sp|Q9LXT9|CALS3_ARATH ----> Callose synthase 3
Intron 1 GTTAGTGGTA ... TGTCTTTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 64.1 | 28 | 50 | 9 |
| A2 | 61.11 | 28 | 44 | 18 |
| A3 | 54.55 | 20 | 24 | 12 |
| A4 | 75 | 13 | 39 | 6 |
| A5 | 70.21 | 14 | 33 | 12 |
| A6 | 50 | 1 | 1 | 0 |
| A7 | 0 | 2 | 0 | 2 |
| A8 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A9 | 66.67 | 2 | 4 | 0 |
| A10 | 44.44 | 5 | 4 | 3 |
>TRINITY_DN122574_c1_g2_i3 from sample A3 / Example spliced isoformCGATTCAATGAGGTTCCATCTACCCAGCCATTTTATTATGATTGATCATCTCACCATTGGTTTCTGACATTGATTTTATCATGCAAGCGAGTGAAATAATGAGATAGCCAGCCGCAAACCCCCCCACAGTGGGTTCCTTGCCCAATATCCCGGTTGCGTCTCTTAGTTAATAAAAAATCCATATCTTTTAAAGTTACCCA
GTTGGTGTCACAGGAATTTGTTTTTTCAGCGCGCCTTGGTTTTTGGCTTCTCTAAGTACATCTATACTTTGTATATATACATCCCGTACAGGGATGTAAATTCACTGTGTATACGTTTGCTGAGATGCAGCAGTCTCTCGGAGCCTTATTTGTGATTGGTCCAGGCACCGAAAGAAGTGCTTCGGTTGCCACGTCACTGT
CCCATACAAGTTTCAGATTCATTTGCAGGGAAATACCGGTGAAAGCAGTCCAGGTGGGTGTTCGTGCTCGTTTTGGTTTATTTCAGGGTTTGGGTTTCGAGGGGTGATTGATTTGCTTTTCGAGGCCCGGTGTTTAATTTACATGCATAATAGTTGAGGATTTAGTTCTGAAGTGATTGATTTCAAGTGGGCTCTCTGTA
TTCATGCTCTTTGAAGCAGAGTTCCAGGCGGGTTACTGTTCTTCGGTCTTATAATAATTGGGTGGAAAAGATAGGTCACCCGTTTGAGAGATGAGTAGTCTATCCTGCTGTGTGTAAGAATATATACTAAGAAATGGCTGGAAGAACTGCAGAGCCACCAGCACGGCGTCTATCGAGGACGCACACCACTGGAAATCTTC
AGGATTCGGCGTTTGACAGTGAAATTATTCCGTCTTCTCTCTCTTCCATAGCGCCGATTCTACGTGTTGCCAATGAGATCGAGAATCAGTGTCCAAGAGTTGCCTATCTCTGTCGGTTCTATGCCTTTGAAAAAGCTCATAAACTGGATCCAACATCTAGTGGTCGAGGTGTTCGCCAGTTCAAAACAGCTCTGCTACAA
CGACTGGAAAGGGATGCTGAACCAACAATGGTGGCTAGGAAGAAGAAAAGTGATGCAAGAGAAATGCAGAGCTTTTACCAACAATATTACGAGGATTATGTGAAGTCACTTGATGGAGCTGCTGATAAAGCTGATCGAGCAGCGCTTACCAAAGCATATCAAACTGCTGCGGTCTTGTTTGAAGTGCTCAAGGCAGTCAA
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>TRINITY_DN122574_c1_g2_i2 from sample A3 / Example unspliced isoform:CGATTCAATGAGGTTCCATCTACCCAGCCATTTTATTATGATTGATCATCTCACCATTGGTTTCTGACATTGATTTTATCATGCAAGCGAGTGAAATAATGAGATAGCCAGCCGCAAACCCCCCCACAGTGGGTTCCTTGCCCAATATCCCGGTTGCGTCTCTTAGTTAATAAAAAATCCATATCTTTTAAAGTTACCCA
GTTGGTGTCACAGGAATTTGTTTTTTCAGCGCGCCTTGGTTTTTGGCTTCTCTAAGTACATCTATACTTTGTATATATACATCCCGTACAGGGATGTAAATTCACTGTGTATACGTTTGCTGAGATGCAGCAGTCTCTCGGAGCCTTATTTGTGATTGGTCCAGGCACCGAAAGAAGTGCTTCGGTTGCCACGTCACTGT
CCCATACAAGTTTCAGATTCATTTGCAGGGAAATACCGGTGAAAGCAGTCCAGGTGGGTGTTCGTGCTCGTTTTGGTTTATTTCAGGGTTTGGGTTTCGAGGGGTGATTGATTTGCTTTTCGAGGCCCGGTGTTTAATTTACATGCATAATAGTTGAGGATTTAGTTCTGAAGTGATTGATTTCAAGTGGGCTCTCTGTA
TTCATGCTCTTTGAAGCAGAGTTCCAGGCGGGTTACTGTTCTTCGGTCTTATAATAATTGGgttagtggtaatttctccatttaatgagtctaagcattggtgatgttgtggccggagagtcccttacaaagcacagttccagatcctcttaggctcttggtgagcttgttcttgttcattttctcattttgccatgttt
aatcattttgagctgtatgataggttaagccatgtgttgcattgaaagcaatgttaagtaacagagtgttcccgatgaagcctgccttcaggcagtgagtttcaccattgggtgttgtaaaaaataacatcttagtcttaatggacatgataggtgtattgggcctctgaaatccacaataccttcctatcccggaacat
cttcacagttgcaaatggtctaaagacatgtcaagcccggaagataaatgtttttagctttttagtattcttagttcgaatttatgtcgatgccgaagattttgatgcatcttgttgttgtctttcagGTGGAAAAGATAGGTCACCCGTTTGAGAGATGAGTAGTCTATCCTGCTGTGTGTAAGAATATATACTAAGAA
ATGGCTGGAAGAACTGCAGAGCCACCAGCACGGCGTCTATCGAGGACGCACACCACTGGAAATCTTCAGGATTCGGCGTTTGACAGTGAAATTATTCCGTCTTCTCTCTCTTCCATAGCGCCGATTCTACGTGTTGCCAATGAGATCGAGAATCAGTGTCCAAGAGTTGCCTATCTCTGTCGGTTCTATGCCTTTGAAAA
AGCTCATAAACTGGATCCAACATCTAGTGGTCGAGGTGTTCGCCAGTTCAAAACAGCTCTGCTACAACGACTGGAAAGGGATGCTGAACCAACAATGGTGGCTAGGAAGAAGAAAAGTGATGCAAGAGAAATGCAGAGCTTTTACCAACAATATTACGAGGATTATGTGAAGTCACTTGATGGAGCTGCTGATAAAGCTG
ATC
Intron 2 GTGAGCTTGT ... TGTCTTTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 27.84 | 35 | 18 | 9 |
| A2 | 24.56 | 43 | 10 | 18 |
| A3 | 29.41 | 24 | 8 | 12 |
| A4 | 25 | 30 | 14 | 6 |
| A5 | 24.27 | 39 | 13 | 12 |
| A6 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A7 | 25 | 3 | 0 | 2 |
| A8 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A9 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A10 | 36.84 | 6 | 4 | 3 |
>TRINITY_DN122574_c1_g2_i5 from sample A3 / Example spliced isoformCGATTCAATGAGGTTCCATCTACCCAGCCATTTTATTATGATTGATCATCTCACCATTGGTTTCTGACATTGATTTTATCATGCAAGCGAGTGAAATAATGAGATAGCCAGCCGCAAACCCCCCCACAGTGGGTTCCTTGCCCAATATCCCGGTTGCGTCTCTTAGTTAATAAAAAATCCATATCTTTTAAAGTTACCCA
GTTGGTGTCACAGGAATTTGTTTTTTCAGCGCGCCTTGGTTTTTGGCTTCTCTAAGTACATCTATACTTTGTATATATACATCCCGTACAGGGATGTAAATTCACTGTGTATACGTTTGCTGAGATGCAGCAGTCTCTCGGAGCCTTATTTGTGATTGGTCCAGGCACCGAAAGAAGTGCTTCGGTTGCCACGTCACTGT
CCCATACAAGTTTCAGATTCATTTGCAGGGAAATACCGGTGAAAGCAGTCCAGGTGGGTGTTCGTGCTCGTTTTGGTTTATTTCAGGGTTTGGGTTTCGAGGGGTGATTGATTTGCTTTTCGAGGCCCGGTGTTTAATTTACATGCATAATAGTTGAGGATTTAGTTCTGAAGTGATTGATTTCAAGTGGGCTCTCTGTA
TTCATGCTCTTTGAAGCAGAGTTCCAGGCGGGTTACTGTTCTTCGGTCTTATAATAATTGGGTTAGTGGTAATTTCTCCATTTAATGAGTCTAAGCATTGGTGATGTTGTGGCCGGAGAGTCCCTTACAAAGCACAGTTCCAGATCCTCTTAGGCTCTTGGTGGAAAAGATAGGTCACCCGTTTGAGAGATGAGTAGTCT
ATCCTGCTGTGTGTAAGAATATATACTAAGAAATGGCTGGAAGAACTGCAGAGCCACCAGCACGGCGTCTATCGAGGACGCACACCACTGGAAATCTTCAGGATTCGGCGTTTGACAGTGAAATTATTCCGTCTTCTCTCTCTTCCATAGCGCCGATTCTACGTGTTGCCAATGAGATCGAGAATCAGTGTCCAAGAGTT
GCCTATCTCTGTCGGTTCTATGCCTTTGAAAAAGCTCATAAACTGGATCCAACATCTAGTGGTCGAGGTGTTCGCCAGTTCAAAACAGCTCTGCTACAACGACTGGAAAGGGATGCTGAACCAACAATGGTGGCTAGGAAGAAGAAAAGTGATGCAAGAGAAATGCAGAGCTTTTACCAACAATATTACGAGGATTATGT
GAAGTCACTTGATGGAGCTGCTGATAAAGCTGATCGAGCAGCGCTTACCAAAGCATATCAAACTGCTGCGGTCTTGTTTGAAGTGCTCAAGGCAGTCAACCAGACAGAGGCTGCAGAAGTTGCCCCAGAGATTATGGAAGCTGGTAAAGATGTTGAGAAAAAAACAGAGATGTATGTTCCTTATAATATTCTTCCTTTAG
ATCAAGCTGGGGCAAATCAAGCAATTATG
>TRINITY_DN122574_c1_g2_i2 from sample A3 / Example unspliced isoform:CGATTCAATGAGGTTCCATCTACCCAGCCATTTTATTATGATTGATCATCTCACCATTGGTTTCTGACATTGATTTTATCATGCAAGCGAGTGAAATAATGAGATAGCCAGCCGCAAACCCCCCCACAGTGGGTTCCTTGCCCAATATCCCGGTTGCGTCTCTTAGTTAATAAAAAATCCATATCTTTTAAAGTTACCCA
GTTGGTGTCACAGGAATTTGTTTTTTCAGCGCGCCTTGGTTTTTGGCTTCTCTAAGTACATCTATACTTTGTATATATACATCCCGTACAGGGATGTAAATTCACTGTGTATACGTTTGCTGAGATGCAGCAGTCTCTCGGAGCCTTATTTGTGATTGGTCCAGGCACCGAAAGAAGTGCTTCGGTTGCCACGTCACTGT
CCCATACAAGTTTCAGATTCATTTGCAGGGAAATACCGGTGAAAGCAGTCCAGGTGGGTGTTCGTGCTCGTTTTGGTTTATTTCAGGGTTTGGGTTTCGAGGGGTGATTGATTTGCTTTTCGAGGCCCGGTGTTTAATTTACATGCATAATAGTTGAGGATTTAGTTCTGAAGTGATTGATTTCAAGTGGGCTCTCTGTA
TTCATGCTCTTTGAAGCAGAGTTCCAGGCGGGTTACTGTTCTTCGGTCTTATAATAATTGGGTTAGTGGTAATTTCTCCATTTAATGAGTCTAAGCATTGGTGATGTTGTGGCCGGAGAGTCCCTTACAAAGCACAGTTCCAGATCCTCTTAGGCTCTTGgtgagcttgttcttgttcattttctcattttgccatgttt
aatcattttgagctgtatgataggttaagccatgtgttgcattgaaagcaatgttaagtaacagagtgttcccgatgaagcctgccttcaggcagtgagtttcaccattgggtgttgtaaaaaataacatcttagtcttaatggacatgataggtgtattgggcctctgaaatccacaataccttcctatcccggaacat
cttcacagttgcaaatggtctaaagacatgtcaagcccggaagataaatgtttttagctttttagtattcttagttcgaatttatgtcgatgccgaagattttgatgcatcttgttgttgtctttcagGTGGAAAAGATAGGTCACCCGTTTGAGAGATGAGTAGTCTATCCTGCTGTGTGTAAGAATATATACTAAGAA
ATGGCTGGAAGAACTGCAGAGCCACCAGCACGGCGTCTATCGAGGACGCACACCACTGGAAATCTTCAGGATTCGGCGTTTGACAGTGAAATTATTCCGTCTTCTCTCTCTTCCATAGCGCCGATTCTACGTGTTGCCAATGAGATCGAGAATCAGTGTCCAAGAGTTGCCTATCTCTGTCGGTTCTATGCCTTTGAAAA
AGCTCATAAACTGGATCCAACATCTAGTGGTCGAGGTGTTCGCCAGTTCAAAACAGCTCTGCTACAACGACTGGAAAGGGATGCTGAACCAACAATGGTGGCTAGGAAGAAGAAAAGTGATGCAAGAGAAATGCAGAGCTTTTACCAACAATATTACGAGGATTATGTGAAGTCACTTGATGGAGCTGCTGATAAAGCTG
ATC