATTTCTGAAGAACAATAAAATAGGTCATGCTACCTCAGTAT

>TRINITY_DN45927_c0_g2_i2 from sample A8 / Example unspliced isoform:

CTGTCTATCACCCCCAGTCCAGTCCAGTGTCATTTCATTTCATAATATTTCACCTCCAATTTCTTTTCATTTCCAGGACGTTGAGATTCCATTCTCATTCTCTCCTCTACATGCTCTGCTCTGCTCTGCTTCCCAGTTGCTCCTTGCTTGCGCCTAATCCTTAATGCTTTTTACTCAATAACCCCAGCTTTAGCCTCTGG
CACTTTGAAGCTGTTTGGCAGATCGAACCCATATTCTCACAACCTgtaagtttacttctataaagaagccctcgaattactcatattttgttaaataattcaataaacccatggaaccagTTTCATCAGATCCAGTTGCCAATGCAAATCTGCGGGAATCGAAATCTGCACCTCGGGTTGTCGATCTCCGTTCCGACACA
GTGACTAAGCCGACCGATGCCATGCGAGCCGCAATGGCGAAGGCTGAAGTGGACGATAACCTCCTGGGTTCGGATCCCACGGCGGTGCAGTTAGAGCACCAGGTTTCCAAGTTAATGGGCAAAGAGGCCGGTTTGTTCGTGGCCTCCGGCACCATGGGGAACCTTATCAGCGTTCTTGTTCATTGCGAGGTGAGGGGCAG
TGAAGTGATACTTGGTTCAGAAAGCCACATACACGTATTAGAACATGGTGGAATTTCAACAATTGGTAATGTCCATCCCAGAGTTGTTCCTAACAAAGAGGATGGAACAATGGACCTCGGACAAATTGAAGCTTCCATCCGGCCTGCAGTCAAAGAGTTAGAGTCATTTTTCCCTACGACACGCCTCATATGCATAGAGA
ACACGCATAATGCTTGTGGTGGCAGATGCATTACGGCAGAATATACAGACAAGTTAGGGGAGTTAGCTAAGTCATATGGACTGAAGCTTCATATAGATGGAGCTCGCATATTTAATGCTTCCACGGCATTGGGGGTTCCTGTTGGCAGGCTTGTTAGTGCTGCTGATTCTGTTTCGGTGTGCTTGTCAAAGGGTTTGGGA
GCTCCAGTCGGATCAGTCATTGTGGGTTCACAAGCATTCATTGCAAAGGTTCAAACCCCGGTGGGCACAGAGCCCTGGATTATAAACTGGGCAAAGAGGCTTAGGAACACTTTAGGAGGAGGGATGAGACAAGTTGGAGTATTGTGTGCCGCTGGCCTTGTCGCATTGCATGATATGGTTGGTCGGCTTAAAGATGACCA
TCATAACTGTCGGATTTTAGCTGAAGGTTTGAATAGCATTGATGGGCTCCATGTGGATCTTGATGCTGTTCATACAAATATCGTCTTTGTCAATATAACTGCCGATTTAGCGCCTTCGGCAGAAGAGCTTTATGGAGCCATGCAGCATGAAGGTGTTCTTGCAATTCCTATGAGTCGTACCAGATTCAGATTGGTCACTC
ATCATGAGATCTCAGAGGATGATATTCGATACACAGTAGCATGTTTTAAGAATCATTTGCAGGGTACTTCGTTACGGTCGCTAGCAGTAAGTGAAATTGCATGAGGTTTCGAAAAAAATAGTACAATTTGACTTACCATGTATATCTGTTAAGCTGTTAATAAGCAGTGGTTTGTAAGCTTCTTGCAACCAAGCGTGTGA
TTATTTCCTTCTGAGAAAATTACGAGACTTTTAGAACTTTCATGAAAACTTAGTGTTGTTTCATTGGCATATATTATTTGGGTAAAATTTAAAACATTGATGTAATTGCCTGTGTGATTCTCTCAAAGGAAATGGTGTGATTCCTAATGCCCGAGAGGTTATTCAAGCTCAATATAATTCTAGCATTTCTTGCTCTTTAG
ATCCTGTTTTCCTCTTGTTTTTTATAAGAAATTAATTAGAATGAAAAGCTGTGCCTTTTTTTTTGTAATATGAAGAACATGGGAAGGGAACACGTCTCAACTAAGATATGATACATAAGACTTGACTTCATATACTTGTACAACAATTGTGAAATTTCTGAAGAACAATAAAATAGGTCATGCTACCTCAGTAT