sp|Q8RWU6|NHX6_ARATH ----> Sodium/hydrogen exchanger 6

Intron 1 GTAAGTTAAT ... TTTCCTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	70.92	8	18	6
A2	54.36	7.3	8	2
A3	55.16	12	14	2.3
A4	47.44	12.3	11	1.7
A5	37.5	3	1	0.7
A6	44.44	2.7	2	0
A7	44.44	4	3	0
A8	40	2	1	0
A9	38.1	2.7	1	0
A10	0	3.3	0	0

>TRINITY_DN128632_c0_g2_i3 from sample A1 / Example spliced isoform

AAGAATGCCCAGTACGACCCTTCACTCACACCTTCTCCTGCCCTGTATGAACAGAAATGGTATTATGGTACAGCCTCTTCTCTGCTGGTTAACTCCGGACTGAATGACTGAAGGTTGCTCGATTTTATTTTCTGCCCAGACACATCACATCTCAGCTGCTATATTTCTCTCACTAGTCGATGTCTCCATAATAATACCCA
CAAAGTCGAATTTTGCCCTTTTCTATCATCTGACCTAATGATCAATGGCTAAGATTAAGTCTGGGCCCCAAGATCTGATGGTCATGATTTAATGTGAAGTTGACATTTAATTTTGTCAACTTCACTTAGGACAAATGCACTCTTATAAAAATTTAATTATTCCTATAGTCTAAGCTTTAGAGAAAATTAAGTTTTTAATA
CGACTTGGGCAATTAATGTTGCCAGCCTGCTAGACATCATAGCCAAGGCTGAGAACACTTCCATGCCACACATTTCAACAATAGGCAATGATCATCAAGTCACCCCTACATATTGAGGGGTAAAAGGTTTGATTTGACAATTCTCTTTCTGAAATGAGTTAGAGTGTATTTCCTTAAGCACTCTTCAGAATATTATTTGA
CCAAAAGTGATCACTCTACTGCACATTGGGTAATAATTAATTGCTCAGCTAGAAGCCTTTACCCCTTGGTACCAGGGAGACACTGATGTGCATTTATCTTAGTCTCAAATTATAACTTCTTGTATTTTGAGCAATTTCACCATTCTTTAAAATGTGCTCATCTCTAAAGTTGCTAGAATAATTATTTGGATTACTTCAAA
CAGAGGCGGGATTACTCTGTTTTTGTATAATTGCAATCTTTAGCAATCAAATCCTCTGTATTGGTCTGGATATATTTATGACTGCAATTTGTAAATGCTTGTAAGGAACAATTGTATATGGTTTATGATATGCAATGTAGAGTTTGATAGTCATACACCTTCTTGTTCTCTATAACTCTAGTTTGATTGGTATCTATTTA
ATATCTCAGTCTCTACAATCTTTTCCTCTTCTGGTTTGTAGTTTTGCATGTCTTATGCATTCAATATTTTTTCTTGTAAGTCTTCCTTTATACACAGCCTTATAGTCTATGGATACCTTGACTCTGGTGTACCTCTTCAAGTATGCGGGACTTGGGATTGACAAGTAAGTACTGGAATGGTTACACTTACATGAACTTCA
TATTGTGTTTAAGAGTTTGTTCTTTCTTCTACTGCTTTTGCATATGTAGAGAGTTATCCATGCTTAAGTGGGAAAGTTTCAAATTTCTTATTAGAATTTACTTATGTCAAATTTGCTTTGTTTGGTTCTTAATGCACGGCTGTTGGATTTTCAGTCTTCAGAATCTGGAGTGCTGCCTATTTGTGCTCTTTCCTTATTTA
TCATACATGTTAGCTGAGGGCCTTG

>TRINITY_DN128632_c0_g2_i2 from sample A1 / Example unspliced isoform:

AAGAATGCCCAGTACGACCCTTCACTCACACCTTCTCCTGCCCTGTATGAACAGAAATGGTATTATGGTACAGCCTCTTCTCTGCTGGTTAACTCCGGACTGAATGACTGAAGGTTGCTCGATTTTATTTTCTGCCCAGACACATCACATCTCAGCTGCTATATTTCTCTCACTAGTCGATGTCTCCATAATAATACCCA
CAAAGTCGAATTTTGCCCTTTTCTATCATCTGACCTAATGATCAATGGCTAAGATTAAGTCTGGGCCCCAAGATCTGATGGTCATGATTTAATGTGAAGTTGACATTTAATTTTGTCAACTTCACTTAGGACAAATGCACTCTTATAAAAATTTAATTATTACTATAGTCTAAACTTTAGAGAAAATTAAGTTTTTAATA
CGACTTGGGCAATTAATGTTGCCAGCCTGCTAGACATCATAGCCAAGGCTGAGAACACTTCCATGCCACACATTTCAACAATAGGCAATGATCATCAAGTCACCCCTACATATTGAGGGGTAAAAGGTTTGATTTGACAATTCTCTTTCTGAAATGAGTTAGAGTGTATTTCCTTAAGCACTCTTCAGAATATTATTTGA
CCAAAAGTGATCACTCTACTGCACATTGGGTAATAATTAATTGCTGTGCTAGAAGCCTTTACCCCTTGGTACCAGGGAGACACTGATGTGCATTTATCTTAGTCTCAAATTATAACTTCTTGTATTTTGAGCAATTTCACCATTCTTTAAAATGTGCTCATCTCTAAAGTTGCTAGAATAATTATTTGGATTACTTCAAA
CAGAGGCGGGATTACTCTGTTTTTGTATAATTGCAATCTTTAGCAATCAAATCCTCTGTATTGGTCTGGATATATTTATGACTGCAATTTGTAAATGCTTGTAAGGAACAATTGTATATGGTTTATGATATGCAATGTAGAGTTTGATAGTCATACACCTTCTTGTTCTCTATAACTCTAGTTTGATTGGTATCTATTTA
ATATCTCAGTCTCTACAATCTTTTCCTCTTCTGGTTTGTAGTTTTGCATGTCTTATGCATTCAATATTTTTTCTTGTAAGTCTTCCTTTATACACAGCCTTATAGTCTATGGATACCTTGACTCTGGTGTACCTCTTCAAGTATGCGGGACTTGGGATTGACAAGTAAGTACTGGAATGGTTACACTTACATGAACTTCA
TATTGTGTTTAAGAGTTTGTTCTTTCTTCTACTGCTTTTGCATATGTAGAGAGTTATCCATGCTTAAGTGGGAAAGTTTCAAATTTCTTATTAGAATTTACTTATGTCAAATTTGCTTTGTTTGGTTCTTAATGCACGGCTGTTGGATTTTCAGTCTTCAGAATCTGGAGTGCTGCCTATTTGTGCTCTTTCCTTATTTA
TCgtaagttaattttttaatttgatattatcgtatagttaatgggtgaatttggattgctagaattgtttccttttatttctgctgaaagattacaagcaatttgtatgtaatttcccttcctgtagATACATGTTAGCTGAGGGCCTTGGTCTCTCTGGGATTGTTGCGATACTGTTCTGTGGAATTGTAAGTATTTTG
GGACTGTTCCTTGTTAGTATAGTTTTAGTAATATTAGCTAAAGTTTTGTCTAAGGAGCTGAATTATTGCTTGCAGGTGATGAAGCATTACACTTTCTC