sp|Q6YZ54|RFC3_ORYSJ ----> Replication factor C subunit 3


Intron 1 GTATCCTCCT ... CTAGTGTAAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A118.9935211154
A219.512649137
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A519.411103122
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A818.391176341189
A917.661177337168
A1018.25878276116



>TRINITY_DN107066_c0_g5_i1 from sample A3 / Example spliced isoform
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CCTTCTAAAAAATCTAACAAAGGAAAAGGAAAAATTGGGAACGATGCTATTCAAAAGACCGGCCCATGGGTCGAAAAATATCGCCCTCAATCCCTCGCAGACGTTGCAGCACATAAAGATATAATCGAAACAATTGATAGGCTGACGAGCGAGAACAAGCTGCCTCATCTCCTTCTTTACGGTCCGCCTGGTACCGGGAA
GACATCCACTGTGTTGGCTGTAGCACGCAAGCTTTATGGGAGTCAGTACCAGAACATGATCCTGGAGTTGAATGCCTCGGATGATCGAGGAATTGAAGTTGTTCGCCATCAAATTCAGGATTTTGCAAGTACTCAGAGTTTCAGTTTTGGTGCAAAGTCTAGTGTTAAGCTAGTCTTATTGGATGAGGCAGATGCCATGA
CAAAAGATGCTCAGTTTTCATTGCGCAGAGTTATGGAGAAATACACCAAGAGCACAAGGTTTGCTCTCATATGCAATTATGTCAATAAGATTATTCCAGCTTTGCAATCAAGGTGCACAAGATTTCGGTTTGCTCCTCTGGATCCTGCCAATGTCACGGAGCGGCTACGGCATGTCATAAGCGAAGAGAGGATTGATGTA
ACAGAGGATGGCTTGTCTGCAATAGTGAGGCTCAGCTGTGGTGACATGAGAAAGGCACTGAATATTTTGCAGTCTACACAGATGGCTTCTCCTCATGTGACCGAAGAAGCTGTCTACCTGTGCACGGGGAACCCAATGCCCAAGGATATTGAACAGATATCATTTTGGTTGCTAAATGAATCATTTGCAAGTGCTTATCG
TTACATATCGGAAATGAAGACTAGCAAGGGGCTGGCTCTTGTTGATGTTATAAGAGAAATTCCACTGTTTATTTTTAATATCAAAATGCCTGCAGCAATTCGTGTCCAACTGATTAATGCTTTAGCTGACATTGAGTATAGGTTGGCATTTGGTACAAATGAGAAACTGCAACTTGGATCTCTTGTCAGTGCTTTTACAC
ATGCTCGCTGTGCATTGGTTGCAGCTGCTAAGTGACTTCTAAGAATTTCATTTCCAGCTACAAGGGAGAAAAAATGCAGTAAGGGGGTATTTTGCCAAGTTATTGTTTCTTCTAATATTCAAAGTAAAATTTGTACATTAAAAGTGAAGGAGTGAGTAGCAAGGAGCACCTGCACACTGCTTTTTTGCTACAAGTCAACA
CATTGCATTGTTTTTGTTCACTATGGATGATGAATATGAGTAAATTTCAGGAATCAATGATATGGGGGTATTTCATGTTGAAATAGTTCCTGCTAACTTTGTCATATTAGTTGATGTTACAAAGTCTTTGCTATCCTAGGGATATCATGGTTGCGGGTTTTCAATGTATTAGGCATTATTTGAGGCTTGTGTTTATGCCC
ATACAAATTTGTCGTATCTACACCCCTTGGTATTCATTTTCATGTTTCCATAGCCTGTATTTTGAACTCCTTAGTAAAAAAGGTTGGTGCTTCAGGACCAGCTAGCAAAATACTCTACATCTGTAGCCAATTCATCAAAGATGTTAGTGTTCTTGTGCTACTTTCATTATAGTTATTCCCAATGGTAAACACACACTTGG
TTGATAGGTGCATGCATGGTAAATTATGGTAGTGTATTTGTG


>TRINITY_DN107066_c0_g5_i2 from sample A3 / Example unspliced isoform:
CTCACTTCCACCTGTGCATCAAGGTGGTTTGCAAATAACGAATTCAATCAATCTCCCTGATCGAAAAGTAATTTGGCGCCATTTTTGGCTTCCCGTTGCTTTTGCTCTGCCATTTCAGTTGTGATATATCCTGCAACTGCTAAAAGAAAACACGCAGGAAAATGGAGGAACCAACGTCGATGGACGTCGACGAACAATTT
CCTTCTAAAAAATCTAACAAAGGAAAAGGAAAAATTGGGAACGATGCTATTCAAAAGACCGGCCCATGGGTCGAAAAATATCGCCCTCAATCCCTCGCAGACGTTGCAGCACATAAAGATATAATCGAAACAATTGATAGGCTGACGAGCGAGAACAAGCTGCCTCATCTCCTTCTTTACGGTCCGCCTGGTACCGGGAA
GACATCCACTGTGTTGGCTGTAGCACGCAAGCTTTATGGGAGTCAGTACCAGAACATGATCCTGGAGTTGAATGCCTCGGATGATCGAGGAATTGAAGTTGTTCGCCATCAAATTCAGGATTTTGCAAGTACTCAGAGTTTCAGTTTTGGTGCAAAGTCTAGTGTTAAGCTAGTCTTATTGGATGAGGCAGATGCCATGA
CAAAAGATGCTCAGTTTTCATTGCGCAGAGTTATGGAGAAATACACCAAGAGCACAAGGTTTGCTCTCATATGCAATTATGTCAATAAGATTATTCCAGCTTTGCAATCAAGGTGCACAAGATTTCGGTTTGCTCCTCTGGATCCTGCCAATGTCACGGAGCGGCTACGGCATGTCATAAGCGAAGAGAGGATTGATGTA
ACAGAGGATGGCTTGTCTGCAATAGTGAGGCTCAGCTGTGGTGACATGAGAAAGGCACTGAATATTTTGCAGTCTACACAGATGGCTTCTCCTCATGTGACCGAAGAAGCTGTCTACCTGTGCACGGGGAACCCAATGCCCAAGGATATTGAACAGATATCATTTTGGTTGCTAAATGAATCATTTGCAAGTGCTTATCG
TTgtatcctccttttcatttgcatgggatatttctggttgttattttaatttgaatgcagctttcaatatccatccttaactagtgtaagACATATCGGAAATGAAGACTAGCAAGGGGCTGGCTCTTGTTGATGTTATAAGAGAAATTCCACTGTTTATTTTTAATATCAAAATGCCTGCAGCAATTCGTGTCCAACTG
ATTAATGCTTTAGCTGACATTGAGTATAGGTTGGCATTTGGTACAAATGAGAAACTGCAACTTGGATCTCTTGTCAGTGCTTTTACACATGCTCGCTGTGCATTGGTTGCAGCTGCTAAGTGACTTCTAAGAATTTCATTTCCAGCTACAAGGGAGAAAAAATGCAGTAAGGGGGTATTTTGCCAAGTTATTGTTTCTTC
TAATATTCAAAGTAAAATTTGTACATTAAAAGTGAAGGAGTGAGTAGCAAGGAGCACCTGCACACTGCTTTTTTGCTACAAGTCAACACATTGCATTGTTTTTGTTCACTATGGATGATGAATATGAGTAAATTTCAGGAATCAATGATATGGGGGTATTTCATGTTGAAATAGTTCCTGCTAACTTTGTCATATTAGTT
GATGTTACAAAGTCTTTGCTATCCTAGGGATATCATGGTTGCGGGTTTTCAATGTATTAGGCATTATTTGAGGCTTGTGTTTATGCCCATACAAATTTGTCGTATCTACACCCCTTGGTATTCATTTTCATGTTTCCATAGCCTGTATTTTGAACTCCTTAGTAAAAAAGGTTGGTGCTTCAGGACCAGCTAGCAAAATA
CTCTACATCTGTAGCCAATTCATCAAAGATGTTAGTGTTCTTGTGCTACTTTCATTATAGTTATTCCCAATGGTAAACACACACTTGGTTGATAGGTGCATGCATGGTAAATTATGGTAGTGTATTTGTG