sp|Q6K638|HCT2_ORYSJ ----> Hydroxycinnamoyltransferase 2
Intron 1 GTTGTGCATT ... ATTTCGTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 89.47 | 1 | 11 | 6 |
| A2 | 59.6 | 2 | 2 | 4 |
| A3 | 76.78 | 3 | 4 | 16 |
| A4 | 58.26 | 10 | 14 | 14 |
| A5 | 88.24 | 2 | 5 | 25 |
| A6 | 88.56 | 3 | 15 | 31.5 |
| A7 | 87.23 | 3 | 8 | 33 |
| A8 | 74.59 | 4 | 9 | 14.5 |
| A9 | 95.96 | 1 | 14 | 33.5 |
| A10 | 62.61 | 8 | 9 | 18 |
>TRINITY_DN44504_c1_g2_i2 from sample A8 / Example spliced isoformGCTCAGTCTAGGTGGCTGAAGCTCAGCGTAGATTCTAGAAGAAAAGAGATGCTGGGCAATCCAGAATACAATTCTGCTAAATTATCCAGAGTACAATTGTGATGGAAACTGTTGTTTATGTACACATTTGGCGAGACCACCACCATCTAACGCCAACTTAAGATGCCATTTGGATAGGTATAGCGAAGAAAGGAACATTG
TGGCCGGATCTCTGAAAGCTGGCTTAGGATTTTCTTGAGCTTTTTGTCTGCATGCGCTGCACCTTTTCAACGGCTCGAAACCTCCATGTATCTAGCCGTTGGGAATTTTGCTATATATTTAAAGGCATTCGAACATTGTGGCACAATTTTGAGAAATGGCGTTCGAACAGTGCTCTGTCATGTTGAGTTGCATTTCTACC
CTGGCTGATTAATGGTTCACAACTGGGGATGGAGTTTGAGGGATTCCTGAGGAGAACAGCTTCTGGATGCTGCAAAGGATTAGTTATAATTGAAGCTGAGTTGAGATGAAGTTCTGATTGATATTTAATGCAGTTGAGAAATCTGTAAGTATTCTTTTACCGATTCATTGTTTTGACAAAGTGATGCATGGTTTGATGAA
AATGTAGTAGTTATAGAACATGTTCAGCAGACATAGAAATGAAGGGTTTCTAAAATTGATGGAATCCAAATTAGTTTTGTAAGGGATAATTTTAAATGTCAATATAGAGTGGATAATTGATGGAATCCAAATTAGTTTTGTAAGGGAATCGCTAGAATTATAATCTGATCGAACATAAATGTGCAGTTTATGGACAATGT
GTAGTTTCTGAATGCCTTAAAAATGATTAATTTGATTGAAGCTCAGTTAAGACGAAACTCCATAAAATTGATGTTTACTGTAATTAAGAAATCTGTATAGAATCTTTCTAATTTTAAATGTCAATATAGAGTGGATAATTGATGGAATCCAAATTAGTT
>TRINITY_DN44504_c1_g2_i1 from sample A8 / Example unspliced isoform:GCTCAGTCTAGGTGGCTGAAGCTCAGCGTAGATTCTAGAAGAAAAGAGATGCTGGGCAATCCAGAATACAATTCTGCTAAATTATCCAGAGTACAATTGTGATGGAAACTGTTGTTTATGTACACATTTGGCGAGACCACCACCATCTAACGCCAACTTAAGATGCCATTTGGATAGGTATAGCGAAGAAAGGAACATTG
TGGCCGGATCTCTGAAAGCTGGCTTAGGATTTTCTTGAGCTTTTTGTCTGCATGCGCTGCACCTTTTCAACGGCTCGAAACCTCCATGTATCTAGCCGTTGGGAATTTTGCTATATATTTAAAGGCATTCGAACATTGTGGCACAATTTTGAGAAATGGCGTTCGAACAGTGCTCTGTCATGTTGAGgttgtgcattgca
atttttttttagctttattttcatggtgaggttgtgaattgcaattttttgtgagttttattctgttttcagtatgccctttgtttactggttatgcgtgtgcttctttctgctttctttttctttttgttctcctttgtgtttctatggtgcattgctgtatttttttcagatttatgtttttgtgatttcagacttgt
ttctttggtttcatttattgctgtgtattttttctggttttccaatcctagagagtaaaaattttatgcctatgaatttcgtcagTTGCATTTCTACCCTGGCTGATTAATGGTTCACAACTGGGGATGGAGTTTGAGGGATTCCTGAGGAGAACAGGTAAAGAAACCGTTCCAAACAACATTCCTCTTGCTAAAGCTTC
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TTATAATTGAAGCTGAGTTGAGATGAAGTTCTGATTGATATTTAATGCAGTTGAGAAATCTGTAAGTATTCTTTTACCGATTCATTGTTTTGACAAAGTGATGCATGGTTTGATGAAAATGTAGTAGTTATAGAACATGTTCAGCAGACATAGAAATGAAGGGTTTCTAAAATTGATGGAATCCAAATTAGTTTTGTAAG
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TTAAGAAATCTGTATAGAATCTTTCTAATTTTAAATGTCAATATAGAGTGGATAATTGATGGAATCCAAATTAGTT
Intron 2 GTAAAGAAAC ... AAATGTGTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 28.92 | 5.7 | 2 | 2.5 |
| A2 | 33.33 | 2 | 2 | 0 |
| A3 | 20.12 | 14.3 | 7 | 0 |
| A4 | 22.75 | 6.8 | 2 | 2 |
| A5 | 37.21 | 10.4 | 11 | 1 |
| A6 | 23.5 | 20.7 | 8 | 4.5 |
| A7 | 45.59 | 11.3 | 9 | 9.5 |
| A8 | 42.42 | 11.8 | 6 | 11 |
| A9 | 33.33 | 12.7 | 9 | 3 |
| A10 | 34.95 | 13.7 | 7 | 7.5 |
>TRINITY_DN35479_c2_g1_i1 from sample A7 / Example spliced isoformGTACAATTGTGATGGAAACTGTTGTTTATGTACACATTTGGCGAGACCACCACCATCTAACGCCAACTTAAGATGCCATTTGGATAGGTATAGCGAAGAAAGGAACATTGTGGCCGGATCTCTGAAAGCTGGCTTAGGATTTTCTTGAGCTTTTTGTCTGCATGCGCTGCACCTTTTCAACGGCTCGAAACCTCCATGTA
TCTAGCCGTTGGGAATTTTGCTATATATTTAAAGGCATTCGAACATTGTGGCACAATTTTGAGAAATGGCGTTCGAACAGTGCTCTGTCATGTTGAGGTTGTGCATTGCAATTTTTTTTTAGCTTTATTTTCATGGTGAGGTTGTGAATTGCAATTTTTTGTGAGTTTTATTCTGTTTTCAGTATGCCCTTTGTTTACTG
GTTATGCGTGTGCTTCTTTCTGCTTTCTTTTTCTTTTTGTTCTCCTTTGTGTTTCTATGGTGCATTGCTGTATTTTTTTCAGATTTATGTTTTTGTGATTTCAGACTTGTTTCTTTGGTTTCATTTATTGCTGTGTATTTTTTCTGGTTTTCCAATCCTAGAGAGTAAAAATTTTATGCCTATGAATTTCGTCAGTTGCA
TTTCTACCCTGGCTGATTAATGGTTCACAACTGGGGATGGAGTTTGAGGGATTCCTGAGGAGAACAGCTTCTGGATGCTGCAAAGGATTAGTTATAATTGAAGCTGAGTTGAGATGAAGTTCTGATTGATATTTAATGCAGTTGAGAAATCTGTAAGTATTCTTTTACCGATTCATTGTTTTGACAAAGTGATGCATGGT
TTGATGAAAATGTAGTAGTTATAGAACATGTTCAGCAGACATAGAAATGAAGGGTTTCTAAAATTGATGGAATCCAAATTAGTTTTGTAAGGGATAATTTTAAATGTCAATATAGAGTGGATAATTGATGGAATCCAAATTAGTTTTGTAAGGGAATCGCTAGAATTATAATCTGATCGAACATAAATGTGCAGTTTATG
GACAATGTGTAGTTTCTGAATGCCTTAAAAATGATTAATTTGATTGAAGCTCAGTTAAGACGAAACTCCATAAAATTGATGTTTACTGTAATTAAGAAATCTGTATAGAATCTTTC
>TRINITY_DN35479_c2_g1_i2 from sample A7 / Example unspliced isoform:GTACAATTGTGATGGAAACTGTTGTTTATGTACACATTTGGCGAGACCACCACCATCTAACGCCAACTTAAGATGCCATTTGGATAGGTATAGCGAAGAAAGGAACATTGTGGCCGGATCTCTGAAAGCTGGCTTAGGATTTTCTTGAGCTTTTTGTCTGCATGCGCTGCACCTTTTCAACGGCTCGAAACCTCCATGTA
TCTAGCCGTTGGGAATTTTGCTATATATTTAAAGGCATTCGAACATTGTGGCACAATTTTGAGAAATGGCGTTCGAACAGTGCTCTGTCATGTTGAGGTTGTGCATTGCAATTTTTTTTTAGCTTTATTTTCATGGTGAGGTTGTGAATTGCAATTTTTTGTGAGTTTTATTCTGTTTTCAGTATGCCCTTTGTTTACTG
GTTATGCGTGTGCTTCTTTCTGCTTTCTTTTTCTTTTTGTTCTCCTTTGTGTTTCTATGGTGCATTGCTGTATTTTTTTCAGATTTATGTTTTTGTGATTTCAGACTTGTTTCTTTGGTTTCATTTATTGCTGTGTATTTTTTCTGGTTTTCCAATCCTAGAGAGTAAAAATTTTATGCCTATGAATTTCGTCAGTTGCA
TTTCTACCCTGGCTGATTAATGGTTCACAACTGGGGATGGAGTTTGAGGGATTCCTGAGGAGAACAGgtaaagaaaccgttccaaacaacattcctcttgctaaagcttcggttcagttgatggcaatgtttttattagaaatctgggttagggtttctaaaatcgaagggcttcaaatttgttttgaaacattattttt
aaatgacaatacataggggatttttgaaatttatgttgttattatatatccttacaactataatcttttcaaatataaatgtgtagCTTCTGGATGCTGCAAAGGATTAGTTATAATTGAAGCTGAGTTGAGATGAAGTTCTGATTGATATTTAATGCAGTTGAGAAATCTGTAAGTATTCTTTTACCGATTCATTGTTT
TGACAAAGTGATGCATGGTTTGATGAAAATGTAGTAGTTATAGAACATGTTCAGCAGACATAGAAATGAAGGGTTTCTAAAATTGATGGAATCCAAATTAGTTTTGTAAGGGATAATTTTAAATGTCAATATAGAGTGGATAATTGATGGAATCCAAATTAGTTTTGTAAGGGAATCGCTAGAATTATAATCTGATCGAA
CATAAATGTGCAGTTTATGGACAATGTGTAGTTTCTGAATGCCTTAAAAATGATTAATTTGATTGAAGCTCAGTTAAGACGAAACTCCATAAAATTGATGTTTACTGTAATTAAGAAATCTGTATAGAATCTTTC