sp|P68430|H32_ONOVI ----> Histone H3.2

Intron 1 GTGTGTTTTC ... AATGCAACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	30.05	64	52	3
A2	27.57	88	48	19
A3	24.64	78	43	8
A4	29.94	55	40	7
A5	22.39	52	24	6
A6	31.92	676	470	164
A7	32.98	465.7	313.3	145
A8	33.92	448	323	137
A9	32.06	539	347.7	161
A10	29.19	372.7	230.3	77

>TRINITY_DN123801_c2_g2_i3 from sample A2 / Example spliced isoform

CTCACAGATTCAGGCCCGGTACTGTTGCCCTCCGGGAAATCCGAAAGTACCAGAAGAGCACCGAGCTTCTGATAAGAAAGCTGCCCTTCCAGCGGCTTGTAAGGGAGATTGCTCAAGATTTTAAGACGGACTTGAGATTCCAGTCGTCAGCAGTGGCGGCATTGCAAGAAGCGGCGGAGGCATATCTTGTTGGGCTCTTC
GAGGACACCAATCTGTGCGCCATCCACGCTAAGAGGGTTACTATCATGCCCAAAGATATCCAGCTCGCTCGCCGCATCCGTGGAGAGAGGGCGTAATCATGTATAAACATAATCGCTATCAATGCCAATGGTAAAGATATCTATTGCATGTAAAGTCATTATCCAGGCTTTCCACCTGTGGTTAATCTGCCATGCCGTTA
AGGAAGCTAGCGCAGAAGCCAGAACCGATTGTGTGAGAACCAGGCTTCGATCCTGGAACCTCTGAGTTATGGGCTCATCACGCTTACCCTGCGCTACTGATATGTGCTGTTTGTCTCTGCTGCTCCATTTTCAGTGATCTTAAATCAAATCAGGGTTCAAATATTTAAGAAATTCACGCGCACACAACATGCTTTGGGGC
CTGGAAATTTCTTATTGATACATGACTTGGTATGCGATGAATTTAATCAATTTATTTGAGAGTTACTGGTTTATGCATAAAAAAATTCAATTCCTTGGTATGAAATGAATTAAATGAATTTATTTGAGAGTTATTAGTTTACGCATGAAGAAGAATCCGGGGAGGTGTAAGTAAATGTTCATTGAGTAATTTGTCACAAG
GCTGAACTGAATAGTTCATCAGGTGGTACAATGCCTGTTAATTTACAAGTCAATGTTAAATGGAGTAGTAAGTTAAAGTTTTAATCCTATTTTTATTTTTTTCCCATTTTTGTGAGCATCATCTGAAAATTGAAAATCGGTTAGTTATGATTATATTCATGGGATATAGGTCCTATAGGTCCTAGATTAACGACTTGCTC
TCTATTCTATTCAGG

>TRINITY_DN123801_c2_g2_i2 from sample A2 / Example unspliced isoform:

CTCACAGATTCAGGCCCGGTACTGTTGCCCTCCGGGAAATCCGAAAGTACCAGAAGAGCACCGAGCTTCTGATAAGAAAGCTGCCCTTCCAGCGGCTTGTAAGGGAGATTGCTCAAGATTTTAAGACGGACTTGAGATTCCAGTCGTCAGCAGTGGCGGCATTGCAAGAAGCGGCGGAGGCATATCTTGTTGGGCTCTTC
GAGGACACCAATCTGTGCGCCATCCACGCTAAGAGGGTTACTATCATGCCCAAAGATATCCAGCTCGCTCGCCGCATCCGTGGAGAGAGGGCGTAATCATGTATAAACATAATCGCTATCAATGCCAATGgtgtgttttcacaccaccatctgctgctctttgaaatttgttctccaataccccccgtttcttttggtgt
ttcttgaaatttgttctccaatccccctttgtttattttggtgctatttacctttgtttgttgttgcaaatgcaacagGTAAAGATATCTATTGCATGTAAAGTCATTATCCAGGCTTTCCACCTGTGGTTAATCTGCCATGCCGTTAAGGAAGCTAGCGCAGAAGCCAGAACCGATTGTGTGAGAACCAGGCTTCGATC
CTGGAACCTCTGAGTTATGGGCTCATCACGCTTACCCTGCGCTACTGATATGTGCTGTTTGTCTCTGCTGCTCCATTTTCAGTGATCTTAAATCAAATCAGGGTTCAAATATTTAAGAAATTCACGCGCACACAACATGCTTTGGGGCCTGGAAATTTCTTATTGATACATGACTTGGTATGCGATGAATTTAATCAATT
TATTTGAGAGTTACTGGTTTATGCATAAAAAAATTCAATTCCTTGGTATGAAATGAATTAAATGAATTTATTTGAGAGTTATTAGTTTACGCATGAAGAAGAATCCGGGGAGGTGTAAGTAAATGTTCATTGAGTAATTTGTCACAAGGCTGAACTGAATAGTTCATCAGGTGGTACAATGCCTGTTAATTTACAAGTCA
ATGTTAAATGGAGTAGTAAGTTAAAGTTTTAATCCTATTTTTATTTTTTTCCCATTTTTGTGAGCATCATCTGAAAATTGAAAATCGGTTAGTTATGATTATATTCATGGGATATAGGTCCTATAGGTCCTAGATTAACGACTTGCTCTCTATTCTATTCAGG