sp|Q42885|AROC2_SOLLC ----> Chorismate synthase 2, chloroplastic
Intron 1 GTAAGTTATC ... TTTGTTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 70.37 | 4 | 9 | 10 |
| A2 | 75 | 4 | 10 | 14 |
| A3 | 50 | 9 | 13 | 5 |
| A4 | 67.74 | 5 | 10 | 11 |
| A5 | 60 | 4 | 2 | 10 |
| A6 | 34.43 | 20 | 17 | 4 |
| A7 | 33.33 | 9 | 9 | 0 |
| A8 | 52.38 | 5 | 8 | 3 |
| A9 | 33.33 | 19 | 17 | 2 |
| A10 | 34.69 | 16 | 13 | 4 |
>TRINITY_DN41103_c1_g1_i2 from sample A8 / Example spliced isoformCGTTCAGCTCTTTGTTAATTAGTAGTCTTCCTATACCCCAATGAAGCACGCCTTTGATGGGACCTGTAGACAACAGTCAGACAGGAGTTGAGGCGAGCTTCCGATTAGTGGAAACATAGAGCTATTTCGTGACTAGAATCACTCCCTAGGCCCGTCTCAAGGGTTTGTCCCCCTGGTTTATTCCTCCCCATTTGAAACCT
ATAAATTGAAGCCCGCCGGTGTTCGGAATGTTACGTAAAACACGGGGACCTCTTAAGCATATCCAGTCTCAGCAGTTCCCCCGTGTGCTGCGTGGAATTCATCTGGTGCCATTTCGAGTTGTAGGGAAATCACGGGGTTTTGTAAACCATATTAGCTCTTTGGGTCTGGGATTACAATGAAATTTCATTAGCGTATCGGC
CCTCTCATGCGGATGCCACATATGACTTCAAATATGGTGTTCGCTTAGTGCAGGGAGGTGGCAGATCTTCAGCACACGAAACTATTGGAAGAGTAGCTGCTGGGGCTGTAGCAAAGAAGATACTTCAGCTAAAAGCTGGGACTGAGGTTCTAGCATACGTATCGCAGGTTCATAAAGAAGTTCTCCCAGATGGGGCTGTT
GATCATGACACGTTAACTCAGGCTGAGATAGAAAGCAATATTGTAAGGTGCCCAGATCCTGTATATGCTGAGAAGATGATAGCTGCTATAGATAATGTTCGAACAAAAGGTGATTCAGTTGGTGGGGTTGTTACCTGTATTGTAAGGAATGTACCGAGGGGACTCGGTTCACCAGTATTTGACAAGCTCGAGGCAGAGCT
GGCAAAGGCTCTAATGTCCTTGCCTGCAACCAAAGGATTTGAAATTGGCAGTGGGTTTTCAGGAACTTTAATCACTGGCAGTGAGCATAATGATGAGTTTTACATGGATGAGAGGGGAGATATTAGGACCCGAACCAATAGATCAGGTGGTATACAGGGTGGGATATCTAACGGCGAGATGATAAAAGTGAGACTCGCTT
TTAAACCGACATCTACCATTACGAGGAAACAAATGACCGTCACCAGAAACAGAGAGGAGACTGAACTCCAAGCACGTGGTCGACATGATCCATGTGTAGTCCCTAGAGCTGTACCCATGGTTGAAGCTATGGTGGCTTTGGTGTTAGTTGATCAGTTGATGCAACAGTATGCCCAATGTGAGTTGTTTCCCCTAGGTTCA
CTTCAGGATTCATTGGATCAGCAGAATGCGAAGGCAGTAGAAATGCTCAGTAACTAGGGAGGATGATAAAGCTGGAAGTTGCAGTTTTGTTTTGGAGGTTGATTTTTATTGTCTTTTTCAAATAACTGAGATAGCATGATGATTGTTTATATGAAGGCAATAATATGTAACAGTCAGGTTAAAGTGTTTGTATCCATACA
AAACCCAAAGCAACAAATGAAACATATCAGCTCTTTTTATTTGTAGTATCCAGGCATGGAACTTATGCTATGGAAATCTGATTTCTTTTGGGGGATTTAAGAGCACTGGTAATATAACTGAATATGGCTACTAAATGTACTGTGCCATGATTAGAGAAGCATGTCACACATTTGTATATCAGAAGACTTTAAAAAAGAGA
AGATCATGGCCAATGCACTTTTCCAAATGCTGCTGATGCAATATGAAATAAAATATAATTGAGGGCTGAGGCAGTTTTTCTGTAATAATAACAGCACAAGGATTGGCAATTGATGGTTATGTCTTGAACTGCCAACTTCTTGAATAGAGTGCATGCTTTTATAATGTTACATGTTTTAAAATTTTAAAATTCTCAATGCA
ATAATACCTGACTCAGCTATTGTAACCTGTTTAATTATCTTACAAGAATATTGGAAAGATAAGTGGTACAGTCTAGCACACATTATGAACTAAATCCCTGAGAGAGATATTGGCACGCAGCAACGAGATTTTTTTTGGAGTAGTCTTTTGATTTGTTGGATCAAAACATAACATTATGCTGTTGTTTTATCTTGTCTATA
TCATAACCTGAATTCTAGTGGGAAGCAATCCCTTAGTGACCAGTGGACTGGGCTTAAATTTTC
>TRINITY_DN41103_c1_g1_i5 from sample A8 / Example unspliced isoform:CGTTCAGCTCTTTGTTAATTAGTAGTCTTCCTATACCCCAATGAAGCACGCCTTTGATGGGACCTGTAGACAACAGTCAGACAGGAGTTGAGGCGAGCTTCCGATTAGTGGAAACATAGAGCTATTTCGTGACTAGAATCACTCCCTAGGCCCGTCTCAAGGGTTgtaagttatcgtgccaggttttttttctcgttggt
cacagggaaaggacagaagcagatgcatttataacgatgcatgcttcgatgatttaataatttctttattgatcaattttatagcttattaataagagaaacatatgcaattcagagagcaaaaccatcacgcttgtgaaatttatcaatttaaatttcccgttggtagtttatataatgcacctagacctacctgcatc
tcatatttgttgagtgacctccttcccgcatctcatatttgttgcagTGTCCCCCTGGTTTATTCCTCCCCATTTGAAACCTATAAATTGAAGCCCGCCGGTGTTCGGAATGTTACGTAAAACACGGGGACCTCTTAAGCATATCCAGTCTCAGCAGTTCCCCCGTGTGCTGCGTGGAATTCATCTGGTGCCATTTCGAG
TTGTAGGGAAATCACGGGGTTTTGTAAACCATATTAGCTCTTTGGGTCTGGG