sp|Q42883|ECAP_SOLLC ----> Calcium-transporting ATPase, endoplasmic reticulum-type

Intron 1 GTATGGATCT ... TTCGCTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	17.73	283	61	3
A2	28.7	164	66	5
A3	22.38	222	64	7
A4	17.22	250	52	8
A5	24.37	90	29	1
A6	21.32	321	87	8
A7	19.07	539	127	16
A8	18.05	386	85	9
A9	16.81	391	79	8
A10	20.32	396	101	4

>TRINITY_DN45920_c0_g2_i7 from sample A8 / Example spliced isoform

AATGGTGATTACTGGCGATAATAAGACCACAGCAGAAGCCATATGTAGGGAAATTGGTGTGTTCTATGAAGGAGAGAATCTCAGTGGTAAAAGTTTCACTGGAAAAGAATTCATGGCACTGCCTATAGGTAAGCGTACTGAAATCTTGGCAAAACCTGGTGGCCGGGTTTTCTCTCGAGCGGAACCAAAGCATAAGCAGG
ATATAGTCCGGATGCTCAAAGAAGCTGGTGAAATTGTGGCAATGACCGGAGATGGTGTCAATGATGCACCTGCTTTGAAGCTTGCAGACATCGGAATTGCCATGGGAATTGCTGGAACAGAGGTTGCCAAAGAAGCATCAGATATGGTTTTAGCTGATGATAATTTTAGCACTATTGTTTCTGCTGTTGCGGAAGGCCGT
TCCATCTACAACAACATGAAAGCTTTCATAAGGTACATGATATCATCTAATGTGGGTGAGGTGGCTTCCATATTTATAACTGCAGTATTAGGCATTCCTGAAGGCTTGATTCCTGTGCAACTTCTGTGGGTGAATTTGGTCACAGATGGTCCTCCTGCAACAGCTCTTGGATTTAATCCCGCTGACATAGATATAATGCA
AAAACCACCTCGTAGGAGTGATGATGCACTGATAAATGCATGGGTGTTTTTCCGTTACATGGTGATTGGTTTGTACGTTGGGGTTGCAACAGTTGGCATTTTCACTCTTTGGTACACACATGATTCATTTTTAGGGATAGACTTTGCAGATGGCCACACATTGGTAACCCTTTCACAGCTCAGGTCTTGGGGACAATGCC
CATCATGGGAGGGTTTCAACGTTTTGCCATTTACTGTTGGTGGGGAAACTCTCTCATTTTCCAATCCTTGTGATTATTTCTCAACTGGAAAAATTAAAGCAACAACCCTTTCCCTCTCCGTATTGGTGGCAATTGAAATGTTCAACTCATTGAATGCTCTATCTGAGGATAACAGTTTGCTCACCATGCCACCTTGGACT
AATCCTTGGCTATTGGTGGCAATGTCTGTTTCATTTGGACTTCACTTTCTAGTCCTTTACGTGCCATTTCTTGCCAATATCTTTGGCATAGTACCCTTGAATATAAGTGAATGGTGTTTAGTTATATTAGTTTCATTTCCAGTGATATTGATAGATGAAACATTGAAACTAATTGGTAGGAGAATGTCGAGAAGACATCA
AAAGTATAAAACTGTTTAAGTACCTTGCCATAACATTTTTATATATGCAAGTGAATCTATGAGCTATTTTGAATGTAAGCTCATAGTGTTTAGCATTTTGATATTTTGTAGGAGGCCACATATGTTAAATAAGGTCCAAGATAATTAGGATTATTTAGCTAAATAAGTTCAATTACTTTGTCAAAGTAACTTGAGCCACA
AGTTAGAGCTTTAGCCCTCTTTTGTATAAATAGGGTTTCTCCTCTCTTGTATGAATTTAATTAATCAATCAAATTATACCATTGATACATTTTGGAGAAGTCTTCCTCCATTATTTGGATTTGCAATGCAATTGGCAGGGGTTCCCAACA

>TRINITY_DN45920_c0_g2_i3 from sample A8 / Example unspliced isoform:

AATGGTGATTACTGGCGATAATAAGACCACAGCAGAAGCCATATGTAGGGAAATTGGTGTGTTCTATGAAGGAGAGAATCTCAGTGGTAAAAGTTTCACTGGAAAAGAATTCATGGCACTGCCTATAGGTAAGCGTACTGAAATCTTGGCAAAACCTGGTGGCCGGGTTTTCTCTCGAGCGGAACCAAAGCATAAGCAGG
ATATAGTCCGGATGCTCAAAGAAGCTGGTGAAATTGTGGCAATGACCGGAGATGGTGTCAATGATGCACCTGCTTTGAAGCTTGCAGACATCGGAATTGCCATGGGAATTGCTGGAACAGAGGTTGCCAAAGAAGCATCAGATATGGTTTTAGCTGATGATAATTTTAGCACTATTGTTTCTGCTGTTGCGGAAGGCCGT
TCCATCTACAACAACATGAAAGCTTTCATAAGgtatggatctctacttctgcaatacaaattgagatgaacttgaaaaatgtattatacttgatacggtagttcttgccatcttggtaggttcctgtttccctgatcttagtggttttttttccgtggtctagcacactcctttgctgtaatcgttttatgtttgtatgt
tcgctgcagGTACATGATATCATCTAATGTGGGTGAGGTGGCTTCCATATTTATAACTGCAGTATTAGGCATTCCTGAAGGCTTGATTCCTGTGCAACTTCTGTGGGTGAATTTGGTCACAGATGGTCCTCCTGCAACAGCTCTTGGATTTAATCCCGCTGACATAGATATAATGCAAAAACCACCTCGTAGGAGTGATG
ATGCACTGATAAATGCATGGGTGTTTTTCCGTTACATGGTGATTGGTTTGTACGTTGGGGTTGCAACAGTTGGCATTTTCACTCTTTGGTACACACATGATTCATTTTTAGGGATAGACTTTGCAGATGGCCACACATTGGTAACCCTTTCACAGCTCAGGTCTTGGGGACAATGCCCATCATGGGAGGGTTTCAACGTT
TTGCCATTTACTGTTGGTGGGGAAACTCTCTCATTTTCCAATCCTTGTGATTATTTCTCAACTGGAAAAATTAAAGCAACAACCCTTTCCCTCTCCGTATTGGTGGCAATTGAAATGTTCAACTCATTGAATGCTCTATCTGAGGATAACAGTTTGCTCACCATGCCACCTTGGACTAATCCTTGGCTATTGGTGGCAAT
GTCTGTTTCATTTGGACTTCACTTTCTAGTCCTTTACGTGCCATTTCTTGCCAATATCTTTGGCATAGTACCCTTGAATATAAGTGAATGGTGTTTAGTTATATTAGTTTCATTTCCAGTGATATTGATAGATGAAACATTGAAACTAATTGGTAGGAGAATGTCGAGAAGACATCAAAAGTATAAAACTGTTTAAGTAC
CTTGCCATAACATTTTTATATATGCAAGTGAATCTATGAGCTATTTTGAATGTAAGCTCATAGTGTTTAGCATTTTGATATTTTGTAGGAGGCCACATATGTTAAATAAGGTCCAAGATAATTAGGATTATTTAGCTAAATAAGTTCAATTACTTTGTCAAAGTAACTTGAGCCACAAGTTAGAGCTTTAGCCCTCTTTT
GTATAAATAGGGTTTCTCCTCTCTTGTATGAATTTAATTAATCAATCAAATTATACCATTGATACATTTTGGAGAAGTCTTCCTCCATTATTTGGATTTGCAATGCAATTGGCAGGGGTTCCCAACA

Intron 2 GTATTTATCC ... TTTATTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	21.34	234	77	50
A2	22.54	165	54	42
A3	19.54	210	49	53
A4	20.56	199	63	40
A5	17.95	96	19	23
A6	20.19	340	89	83
A7	22.48	450	123	138
A8	19.96	411	111	94
A9	21.47	439	114	126
A10	21.21	351	112	77

>TRINITY_DN45920_c0_g2_i8 from sample A8 / Example spliced isoform

AATGGTGATTACTGGCGATAATAAGACCACAGCAGAAGCCATATGTAGGGAAATTGGTGTGTTCTATGAAGGAGAGAATCTCAGTGGTAAAAGTTTCACTGGAAAAGAATTCATGGCACTGCCTATAGGTAAGCGTACTGAAATCTTGGCAAAACCTGGTGGCCGGGTTTTCTCTCGAGCGGAACCAAAGCATAAGCAGG
ATATAGTCCGGATGCTCAAAGAAGCTGGTGAAATTGTGGCAATGACCGGAGATGGTGTCAATGATGCACCTGCTTTGAAGCTTGCAGACATCGGAATTGCCATGGGAATTGCTGGAACAGAGGTTGCCAAAGAAGCATCAGATATGGTTTTAGCTGATGATAATTTCAGCACTATTGTTTCCGCTGTTGCAGAAGGCCGT
TCCATCTACAATAACATGAAAGCTTTCATAAGGTACATGATATCATCTAATATGGGTGAAGTGGCTTCCATATTTATAACTGCTGCATTAGGCATGCCTGAAGGCTTGATACCTGTGCAGCTTCTGTGGGTGAATTTAGTCACAGATGGTCCTCCAGCGACAGCCCTTGGATTCAACCCTGCTGACGTAGATATAATGCA
AAAACCACCTCGTAAAAGCGATGATGCACTGATTAGTGCATGGGTGTTTTTCCGTTACCTGGTGATTGGTTTATATGTTGGACTTGCAACAGTTGGCATCTTTGCTTTGTGGTACACACATGATTCATTTTTAGGGATAGACATCTCTGCAGATGGCCACACTTTGGTAACTCTTTCGCAGCTTAGGTCTTGGGGAGAAT
GCCCATCGTGGGACGGTTTTGAGGTTTCACCATTTTCCGTTGGTGCGAAAACCCTCTCATTTTCCAATCCTTGTGATTATTTCTCAACTGGAAAGGTTAAAGCAACAACCCTTTCCCTCTCCGTTTTGGTGGCCATTGAAATGTTCAACTCGTTGAATGCTTTATCCGAGGATAATAGTTTGATCACCATGCCACCTTGG
ACTAATCCTTGGCTATTGGTGGCAATGTCTGTTTCATTTGGACTTCACTTTCTGATCCTTTATGTTCCATTTCTTGCCAATGTTTTTGGCATTGTACCCTTGAGTTTAAGTGAATGGTGTTTAGTGGTACTGGTTTCATTCCCAGTTATTTTGATAGATGAAGTGTTGAAACTAATAGGTCGGAGAATGTGTAGAGAACA
CAGAAAGTGCAAAACTGTTTAAAATACTTGGCGGTACTACTAAAAAAGAAAACAAAAATGTTGGGCCATACTCATCATATAAAGTGCGGGTCAGCATGTATAACAGAGTTTTTAGCTCGTCTGGGTGGGTGGATGAGTGTCTCAAAGGCAATTATGTTTCACTAGAGGACATGCCATCCAGTATATTTCTTACAAAAGGA
GATTTTGGGAAAACCAAAAAGTTGTATGAATACCTGGAAAAACATTGTAATGCATAAAAAATTTCCATGGTTGGAAAATGCTTTGCAATTGTGGCTTTTATTTGTAGGATATGACTGCAAGACCTCTGTATTAAATACATGCTACCTCGAAATGTGGCTTCTCTTCAAAATTTGGAAGTATGTAATTGTATTTTGAAATC
TGAATGTGACAAGTTTTGTTATACTCCAGAGTTCTGGCAGGATGGGTTCCAAAGTGGATCTTTGTCATATCATGAAATGAGTAATTCAAAATGTTCTTTTGGATGTGGATGTTACGATGAAAGTGTACTATGTTTACATGATCATGATCTTATTAGATATTTTAACTGATCCAATGATTTTATTGGATATTATGTTTATA
ATATATAGTGAGAATAAAAATGTTTTTTCTAAAAAAAAAAAAGAAAACAAAAATGTTGGGCCATACTCATCATATAAAGTGCGGGTCAGCATGTATAACAGAGTTTTTAGCTCGTCTGGGTGGGTGGATGAGTGTCTCAAAGG

>TRINITY_DN45920_c0_g2_i4 from sample A8 / Example unspliced isoform:

AATGGTGATTACTGGCGATAATAAGACCACAGCAGAAGCCATATGTAGGGAAATTGGTGTGTTCTATGAAGGAGAGAATCTCAGTGGTAAAAGTTTCACTGGAAAAGAATTCATGGCACTGCCTATAGGTAAGCGTACTGAAATCTTGGCAAAACCTGGTGGCCGGGTTTTCTCTCGAGCGGAACCAAAGCATAAGCAGG
ATATAGTCCGGATGCTCAAAGAAGCTGGTGAAATTGTGGCAATGACCGGAGATGGTGTCAATGATGCACCTGCTTTGAAGCTTGCAGACATCGGAATTGCCATGGGAATTGCTGGAACAGAGGTTGCCAAAGAAGCATCAGATATGGTTTTAGCTGATGATAATTTCAGCACTATTGTTTCCGCTGTTGCAGAAGGCCGT
TCCATCTACAATAACATGAAAGCTTTCATAAGGTACATGATATCATCTAATATGGGTGAAGTGGCTTCCATATTTATAACTGCTGCATTAGGCATGCCTGAAGGCTTGATACCTGTGCAGCTTCTGTGGGTGAATTTAGTCACAGATGGTCCTCCAGCGACAGCCCTTGGATTCAACCCTGCTGACGTAGATATAATGCA
AAAACCACCTCGTAAAAGCGATGATGCACTGATTAGTGCATGGGTGTTTTTCCGTTACCTGgtatttatccatacattttgttatttatttcattttctttctaacctaaaatgtttaacattctgtgcatggatgttttcagcgcttatacattgtgtgtaaagtttctggaatttcactgtgtcatagtctagaaacg
atcaacgttttaagtggacacttcacctattattagggttacaatgtttaacatttttccacataaagaagcgaggtgctcttcttgctgaaagaaaaaaaaaagaaatcactagaataatgataataataagaaaataaactagcatagatctatctcaaccttagatcttatgcgctgagaagtttgagcctcaattt
ttttacccctattgatacatactagtctgtaaaccattcttgtaaaattgaactataattatcatctataatcattttcaactctctttttattgcagGTGATTGGTTTATATGTTGGACTTGCAACAGTTGGCATCTTTGCTTTGTGGTACACACATGATTCATTTTTAGGGATAGACATCTCTGCAGATGGCCACACT
TTGGTAACTCTTTCGCAGCTTAGGTCTTGGGGAGAATGCCCATCGTGGGACGGTTTTGAGGTTTCACCATTTTCCGTTGGTGCGAAAACCCTCTCATTTTCCAATCCTTGTGATTATTTCTCAACTGGAAAGGTTAAAGCAACAACCCTTTCCCTCTCCGTTTTGGTGGCCATTGAAATGTTCAACTCGTTGAATGCTTT
ATCCGAGGATAATAGTTTGATCACCATGCCACCTTGGACTAATCCTTGGCTATTGGTGGCAATGTCTGTTTCATTTGGACTTCACTTTCTGATCCTTTATGTTCCATTTCTTGCCAATGTTTTTGGCATTGTACCCTTGAGTTTAAGTGAATGGTGTTTAGTGGTACTGGTTTCATTCCCAGTTATTTTGATAGATGAAG
TGTTGAAACTAATAGGTCGGAGAATGTGTAGAGAACACAGAAAGTGCAAAACTGTTTAAAATACTTGGCGGTACTACTAAAAAAGAAAACAAAAATGTTGGGCCATACTCATCATATAAAGTGCGGGTCAGCATGTATAACAGAGTTTTTAGCTCGTCTGGGTGGGTGGATGAGTGTCTCAAAGGCAATTATGTTTCACT
AGAGGACATGCCATCCAGTATATTTCTTACAAAAGGAGATTTTGGGAAAACCAAAAAGTTGTATGAATACCTGGAAAAACATTGTAATGCATAAAAAATTTCCATGGTTGGAAAATGCTTTGCAATTGTGGCTTTTATTTGTAGGATATGACTGCAAGACCTCTGTATTAAATACATGCTACCTCGAAATGTGGCTTCTC
TTCAAAATTTGGAAGTATGTAATTGTATTTTGAAATCTGAATGTGACAAGTTTTGTTATACTCCAGAGTTCTGGCAGGATGGGTTCCAAAGTGGATCTTTGTCATATCATGAAATGAGTAATTCAAAATGTTCTTTTGGATGTGGATGTTACGATGAAAGTGTACTATGTTTACATGATCATGATCTTATTAGATATTTT
AACTGATCCAATGATTTTATTGGATATTATGTTTATAATATATAGTGAGAATAAAAATGTTTTTTCTAAAAAAAAAAAAGAAAACAAAAATGTTGGGCCATACTCATCATATAAAGTGCGGGTCAGCATGTATAACAGAGTTTTTAGCTCGTCTGGGTGGGTGGATGAGTGTCTCAAAGG

Intron 3 GTATGGATCT ... TTCGCTGAAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	3.74	283	0	11
A2	4.65	164	2	8
A3	6.36	221	0	15
A4	6.37	250	0	17
A5	3.23	90	0	3
A6	3.89	321	1	13
A7	5.27	539	2	30
A8	6.3	387	3	26
A9	4.39	392	0	18
A10	4.58	396	1	19

>TRINITY_DN48651_c0_g2_i7 from sample A7 / Example spliced isoform

AAAAGCTCTGCGTTGTTTGGGCCTGGCATACAAGGAAGATTTAGGAGAGTTCAGTGACTATGATGGAGAGAAACATCCTGCTCATATGAAATTGCTGGAGCCAGCCAATTATTCTGATATAGAAAGCAACCTTATCTTTGTTGGCGTTGTTGGATTAAGGGATCCTCCTCGTGAAGAAGTTCACAAAGCAATAGAGGATT
GTAGAGACGCAGGTATTCGAGTAATGGTGATTACTGGCGATAATAAGACCACAGCAGAAGCCATATGTAGGGAAATTGGTGTGTTCTATGAAGGAGAGAATCTCAGTGGTAAAAGTTTCACTGGAAAAGAATTCATGGCACTGCCTATAGGTAAGCGTACTGAAATCTTGGCAAAACCTGGTGGCCGGGTTTTCTCTCGA
GCGGAACCAAAGCATAAGCAGGATATAGTCCGGATGCTCAAAGAAGCTGGTGAAATTGTGGCAATGACCGGAGATGGTGTCAATGATGCACCTGCTTTGAAGCTTGCAGACATCGGAATTGCCATGGGAATTGCTGGAACAGAGGTTGCCAAGGAAGCAGCAGATATGGTTTTAGCTGATGATAATTTTAGCACTATTGT
TTCTGCTGTTGCGGAAGGCCGTTCCATCTACAACAACATGAAAGCTTTCATAAGGTACATGATATCATCTAATGTGGGTGAGGTGGCTTCCATATTTATAACTGCAGTATTAGGCATTCCTGAAGGCTTGATTCCTGTGCAACTTCTGTGGGTGAATTTGGTCACAGATGGTCCTCCTGCAACAGCTCTTGGATTTAATC
CCGCTGACATAGATATAATGCAAAAACCACCTCGTAGGAGTGATGATGCACTGATAAATGCATGGGTGTTTTTCCGTTACATGGTGATTGGTTTGTACGTTGGGGTTGCAACAGTTGGCATTTTCACTCTTTGGTACACACATGATTCATTTTTAGGGATAGACTTTGCAGATGGCCACACATTGGTAACCCTTTCACAG
CTCAGGTCTTGGGGACAATGCCCATCATGGGAGGGTTTCAACGTTTTGCCATTTACTGTTGGTGGGGAAACTCTCTCATTTTCCAATCCTTGTGATTATTTCTCAACTGGAAAAATTAAAGCAACAACCCTTTCCCTCTCCGTATTGGTGGCAATTGAAATGTTCAACTCATTGAATGCTCTATCTGAGGATAACAGTTT
GCTCACCATGCCACCCTGGACTAATCCTTGGCTATTGGTTGCAATGTCTGTTTCATTTGGACTTCACTTTCTAGTCCTTTACGTGCCATTTCTTGCCAATATCTTTGGCATAGTACCCTTGAATATAAGTGAATGGTGTTTAGTTATATTAGTTTCATTTCCAGTGATATTGATAGATGAAACATTGAAACTAATTGGTA
GGAGAATGTCGAGAAGACATCAAAAGTATAAAACTGTTTAAGTACCTTGCCATAACATTTTTATATATGCAAGTGAATCTATGAGCTATTTTGAATGTAAGCTCATAGTGTTTAGCATTTTGATATTTTGTAGGAGGCCACATATGTTAAATAAGGTCCAAGATAATTAGGATTATTTAGCTAAATAAGTTCAATTACTT
TGTCAAAGTAACTTGAGCCACAAGTTAGAGCTTTAGCCCTCTTTTGTATAAATAGGGTTTCTCCTCTCTTGTATGAATTTAATTAATCAATCAAATTATACCATTGATACATTTTGGAGAAGTCTTCCTCCATTATTTGGATTTGCAATGCAATTGGCAGGGGTTCCCAAC

>TRINITY_DN48651_c0_g2_i3 from sample A7 / Example unspliced isoform:

AACATGAAAGCTTTCATAAGgtatggatctctacttctgcaatacaaattgagatgaacttgaaaaatgtattatacttgatacggtagttcttgccatcttggtaggttcctgtttccctgatcttagtggtttttttttccgtggtctagcacactcctttgctgtaatcgttttatgtttgtatgttcgctgaagGT
ACATGATATCATCTAATGTGGGTGAGGTGGCTTCCATATTTATAACTGCAGTATTAGGCATTCCTGAAGGCTTGATTCCTGTGCAACTTCTGTGGGTGAATTTGGTCACAGATGGTCCTCCTGCAACAGCTCTTGGATTTAATCCCGCTGACATAGATATAATGCAAAAACCACCTCGTAGGAGTGATGATGCACTGATA
AATGCATGGGTGTTTTTCCGTTACATGGTGATTGGTTTGTACGTTGGGGTTGCAACAGTTGGCATTTTCACTCTTTGGTACACACATGATTCATTTTTAGGGATAGACTTTGCAGATGGCCACACATTGGTAACCCTTTCACAGCTCAGGTCTTGGGGACAATGCCCATCATGGGAGGGTTTCAACGTTTTGCCATTTAC
TGTTGGTGGGGAAACTCTCTCATTTTCCAATCCTTGTGATTATTTCTCAACTGGAAAAATTAAAGCAACAACCCTTTCCCTCTCCGTATTGGTGGCAATTGAAATGTTCAACTCATTGAATGCTCTATCTGAGGATAACAGTTTGCTCACCATGCCACCCTGGACTAATCCTTGGCTATTGGTTGCAATGTCTGTTTCAT
TTGGACTTCACTTTCTAGTCCTTTACGTGCCATTTCTTGCCAATATCTTTGGCATAGTACCCTTGAATATAAGTGAATGGTGTTTAGTTATATTAGTTTCATTTCCAGTGATATTGATAGATGAAACATTGAAACTAATTGGTAGGAGAATGTCGAGAAGACATCAAAAGTATAAAACTGTTTAAGTACCTTGCCATAAC
ATTTTTATATATGCAAGTGAATCTATGAGCTATTTTGAATGTAAGCTCATAGTGTTTAGCATTTTGATATTTTGTAGGAGGCCACATATGTTAAATAAGGTCCAAGATAATTAGGATTATTTAGCTAAATAAGTTCAATTACTTTGTCAAAGTAACTTGAGCCACAAGTTAGAGCTTTAGCCCTCTTTTGTATAAATAGG
GTTTCTCCTCTCTTGTATGAATTTAATTAATCAATCAAATTATACCATTGATACATTTTGGAGAAGTCTTCCTCCATTATTTGGATTTGCAATGCAATTGGCAGGGGTTCCCAAC