sp|Q9ZR39|U2A2A_NICPL ----> Splicing factor U2af large subunit A

Intron 1 GTATGTGCTT ... GAATTTTCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	12.08	94.7	0	13
A2	18.82	69	1	16
A3	23.21	86	6	26
A4	18.28	76	8	17
A5	35.29	22	0	12
A6	9.88	73	4	8
A7	19.05	102	3	24
A8	21.58	109	5	30
A9	20.63	100	2	26
A10	18.87	86	5	20

>TRINITY_DN104621_c0_g1_i11 from sample A4 / Example spliced isoform

CAAAATGCATGTAACTGAGATAATGACTATTGTTAACTTTATGAAATAAAATAAGTTGTCAAAATTAAAAGCAAAAAGTAATTATGCAAGTATTGATTTTAGACACATTCTTTAGTTTGAGGGGGTTAAGTCCATTATGTCTGAACTGTGTGTTTATACCTATTTCATAATGAATCATATTACCTATAATTCACCATTTT
CTCTTATTATTGTTATAATTATAACTTTTATCTAACAGACCACCATGTATTGTGAAATCTCATCAGGGAGTAACAGGCCTCTCACCATGCTAAGTAAAAGTAACAATGTACGTAGGCTTAAGTCTTGTAGAAAAAAATAATTATGTAATTAGTGATTCAAGTTTTAGACACATTCCTGTGCCTTAGGGAGTTAAGTCCAA
TATGTCTGAATGGTGTATTTATATTACCTCTTTCATAATGAATCATATTACCTATCGTGCACTATTTTCTCTTGAGGTTATTATTGTTGTAAATTTTATCTTTATCAGGCAGACCACTATGTATTGTGAAACCTCATCTGGAGAAACAGCTTTCTCTCCAAGCTCAAATGTGTTCAGGAATCACAATCCAGGATAATCCA
GAAAGCAGCTTAAGAACTACCTGAAAAAGTATCCATTCTCCTTTGCTGCCTCCCATACAGTATGGAGGAAGGTCATGCAGGAAAGTGCCTGGACAGTGGAAACCGAGCATCCTGTAGGTCAAGATTGATTATGCAATGCCTTGAGCAGTTGTTTCTCATATTTCTCTGTACAACTGGTACTCTGAAGCTGTTCTCAAGTG
TCCTATGCTTCTAGTAGCAAATTTTCTTTGTCCTGTTGATGCTGTTATTGAAGGTTCTTTTATCCGAAACCCACATTAGAAACCTTTCTATTAGAAACCCACATTGTCTTCATTCTGTCTGTGTATGATGTTACTTTTTTATTTCTATGCATGGAATGGACCTTATTTTTCTGATTCATCATTTTTTATATCATTTTGTC
TTACCCACAGAGTATGAGCTTTGTTTAATCTGAATGTGCATAGGTAAAACTGCAGGATGTTGTTTGATCTGAGTTTAGCAGTTGAAATTTTATTTTGTGCTTTGGTTTTTGTTAAATTTCCAATCTGCTTCTTGTATGGCATGTCGAGACATTGACTGTGATTTATTAGCAGTGATGTAAGTTATATGTATTTTGGATAA
ATGATTAACGTTATTGTCTCTTTTGCTGACTCTAGGTCGTGGTTTATTTTTTCTCACGGCTGGCTAACTCTGCTCTCATGTATTTGTCTGTCACTTAGCTCTAACAAATACTATCTTATGTGTTAATAGAATGATTCTTATTTGATTTATATTCTATGCAGATTTTTCTTGGAGGGATTTCACATACACTGGATTCTGAT
AAGGTGAGGATGTCTTCAATGTTCAGATGCTGAGTTCTTCGTCAAGGAAGCAGGCTTCATGTGCTAACTTTTTATAGGAATGAATTTATGGAAAATATTCTCAATCATAAGACAACAATAATAGTACTTTACAAAGTGAATAGAAGGGTTGTGGGGCTTGTGAGTTTCAGGAAAAGAAACAGAATAAACGTAGTTCGTGT
TTCCTTTTTATTTAATTAGTGATTAGTACTGGTGTTTTGGGAGCACTTGTTCCTAATATCCTCCAGTTTCTGGAGATGATGACTGCATTTGGAAAAGCCAAAATGAGTGAAAGAATAAAACTGATCTATACCTTTGTTCAGTATTTAATACTGCATAAACAGTGTGAGCTTTGAATTCGTTGATACTACTTTTTACAGGT
CAGAGAGATTGTCACTGCATTTGGAGAACTGAAGGCATACCACTTGGAAGTTGACACTAATAGGAAACCTCCTGAAGCTTTTGCATTCCTTGAGTATGTTGACTCTTCTGTCACTTTGAAAGCCTGTGCGGGGCTGAATGGTATGAGATTAGGAGGTCGTGTTATAACAGTAGTTCAGGCCACTCCTGATGCTTCTGGTG
AGGGTGGGAGCGTTCCATTCTATGGTATCCCTGAACATGCAAAACCTCTTGTACAAAAGCCTACACGGGTTCTTGAACTGAAGAATGTGCTAACCAAAGAGGAGCTTCTACAACTGTCAGAAGTTGAACTGGAAGAAATATCTGAAGATGTGCGTCTTGAGTGTGCCAGGTTTGGTACTGTCAAATCACTTAATATTGTA
AGGTGGAATAGAAGTGGAACGGACATTTCTATTACGTATAATGTTGGTCAAAATCAGGGTGGTAACATAACTTCTATCCAAGGCAAGGAAAATGGAAATCCACAGAAGTCTTTCCTGGATGTAGCTGATTGTGAAAATCTCTCCAAATCTTTGGACCAGCAAAACAAGGTTGTCGAAGATATTATGGAAAATGGAAGAGA
GCCTATGGATGGTATTGTGGATCCTAATGATGATCCAGTGCAAGAAGATATGGAATGTGATGAGAATGATGTGGCAAACAAGTTGGATGCAGGTGGTGCTGTTTCAGATGGAAATGCATTGCAAAATGTGAATTTGACATCTCCGGATAAGGAAGAACATGGAAATGCTGGTATAATTAATGAAGTAGCCTTTGCCGATA
AAGCTCCTGACCAGAGTGTTGATGCTATAGACTTGGGGAAACATTCTCTTGCTGGAGACCTGGTACAACAGGAAAGAGATGAGGGGCAGAATGCTTGTTTGGATACTGTGAATCATCCAGTGTCTGTAGTTGCAACCAAAGAAGATGGTGAGACATTAATAGATTGTGAGTTACTAGAAGTGGGTAGCATCCTCATCGAA
TTTTCAAGGGAAGAAGCCACATGTTTGGCAGCACATACTTTGCATGGACGTCTGTATGGAAGTCGAAAGGTGATAGCGAGCTATTTTCCTCATGGTGTGTACCAGAAGATATTCCCAAGAGGGAATGCTCGATGAGTGAGTATAGAATTCTTCTGTCCAAGAATGTCGTCATCTGCCTGTCATGATTGAGTTAATTACTT
GCTGTCGATTATTTCTAGATCAATTCAATGCTTTCATTCTCCATACATATATCTTGTGACTGCTCTACCGTGTATGTAACAAAGTATTGCGATTTATACATCTTGAGGGTGGAGTAGTTGGCAAATTACTACTGTGTATGTAGCAAGCTTCTGTCACATATGCAAATTACTACTGTGTATGTAGCAAGCTTCCGTCACAT
ATTCAAGGATTCATAGGCAATGAGTGCACCTCATATATTTGGCTGAATCTTGCATTCGATGAGACTGGAATATGTTTTTCAAAAGCATATTAATTATTTTCAATAATATCCTCTGAAACATCATCGAAAGTTCTTTTAATGCATTGAAGTTTGTCTTGATTTACTGAGCCCCCT

>TRINITY_DN104621_c0_g1_i10 from sample A4 / Example unspliced isoform:

TGCCTTGGGATTTAAAAGTTTAAATTTGCATACTAATTACCAAAACATATGTTTCTCTAAGGGTGGGAGCGTTCCATTCTATGGTATCCCTGAACATGCAAAACCTCTTGTACAAAAGCCTACACGGGTTCTTGAACTGAAGAATGTGgtatgtgcttagatattttcttgtgataatgtgtccaatttttataagcagt
tttaagtaatggttgtattgaattttcagCTAACCAAAGAGGAGCTTCTACAACTGTCAGAAGTTGAACTGGAAGAAATATCTGAAGATGTGCGTCTTGAGTGTGCCAGGTTTGGTACTGTCAAATCACTTAATATTGTAAGGTGGAATAGAAGTGGAACGGACATTTCTATTACGTATAATGTTGGTCAAAATCAGGGT
GGTAACATAACTTCTATCCAAGGCAAGGAAAATGGAAATCCACAGAAGTCTTTCCTGGATGTAGCTGATTGTGAAAATCTCTCCAAATCTTTGGACCAGCAAAACAAGGTTGTCGAAGATATTATGGAAAATGGAAGAGAGCCTATGGATGGTATTGTGGATCCTAATGATGATCCAGTGCAAGAAGATAAGGAATGTGA
TGAGAATGATGTGGCAAACAAGTTGGATGCAGGTGGTGCTGTTTCAGATGGAAATGCATTGCAAAATGTGAATTTGACATCTCCGGATAAGGAAGAACATGGAATGTGATGAGAATGATGTGGCAAACAAGTTGGATGCAGGTGGTGCTGTTTCAGATGGAAATGCATTGCAAAATGTGAATTTGACATCTCCGGATAAG
GAAGAACATGGAAATGCTGGTATAATTAATGAAGTAGCCTTTGCCGATAAAGCTCCTGACCAGAGTGTTGATGCTATAGACTTGGGGAAACATTCTCTTGCTGGAGACCTGGTACAACAGGAAAGAGATGAGGGGCAGAATGCTTGTTTGGATACTGTGAATCATCCAGTGTCTGTAGTTGCAACCAAAGAAGATGGTGA
GACATTAATAGATTGTGAGTTACTAGAAGTGGGTAGCATCCTCATCGAATTTTCAAGGGAAGAAGCCACATGTTTGGCAGCACATACTTTGCATGGACGTCTGTATGGAAGTCGAAAGGTGATAGCGAGCTATTTTCCTCA

Intron 2 GTGAGGATGT ... CTTTTTACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	34.66	39.3	8.7	20.8
A2	34.04	29.3	6.9	15.5
A3	30.06	44.3	15.6	19.3
A4	37.34	31.6	14.3	18.7
A5	59.33	12.5	14.7	18
A6	18.91	14.4	1.9	3.1
A7	27.68	36.6	3.7	14.3
A8	27.24	29.2	4.7	11.8
A9	34.3	43.6	0.9	25.3
A10	23.87	38.5	5.1	12.3

>TRINITY_DN130232_c0_g1_i5 from sample A1 / Example spliced isoform

TACATGGAAATAATTTGATAATCAAACGACCCAAAGACTTTGTCGAAGCAGCAGGGTTCAGAGAGTTACTGTTGTGGTGCAGAATGGAGGCCCTGAGAAGTCCCTGCCTGCAGCTGATCTCATATCTAGTGTTGTGACCGACTCTCCTCACAAGATTTTTCTTGGAGGGATTTCACATACACTGGATTCTGATAAGGTCA
GAGAGATTGTCACTGCATTTGGAGAACTGAAGGCATACCACTTGGAAGTTGACACTAATAGGAAACCTCCTGAAGCTTTTGCATTCCTTGAGTATGTTGACTCTTCTGTCACTTTGAAAGCCTGTGCGGGGCTGAATGGTATGAGATTAGGAGGTCGTGTTATAACAGTAGTTCAGGCCACTCCTGATGCTTCTGGTGAG
GGTGGGAGCGTTCCATTCTATGGTATCCCTGAACATGCAAAACCTCTTGTACAAAAGCCTACACGGGTTCTTGAACTGAAGAATGTGCTAACCAAAGAGGAGCTTCTACAACTGTCAGAAGTTGAACTGGAAGAAATATCTGAAGATGTGCGTCTTGAGTGTGCCAGGTTTGGTACTGTCAAATCACTTAATATTGTAAG
GTGGAATAGAAGTGGAACGGACATTTCTATTACGTATAATGTTGGTCAAAATCAGGGTGGTAACATAACTTCTATCCAAGGCAAGGAAAATGGAAATCCACAGAAGTCTTTCCTGGATGTAGCTGATTGTGAAAATCTCTCCAAATCTTTGGACCAGCAAAACAAGGTTGTCGAAGATATTATGGAAAATGGAAGAGAGC
CTATGGATGGTATTGTGGATCCTAATGATGATCCAGTGCAAGAAGATATGGAATGTGATGAGAATGATGTGGCAAACAAGTTGGATGCAGGTGGTGCTGTTTCAGATGGAAATGCATTGCAAAATGTGAATTTGACATCTCCAGATAAGGAAGAACATGGCAATGCTGGTATCATTAATGAAGTAGCCTTTGCCGATAAA
GCTCCTGACCAGAGTGTTGATGCTATAGACTTGGGGAAACAGTCTCTTGCTGGAGACCTGGTACAACAGGAAAGAGATGAGGGGCAGAATGCTTGTTTGGATACTGTGAATCATCCAGTGTCTGTAGTTGCAACCAAAGAAGATGGTGAGACATTAATAGATTGTGAGTTACTAGAAGTGGGTAGCATCCTCATCGAATT
TTCAAGGGAAGAAGCCACATGTTTGGCAGCACATACTTTGCATGGACGTCTGTATGGAAGTCGAAAGGTGATAGCGAGCTATTTTCCTCATGGTGTGTACCAGAAGATATTCCCAAGAGGGAATGCTCGATGAGTGAGTATAGAATTCTTCTGTCCAAGAATGTCGTCATCTGCCTGTCATGATTGAGTTAATTACTTGC
TGTCGATTATTTCTAGATCAATTCAATGCTTTCATTCTCCATACATATATCTTGTGACTGCTCTACCGTGTATGTAACAAAGTATTGCGATTTATACATCTTGAAGGTGGAGTAGTTGGCAAATTACTACTGTGTATGTAG

>TRINITY_DN130232_c0_g1_i12 from sample A1 / Example unspliced isoform:

TCTTGTGAATGCTTTTATCAGTGATCGACATCATATATATATATATATATATATAATGTGTTTTCTTGTCTGAATGCCCATCTTGCCTTGTAAACCCAGGTGTTTGTACATGATATATGATGCAGGGTTTTGCCAACTTGTCAAGGTGATTAGTAAAAGTTGTATAGAATCAGCTAAAAGAATAAAATATGTACTAGTAA
AAGGACCTTTTACTGAAGTTCACCTAGATAAACAGGGTCCAGGGTCTGCCCCATTACCGCGTCACTGTATAACATAGTTACTGGAGTCTTATGTTGGGCTCCACTTGGTTCTGAGTTTAAACAGGATTTGAGTGATGCGATTTTGATTTGCTACTCAACCACGAATCAGATCAAGGTGGTGAGTTTAATTTGCAATTTAA
ATTGAGTTGATGAGTCTCAAAAGTCAGAATTGGTCATCATAAAGGACTCATTTTGCTTGTTTTTCTGATATGATTTCACAATAGACAACTATAGACTTGTCCTGTCCAGAATCCATGGTATTTTGTGGTATGTACTATTGTATAAATACTTTTTAAGTGAGGTGTTATTGAAAACTTGCACTATATGACAACTGTAAAAT
TACATATTGATGAAAATATATATTTTTACTGAAACTTTGTGCATTTTACCATTATTCTAATTTCTCAGTCAACTCACTAGTTTTTCAAGTTGGAGCAACTCTTACTTTTCAGCCGTGCTACATCATTCTTCGAGTTGAGTTTGGTAACTTTGCTGTATAGTGCAAGTATGATCCCTGTAACATTTTATGTCTTCCTGATT
GGAGACAGTTCTTGATACATACTTTGCATGGAGCCAATCTAAGAAGATGCTAATAAAATAAGACATTTGCCGAAGTCCACAAAATTGGTTTACAGGACCCACTTGGTTACCAAACCAATACATAGCCACAGTCTGTACCAATACGGCTTGAAAATATTGACAATGATATGATGGTGCATCATTAGTAAAATGCCTAGTGA
AAATTACCATGAATTAGTGTAGATAGTAACTTATGGTGCACACTGCAGACAAGATGGGTTTTATTCTCTTCCTGGTTTTTTCATTGTCATGGTAATGTGAATGATCTATTGCTTCTGCTGGTTTCTACTTTCTCATCAAGGGCTTATTAGTATATGGATACCTTTAGAAATCAATAAAATGTTCTCTACTGGCAAATTCT
TTGATGCAATCAACTGAGTCAAGAAATAACGTAGGTTTCATCTTTCCTCATCTCATCCTCTTGTTTAATTTTGAAATTGCCATTATTTTTCGCGGAAGTTGAAAGAATTCCTGTCTCTGAGATGTGGATGGAATTCTCGTAGGTTTGGATCTTCGGGCCCATCAGTTTATGCGATGATCTACTTGATTGTCTCTGTTCTT
TGCTTTATAGATATATTCTGTTCTGAGGTAGGTTATCTATGTAGCAGGGGTTCAGAGAGTTACTGTTGTGGTGCAGAATGGAGGCCCTGAGAAGTCCCTGCCTGCAGCTGATCTCATATCTAGTGTTGTGACCGACTCTCCTCACAAGATTTTTCTTGGAGGGATTTCACATACACTGGATTCTGATAAGgtgaggatgt
cttcaatgttcagatgctgagttcttcgtcaaggaagcaggcttcatgtgctaactttttataggaatgaatttatggaaaatattcagaatcataagacaacaataatagtactttacaaagtgaatagaagggttgtggggcttgtgagtttcaggaaaagaaacagaataaacgtagttcgtgtttcctttttattt
aattagtgattagtactggtgttttgggagcacttgttcctaatatcctccagtttctggagatgatgactgcatttggaaaagccaaaatgagtgaaagaataaaactgatctatacctttgttcagtatttaatactgcataaacagtgtgagctttgaattcgttgatactactttttacagGTCAGAGAGATTGTC
ACTGCATTTGGAGAACTGAAGGCATACCACTTGGAAGTTGACACTAATAGGAAACCTCCTGAAGCTTTTGCATTCCTTGAGTATGTTGACTCTTCTGTCACTTTGAAAGCCTGTGCGGGGCTGAATGGTATGAGATTAGGAGGTCGTGTTATAACAGTAGTTCAGGCCACTCCTGATGCTTCTGGTGAGGGTGGGAGCGT
TCCATTCTATGGTATCCCTGAACATGCAAAACCTCTTGTACAAAAGCCTACACGGGTTCTTGAACTGAAGAATGTGCTAACCAAAGAGGAGCTTCTACAACTGTCAGAAGTTGAACTGGAAGAAATATCTGAAGATGTGCGTCTTGAGTGTGCCAGGTTTGGTACTGTCAAATCACTTAATATTGTAAGGTGGAATAGAA
GTGGAACGGACATTTCTATTACGTATAATGTTGGTCAAAATCAGGGTGGTAACATAACTTCTATCCAAGGCAAGGAAAATGGAAATCCACAGAAGTCTTTCCTGGATGTAGCTGATTGTGAAAATCTCTCCAAATCTTTGGACCAGCAAAACAAGGTTGTCGAAGATATTATGGAAAATGGAAGAGAGCCTATGGATGGT
ATTGTGGATCCTAATGATGATCCAGTGCAAGAAGATATGGAATGTGATGAGAATGATGTGGCAAACAAGTTGGATGCAGGTGGTGCTGTTTCAGATGGAAATGCATTGCAAAATGTGAATTTGACATCTCCAGATAAGGAAGAACATGGCAATGCTGGTATCATTAATGAAGTAGCCTTTGCCGATAAAGCTCCTGACCA
GAGTGTTGATGCTATAGACTTGGGGAAACAGTCTCTTGCTGGAGACCTGGTACAACAGGAAAGAGATGAGGGGCAGAATGCTTGTTTGGATACTGTGAATCATCCAGTGTCTGTAGTTGCAACCAAAGAAGATGGTGAGACATTAATAGATTGTGAGTTACTAGAAGTGGGTAGCATCCTCATCGAATTTTCAAGGGAAG
AAGCCACATGTTTGGCAGCACATACTTTGCATGGACGTCTGTATGGAAGTCGAAAGGTGATAGCGAGCTATTTTCCTCATGGTGTGTACCAGAAGATATTCCCAAGAGGGAATGCTCGATGAGTGAGTATAGAATTCTTCTGTCCAAGAATGTCGTCATCTGCCTGTCATGATTGAGTTAATTACTTGCTGTCGATTATT
TCTAGATCAATTCAATGCTTTCATTCTCCATACATATATCTTGTGACTGCTCTACCGTGTATGTAACAAAGTATTGCGATTTATACATCTTGAAGGTGGAGTAGTTGGCAAATTACTACTGTGTATGTAGCAAGCTTCTGTCACATATGCAAATTACTACTGTGTATGTAGCAAGCTTCCGTCACATATTCAAGGATTCA
TAGGCAATGAGTGCACCTCATATATTTGGCTGAATCTTGCATTCGATGAGACTGGAATATGTTTTTCAAAAGCATATTAATTATTTTCAATAATATCCTCTGAAACATCATCGAAAGTTCTTTTAAT

Intron 3 GTACATGTTA ... TTTCTCTAAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	16.67	95	17	21
A2	25.52	42.3	13	16
A3	17.98	50.2	8	14
A4	23.16	74.7	18	27
A5	10.63	16.8	1	3
A6	16.61	85.3	15	19
A7	11.83	85.7	14	9
A8	13.07	69.8	6	15
A9	15.7	72.5	8	19
A10	10.27	70	8	8

>TRINITY_DN130232_c0_g1_i9 from sample A1 / Example spliced isoform

TCTTGTGAATGCTTTTATCAGTGATCGACATCATATATATATATATATATATATAATGTGTTTTCTTGTCTGAATGCCCATCTTGCCTTGTAAACCCAGGTGTTTGTACATGATATATGATGCAGGGTTTTGCCAACTTGTCAAGGTGATTAGTAAAAGTTGTATAGAATCAGCTAAAAGAATAAAATATGTACTAGTAA
AAGGACCTTTTACTGAAGTTCACCTAGATAAACAGGGTCCAGGGTCTGCCCCATTACCGCGTCACTGTATAACATAGTTACTGGAGTCTTATGTTGGGCTCCACTTGGTTCTGAGTTTAAACAGGATTTGAGTGATGCGATTTTGATTTGCTACTCAACCACGAATCAGATCAAGGTGGTGAGTTTAATTTGCAATTTAA
ATTGAGTTGATGAGTCTCAAAAGTCAGAATTGGTCATCATAAAGGACTCATTTTGCTTGTTTTTCTGATATGATTTCACAATAGACAACTATAGACTTGTCCTGTCCAGAATCCATGGTATTTTGTGGTATGTACTATTGTATAAATACTTTTTAAGTGAGGTGTTATTGAAAACTTGCACTATATGACAACTGTAAAAT
TACATATTGATGAAAATATATATTTTTACTGAAACTTTGTGCATTTTACCATTATTCTAATTTCTCAGTCAACTCACTAGTTTTTCAAGTTGGAGCAACTCTTACTTTTCAGCCGTGCTACATCATTCTTCGAGTTGAGTTTGGTAACTTTGCTGTATAGTGCAAGTATGATCCCTGTAACATTTTATGTCTTCCTGATT
GGAGACAGTTCTTGATACATACTTTGCATGGAGCCAATCTAAGAAGATGCTAATAAAATAAGACATTTGCCGAAGTCCACAAAATTGGTTTACAGGACCCACTTGGTTACCAAACCAATACATAGCCACAGTCTGTACCAATACGGCTTGAAAATATTGACAATGATATGATGGTGCATCATTAGTAAAATGCCTAGTGA
AAATTACCATGAATTAGTGTAGATAGTAACTTATGGTGCACACTGCAGACAAGATGGGTTTTATTCTCTTCCTGGTTTTTTCATTGTCATGGTAATGTGAATGATCTATTGCTTCTGCTGGTTTCTACTTTCTCATCAAGGGCTTATTAGTATATGGATACCTTTAGAAATCAATAAAATGTTCTCTACTGGCAAATTCT
TTGATGCAATCAACTGAGTCAAGAAATAACGTAGGTTTCATCTTTCCTCATCTCATCCTCTTGTTTAATTTTGAAATTGCCATTATTTTTCGCGGAAGTTGAAAGAATTCCTGTCTCTGAGATGTGGATGGAATTCTCGTAGGTTTGGATCTTCGGGCCCATCAGTTTATGCGATGATCTACTTGATTGTCTCTGTTCTT
TGCTTTATAGATATATTCTGTTCTGAGGTAGGTTATCTATGTAGCAGGGGTTCAGAGAGTTACTGTTGTGGTGCAGAATGGAGGCCCTGAGAAGTCCCTGCCTGCAGCTGATCTCATATCTAGTGTTGTGACCGACTCTCCTCACAAGATTTTTCTTGGAGGGATTTCACATACACTGGATTCTGATAAGGTGAGGATGT
CTTCAATGTTCAGATGCTGAGTTCTTCGTCAAGGAAGCAGGCTTCATGTGCTAACTTTTTATAGGAATGAATTTATGGAAAATATTCAGAATCATAAGACAACAATAATAGTACTTTACAAAGTGAATAGAAGGGTTGTGGGGCTTGTGAGTTTCAGGAAAAGAAACAGAATAAACGTAGTTCGTGTTTCCTTTTTATTT
AATTAGTGATTAGTACTGGTGTTTTGGGAGCACTTGTTCCTAATATCCTCCAGTTTCTGGAGATGATGACTGCATTTGGAAAAGCCAAAATGAGTGAAAGAATAAAACTGATCTATACCTTTGTTCAGTATTTAATACTGCATAAACAGTGTGAGCTTTGAATTCGTTGATACTACTTTTTACAGGTCAGAGAGATTGTC
ACTGCATTTGGAGAACTGAAGGCATACCACTTGGAAGTTGACACTAATAGGAAACCTCCTGAAGCTTTTGCATTCCTTGAGTATGTTGACTCTTCTGTCACTTTGAAAGCCTGTGCGGGGCTGAATGGTATGAGATTAGGAGGTCGTGTTATAACAGTAGTTCAGGCCACTCCTGATGCTTCTGGTGAGGGTGGGAGCGT
TCCATTCTATGGTATCCCTGAACATGCAAAACCTCTTGTACAAAAGCCTACACGGGTTCTTGAACTGAAGAATGTGCTAACCAAAGAGGAGCTTCTACAACTGTCAGAAGTTGAACTGGAAGAAATATCTGAAGATGTGCGTCTTGAGTGTGCCAGGTTTGGTACTGTCAAATCACTTAATATTGTAAGGTGGAATAGAA
GTGGAACGGACATTTCTATTACGTATAATGTTGGTCAAAATCAGGGTGGTAACATAACTTCTATCCAAGGCAAGGAAAATGGAAATCCACAGAAGTCTTTCCTGGATGTAGCTGATTGTGAAAATCTCTCCAAATCTTTGGACCAGCAAAACAAGGTTGTCGAAGATATTATGGAAAATGGAAGAGAGCCTATGGATGGT
ATTGTGGATCCTAATGATGATCCAGTGCAAGAAGATATGGAATGTGATGAGAATGATGTGGCAAACAAGTTGGATGCAGGTGGTGCTGTTTCAGATGGAAATGCATTGCAAAATGTGAATTTGACATCTCCAGATAAGGAAGAACATGGCAATGCTGGTATCATTAATGAAGTAGCCTTTGCCGATAAAGCTCCTGACCA
GAGTGTTGATGCTATAGACTTGGGGAAACAGTCTCTTGCTGGAGACCTGGTACAACAGGAAAGAGATGAGGGGCAGAATGCTTGTTTGGATACTGTGAATCATCCAGTGTCTGTAGTTGCAACCAAAGAAGATGGTGAGACATTAATAGATTGTGAGTTACTAGAAGTGGGTAGCATCCTCATCGAATTTTCAAGGGAAG
AAGCCACATGTTTGGCAGCACATACTTTGCATGGACGTCTGTATGGAAGTCGAAAGGTGATAGCGAGCTATTTTCCTCATGGTGTGTACCAGAAGATATTCCCAAGAGGGAATGCTCGATGAGTGAGTATAGAATTCTTCTGTCCAAGAATGTCGTCATCTGCCTGTCATGATTGAGTTAATTACTTGCTGTCGATTATT
TCTAGATCAATTCAATGCTTTCATTCTCCATACATATATCTTGTGACTGCTCTACCGTGTATGTAACAAAGTATTGCGATTTATACATCTTGAAGGTGGAGTAGTTGGCAAATTACTACTGTGTATGTAGCAAGCTTCCAAGCTTCCGTCACATATTCAAGGATTCATAGGCAATGAGTGCACCTCATATATTTGGCTGA
ATCTTGCATTCGATGAGACTGGAATATGTTTTTCAAAAGCATATTAATTATTTTCAATAATATCCTCTGAAACATCATCGAAAGTTCTTTTAAT

>TRINITY_DN130232_c0_g1_i8 from sample A1 / Example unspliced isoform:

TACATGGAAATAATTTGATAATCAAACGACCCAAAGACTTTGTCGAAGCAGCAAATGGAGGCCCTGAGAAGTCCCTGCCTGCAGCTGATCTCATATCTAGTGTTGTGACCGACTCTCCTCACAAGATTTTTCTTGGAGGGATTTCACATACACTGGACTCTGATAAGGTCAGAGAGATTGTCACTGCATTTGGAGAACTG
AAGGCATACCACTTGGAAGTTGACACTAATAGGAAACCTCCTGAAGCTTTTGCATTCCTTGAGTATGTTGACTCTTCTGTCACTTTGAAAGCCTGTGCGGGGCTGAATGGTATGAGATTAGGAGGTCGTGTTATAACAGTAGTTCAGGCCACTCCTGATGCTTCTGGTGAGgtacatgttatgatttgctgaatcctttt
tgtatggatgtaattccttgaaattgccttgggatttaaaagtttaaatttgtatactaattaccaaaacatatgtttctctaagGGTGGGAGCGTTCCATTCTATGGTATCCCTGAACATGCAAAACCTCTTGTACAAAAGCCTACACGGGTTCTTGAACTGAAGAATGTGCTAACCAAAGAGGAGCTTCTACAACTGT
CAGAAGTTGAACTGGAAGAAATATCTGAAGATGTGCGTCTTGAGTGTGCCAGGTTTGGTACTGTCAAATCACTTAATATTGTAAGGTGGAATAGAAGTGGAACGGACATTTCTATTACGTATAATGTTGGTCAAAATCAGGGTGGTAACATAACTTCTATCCAAGGCAAGGAAAATGGAAATCCACAGAAGTCTTTCCTG
GATGTAGCTGATTGTGAAAATCTCTCCAAATCTTTGGACCAGCAAAACAAGGTTGTCGAAGATATTATGGAAAATGGAAGAGAGCCTATGGATGGTATTGTGGATCCTAATGATGATCCAGTGCAAGAAGATATGGAATGTGATGAGAATGATGTGGCAAACAAGTTGGATGCAGGTGGTGCTGTTTCAGATGGAAATGC
ATTGCAAAATGTGAATTTGACATCTCCAGATAAGGAAGAACATGGCAATGCTGGTATCATTAATGAAGTAGCCTTTGCCGATAAAGCTCCTGACCAGAGTGTTGATGCTATAGACTTGGGGAAACAGTCTCTTGCTGGAGACCTGGTACAACAGGAAAGAGATGAGGGGCAGAATGCTTGTTTGGATACTGTGAATCATC
CAGTGTCTGTAGTTGCAACCAAAGAAGATGGTGAGACATTAATAGATTGTGAGTTACTAGAAGTGGGTAGCATCCTCATCGAATTTTCAAGGGAAGAAGCCACATGTTTGGCAGCACATACTTTGCATGGACGTCTGTATGGAAGTCGAAAGGTGATAGCGAGCTATTTTCCTCATGGTGTGTACCAGAAGATATTCCCA
AGAGGGAATGCTCGATGAGTGAGTATAGAATTCTTCTGTCCAAGAATGTCGTCATCTGCCTGTCATGATTGAGTTAATTACTTGCTGTCGATTATTTCTAGATCAATTCAATGCTTTCATTCTCCATACATATATCTTGTGACTGCTCTACCGTGTATGTAACAAAGTATTGCGATTTATACATCTTGAAGGTGGAGTAG
TTGGCAAATTACTACTGTGTATGTAG