sp|Q8VYR9|KEA5_ARATH ----> K(+) efflux antiporter 5

Intron 1 GTTAGTTTCC ... TAGCATGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	42.86	58	39	48
A2	41.98	47	24	44
A3	53.04	27	14	47
A4	58.02	17	5	42
A5	45.05	25	23	18
A6	44.39	208	95	237
A7	45.35	138	77	152
A8	46.09	200	82	260
A9	44.75	121	59	137
A10	46.21	78	42	92

>TRINITY_DN125568_c0_g2_i1 from sample A1 / Example spliced isoform

CTCTTCCTTTCTAGCATTGGGATGCTTATTCATGTCCAGTTTCTCTGGAACCATATGGATATTTTGCTAGCATCTGTGATTCTGGTGATTATTGCAAAGACCATTGTGGTCACTGTTGTTGTGAAGGGCTTTGGTTACAGCATTAGGACGGCTTTCTTTGTTGGCATGTCCCTGGCTCAGATTGGAGAGTTTGCTTTTGT
TCTGTTAAGTCGTGCATCGAATCTTCATCTGATTGAGGGAAAATTGTATCTCTTGCTGCTGGGAACAACAGCGCTTAGCCTGGTCACTACTCCTTTGCTATTTAGAATGATTCCAGTAATCATGCATTTGGGTGTATTGATGGGTTGGTTCCCTCCTGACAGCAATCAAACAGAGGTACTGTCAAAGGAGCGGGATTGAA
TATTTTGCCATGCTGGATGCTGGGACTGTGATGCTGGTTACTATCCAAAACGTTCAGATGCAATGCAATCTTAAGCTTTGGTTAGGAGACAGCTCACCTTTATGGTTGAAACTATGTACTTTGGATGAGGTCTAGTGACTGCTTTATTAGTAATGAAAGGTTTCCTTTTATGGTGTGCTTTTTCATTTTGTGTCTATTAC
AATCACAATTCAGAGGTTTTAAAAAATGCAAGAAAATATAAATAGAATCAGCCATGCATTGCTGCTAGAGATAGAGAGGATGTACTGCTGTCTTCACCAGCAGGTTATTGAGTTCAAGCAGTGAATCTGCGATACTGATGGTTCTTTCTGCATGTAAAAAGCTTAATTTGTGTACGAGTTTCCGGCTGCAAATGCAGAAT
ATGCTTTCTTTTGAAGGTCAATCTTTCAGATGCCTCTTCAAGATCCCCACTAGGGGTTCTCATTGTACTGTAACATTATAATTGTATATATCTGTGGCCACTACTATGATCAACAGCATGATTGTTGTCATTGGATGGACCAGTTTCTGTTGCTTGGTGCTGTTA

>TRINITY_DN125568_c0_g2_i4 from sample A1 / Example unspliced isoform:

CTCTTCCTTTCTAGCATTGGGATGCTTATTCATGTCCAGTTTCTCTGGAACCATATGGATATTTTGCTAGCATCTGTGATTCTGGTGATTATTGCAAAGACCATTGTGGTCACTGTTGTTGTGAAGGGCTTTGGTTACAGCATTAGGACGGCTTTCTTTGTTGGCATGTCCCTGGCTCAGATTGGAGAGTTTGCTTTTGT
TCTGTTAAGTCGTGCATCGAATCTTCATCTGATTGAGGGAAAATTGTATCTCTTGCTGCTGGGAACAACAGCGCTTAGCCTGGTCACTACTCCTTTGCTATTTAGAATGATTCCAGTAATCATGCATTTGGGTGTATTGATGGGTTGGTTCCCTCCTGACAGCAATCAAACAGAGgttagtttcctttcactgctatttt
ttattaatttatgccttaggggatggcatgggtggtaattgcagagcctatagctcgaaaactgccttcacactgggcaggtctgagctaagactctcctttgcaggtggtctctaaaggagagaaccttcaccctggaagcacacaacgtattgttgttacagtccaaggttctcagaaataatgaggcattttcatat
tgaaggaggcaggatattttgcagcatctgcaagtatcctggatatctcctcattttaaggattgtagcatgcagGTACTGTCAAAGGAGCGGGATTGAATATTTTGCCATGCTGGATGCTGGGACTGTGATGCTGGTTACTATCCAAAACGTTCAGATGCAATGCAATCTTAAGCTTTGGTTAGGAGACAGCTCACCTT
TATGGTTGAAACTATGTACTTTGGATGAGGTCTAGTGACTGCTTTATTAGTAATGAAAGGTTTCCTTTTATGGTGTGCTTTTTCATTTTGTGTCTATTACAATCACAATTCAGAGGTTTTAAAAAATGCAAGAAAATATAAATAGAATCAGCCATGCATTGCTGCTAGAGATAGAGAGGATGTACTGCTGTCTTCACCAG
CAGGTTATTGAGTTCAAGCAGTGAATCTGCGATACTGATGGTTCTTTCTGCATGTAAAAAGCTTAATTTGTGTACGAGTTTCCGGCTGCAAATGCAGAATATGCTTTCTTTTGAAGGTCAATCTTTCAGATGCCTCTTCAAGATCCCCACTAGGGGTTCTCATTGTACTGTAACATTATAATTGTATATATCTGTGGCCA
CTACTATGATCAACAGCATGATTGTTGTCATTGGATGGACCAGTTTCTGTTGCTTGGTGCTGTTA

Intron 2 GTGGTCTCTA ... TAGCATGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	51.67	58	76	48
A2	49.46	47	48	44
A3	61.97	27	41	47
A4	63.04	17	16	42
A5	51.92	25	36	18
A6	52.02	208	214	237
A7	54.68	138	181	152
A8	53.16	200	194	260
A9	54.68	121	155	137
A10	57.18	78	117	91.3

>TRINITY_DN125568_c0_g2_i1 from sample A1 / Example spliced isoform

CTCTTCCTTTCTAGCATTGGGATGCTTATTCATGTCCAGTTTCTCTGGAACCATATGGATATTTTGCTAGCATCTGTGATTCTGGTGATTATTGCAAAGACCATTGTGGTCACTGTTGTTGTGAAGGGCTTTGGTTACAGCATTAGGACGGCTTTCTTTGTTGGCATGTCCCTGGCTCAGATTGGAGAGTTTGCTTTTGT
TCTGTTAAGTCGTGCATCGAATCTTCATCTGATTGAGGGAAAATTGTATCTCTTGCTGCTGGGAACAACAGCGCTTAGCCTGGTCACTACTCCTTTGCTATTTAGAATGATTCCAGTAATCATGCATTTGGGTGTATTGATGGGTTGGTTCCCTCCTGACAGCAATCAAACAGAGGTACTGTCAAAGGAGCGGGATTGAA
TATTTTGCCATGCTGGATGCTGGGACTGTGATGCTGGTTACTATCCAAAACGTTCAGATGCAATGCAATCTTAAGCTTTGGTTAGGAGACAGCTCACCTTTATGGTTGAAACTATGTACTTTGGATGAGGTCTAGTGACTGCTTTATTAGTAATGAAAGGTTTCCTTTTATGGTGTGCTTTTTCATTTTGTGTCTATTAC
AATCACAATTCAGAGGTTTTAAAAAATGCAAGAAAATATAAATAGAATCAGCCATGCATTGCTGCTAGAGATAGAGAGGATGTACTGCTGTCTTCACCAGCAGGTTATTGAGTTCAAGCAGTGAATCTGCGATACTGATGGTTCTTTCTGCATGTAAAAAGCTTAATTTGTGTACGAGTTTCCGGCTGCAAATGCAGAAT
ATGCTTTCTTTTGAAGGTCAATCTTTCAGATGCCTCTTCAAGATCCCCACTAGGGGTTCTCATTGTACTGTAACATTATAATTGTATATATCTGTGGCCACTACTATGATCAACAGCATGATTGTTGTCATTGGATGGACCAGTTTCTGTTGCTTGGTGCTGTTA

>TRINITY_DN125568_c0_g2_i2 from sample A1 / Example unspliced isoform:

CTCTTCCTTTCTAGCATTGGGATGCTTATTCATGTCCAGTTTCTCTGGAACCATATGGATATTTTGCTAGCATCTGTGATTCTGGTGATTATTGCAAAGACCATTGTGGTCACTGTTGTTGTGAAGGGCTTTGGTTACAGCATTAGGACGGCTTTCTTTGTTGGCATGTCCCTGGCTCAGATTGGAGAGTTTGCTTTTGT
TCTGTTAAGTCGTGCATCGAATCTTCATCTGATTGAGGGAAAATTGTATCTCTTGCTGCTGGGAACAACAGCGCTTAGCCTGGTCACTACTCCTTTGCTATTTAGAATGATTCCAGTAATCATGCATTTGGGTGTATTGATGGGTTGGTTCCCTCCTGACAGCAATCAAACAGAGgtggtctctaaaggagagaaccttc
accctggaagcacacaacgtattgttgttacagtccaaggttctcagaaataatgaggcattttcatattgaaggaggcaggatattttgcagcatctgcaagtatcctggatatctcctcattttaaggattgtagcatgcagGTACTGTCAAAGGAGCGGGATTGAATATTTTGCCATGCTGGATGCTGGGACTGTGA
TGCTGGTTACTATCCAAAACGTTCAGATGCAATGCAATCTTAAGCTTTGGTTAGGAGACAGCTCACCTTTATGGTTGAAACTATGTACTTTGGATGAGGTCTAGTGACTGCTTTATTAGTAATGAAAGGTTTCCTTTTATGGTGTGCTTTTTCATTTTGTGTCTATTACAATCACAATTCAGAGGTTTTAAAAAATGCAA
GAAAATATAAATAGAATCAGCCATGCATTGCTGCTAGAGATAGAGAGGATGTACTGCTGTCTTCACCAGCAGGTTATTGAGTTCAAGCAGTGAATCTGCGATACTGATGGTTCTTTCTGCATGTAAAAAGCTTAATTTGTGTACGAGTTTCCGGCTGCAAATGCAGAATATGCTTTCTTTTGAAGGTCAATCTTTCAGAT
GCCTCTTCAAGATCCCCACTAGGGGTTCTCATTGTACTGTAACATTATAATTGTATATATCTGTGGCCACTACTATGATCAACAGCATGATTGTTGTCATTGGATGGACCAGTTTCTGTTGCTTGGTGCTGTTA

Intron 3 GTTAGTTTCC ... TCCTTTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	33.91	76	39	8
A2	33.33	48	24	10
A3	25.45	41	14	6
A4	23.81	16	5	8
A5	38.98	36	23	8
A6	30.74	214	95	23
A7	29.84	181	77	24
A8	29.71	194	82	18
A9	27.57	155	59	22
A10	26.42	117	42	16

>TRINITY_DN125568_c0_g2_i3 from sample A1 / Example spliced isoform

ACGTGAAATATGGTTATGGTCTTTTATATATGGATTAAGCCTCCAGCAGATTTCAAACATTAGTGATGTCTTGTTTGTTATGTTTCTTGTCTAGGGAAAATTGTATCTCTTGCTGCTGGGAACAACAGCGCTTAGCCTGGTCACTACTCCTTTGCTATTTAGAATGATTCCAGTAATCATGCATTTGGGTGTATTGATGG
GTTGGTTCCCTCCTGACAGCAATCAAACAGAGGTGGTCTCTAAAGGAGAGAACCTTCACCCTGGAAGCACACAACGTATTGTTGTTACAGTCCAAGGTTCTCAGAAATAATGAGGCATTTTCATATTGAAGGAGGCAGGATATTTTGCAGCATCTGCAAGTATCCTGGATATCTCCTCATTTTAAGGATTGTAGCATGCA
GGTACTGTCAAAGGAGCGGGATTGAATATTTTGCCATGCTGGATGCTGGGACTGTGATGCTGGTTACTATCCAAAACGTTCAGATGCAATGCAATCTTAAGCTTTGGTTAGGAGACAGCTCACCTTTATGGTTGAAACTATGTACTTTGGATGAGGTCTAGTGACTGCTTTATTAGTAATGAAAGGTTTCCTTTTATGGT
GTGCTTTTTCATTTTGTGTCTATTACAATCACAATTCAGAGGTTTTAAAAAATGCAAGAAAATATAAATAGAATCAGCCATGCATTGCTGCTAGAGATAGAGAGGATGTACTGCTGTCTTCACCAGCAGGTTATTGAGTTCAAGCAGTGAATCTGCGATACTGATGGTTCTTTCTGCATGTAAAAAGCTTAATTTGTGTA
CGAGTTTCCGGCTGCAAATGCAGAATATGCTTTCTTTTGAAGGTCAATCTTTCAGATGCCTCTTCAAGATCCCCACTAGGGGTTCTCATTGTACTGTAACATTATAATTGTATATATCTGTGGCCACTACTATGATCAACAGCATGATTGTTGTCATTGGATGGACCAGTTTCTGTTGCTTGGTGCTGTTA

>TRINITY_DN125568_c0_g2_i4 from sample A1 / Example unspliced isoform:

CTCTTCCTTTCTAGCATTGGGATGCTTATTCATGTCCAGTTTCTCTGGAACCATATGGATATTTTGCTAGCATCTGTGATTCTGGTGATTATTGCAAAGACCATTGTGGTCACTGTTGTTGTGAAGGGCTTTGGTTACAGCATTAGGACGGCTTTCTTTGTTGGCATGTCCCTGGCTCAGATTGGAGAGTTTGCTTTTGT
TCTGTTAAGTCGTGCATCGAATCTTCATCTGATTGAGGGAAAATTGTATCTCTTGCTGCTGGGAACAACAGCGCTTAGCCTGGTCACTACTCCTTTGCTATTTAGAATGATTCCAGTAATCATGCATTTGGGTGTATTGATGGGTTGGTTCCCTCCTGACAGCAATCAAACAGAGgttagtttcctttcactgctatttt
ttattaatttatgccttaggggatggcatgggtggtaattgcagagcctatagctcgaaaactgccttcacactgggcaggtctgagctaagactctcctttgcagGTGGTCTCTAAAGGAGAGAACCTTCACCCTGGAAGCACACAACGTATTGTTGTTACAGTCCAAGGTTCTCAGAAATAATGAGGCATTTTCATAT
TGAAGGAGGCAGGATATTTTGCAGCATCTGCAAGTATCCTGGATATCTCCTCATTTTAAGGATTGTAGCATGCAGGTACTGTCAAAGGAGCGGGATTGAATATTTTGCCATGCTGGATGCTGGGACTGTGATGCTGGTTACTATCCAAAACGTTCAGATGCAATGCAATCTTAAGCTTTGGTTAGGAGACAGCTCACCTT
TATGGTTGAAACTATGTACTTTGGATGAGGTCTAGTGACTGCTTTATTAGTAATGAAAGGTTTCCTTTTATGGTGTGCTTTTTCATTTTGTGTCTATTACAATCACAATTCAGAGGTTTTAAAAAATGCAAGAAAATATAAATAGAATCAGCCATGCATTGCTGCTAGAGATAGAGAGGATGTACTGCTGTCTTCACCAG
CAGGTTATTGAGTTCAAGCAGTGAATCTGCGATACTGATGGTTCTTTCTGCATGTAAAAAGCTTAATTTGTGTACGAGTTTCCGGCTGCAAATGCAGAATATGCTTTCTTTTGAAGGTCAATCTTTCAGATGCCTCTTCAAGATCCCCACTAGGGGTTCTCATTGTACTGTAACATTATAATTGTATATATCTGTGGCCA
CTACTATGATCAACAGCATGATTGTTGTCATTGGATGGACCAGTTTCTGTTGCTTGGTGCTGTTA