sp|O23482|OPT3_ARATH ----> Oligopeptide transporter 3
Intron 1 GTGAGTTCCC ... ATGATTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 34.29 | 23 | 10 | 14 |
| A2 | 20 | 12 | 1 | 5 |
| A3 | 23.81 | 16 | 5 | 5 |
| A4 | 20 | 24 | 6 | 6 |
| A5 | 38.46 | 4 | 2 | 3 |
| A6 | 17.46 | 26 | 6 | 5 |
| A7 | 19.3 | 46 | 9 | 13 |
| A8 | 16.67 | 20 | 3 | 5 |
| A9 | 14.29 | 24 | 3 | 5 |
| A10 | 22.73 | 34 | 11 | 9 |
>TRINITY_DN116547_c0_g1_i1 from sample A1 / Example spliced isoformAGTGAGCATGCCATAAAACATTAAAATGTAACATTCTTCCATGTGCTTTCTGCTTCATTTTTTCTGACTTGAGTACTTATTTGAATATGAATCAGGGCTCTCCATGAAAAAGACCATTCTCGGAAGAGACTGTCACGTATGCAATTCTTCACAATATTTACAGTGGCCAGCTTTGCCTACTACACATTGCCTGGATACAT
GTTCACAATTCTGACATTTTTCTCATGGGTTTGTTGGATATGGCCTCATAATATCACAGCTAATCAAGTTGGTTCAGGATACAAGGGTTTAGGTGTTGGAGCCCTCTCCTTTGATTGGGCTGGAATTTCAGCATATCATGGAAGTCCCTTAGTCACACCATGGTTTTCAATCTTGAATGTTGCTGTTGGGTTTGTAATAT
TCATCTACATAATTGTCCCTTTATCTTACTGGAAATACAACATCTTCGAATCTAGGAAGTTCCCCATTTTCTCTAGTGAACTGTTTACTGCTACTGGTCAGAAATATGATACCACAAAGATCCTGACACCGCAGTTTAATTTGAATGAAAGGGCCTATAATGACTATGGAAAGCTATATCTCACCCCTCTTTTTGCACTG
TCTATTGGATCGGGCTTTGCAAGAATTGCAGCAACTATTACACATGTGCTCCTCTTCAATGGACATGACATGCTTAAGAGGAGCAGATCTGCTCTAAATGCTGGAAAATTAGATGTGCATGCACGCTTGATGAAGAATTATAAGCCAGTCCCGGAATGGTGGTTTCTCATCTTGTTAGTGGGCAGCATGGCATTCTGTCT
TTTATTATCATTTGTATGGAAGGATGATGTTCAAATTCCATGGTGGGGTATGATACTAGCATGCGCTTTGTCATGGTTGTTAACACTTCCAATCGGAGTCATCCAAGCAACTACAAACCAGCAACCGGGTTATGATATTATAGCACAGTACATGTTTGGTTACATACTGCCGGGGAAACCTATAGCGAATCTGCTGTTCA
AGATTTACGGCAGGATAAGCAGCATACATGCACTCTCTTTCCTTGCAGACCTGAAGCTTGGTCACTATATGAAAATTCCTCCACGTTGTATGTACGCTGCTCAGCTTGTGGGCACAGTTCTTGCAGGTGTAGTGAATCTGGGTGTTGCATGGTGGATGCTGGAATCTATAGAGAACATCTGTAATGTGGATGCTTTACCT
CCTGACAGCCCTTGGACATGTCCAAAGTACAGAGTAACGTTTGATCAATCTGTAATTTGGGGTCTTGTCGGTCCAAGGCGCCTGTTTGGACAGCATCAGCTGTACCAAAATCTGGTCTGGCTTTTCCTTGTAGGTGCACTTCTCCCTGTGCCAGTTTGGATTCTGACTAAGCTGTTCCCCGATAAAAAATGGATTTCACA
GATAAACATACCTGTCATTACATATGGGTTTGCCGGCATGCCTCCTGCCACTCCTGCCAATATTGCTTCTTGGATCATAACAGGTACTATCTTCAATTATTTTATATTCCGCTACAGGAAGAGATGGTGGCAGCGATACAATTATGTGCTTTCTGCAGCCCTAGATGCTGGTACAGCATTTATGGGAGTGCTGTTATACT
TCGCACTTGGTATGCATAATAAGAATTTAAAGTGGTGGGGAGCAGAGCTGGACCATTGCCCACTTGCTTCCTGTCCAACTGCCCCAGGCATTGTTGTCAAGGGATGTCCAGTGTTTTGATTACTTGCTTTTCTCATATCCAATCGGATTTAGCTCTCTTTTCTTGAAGGAAACATATTACTACGCCATTACTTTTACAGG
TCAAAAGAAGTTCTCTTGTCAAATATCTTGGCAGTACATGTTTGTAAGAATGGTTTTGCAATCTTCAGCAGGGAAACAGATTTTCTCATATCCAGTAGGATTTAGCTCTCTTTTCCTGAAGGAAACATGTTGCTACGCCATTACTTTTACTTGTCAAAATCCGTGGCAGTACATGTTTGTAAAAATAGTTTGTGCAATCT
TCAGCAGGGAAGCGGCTTTTATAAAATAGCACGGAGGAAATATAAACACCACAATTTCTTTGATCCAAGTACCAAGGAATTTTGTTCTTGACTACTGGAAGGCCTCTTCAAGTCTTTTCATACAACTGGATC
>TRINITY_DN116547_c0_g1_i3 from sample A1 / Example unspliced isoform:CTGGTCAATATAAAGCAGTGGGCTGTCCCGGCCTTCTCTGCATAAAATGCCCTCGGATCAGGACAATTGATTTTCGATCTTCGTCTGTCGTTTTGTACAGTGTGTTGGACATATCTTCAGATACTTCTAGCCCTGCATTGTATTTATATTCCAGACCATTACTGTATCAGCTGCGCTTGATTGGGTTGCCTGCAGCAGGC
GGGCAAAATGGATGCATATGATGGAGACAAGAAAGCAGCATTAGAGGAAGAACAGTCGCCAATAGAAGAGGTGGCATTGGTGGTGCCTGTGACAGATGATCCATCTCTGCCCGTGTTTACATTTCGTGTCTGGGTTTTGGGATGTGTGTCATGTGTACTGCTAATGTTTGTGAACACATTCTTCTCCTACAGAACGCAGC
CCCTCACCATATCCGGCATTTTAGCTCAGATTTTGGTGTTGCCAGTTGGGAAATTCATGGCAGCCACTCTCCCAACTAAGAAATTGCGAGTACCCTTCTTCGGGTGGGAGTGGAGTGTGAATCCGGGCCCCTTCAATATGAAAGAGCATGTTCTCATAACCATCTTTGCTAACTCTGGCGTCTCATATGGCGGTGGAGAT
GCATATTCAGTCGGGGCAATCAATGTCATGAAAGCTTATTACAAGCAAAATATTAGCTTTATTGCAGCTCTCATCATCGTACTCACAACGCAGATTTTAGGTTATGGCTGGGCTGGTTTGCTGAGAAAGTATCTAGTAGAACCTGCAGAAATGTGGTGGCCTTCCAACTTGGCACAGGTCTCTCTCTTCAGGGCTCTCCA
TGAAAAAGACCATTCTCGGAAGAGACTGTCACGTATGCAATTCTTCACAATATTTACAGTGGCCAGCTTTGCCTACTACACATTGCCTGGATACATGTTCACAATTCTGACATTTTTCTCATGGGTTTGTTGGATATGGCCTCATAATATCACAGCTAATCAAGTTGGTTCAGGATACAAGGGTTTAGGTGTTGGAGCCC
TCTCCTTTGATTGGGCTGGAATTTCAGCATATCATGGAAGTCCCTTAGTCACACCATGGTTTTCAATCTTGAATGTTGCTGTTGGGTTTGTAATATTCATCTACATAATTGTCCCTTTATCTTACTGGAAATACAACATCTTCGAATCTAGGAAGTTCCCCATTTTCTCTAGTGAACTGTTTACTGCTACTGGTCAGAAA
TATGATACCACAAAGATCCTGACACCGCAGTTTAATTTGAATGAAAGGGCCTATAATGACTATGGAAAGCTATATCTCACCCCTCTTTTTGCACTGTCTATTGGATCGGGCTTTGCAAGAATTGCAGCAACTATTACACATGTGCTCCTCTTCAATGGACAgtgagttcccttacattcatttgtttcaatctttattat
tttgaaaatctaaaataaacagtgtgcccattctttcaaaagtgatgaagagtgaattttatgattgcagTGACATGCTTAAGAGGAGCAGATCTGCTCTAAATGCTGGAAAATTAGATGTGCATGCACGCTTGATGAAGAATTATAAGCCAGTCCCGGAATGGTGGTTTCTCATCTTGTTAGTGGGCAGCATGGCATTC
TGTCTTTTATTATCATTTGTATGGAAGGATGATGTTCAAATTCCATGGTGGGGTATGATACTAGCATGCGCTTTGTCATGGTTGTTAACACTTCCAATCGGAGTCATCCAAGCAACTACAAACCAGCAACCGGGTTATGATATTATAGCACAGTACATGTTTGGTTACATACTGCCGGGGAAACCTATAGCGAATCTGCT
GTTCAAGATTTACGGCAGGATAAGCAGCATACATGCACTCTCTTTCCTTGCAGACCTGAAGCTTGGTCACTATATGAAAATTCCTCCACGTTGTATGTACGCTGCTCAGCTTGTGGGCACAGTTCTTGCAGGTGTAGTGAATCTGGGTGTTGCATGGTGGATGCTGGAATCTATAGAGAACATCTGTAATGTGGATGCTT
TACCTCCTGACAGCCCTTGGACATGTCCAAAGTACAGAGTAACGTTTGATCAATCTGTAATTTGGGGTCTTGTCGGTCCAAGGCGCCTGTTTGGACAGCATCAGCTGTACCAAAATCTGGTCTGGCTTTTCCTTGTAGGTGCACTTCTCCCTGTGCCAGTTTGGATTCTGACTAAGCTGTTCCCCGATAAAAAATGGATT
TCACAGATAAACATACCTGTCATTACATATGGGTTTGCCGGCATGCCTCCTGCCACTCCTGCCAATATTGCTTCTTGGATCATAACAGGTACTATCTTCAATTATTTTATATTCCGCTACAGGAAGAGATGGTGGCAGCGATACAATTATGTGCTTTCTGCAGCCCTAGATGCTGGTACAGCATTTATGGGAGTGCTGTT
ATACTTCGCACTTGGTATGCATAATAAGAATTTAAAGTGGTGGGGAGCAGAGCTGGACCATTGCCCACTTGCTTCCTGTCCAACTGCCCCAGGCATTGTTGTCAAGGGATGTCCAGTGTTTTGATTACTTGCTTTTCTCATATCCAATCGGATTTAGCTCTCTTTTCTTGAAGGAAACATATTACTACGCCATTACTTTT
ACAGGTCAAAAGAAGTTCTCTTGTCAAATATCTTGGCAGTACATGTTTGTAAGAATGGTTTTGCAATCTTCAGCAGGGAAACAGATTTTCTCATATCCAGTAGGATTTAGCTCTCTTTTCCTGAAGGAAACATGTTGCTACGCCATTACTTTTACTTGTCAAAATCCGTGGCAGTACATGTTTGTAAAAATAGTTTGTGC
AATCTTCAGCAGGGAAGCGGCTTTTATAAAATAGCACGGAGGAAATATAAACACCACAATTTCTTTGATCCAAGTACCAAGGAATTTTGTTCTTGACTACTGGAAGGCCTCTTCAAGTCTTTTCATACAACTGGATC
Intron 2 GTAATATTCA ... GACACCGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 96.77 | 1 | 33 | 27 |
| A2 | 100 | 0 | 17 | 11 |
| A3 | 90.48 | 2 | 24 | 14 |
| A4 | 76.32 | 9 | 31 | 27 |
| A5 | 100 | 0 | 6 | 10 |
| A6 | 85.96 | 4 | 23 | 26 |
| A7 | 80.49 | 8 | 32 | 34 |
| A8 | 86.44 | 4 | 21 | 30 |
| A9 | 84.31 | 4 | 24 | 19 |
| A10 | 80 | 12 | 53 | 43 |
>TRINITY_DN46886_c0_g1_i3 from sample A10 / Example spliced isoformTGAATGTTGCTGTTGGGTTTTTTAATTTGAATGAAAGGGCCTATAATGACTATGGAAAGCTATATCTCACCCCTCTTTTTGCACTGTCTATTGGATCGGGCTTTGCAAGAATTGCAGCAACTATTACACATGTGCTCCTCTTCAATGGACATGACATGCTTAAGAGGAGCAGATCTGCTCTAAATGCTGGAAAATTAGAT
GTGCATGCACGCTTGATGAAGAATTATAAGCCAGTCCCGGAATGGTGGTTTCTCATCTTGTTAGTGGGCAGCATGGCATTCTGTCTTTTATTATCATTTGTATGGAAGGATGATGTTCAAATTCCATGGTGGGGTATGATACTAGCATGCGCTTTGTCATGGTTGTTAACACTTCCAATCGGAGTCATCCAAGCAACTAC
AAACCAGCAACCGGGTTATGATATTATAGCACAGTACATGTTTGGTTACATACTGCCGGGGAAACCTATAGCGAATCTGCTGTTCAAGATTTACGGCAGGATAAGCAGCATACATGCACTCTCTTTCCTTGCAGACCTGAAGCTTGGTCACTATATGAAAATTCCTCCACGTTGTATGTACGCTGCTCAGCTTGTGGGCA
CAGTTCTTGCAGGTGTAGTGAATCTGGGTGTTGCATGGTGGATGCTGGAATCTATAGAGAACATCTGTAATGTGGATGCTTTACCTCCTGACAGCCCTTGGACATGTCCAAAGTACAGAGTAACGTTTGATCAATCTGTAATTTGGGGTCTTGTCGGTCCAAGGCGCCTGTTTGGACAGCATCAGCTGTACCAAAATCTG
GTCTGGCTTTTCCTTGTAGGTGCACTTCTCCCTGTGCCAGTTTGGATTCTGACTAAGCTGTTCCCCGATAAAAAATGGATTTCACAGATAAACATACCTGTCATTACATATGGGTTTGCCGGCATGCCTCCTGCCACTCCTGCCAATATTGCTTCTTGGATCATAACAGGTACTATCTTCAATTATTTTATATTCCGCTA
CAGGAAGAGATGGTGGCAGCGATACAATTATGTGCTTTCTGCAGCCCTAGATGCTGGTACAGCATTTATGGGAGTGCTGTTATACTTCGCACTTGGTATGCATAATAAGAATTTAAAGTGGTGGGGAGCAGAGCTGGACCATTGCCCACTTGCTTCCTGTCCAACTGCCCCAGGCATTGTTGTCAAGGGATGTCCAGTGT
TTTGATTACTTGCTTTTCTCATATCCAATCGGATTTAGCTCTCTTTTCTTGAAGGAAACATATTACTACGCCATTACTTTTACAGGTCAAAAGAAGTTCTCTTGTCAAATATCTTGGCAGTACATGTTTGTAAGAATGGTTTTGCAATCTTCAGCAGGGAAACAGATTTTCTCATATCCAGTAGGATTTAGCTCTCTTTT
CCTGAAGGAAACATGTTGCTACGCCATTACTTTTACTTGTCAAAATCCGTGGCAGTACATGTTTGTAAAAATAGTTTGTGCAATCTTCAGCAGGGAAGCGGCTTTTATAAAATAGCACGGAGGAAATATAAACACCACAATTTCTTTGATCCAAGTACCAAGGAATTTTGTTCTTGACTACTGGAAGGCCTCTTCAAGTC
TTTTCATACAACTGGATCCACCTCTCTCCCTCTTAAGACACAAATTAATCAATATATACTGTTTTATAAAGTTTTTGGAATATAATGCTTGCCTCTCCTATTTTTCCAAGAGGCAAATTGTCTAAAA
>TRINITY_DN46886_c0_g1_i4 from sample A10 / Example unspliced isoform:CGTGCACCGCTGGTCAATATAAAGCAGTGGGCTGTCCCGGCCTTCTCTGCATAAAATGCCCTCGGATCAGGACAATTGATTTTCGATCTTCGTCTGTCGTTTTGTACAGTGTGTTGGACATATCTTCAGATATTTCTAGCCCTGCATTGTATTTATATTCCAGACCATTACTGTATCAGCTGCGCTTGATTGGGTTGCCT
GCAGCAGGCGGGCAAAATGGATGCATATGATGGAGACAAGAAAGCAGCATTAGAGGAAGAACAGTCGCCAATAGAAGAGGTGGCATTGGTGGTGCCTGTGACAGATGATCCATCTCTGCCCGTGTTTACATTTCGTGTCTGGGTTTTGGGATGTGTGTCATGTGTACTGCTAATGTTTGTGAACACATTCTTCTCCTACA
GAACGCAGCCCCTCACCATATCCGGCATTTTAGCTCAGATTTTGGTGTTGCCAGTTGGGAAATTCATGGCAGCCACTCTCCCAACTAAGAAATTGCGAGTACCCTTCTTCGGGTGGGAGTGGAGTGTGAATCCGGGCCCCTTCAATATGAAAGAGCATGTTCTCATAACCATCTTTGCTAACTCTGGCGTCTCATATGGC
GGTGGAGATGCATATTCAGTCGGGGCAATCAATGTCATGAAAGCTTATTACAAGCAAAATATTAGCTTTATTGCAGCTCTCATCATCGTACTCACAACGCAGATTTTAGGTTATGGCTGGGCTGGTTTGCTGAGAAAGTATCTAGTAGAACCTGCAGAAATGTGGTGGCCTTCCAACTTGGCACAGGTCTCTCTCTTCAG
GGCTCTCCATGAAAAAGACCATTCTCGGAAGAGACTGTCACGTATGCAATTCTTCACAATATTTACAGTGGCCAGCTTTGCCTACTACACATTGCCTGGATACATGTTCACAATTCTGACATTTTTCTCATGGGTTTGTTGGATATGGCCTCATAATATCACAGCTAATCAAGTTGGTTCAGGATACAAGGGTTTAGGTG
TTGGAGCCCTCTCCTTTGATTGGGCTGGAATTTCAGCATATCATGGAAGCCCCTTAGTCACACCATGGTTTTCAATCTTGAATGTTGCTGTTGGGTTTgtaatattcatctacataattgtccctttatcttactggaaatacaacatcttcgaatctaggaagttccccattttctctagtgaactgtttactgctact
ggtcagaaatatgataccacaaagatcctgacaccgcagTTTAATTTGAATGAAAGGGCCTATAATGACTATGGAAAGCTATATCTCACCCCTCTTTTTGCACTGTCTATTGGATCGGGCTTTGCAAGAATTGCAGCAACTATTACACATGTGCTCCTCTTCAATGGACATGACATGCTTAAGAGGAGCAGATCTGCTCT
AAATGCTGGAAAATTAGATGTGCATGCACGCTTGATGAAGAATTATAAGCCAGTCCCGGAATGGTGGTTTCTCATCTTGTTAGTGGGCAGCATGGCATTCTGTCTTTTATTATCATTTGTATGGAAGGATGATGTTCAAATTCCATGGTGGGGTATGATACTAGCATGCGCTTTGTCATGGTTGTTAACACTTCCAATCG
GAGTCATCCAAGCAACTACAAACCAGCAACCGGGTTATGATATTATAGCACAGTACATGTTTGGTTACATACTGCCGGGGAAACCTATAGCGAATCTGCTGTTCAAGATTTACGGCAGGATAAGCAGCATACATGCACTCTCTTTCCTTGCAGACCTGAAGCTTGGTCACTATATGAAAATTCCTCCACGTTGTATGTAC
GCTGCTCAGCTTGTGGGCACAGTTCTTGCAGGTGTAGTGAATCTGGGTGTTGCATGGTGGATGCTGGAATCTATAGAGAACATCTGTAATGTGGATGCTTTACCTCCTGACAGCCCTTGGACATGTCCAAAGTACAGAGTAACGTTTGATCAATCTGTAATTTGGGGTCTTGTCGGTCCAAGGCGCCTGTTTGGACAGCA
TCAGCTGTACCAAAATCTGGTCTGGCTTTTCCTTGTAGGTGCACTTCTCCCTGTGCCAGTTTGGATTCTGACTAAGCTGTTCCCCGATAAAAAATGGATTTCACAGATAAACATACCTGTCATTACATATGGGTTTGCCGGCATGCCTCCTGCCACTCCTGCCAATATTGCTTCTTGGATCATAACAGGTACTATCTTCA
ATTATTTTATATTCCGCTACAGGAAGAGATGGTGGCAGCGATACAATTATGTGCTTTCTGCAGCCCTAGATGCTGGTACAGCATTTATGGGAGTGCTGTTATACTTCGCACTTGGTATGCATAATAAGAATTTAAAGTGGTGGGGAGCAGAGCTGGACCATTGCCCACTTGCTTCCTGTCCAACTGCCCCAGGCATTGTT
GTCAAGGGATGTCCAGTGTTTTGATTACTTGCTTTTCTCATATCCAATCGGATTTAGCTCTCTTTTCTTGAAGGAAACATATTACTACGCCATTACTTTTACAGGTCAAAAGAAGTTCTCTTGTCAAATATCTTGGCAGTACATGTTTGTAAGAATGGTTTTGCAATCTTCAGCAGGGAAACAGATTTTCTCATATCCAG
TAGGATTTAGCTCTCTTTTCCTGAAGGAAACATGTTGCTACGCCATTACTTTTACTTGTCAAAATCCGTGGCAGTACATGTTTGTAAAAATAGTTTGTGCAATCTTCAGCAGGGAAGCGGCTTTTATAAAATAGCACGGAGGAAATATAAACACCACAATTTCTTTGATCCAAGTACCAAGGAATTTTGTTCTTGACTAC
TGGAAGGCCTCTTCAAGTCTTTTCATACAACTGGATCCACCTCTCTCCCTCTTAAGACACAAATTAATCAATATATACTGTTTTATAAAGTTTTTGGAATATAATGCTTGCCTCTCCTATTTTTCCAAGAGGCAAATTGTCTAAAA