NA ----> NA

Intron 1 GTACTAAGTA ... CTATGTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	50.68	36	1	37
A2	50	21	0	21
A3	53.33	28	2	32
A4	52.38	10	6	11
A5	50	15	3	15
A6	50.09	263	0	264
A7	51.02	216	0	225
A8	50.46	320	2	326
A9	50.34	290	4	294
A10	49.35	157	0	153

>TRINITY_DN39785_c0_g1_i3 from sample A7 / Example spliced isoform

TCCACCACAACTTAGAGGGAGGGCAGGACAGATACGGTCAGTTCTTGGTGTACCCAACAAATACACTTTCTGAGCCAATAAAAAGATCGAGAAGAAATAACACACTTTGAAATCAATGAGCAATGTTGTAACTGAAGATATTGAAAAACTGTTTGTGAGGAAGAATAAAGCTCAGGATGACAATGGGGGAGAATCACTAA
TTGTTCAATAACTGTACAAAGATGCATCTTTCATAAAACATTTCATTATCAACAGTCAAGTTTTGTATCACTGGTTTATACTATAATGTAAACTGTTTCTAACATGATGAAAAGCTCAATAAAGCTGTGTCCTTTGAGCCATGATCATTCATTCAAGAGATGTTATCTGCTCACATAAATGATTGGCAAAGTTTTGCGGG
CTTATGTTGCAGAGGGTAATGTTGTACTCTTTAATTTATGTAGTTTCTATTCTTATATGCAATGCCTTTGTTACTGTGATCTGTTGTGCTTTGAGATTATTTTGCGATGGGGTGTGTTTTGGTTGTAACAATGTTGTAAATCTCAACTATGGCTCTTATTCCTGTTCTCTCTGCCATTTAGTTGAGATTAGTAAGAACAG
CTTGACTTCCATGTTGTGCTTGTGAAGAATACAATGATTTGATAAACTCTGCACCCATATTTAAATTCTAATTTTGATTTTGTGTAATGTCCAAAGTATGTCTACATAGTTCTGTATGATTGTGTATAATATTCTAG

>TRINITY_DN39785_c0_g1_i1 from sample A7 / Example unspliced isoform:

ACCAAAGTCATAATCATGTGCATTGATGTATACAAGTGTTTTATTTTAGTATCATGCCTTCTCAGTATAGGGCAAGACAGATACGGTCAGTTCTTGGGTGTACCCAACAAATACACTTTCTGAGCCAATAAAAAGATCGAGAAGAAATAACACACTTTGAAATCAATgtactaagtaattttcattgagcagtgtaaatg
attattaagcaattttttatgccacatggtcttattagtgaattataggtttctgtttctaaagatttttatgtttccttctatggtgcttggtctatgtgcagGAGCAATGTTGTAACTGAAGATATTGAAAAACTGTTTGTGAGGAAGAATAAAGCTCAGGATGACAATGGGGGAGAATCACTAATTGTTCAATAACT
GTACAAAGATGCATCTTTCATAAAACATTTCATTATCAACAGTCAAGTTTTGTATCACTGGTTTATACTATAATGTAAACTGTTTCTAACATGATGAAAAGCTCAATAAAGCTGTGTCCTTTGAGCCATGATCATTCATTCAAGAGATGTTATCTGCTCACATAAATGATTGGCAAAGTTTTGCGGGCTTATGTTGCAGA
GGGTAATGTTGTACTCTTTAATTTATGTAGTTTCTATTCTTATATGCAATGCCTTTGTTACTGTGATCTGTTGTGCTTTGAGATTATTTTGCGATGGGGTGTGTTTTGGTTGTAACAATGTTGTAAATCTCAACTATGGCTCTTATTCCTGTTCTCTCTGCCATTTAGTTGAGATTAGTAAGAACAGCTTGACTTCCATG
TTGTGCTTGTGAAGAATACAATGATTTGATAAACTCTGCACCCATATTTAAATTCTAATTTTGATTTTGTGTAATGTCCAAAGTATGTCTACATAGTTCTGTATGATTGTGTATAATATTCTAG