sp|P10978|POLX_TOBAC ----> Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94


Intron 1 GTATATTTCT ... TTCTATGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
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A10-1000



>TRINITY_DN134467_c1_g2_i1 from sample A1 / Example spliced isoform
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>TRINITY_DN134467_c1_g2_i2 from sample A1 / Example unspliced isoform:
TTGAATTTGAATTTGAATTTTTTTTTTATTAATAGCATTTTATGATATTAATATTTAAGTTATCGATCTAGCATTTTAAATAGGCTAATTAAAGCGGAAAATCACCAAAGTGACATCTTTCGTGTAGATTAGTCTGTTCGGGGTGTTAGATATTTGTGTGTATGTGATTCATGCGGGTATTGACTGGCCCAAAGGAAAGT
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GATGATTCTCTTAGGCTGCATGGATATAGACTTAGCCTTGAGAATGTCCAAACCCGATGAACTCAATGAGGATAGTACTCAAGAGGATGAGGTTTATTGGGGTAAGTGGGAACGTTCAAATAGGCTAAGTCTTATGATCATGAAGCGCGGCATTCCAGAAGCTTTCAGGGGTGCGGTAACCGATGAGGTTACTAATGTCA
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ctcacatttgtgtttctatgcagGGTTGCCTGAGTTACCGAAAACCAAGTGATGCTGAAAGATGCATCTATGTCGGAGATGGTCAGTCGGTAGAAGTAGAGGCAATAGGGCACTTTAGATTATTATTGAAATCTGGTTATTTTTTGGATTTAATAGATACTTTTGTTGTACCATCTTTCAGACGGAATTTAATTTCAGTT
TCTGTTTTGGACAAATCAGGTTATTGTTGTTCATTTGGAAACAATAAATTTACATTATCTATTAATTCAAATGCTGTTGGAACCGGTTTTCTTAATGTTTATGATAATCTATATTTGTTGGAAACTGTTCCGTCCTATAATGAAACCTTGCATGTGGAATCACGAGGTACAAAGCGTAAATTGAATAAAGATAATTCGGC
CTCATTGTGGCACAAACGCCTAGGTCATATCTCTAAATCTAGAGTTGAGCGACTTGTGTCCGATGGGATTTTGGAATCACTTGACTTTTCAGATTTTGATATTTGTGTTGAGTGTATTAAAGGAAAACAGACCAAAACAAAGAAATTAGGTGCCAATAGAGCTACAGACGTCTTAGAATTAATTCATACAGATATCTGTG
GACCATACCCTACGGCATCTTGGAATGGTCAACAGTACTTTATAACATTCATAGACGACTATTCAAGATATGGCTACCTATTTCTTATACATGAGAAATCACAATCATTGGACGTGTTCAAAACATTTAAAGCAGAAGTTGAGTTACAACTCAACAAAAGAATAAAGATCGTCAGATCTGACCATGGTGGTGAATACTAT
GGTAGATATGACGGATCAGGTGAACAACGTCCAGGACCATTTGCTAAATACCTAGAGGAATGTGGGATCGTCCCTCAATACACCATGCCAGGATCACCTAGCATGAATGGTGTAGCATAAAGACGAAACCGAACTCTTAAGGACATGGTAAGGAGTATGATTAGTCATTCTACTTTACCCGAAAAACTCTGGGGTGAAGC
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TCCGAAGACTCAAAG