NA ----> NA
Intron 1 GTAAGTTTAG ... ATATGCTTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 13.11 | 53 | 0 | 8 |
| A2 | 5.06 | 75 | 0 | 4 |
| A3 | 7.41 | 50 | 0 | 4 |
| A4 | 0 | 29 | 0 | 0 |
| A5 | 5.26 | 18 | 0 | 1 |
| A6 | 8.82 | 93 | 0 | 9 |
| A7 | 8.11 | 204 | 0 | 18 |
| A8 | 9.68 | 140 | 0 | 15 |
| A9 | 12.32 | 178 | 0 | 25 |
| A10 | 11.33 | 180 | 0 | 23 |
>TRINITY_DN43889_c2_g3_i1 from sample A8 / Example spliced isoformCAAACATAAAAGATCACCAAGTAAGCTCTTTCAAAGTCAATTTTAATTTTAACGTGTGATGCCGCTCCACTATAAACCCTCCTCGTTTCCCTAAACCTCTCGTTGCTCTTAGCGCACTCTAAAAACCTCTCGTTGCTCTTAGCGCACTCTAAAAACCTCTCGTTGCTCTTAGCGCAGCTCATTATGACAGGCGGATGTAA
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GTGTGGGCTCAAAACTTATCCATACAATTTTTGGTGTGAATTACCTTCA
>TRINITY_DN43889_c2_g3_i3 from sample A8 / Example unspliced isoform:CTACAGTACAGAAGACGTTgtaagtttagttttgtactataattttcactgaatttctgcctcgttttgtatttataatattattgcttgaattactatgttttggtattgtaacacattatttttttatttacttgaatgattactttttgtttgtgcatttgattacactgctgtactgtcacattatattttcagca
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GTTTCACCTCTAAATTAACTAAGTTGAGATGAGCCAACCCTTTGTTCTCTCTATCATTGTTTTGTGAGTTAGCTGAAAAGTGTGGGCTCAAAACTTATCCATACAATTTTTGGTGTGAATTACCTTCA