sp|Q8RWW0|ALE2_ARATH ----> Receptor-like serine/threonine-protein kinase ALE2

Intron 1 GTAACTGACT ... ATTCCCACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	18.1	181	0	40
A2	19.38	129	0	31
A3	15.67	113	0	21
A4	18.22	193	8	43
A5	21.54	51	0	14
A6	18.97	141	0	33
A7	14.52	259	2	44
A8	20.25	126	0	32
A9	18.21	238	1	53
A10	19.08	263	0	62

>TRINITY_DN107949_c0_g1_i5 from sample A3 / Example spliced isoform

GATTGTTCTAGATAGCGGTGAACTGATTTCTTTTGAGGCAATGTTTTTTGCATGCTCTATTGAGATATTCTTCCACTTGGTGTACTTGAAATTTGCCATTAACTGTTTTATTTGCTGTGGGATTTTATAAATTGTAGTGAACTTATTTGTTTGCTGAGGGGCACTTGCAGTGAATGCATTTCTTTTGTCAGGGTGCTTCT
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ATGAACTTGTTCCAAACGGAAGCTTAGAAGCTTGGCTTCATGGACCTCTAGATGCAAATCATCCGTTGGACTGGGAGACAAGAATGAAGATTGCTCTGGATGCTGCCCGTGGTCTTGCTTACCTCCATGAGGATTCCCAGCCTTGTGTCATTCACCGAGATTTTAAGGCATCCAATATTTTACTGGAGAATAATTTTCAT
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AATCTTTCACGCACAGCTGTTTTTTCTGAAGATCTGCAAGAAGGACGATAGTCTGAGTGCCTTTTCCAGAGATTTTGTACAATTTCCAGCAAGCTATGCAGCAGGAAATGCCGTCATTTCAAAATAGGTCTGTGGGAATCTTATGAAGTTTAAAGCTGCAGTGCATGTTTGCATTGATGGCTGCTTCAGACTTACTGGGA
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>TRINITY_DN107949_c0_g1_i3 from sample A3 / Example unspliced isoform:

AGCTTAGAAGCTTGGCTTCATGgtaactgactagtttctattagcttagccattttactttagtccttgaaagaggatttcaatgttttcttggattaaagtttctctcaactaattttctgaactgctggactgtgtgatgcatgagagagcctagtataccagactcctttaccctgttttctttgtggagttgaggt
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TCCAGCAAGCTATGCAGCAGGAAATGCCGTCATTTCAAAATAGGTCTGTGGGAATCTTATGAAGTTTAAAGCTGCAGTGCATGTTTGCATTGATGGCTGCTTCAGACTTACTGGGAGACTGGACACTAATGAAGTTGGATTTGACTGTTGAATCTAATAAAGCCTTTATTGGTTCCTCACCTACTACTTGAACAACCACT
TGTTTGTTATCTGTCTACAACTCATCCTAGGTTGGGTGGGTTAGAGTGTTTGTCAGTATCATATTTCTCAAAAGTAAATTGATTTTTGTTTATGTCCATACCGAGAGATTGGGAAGGGCCATGCTTGTCTTTTGGTCGTTGCAGTTTTGCATTTCCTCTTTGGTGTGCAATGATGATTCAATATTTCTAGGACAAAGGAA
CTGTGGTTTGGCTTTTAGATTCATCTACGTCTGGTACCAATGGTGAGGTTCTGGAGAAAGTTGTATGTAGAAACTGGAATTCCAGTTTTGCTTTGCAATTTTGGCGGAAGCAGACAGTGATCCTGCTTGTAAAATAAATTATTTTTACCTCTAATTCCAAATGTTCAAATGGATAGATTTCAATAGATATCACATAAAGT
GGAGGTTGTATTTTTCCTCATGATGCAAATGGTGTGTCATCGATACATTAGGCATCGTGTACTCTGGTCCCTGGTTGATGTCTAAATTTTAATTTTCAATATCTCGTATCGGTCCTTGTGTTGTATTTGTGCATGGAATGATTCTGCATTTGTAATTTTGTATTGATTCCCGCCTATTTCCAAAACATTAAAATGCGTTT
TCTTATGTGGCACATTGCCAATCCATGTGGTTTGATGTGAACCTATATGGTTCCCCC