NA ----> NA


Intron 1 GTAAGTAAAA ... TTGAATTTAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A122.6265195
A228.0559235
A328.3853214
A430.6970316
A534.7830166
A62557193
A724.7385.3288
A828.7752214
A921.43661812
A1028.9961.3256



>TRINITY_DN103236_c2_g1_i8 from sample A4 / Example spliced isoform
ACTCGAGAAGGAGAAATACCCAAAACCTTCGATCTACAAGCAAGCGACGACCTCACAGTACCGAGTTCGAATCCCAGGGGGCTAAGTCATTGTGCCCTCGAATATCGTCAGTGCTTCCACTCCACATTTCTGAGGAAATCATCATCTGCGGAAATCAAGCAACTCTCTCTTAATTGATGGAATCATATATTCATCATCTA
CAGCCGTTGAGAGCTGCTCCTGGTCATATGACGGCTTATTGGAAGGCCTTCTAGTCGTGGGAGAGAGCTAAGGAGCGCAAGGAAGGGCAGAAGGTGTCCTCTGAATGCTGTCATGATATTAGTAATTTATGCTCGGTGATATGCGGCTGGGCCATATCCCCTTTCGGGATAACAGGGTTCTTGTATGCAAATCAAGTGAA
ACTTCTGATTAGGAGGGATGAACGGTGCTTTCAATGGACAAATATTAGCTGAGAAGCTTTCTAAGCTGAACAACTCACAACAGAGTATTGAGACATTATCGCATTGGTGTATTTTCCATCGGAAGAAAGCAAAGCAGGTTGTGGAGACATGGGATAGACAGTTTCATAGTGCACCCAGAGAGCAGAGAATTCCGTTTTTG
TATCTTGCAAATGACATCTTACAAAATAGTAGGCGTAAAGGCTCAGAATTTGTAGGCGAGTTTTGGAAGGTTCTTCCTGGAGCTCTAAGTGATGTATTTGAGAAAGGGGATGAACATGGAAGAAATGCGGCTATGCGATTGGTTGATATATGGGAGGAAAGAAAAGTCTTTGGATCTCGTGGTCAGATTCTCAAGGAAGA
GATGGTGGGGAGAAATCCTCATCTATCGTTGGAGAACACAAACAATGGCAGAAATTTACATTCCACCAAAGTAAAACTTGCTGTTGGAGGCACATTGGAGAAGATAGTTTCAGCATATGATTCTGTTCATGATCGCCATTTGGAGGACGATGCAGTTTTGGTCAAATGTAAGGCTGCTGCTAGTGATGTGGAGAAGATGG
AAAAAGATTTTCAGAATGGCTGCAATTTTGGTTGATATATGGGAGGAAAGAAAAGTCTTTGGATCTCGTGGTCAGATTCTCAAGGAAGAGATGGTGGGGAGAAATCCTCATCTATCGTTGGAGAACACAAACAATGGCAGAAATTTACATTCCACCAAAGTAGTAAGTAAAATGTCTTATTCTCCTTTGTGTTAAGTTTC
TCTAGCAGACTCATTGGTACTATTCTTTTCTGAGCTTTCTAAGCACAGTTTCCCAGGTTACCATCCTAATGTTTTCAAAGCTGTTGAAAGCACACATATTTCTTCTTTTTATTATATAGCTGCAATTTAAGACATGTGCATCTTATTTTTTTCTTGAATTTAGAAACTTGCTGTTGGAGGCACATTGGAGAAGATAGTTT
CAGCATATGATTCTGTTCATGATCGCCATTTGGAGGACGATGCAGTTTTGGTCAAATGTAAGGCTGCTGCTAGTGATGTGGAGAAGATGGAAAAAGATTTTCAGAATGGCTGCAATTTTGGTAAGGAAAAGCACGACATAGAAATAATGCTTACCCGTCTACAGTTTTGGTTTTCCATCTCTAGATTTTTAACTTTGCGA
GGACTACGAGTTTGTAATCCCACATTCATGTTTCTTTGGTCAGATGTTTAATTGTGCACGTGTAATAATGTGGCCTTAAAAGATACTCTGTTTGTGCCAAACTGGTCTTTTGTAGCTCACTTTGTTGGCCATTTATGAGGTGCCTTCTCAGCTATGTAGTTTGCATATCTTTAGAAACTTCTTTATGTCTAGGAGGAATA
TCTATTTTGAAGCATGCTCATAAAAAATGATATTGCAACGGTTGATCTCTTAGAAAGTTGTGTTGCTGTGTGAGACATGAAAGAAAGCTGATTTGGAGTTACGGTTTTATTGTAAGGTCTTAAAATGTTCCAAGTATCTTATTGTTAGATAGATTAATGTGATGTTAGTATGTAAGACTTAGGTCATAGTTAAGAATCAA
GATATTCAGACTAAAAAAAATGTCAATGATGTAATGTTATGACAAAGCTAATGATATATTATGACAAAGCTGTAATGAGTCATTAACGATGTAATAAAGGCTGAAGTATATGAATTGTTCCATACTGGAAAACTGGATCAAGGCTCCTTCATATATTTGTGAATGCACATATCATCTATGCTTCAATAACAAATTGTAGC
ATTGGTTATCATCACACTTATCTGCCTATGTGTATGGATAATTAACAGTGGTATTGAGCCCCGAGGGTTAGCTCAGTTGGTTGGAGCTTCCGTGTCCAAGATATGCAAGAATCAAATATGGTAGAGGAATTGCGGGAAAAGGACAGTGTTTTGAGGCAATGCATTGAGCAGCTTGAAACCACTGAAATGGCCAGGGCAGC
CCTTGTCTCTCACCTAAGAGAGGTTCTCCAGGAAGAGGAGTCTAAGTTGGAGCAAGTTCGGACTCAACTGCAGGTAATATTGTTAAGTTATTGTTACGTGTGTTTTTGTGCAAAATTTATGAAAGGCTATTTTCAGTATCAAATTGTATGTCAGCTGCTGCACATGTTGCTAAATTATTTTGCTTGGGTGAATGCCTCCT
ATACTGAATATCTTCATAATAAAAAATTGGTTGCTCCATCAGGTAAGATTGGTTTTCTAAATCAACTTGTATGATCTTAGTCTGACTTGATCTTTCATCAAAGGATGGTTAGGAAATGGTCATGGGAACAAACGGATTTTCTGCAACCGAATTACAATTTTACAATTTTCTGCAACTGAATTATTTGTCGTTAGGAACAG
ACGGATTTTTGACATGACTTGATTTGTAACTTGAGTGGATAAAATTGAATAGAATTTATATATTTTTGGCCACATATTTGTAAATGACAACTCAAATTAGTATACGTCATATCAGAGTCTGTATCTAGTCAAACATATTTGATTCATACGGTATTGGCTCTCCCTTGATTTCGTTTACGTTTCTTCCAGCTAAAGAAGAT
TTATTTTGATGTCATCGTGTTTTGTAAGACATGTATTTTTATGTCCATAGTAATAATACCTGGTTCCCTTTTCCTATTACATGTTTACCGATCAGTCTCCCAATTTCCTGCAACAAAACTTTATTCATGTTGGGAGGTTGGAATGGATTGTAAATTGGTTCATGGGAACAGATAAATAGATTGACAAATTGATAGAAGAT
ATGTTAGTTTGCAATGCAATGCATTGTACTCAGATAGGTAATTGGAAAGTCATCCTTTGTACTAGGTGCCTTGGGTGATGGGATTATTGTACAAACACCATTAAATCAACCATGCTGCCAAAACTCATTTGGTCAACGTCACTGGACATTCATGACCTTTCTCTATGCAAATATAAATGATATGGTCCTAGTTCACTAAT
ATGTGGGTTAAGTACCCTTTATATCTGTTATCATTCATACAGTAAAATAAGCGGAATGGGTTTGAAGGCCTAGGCA


>TRINITY_DN103236_c2_g1_i6 from sample A4 / Example unspliced isoform:
ACTCGAGAAGGAGAAATACCCAAAACCTTCGATCTACAAGCAAGCGACGACCTCACAGTACCGAGTTCGAATCCCAGGGGGCTAAGTCATTGTGCCCTCGAATATCGTCAGTGCTTCCACTCCACATTTCTGAGGAAATCATCATCTGCGGAAATCAAGCAACTCTCTCTTAATTGATGGAATCATATATTCATCATCTA
CAGCCGTTGAGAGCTGCTCCTGGTCATATGACGGCTTATTGGAAGGCCTTCTAGTCGTGGGAGAGAGCTAAGGAGCGCAAGGAAGGGCAGAAGGTGTCCTCTGAATGCTGTCATGATATTAGTAATTTATGCTCGGTGATATGCGGCTGGGCCATATCCCCTTTCGGGATAACAGGGTTCTTGTATGCAAATCAAGTGAA
ACTTCTGATTAGGAGGGATGAACGGTGCTTTCAATGGACAAATATTAGCTGAGAAGCTTTCTAAGCTGAACAACTCACAACAGAGTATTGAGACATTATCGCATTGGTGTATTTTCCATCGGAAGAAAGCAAAGCAGGTTGTGGAGACATGGGATAGACAGTTTCATAGTGCACCCAGAGAGCAGAGAATTCCGTTTTTG
TATCTTGCAAATGACATCTTACAAAATAGTAGGCGTAAAGGCTCAGAATTTGTAGGCGAGTTTTGGAAGGTTCTTCCTGGAGCTCTAAGTGATGTATTTGAGAAAGGGGATGAACATGGAAGAAATGCGGCTATGCGATTGGTTGATATATGGGAGGAAAGAAAAGTCTTTGGATCTCGTGGTCAGATTCTCAAGGAAGA
GATGGTGGGGAGAAATCCTCATCTATCGTTGGAGAACACAAACAATGGCAGAAATTTACATTCCACCAAAGTAAAACTTGCTGTTGGAGGCACATTGGAGAAGATAGTTTCAGCATATGATTCTGTTCATGATCGCCATTTGGAGGACGATGCAGTTTTGGTCAAATGTAAGGCTGCTGCTAGTGATGTGGAGAAGATGG
AAAAAGATTTTCAGAATGGCTGCAATTTTGGTTGATATATGGGAGGAAAGAAAAGTCTTTGGATCTCGTGGTCAGATTCTCAAGGAAGAGATGGTGGGGAGAAATCCTCATCTATCGTTGGAGAACACAAACAATGGCAGAAATTTACATTCCACCAAAGTAgtaagtaaaatgtcttattctcctttgtgttaagtttc
tctagcagactcattggtactattcttttctgagctttctaagcacagtttcccaggttaccatcctaatgttttcaaagctgttgaaagcacacatatttcttctttttattatatagctgcaatttaagacatgtgcatcttatttttttcttgaatttagAAACTTGCTGTTGGAGGCACATTGGAGAAGATAGTTT
CAGCATATGATTCTGTTCATGATCGCCATTTGGAGGACGATGCAGTTTTGGTCAAATGTAAGGCTGCTGCTAGTGATGTGGAGAAGATGGAAAAAGATTTTCAGAATGGCTGCAATTTTGGTAAGGAAAAGCACGACATAGAAATAATGCTTACCCGTCTACAGTTTTGGTTTTCCATCTCTAGATTTTTAACTTTGCGA
GGACTACGAGTTTGTAATCCCACATTCATGTTTCTTTGGTCAGATGTTTAATTGTGCACGTGTAATAATGTGGCCTTAAAAGATACTCTGTTTGTGCCAAACTGGTCTTTTGTAGCTCACTTTGTTGGCCATTTATGAGGTGCCTTCTCAGCTATGTAGTTTGCATATCTTTAGAAACTTCTTTATGTCTAGGAGGAATA
TCTATTTTGAAGCATGCTCATAAAAAATGATATTGCAACGGTTGATCTCTTAGAAAGTTGTGTTGCTGTGTGAGACATGAAAGAAAGCTGATTTGGAGTTACGGTTTTATTGTAAGGTCTTAAAATGTTCCAAGTATCTTATTGTTAGATAGATTAATGTGATGTTAGTATGTAAGACTTAGGTCATAGTTAAGAATCAA
GATATTCAGACTAAAAAAAATGTCAATGATGTAATGTTATGACAAAGCTAATGATATATTATGACAAAGCTGTAATGAGTCATTAACGATGTAATAAAGGCTGAAGTATATGAATTGTTCCATACTGGAAAACTGGATCAAGGCTCCTTCATATATTTGTGAATGCACATATCATCTATGCTTCAATAACAAATTGTAGC
ATTGGTTATCATCACACTTATCTGCCTATGTGTATGGATAATTAACAGTGGTATTGAGCCCCGAGGGTTAGCTCAGTTGGTTGGAGCTTCCGTGTCCAAGATATGCAAGAATCAAATATGGTAGAGGAATTGCGGGAAAAGGACAGTGTTTTGAGGCAATGCATTGAGCAGCTTGAAACCACTGAAATGGCCAGGGCAGC
CCTTGTCTCTCACCTAAGAGAGGTTCTCCAGGAAGAGGTTGAATATTCAAGTGATCCCTGTTTGAAATTATATAAGACACCATAAATGCAAGATAAGCTCAGACTAAGTTAGTGTTGTGGTTACAGTGATCCATTTAGAAATTTGATGAAATAGCTTTTGCAGGAGTCTAAGTTGGAGCAAGTTCGGACTCAACTGCAGG
TAATATTGTTAAGTTATTGTTACGTGTGTTTTTGTGCAAAATTTATGAAAGGCTATTTTCAGTATCAAATTGTATGTCAGCTGCTGCACATGTTGCTAAATTATTTTGCTTGGGTGAATGCCTCCTATACTGAATATCTTCATAATAAAAAATTGGTTGCTCCATCAGGTAAGATTGGTTTTCTAAATCAACTTGTATGA
TCTTAGTCTGACTTGATCTTTCATCAAAGGATGGTTAGGAAATGGTCATGGGAACAAACGGATTTTCTGCAACCGAATTACAATTTTACAATTTTCTGCAACTGAATTATTTGTCGTTAGGAACAGACGGATTTTTGACATGACTTGATTTGTAACTTGAGTGGATAAAATTGAATAGAATTTATATATTTTTGGCCACA
TATTTGTAAATGACAACTCAAATTAGTATACGTCATATCAGAGTCTGTATCTAGTCAAACATATTTGATTCATACGGTATTGGCTCTCCCTTGATTTCGTTTACGTTTCTTCCAGCTAAAGAAGATTTATTTTGATGTCATCGTGTTTTGTAAGACATGTATTTTTATGTCCATAGTAATAATACCTGGTTCCCTTTTCC
TATTACATGTTTACCGATCAGTCTCCCAATTTCCTGCAACAAAACTTTATTCATGTTGGGAGGTTGGAATGGATTGTAAATTGGTTCATGGGAACAGATAAATAGATTGACAAATTGATAGAAGATATGTTAGTTTGCAATGCAATGCATTGTACTCAGATAGGTAATTGGAAAGTCATCCTTTGTACTAGGTGCCTTGG
GTGATGGGATTATTGTACAAACACCATTAAATCAACCATGCTGCCAAAACTCATTTGGTCAACGTCACTGGACATTCATGACCTTTCTCTATGCAAATATAAATGATATGGTCCTAGTTCACTAATATGTGGGTTAAGTACCCTTTATATCTGTTATCATTCATACAGTAAAATAAGCGGAATGGGTTTGAAGGCCTAGG
CA



Intron 2 GTTGAATATT ... GCTTTTGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A130.9244.72014
A229.9428.7125
A329.0549.3206
A450.7319.4208
A533.7726.3131
A624.2658.3180
A724.82115371
A821.5745.4120
A925.3293310
A1023.52122.9370



>TRINITY_DN120601_c2_g1_i7 from sample A2 / Example spliced isoform
AAACACTCGAGAAGGAGAAATACCCAAAACCTTCGATCTACAAGCAAGCGACGACCTCACAGTACCGAGTTCGAATCCCAGGGGGCTAAGTCATTGTGCCCTCGAATATCGTCAGTGCTTCCACTCCACATTTCTGAGGAAATCATCATCTGCGGAAATCAAGCAACTCTCTCTTAATTGATGGAATCATATATTCATCA
TCTACAGCCGTTGAGAGCTGCTCCTGGTCATATGACGGCTTATTGGAAGGCCTTCTAGTCGTGGGAGAGAGCTAAGGAGCGCAAGGAAGGGCAGAAGGTGTCCTCTGAATGCTGTCATGATATTAGTAATTTATGCTCGGTGATATGCGGCTGGGCCATATCCCCTTTCGGGATAACAGGGTTCTTGTATGCAAATCAAG
TGAAACTTCTGATTAGGAGGGATGAACGGTGCTTTCAATGGACAAATATTAGCTGAGAAGCTTTCTAAGCTGAACAACTCACAACAGAGTATTGAGACATTATCGCATTGGTGTATTTTCCATCGGAAGAAAGCAAAGCAGGTTGTGGAGACATGGGATAGACAGTTTCATAGTGCACCCAGAGAGCAGAGAATTCCGTT
TTTGTATCTTGCAAATGACATCTTACAAAATAGTAGGCGTAAAGGCTCAGAATTTGTAGGCGAGTTTTGGAAGGTTCTTCCTGGAGCTCTAAGTGATGTATTTGAGAAAGGGGATGAACATGGAAGAAATGCGGCTATGCGATTGGTTGATATATGGGAGGAAAGAAAAGTCTTTGGATCTCGTGGTCAGATTCTCAAGG
AAGAGATGGTGGGGAGAAATCCTCATCTATCGTTGGAGAACACAAACAATGGCAGAAATTTACATTCCACCAAAGTAAAACTTGCTGTTGGAGGCACATTGGAGAAGATAGTTTCAGCATATGATTCTGTTCATGATCGCCATTTGGAGGACGATGCAGTTTTGGTCAAATGTAAGGCTGCTGCTAGTGATGTGGAGAAG
ATGGAAAAAGATTTTCAGAATGGCTGCAATTTTGGAGATATGCAAGAATCAAATATGGTAGAGGAATTGCGGGAAAAGGACAGTGTTTTGAGGCAATGCATTGAGCAGCTTGAAACCACTGAAATGGCCAGGGCAGCCCTTGTCTCTCACCTAAGAGAGGTTCTCCAGGAAGAGGAGTCTAAGTTGGAGCAAGTTCGGAC
TCAACTGCAGGTAATATTGTTAAGTTATTGTTACGTGTGTTTTTGTGCAAAATTTATGAAAGGCTATTTTCAGTATCAAATTGTATGTCAGCTGCTGCACATGTTGCTAAATTATTTTGCTTGGGTGAATGCCTCCTATACTGAATATCTTCATAATAAAAAATTGGTTGCTCCATCAGGTAAGATTGGTTTTCTAAATC
AACTTGTATGATCTTAGTCTGACTTGATCTTTCATCAAAGGATGGTTAGGAAATGGTCATGGGAACAAACGGATTTTCTGCAACCGAATTACAATTTTACAATTTTCTGCAACTGAATTATTTGTCGTTAGGAACAGACGGATTTTTGACATGACTTGATTTGTAACTTGAGTGGATAAAATTGAATAGAATTTATATAT
TTTTGGCCACATATTTGTAAATGACAACTCAAATTAGTATACGTCATATCAGAGTCTGTATCTAGTCAAACATATTTGATTCATACGGTATTGGCTCTCCCTTGATTTCGTTTACGTTTCTTCCAGCTAAAGAAGATTTATTTTGATGTCATCGTGTTTTGTAAGACATGTATTTTTATGTCCATAGTAATAATACCTGG
TTCCCTTTTCCTATTACATGTTTACCGATCAGTCTCCCAATTTCCTGCA


>TRINITY_DN120601_c2_g1_i6 from sample A2 / Example unspliced isoform:
AAACACTCGAGAAGGAGAAATACCCAAAACCTTCGATCTACAAGCAAGCGACGACCTCACAGTACCGAGTTCGAATCCCAGGGGGCTAAGTCATTGTGCCCTCGAATATCGTCAGTGCTTCCACTCCACATTTCTGAGGAAATCATCATCTGCGGAAATCAAGCAACTCTCTCTTAATTGATGGAATCATATATTCATCA
TCTACAGCCGTTGAGAGCTGCTCCTGGTCATATGACGGCTTATTGGAAGGCCTTCTAGTCGTGGGAGAGAGCTAAGGAGCGCAAGGAAGGGCAGAAGGTGTCCTCTGAATGCTGTCATGATATTAGTAATTTATGCTCGGTGATATGCGGCTGGGCCATATCCCCTTTCGGGATAACAGGGTTCTTGTATGCAAATCAAG
TGAAACTTCTGATTAGGAGGGATGAACGGTGCTTTCAATGGACAAATATTAGCTGAGAAGCTTTCTAAGCTGAACAACTCACAACAGAGTATTGAGACATTATCGCATTGGTGTATTTTCCATCGGAAGAAAGCAAAGCAGGTTGTGGAGACATGGGATAGACAGTTTCATAGTGCACCCAGAGAGCAGAGAATTCCGTT
TTTGTATCTTGCAAATGACATCTTACAAAATAGTAGGCGTAAAGGCTCAGAATTTGTAGGCGAGTTTTGGAAGGTTCTTCCTGGAGCTCTAAGTGATGTATTTGAGAAAGGGGATGAACATGGAAGAAATGCGGCTATGCGATTGGTTGATATATGGGAGGAAAGAAAAGTCTTTGGATCTCGTGGTCAGATTCTCAAGG
AAGAGATGGTGGGGAGAAATCCTCATCTATCGTTGGAGAACACAAACAATGGCAGAAATTTACATTCCACCAAAGTAAAACTTGCTGTTGGAGGCACATTGGAGAAGATAGTTTCAGCATATGATTCTGTTCATGATCGCCATTTGGAGGACGATGCAGTTTTGGTCAAATGTAAGGCTGCTGCTAGTGATGTGGAGAAG
ATGGAAAAAGATTTTCAGAATGGCTGCAATTTTGGAGATATGCAAGAATCAAATATGGTAGAGGAATTGCGGGAAAAGGACAGTGTTTTGAGGCAATGCATTGAGCAGCTTGAAACCACTGAAATGGCCAGGGCAGCCCTTGTCTCTCACCTAAGAGAGGTTCTCCAGGAAGAGgttgaatattcaagtgatccctgttt
gaaattatataagacaccataaatgcaagataagctcagactaagttagtgttgtggttacagtgatccatttagaaatttgatgaaatagcttttgcagGAGTCTAAGTTGGAGCAAGTTCGGACTCAACTGCAGGTAATATTGTTAAGTTATTGTTACGTGTGTTTTTGTGCAAAATTTATGAAAGGCTATTTTCAGT
ATCAAATTGTATGTCAGCTGCTGCACATGTTGCTAAATTATTTTGCTTGGGTGAATGCCTCCTATACTGAATATCTTCATAATAAAAAATTGGTTGCTCCATCAGGTAAGATTGGTTTTCTAAATCAACTTGTATGATCTTAGTCTGACTTGATCTTTCATCAAAGGATGGTTAGGAAATGGTCATGGGAACAAACGGAT
TTTCTGCAACCGAATTACAATTTTACAATTTTCTGCAACTGAATTATTTGTCGTTAGGAACAGACGGATTTTTGACATGACTTGATTTGTAACTTGAGTGGATAAAATTGAATAGAATTTATATATTTTTGGCCACATATTTGTAAATGACAACTCAAATTAGTATACGTCATATCAGAGTCTGTATCTAGTCAAACATA
TTTGATTCATACGGTATTGGCTCTCCCTTGATTTCGTTTACGTTTCTTCCAGCTAAAGAAGATTTATTTTGATGTCATCGTGTTTTGTAAGACATGTATTTTTATGTCCATAGTAATAATACCTGGTTCCCTTTTCCTATTACATGTTTACCGATCAGTCTCCCAATTTCCTGCA