NA ----> NA

Intron 1 GTGCTCCTGT ... TCCTTGTTAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	35.64	59.2	32	41
A2	39.43	33.2	23.2	24.8
A3	41.01	33.2	26	24.2
A4	44.31	28.2	25	26.8
A5	41.67	25.8	17.2	20.6
A6	31.39	34.2	20	16.4
A7	39.25	44.2	29	33.4
A8	31.15	54	18.6	31.8
A9	46.34	22.8	17.8	22.6
A10	46.55	16.2	12.4	16.6

>TRINITY_DN134030_c0_g1_i2 from sample A1 / Example spliced isoform

GGGTTTTAGTATAACTACTTACATCTTGTCAATCTATATTTCTTTGATATATGACTTGTACAGATTGATTATGTTTCTTAGTATATGTCCTTCGTCACTTATGGGGTTTTCTAAGAAATGATGGAAACGTTTGTGTTTCTTTTAGCTTGTGATGAGTCTTTCGTGTCTCATGTTCTAACTTCAAGTTTTTATAAGATAAT
TATCATAACATAGAAATGTGTAAAGCTGGGATGATTTTTTTTTAATTTTAAATATATAATTTTAAGATATGGATGCTTTTTAAAAGGACGGTGCAGAAAGGATGTAAATCATGCTACATCTGTATGTGACTACAGAAATATTTTGTAATCCATGCTACATCTATATGTGACTACACTACAGATGTAGCTACATCTATATG
TGACTATATGTGACTACACTACAGAAATATTTGTAAATCTGTCATAGTCTGTCACTCTATGCCAGATCTATCTTAAATCCTAATTTATTAAGCAGTATGTTTTCCTTCTTTCCTCATTTCTGTCATCTAGTAATTGTAATATGAAATTCTTCTATTACCCTGTCATCTATATTCCGTTTCTCTCCTTGTTAGGTTCTCCT
GTATTCTTTTTCTTTTTGTTTGTCTTTTTCTTAAATCAGTCCCTCTGTTAGAGTCTGGTGGACATTAATATTAAATTAAACTAAATTAATGCAAATAAAATTAATG

>TRINITY_DN134030_c0_g1_i6 from sample A1 / Example unspliced isoform:

TTCCGTTTCTCTCCTTGTTAGgtgctcctgtattccctttctccttgttagGTTCTCCTGTATTCTTTTTCTTTTTGTTTGTCTTTTTCTTAAATCAGTCCCTCTGTTAGAGTCTGGTGGACATTAATATTAAATTAAACTAAATTAATGCAAATAAAATTAATGCCTGGCCTTACAATGATGTCACAAATGAAGGCTAA
GCTAGAGCTGAGGACATGATATTCTTATCGGGTGTGATTTAATGAATTTCTATCCGGTTTCTTATCTTTTTAATGATGCCTTCAATTATTTCTGTTAATTTATTTTATTTTGATCCTTATACAGTGGAATCGGTAAGACTAATGAGAGGAGACCAAATTTTAAATTTGTCTATTTGTATCATTTTTCAATTTTAAATCTT
CTCAAGGCTGGAATAGGAGAATTTTTTATGTTGTGGAGGTCCTATGAATTTTCTATTTATTCAGTATTGATCAGTGCCAATTTTAAGGTGCTTGGCATCAGCTTCCAATAGATGCAGGCTCAGGGCCGATTTTCCATATTTTCCTTTATTTTATAATCTTATTTGTTCATTACTTCATTATTTATTAGTGTCAATTATAA
TCCTATTTATTCAGTATTGATCAGTGCCAATTTTAAGGTGCTTGGCATCAGCTTCCAATAGATGTAGGCTCAAGGCCGATTTTCCTTATTTTCCTTTATTTTATAGTCTTTTTTATTTAGTATTTATTAGTGTCAATTATAATCCTTTAATATTTTAAGGTGCTTGGCATTAAGCATTGGTTTCTAATGGATGCAGGCTC
AAGGCTGATTTTCCTTTATTTCATGCTCTTATTTAATAAAATTATTGCAATAAGAAACTTGATTTTCTGCTCCTATTTGATAAAATTATTGCAATAAGAAATTTGATTTTCTGCTCCTATTTGAT